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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0528200 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0528200.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Mei2-like protein; TAIR: AT5G07290.1 MEI2-like 4; Swiss-Prot: sp|Q64M78|OML4_ORYSJ Protein MEI2-like 4; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2SRL8|A0A0B2SRL8_GLYSO Protein MEI2-like 4; Found in the gene: LotjaGi1g1v0528200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:105493892..105511479) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTCCTTTTGGAAAATTCCCACCTTGCCTTATGCGGTAATTCATTCGTTTTCTCTCTCTCACATCTTCCTCTCCCTCCTCT TCCTGTTTCATATATGTAGCTGAATTCTTAGCCATCCCATCACTTGTGTGTTGGCTCCAATCCCCCATTTCTACAAAGGT CACTTTATTTTTGCTTTTGGCTTTCCAATTCATACGGGTTTCTGGATTTTCATGAGTTTTGTGTTTGTTTACTTCTTTGA GCTTTGGTTTATGATTTTGTGTTTTTTTTATAGGCAAATATTAGTTGTTATTAATGTTAGTAAATTAGTCATTCTTCAGG GTTCGAACACCGGACCCTTTGCCCTTCATCCCACCCAACCCTTATGTCCCCTAGCTCTTACCATTGAGCTAACCCTCGGG CACATGATTTTGTGCTTCTAATGTGTTAATTATGTTCAATTGAGTTTTTACTTTTGTTGGGGTGAATTTGATATGTTCAA GTTGTTTAGGATCCTCTTGATCTTTCAGAATATTGTTGGATTTGCAATTAATTAATACTATATGTAAAATGTGTCATTGT CGCGTGTTAGTGGATATATATTTATCTTAGTTTGATGTGTCTTAAATTTTTCATGATCTCTCACAATTAAGACTTTTTAA GACCTTTCTTAGAGCTATGCTTTTAATCTGTGTTGAAAGAACGTGGAAGATTTATATGGTGTGTTGTTCCTTGTTTAGTT TTCTTGCTGGAGAGGCAAAATATTAAATTCACTGCCTTGCTTTGCTGTGCTCAACAGATATAAAAGGATTCTAGCTTTTT TCTGGGATTCATCATGCCTTCTGAGACAATGGACTTCAATGGTTTGTCTCCATCGTTGTATTCCTCCCGAGATATTTTTT CATCTACCGAGGTACCTTCTTGTTTCATCTTAAATAGATTCCATCTTGAATTGAACATGGTGTTATTTTTTGAGCTTTAA 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CTTTGCTCAACTGATGTATTTATTACTCCCTCAAATTTACTTTAGACTTTAGAGTCCATTTGGTTGGTGGAAGAAAAAAC ATGCGTAATTATATCATATTCTGTTTTTTTTTTTGAAATTCATATTCTGTTGTTTGTAGGGTGAAAAATATATGGAAACA AATTTTCATACAGGTTTCAGCCTCACTCCAAATTTAAATTATTTAATTAACTATTTATATTTTTATAATTTGAAATATTC TAATTTATGAATGTAAAATTACTAATTTTAATACATATTAATTTATCACTTTTTAGTTGCTGTTTCTC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0528200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCTTCTGAGACAATGGACTTCAATGGTTTGTCTCCATCGTTGTATTCCTCCCGAGATATTTTTTCATCTACCGAGAG GCAGGCTGGATTCTGGAAATCAGATAACCTGCCCAAATGCTATGATTCTGATCAGAGAATAAAACCTAGCTTGAATGTAC AAGAAGCATCCGATTCTTCAGATAGCCATGAGGTTGATATAATTGCCACTCAGTATGAACGTAACCTCTTCTCAAGTTCC CTGTCAGAGTTGTTTACCAAGAAATTGAGATTATCTGCAAATAATGCTTTATATGGACATTCAGTTGATAATGTTACATC CCACTATGAGGATGAGAGGCTTTCTGACTCTATTGAAGAACTTGAGGCTCAAATTATTGGAAATCTACTCCCCAATGATG ATGATTTGCTTTCGGGAATGTGTGATGATCATGGTCTCATCACCCAAGGCAGCACTGGTGATGACATGGATGAAGTAGAC CTTTTCAGTAGTGTTGGAGGGATGGAATTGGGAGAAGATGATAACTCATCTTCTAGACAAAAGAATTCTGAAATCTTTGG TGGAGCTTTTAACAGTAAACTAGGGCTGTGCAATTCTTCAATTGCTGGTGAACACCCGACTAGAACATTATTTGCGAGAA ATATTAATAGTTTCCAGACAAGCCAATCTGGAAACTCAAAAACGCGTATGATTCAACAGATCCCTTCAGAATTAGAACAA AAAAACTGTAACCTTTTTCTGAATCAGAACTTCCCTCCTTCGAAATCGCCAACTAACTTCCCAGGCTTGCATGGATCTGG TAGCATGGATGGTGGAACAATTCTAGGTGTTGATCCTACAATATGCACACCATCCACAAATACTGCTTTTAGACATGAGG TCTCTTCAAGCGTTCCTAATACCTCACCATCCCTTGTGAGACTTAAATCAGTTCGAAACCAATGTGAAATCACTGAATCT GGTTCTCCTGGCCAGTTGAATTTTGGTATTCAAGCTGCATCAGCTTTTCATCCTCATTCACATCCAGAATGTCATGGTGG TTTAGCTAATGGTGTTCACCGTAATCCTCGTGGGGTAGAAAACATCAATCTCAATACACATGAAAGAAAAGATAACATGC AGTTCTCTCCAGGAAACTCAAGTGGAGGCTTCATGGAACTCAATGAATGTGTTTTAAGATCCTCTGGTAATGGAAGCTGC CCTCTTCCTGCTCATCATTACAAATGGAGCAACTGTCAGCCTCATGGAATGATGTGGCCAAATTCACCATCGTATTTGGA TGGGATTTGTGTGGCCCCTGCTGTGCAAAGATTGCATGCACTCCCTAGGTCACCATCACATATGATGAACACTGTTTTAC CCATAAATAACCAGCATCTGCGATCAGCTTCTCTTTGGGACAAAAGACATGCCTATGCAGTGGAATCTCCTGAAGCTTCT GCCTTCCATCCAGGATCTCTTGGGGATATGCGATTTTCCAGTAATACAGCAGCATATTGTGTTGACTTTGTTCCTCATCC CATCTTTCCCCATTTTGGGGGAAGCATTGTTGACCTTCAAATCCTCCCTAAGAATCATGGACTCCATTTCCATGACCAAG GGGACCTGATTTTTCCTGGAAGAAACCACATGAATAATTCATTTGATACTTACAAACAGCGTGCGAGAAGCCGTAGAAAC AGTGTTTCAAGCTTGGCTGACATGAAACAATATGATCTTGACATTGACCACATAAGAAGGGGGGAGGATACCCGCACAAC ACTTATGATAAAGAACATTCCTAACAAGTATACTTCCAAGATGCTGCTGGCTGCAATCGATGAATGCCATAAAGGAACTT ATGATTTTGTGTATCTACCAATTGATTTCAAAGCAAGTGCTTTTTTCTTTTTAATCGATTGGAATTCAGGGTCCATTTGT TTTGGAAAGAATATTTTCTAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0528200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPSETMDFNGLSPSLYSSRDIFSSTERQAGFWKSDNLPKCYDSDQRIKPSLNVQEASDSSDSHEVDIIATQYERNLFSSS LSELFTKKLRLSANNALYGHSVDNVTSHYEDERLSDSIEELEAQIIGNLLPNDDDLLSGMCDDHGLITQGSTGDDMDEVD LFSSVGGMELGEDDNSSSRQKNSEIFGGAFNSKLGLCNSSIAGEHPTRTLFARNINSFQTSQSGNSKTRMIQQIPSELEQ KNCNLFLNQNFPPSKSPTNFPGLHGSGSMDGGTILGVDPTICTPSTNTAFRHEVSSSVPNTSPSLVRLKSVRNQCEITES GSPGQLNFGIQAASAFHPHSHPECHGGLANGVHRNPRGVENINLNTHERKDNMQFSPGNSSGGFMELNECVLRSSGNGSC PLPAHHYKWSNCQPHGMMWPNSPSYLDGICVAPAVQRLHALPRSPSHMMNTVLPINNQHLRSASLWDKRHAYAVESPEAS AFHPGSLGDMRFSSNTAAYCVDFVPHPIFPHFGGSIVDLQILPKNHGLHFHDQGDLIFPGRNHMNNSFDTYKQRARSRRN SVSSLADMKQYDLDIDHIRRGEDTRTTLMIKNIPNKYTSKMLLAAIDECHKGTYDFVYLPIDFKASAFFFLIDWNSGSIC FGKNIF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 44 | 217 | 174 | 2.6E-126 | – | |
| PANTHER | 44 | 217 | 174 | 2.6E-126 | – | |
| PANTHER | 236 | 625 | 390 | 2.6E-126 | – | |
| PANTHER | 236 | 625 | 390 | 2.6E-126 | – | |
| Pfam | 585 | 625 | 41 | 2.7E-18 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0528200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…