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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0064800 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0064800.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Translation initiation factor IF-2; TAIR: AT1G26750.1 hypothetical protein; Swiss-Prot: sp|Q9PGR3|IF2_XYLFA Translation initiation factor IF-2; TrEMBL-Plants: tr|I3TAB6|I3TAB6_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0064800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:15082704..15095135) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTTTGGGGTTGACTGAACAAGCTTGTGAGCGAGACCTGCACCGCGAGACTGGAACAACTCGAGGTTAGGGCAACTTACTT ACTAGCTATTATACTGTAGGCGTCGATAAATTCGACTTGAATATTGCTTGATATTGAATATTGCTTGGATATTGTTTATG CTTTGAACTGCGAAATATTTTCTGTAGGCTTCAGCCGAGTAAAACTTATATAAGACGTGTATCTCCGTTTTCTGAGAGGC TTCGGTCGTTTACTGGTTTCTGTCTTATGATTCCCGCACTTAATTATTATTATATTGCTTCTTATAGCTTGAGATATTGA ATTGATATCAAACTGTGCGTATTGACGCGATTGCGGAGCGTGGGACATTTGAATTGATCCTTCAGGTTGAAATAATAACC CTAGGCAGGTCCTGACCTGAGGTCTGAGATCTAGCCCTCTTTGAAATACTTAGACTTTTCCCGAGGATTATATTTGGGGG ATTTTGGGAAACTTTGAATAGTTAGAATTTGGAACTTGAGAACTTATGGAACTTGGATTTCGATAATAAAACTCATAACT TGATTAACTCAATTTGAAATGCTTTGATTAATTAACGAGACCATTAGGAAAATTTAAGAGTTGGAAATGATTGTGAAAAA CGGGAAATAGTCGAAAAGCTTTGAACTTGAGATGATTTGATGGTCGTCACGGGGATGAACCATAGTGACCATGGAAATGG CACTGAGTGCAATATGTACTCCGGCTTTTCACAGCCTAGTCGCAAAGAAGACTTTGACCTTCGGGTACTTTTAAATTGAG AGTTGTGGTTAAACACGTACGTGTGAGGACGATTCGATGTTTAGTTAACCATATTGCATTATGCATACGTTTGAGGTTTG GGACGGTCAAAAGACCGGCCTTTATCGAAGAACACCTAGAGTGTATCTTCGACATTGCGGCGCGAATCCGTATGTTCAAA 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TTTACTTTTACCTAACCCTAGGACCTTGGAATTTTGTTATGCACGTTAGGATTTCAATATTGTGAGTAATTCAATTCCTA TGCCGGTAACATGGGGCGGATGCAGCGCCCGACTAGGCTGGGCACATGCCCAGGCTTCTTGCCAAAAATTGTTTACTTGG GCCGCAGGCCCTTTTTTGAGAAGAAAAAAATGTATTAAATGGGCAAAAAAAAAAATAGATCTGTAACAGTGTGAGTGAGT GCAGCCCTTACACACACGTTTTTCGTTTCCTCTCACGCACACATTCTGAATCGCACATCGTCTCTTTCCCTGATTCTCTT TCTCTCGTTCGAACAGCCCCTGCTTCTTCCTCTCTCAAACTGAAACTTTGTATCAGGTATGTTGATTCTGCTGAAGTTGC TCTTTGCCTTCATCTGATTTAAATGCGTAACACTTGTATCTCTGGGAGGAAATCTTCTCAATTGAACAATCTCCTTCCCA TCAACAATAATTTTTTTTTCTTCACAGTTACATTTTGTGTATCCGAATATGCGATTATAGTTTTTAAATTAAACATTAAA CTTTGCACAGGCTCCACAAAAATCCTGGCTCCGCGACTGCCTGTAACATGTTTGTGAAAATTCTTTTTTTATGAATTGTG TCTTTCATGTAATGGAAAGCTCTTAAAAATGTTTTATTGAGCTGTCAAATGGATTTTTGAATGTTATTTGGGTCTGTGAT TGAATGTCTATTCAGTTGCATGTTTGAGAGACTATCTCACTGTTCTGCTGTTAAGGACTCATATAAAATCTCATATTGTG GGGATTGGATCTTTTAGTTTTGAGATCTTATAAAATTTAAATGGTGGTGAAAGTTTTTCTGCTTTAGATGCAATGAATTA GTTTGTGATATTTTACCATGTAATGGTTAAATTAAATTGACTAAAATTTTAATTATTTTGGAACTCAAGCTGTAGAAGGG 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GTTCTTTATAGAACTGCTCACGTGGTGAACTAATGATCCATAACCTGTTTCACTACTTCTCTAACAGTGATATAGCTAGT CTCGGTTTCTTGCTTTAGTGAAGGCTTTGTTATATGCTGTTAGTTTCTGTTAGTGACTGTTATTTTAACAGCTGTTGCCA GTTGTAATTGTTCTTACCTGTCATTGACAGCTGTAGTTAGTTACATTTTTTAATGCAGTGAGTTAGCTCTTAGCTTCTTT TAGAGCATCTCTAATGCTAGTTCTTAGTTCTTAGCACTATTCATGTGGGTCCGTATTGCCACATGTGCTTAAGCAACTCT TTGCAGATTTTGCTCCAACCATGAGTTCTTAGTTCTTAGTTCTTAGTTCTTAGTTCTTAGTTCTTAGTTCTTAGTTCTTA GTTCTTAGCACTATTCATCCGGTCCCACAATACCATTATATTAATATTTTTTATTTCTATATAAATTTGATTTGAATTTA AATGTTAACTCAATACTTAAATTAAATGAATGAGAGAGAAAAAATTAATTGTTTATGCTAAGAACTCAAAAGTAAAACTC CTTATATAAGAACCTAGTTCTTATTTTTAAGAACTAAGAACTCCACGTCAGCACCTCCAGTGGTTAAGAACTCAGTTCTT AGTTCTTAACTAAAAAATAAGAACTAAGAACCTTGCATTGGAGATGCTCTTAGAAGCTTCAGCTTTCTATAAATACTAGA TAGCTTAATTTTACTGTTAAATGAAATATTCAGTTTCTCGCTTCTTTTCTTCTGGGTACCAATTCTATTATTCTCACATG GAGTGTCTCCACTTCTATTTGATAATTCTTTCCCTTTTATGTTTTGATGGTTGTGAGGTTGATAGAATCAGCCAAGAAGA AGATAGAAAACTGTTATTCAATACAGAAAAGATTAAAAGAACACCGTTGCTGAGTAATTCAAGAGACTCAGCTACTCTCC CTAAACCCCAATTACATGTGATCCCCCAGGATAGCTAACACTCTCCCTAACTCTCTTATTTATAGGCGATAAGCCTCACT CACTAATTCCTAACTAATCCCTAACTAACTAGCTAACTGAGTATCTATCAGAAGTTCTCAAGTGTTTTTCTTCCACCAAT TAGAATATGATTTACTTACTTTCTTACAATTCATTTTTATTTTGATTTTTATTTTTGTATTATATATGGTATGGTACTAA AAAACTTAATACGTGCTGGTTTTATCAATTCTCTATGCATTCATCTATGGAATAGTTACTTATTGATGGCAGATATCGAT ACATAGAGTATGGCAGTTTTTTTCAATTTGCTTCTATTTGCATCAGTATAACTCTTACATAAGCTGTAGCCTTAATGGTA ATAATAAAATTGAAGCACCAAACACAATAAGCATTTATCAATATATGTGATTAATGATTTGAGTTCAACAGGTTCTGTGC TTTTGATCCCCCTCCATCTCGTCTGTTTGCCTTGAGGGTTCTTGAGTTGAAAGAGCATGGCATTAGTGAGGAACAAGCAA TGTCTGTAGCCGATGTATGTAACCTGAACCAGTTCCTTAAATTGTATTTTTCTGCAATTTATTTTTCCTTTGTCCTCTAA TAATCACATGGATGTTTTCTGCTTCCTAGACGGAATATCGGGCTGAGAAGAAGGCGAAGAAGCAGGCATATAAACGTCTG AAGGAAATTGCTCATCTTCAAGGAAAGAGACCTCCTCCAAACCCATATCCTAATCCTATCAAGGAGATACAAGCTGAGGA GAGGAAATATGTTCGCGATCGTTTCTTTAATCCCAAGATACATGAAATTGTGAAGCAAAAGAAAGCAGAGGCTGAGAGTT TCAGAAGTGGATTCAGAGGGGGTGATTGGTGATTTTAACGGTGCCAAGTTACAATAATATTGAAATTTTGGCTATTGAGC 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0064800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCGTTTATGAAAGGAGATTTGCTTTCTCGAACCAGAAAGCTTGTGAAGGGTTTGGCCAAGGCAGAACCCGTGTGGCT CAAAGCCATGGAACAAGCGCCACCTGCAACATTTCCTCGAGCTGGGGATAAAATTCAGACCATCACTCTTCCTGAGGATG TTTATGTGAAAAAGTTCTATAAAAAATACCCTGAATCTAAGTACCATGATCCGATCAAGTTCTGTGCTTTTGATCCCCCT CCATCTCGTCTGTTTGCCTTGAGGGTTCTTGAGTTGAAAGAGCATGGCATTAGTGAGGAACAAGCAATGTCTGTAGCCGA TACGGAATATCGGGCTGAGAAGAAGGCGAAGAAGCAGGCATATAAACGTCTGAAGGAAATTGCTCATCTTCAAGGAAAGA GACCTCCTCCAAACCCATATCCTAATCCTATCAAGGAGATACAAGCTGAGGAGAGGAAATATGTTCGCGATCGTTTCTTT AATCCCAAGATACATGAAATTGTGAAGCAAAAGAAAGCAGAGGCTGAGAGTTTCAGAAGTGGATTCAGAGGGGGTGATTG GTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0064800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSFMKGDLLSRTRKLVKGLAKAEPVWLKAMEQAPPATFPRAGDKIQTITLPEDVYVKKFYKKYPESKYHDPIKFCAFDPP PSRLFALRVLELKEHGISEEQAMSVADTEYRAEKKAKKQAYKRLKEIAHLQGKRPPPNPYPNPIKEIQAEERKYVRDRFF NPKIHEIVKQKKAEAESFRSGFRGGDW
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 179 | 179 | 2.4E-96 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0064800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…