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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0024700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0024700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein FLX-like 1; TAIR: AT1G55170.1 DNA double-strand break repair protein; Swiss-Prot: sp|Q9C717|FLXL3_ARATH Protein FLX-like 3; TrEMBL-Plants: tr|I3SIR2|I3SIR2_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0024700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:2712894..2724750) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTCTTCTTCCTTTTGGGTTATTGTCTTGTTTGGGGCCCTATGCTCTTGACCCAAATGTTTGTTAAACAAAAATTTTATAT CATCGTATTACATTCACGAGTTGGATTCCATATCGATATCAAACCCGTGGGTTCATTCTGAGTTTTCTGTATTGGTGCAT CATCCTCACGCGACTGCTACCAGACCCTTGTTCTCAATTCTCTTTCTGTAAGGTACCCTATTCATTCTCTTCATCTGTTA ATCCCTATCTAGGTTTTAGTTTCGTTCTCAAACATTGATTTCATTCAATATCTGTCTGTGATTTATTTTTCTTCTGATTT TTTTGGGGGCTTTTGCTTGATGTGCTTCGTGTGCCATTCTCATCTTGTGATCATGTGCGTTGCCACCACCAATCCGATAA AGTTTTTTTTTTTTTTTTGGGATTCTGCATAACCCGTTTTGAAAAGGGGTTAATTATGATTATGACTCGCATTGCTGATC ATAATTTGACATACCCTTTTGCTAATGATGCCTAAATTTTGAATCTTTGGTTGAAATAACAACATGGTCATAATTTTGAT TCTGATTGTAATGGTATTTTTATCTGATTTTGCTGTTTTAGGTGACTTGAAATGGCAGGAAGGCACCGTGGTCACAGGGA ACCGATGAGTGGCCGGAGGGGTTACCCACCTGAAGGGCCTTATACTCGTGGGCCGCCACCGATGCCACGACCGCATGTTC CCCCTCATCCGGCGCTGTTGGAAGAAGAGCTTGAATTGCAGCGTGCTGATATGAGGAATCTTGCGGCGGAAAACAGGAGG CTTGTGGTGGAAAACAGGAACCTGAATGATGACAGGATGGCATTGCAGAGGGAACTTGCAGCCGTCAAGGAGGATCTTCA TCGCATGATTGGCAACATTCGCGCTGACCATGATCTGCAATTAAGGGAGATGGCCGAGAAAGGCATGAAGTTGGAGTCTG ACCTTAGGGCAACCGAGCCCTTTAAGAATGAAGCTATACAGCTGCGGTCTGAGGTTAAGAAACTTACTAATACCAAACAG GAACTCACAGGGAAGGTTCAGACACTTACACAAGAAGTTTCAAGGTTACAAGCTGAAAATCAACAAATTCCGATGTTGAG GTCTGATTTGGATAACATGCACCAAGAGCTAATGCGTGCCAGGTGTGTGGCTCGATTGTTAATGGTGTTTCCGTTTTTCT ATCTTCAAGCTCCTTTGTGATAGGTATTTCCACATTGGTTTGCTTAAACTGATGGTAAATGGTAATTACATTTTTTTTAG AACCATGGTGGATTATGAAAAGAAAGCAAATATGGATATCATGGAACAGAGTCAGTCAATGCAGAAAAACTTGGTTTCCA TGGCCCGGGAAGTTGAGAAATTGCGTGCTGAGCTTGCTAACGCTGATGGCAGACATTGGGGTGCTGGTATGACTTGTTTG TTATATTGTCCTTTGCAGAATTTATTATCCTCTAATAGATAACTCACATAACTGGAATTGAATCCATATCTTGGATACTC TGAATAGCAGTACTTTGAGGGTGGTGGTATCTCCCAATTTCCAGAAGGTGCATGTGTAGGGGTATGCTAAAAGAACTAAT GCAGCAGCATCAAATGATTTTCTGTTGTTGGATTATTGGATATGGATGTGATATTGATAAGCCACCAATCTTGGGAATAT CTTTGCATCATGACCTGAAACTGAAATCATGAATCATTTTTGAAAAGCCATCCTGACCCATTTAATTCCAATTTACCAAA ATATTAGTCTTGTTCTTTAGTCTATTTTTTGTTTCATGTTTGCTTCTTTCATGAAGGTGGAACTTATGGAACAAAGTTTG GTAGCCCAGACGGGGGTTATACAGCGCCATATGCAGATGGGTATGGTGTTCACCTGGTATGTGATTTACTTAATTTTTAC 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AGCTTCAGATTTTGTTACTAGTGGACCAGAAATTTTAGAGTAATGGTCAGAAATTTAAAATTTCAATCAACTTGTGAATA GTAGCAGCCTAGTTTTAGCTGTCAATGCATTCTATCTAAAATCTTAGGAACTAAGATCTCCTATAGGCTCAAACGATTTG TTGGATACTTGGAGCTGTTTGAATTTTAGGGTGGAACACCTTCCTCTTGTGTTGTTCCTATAGGTCTCAATTCTTATCAG GCTTCTATTATGAGCAAAGGAAAATTAAGATCTTGATTTGTATACATAACAAATCAGGTCAAGTGTATAATCATACAGTA TTGTTAATTGCTCCTGGATTGCTGGAAGACCCAGTTAACATGGATGTATTATAGCTAAAGTTGAATGCTTGCATCTTATA GGTTGAATTTGTTTCCAGTGGTGGGTTAAGTATACTGGTTTTTATTGCTAGTTTTCTCTAATGAGGGATTCATATAGCAG GATATGGAATTGTGGACACTACCTTGTTAAAGGGCATTAAGGCTGGAGCTAGTTTATTTATATTTTAGGTTATGTTATTA CTGCTGACCTTGACATGGATATTATGACTTGAAAAAAGCAGTCTCTCTTGTGTCATGAACCAACTACCCAAAAGCTTAAG CTATTGGGTAAAGGACACATGAATGGTTTTATATTATATATCTAACACTCTGGAATAAGCTTGACTGTGAGTCTGTGCGA GTAATGAGTGGAAAAGATGAACACACAGTTTCCTTAGTGAGATAAAGATCTTGGGGTTATGTGTACTTGTGTCCTGGTTT CGATTTAGATTGAAAATACTGATGTGGAGTTCTGCTAGTACTCAAGCACTTACCCTCACAAGTCTTTTGAGATTACTGGT TTACTTTATCAGGGTGATGGATGCTAGCATAGCTTTGTAGCTTGCTTATCTAGTGCTCATAATTTTGAATAAGATTTTTT CTATTATCATATAAAAGGTCTTTTATTTTGTTTTGATACTGCTATTTCTGTATGATATACCATTAAGTAGTATGTTCCTT CACTTGTTTTTTATTTTGGTTTCTTCATGTATTTTTTCCCCACAGAACTTTGTTTGCATTTGCAAGTAACTTACCATTCT ACCTAACCTTGTATTTATTATGGTTACAGGTTTTGGCTGGGAATCTGGTTTGGGACTGAGGAGTGATGTTGCCATAATGT TGTGAGATTTTGAGGAACACTGTAGGTCCTTTACGATTTCAAAAATACAAAACCGGATAACTTATCTTAGGTGAAGACTG GATGTCACTGGCAGAAGGAAGGATGTATTTTACCTGGTTGTGCTGGATCAGGATAACATATAGCCGCCTTTGTTGTTCGG ATCATATGATTGAGGTTGGAAATGAAAGCTTTGGTGGTACGCATGGATTGTTTCTTACGAGTTATGTGCTATAAGGTATG GCTGGTGCCATGGTAAGACATCTTCATGTATTGCTCAGTGCATAACTCAATTTCAGATTGATTCTATGCGCAGACTACTA TCAGTATGTTTAGAAACTCGTTCAAAAACCACATTGAAGTTAAAATCTTGGTGAAAGAGAAGCTACTTCCCTTAGCTTCT CCTATAGAGTAGAATTGATTATGGGTCTTGAAGACATAAAACCAAACATGCAAATTTTTTTGAAGCCTGTCGGGCAATGA TCCTTTACACCCAGTTTGTTTATCATTGGATTTTGGTTTAAATTTGTAGATGAGACTATGTTAGAAAATTTTAGCACCTT TTTTAGAATTTTAGCACTTTAGAGGGTTAAGTAAGAAATCACAACCATTGATTGAGAATGAGATTATGTTAATATACTTG TAAAGTGTATAACTAACTGTATTGTTTCTAAAATCTCAAAAGTTGATTTCTAATTAATGGTTGTGATGATTTACATTATC CTCTAAAGTGAATCTCTCACCTTAGAGGAGCTAAATTAATTAATGTGCCTCAAAGGACTTGAGGCGTAGTTTGTCGGTTC GAGTTGTCCTCTGTGCACCTACCCATACGCGCACAGCCTTGTTATGATCAAATAGCGGCTCAACAGGGGGTTCAGACTTC AGAGGTTGTTTTACCAGTCTAATTTTTCAGGGGCCAATTTTTATGGTGTTGGTTTTGCTGGGTTTGGTCATGGTTCTGCT GTTGTTTTCCAATTTTTAAATTCCCCTCCCCTTATTTCTGCTTTCTGTTGCCTTTACCATCAACAGTATTGAAGTTGCAA GTTGCTGTTTACTCCAACTTTGTAGTTTAGTTGTTCATGAGTAGGGAAGTGTTTGGATAAACAGTTTGATTAAGCACAGC ATTTACATTTACCACGAGTTATATTGTACCATGAGTTCAAATAGGTTGTTTCTTTTGAGTTTATGTAAATCTTGTTGATT TTTTTTTTTGAAAGTGTAATGCTTAATAATATTTTTGTGGAAATGAATTTAAAATGAACTGTGTTTATAAATTTATAACA CTTTATATTATACCATAATGCTTTCTTCAGATGTTGGTTTTTCATTAAAAGATGAATTTCTATTAAAATTTATTGTCATT TGGCCTTCACCATACTCGGGTTGGAATTGCAAGAGCAATTTAACGTACAAAAAAGAATTTTTATACATGTAGTCACATAT TATAATATTCAATGAGATTGATGTTTTAACTAATTATTGTAGTTAAACTGGTTAAATAGGATTTAAAACAAGGTTGAGTA TTTTTTTGTCATTGACAAATTTTGATTTTAGTTCCAGTTAAAATTTTATTCGACTTCACTGTATATAAAAATTAAAAAAT CGTGGTTTCAGTCCATGGTGAAAGATTCAAATCGCATATCTTTTGAATTTACAAGGATAAAAATTGAATAAATTTGTAAT AGTATTAAAACCAAACATTACAAATTTTAAGAAATTGAACGAAAACGGTAGTAACATACAATTTGTGGACATGAGCATAT TACACAGCTTATATTTATTCTGCTAGAATGGGAACACGTATTTCTGTGTAAAATGATAAGCAAAAGAATGGTCAGTCCTA TGTGTATAAACTAAAGAATAACTAATTGTGTGTTTGAATATCAATTGAGTGAATGAATTTCCATCCCAATTTATAAGAAG AATTATGCTCACTTTTTATCTTGAAGTGAGTACTAATGTCTGTTTGCATTCCAAACACAGCTTTAAGTGGTCGAGATAGG AGGTAACCATTTAGATCTTTTCCCTTTCACTAGAGATTCTGTATCAGGAAAATGACCCTCACCATCATTTGAGTCCTCCA AAGACCCTTCTTGAGTTACTTTCACAGGGTAAGTTACAAGGTGCACACCTTCCATGTCCACAATCTCTTCACCGCTGTAT ATTTCCCACATTTGATCTCCTATTAATCTGATTCTCTGCACACATTCCAAACTTTCTGGCTCTAAGAACAATTCCTCAGC ACTCCCAGTGTGCTCATACCATAGTGACATCCTGTATGCATGAATATCACCCTGGTTTATGAGGTGATCACCTCCATCTT GAGTCTGGTAGGCACCTATGGCAATCTCAGTGTCCCTTTGCCCGTCCATGGATCTTTGGTTCACATTTGCTGATCCTATT ATTATGTATACATCGTCCACTGTGGCAGAAGCAAGACAACAATATTTTAGCTAACCAAGATTATCAATACAAAATATTGT GGGTGAGCCTCGGCGCAAGGGTGAAGTTGCTGTCATGTGACTTTGCAGTCATAGGTTCGAGCCGTGGAATCAGCCTCTTG TAAAAATTCAAGGTAAGACTGCCCACATTAGATCCACAAAGTGGATCCGGCCCCTCCCCGGACCTCGTGCATAGTGAAGA CTTTATAGCACAAGGTTTGCCCTTTTTATCAATACAAAATACAAAATACAAAATACTAAGTGAAAAGTAGTGTAATCATA CCTATCATGAGCTTGGAGTGAACATAAACCATGAACCTCCTGTTCTTTTGAGCATTCCAGTATTGTGTTTCAGGATTTGG AGGATGTGGTGGAAGACACTCCCCTTTTTCCTTCTTTTCCCTATTTGCAAGGCAAAAGAAATTCAAATAGTCTTTTGGAT GCCCTGGCTCCCCACATTCTCTTATTGCTTCTCCAATCAACGTATACATCATTTTCATTGTTTCTCTGGTCCAATGCAGT ATATCTTGAACTGGTTCACTTTCAGGCACTCCTTCTGGCCACATTGGTATGACTATATACACTGCAAACCTTTCTCTTGC CTTAATCTTATTGACCACCTTGAGTGCAATTTCAATAGGAATCAGATTTCTGCAGCCACTATTCCTATCTTTCTCCCACA AATGGCATCCCCCAATGAAGTACTGGTTTTCAATGTATATAAACCTGTCAGCAAGCCTAATTGCTTCAACATAAGCTTCA TGGATGCTACTCTCCACAGTTAGTTTTCTAAATAGCTTGCTAACAGAAACGTTGTCAATTGACCTGTACACTTGAACTTT CCAATTCCTCTCTTTTGGGGTGCTTGAGGGAATTGGGATAAGGTTTAATAAGGTGCTAGCTGGGACTAAAAGAGAAGCAT CACATTGCTTTGTCCACCTTTGCTCAAAATTGGTTAACACATCCCAAGCAGCCTCTCCTGCAGGGACAAAACCAGGAAAA ATGGGTGAGACGAGCGGAATTTTAACACATTAAACAAAATTATCAACGACAAGCATATAACATCAGTATACTATTCTATT GAGGTTTTTTTTTCCTTCAAGGGATGACGGCCACATTTTGGCCCGATTTCTACCCGACTTCTAATACACTTGCACCCGTC CCTACTCACCTGTAACACAAGCATGAGCATCATGCCAAGCCTCTCTTGGCCCTCCTTTGTTGAGGCTAGCTCCTGCAATG TTTGTCTGGTAGAAGTCATGGTAATGTGATTCCTCATCAAGTGTTTGAAACAATGAATGTTTCTCTGTATCATATCTGCC ATCACACAAATCTAAACCCCCCAAGAAGCTCATGATCTCTTTTTCATTAACAGAGTTTGGTGCTTTGGTGTCCACAGTTA TGGTCTTCTGATGGTGAGCAAAGAGTGTTGGGAACATGTAGTGTAATCTTGGACACTTTCTGCATATTACTTTTGTGTGT TTGAAGTAAGAAAAAGTGTCCTCATCGTGTGTTTTCATCACACCCTTGTTCATGATAAAAGGCAAGGATGTCTCATCATC CCAAATCATAACCCTCACAGCCACTCCTTCCTCTGCCTTCTTCTTCAATAGCTCACCCAGCTTTATTTCTCTGGCATGAG GTATTTCTGTTTCAGGATCTCTAACCTGCACAAGGAGCATATTAGCTTCCCAACAATGGTATATATCTTACAAATATAAT ATGTACTATGAAATCATTCACGTGTCTTCACCCAAAAGTTGATAGTTAGTTTGTGACATAGTACCAGAGTCATTATAACC AAGTAATCTAGAGTTTGATGCATGTTGCCCCACTATGGCACTATGTAATAAAAAACTTAGTGCTTGTTTGGTTTACTTGG CGCAAACATGAAAACACTTTTGACGCATTAACGGAGAAATATGATTTAACCACATTGACTCAAACATGAGTTGACGTTGA GTTCATTGGAAATATAGACTTACAAAAGATTTTGGGATAATTGGTTCATTACAATATCAGCATAAAGAAAAAGTGTGAAA TGAGATTATATGTACCAGAACCATCTTGGGATTTAAGGACCAGCCTGCTATGTAAATCAAATATTTTGCACCCTCAATGG CTTTATACACATCCTCCCAAAGCTTTCTTGGAGCTCCACATACACCAAAAGGAGGTTGGAAAGCAGATGAGTGGTGAGCA TCATGATAGAGTTTAACCTCACAATTGGACCTTTGAGGAAATGTAACATTCCTCAGCCCTTGAAACTCCCCACTGCTAAT TAGCTTTTCCCAACCTGGTTCCATATATGCTGGCTTGAACCATAGCAAAAACCTTAGTTTAAGTTGTGGATTTGGCTTTC CATTTTCCATGAGGAGAGGGAAGAACCCGTTGATCAAGGTTTCTTCATTCAACCTCTGGGCCTGGATATGGAGCTTCCCC AATATGGTGCATGGTGTTTTCAGTGTAATGGTGATAGGTGAATCATCTTGATGAGCACATTGAATCTGAAAGGTTTGGTT CCAGACACGTTCACGTTCTAAGGTTGTTTTTGCCACCACATTGTTGTCTATCTTTATGGTCACATAAGCAGGCTTTCCAT TTACCAACAAACACTGAAAAAGATAATTTGTTGCATACTATGAGTTCACAAAAAACTGCAGGATTTCACAGAATAGCTAA AGCATTATTTTGGGCTCGTTTGGGTAAACAGTATAAGTAACTCTTATACAATTAGTTTTAAAACTAAAATCAATTATAAG TAGAAACTCATGTGAGTAGCTTCTGGGAGTCAGAATTGATTCGGACGAAAGAGAAAACGATCCTAACATGCTATAATTAA GCGCTTATGACAATAACGGTTTATTCATAAGCTAATTTGAAAAACATATTGAAATAAGTTCAATATAAGATTATATACAT CTATAATCATTTGTCCATAAACTAGTTTGAGCAGCTTATGAAAATAAACTCAAAACACCTAAGCAATTTTCACAAGTCCC ACCCAAATATTTGCATAAACACTCCTACAATAATATAAGATCATATAAGCTCTTCCAAACGCGGTCTCACGTTGAAGGGA AATCGATGTGAGTAAGGTGTGGCGTTGAAAATGGTAGCTTCAATTGTTCCATGGATGAGCTTAGGCTTTTCCTCCATCGC CTTATCCTTCATATGTTGACAAGGAGCAAATGAGAGAGACAGAAAACTATCAAATTTGGATTTGACTTATATAGGAATCT TTGTAAGTTACTACCCTCATATGTATTTGCCATAAAACTATCATATGTTTGATATATAAATGTTTAAGCTTGTTGTTACA TATGAAGAAGCAAAGGGAACCTTTGAATTCAATTGAACTCTTGGTAGGCACAGTTTGGGAAAACTTGTGGAATTAATCAG ACGTAGTCACAAACAAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0024700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAGGAAGGCACCGTGGTCACAGGGAACCGATGAGTGGCCGGAGGGGTTACCCACCTGAAGGGCCTTATACTCGTGG GCCGCCACCGATGCCACGACCGCATGTTCCCCCTCATCCGGCGCTGTTGGAAGAAGAGCTTGAATTGCAGCGTGCTGATA TGAGGAATCTTGCGGCGGAAAACAGGAGGCTTGTGGTGGAAAACAGGAACCTGAATGATGACAGGATGGCATTGCAGAGG GAACTTGCAGCCGTCAAGGAGGATCTTCATCGCATGATTGGCAACATTCGCGCTGACCATGATCTGCAATTAAGGGAGAT GGCCGAGAAAGGCATGAAGTTGGAGTCTGACCTTAGGGCAACCGAGCCCTTTAAGAATGAAGCTATACAGCTGCGGTCTG AGGTTAAGAAACTTACTAATACCAAACAGGAACTCACAGGGAAGGTTCAGACACTTACACAAGAAGTTTCAAGGTTACAA GCTGAAAATCAACAAATTCCGATGTTGAGGTCTGATTTGGATAACATGCACCAAGAGCTAATGCGTGCCAGAACCATGGT GGATTATGAAAAGAAAGCAAATATGGATATCATGGAACAGAGTCAGTCAATGCAGAAAAACTTGGTTTCCATGGCCCGGG AAGTTGAGAAATTGCGTGCTGAGCTTGCTAACGCTGATGGCAGACATTGGGGTGCTGGTGGAACTTATGGAACAAAGTTT GGTAGCCCAGACGGGGGTTATACAGCGCCATATGCAGATGGGTATGGTGTTCACCTGGGTGCTGCAGAGAAAGGTTCTCT GTATGGGGCTAGTGCTGCTTCAAGGCCTGAGAAACCTCGCATGAATCGTCGTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0024700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAGRHRGHREPMSGRRGYPPEGPYTRGPPPMPRPHVPPHPALLEEELELQRADMRNLAAENRRLVVENRNLNDDRMALQR ELAAVKEDLHRMIGNIRADHDLQLREMAEKGMKLESDLRATEPFKNEAIQLRSEVKKLTNTKQELTGKVQTLTQEVSRLQ AENQQIPMLRSDLDNMHQELMRARTMVDYEKKANMDIMEQSQSMQKNLVSMAREVEKLRAELANADGRHWGAGGTYGTKF GSPDGGYTAPYADGYGVHLGAAEKGSLYGASAASRPEKPRMNRR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 39 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 15 | 15 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 258 | 258 | 1.2E-97 | – | |
| PANTHER | 1 | 258 | 258 | 1.2E-97 | ||
| MobiDBLite | 22 | 38 | 17 | - | – | |
| Coils | 42 | 88 | 47 | - | – | |
| Coils | 128 | 162 | 35 | - | – | |
| Coils | 201 | 228 | 28 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0024700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…