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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0063200 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0063200.3 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Embryo defective 2410 protein; TAIR: AT2G25660.2 embryo defective 2410; Swiss-Prot: sp|B8DC21|CCA_LISMH CCA-adding enzyme; TrEMBL-Plants: tr|V7CWH3|V7CWH3_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0063200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:10585160..10607962) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACGAGCCTGAAAAACCACTCCACTTTTTTCGGGACTAAGCTTCATGCTTCTTTCGAAACCAACAGGAACAACCCTTTTCA TTTCCAGAAAAGAAGGTTGCAAAAAAAGGGTCTTTTTTGCAGTTGCAGCACAAAACGTTGTCGTCTGGTAAGCCAAGCGT TACGGTTTTCGCATTTTTCTGGCCAAAATGTAGAATTCTTGAGGAAAGACCAAATTTTGAGAAGTGGGTCGAGGTTAAAA TGTGCAAAGGAAAAGGAACCCATTTTTACAAGAGAGGCTTTGGTTAGTTATTTGACCCCTTTGTGGAAAGAGGGTCTTCT TTTGATAAGGGCTTCTGTTTACACTGCTGTTTTGTGTGGAGTTTGCATGTTAGTGTGGTATGGTCAGAATAAGGTTAAGG GTTATGTTGAAACCAATTTGCTGCCTTCTGCTTGTGAAGCAATTAGTGAGTATATTCAGCGTGACCTTGTGTTTGGTAAG GTTCGACGAGTCTCGCCGTTGAGTATTACGTTGGAGTCCTGCTCGTTTGGGCCGCATAAGGAGGAGTTTTCGTGTGGGGA GGTTCCTACGGTTAAGCTTCGTCTTAGGCCTTTCGCGAGTTTGAGGACGGGGAAGTTGGTGATTGATGCGGTTTTGTCGA ATCCGAGTGTTTTGGTTGTGCAGAAGAAGGATTATACTTGGTTGGGGATACCGTTCAATGAAGGCGGCAGAGAGAGGCAC TATTCGACTGAGGAAGGGATAGATCATCGTACTAGAACGCGGAGGCTTGCGCGAGAGGAAGGTGTTGGGCGGTGGGAAAG AGCAAGGGATGATGAAGCTCGGGAAGCTGCTGAGGCGGGTTTCTTTGTTTCTGAGCGGAGTTGTTGTCCATCCGGAGGTG AGGGTTTAAAGGAGGTCGAAAGTTGTTCAGCCGAGTTAACTGATACCACACCCTTTTTCTGCACGAATGGTGGGAAGCAT 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TTGGAAGTACGGGCCCAAAAGATATTAAGGTTTCTCTCTTAACTTCACTAGAGGGTTTCTTAGTCTTGACATAGATATGG ATATAAAGCGGCTGATTTGACCTTCAAACCATAAATGTCATGGATTTCTGGAAGTGTACTCTTTCCCCACACCTGATTCC TTTTAATTTTTTTTTCTACTTGTCAGTGGTCAGGTTGATTCTCAGTTGCAAATAACTGGTTCGATATTGCAACCAAACAT ATCTGGGAATATCAAACTAAGTCACGGAGAAGCATATTTGCCACACGATCGAGGTGGTGCTCATGCTTCTAATAGATTCC CATCAAATCAATCAGTGCTTCCTGCTGGTGGCATTAGTAAAATGTTTGCATCAAGATATGTTTCACGATTTTTCAGCTCA GAATCTGCTTCTTCAAGGGCCACAAATTCTCAATCCTCTGGCTCTGGTATTACTTTACATGTGTATCAGTTTAGCCTGCG ATCTCTTTTTTCTTATGATTAGATGCTAAATGCTCTACAATCAAAATGGACCCCCTTACAATTTAATGAAAACAATGTTA TCAACAGTGGAATCCTGTTTATAATGAATTACTAATTCAAATACCGTTGTGGCCTGTGATGGAAGCATGGTCGCACTTAT ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTTGAAAAGCTCTGAATATAAACCAATGACATGTCAA AAAGAATAAATAAACTACAAGCATTTTGTAGATAAGTTTTGGCAGCTAATAATCTCTTTAAATTATGAGGTAACTGTTTT AGACCATCTAAAGATTTGGGCAATTTGCAAACAAAACTTGACTCCACTTGTGCAACAAAACCCTGTGATAGCTCCTGATA AATCTCCTCCTTCTAGTCACCATGTAGGAAGGCATTTATAATGTACAACTGATATAGAGGCTGATGTTTCATGGCAGCCA TAGTTAATTAAAAATGAACAAAAGCTATTTTAGCACTCGTTAAGAGGTATCACCATAATCCAAGAATCGAATATGATCAA CATCCACGTTCTTCCTTTGATACACCGTGGTAATTTGTGGCTTAGGCGTGGGTTTACTGAGAATGCTCAATCTAATGTAA ATCAAAGTGTGACTTGGAGATTAACCTTCATAAAAAGAATATATAAGTGCTGAATCATGTGAAAGGATAGCATCTCACAG TAAGAATATTTTATGCGATTTTTAGCATGCTCAATAGTTCATCATTAACCTTACGAGATGCTAGGATCAATTATTTGATT TCTTGATCTTCTACTTTTGCTTATGTTTATATATTTTACTTTAGTTAATTATGTTGTATTTATCACATTGGCTGTTAGTG CATATTATGATCTCTTCCTTGAAAACAACTGTGGCAGTTAATAATGCAACTCAGGTTGAAAAGCAGACAGAGGATGTGCA GATTAAACCAGATCTAGAAATCTGCCTTAGTGATTTGAAGCTTGTGCTTGGACCAGAGTTGAAGATAGTTTATCCTTTGA TCCTTAATTTTGCTGTGAGTGGAGAGCTTGAGTTGAATGGTCTTGCCCATCCCAAATGGATAAAACCTAGAGGCATACTG GCATTTGAAAATGGTGAAGTTGATTTAGTTGCAACCCAGGTTTGTGTAATGTTTTACTCTGTTACTTTTTTAAATTGTAT CCTGTGGTTTCTTCTAAGCTAGTTTCATTTTGGTTTGTCTCATAAATTTCTCAAGTCTTAACCCATTGTTTATTTTGGTA CAATCCATTTCAAATGCAGGTTCGGTTAAAACGAGAGCATTTGAATATTGCAAAATTTGAGCCTGAGTATGGACTAGATC CAATGCTAGATTTGGTTTTGGTTGGATCTGAGTGGCAATTTAGAATTCAAGGTAGAGCTAGCAATTGGCAGGACAAACTT 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CATTGTCTGTGTAAGTGTACCTGAACACATTAGTAATAAAAGTAAGTCACTCATAGAATCAGCCAAGAATGTAAAGAGAA AGAGTACTATTATGCAAGATGAACCTGTCTTAAATAGCAATTAGAGAGAATGTACACTGGTGTAGAGCATTCGAGATGCT CCACTCTCTCCCAAGTCCCATATGGTCCCAAGGATACCCTACTCTCACTAAACTCTTATTTATAATGCTCTCAATAACTA ACTCCCTTAACTAACCGAACTTGACTAATCCAAACTACTAACTAACTAACAATGTTATGTGGAACAGGATGCCCTTTCAC CTGCTGAGGTAAAGTGAAAGTGGCTTCTATGATATGATGTTTGAGCAGAGTGGTCCTATTAATATTTTTTTTTTTTATCA ATGCAGGCTGCCAGAAGATTTGAGAGTCAGTTGGCTGAATCCATTTTGGAAGGCAATGGGCAACTTGCATTTGAAAAACT TGCAACTGCAACTCTTGAAAAGTTGATGCCACGAATAGAAGGGAAGGGAGAGATTGGCCACGCAAGGTGGAGAGTCGTGT ATGCACCTCAGATTCCTAGTTTGGTTTCTGTTGATCCTACGGCAGATCCTCTCAAGTCTCTAGCTAGTAATATATCGTTT GGTACAGAAGTTGAAGTCCAGCTTGGGAAACGACTTCAGGTAAGTATAATATAAGTAGTTAAATTTTCAGAACTTTCTTC CCGAGACCTATGATACTGTTAATTTACGTTGCCATGAAAATATTAAATCTCTATCAATATAGCAAAAAGAATACCCATAG TATTGCTTTATAATGAAAGCAATAGATAATGCACAAAAAAAAAGGTTTTGTAGGTAAAAGTTTTCCTAGTTTAAGAATAG TAAGCAGTTCCTCATCAAACTCTGTTTGAACAATTGTTAACTGGATAAATATCTCATTCACTAGTATTCCTACGCCAAAT CCTTTTTTATCTTTTATATTTTTCATAAATATTCCCTTGAAATAATCTTGTGGTGCTTGGTCTGTCACTTTTATTTTATT GCCAGTGGGTTTCGTTTTGATGATTTTATTGGGTAGATGTTTGCTATTCATTAAGCCAACATTCTGAAGTTGCCAGTGCA CATTTCAAGGCAGCTTGAATGTACTGTTGGCCAATTCATGTCTCTTGTGAGTGAATGTGTTTTTGCCAACTTGAACGTAA ATACAAACACACGTAGTTGTTGCTATATTCCTACATCATATAGAAGCATCAACCGATAGTTGGTTCAGGTGGCACATGCC TGATTCCCCTTTAAGCATGGTCCGAGTTTGAGTATTGTGAATGGAAAAAACCCAAGCCCCAGTATGATGTGGATGTTTCC AGCTTGAACAAGATTCTCTCTTGAAATACATAAAAAAAAAAACTTATATTATACAGTGAAATACCAAATCCTTTCTGTGG TTTTAACTGAGAACCTTGGCCTACGTTAAACTGCATTTTCTACCTTTATTCTTTTTTTAATATCTTATAATTATCTAAGG TGATTGTTTCTTTCAGGCCACAGTCGTGCGGCAAATGAAGGAATCCGAGATGGCAATGCAGTGGACCTTGAGCTATCTTC TTACAAGTCGTTTGCGGGTGCTCTTACAATCTGCTCCATCCAAACGCATTCTTTTTGAATATTCTGCTACATCCCAGGAT TGA
CDS sequence (LotjaGi5g1v0063200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTAGTGTGGTATGGTCAGAATAAGGTTAAGGGTTATGTTGAAACCAATTTGCTGCCTTCTGCTTGTGAAGCAATTAG TGAGTATATTCAGCGTGACCTTGTGTTTGGTAAGGTTCGACGAGTCTCGCCGTTGAGTATTACGTTGGAGTCCTGCTCGT TTGGGCCGCATAAGGAGGAGTTTTCGTGTGGGGAGGTTCCTACGGTTAAGCTTCGTCTTAGGCCTTTCGCGAGTTTGAGG ACGGGGAAGTTGGTGATTGATGCGGTTTTGTCGAATCCGAGTGTTTTGGTTGTGCAGAAGAAGGATTATACTTGGTTGGG GATACCGTTCAATGAAGGCGGCAGAGAGAGGCACTATTCGACTGAGGAAGGGATAGATCATCGTACTAGAACGCGGAGGC TTGCGCGAGAGGAAGGTGTTGGGCGGTGGGAAAGAGCAAGGGATGATGAAGCTCGGGAAGCTGCTGAGGCGGGTTTCTTT GTTTCTGAGCGGAGTTGTTGTCCATCCGGAGGTGAGGGTTTAAAGGAGGTCGAAAGTTGTTCAGCCGAGTTAACTGATAC CACACCCTTTTTCTGCACGAATGGTGGGAAGCATGATCATCGGTTTATGGACACAGGTGTTGATTATGATGTGAAACATT CCTATTTGGAAAAATCATTTGGAGTGAGATTTCCTGTTTCTGGACTTCGATTTTGGTCCAGAGTAATATCAGGGCGTAAG AGACACAAATTTAAGAGGAAAGCTAATGGGAGTGACATCTATGCATCTGGTGTTGCTATGAAAAAAAGAATATTTGATCG TAGTGCTTCAGCAGCTCGCACATACTTTGATGATCAATCAAATGGAAAGTTTGGAGAGCCTGCATCACCTTCTCAATGTT TTCATTTTATGAATCATGACATGCATGTGGTGAAAAGTGAGTTTGACAAAAATGCAAATTCTGTTACGGTTGGTGATGAA AATAGAAGTGATGATAACCAAATTGCTGCACAAATTAGAGATATGAGAATCTGGCCCTCCTTGGTAAATGAAAATGACAG AGCTCATTCAGGTTATGGCAAATTTGTCTCTGATCCTACTTTACAGACAAGAGAGAGTGAACTTGAAAATTTGCAATCCA GTGAGGAAGTTGCAGAACCTGCCAATGGTAATAGTAGTACAGAGAAAAATGAAGAGTTGGTACCTCCTGTTGAAGACAAT CATTTTGAGGATGAAGATTTTTCTGGGGGCCAACCAGGTTTAACATCTGAAGATTTTGATTTTGTGAAGCCTAAGCCTCG ATTGGCAGCTGATTTTAAAATTCCATTTGAGCCCTTGATTGAGAAATTTGGCTTAACCTCCTCTTTAAGAAATTTTGAGC AGCTGATATCTTCCTTTCTTTCTGGTCCCATTGAAAAGTTGAAGTTGGATGTGGGTCTGAAAGTTGAAGATCTTGTAGCA GAACATGTTGATGGGGTTGATTTTGTGCAGTCTGAAGGCATTAATAAGATGCTTCCTGTAACATTGGATTCTGTTCATTT CAGAGGTGCAACGGTGATGCTACTTGCATATGGTGACAGGGAACACAGCATAAGGGAGATGGAGAATGTAAATGGGCATG TAAAGTTCCAAAATCACTATAGTCGCATACATGTGCATCTTAGTGGAAATTGTAATACTTGGAGATCGGATATTATATCT GAAGATGGGGGCTGGTTGTCTGCTAATATTTTTGTTGATACTCTTGAGCAGAATTGGCATGCTAATTTAAAAGTTGACAA TCTTTTTGTCCCGCTGTTTGAAAGGATCTTAGAAATTCCAATTACGTGGTCTAAAGGGAGGGCTAGTGGCGAGGTCCACT TGTGCATGTCAAAGGGGGAAACTTTTCCAAATTTTCATGGACAGCTTGATGTGACAGGGTTGGATTTTCAACTATTGGAT GCGCCATCATGTTTTTCTAAAATATCAGTGAGTTTATGTTTTCGTGGGCAAAGAATATTTTTACACAATGCAAATGGCTG GTTTGGCAGTGTTCCTCTTGAAGCATCAGGAGACTTCGGCATTAATCCTGAAGAAGGAGAGTTTCATCTTATGTGTCAGG TTCCAGCGGTCGAAGTGAATGCTTTGATGAGAACTTTTAAGATGAGACCGCTCTTATTTCCGCTAGCTGGATCAGTAACT GCTCTATTCAATTGTCAAGGCCCGCTTGATGCTCCTGTCTTTGTAGGAACTGGAATGGTTTCTAGGACGTTCTCTTATTT ACCAATTGACACCGCTGCATCTGTATCATCTGAAGCAGTTTCTGCAAGTAAGGAGGCTGGTGCGCTGGCAGCATTTGATC GCGTTCCATTTTCTTATGTATCTGCCAATTTCACTTTCAACACTGATAACTGTGTTGCTGATTTATATGGAATTAGGGCG TGTCTTGTAGATGGTGGTGAAATTCGAGGGGCTGGGAATGCATGGATATGCCCCGAGGGGGAGGAGGATGAGACAGCAAT AGACGTGAATTTATCTGGAAGTTTGGCCATCGATAACATCTTGCCTCGTTACATTCCAAGTAATTTTCATCAGATGCCAC TCAAGTTAGGGGTATTAAATGGAGAAACGAAACTTTCAGGATCTCTTCTAAAACCAAGGTTTGATATAAAGTGGACTGCA CCTATAGCAGAAGGATCTTTCAATGATGCTCGAGGAGATATCATAATCTCACATGATTTTATTACTGTGAATTCTTCCTC AGCTGCATTTGATCTGTATACGAGGATTCAAACATCTTATCCTGGTGATTTCTATCTTAAAAATGAAGAGTTTTATGCAC CAAGAGCCATTCCATTTACAATTGATGGAGTTGAGTTGGATTTACGTATGCGTGGGTTTGAATTCTTCAGTTTGGTTTCT GCGTATACTATGGATTCTCCAAAGCCTTTGCATTTGAAAGCAACTGGAAGGATCAAGTTTCAGGGAAAGGTTTTAAAGCC TAGTGGCAGTATCAGTGAACAAAATTTTGAGATGAATAGGCAGCATGTGCAAATGTTGGAGAAAGGAATCACAGATAGTC TTGATGGAGAGATTTCAATCTCTGGTCTGAAATTGAACCAATTGATGCTTGCACCCCAGTTGTCTGGGTTGTTGAGAATT TCTCCTGAGCGTATCAAGCTGGATGCTTCGGGTAGGCCTGATGAAAGTCTTGTAGTGGAGTTTGTTGGGCCACTGCAACC CAGTAATGAAGATGGTCTGCAAACTGGAAAACTGTTGTCCATTTCCCTACAGAAAGGGCAATTGAGGGCTAACATTTGTT TTCAACCATTTCATTCTGCTAACTTGGAGGTGCGGCATTTTCCACTTGATGAATTGGAGCTTGCTTCTCTTCGGGGGACA ATACAGAGAGCAGAATTCCAACTTAATCTTCACAAAAGAAGAGGACAAGGTGTCCTATCTGTACTTCGGCCAAAATTCAG TGGTGTGCTTGGTGAAGCCCTAGATGTTGCAGCTAGGTGGAGTGGAGATGTTATCACTATTGAAAAAACTGTGTTGCAAC AAAACTACAGTTGCTATGAACTTCAAGGTGAATACATTTTGCCAGGCACCCGAGATCGTAATCCTGTTGAAAAAGAAGGA GGTGGCCTTATGAAAAGGCTAATGTCTGGGCATATTGGCAGTGCTATTTCCTCAATGGGCAGGTGGAGAATGAAACTTGA AGTTTGTAAAGCCGACGTTGCTGAGATGCTTCCTCTTGCAAGGCTTCTTTCCAGAAGCATGGATCCTGCTGTTCATTCAA GATCTAAGGATTTCTTCGTTCAAAGTTTACACTCAGTGGGATTATATACTGAAAGCCTTCAACAACTGCTTGAGAAAATG AGAGGGCTTCATGCTCCATCAGATGATGTTGTTCTTGAAGATGTAACGCTGCCTGGTTTATCTGAACTGAAAGGTCACTG GCGTGGATCTCTTGATGCTAGCGGTGGAGGAAACGGGGACACCCTGGCAGAATTTGACTTTCATGGGGAGGACTGGGAGT GGGGAGACTACAAAACTCAGCGTGTGGTGGCAGTGGGTGCTTACAGTAATGATGATGGGTTGCACCTGGAGAAGATTTTT ATCCAGAAGGATAATGCGACCATCCATGCAGATGGAACATTGTTAGGACCTAAAACAAACCTCCACTTTGCTGTCTTAAA TTTTCCCATCAGTCTGGTCCCCACTGTAGTTCAGGTCATTGAATCTACCGCAACAGATATTGTTCATTCTCTGCGGCAAT TGTTAGCGCCCATTAAGGGTATATTGCATATGGAAGGAGATCTCAGAGGAAGTTTAGCAAAACCAGAATGTGATGTGCAA GTAAGGCTCTTGGATGGTGCCATTGGTGGTATTGATCTTGGGCGAGCAGAAGTTGTTGCTTCTCTAACCTCAACCAGTCG ATTTCTATTCAATGCAAAACTTGAACCTATAATCCAAAATGGCCATGTACTCATTCAAGGTAGCATTCCTGTTGCTTTTG TGCAAAATAACACCTTACAAGAAGATGCAGAATTGGATACGAGTCGAACTACCTGGGTACCTGATTGGGTGAAGGAGAAG AATAGAGGGACTGCTGATGATGCAAGTGATAAAAAAGTTTCTAGAGATAGAAATGAAGAAAGTTGGAATACTCAATTAGC AGAAAGTCTTAAAGGTTTAAATTGGCAAATTTTAGATGTTGGAGAGGTCAGGATTGATGCTGACATAAAAGATGGGGGAA TGACATTGGTAACAGCCTTATCTCCTCATGCCAATTGGCTTCAGGGCAATGCTGATGTCATGCTTGAGGTCAGAGGCACA GTTGATCAACCGGTACTTAATGGACACGCATCTTTCCACCGGGCATCTATTTCTTCACCAGTGCTCCGAAAGCCACTAAC CAACTTTGGGGGAACTGTTCATGTGAAATCAAACAGGTTGTCCATCACATCACTAGAAAGTAGGGTAAGCAGAAAAGGAA AGCTCCTTGTGAAAGGGAACCTACCACTCAGAACTAGTGAAGCAGCCCCTGATGACAAGATTGAATTGAAGTGTGAAGTT TTGGAAGTACGGGCCCAAAAGATATTAAGGTTTCTCTCTTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0063200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLVWYGQNKVKGYVETNLLPSACEAISEYIQRDLVFGKVRRVSPLSITLESCSFGPHKEEFSCGEVPTVKLRLRPFASLR TGKLVIDAVLSNPSVLVVQKKDYTWLGIPFNEGGRERHYSTEEGIDHRTRTRRLAREEGVGRWERARDDEAREAAEAGFF VSERSCCPSGGEGLKEVESCSAELTDTTPFFCTNGGKHDHRFMDTGVDYDVKHSYLEKSFGVRFPVSGLRFWSRVISGRK RHKFKRKANGSDIYASGVAMKKRIFDRSASAARTYFDDQSNGKFGEPASPSQCFHFMNHDMHVVKSEFDKNANSVTVGDE NRSDDNQIAAQIRDMRIWPSLVNENDRAHSGYGKFVSDPTLQTRESELENLQSSEEVAEPANGNSSTEKNEELVPPVEDN HFEDEDFSGGQPGLTSEDFDFVKPKPRLAADFKIPFEPLIEKFGLTSSLRNFEQLISSFLSGPIEKLKLDVGLKVEDLVA EHVDGVDFVQSEGINKMLPVTLDSVHFRGATVMLLAYGDREHSIREMENVNGHVKFQNHYSRIHVHLSGNCNTWRSDIIS EDGGWLSANIFVDTLEQNWHANLKVDNLFVPLFERILEIPITWSKGRASGEVHLCMSKGETFPNFHGQLDVTGLDFQLLD APSCFSKISVSLCFRGQRIFLHNANGWFGSVPLEASGDFGINPEEGEFHLMCQVPAVEVNALMRTFKMRPLLFPLAGSVT ALFNCQGPLDAPVFVGTGMVSRTFSYLPIDTAASVSSEAVSASKEAGALAAFDRVPFSYVSANFTFNTDNCVADLYGIRA CLVDGGEIRGAGNAWICPEGEEDETAIDVNLSGSLAIDNILPRYIPSNFHQMPLKLGVLNGETKLSGSLLKPRFDIKWTA PIAEGSFNDARGDIIISHDFITVNSSSAAFDLYTRIQTSYPGDFYLKNEEFYAPRAIPFTIDGVELDLRMRGFEFFSLVS AYTMDSPKPLHLKATGRIKFQGKVLKPSGSISEQNFEMNRQHVQMLEKGITDSLDGEISISGLKLNQLMLAPQLSGLLRI SPERIKLDASGRPDESLVVEFVGPLQPSNEDGLQTGKLLSISLQKGQLRANICFQPFHSANLEVRHFPLDELELASLRGT IQRAEFQLNLHKRRGQGVLSVLRPKFSGVLGEALDVAARWSGDVITIEKTVLQQNYSCYELQGEYILPGTRDRNPVEKEG GGLMKRLMSGHIGSAISSMGRWRMKLEVCKADVAEMLPLARLLSRSMDPAVHSRSKDFFVQSLHSVGLYTESLQQLLEKM RGLHAPSDDVVLEDVTLPGLSELKGHWRGSLDASGGGNGDTLAEFDFHGEDWEWGDYKTQRVVAVGAYSNDDGLHLEKIF IQKDNATIHADGTLLGPKTNLHFAVLNFPISLVPTVVQVIESTATDIVHSLRQLLAPIKGILHMEGDLRGSLAKPECDVQ VRLLDGAIGGIDLGRAEVVASLTSTSRFLFNAKLEPIIQNGHVLIQGSIPVAFVQNNTLQEDAELDTSRTTWVPDWVKEK NRGTADDASDKKVSRDRNEESWNTQLAESLKGLNWQILDVGEVRIDADIKDGGMTLVTALSPHANWLQGNADVMLEVRGT VDQPVLNGHASFHRASISSPVLRKPLTNFGGTVHVKSNRLSITSLESRVSRKGKLLVKGNLPLRTSEAAPDDKIELKCEV LEVRAQKILRFLS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1689 | 1689 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1689 | 1689 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 352 | 418 | 67 | - | – | |
| MobiDBLite | 356 | 391 | 36 | - | – | |
| MobiDBLite | 392 | 406 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1521 | 1541 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0063200.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…