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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0220300 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0220300.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Nucleolar GTPase, putative; TAIR: AT3G58120.1 Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein; TrEMBL-Plants: tr|G7I832|G7I832_MEDTR Nucleolar GTPase, putative; Found in the gene: LotjaGi5g1v0220300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:52657401..52684698) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GAAAAAAAATAGAGCGAAGAAAATCCATATAATGATGGGTGTAGTTGTGCCGTTACACGTCAGCCATTACATTCTTCTTC TTCCGTTTGCAAACGAACCCAATTCAGACACAGAGATCCTCCGATTCATTCATTCGAGAATCTCTGAGCTATGGCGGAGG AAGAGGAAGATGACGAGAGCTTCGGTGACTTCAAGTTCGCGTCCTTTCCAAATCAACCCACCGAATCCTCTAACCACTTC AATGGAGGAGGAGGAGGAGCCTCGTCAAAACCCTTCGACCCTTTCGCCGTTCCCCCCTCCGATCCCGCCGTTCCGGCGAA GAAGCCTCATGGAGCTATTCCTCTTTCAATCTTCGGCGAGGAAGAGGAGGAGGTAGAGGAACCTGCTCCTGCCAATGTCT TTTTCTCCAACGGTGGTGGCGGTGCGGTGAAAAACGGATCCGATTCGAATGGAATCAGTAATTTGATTTCCGGTTTGTAT ACTCAGCAGCGCCCTCATGTGAGTTCTGAAAACGGATCAGCTTCCACATCCAATGGTGGTGTAACGAATTCGAACGCGAG GGATTTGAATCCAGATTCTGAGGACGAGGATGGATGGGAATTCAAGTCGGCGGAATGGGAAACTGGAAACAAGAGCCTGA ATATTCAGGTAATGTATGCTTGATCCATGCCCCTCAGCTTCTTCAACAAATGTGAATGGATTCTTTTTTACATAGCTTGT TGAGTATGAAACTAGCTTTAGGAAACTATGCACTTTACATATTTATGTAATTATTGAATTTGCATTTGAAATGAAATGAG AGAAAGGGTTGCAAGATATGCAAAAAAAAAAGGGTTTTGATCATGTTAGGACTGCGACGTGTATACAGATTAGAGTAGAG AGAAACACACGAAAGTTTTGATCACACAGTTTGGCCAAATTGCTTACGTATGCTACTATAGAGCAGTTATAGTTCCGTTT 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AAGGTAGAGTAATTAAAGAGGATATCTTTAGAACTCAGCGAAAGAGACATCAATTTTTATGGCCTTTGCCATCTTCAAAT GTTATCATTGTCTAAACTATTGATTTTTTAAAGCAAAACGTGTTTATTGAATTATAAAAGCGTCGAGATACAAGTCTTCT CTAACATTGTTGGCTGCAGATGGAGTATTTATGCAAGGAGAGGCACAAGCTGAAGTGGCAGATCCAACATTGGTGGCTGC AGATGGAGCAATTATGCAAGGAGAGGCACAAGCTCAAGTGGCAAATCCAACATTGGTAGCAGATGGAGAAATTATGCAAG GAGAGGCACAAGCTCAAGCGGCAGATGGAGCAAGTATGCAAGCAGAGGCACAAGTGAGTCTTGGCCAAAGTGATGAAATG AATATGCGTCCAAACTTTCTTATTCATTTCATCACTTTGGCCAAGACTCACTTGTGCCTCTGCTTGCATACTTGCTCCAT CTGCCACTTGAGCTTGTGCCTCTCCTTGCATAATTGCTCCATCTGCCACCAATGTTGGATCTGCCACTTGAGCTTGTGCC TCTCCTTGCATAATTGCTCCATCTGCAGCCACCAATGTTGGATCTGCCACTTCAGCTTGTGCCTCTCCTTGCATAAATAC TCCATCTGCAGCCAACAATGTTAGAGAAGACTTGTATCTCGACGCTTTTATAATTCAATAAACATGTTTTGCTTTAAAAA ATCGATGGTTTAGACAATGATAACATTTGAAGATGGCAAAGACCATAAAAATTGATGTCTCTTTCGCTGAAATCTAAGGA TATCCTCTTTAATTACTCTACCTTTGGTCATTTTTCCCTTTAAATTTGTGTAGACAAAGTAATAAGTAATCGTGGTTTAG TCTATAGTACTATTTGATGTTGTGTTTGAATGTGTCTTCTTGTCAAAATTTCTAGTTGAATAAATGTACTCACTCAGTCA TAGTAATTACGTGTTTTGAAGAATTTGTGCAATTATGCGATTATCTATCGTTAACAATTGCTCAAGAATAAGTTCGAGAA AAAATATAAGTTTGATAAGGTTAGTTCCCGTTAGGCAATACATCTAAAAGAAAATGAAATGACAATATGATATGATTAGG ATTTTGGGGGAGGGGGAAGATGTGTATAATAAAAGAGAGAAAGTGAGGAGAAGATAGATTTTCTAAACATGCTATAAAGT GATTAAATACATTTTTTCCCTTCAAAAAATATTTCAATACTTCAGTCCAAACTTGAAAGTGTACTAATGGTGAGAGTGTG AAAGAAAATCCCATATATATATATATATATATATATACTTTTGCCTAAAAAAGATAGTGGAACTAGGAACAAACTAATAA AAAATTGTAAATAGATTGGTTTTGCAGGAAAGAAAAAGCAAAAGAAGAGTAAAATAAACACACATTTTATTATTATTACT ATTCATGTATCCAAAACCAATTTATGAATCTCAATGTCAAGTTTTTTTATTTTTTTACTTTTATTTCATTTCCTAATTCC TCAATTCGAAATCAGATGTCGTGTCATAATCTCTCAATTCATAAGAAAAATCACTTTAATGTGTTATGATGGTGAAAAAA CTAATGTGAATTCAAAAAATTTGGATCAATAAATATGCGAGTAAATAGATAGATATCAAAGGTTTTCAAATGTTGCATGC AACCAATTTACCTTGGAGATCATGGATTTAATTGGTTGGTACATCTTTCATCTTCATCACTGTCTTCAGATCCTCTAATG AGCTTCAACACCGACGTCATTTCCCCCTTCGCTTGGAGAAAATTGACCACCTTGATGAGAGAGATCGAACGCGAGAGCGG AAAACGAGCCTCGAGGGTGAAAACCACCTTAAGGGAAACGATGGAGAAAACATTGAAGGGGAAATGGAGGAAAATGTGCA ATGGAACAGAGGAAAGCCACAAAATAATCGACAAGTTCATGGAAGAACTGAGATTTATGAGAGAAACTTCATAGAAAAGG TGAAGCGGCCGAGGGGTGAGAGTGAGGCAGAGGTACACTAGGGTTAGGTTTATAAATAGCATTGCTAGTTGGGCTGGGCC TGAATAAATAAAACAATGGGCTGGACTGGACCAACCGATTTTTGACAAACATAGTAAATCTCCAGTCTCGCACTCGATCG AACTATGAACTATACTGTTTAGGGTTTGTGGTTTAGAGTTCACGGGCCAAACCGTCATAAAGTCAATATCCATTTTCAGC CGTTGATTTCAATTTACAATGGATGGGGGTTTCAGATTAGCAAAACTGACGAAAAATTGCCATAACTAGAGCCAGAAAGT CAAAAACAAAACGCAAAACCCTCTTCTTACTTAGCCACACTCTCTTGCTCGCTCTCACTCAACCCTTTTTCACCCTTGAC GGCGGCGCGTGAAGATAACGAACGATGTTGGATATCAACCTGTTCCGGGAAGAGAAGGGCCACAACCCTGAAATCATCCG CGAATCTCAACGCCGCCGTTTCGCCTCCGTCGAGGTCGTCGACGAGGTCATCGATCTCGACAAAGAATGGCGAAAGCGTG CGCTCTCTCACAATCTCTCTTCAGTTCTACAATGTCTGTTATCAGCGTAACTGATTTTGATGTATTGATTTTCAGGTCAA TTCGAGTTGGAGAATCTGCGCAGAGAGTTCAACAAGATCAACAAGGAAGTCTCCAAACTCAAGCGTGCTGGTGAAGATGC AACCAAGTTGATTAGTGAATCAGAGGAGACTAAGAAATCGATAGCGGAGAAGGAGGCTGAGGTTCGGGACACGCTGAAGC TTCTGAATTCCAAATTGGAAACGATTGGGAACCTCGTCCATGACTCGGTTCCTATCAGCAATGATGAGGTTTTGTTCTGT TTCTGGTTTCTTATTTTCTGATGATGATGATGATGCTTGTGTTAGAATTAGAAATCATGGGGGTTTTATTTGTGTGCTGC TTTATTAGGCTAACAATGCTGTGGTTAGATCGTGGGGCGAGAAAAGAGAGGAGCCTAAACTGAAGAATCATGTGGATCTG GTTGAGCTTCTTGAGATAGCAGATACAAAGAAAGGTTTTAATTGTTGAATCCAGTTTTTTCAATTGATGATTTGTTTGTG ATTTCTGCGTCCTGACCTGAACCATTTCATTTGTATGATTGACGTAGCTATTTCACTATCACATGGTTTGTGTAGCTTTA TTCTGCCACTGTCTCGAATCTCAATTGTAGGCACTATGGCTTATTTTTTTATGTGTAGTTTCGTTTTGCTTGTACATCAA AATCTAATGTGGATAAGTACAAGTTTCTTCACTTTCATTGTGTGTCCTCCTTTTCACTGTATTTGTCATCTACTGAAGCA TTTATGCTAATCACCAATAAGTGGGTCGAATGTTGCTGCATTTTAACTAGGCTAGCCGGGCTTTTCAATACTCTGCATTG TGGTCATTTTTTCTCTGAATGTATCCTAATCTTTAATGTCATCTTGCTTCATACATAATAGGAGCTGATGTTGCTGGAGG TAGAGGTTTCTATCTCAAAGGAGATGGTGTTCGTCTTAATCAAGCTATGATCAACTTTGGGCTTGATTTTATGGAGAAAA GGGGATATACCTTGTTACACACTCCTTTCTTCATGAGAAAAGAAATTATGTCTAAGTGTGCTCAGTTAGCCCAATTTGAT GAAGAACTTTATAAGGTAAAGTTCTTAAGTCGGTTCCATTATTTGTCTGGTATTTTGTTTATGATTTGTTATGTTAATGT TAGGACATATTGGTGATGCATCTTTTATACTCTTTGACAATACAAATATATGTTCTTTCTTGAGGAATATGCTTAATATT GATATTGAAAAAATGGTATTTTTTTCATTCTATTTTCCATTTTAAGAGATTTGTTACGGAAGTAGTGAAAACAATAATTT TTTTTCCTAAAAATAATAACAAACCAAAGGCAACCTTAATATTTTCCTCTGAGCTTATCTAAGGAGCTATTATGTTAGGT AACTGGTGAAGGAGATGACAAATATCTGATTGCCACAGCAGAGCAACCACTTTGTGCCTATCATTTGGATGATTGGATCC ACCCTTCCCAGCTACCCATAAGGTAATTTGAATTTGGTGATATATGTTAGTGTTGGAACTTGAAAGACTGTTAATTTTAA CACTGGTAATATACTTTCTATAGATATGCTGGATATTCATCTTGCTTCCGTAAAGAAGCTGGATCTCATGGTCGAGATAC CCTAGGAATTTTCCGAGTTCACCAATTTGAGAAAGTGGAGCAGTTTTGCCTTACTAGCCCCAATGACAATGATTCATGGG ATATGCACGAGGAAATGCTAAAGAACTCCGAGGACTTCTACAAGGAGGTATGAAGCTGTTCCTCATTAAACAACTAGAAT ATGTTTAAAGGCGTCATCTATATCAGTCAAAATTCCATATAAATAATATAATTTTTGAATGATTACTGAATCCGGGTACC ACTAAATAAAGGCAAATGATGTCTTTGACATGCTGAACATATCTAACCAGGGGATGTTTTGTGCATACCTATGTCTTCCT AATTTTTTATATCTGTTTTTTCTGCTTTTGATTATGTCTGTAGTACTTACATGTTGGAATTATCCCATTTGATTTTTTTT TTGTAGATGTTATCTTTGTATATGGATCAATCTCTAAGTTGTTTCCAACCTAAACTGATTTCTTTCTTTGCCATCTTTCT ATTTTTCTTTCTGATGTAATTAAACTTTTATTGGCTGCAGTTAAACATTCCATATCGAGTTGTTTCCATTGTATCTGGTG CTCTGAATGATGCTGCGGCAAAGAAGTATGATCTAGAAGCATGGTTTCCAGCTTCTCAAGCTTACAGAGAGCTTGTGTCC TGTTCAAACTGCACAGACTATCAGGCCAGAAGGCTAGAAATTCGATATGGACAGAGGAAGGTTAGTTATGCTCAACTTCA TCATATTGATGAATTTACTAGTATTATTCAATAGCTTGTGAATGAAAAAGTTAATTTATATTAAAAATGAGATTGTGCCT TATGCATGTCAAAATCTCGCAGTCTGAATTTATGAAGTCCTTTCTACTCTGAAATTTCCAAGTTCCTTTCTTCTCCATTA GTATAGTCTGTCGTTCAAATTCTATTAAGCAGACAATTGGATTTTATCTTTGTTAAACATTTTGAGAATAATCGCAAGAG ATGATGGTGCTTACTTATGTTAAGGGGCCTAAGATATTCAGTGGTTATCAAAGTTTGTTGTTGGGATTTTGTCGTGAGGA ATATTTTCTTTTGGCTTTGACTATTTTCATCCCTATACGTGAATTTACATTCATACATTAATGTGAATTTGCATGTTTTA CTGTTGCAGAGCAATGAGCAGTTGAAGCAGTATGTTCACTTGTTGAACTCTACACTCACGGCTACTGAGAGGACCATTTG CTGCATACTAGAGAACAACCAGAAGGATGACGGAGTGGAGATTCCAGAAGCCCTTAGGCCGTACATGGGTGGAAAGTCTT TCATACCTTTCAAGAACCAACCTGAAGCAAAAGGGAAGAAATCGAAGTAATTGCATTACTTTTAGTCTGAATGATATTTA TGAAGAGTTAGTTCAAAATTGTAGTTTATGACACTGTTAATCTGTCCTCAACCCCTCCCTGAATGCCTAAATAGTAAATT ATCTTGAGGAGCATGCACGGATTTTTGGTAACACACTTGGCATATTCTGTAACTCATTAATCTATAAACCTTGTACTTTT TGCGGTGTGTTTTGATGATTTTATTCATTGTGAAAGGTTAACATTGATCAGATGTTATTTTGTTAAATGGGGCGAAACAC ATATCTGCTACTTATAAATGTCAAAATGTGTTTACTTTCATTGTTTTCGTACAAGGTTTAGGTGACATGAGGTTGTTGTT TGGTTCGTTATACATCTTTTAGGGGGTTAACTTGTATTACGGGGATAATTTGTTCAGCGCAGTAGACACCTATAAAAATA TGCAATTTCGAAGTTAAATTTGGGTGTTATTCAACTGCAAGGGGATTCTGGTTCATTCATGCATGGGATTGGAGTTCTGA AGTCTGGTTTCTCTCTTGCAGGGCATTGAAACATGTTCAATTTAATCCTGCTGCTAATATTCTAACTTCAATTACAAAAT TCATTGGAAAGAGCAATGTCATCCGCAAAATTGGGACTAGAATATTCAATGTATTGTAATAGAGAGGGTTGATGGGGTTT TATTTGGTAGCCAACCTTCTAGCTGTGGTTTCTTACTGGGTCACTTGCAAATGATATGTTTTACAACTATGATGATTTAT TCTACTCGCATGTTTTTTATTCTGTATTCTGCAGCCAAAGCGATTATTTTAAAAATAGCTTTGATCTGCATGGTTCTTCC TTGGCTCATTCGTTTCCGAACTTGTAGCTAATCAAGTCTTTATCACAAACATGAGAATATATATCATATTTGATACCAAG GGCATTTCGAACTTCCAATCCCTTACCAACTCTTTTAATTTGAACGTGAATAATGTTTTGTGGTAGCGTGATATTTAGGG TATGTAGTTATCCAATCTAGATGCAAATTGTTTTATAAAGCTTTTGGTTGAGTATTATTTGTCAATATCAGAATTGATTC TCCACTGTCAAAATTAGTTTTATGGTGTTTAAACGTTTCATTTGATAATCGATTTTAGCTTTAAAATCAATTTTGGAGCG ACACTAATACTAGGCTAATAGCTTGTGTGGTGAACATATTAATAGAGTTTTCACAACATGTCTCTACACAACTTTTCAAC ACTTTTGTGATAATTTTAGAGCCAAAATAATATGTAACAATGCTGGTTCAAAACTGATACAATCAATGCTAATCAAATTG AGTTGAACACAACTTTTCTGTTGAAGAAGTAAGTAGAGTAGCTTATGGAGGATGGTCGCGATCACTCCACAATGGTCAAG TCATTGGAGAGGATGTAGTCTGTTATAGAGTCACATGGAGAGACACTATCAAGTAAGTGGCTTTTGGTAAAAAAACATAG AATTACTCTCATACCAAATATATGAACTAGGAGAAGTATGAAGATACCCTTCATCATGGTATTGCAAGTATGTTTCTGAA TATTACAAGGCATGTAGGCATATAGCTGTGTCAACAGTATAAAACACAAGCCATGGAGATAAAATTCCATCACCAGCACA GAATTTGAATACTTTGCAGCACACTTTTGTAACTTCAATGTAACTTGAGCAACCTATTTTTTTAACTTCACTAGCTAAAG GATCTGAAAACTGATGTACACACCGTCCCTCATGAATGTTTGGTAGTAAAAAGATAAAGCAATTTACATGGGTGCTTAGA ACTTAAAAAAAGTTACATGGCAAAAGCGCAAAACAATAGAACTGACAGTACTTGTTCAACTTGAACTGTGATCAAGAAAA CTCATCACTCATCCCATGCAAATCAGTGTTTGTATGCAGAAGCAGAACAGCTCTTGCAACTTGCAAGGACAGAGAACTCA GACAATTGAACTACCTACCTGTTGTGTAAAGGGTCAGGAGAGGAAGGTACTTCTCTCTTAACTGCAGCGTAAGCTCCTCG AGATGTTCCATGGCTAAAGCTTTTCCTCCATGCTGGAAATTTATGTACATGTTCCACTTCTTTTCCATATTCAGCTCCTA ATACTCCATGGTTTAAACAATAGCTGCTAAATAATATCACTAAGAAGAGTACTAAGAGATACCCCACTTGAGTCTTTGAA ATTGACATAACTTCTCCTACAATCTTCAATGATCATTATTTTTCCTCTTTCACCTTCTCCGAGGCAAAGCTGGGATATAA TACAGATCAAGATTGAGATAGCTCTTGATATCTGGATTTATAACAGTAGCTATGCAGCACAGACCAATAAAAGAAGAAAT GTGAGAACAAGGATTGACGGTTATGAATTTGCTTGTCATAGACTAGGGAAAACTATAGGTCATTAGGAGAAGGGTCCAGG AAGAGTAGTAAACAAATGGTTAACCCCTTGTCCTCATTCAAATCAATAATTGACATGTGAAACATTGTGGCCATGATGAA AATGTACATGTTCCTATC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0220300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGGAGGAAGAGGAAGATGACGAGAGCTTCGGTGACTTCAAGTTCGCGTCCTTTCCAAATCAACCCACCGAATCCTC TAACCACTTCAATGGAGGAGGAGGAGGAGCCTCGTCAAAACCCTTCGACCCTTTCGCCGTTCCCCCCTCCGATCCCGCCG TTCCGGCGAAGAAGCCTCATGGAGCTATTCCTCTTTCAATCTTCGGCGAGGAAGAGGAGGAGGTAGAGGAACCTGCTCCT GCCAATGTCTTTTTCTCCAACGGTGGTGGCGGTGCGGTGAAAAACGGATCCGATTCGAATGGAATCAGTAATTTGATTTC CGGTTTGTATACTCAGCAGCGCCCTCATGTGAGTTCTGAAAACGGATCAGCTTCCACATCCAATGGTGGTGTAACGAATT CGAACGCGAGGGATTTGAATCCAGATTCTGAGGACGAGGATGGATGGGAATTCAAGTCGGCGGAATGGGAAACTGGAAAC AAGAGCCTGAATATTCAGGCTGAGGTGCCGAAGCATGAAAACGGTACACTTGGTGTTGGTGATTCGTCCACTGGGATTCC TGGCAAAGACAACGGTGGATGGCACCTGGGATTTGAGTTCAGCCCAAGCTCTGCATCGCAAGATCATATTAGCCCACAAC CAGGTCCCAAAAGTGAATCGAAGGAAACTGCAACCGGGCTTACTATGTTTGACGAAAATTTTGGGAAGTTGAAGAATGCA CATTCATGGCCAGGATCAAATCAAACTCTGGAAGCACCAAAAATGGCTGACACATGCCCCACTAGTACAGGAGTACTCAA ATATGGTGGGGGAGCTTCCCATACTACTATAGATCTATCTCATGCATCAGAATCTCATCAATCTGATGAATGGGACTTTG GCTTTAATTTCAATTCTAGTTCCCTGGGCAAAGGCAGTCATATTTCAGAATCATACTTCACAAACAAAAGCAACCACGAT GATAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACATTGTTTCCCCAACCAATATAAATGTTGCTTCAGATGTGAA TTTGTTTGAATCAAAGGACGCAGTTTCGGAAAAAGAAACAAAGCATGAGAAGCCCCTAACAAGCTCAGAGAATCATAGGG AAGCCTTGCCTCTGTCAATATTTGGTGATGAGGTGCCCGATACAAATGAACTTTCTATATCTCAAGATTTGTCTCCCTAT GCACCAAAATCCTCAATGGGGAACAGCTTTAATAGTCCTGGTTCCAACTTATCTATCAACGACATGATATGGACATTATA TAATCAAGCTGAAAACCAAACTCCTGATGTGACACCAAAAGGAAGTGAAAATCAGATTCATGCCTTCCCCGAAATTTCAG GGTCCAATTTGGTTGACGGTGATGATTTTGATGATGATTTCGGGGACTTTAAGGATGCTTCACCGGGAACCAGATGTGCC GAGGAATCTGCCCAAGAAACATCTTTCAATCATGCTCAACAAGTCAATGAGAATGGATTCCAGTCTTCCAGGACAGTTTT AAATTCTGATTTGGTCAATGGTAATGATGATTTCGAGGATGATTCATGGGAATTTAAGGATGCCATCTCTGGAACAAGAA GTCAAGATCAGGCATCTACCATTGATAACACAGATTTACTGATGCTGATGCAGTCATCAACAGAGTTAGAGCCAACTGAT TGTGTAGAGTTCTATAGCAGATTGAAGGATGAATTGTGCAATGATGTCCTGTTCCATCTTCAAAATCTTAAGGTAGCTCA AAATGCTGCTGTTCTTTCGGGTGAAGATGCAAAATCAGAAGCTCTTGAGAAGGAAATTCAGGAATTTTCAAAGATACTGC ATCAGGATAATATGAACATCCCTGATGAATATCTATCAGATAATTATTCACCAAGAAACGTGAACTTGACTGTGCTTCTT GAAGTTTTGAAGGAACCGAAGTTCCAACCTATTGAGTCAGAGTACCAGCTAGCATCGAGGTTGTCCATGGCTGAGAAGGA TATGAAACCTGCTATTGAACTTTTGAAAGATGCAGTATCAACATTAAGAATTCTCAAGTTGGGATCAAGAGAAGAACATT TGAATTATTTTACCATATGGTCCAAAGTGGCCTTTGTTTGTTCTCAAGAGCTGAAACATGGTGCTTATATTTGGAAGCAA GCAGTACAAAAGAATGTCCATGACCAGATATTATCTAACCCAAAAGGTGTTAAGTATATTCATGCACTTGGAGAAATTTA TAGAGTGGCAGAAATTATTGGAGCTTCAGCCAAACTTCACAAGCCATGGATGTTATCTGGATCTATAGATCCTACAAGTT TATTTGCTCTTTTGAACGAGTGTTATAGTCTATGGTTGACTTCAGGACTTGAAGAAGCTCTTTTGTGTATATCAAATCAG AATCATTTTGAGTCAGATTACATTTCAAGGAAATTAGTTGAATCCATTAAATACATTCATGAGCTTGATGACCATGTCCT TCAGAACTATGTCATCTCTGGAGAAGAAACAACTTGTCAGTTGTCAGCCCTACCTGCTGATCTCATACCAGGGCTAAACT TGGTGACATGGAATGGGAAGCAATACTTCGTCAAGCTCATTAATTTATGGGTTAATCTTTTAAGTTCCGATCCTCCCAAG AATTAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0220300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEEEEDDESFGDFKFASFPNQPTESSNHFNGGGGGASSKPFDPFAVPPSDPAVPAKKPHGAIPLSIFGEEEEEVEEPAP ANVFFSNGGGGAVKNGSDSNGISNLISGLYTQQRPHVSSENGSASTSNGGVTNSNARDLNPDSEDEDGWEFKSAEWETGN KSLNIQAEVPKHENGTLGVGDSSTGIPGKDNGGWHLGFEFSPSSASQDHISPQPGPKSESKETATGLTMFDENFGKLKNA HSWPGSNQTLEAPKMADTCPTSTGVLKYGGGASHTTIDLSHASESHQSDEWDFGFNFNSSSLGKGSHISESYFTNKSNHD DNNNNNNNNNNNNIVSPTNINVASDVNLFESKDAVSEKETKHEKPLTSSENHREALPLSIFGDEVPDTNELSISQDLSPY APKSSMGNSFNSPGSNLSINDMIWTLYNQAENQTPDVTPKGSENQIHAFPEISGSNLVDGDDFDDDFGDFKDASPGTRCA EESAQETSFNHAQQVNENGFQSSRTVLNSDLVNGNDDFEDDSWEFKDAISGTRSQDQASTIDNTDLLMLMQSSTELEPTD CVEFYSRLKDELCNDVLFHLQNLKVAQNAAVLSGEDAKSEALEKEIQEFSKILHQDNMNIPDEYLSDNYSPRNVNLTVLL EVLKEPKFQPIESEYQLASRLSMAEKDMKPAIELLKDAVSTLRILKLGSREEHLNYFTIWSKVAFVCSQELKHGAYIWKQ AVQKNVHDQILSNPKGVKYIHALGEIYRVAEIIGASAKLHKPWMLSGSIDPTSLFALLNECYSLWLTSGLEEALLCISNQ NHFESDYISRKLVESIKYIHELDDHVLQNYVISGEETTCQLSALPADLIPGLNLVTWNGKQYFVKLINLWVNLLSSDPPK N
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 478 | 478 | 1.2E-252 | – | |
| MobiDBLite | 1 | 150 | 150 | - | – | |
| MobiDBLite | 17 | 34 | 18 | - | – | |
| MobiDBLite | 92 | 138 | 47 | - | – | |
| MobiDBLite | 197 | 222 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 200 | 222 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 311 | 338 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 351 | 372 | 22 | - | – | |
| MobiDBLite | 351 | 370 | 20 | - | – | |
| PANTHER | 482 | 880 | 399 | 1.2E-252 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0220300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…