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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0325200 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0325200.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein; TAIR: AT2G45320.1 polyphosphatidylinositol phosphatase; Swiss-Prot: sp|Q7ZWV3|NDR1B_XENLA Protein NDRG1-B; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2SSM1|A0A0B2SSM1_GLYSO Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0325200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:69195248..69211997) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CATGAGTGTATCACGGAAGGACGGTCGTGGCTAGGGAGGGGGTTCCGGCGGCCGCACGTTGCTATTTCCATCTTCCGAGG GAGCCAAAAAGATATCCAATGTTGTAATAAACATTATAAATATATGTACCAAAAAAAAATTATAAATATATTTTTACGAT TTTAGAACTGAGCCTAAAACATTCTTCCTCTCATCAGTCCTCAAAATCTTTCTCACAACCTTCTCCCTCAATCTTTCCCA TCAGTACCTTCGCTTCGCAATCTGTCATAGAAGGGTTACCCTGCTCTTCCATCGCGGTGTTGAACGCCGGAATCCAACAG CAAAGGTTTCAACCAGATCAGCTCCTACCTGACCTGCTTGCTGGGATGCAAGGTGTATCGATCGAATCGAAGGCTAGGGT TCTTCAATGTTCTATCACCACGCATACTCATTTTTGATGTTTCTCTCTCACTCACCAGGTACTATTTCTCGCCTCTCCTC CATTTACCTATCAATTGATGATTGCTGTATGTGAAAATTAAGTTGGGAAACAAAATATACTCAAACTTGCATGCTTACTT TGTGTAAGTAGAAATTTATCAGTTCCTAATTTGTTTCACTGGTAAAGGAATCATTGGATATTGTTCTTGAGTCGCAGTTA TTGATTACAAATGGGCAAGTGTTTTGTCTCAGTTGACTGCGTTAGTAGCATAAGTTTAATTGGATCACCAAGGATGACAT GGGGTAATCTCATCGTGAATCATGACTCGATCCAATGCAGACTCGAATATCAGGAAGACCAACTCAAGCCTGACCAGAAA TCTTACTACTCTCACTGTTGGCAACTTCGCATTACCAACCTTATGTTAAGAAATTCTAAACTTTAGTATAAGATTAGGGA GATTGTAGACTAAGATAATAAAAAACTATCACATCACTATTTAGATGTAAAATGATTTTTGTCGTGCACATAATTATTTT 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ATTGCAATCGATTGGTTAACACGTTTCTAAACGTATTCTGAAACATGGAAGAAAATGCAATGGCTTATCAAATTATCCAT CAAAACTATGAAAAAGATTCAACGAAACACATTAACATATTCACTGTCTATTTTATGTCAAGCATCATTTGAAGTAACTC CTGATATAGCAATAAAAGGTTGACTAGGTGATGTAGATTTTTAAAAGAGATTCTGGATTTATTGTGACAACAAAGTTCAA CAAATTCATGTCTCTAACACCCCTCCTAGTATAGTGTCACTCTCACATAACCTTGTCTTGCACCGTAGTAGTGATCATAT GGAGTTGGATTTATTTTTTCTGAGAGAAAAGATTCCGAGTAAGTCCCTTAACCCTTACACTTTGTCATGACCAGCCAATG CTTAGAATTCTGACCTTCTGACCCAGCCATTCACAACTGTCAGATTTACTGCTTTAAGGGACAAGCTCAGGGTGTTTGAT AAAGTACCATGTGCCCCCCACCCCCTCAGTTTGAAGGGAGCATGTTAGTGTAATAAGTAGCTGTAGAACAGTAGTTTTAT GCTTGATTGTATTGAACTCTGTACTAGTTACAATTTTTTAACAGTTAGTAACTCACTTTCACACAGACACTAACAAAACT TGTAATTTGCTTTAGTTTCATTAATGCAAACTTATCAGAGTTTTTCACACCTACATATGCAAATACTTTTGATACGCTTC TTTGGTGATTTGCAAGCTGACTCTACCATTGGTGTAATGATTCAATTTTTTTTTTCCTGGATTCTATTTCTCCACTCAGC ATTGTTGAAAATGACTAAATATTTTTCAGTTTCCTGATTTATCTCCTTTTTTTTTCTGGTGACTAATTCTTAAATTTAAA TTGAAAATCCATGCAGGGCAAAGCTGTTCCTACAAGAGGTTTTAAAAATTTATACCTCGAAATACATGAGTGCTTCCCGC 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CGAAATAGTGATATAAGGACTAGAAAATAAAGACATTCTAAAAAGAATAGAAGACTATATGTGAAATCAAGGAGTGGGGC AGAGGATGAGAAAATAAAAGTACCTGAGAGTCATTAGGCCCCAGAAAATAGGAAAAAGTATCTTTTCCAATCGGTTACCG TTGGTGACAAGTTGAACAGTCCATTTATAAGCTCCATAGTTGTAATTATTAGGGCCATCTAAGCATGTAGACCTTGCTTC TCTGTTCTCTGCCCACGCCAATCTTGCTCTGTCCCTACTCAATAAGCTTGTGCTTCCATAATACATTGGCTTATGACAAG ACAGCATTTGAATTCCACAACCACCTGTTTTCTGGCACTGCTCTTTCAGACACTTTGCTGCCCTTTGCATCCCCAGCAAG TACCAACAAGCCCCAGCTGCCTGAAAAAAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0325200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAAATATTCAGTGGATGGCGTCGTTTTGTTTTTTGTCTTCCTTTAGTTTTCCTCCTCACTCATCTGTTGTCTGTTAC GGAGTTGCACAAGAACCCAGAAATGGAGGAAACCCACAAGCAACTAAACAAGAAATTTGATCATCTTGTTTTTGGTCCTG CTGCTGGCCAAGGCTTGTCAAATCGATTGCAATGCGAAGGGACAAAAGCTCTTAACAGGACCCATTCTTCTAACAGCAGA TCAGGGGTAGATGGAAGTATAACATTTGTCACTGTCTTTACCATTTATAATTCCTCTCTCAATAATGTTGATGATAAATC ATCGAACACAATTGTTGGTAATGCTTCATATAATAAGGTGGGCAGGTCTATGGCTGTGTTGAATGTCTTCATTAACTTCA TTCAGGTGGCGATGCCCCAGAGCAAAGTGATTATTCTCACAGATCCAATTTCTGACCTCTCAGTGCATAGAAATGGGGTC TCTGTTTATCCTATACAAGGTGAATATTCACGAGACAAGTTGATGCTCCAAAGGATCAGGTCTTACATTACCTTTTTAGA AACAAGGCTTCAGATGCTTTCTCAGAAGCCAAGGATTATCACCCATTACATCTTCACTGATTCTGATATGGCAGTGGTTG ATGATTTGGGGAAGATTTTTCATGAACAACCTGATTTTCATCTGGCTCTGACCTTCAGGAACAACAAGGCCCAACCTTTG AATTCAGGATTCATTGCTGTAAGGGGTACCCCTGATGCAATTTTAAGGGCAAAGCTGTTCCTACAAGAGGTTTTAAAAAT TTATACCTCGAAATACATGAGTGCTTCCCGCATGCTGGGTGATCAGTTAGCTCTTGCTTGGGTTGTGAAGTCAAAACCTA ACTTTGACACAAGCAGGTTTGCCAAAGCACTTGCTTTCTCTGAAGACATTGGTGGTACTTCAGTATTGTTCTTACCCTGT GCCCTGTACAACTGGACTCCCCCTGAGGGTGCTGGTCAATTTCATGGCATGCCATTGGATGTTAAGGTAGTTCATTTCAA AGGATCAAGGAAACGTCTAATGCTCGAGGCTTGGAATTTTTATTCTTCTTCTCCTGACATTGAAGACATGTTATGCCTCA TTTTGGGAAGTGGAAGAACAAAATATGATTTTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0325200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKIFSGWRRFVFCLPLVFLLTHLLSVTELHKNPEMEETHKQLNKKFDHLVFGPAAGQGLSNRLQCEGTKALNRTHSSNSR SGVDGSITFVTVFTIYNSSLNNVDDKSSNTIVGNASYNKVGRSMAVLNVFINFIQVAMPQSKVIILTDPISDLSVHRNGV SVYPIQGEYSRDKLMLQRIRSYITFLETRLQMLSQKPRIITHYIFTDSDMAVVDDLGKIFHEQPDFHLALTFRNNKAQPL NSGFIAVRGTPDAILRAKLFLQEVLKIYTSKYMSASRMLGDQLALAWVVKSKPNFDTSRFAKALAFSEDIGGTSVLFLPC ALYNWTPPEGAGQFHGMPLDVKVVHFKGSRKRLMLEAWNFYSSSPDIEDMLCLILGSGRTKYDF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Phobius | 1 | 9 | 9 | - | – | |
| Phobius | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| SignalP_EUK | 1 | 29 | 29 | - | – | |
| PANTHER | 3 | 384 | 382 | 1.2E-194 | – | |
| Phobius | 10 | 20 | 11 | - | – | |
| Phobius | 21 | 25 | 5 | - | – | |
| Phobius | 26 | 384 | 359 | - | – | |
| SUPERFAMILY | 127 | 352 | 226 | 5.62E-12 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0325200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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