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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0153200 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0153200.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Uridine kinase; TAIR: AT1G26190.1 Phosphoribulokinase / Uridine kinase family; Swiss-Prot: sp|C6KTB7|ALTH1_PLAF7 Putative E3 ubiquitin-protein ligase protein PFF1365c; TrEMBL-Plants: tr|A0A1J7HSG2|A0A1J7HSG2_LUPAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0153200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:25444758..25455761) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCACGGTCCACAGACATAGCAACTTGTCTGTCTCAGGGCTCTGCATGCAAAAATCTTCCATTGGAAGATGGATTTGAATC ACACGTGGTTCTTTAGAAATTCACGTTTTGTTCGGTTCTCTTGATCTCTTCCTCTTCTTCTCTCCATGATCCATACATTG TTACTCGCTTTAGCCAATGCAGATTGATCATGCTTCAAGGTTGTTCTACCGCTAAACTCACTGTTTATTGAGGGAGCTAA CGAGAACGGTGAGTGCTCCGATAATAATCACAAATGTGTATGTTGGATCCATTTTGATTCTCATTCTCATTCTCACTCTC CTTGGTTGTTATTAGCCATTGATTTATGGGGTTTCCTCTGTTAAAGAGTTGTGCTTTTTCCCCTTTGGTTTGTGAATCAA AATGCTGATTATTTCGTTTTAGGTCGTGTATCGAAGATGGTGTCGTCTAGGATGTTGAATTTTATGATAAATTTGATTGT GGTAAGTGGTAAGAAGGAGCAATATGCTCATAAAGTTTGATTTGTGTTCATCAGAGTCTTCTGTTGATTGTTTCTATGGC AACTTTCTAAACATAATGTTTGAATTTGACCAGAAAATGGTCTTGAATTTGGCCTTACTCTTTTGAGGTTATTAGTATCA GAAAGTTTCTTCTTTGATTTTATGATTCACTATGATATCAGTTTCCTCCACTTTATTGAGGACTTCCTATATTTGGGGCT TGGGGGTTGTTGTGATAATGACTGCAATTTCTTATAATATGAAGGTTCTTCAAGGCCCGTGGCTAGTTTACGGGTAATAG ATATAGCAACAGAAGTTTCTAAAATTAGTTGTTACTTACATTACTTCTACCTCTACATATTATTAATATGGGTTGAATGA CACTTAGCTTCTGTCTTCAAATTTACTCTCTTATTGTATTTATGGATGAATCTCTAGTTTTGACTTTTGAGAAGAATTCA 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GTTTACGTGAACATTCCATATATGTTTCATGATATAGAGAGAGGAAAAGAGCAAAGTAAGAGAGCATATGACTAAATCCG CATGTCTCAATTAAATAGTAAAGCTATAATATATATTCATTGAAGTACTAATTACATGATTCTACCTCATAAAAAGTATA CTTATATACACTATTGACATATCTTCTACCGGTTTATCATTTTTCATGTTTGACATTTAGTTCCTTCATTTACTTTTTAG TTTTTATATTTAATTTTTGATTGATTGCAGATTACATGTTTAACCTGTTTGTTGTAACTTAATAATAAATAGGTACAAGG AAGAGATCGCTTAGTTGTGATATACATAGCACAACAGATGGGTCTTGAAGGTTCTTACATTCCCCGTACCTACATTCAAC AGATTCAACTTGAAAAGCTTGTAAATGGTGTTGTGGTATGGCAACTTTCAATATGCTAATACCTAATCCTATATTAGCTT TCTTTGTCTAAATATTCCACAGGCCATGCCAGATGATTTAAGGACAAAGCTTAGACTTGATGAGGATTTGATGTCAAGCC CCAAAGAAGCACTCTTTAAAGCCTCTACTAACGCGCTTCACGTAAGACATAGGCGTATAAGGAGGTGAATATTTACAGTC TATATATGCTTTCTGCTTTTGAGTATTGAGAGAAGAGAAAAATAGGAGATTTTTTGAATACATGCAATGTGAATTATATT GATTTATAATAATAAGTACAGAAGATCTAGAATATCCTAATCACGACAGTTAAATAATTTCATTAGCCTATACAATTAAT TTAGACACAATTTATATATTTTTGAAAAATCCGTAAGTTTGAGCACTAAGCTCATTACAATTGTAGCTTATTTGAAGTTC TCTCAAACAGGTAATGAAAACATATGAGAAATGGTAATTGGAACTAATGAAGTAAATAGTTATTCCCTCTCAGTTTAAGT 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TTATACACAATTCTCTCAATGAGGAAGATTTGTAAATCTTAACTTTAGGAACCAAAAATAGATTAAATAGTAGAAGGTTG TAGAAAGGAAATGTTCTAGTGACATTTAATTGGAATTTCTCAAGATAAATGTTATGCAATGGGAGTGGAAGATAGCATAT TTTTTTTTAATAAAATGTTTAATTGCACTTTTAGTCCATCTAGTTTGGACTATGTGCGAGTTTGGTCCCTCTAGTTTTTT GAACTAATTAAGTCCCTCTACTTTTAAAGTTAAGCAAATTTGGTCATTCTGTTATTTTTCATATACTAAAATTTCTTAAA TCTTCATTTTGTATTCAAGTATTTTTTATTTCTAATTTTATAGTTTAAAATTTGGTGAAAAATAAAATTTTAAGGATTTT ATGTGATGTGAGAAAGAGGTTTAGAGAGGAGAAATTTGACAATTCCTCAATTTTAAGTCGAATCTAATACAACAGTGCTA CCAACACTCACTCTAACACTTTCTTTCCAACTCTCTTTTATTGGTTAAAATTTATGCAGGTCACACAAAATTGGGAGTGG GGCCCATATAATTTAGTGGACCCTACGTGGATTTCAACTAATGAAAGAGAGACGGTTGGAAAGAGTGTCAAAGTGAGTGT TGGTAGCATATCTCAATTTAACATTTTAGTTTGCCAGTTTAATTTGAGTAGGAGAATGTTTAACATGATTTAATTGAATC AATTTGAAGTTACTTCACTTAGATAATAATAATTTTAACTAGAATAAAAGTGATGGGGACTTGGTTGTATATAACAATTT TAAATTCGAGCGATTAAATTTACTACAAAAAATTATTAAGGGATCAAAACCACACAAAGCTATAGTTGAGGGACAAAAAG TACAATTGAGCTAAAAAATGTGCTTTTAATGGTGGTTAACTTACCAAAAGTCATTAACTTACCTTGGTAGTGTTATATAA 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TACCAGATCTATCAGTATGTGTATACATACCCGTAAGGTTACAATGGTGTAATAATAATAATATGATCTATCAGTATGTG TATACAAATTTACCACACCTACTGCAGGCTACACTCTGAGCAAGGTTAAAATGGTGTCGCCGCTAATCTCAGCAAGGTTA CAATGGTGTTGCCTCTTATTTGTTGGGAGAGCATTCCGCCTAACTAGCCACAAAAAGAAGCAAACTATCGCCCGTGCACA ACACTTTCCATTTTTTTTCCAAATCCTGGATTGGTTTGCCATCATCCGCAATCTAAGCATAGGACCATCACCAGCAATCT AAGCATAACCAAAACTTGAGGTAAAATACTCATGATGCGTTCCCTTCCAGCCCAAAGAGTCATCACCCTGAGTCACAGTT CGAATTGTAAAGGTGTTACATTAAATTTTGTTTTTATTTCAAAG
CDS sequence (LotjaGi4g1v0153200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCAGATGATTTAAGGACAAAGCTTAGACTTGATGAGGATTTGATGTCAAGCCCCAAAGAAGCACTCTTTAAAGCCTC TACTAACGCGCTTCACGTAAGACATAGGCGTATAAGGAGTGATATGTCACAGTCATGTACAAATCAAAGGGATAAAAATC AAGCCAAAGTAACTGGATATGTTTCCAACAATCGAGTGCTTCATGAAAGAGATAATTCAGATTCAGTCACAAATCTGGCA AATCAGGGGGCCATTACAATACTTTCAGAACAAATTTCTTCCTTAAATGATAGAATGGATGAGTTTACAAATCAAATTCA AGAGCTGAACTCCAAGTTAACTATCAAGAAAAATTGTGCAAGCCAACAAAATATTGTCCTGCAAGCTGAGGCCTGCAATG GTTCTGCTCCCACCTCTCACTCCATCACTAGTTGGAATAATCGTTCACTAACTAGACCTATCATTCCAAATTCCTCGTCC CCAACACAGTTCGCCAAGGAGACACCATTAGCAGATGAGATTGCAATGGGTCAGCGTCAGATCATTCATCAGTTGGACAA TCTGAATAATCTTTTATGCGGAAACACGGGAGATAAGCCTCATCAAACAAGAACCAACAGAAAAAGTGTAGCTCCTTATT CAGATTCCACTGGACCTAATCTAATATTGGCAGTGGCTGTTGGTTGTTTGGGGATCTTCTTGGTGAAGGGTTTGTTAACT CGAAATTGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0153200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPDDLRTKLRLDEDLMSSPKEALFKASTNALHVRHRRIRSDMSQSCTNQRDKNQAKVTGYVSNNRVLHERDNSDSVTNLA NQGAITILSEQISSLNDRMDEFTNQIQELNSKLTIKKNCASQQNIVLQAEACNGSAPTSHSITSWNNRSLTRPIIPNSSS PTQFAKETPLADEIAMGQRQIIHQLDNLNNLLCGNTGDKPHQTRTNRKSVAPYSDSTGPNLILAVAVGCLGIFLVKGLLT RN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 208 | 208 | 2.0E-34 | – | |
| Phobius | 1 | 220 | 220 | - | – | |
| PANTHER | 1 | 208 | 208 | 2.0E-34 | – | |
| Coils | 85 | 112 | 28 | - | – | |
| TMHMM | 217 | 239 | 23 | - | – | |
| Phobius | 221 | 239 | 19 | - | – | |
| Phobius | 240 | 242 | 3 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi4g1v0153200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…