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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0258200 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0258200.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Glutathione S-transferase; TAIR: AT3G09270.1 glutathione S-transferase TAU 8; Swiss-Prot: sp|Q9FQA3|GST23_MAIZE Glutathione transferase GST 23; TrEMBL-Plants: tr|I3SG87|I3SG87_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0258200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:56663975..56682745) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCTCACTTTGTTATGTAAGTGGTGAAAACAACTAGTCACCGTATCATGTGTGTGGGAAGATAGTATATTATTCACACACT GAAAAGTTCTGCTTGTTTGTATATCTTAAGCTATTAATACAGGGCTTAAATATAAGAAAAAATAACTGAATAATTACTAC AACTAAGCACTAACTATTAACACAAGTAGCTTACAAGTGGTTACAACTTACAACTAAGTGCTAACTAACACATGTAGTTT ACAAGTGGTTATGGTTCATATACCTCAGTTCACTGTATTGCATATCACACAGATCACCTAAAAATGTTTTTCTATTCTCA CAGCTTCAACCAAAGTTCTTATTGGCCACATCAAGCCATCGACTGGGTCAAATCCAAGGACAGAACCATGTCAGACTTGC ATTATATAATGCACTCGGATATTTGATTGGTAACAATGAGTTCAGCTGGCATGCTATCATATTGATCTCATCCTCTTATC ATGCATACAATTCTCCTCCCACAAAAGCCATTAGGAGTTGCTTCTCCGAGAATCAGTTCTTCCACCGTGAAAATCCACCG TGTATCCAAATATGGACTAAGCAAGGTCTTTGAAACCATGTTGCACGAGATATATCTATTCAGTATCATAATCATCCATT TCAAGCACACTTGAGAGTGCTGATGTCCATGCCAGCAACCCACTGGAAGCATCCTCTTTCATCAATACATGTAACTTGTC AACAGCCTGCTTTGATACTCCATATCTATGCAAAAGAAATCCAAGTGATCTTAAACTAAAGTCATCAAATTGAATGGAAG CTCCGACCATTCCCTTGAAAGTCTCCATCACTTCCTTGGGTCTCCCAGCAATAGCATATAGGTCAAGCACATTATTATAA CTTAAAGAATCTGTCAAGAGTCCCAATTTTCTCATCTGCTTTGCAATTTGGATGGCTTCATCAAACCTTGCAATTTTCTT 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GCCACCATTCTTCGGTAGATTTGGCAGTGAAGAACAAGAGAAGGTTATAAAGGACATATGGGAACGATTTGGAGTCATTG AAGATCAGTGTTTGGGTGATCACAAGAAATTCCTTGGTGGCGACACTTTGAACATTGTGGACATAGCTTTTGGGTCTTTA ATGAGAACTCTTGTGGGCCTGGGAGATGCTCTTGAAGTGAAAATCCTGGTAGCTGAGAAATTCCCTCGCTTGCATGCATG GTTTAACAATTTCATGGATGTTCCTGTTATCAACAACAACCCTGAGCATGAGAAATTGGTGGCTGCTATTAAAGTTTTCA GGGAAAAAACCTTGGCATCTTCCAGAGAATGATATACAAAAGCATTTAGCCATCTCATATATGTATTTGGGTAATTTCTT GTTGTACTTCTGAAAGAAAGTAATAAAAGTTAAGCCATTGGGATTTAGCTAGTGCTAATTGCTAAGTGGTATTGGTAATT TAGATGAAGTTATGGATTTAAATTTTAGTAGTGCTTAAACTCTTGCTCTTGCTCTGCAGGGTTGTAAAATAATTGTTGGA GATTTGTATAATATTTCTTCACCATCGAATGCAATTATTTTCACCCCTGTCTCTTAAATGCTTCGGTGTCTTGTTTGTAA AAATGTGATTGAAGAGAGGGTCTTTGTTTTGCTGATAGACAGCATCTAAGAACAAACATAGATTAAGAGTCTATTTTTAG TGATTTTTCTATGATTTTCTATATAAATTAGTGCCTAATTACTCACGGTTTTCATAATAATTGTGCAATAGGCAGGTTCA AATCACTACAAGAAAACGCTGATAAATTTGGATTGTGTACGTGAGACGAATTTAGACGGGTTACGCTTGACTTCTACTTG ACCCTAAATATTGATTGAACCAATTTTTAAATTGAAACTCGTCCCCATACTGAAGAGGTGCAGGTTTAAGAAAGATCAGA TCGCAAAAAGACGGACTCGGGTTGACTGTAAAGACAAGTTGAATGACACTTTCAAATACTTGTCACTATGTAAAAACACT AATTTTCAATCCTATTATGAATTATAAAAGAAACTACATGTGTACTAGATTGTTTTTACTAAATTTTTATAAGTACAACG TTCCAATCTAACTATATAATGAGATGCATTTCTAGTGGTAGAGGACATCTCTCTAGGTCAAAATTTAAAGTACAGGAAAA AAAAATCTGAGAATTCAGAACTGTCTAGCATGACCCTCCCCCTCCACTTCATTGTGTTCACAACATTGTGTTTTTACTTC TTACAATGCAAACTGTCAAGTTGGTTACTTATATATACACACCTCATTTTTTTAAATACTTCATTTTCACCTCTTTTTAT TTCTATCTCTCTCCTCTTATCATCTATCACATCTAATACTTTCTCTCTCTTACTTTTTCTTTTCTTCATATCTCTCTCTT CATTCCGCCTCTCTCCACCTTAAAGAGAGGTGTGAAGATAACATTATTGAC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0258200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAGATTTGAAAGTCCATGGATTTTGGTACAGTCCTTTTACTTTCAGGGTGCTATGGACCCTAAAGCTGAAGGGCAT ATCATATGAGTACATAGAGGAAGATCGCTACAACTTGAGTCCACAACTTCTTCAATACAACCCGGTGCACAAGAAGACTC CGGTGCTTGTTCATGCTGGAAAACCAATATGTGAATCCATGATCATTGTTGAGTACATTGATGAGTTATGGTCTCAAAAC CCACTAGTTCCTGCTGATTCCTATGAGAAAGCTGTGGCCCGGTTTTGGGTTCGATACGCCGATGACATGATTTCAGCAGT TTTGCCACCATTCTTCGGTAGATTTGGCAGTGAAGAACAAGAGAAGGTTATAAAGGACATATGGGAACGATTTGGAGTCA TTGAAGATCAGTGTTTGGGTGATCACAAGAAATTCCTTGGTGGCGACACTTTGAACATTGTGGACATAGCTTTTGGGTCT TTAATGAGAACTCTTGTGGGCCTGGGAGATGCTCTTGAAGTGAAAATCCTGGTAGCTGAGAAATTCCCTCGCTTGCATGC ATGGTTTAACAATTTCATGGATGTTCCTGTTATCAACAACAACCCTGAGCATGAGAAATTGGTGGCTGCTATTAAAGTTT TCAGGGAAAAAACCTTGGCATCTTCCAGAGAATGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0258200.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MADLKVHGFWYSPFTFRVLWTLKLKGISYEYIEEDRYNLSPQLLQYNPVHKKTPVLVHAGKPICESMIIVEYIDELWSQN PLVPADSYEKAVARFWVRYADDMISAVLPPFFGRFGSEEQEKVIKDIWERFGVIEDQCLGDHKKFLGGDTLNIVDIAFGS LMRTLVGLGDALEVKILVAEKFPRLHAWFNNFMDVPVINNNPEHEKLVAAIKVFREKTLASSRE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 221 | 221 | 2.5E-81 | – | |
| SFLD | 1 | 222 | 222 | 0.0 | – | |
| Gene3D | 1 | 82 | 82 | 1.3E-35 | ||
| PANTHER | 1 | 221 | 221 | 2.5E-81 | – | |
| SFLD | 1 | 222 | 222 | 0.0 | – | |
| ProSiteProfiles | 2 | 81 | 80 | 20.99 | ||
| SUPERFAMILY | 3 | 103 | 101 | 8.16E-25 | ||
| Pfam | 3 | 75 | 73 | 8.7E-18 | ||
| CDD | 4 | 77 | 74 | 3.05142E-43 | – | |
| SUPERFAMILY | 75 | 217 | 143 | 4.91E-30 | ||
| Gene3D | 83 | 222 | 140 | 1.4E-31 | – | |
| ProSiteProfiles | 86 | 214 | 129 | 14.368 | ||
| CDD | 88 | 214 | 127 | 1.3872E-38 | – | |
| Pfam | 104 | 194 | 91 | 2.1E-6 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0258200.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…