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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0149400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0149400.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Aldo/keto reductase family oxidoreductase; TAIR: AT1G60690.1 NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|C6TBN2|AKR1_SOYBN Probable aldo-keto reductase 1; TrEMBL-Plants: tr|I1JRM5|I1JRM5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0149400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:25622064..25634566) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTAAAAACAATACAAAGACAAACCCTAATTCTAATTGAGCAGCAACCCTTTCTTCTCCTTCCTAGCGCCGCCACCACTTA CTCAACAACCTTCTCCTTCCCTAACCCAAAACACAGCCGACACACCTCTTCTCTCAACCCCAACCCCAAACCCTAATCAC AATAGTCGTCGCTACCCCTTTCCTTACCCAGATTCGAATAATCGAGATCAAGAGTGAGAGGGATGGAGCGATTAAGAAAC AGAGTGAGAGACAAGGAGCGATTCAAGAAAGAAATTCGCGAGGGAGAGAGAATCAATGGCGGCTAAGGGAATGCACAACG AGTGGTGGGACATGGCGCGATGGCTCGAGCTATGGCGGCGGTGCGACGCCGGTGGAGGAGCTTTGTTCTGGCCTCGTGGC TTTGCTCCAGCACCGTGTGATGATGAGTTTGTGTTTTTTTGAGGGTAGGGTGGGTTGCGATGGGTTTTCGATCGGTGAAG GTGGGTTTCTGGGTTGGGGATTTTGGTGGTTGGGGGCGATGGTGGGGGTGGATTCGATGGTTCAATTTTGCACAGACTGG GGGTGGGTTCGATGGGGTTGGGTTCTGGTTTGGATACAAAGTGGACAGGGGAAACAGGAGAAAGTAAAGTAAGTAAAGAA AGTAATTTTGCACAGGCAAGGTTTGTGAGTAAGTGAGCAACTCGGAAATCTGGAAGATTTGGGAGCCAACACAGAGGTAT TCATAGCAACAGAAAGTTTATTTTGAATAATCGTTAGAGGAACATGACATGACTGTTCTTATTGCTTAAATTTTAACAAC GTTGCATTCTCACTAATTAGTTGACCAATAATTATGATACTCTTTTTTTTGGTAGAAAGAGCTAAAAGAAACAAAACAGA TAAAAAACTACTACTGCAGCCTTAGGAAAATAGTTCCCATGCAATCACCTAACAACACAAGAGCAAGACCACCTGGAGGC 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TCGGGCCTAACTAAGACTGGGTCTATGTAAGATGAGACCGGGTTGACCCGGAGATACTAAGATTCTACACTCTAATATAT ATATATATATGTATATGTGTGTGTAGGGGTGTGTGTGTGTGTTCTTCCATATTCAAATGCCATGTTCATCACTATCCTGG CAAGTAGATATAAGAAATCAGCAAACTAGATAAGAATATTCAAACATACAATTTGTGGTTAGGCTGCTTAGATATCAGAA CCCTTGAACCTAGATAAGCATATATTCAAATGACTTGTTATCACTATTCAAAATCCTATTTTAAGAAAGTAGGTGCTTCT AAGCACAACGGAATATGTGAAAAAAATTTAAAATGAAGTTTTTTGAAATGAAACCGTGAGTGAAGGGTTAAGCTATTGTA TGTGAATGTATGATAGTTAAAATATGTATTTGGGACAGGTCGGGTGACCCAATGGTCAACCCAGACCTGTCCCAACCTGA AGTCAGGTCTTTTAGTTGAACAATTTTTTTCGTCCTTTCTTTAAACCAGGTTGGGTCTAACCTGGCCAGGTGGCACCGGG TTAGGACGGGTTGATGAGCTGACCGGGGTCTTGTTCACCCCTTTGAATGATCTCAATTTCTTACTTTCTTTTTCGTCTAC CCTCTTGTCTCTGAGAAATGTGCATCTGGTAACTTTGTCTCCAACTCCGCACTTGAATTCTCAACAAACTTAAACAAGTT TCACATGCATGTAGCTACTCATCTATGCACATACAAAATTGTGATGGCTCACAGTGATTGTTTCTTTTATTGACATTTTC GTCTCAGAAAACTACTTGAGGGGTTATCGCCTGGTCTTCGACAGGGAGAATCTACGGTTTGGCTGGTCTAGATCCAATTG TAAGTACTTCTTTTACTTAAATTTTAACCTTCTTTTCCAAATCTTAATGAAAAATTACTCCTACTTTATATGTAGTTTGT ATTCTGTTAACTAAATCAAGAATCTATTATGTGAAACGGGAAAACCTACTGAGTTTTCAAACACATTAAAAGAGTGAGTC AAAGAATGGAACAAATTGATATAGACCTGATTATTTCTTAAAAAAAGTTGTGTTTTGGTCAAAATGAAGGCTAGCTAATT CATTTAAGTTTTGTGGGACTACCTTGTATAGTTTTATGTTCTCTATATCATTTTCATTTGCTTCAAGTCTATGAATGTGC TAATCACTCAGAATCACCAGGTGAAGATAGTGTAGGAGTTAGAGTAAATTCCACATCACCGTCGCCGAGCACTTTACCAG CGAATCAGCAGCAGAGCCCTCCTAATACTCATTCTGTGCCACCGGCTATTGCTGGACACACTTCCCCCAAACCGTCCACG GCTACACCTGGTTTTACCTCTTGGCATTTGTTAAATTCATTGTCTCTGATATGCCTCCTTTTGTACTGGTTATGTGGTTA AGTCTATCTAATCTACTTGTAAATTTTTCTCCAATCTAAACTAGACAATCATGGGGTTTGCTTTTTCATCTTTTTAGGCT GTTGTATCTATTTAGGTTCGTAAGATAATTTTCCCTTTGTTGTTCTTTTGGTATGTAGGCCTTTTCCAATTTTCTTTTCT ATGCATCATCCAATTCTGTAAGCGCAATCCCCCTACCCCCTATTCCTATACCCTAATGGCAGATAAGCTTTTTGTTAGGA TCTTATATTATATGGTTAGTTTTTTGTTAGAATCTTTTTGATTTGCATACATTTCTTTTACATTCTAAATAATGGACTGA AGGGTTCTAAACCCTTCAATTTGCAAACTAGTCATCCTTCACCTGGCCCCATGGAGCTGGGAGTTGGATTTGTCACCCCA CTCATTAGAAATGTTACCCCACTTAAAACACTTTCGAGAACTCAATTCCTGACATATTTCGGAAATTGAGTTTCCGAAGT ATTTTTCTACTTAAAAGTGGGGTGTTACACTGTGTTTTGCACTTCCGGAAATTTAAATCCCGAATTAATTCAGAATATAA ATCCCAAAATAATCGGAAATTAAAAAACCGAAATTGTGGGGTGGGAAATCTAGTCGTGGAGGTGGGAAATCTAATTCTCC ATGGAGCTTAGCTCTCCACTACCTAAATTTGTTTGGGAGGTATTTTTTGAGTAAAAGGAGGGAGGGTAAATTAGTTATTC TAAACAACTTCTAAGTTGATATCTTTTTTAAATGAAAGTTATGGAATGTTAAATTATCATTAGCACAATATTGAATTATT ATAACTATTATATAATTTACTGAATTTTAATAATTGGGTTAAATAATATTTTGGTCATTGTAATACGCTAAATTTGAAAT TGGTCCCTTCTGGAGCAAGTTTGAACTCATACCCTACTACATGGAAACTATTTAGTTTTGGTCCTTGTCGGACATAGTGG TAGTGGTTTGATGACCTTGCCACATGGCTTCACCGGTTCTACGTGTAATTGCCACATGCTTAATGAAGCTGACTTGTAAT TTTTTCTTTTTCTTTAAAAAATGAAATTTTCACCTCAAATTAACTCATTTAACTTTTAATCTAACCCCCAACTTATGTAC CCAAAAAAAATCTAACCCCAACTTAACACTAACTCACTAATTAAAATAATCCCAAAACCAAATTAAACTCCTCAAACCTA GCCATAATTTGTTTTCTTCCCCAATTTCGACTCATCTGCAACAGACTACTTCTTCTCCTCTTCTTTATCCTTCATCTTCG ATTTCTTTTAATGGAAAAAATAAAAAAAAATGAATCAAAATTTATTATTATGTTTTTAGTTAAAATTCTATTATTCATTG AAAAACACTGAAATTATTGCTGAGTAATTTAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAGGAAGTTGTGTCTGACGTCTGAACC CAATAAAACAAGAGATACGGATGGATGACTGTGACTGTGAGTCTGTGAGAAGTGTTACATTGCGGTTCAGTGCGTGTCGG AAAATTGGAACAAGAGGAAGAGCGAAACACAAAAATGGTAGACATTCCTCGAGTGAAGCTTGGAAGCCAAGGCCTCGAGG TAACTAAGTCATTGAAATCTGAATGCCATTTGTGTGAATGTGTTTTCTCATCAATTTCTGGTGTTTGATTGCATTATAGG TTTCCAAATTAGGATTTGGGTGCATGGGTCTATCCGGAGTGTACAACTCTCCTCTTCCTGAACAGGACGGTATCTCTGTG ATCAAGTATGCTTTCAACAAAGGGATCACCTTCTTTGACACATCCGATGTATATGGACCCCATGTAAATGAAATTTTGGT CGGAAAGGTATGTCCATGTTTCATTCTTTATCAGTTTTTCAAAAAGGTACTCAAATTAGTTTATATAAATGTTTGGATAA ACTCATGAAAGTAACTTATGACGACTTGTAAGTTGTTTTGAGTTTATTTTCAAAAGGGGCTCAAATTAGCTTATGGATAA GCACTTTGAGTTTATTTCAATAAGCTTATGAATGAACACTTATGTGTTATATGTTTATTGTCATAAATTCTTAATTTAGA AACCACGAGGTTTGGCATGGTGATTGCCCATCTCGTCCATTAACCACGAGGTTGGAGGTTTGATTTTCTTCGCCTATGGG AATGAAACAAATTTCGTGGCTAGCCGCTTACTGCTTAGTGAGAGAACCCACGGCGAGGGCGTTAGTCACTGCTGTCGACG ATAGATACCCTGGTCTAGAAAAAATGCTTACCTAAGGTTGTTTAATCGACACACCCTATATTTTTCCAAACAATTCGTAC AAAGTTATGGAACAGTATGAATAACACTATGAGTAACTGATCTGTTTCACATTCTTTCTGCCATTTGAAGTTTTAAAATG 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CTGTGGATTATCCATGAACTATTGTTTCACCTTAAAAATAAAGACTGAATTGAGTTAGTAGGAAATCTCAAGGTTTGTTT TAAAGGCTTGTACTGTGAGGTCACTAGAACTTCTTCGGGAAAGGGTGAAGCCATTTCCTTTTATAAAAAAAAAACTCTTT TTAACAAGTGAAGTTCTGAACAATTTTACTTGCTTAAATTGGAACTTTTTCATTTGTGTATATGCTACCAAGTTCTTTAA TTTCTTTCCTGTCAAAAAAAAAAGTTCTTTAATTGCTTTCATTTGCTTTTCCATGTCCTTCATGATTCTTCATTAGATGG CCCTGATCGGTCACAAAACTTACAGGGAACTTGGGATTGGAATAGTACCATACAGTCCCCTTGGCCGTGGATTTTTCTGT GGCAAGGCTGTCATAGAAAGTGTGCCTGCAAACAGTTTTCTGGTATGGACTTGCTCTTTCCTTTATGATGAAAAATTGGC CTTGTTCATTGTTTATCAACATCTCATTTTACCAGGCATTCCAACCAAGGTTCCAAGGGGAGAACTTTGACAAGAACAAG ATCTTCTACTCTCGGCTAGTAAAGTTGGCAGAGAAGCATGGATGTGCAGCTTCACAACTTGCTCTTGCATGGATTCTTCA TCAAGGAGATGATGTGGTACCCATCCCTGGTGAGTGATTTTTCATTTTTTTCCCAACCCACATCAAATAAAATAATCTGC CATTCAGTGCTGCTGAAGGACTGAAAATTTATTCCATCTTTCTTGTTAGAAGAAAGTTGCACCTTGAGTCCTTGACATTT CAAATCACAAACATCCATTTCCACCCAGAAGCCAGAAATCACACCTTCTTCTCTTTTGCCTCCCTGTTCGTCTATGTTTG ATCTGAACATATATATGAACCCCTTCCCTTCATCATGTATTAGAATTTAGGAGCGTGAATGTTTCACGACCAAATTTCTG CGGGTGGTCCATCTATCAGTGGATCTAGGATACACTCTCACACCTTTTTAGAATTCAGACTAGGCTTAACTCTACCTCAA AGCTAGCTGAAGATTGAGGATTGTTCTATCCTTTAATTATAAGGACTTATTTAGCTATATCTTTGTTCAATATGAGACTT CAATTAACATTTTGCTCATGCATCACATTTAAGAGACATTCAAATTATGATTTTTTTTGGGGCCAGACAGTAACATTTCT GCAACCTATGTATTGTAGGAACAACTAAGATAAAAAATCTTGAAAGTAATATTGGGTCATTTGAAGTGAAGCTGAGCGAA GAGGACTTGAAGGAAATTGCAGAAGCAATACCAATATCTGAGGTGGCTGGGGAGCGAACTTCTGATGCTTTAGTTAGATG CTCATGGAACTTTGCTGATACTCCACCAAAAGCATAGCTATACAGCAGTTATGCAACTCAGCGTTCAGATGGTTTTTATT ATTATCTAGTTTCTGGTTTCTACGCACGCCTCCAAAAGTTAGTCATATAGTCATCGAAGGATAAGAGCTGAGGACATATG AGTTGGAGAGGGGAAGGTCTAGGGATCAATCTTTGGAAGGGGAATTTAAATACTTTCCGATGAACCAAAAAAAAAAAGTC TTATCTGAATAAAACTGTTGCTCTTTTGTGTGCTTAATTATGTTTAGATTAAATGATGAGAGAGAGTGTGTGTGTGTGTG ATCTGAATCCAAGATTTCCTATCATGGTTACCAGCAATTTTGCTGAAGGAAATATTTTCTTCACACCTTGCTTAAACATG GTTCGGTTAATGTGATGTTCCCCTAATTCCCTGTTTATTTCTCTTGTCTGGAGGGATGTGAAATAATGAAACTATCTCAT GTTTAAAATGTCTAATGCCATATTTACAATTCGTCTGCTTTGATAGAATGAAGTCAGTAATCATCACTTGTTTTAAATTA CAATTTTAATTTATTGTTTGATG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0149400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTAGACATTCCTCGAGTGAAGCTTGGAAGCCAAGGCCTCGAGGTTTCCAAATTAGGATTTGGGTGCATGGGTCTATC CGGAGTGTACAACTCTCCTCTTCCTGAACAGGACGGTATCTCTGTGATCAAGTATGCTTTCAACAAAGGGATCACCTTCT TTGACACATCCGATGTATATGGACCCCATGTAAATGAAATTTTGGTCGGAAAGGCGCTCAAGGACTTACCTCGAGATCAA GTTCAGATTGCCACAAAGTTTGGGATTGTCAAAGTTGAAGCTGGATCTGGTAATATTATAGTGAATGGTACACCTGAGTA TGTTCGGTCCTGTTGTGAGGCTAGCCTCCAACGTCTTGGGGTGCAATACATTGATCTCTATTATCAGCACCGTATTGACA CCACAGTGCCCATTGAAGACACTATGGGAGAACTTAAGAAGTTGGTCCAAGAGGGAAAGATAAAGTACATAGGATTATCT GAAGCTAGTCCTGACACAATTAGGAGGGCACATGCTGTTCATCCCATCACTGCTGTGCAAATGGAGTGGTCTATTTGGAC TCGTGAAATCGAGCAAGATATTGTTCCACTTTGCAGGGAACTTGGGATTGGAATAGTACCATACAGTCCCCTTGGCCGTG GATTTTTCTGTGGCAAGGCTGTCATAGAAAGTGTGCCTGCAAACAGTTTTCTGGCATTCCAACCAAGGTTCCAAGGGGAG AACTTTGACAAGAACAAGATCTTCTACTCTCGGCTAGTAAAGTTGGCAGAGAAGCATGGATGTGCAGCTTCACAACTTGC TCTTGCATGGATTCTTCATCAAGGAGATGATGTGGTACCCATCCCTGGAACAACTAAGATAAAAAATCTTGAAAGTAATA TTGGGTCATTTGAAGTGAAGCTGAGCGAAGAGGACTTGAAGGAAATTGCAGAAGCAATACCAATATCTGAGGTGGCTGGG GAGCGAACTTCTGATGCTTTAGTTAGATGCTCATGGAACTTTGCTGATACTCCACCAAAAGCATAG
Protein sequence (LotjaGi1g1v0149400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVDIPRVKLGSQGLEVSKLGFGCMGLSGVYNSPLPEQDGISVIKYAFNKGITFFDTSDVYGPHVNEILVGKALKDLPRDQ VQIATKFGIVKVEAGSGNIIVNGTPEYVRSCCEASLQRLGVQYIDLYYQHRIDTTVPIEDTMGELKKLVQEGKIKYIGLS EASPDTIRRAHAVHPITAVQMEWSIWTREIEQDIVPLCRELGIGIVPYSPLGRGFFCGKAVIESVPANSFLAFQPRFQGE NFDKNKIFYSRLVKLAEKHGCAASQLALAWILHQGDDVVPIPGTTKIKNLESNIGSFEVKLSEEDLKEIAEAIPISEVAG ERTSDALVRCSWNFADTPPKA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 340 | 339 | 1.3E-208 | – | |
| PANTHER | 2 | 340 | 339 | 1.3E-208 | – | |
| Gene3D | 4 | 341 | 338 | 3.6E-135 | ||
| CDD | 6 | 312 | 307 | 2.3803E-114 | ||
| SUPERFAMILY | 6 | 312 | 307 | 1.83E-101 | ||
| Pfam | 18 | 312 | 295 | 6.2E-77 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0149400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…