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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0179800 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0179800.2 |
| Related isoforms 4 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Pantothenate kinase; TAIR: AT4G32180.1 pantothenate kinase 2; Swiss-Prot: sp|Q8L5Y9|PANK2_ARATH Pantothenate kinase 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0GNK5|A0A0R0GNK5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0179800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:34627373..34652922) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTGGGTGGTGTGGAATTCATATAAAATGGCTGGTTTGGTAGAACAAGAGGGTCAACAAATTCTTGGAATTGACGAAGAGG GTCAGAACAAGGTGACTGAGAATAAACGCACACATTTGGAAGGGGAAAGGGACATGATGGCTCCTGCAGCAGGAAGTTCA ATTCACAGGTCTGGTTCAAGGCCTCAGCTTGATGTCAGCAAAGCTGAGATTCAAGGGAATGTGGAGGAGAAGTATCCCAC CATTTTGTTGCCTAATCAATCTGATGATTTGTCTCACCTGGCTCTTGACATTGGAGGTATGTATTGTATATATGGTGATT GTTTACCAGGATTCTTTGTTAGTTTCAGGCTTATTGGTGATGTCATGTAAGAAGGGCAGATAATTCTCAAATTGAAAACA CCAAAAGAGGACCTCATTCTTCTTGCCATATATATGCTTTGTGATGTTTGTTCCATTCTTTTTTGCTATGTGGTTTTTGT TGTTGTTATTATTAAATTTTTTTAAAGTTAGCATTTTTGGTTTAGTGCAAGTTTGGAAATTCTAGTACAATTGATTATAA AGTCAAAATCAATTATGGGGAGAAGCTTGTGTGAGTAGCTTATGGGTACATTGATTCTGAGGAAAAATAAGCTGATCCAA CATGCTATTATATTTGGTATGAAGTACTACATGGAATTTCTAGAACAAACTTCCTTCTTTTGAGGAACTTTCCTTTTTAA ACTCCAAAAGGTTCTTTTTTCTCGATTCTTCACATTTTATGTCATCTTTTAGGTCTGGTCTTTCTCCCTGATTTCTGGCA TTTTGAACTTTCTCTTGTGGAGAAAAAAGTTATCAATCTCTTGTGGAGAAAAAAGTTATCAAACCTATGACAGTACTTAT AGCAGTTTGACCTTTTTCCGTTTTAAGATTTTCACAGTTCTGTGTCATGTTCAAGGATTTGAATTTCTTGCAGTTGATTT 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GCAAAATTTCAAAATTTAGTTCTTATATCTTTAGGATATAAGCTAATGTGGAATTTGAATCTGAAAACAAATTAAAGAGA AGCTTAGATGTGGCTTCCTCCAGAGTTCTTGGGTCAATCAGATGTACACAGCTTGATGCTTACCCGTATAAGCAGCTTAT GTGCTCTCGTGAACACATGACCAATAGATCAGAAGACATTGATTTCACTGTTGTGCCAAGGGTGACACCAGTATTGAAAT GAAAAAAATATTCTCTAAAATAGAAATTCCTGCTGTCAGTGAAAACATAATTTGTTTTTTTGTCATTTTCACACCTATAT TCTCCTGATATTTCCTTTAATTTTTTAACAATTGTTTATTTGTGCATAACAGGGAAAATGAGGCATCACTTGCTGTTTTA CCTGACTTGTTCGCGGAACTTGACAGCATGGATGAGGTATGCCTGACTGATACTATAGTCCTCCAAATTTAACATGTTAG GAGGAGGGTTCCATAGTCATTCTCTGATGAGTAGAAGTAAGACTGGTTTATCTAACTGTGTGCTACTCATTTTTTCAAAA AATGTGTACATGCACCCATTATTTCGGTTAAAATAATATTGGGTCCGTTTGTTTCTGCTTAAAAAGTAATTGATTTTAGA GTTAATTAAAAATGGAAGATTTTTTGAAAAACAGAAATTAACTTTGTTTACAAATGTAAAAATTGCTTCACGTTAAAAAG TTACTAGAAATAATTTATTATTCCCAAAGCTACTAGAAATACCTTAAATTAATAATCAGATTTTTGCCTTTTCTCAAATT CTGCTTTTTATTAAAAGCGTATACAAACAGTTCAAAAAATACATAAGTGATTATTTTTTCAAAAACAAGTGTTTATTTCA CAAAATAAGGAGAGACAAACAGGCCCAATAACTGCACGAGTTAGGTTATTCATGAGGCTATCCTAACTCATTCATGTAAA AATATGTTAGTCGTCTTTTTGTGTCTGCTGAGGGCTCAAGTCACCGTAGCTTCTCATAAATCATGTTGCTGCTACCAATC TGAAACTCTTCTTTGTTTTAGGAAACCAGGTTGCTTACCCTAATTGAAGGTGTACTTGCTGCGAACATTTTTGACTGGGG ATCTCGTGCATGTGTGGATCTCTATCATAAAGGAACTATTATTGAAATTTACAGAATGAGTCGCAATAAAATGCATAGAC CTTGGCGGGTAGGTGGAATTAAACATATCTGTAGATGAGGGCACTTGATTTCTGAATTTATTCATCATAATTGATAGTTG AATCTTGAATACTAAGATAACTTTATTCTCATCTAGGTGGATGATTTTGATGTCTTCAAAGAGAGAATGTTTCGACAGAC TGGGGACAAGAAAACGTCCCCTCATAGAAGGGCTTTACTTTTTGTAGATAATTCAGGTGCTGATATTGTTCTAGGAATGC TTCCGCTTGCAAGGGAGCTCCTCCGTCGTGGAACTGAAGTAAGTACACCCTTCGTATATTGGGAAATTTAAACTTTCTTA ACAAAATAATTAATTTGATTTGAATTCAAACTATTACTAAATTTAATAAATGTTAAATGTATTGGTAGCTGACAATATTC AATGTGATTTATGCCTTCTTGCCCAAAATCCCCCCCTTCAGTATGGTTTCTTGTGGATTTTATGATTTTGAACATGTAAA TTTATGATTGATATCTGTCAGTTTGGCTGCTATAAAGTCATTTTGGCCACAATACCTATAAATTGTTTTATTTTCAGGAT TATTAATGGACATTTTCTTGCAGGTAGTTCTCGTTGCAAACTCGCTTCCTGCATTAAATGATGTGACTGCGATGGAGCTT CCTGATATTGTAGCTGAAGCTGCCAAGGTTTTTATATTTTTCAACTTGAATTTGCTCCGTCCACACTATTTTTATTTTAT 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ATCTTGTGAAAGAAATCTCAAGATTGGAGAACAAATTGCGAGATCTTGAAGAGAGGAGAAAACAGAGGGAACAAGAAAGG AGAGAAGCAGAGGCTGCGCAGAGAGAATCAGAGGCTGCAATCGAAGCGGGGCGAACAGCGGCAGCGACGACGTTGTTGAG AGGAATGAAGACGATGGCGGAAGAAGAAAGATACGCTACGGTGGGTGAGCAACCATCAGAAGTAGAGGAAGATTTGACTT CTGAGGAGACGCTGGAACCCAATGTTGAAGCGGCGGAGGAAGATCGAGTAGCGGCGGAGGCAATGCGAAAGGAATCAAAG TTCGCTTCAGATGTGGAGAAAAACCTAACTTTTGCGATGAAGGGCTTCAATCTTGCATCAGAGGTAGCAATGCCGCAATT GGAGATGAAGAGTGGCAAGATCCTGCATGTCCAAAATGGTGATGTGTTGGGCACGATGTTTCGAGTTGCTGCGGAGGCCA CGTTGACGGAAACCACCATGCAGCCACCATGGAAGCGACCACACACATTTGTTGGTGGGCCGGAGAAGACAAAACGTTCG CTGGTGAAACCACCAAACACGCTTGTTTGCATGCCGGAGATGATAAATCGTCCACCGGCGAAACCGCCTAATATAGGGGC TTTGTGGGCGTCGACGTCGGCGGAGTTTATCGTCGCAAGTCGTGCACCAATGGGGAAGAGAGATGACAGATTGAAGATGA GTCTTCTCCAATGTCGCAAGGAGGATCTGCCTCCATCATTGGATCCGTCAGAGCACAGTACTCCTGCAAAGTTCGCTACT TCGCAAACGGCAAGAGAGGTGTCGACGAGAGCAATTCCACAAGCGAAGGAGATGAAGGCAGCAAGCATGCAGGTACAGTT TCTGCCACTAAATTCATCGAAATCAACTATTTGTGTGGTGAACAAAGGGAAAGTGGAAGATAAGAGACAAGCTAAACTGA TCACTGTAACCATGCGTGAGTGGTACTGTTTCTGTAATGATCTCAAAACAGAGACGAGGCCAGCAAGGATTGGGTCTGAG TTGAACATTTTTTCTAAGCGAATGGGACAATCCCAAAACACTAAAAGGGGGGATTGGGCCTTACAACAGAATAGGGGAGT CAAATTAATAGATTGGGCCAACTTATCAGCTTTTGGGTCAAAACCCAATTTGCCCATGTACTTGAAGCAGGGAACCAGAA CTCATTTCAAAGAGTTACAGAGAACTATGCTGTTGACTACAAGTGTAGACATTGAAGAGGATGGGATTGCTGTGTCAAAA TTATACTTCAGCTTTGATTGTGAGTTGCAACACAGGTATGCATATAAATTTTTTGGTAGATAGGAACAAGGCCATGGTAG TACAAACAAATTGATTGTTGAAACTTTTACTACTAGTTTTGGCCATCTTGGTACTGGACAGGAGCAAGACAGTATTTTGG GGTTATTAATTGATCCGGGTGGACACAATATGAGAATGGGGGGAGGAAGTCGAAGAACAGTGGGGGCTAAGAACAAGTAT TTAAGTGATTTGTTCTATATTGTCATTTTGGGGAGTATAGAATATTGGGGTAAACTTGAGTTCTTGGTCCAAAGAGTTGA TAATGAGGTTTATAAGCCTTGTGGTTATTTCCCTGCTGAGTTCAAGTATCAACTATTCAGCAATCTAGGGACCCATGATG ATGAGTCAATTTTCACAGCCACCATGGCAAGGAATTGGGGAGATTATGCTATTTGTATCCATGACATGGCTAAAGTAATG ACAGTGACTAAAATGAAGGACAGGAACAAGCAATCTTCCAATTTCATATTGCTCCCTTGCCACCTTGATCACACTAGAGT ACCTTTGATAATTTGGCATTCATTAGATCCCTATATTCTGGTTTTCACTACTGTTGAGGGTGATGCTATGCTAAAGATGG GTCATGCCCAGGTTCGAAGGTGGGCTCAAGAGGTGGAAATTAGAGCTGTGCATGAAATGGGCTTGGATTCAGCTGAGTTA GCTGCTGGTTTTTACAGCTTGGGTTCTCAAAGTGCTGAGTTATATAGTTTGGGGAGGCTAGTTTTTGAAGGTTCTGCTAC CTTGCTTCTTCAACCTGTTGGCAACCGCTTGGTCTTCTACACATTGTTTTTCCAGAATGGGAACCTTGGCAACAGTTATT TGAGTTGGCCTATGAAGATGATATCCAATTCTTATGTGGCTGGGAATATTTGCTTTCTGCAATGGGATCCAGGTGGAAGT TGTGCTTGTCCCATTTGGATTCTTGAGATAGTTGTTCCATGATGTAGCTTGTCATTTGTCTTCACCTTGAGGACAAGGTG AATTTTCAGGGGGGGAGTATTGATAGGAATGCAGGGTTAGTTAGGAATTGTTAGTTGTTAGGAAGTTAGTTAGACAGTTA TAAGGCATGTTGCCTATAAATAAGAGAGGTTAGTGAACATTAGGGGTATCTTTGTATTCTGTTAGGAATTGGGTTTAGAG AGAGAAGTGGTTCTCTTTCTAGGGTTAGAGAGGGTGTTTGGCATCTCTCTCATGTATCTTTCCCCTAATCCCCAATTGGG AATTAGGGTTCTATCAATAAACTACTGCTAAATTTCTGAGTTCTATCACTCATTTTATAGTGCATGTTTGAAAACTCGTT TGGAAACCACGGTGAAGTCAAAATTATGATGGACACTCGTTTGAAAAACTCATTTGCAACTTACCTTAGTTTTTGCTTTA GTCCATAATTTTGGATTCACTGTAGTTTTCGAACGAGTTTCCAAACATGCGCAGATGGTCACTTGATTTAAGAATATCAA GGAGAAAGTTATTCTAATTGAGCTTTTGTTATCTGCAGATAATTTTGGAAGGCATGGGTCGATCTCTTCATACTAACCTC TATGCTCGGTTTAAGTGTGATGCTTTGAAGGTAATATTATCTGGTTTATAGCTAATGGTTATTGTCACTATCTAATGACT TTTTCATACTTTATTTTGCTCTTTTTTTTTATGATGATTACCTTTTGTTGAAGATTCTATTACTTTGTGTTCTTACATGG TTTTATGAACAGATTGGGATTCTTCATATGAATTTTCTTTCTCAGCATTCAACCACATTTTGAATTATACATATTTTGGT TATTTTTAGCAGCATGTTAGGTTTAGCTGTTTAGAAAGCTCTGGTGTGTTTTTATGCAAAAGCTTATTCATCATTAGGAT CGTCGATTTGAGGAGATAAACTGAGCATGCAATAACTGCTAATGACATTTGAATCTTTTCACACTGCATTTGTACATGTC ATTCTGTTGATGTGAGATGATAACTTTAAGTGGTTGGCTTGTCACACTTTTAGCCCCCTTCTTCATATTTGTTTATTTAT TTATTTTTCAATAATTTTTACAGCTTGCAATGGTGAAAAACCAGAGATTGGCTGAGAAGTTGGTTAAAGGGAACATATAC GATTGTATTTGCAAATATGAACCTGCTGCA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0179800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTGGTTTGGTAGAACAAGAGGGTCAACAAATTCTTGGAATTGACGAAGAGGGTCAGAACAAGGTGACTGAGAATAA ACGCACACATTTGGAAGGGGAAAGGGACATGATGGCTCCTGCAGCAGGAAGTTCAATTCACAGGTCTGGTTCAAGGCCTC AGCTTGATGTCAGCAAAGCTGAGATTCAAGGGAATGTGGAGGAGAAGTATCCCACCATTTTGTTGCCTAATCAATCTGAT GATTTGTCTCACCTGGCTCTTGACATTGGAGGATCTTTGATAAAGTTGGTGTACTTTTCTAGACATGAAGACCAATCAGC TGATGATAAAAGGAAAAAAAGTGTGAAGGAGCGACTGGGGCTTTCTAATGGTAACAGGAGAAGCTTCCCTATTCTTGGTG GAAGGCTTCACTTTGTGAAGTTTGAAACAAGAAATATCAATGAGTGCTTGGATTTCATTCATTCCAAGCAGCTTCACTGT GGCGGGCTGGAGTCACGTTTCTCTGATGATGTGGCTGACCAGAATGGCATAATCAAGGCTACTGGTGGTGGAGCATACAA GTATGCTGACCTTTTCAAAGAAAGACTGGGGGTTAGTCTCGACAAAGAAGACGAAATGGATTGTCTTGTGGCCGGAGCAA ATTTCTTGCTTAAGGCAATTCGTCATGAAGCTTTCACACACATGGAGGGCCAAAAAGAGTTTGTTCAAATTGACCCTAAT GATATGTTCCCTTATCTTCTGGTTAATATTGGATCTGGTGTTAGTATGATTAAGGTTGACGGGGATGGGAAATTTGAGAG GGTCAGTGGTACTAATGTTGGTGGTGGTACTTATTGGGGTTTGGGAAGACTGTTAACAAAGTGCAAGAGCTTTGATGAGT TACTTGAGCTGAGCCAGAAAGGAGATAATAGAACTATTGACATGCTTGTTGGGGACATTTATGGTGGTTTGGACTATTCT AAGATTGGCCTATCAGCTTCCACTATTGCTTCAAGTTTTGGAAAAACTATATCAGAAAAAAAGGAGCTTGAAGACTACAG ACCTGAAGATATATCACTCTCTCTTCTAAGGATGATTTCATACAATATTGGCCAGGTAGCTTACTTGAATGCACTGCGAT TTAAGTTGAAGCGAATCTTTTTTGGAGGATTTTTTATAAGGGGTCATGCTTACACCATGGACACTATTTCTTTTGCTGTT CATTTCTGGTCTAATGGTGGAGCTCAAGCAATGTTCTTGCGACATGAAGGCTTTCTGGGAGCCTTAGGTGCATTTATGAG CTATGAAAAGCATGGTTTAGATGACCTCATGGTGCATCAGTTAGTTGAAAGGTTTCCAATGGGTGCTCCGTACACAGGAG GCAAGATTCATGGCCCACCACTAGGAGACTTGAATGAGAAGGCAAGTGGTCAGAGTTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0179800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAGLVEQEGQQILGIDEEGQNKVTENKRTHLEGERDMMAPAAGSSIHRSGSRPQLDVSKAEIQGNVEEKYPTILLPNQSD DLSHLALDIGGSLIKLVYFSRHEDQSADDKRKKSVKERLGLSNGNRRSFPILGGRLHFVKFETRNINECLDFIHSKQLHC GGLESRFSDDVADQNGIIKATGGGAYKYADLFKERLGVSLDKEDEMDCLVAGANFLLKAIRHEAFTHMEGQKEFVQIDPN DMFPYLLVNIGSGVSMIKVDGDGKFERVSGTNVGGGTYWGLGRLLTKCKSFDELLELSQKGDNRTIDMLVGDIYGGLDYS KIGLSASTIASSFGKTISEKKELEDYRPEDISLSLLRMISYNIGQVAYLNALRFKLKRIFFGGFFIRGHAYTMDTISFAV HFWSNGGAQAMFLRHEGFLGALGAFMSYEKHGLDDLMVHQLVERFPMGAPYTGGKIHGPPLGDLNEKASGQS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 35 | 35 | - | – | |
| MobiDBLite | 20 | 35 | 16 | - | – | |
| PANTHER | 79 | 451 | 373 | 1.1E-192 | – | |
| PANTHER | 79 | 451 | 373 | 1.1E-192 | – | |
| SUPERFAMILY | 83 | 223 | 141 | 4.66E-36 | ||
| TIGRFAM | 84 | 427 | 344 | 1.7E-111 | ||
| Pfam | 84 | 426 | 343 | 1.7E-135 | ||
| Gene3D | 86 | 426 | 341 | 1.6E-128 | – | |
| SUPERFAMILY | 195 | 428 | 234 | 1.79E-70 | ||
| Gene3D | 225 | 420 | 196 | 1.6E-128 | – | |
| Gene3D | 305 | 349 | 45 | 1.6E-128 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Pantothenate kinase activity | Catalysis of the reaction: ATP + pantothenate = ADP + D-4'-phosphopantothenate. | ||
| Molecular function | ATP binding | Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator. | ||
| Biological process | Coenzyme A biosynthetic process | The chemical reactions and pathways resulting in the formation of coenzyme A, 3'-phosphoadenosine-(5')diphospho(4')pantatheine, an acyl carrier in many acylation and acyl-transfer reactions in which the intermediate is a thiol ester. |
Expression pattern of LotjaGi1g1v0179800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…