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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0248900 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0248900.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Replication factor-A-like protein; TAIR: AT2G05642.1 Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein; Swiss-Prot: sp|Q65XV7|RFA1C_ORYSJ Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit C; TrEMBL-Plants: tr|G7LDT6|G7LDT6_MEDTR Replication factor-A carboxy-terminal domain protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0248900 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:59746769..59757686) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTTGCTGGAGGAGAAAGGGCTTTCCTGTGTATCTCCATGTAGTTGGTGAACTCCCATTCCTCTTGACCCAAATCAGAGT TCTTCATTCAGTAGGTAACTCCAAATCCTAATCTCTACAACCACTTTCTTTAATGCAATTGATTTGAAGTCAGATTTCAG TCAAGTTTATGTCTCATCTAATTGGAGGTCATATTTTTCCAGTACCTTATATTACAAAGTCATCAGTTTCTGATGTCAGA CAAATCTTCCCGGAATAGATTTTTAAGATTTCTTATTTTGTACTCTGATTGACAGAGGAATGACATTTATTTTGGGGTAG ATATCACAGATTAAAATACTATTCTTCCCAGGCTATATATATCTACCCCTTTGTATGCTATAACGTGAAAAGTTTAAGAC AAGAGTTCAAAACTAGCACCTTATTCTCAGTTTCAGTTGTTGTGTTAAGTATGAAGTCCAGTTTGCCTAAAACTTTGTTT CCTTTTTGTTATCTCAGGAAAAAATATATTGCAGATCGTCCTACTCCTTCTGCTTGGTGTGATTTTGATAAAGTGGAACA AATTTCACTTGATGATCATCCTTGGAATATCAAGGTGCGTGTTCTTGCTTGCTGGAAAAATCCTGATGAGCTGTTGGAAT CTGAATCATCATGCTTGGAAATGGTGCTTATTGGTGCTGAGGTAGGAATTGTAGACTAATCTAATAATATATGTTACTTA TGCTCTATACTTCATTGTATCATTGTTTCATTATAATTAGTGACAATGTTTCTTTAGTTAAGTAGACTTCTTCAATGTGT TGTATTTCCTCTTTAAACATTCATAGTGTGACTTTGCATTTGTTGTAGGGTGTCAAAATACAAGCTTCTATCTGTAAGAG ACACCCAATAAGGAATCAGATTGCTGAAGGAGCTGTGTACAAGATATCAAATTTCAGGATCTTCCCTAATGATGGAGTGC TGCGTTTCACCGGGCATAGCTGCAGGCTTTTTTTTCATGGATGCACAAAGATGGTTCGAACCACTGAGGATGGTGTTATT CCTTTAAACTGCTGGTCCTTCTTTGATACACGCCATATTAAAATTATCAGGGATACCTTCACAGAAGTAATAGGTGAGTG TTATTGAAAACTTGATATTTTAATGTTATCTAAAATCTTATTCATGGTGTCACTACTGTAAATGATTGATGATATTATAT GATAGCCAAATTGCTGTAGTAATATTGGTGCAAGCATTGGAATGTAATTTGTTGCAATTTTTTTAGAGAAGTATAATAAT AATCTTCACAAATTTTGTATACCAAATGTTAGGAACTCATTTTATACCCACATTAAAACACTGGAATAAATCACCGCTTC GAGTCTGTTGGTTGTTTTCCATAACATTTCCATTCATCTATGTTTCATATTTCATTTAATGTAATGGCAAATTTGAATTA GATTTTGTTGGACTGGTCATTGCTGCATCAGAGGAGAAGGTTTACATCAGAAATTCAAAAATTACTAAGAGGATGGTGAT TCAACTCCAGGACCTTAGGTATTTAATATTAGTACAATAATTTTTTTGGGTTACTATTGTCATGCTTGTGTGAAGTGTTT AGTGGGCCTAATGTGATAATTATAATATTCACAGGGGAAATATCCATTGTGTGCTTGAAGGAGAACATGTGGAAACATTT TTGGAGTATTTGTCTTCAAACTGGACAGAAAAACCTATGATGGTTATACAGTTTGTCAAAGTTTTCACCCCACAGAGGTG ATTAGCAGGAAATGGTTTTATGAATGTCCTTATTTAATTTAAATTATATAATTTGATGTGTTTATTAAACAATTTGCAGG GAGACTATTCATTGATTGCATACCACCTGCAACCAAAATGTACATTGAGCCTGTTATTGAGGAATCAGTTGTGCTAGCTG 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AATACGTAATGATGGTGGAATTACATATAATGGAGCTGAATGTTACCATGTCCTTGCCATTACTGAGGATCCTGAAGCAA TTTCCTTATTTCATGCATTACAATCTAATGATTCAACTGCCAATGTGTGTTCCTGAAACATTTTTTTTTGCTGCTAATTT ATTTTACCATATCTTCTTCTTGTATATGGTTTTTTATACGCTTGCTTCTCATGGTGAACCTTAATTCATTGTTTATACAT TTTAGGCACATTTGGGACCAAATACCACTGGTGTTGAAAACACAATGAAGAGCTGGAAGACAAGGAAGTTGGTGGTTTTT CCTATAATACACCATTTGAAGATGTGCCTGAAAGTAGCACTGGATCTTTACTTCCCAAACCATTGAAGAGGGAAATTGGT GTTGGACTTTGATGATGAATCTGAGGGAGGATGGTAATAATGTCCAAGTTGTGGAAGGTTTCCTGAATGAGAAGAATTCA TCTAACTTGGTGCTTTCTGCTGACGAAGACAACATTAGGGTGGAAGTGGATGAGGACAAAAGTATTGATGATGCAGATGA TGACTTTGAATGTACTATGATGGAAATTGCTGAGGAAGATGAGTTAGATGATGAAGCTGAATTGGAGGATGATCTTGCAT ATGTTGACTGAGTTACTAATTCTGTTTTTCTATGTGTTTCATTAAGTTTATCTAACTATGGCACCAGCTTTAGGTTTAAG TATTTTGGATGTTATGTTGTACAATTAAGTCCTTTGTTTAGTTCAAGGGACATGTTTATGTTTCAAGTGCTTTAGGTATA AGTATTTTGGGCTGTTGTGGTGCCCAATTAAGTCGTTTGTTTAGTCCAAGAGACATGTTTATGTTTCAAGTGTGTCTATA TTAGGTAGTTCTTCTAAGTTCTAAGTATGTGTTTTTCATTTTACTGCCATGTATGTGAGACTACATGTTTGTACGTATGT TATGTGTTGTTAATATAATGTTGGTGTTTTTTTTAAAGTAGAAATATATATATATATATATATATAATATATATTATATA TATACACACATGTATATTGATAGATAAAAGTCTTGGGAACAATTCCCTCCCAAGTGAGAACAAAGTACAGCTAAAAGAAA GAGAAGACAAACAAATAAAAAGAAGACAACAATAACTAGAAGAAAACACAAAAAACAAGATAGAAAACTAAGACTAATTA CCACGTAAGAAATAACAAATAGACAAAGAAAGTCAAGGCTCCCTCCAGTAGCGTTGGATTCAAAACATATTTTGTCATAC TGTATAAAGTCTTGTGCAGCTTCTTCAAGCACAAGGGGACCCCCCACTATTATTATTCCAATATTCACGCCACTCTTCCA TACTCCCTTGTCCAGTAATATATTGGATTCCCAGCAATATCATGACCCACCAACACAAGAACTAATTTATCCACACAATA TCATCTGTCATCCAAGAATATAGCATCTGATATGAGAACCCCCTTCCCCATGTAGATTCTTCGTCTACGGGATCAAAGTT GCATAAGAGCAATGAAGTCCTATATCATGATATGCTACTATAATACTCATGCTCTGAGTTTCATTCATCATCTCAAGTTT GCAGTAACTCATAACCAGCCTCATAACCAGTCAAAAAAAATTTTAATAGCTTGTACATGGCAACATATGTATTATAACAT ATGTACATAATGTATATCGTATTTAAGTTATTAATTCACACTTATATTATATAGTTTCATATGGATTAGGTTAGCTTTAC ACCTCTTACATATGTATACAAGACGGAAATAAGATAAACCAACGAAGAAAAGTGTCTAAAGTAAAAGATAGTGCAGGTGG AAACGCAAATGATAACAATTAAAACAACTTCAGTTTGGAACCTTAGCAGATTGTTCAAACGCAAATGGATTAACTGTGTT CAATAACCAGTATAATCAAGTTTAACAAACTCTGTAATCGCTTATTCGTGTTTCGAATAAAATTAAATGATAAAACCTCG TGCATCGCACGGGTTAAAGAATCCTAGTCAGATATAGGAAGGAGGAGTTGAAGAGTGAGCTGTGCATTCAGCAGTGAGTT GACTGCGAGATAGATGACGAAGTTGAATTGCAGAAGAAGCATCCTCCTTCTCCTCTTCTTCTTCTTCCTCGTTGCAGTCT CGTTAGCAATAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAACAATTCATCTCTCGTTTCCAGCAATACCTTCAAATCCAAACTGACCA ACCAAACCCACGTTACAAAGAAGCATCAGAGTTTCTCATCTCACAAGCCCAATCCTCTCACTCGAATTCCAANNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNGGGTCAAATTTTGATCACTTCAAACAAATGTTTGGTTTTTATTATAACAATAGTACATTATAATTTTT GGAAAAAATGACTAAAAATATATTATCTAAAACACTACTTAGTGTATCTAGGTTGAAAGAATCGACAACACATTATAGTC ATATAGATAATGTGTTATCTAAATAACTAATAAGCTCTGATTAAGTCTCATAGAACACTACATTTATTTATGACTAAATT TGTTAAATTATGATTTAAAACGATTTATGTTAGACTTATGTAATGTTTTATGTTTTTGTATAATTGGTTATTTTGATATG TTTTTATAGCCTCTACTATATAGTGCTTTTGAATTTGATTATTACTGTCCTAAGACCCTGTTTGGGAAAACAGCTTAATT AAGTGCTTATGGTCATAAGTTATTTTAAAAAGTTTATTGATATAAATTGAAAATAAGTTATATATAAACATAAGTTCTTT TTAATTAGTTATCATAAATAGTTATGAAAATAACTTCAAAATAACATACGATATGACATTACTTGTTTGAATAAGCTATT CCAAACATTGACATAAGCGCTTGAGCAATCAGATAAGCTCAAATAAGTTGTTTCCTCTTTGTGATGTTAATTGAGGCATA ATTGTACGGTCGACATTTGGTATATGTTGCGGGGTAGTTTTTTAAGTTAGTTTCAAGTTCAAGTTCAACTTCAAGTTCAA GTTTAAGTTTAAGTTCAAGTTCAGGCATTGGATTGGCTTTAATATTTAGTTTCTTTGGATTTTTGTCTTTTCTTTCTCTA CTTTTTCTCTTGTATATGGGCTTAGCACCCCTTGTGCTAAATTTAAATGCAATTCTTTGACTTATGAAAAAAAAAACTTC TCAAATAGTTGAAAGTTTTGGAATTATTTGTTATTTGAAAATATTAATATAAAATGCCTCCAAATTTTAAATTATCTTTT TTCAATGTATTTGAGCTACCTTGATTTAGGTGTGGTTTAACGTGTACTGAAGAAATCTTTTGATTAGACTTAAAAAAATG TTATAATTTAAAAAATATATTTATTGTATTCCATAAGAAATTAAATTAGATAAATGTTTTAATTTGTTCATTCAATATTT TGTCTACAGTGTGGAAATAATACTCAATCTTTTTAAAAAGATAAGGATCCACATATTTATGTGTATCATTAACGGCTGTC ACAAAAACAATATCATCAACACATTGAATTTAATTGAAATCTTGACAAATTTTCTTCCCATTTAGATAGTATATATTTTT GTTTAAACCTAAAACAAATTTTTTTTTTAAATAAATAAAAAATAAAAATATACTCAAACAGTTTTTTGATATTTTCTATA TCTTCTTATTAAGTAGCATCACCAAACACGTCCTTCTCTGCACCCTAGAATCATTGTTTTTTTCTGTGCTATCGGTGTCG AAATTGAGTTGTCATCTATGATCAAGGTTCTCCCATTCCTAAATTCTGCCACCTCCTGATGTAGTTGCATAAGGTGAAGG GCAAGGAGGACGCGTGGACATCCACCTGCTGTTTGAACTCTATATTTAGGGTTAGTCGTTCCATAGGTTGCTATGGACAT TCACTTCTCTGATTCTAATTCATCGTTGGGGTTTTCAATTGAATCTCAATTCATTTGAATTCTTGAATAGCAATTTGATG TCAGCGGTAAGCCATGGTTTTGTACTTTTGCGTGTGAGGAGACTTTGTTGATTGTAATTGATGATTTATTGATTTCCTGT AGCCTGATCTTTGCTGGAGGAGAAAGGGCTTTCCTGTGTATCTCCATGTAGTTGGTGAACTCCCATTCCTCTTGACCCAA ATCAGAGTTCTTCATTCAGTAGGTAACTCCAAATCCTAATCTCTACAACCACTTTCTTTAATGCAATTGATTTGAAGTCA GATTTCAGTCAAGTTTATGTCTCATCTAATTGGAGGTCATATTTTTCCAGTACCTTATATTACAAAGTCATCAGTTTCTG ATGTCAGACAAATCTTCCCGGAATAGATTTTTAAGATTTCTTATTTTGTACTCTGATTGACAGAGGAATGACATTTATTT TGGGGTAGATATCACAGATTAAAATACTATTCTTCCCAGGCTATATATATCTACCCCTTTGTATGCTATAACGTGAAAAG TTTAAGACAAGAGTTCAAAACTAGCACCTTATTCTCAGTTTCAGTTGTTGTGTTAAGTATGAAGTCCAGTTTGCCTAAAA CTTTGTTTCCTTTTTGTTATCTCAGGAAAAAATATATTGCAGATCGTCCTACTCCTTCTGCTTGGTGTGATTTTGATAAA GTGGAACAAATTTCACTTGATGATCATCCTTGGAATACCAAGGTGCGTGTTCTTGCTTGCTGGAAAAATCCTGATGAGCT GTTGGAATCTGAATCATCATGCTTGGAAATGGTGCTTATTGGTGCTGAGGTAGGAATTGTAGACTAATCTAATAATATAT GTTACTTATGCTCTATACTTCATTGTATCATTGTTTCATTATAATTAGTGACAATGTTTCTTTAGTTAAGTAGACTTCTT CAATGTGTTGTATTTCCTCTTTAAACATTCATAGTGTGACTTTGCATTTGTTGTAGGGTGTCAAAATACAAGCTTCTATC TGTAAGAGACACCCAATAAGGAATCAGATTGCTGAAGGAGCTGTGTACAAGATATCAAATTTCAGGATCTTCCCTAATGA TGGAGTGCTGCGTTTCACCGGGCATAGCTGCAGGCTTTTTTTTCATGGATGCACAAAGATGGTTCGAACCACTGAGGATG GTGTTATTCCTTTAAACTGCTGGTCCTTCTTTGATACACGCCATATTAAAATTATCAGGGATACCTTCACAGAAGTAATA GGTGAGTGTTATTGAAAACTTGATATTTTTAATGTTATCTAAAATCTTATTCATGGTGTCACTACTGTAAATGATTGATG ATATTATATGATAGCCAAATTGCTGTAGTAATATTGGTGCAAGCATTGGAATGTAATTTGTTGCAATTTTTTTAGAGAAG TATAATAATAATCTTCACAAATTTTGTATACCAAATGTTAGGAACTCATTTTATACCCACATTAAAACACTGGAATAAAT CACCGCTTCGGGTCTGTTGTTGTTTTCCATAACATTTCCATTCATCTATGTTTCATATTTCATTTAATGTAATGGCAAAT TTGAATTAGATTTTGTTGGACTGGTCATTGCTGCATCAGAGGAGAAGGTTTACATCAGGAATTCAAAAATTACTAAGAGG ATGGTGATTCAACTCCAGGACCTTAGGTATTTAATATTAGTACAATAATTTTTTTGGGTTACTATTGTCATGCTTGTGTG AAGTGTTTAGTGGGCCTAATGTGATAATTATAATATTCACAGGGGAAATATCCATTGTGTGCTTGAAGGAGAACATGTGG AAACATTTTTGGAGTATTTGTCTTCAAACTGGACAGAAAAACCTATGATGGTTATACAGTTTGTCAAAGTTTTCACCCAC AGAGGTGATTAGCAGGAAATGGTTTTATGAATGTCCTTATTTAATTTAAATTATATAATTTGATGTGTTTATTAAACAAT TTGCAGGGAGACCATTCATTGATTGCATACCACCTGCAACCAAAATGTACATTGAGCCTGTTATTGAGGAATCAGTTGTG CTAGCTGGAAGGTAGAATCATAACTATCCTCTACTAACTTCAATAAAGGGTATATAATTATGTCCATTTTTTAGTTATTA TCTCTTTGGACTGACATTTAATTGATTTATCATTAGGTTGGCAGAAGCTGGATTTCAAAATGGCCCTGTTGAGTTTATAA GTCGTGATATTGCGTATGCGAATCTTAATGCTGACGTGCTGAAGTTCTACCCAAGGAGAACAATTTCTGAGCTTTTAGTG GAGAAAGAGGTAAATCTTTATCTTGTTTAATTACATATGTGTTAAATATAATAACTTGGATATTTAGTTATTTTTTTCAG TATTAATCTGTGATTATATCGTTATATTTGTCTAACATGATCCAAACCTAATTTATTCACAGCAAGGTGTATTTCTTGTT CATGTTGTTGTTGTTGCGGTCTTAAAGGGTGGTTATTGGTGTTATCCTTCTTGTAGATGCCACAATGAGTTGAATTTACG TAATGATGCGTTTGAATGTTCAAAGTGTTCTATGATCTTTGAGAAGATGATTCATAGGTCAGTTCAACTGTCTTTATTAT TTTCACCCACTGTTTTAATGTTCATGTTCAAAAGCCATTTTGTCATAGTCATAATTGTTAATTTATGTGATATTGCAACA ATAGTCATTGACCACTTGGTTTCAATATTAACAGGTACCGTGTTAAGATTGAAGTTTTTGATGCTTCCGATAGTGCTGTT TTTGTTCTCTTTGAGAGGGAAGTACAACAATTGATTAGTGTGTCATGTGAAGATTTAGTCAGTAACATTAAGGTGTGACA TGAAATACTATTTTTTATTGTCTATGTGTTTATACTATGGTCTTATATTTATAATGTGAAAGTTATTGACTTCTGAAAAC TTATGAATTGTAGGTGGATGATGATTCTAATGTTGTCTATCCACAAGAATTTGAAGATCGCATACCTGGAAAAGAGCTTA TTTTTAAAATACGTAATGATGGTGGAATTACATATAATGGAGCTGAATGTTACCATGTCCTTGCCATTACTGAGGATCCT GAAGCAATTTCCTTATTTCATGCATTACAATCTAATGATTCAACTGCCAATGTGTGTTCCTGAAACATTTTTTTTTGCTG CTAATTTATTTTACCATATCTTTTTCTTGTATATGGTTTTTTATATGCTTGCTTCTCATGGTGAACCTTAATTCATTGTT TATACATTTTAGGCACAATTTGGGACCAATACCACTGGTGTTGAAAACAATGAAGAGCTGGAAGACAAGGAAGTTGGTGG TTTTTCCTATAATACACCATTTGAAGATGTGCCTGAAAGTAGCACTGGATCTTTACTTCCCAAACCATTGAAGAGGAAAT TGGTGTTGGACTTTGATGATGAATCTGAGGAGGATGGTAATAATGTCCAAGTTGTGGAAGGTTTCCTGAATGAGAAGAAT TCATCTAACTTGGTGCTTTCTGCTGACGAAGACAACATTAGGGTGGAAGTGGATGAGGACAAAAGTATTGATGATGCAGA TGATGACTTTGAATGTACTATGATGGAAATTGCTGAGGAAGATGAGTTAGATGATGAAGCTGAATTGGAGGATGATCTTG CATATGTTGACTGAGTTACTAATTCTGTTTTTCTATGTGTTTCATTAAGTTTATCTAACTATGGCACCAGCTTTAGGTTT AAGTATTTTGGATGTTATGTTGTACAATTAAGTCCTTTGTTTAGTTCAAGGGACATGTTTATGTTTCAAGTGCTTTAGGT ATAAGTATTTTGGTTGTTGTGGTGCCCAATTAAGTCGTTTGTTTAGTCCAAGAGACATGTTTATGTTTCAAGTGTGTCAT ATTAGGTAGTTCTTCTAAGTTCTAAGTATGTGTTTTTCATTTTACTGCCATGTATGTGAGACTACATGTTTGTACGTATG TTATGTGTTGTTAATATAATGTTGGTGTTTTTTTTAAA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0248900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTGCTTATTGGTGCTGAGGGTGTCAAAATACAAGCTTCTATCTGTAAGAGACACCCAATAAGGAATCAGATTGCTGA AGGAGCTGTGTACAAGATATCAAATTTCAGGATCTTCCCTAATGATGGAGTGCTGCGTTTCACCGGGCATAGCTGCAGGC TTTTTTTTCATGGATGCACAAAGATGGTTCGAACCACTGAGGATGGTGTTATTCCTTTAAACTGCTGGTCCTTCTTTGAT ACACGCCATATTAAAATTATCAGGGATACCTTCACAGAAGTAATAGATTTTGTTGGACTGGTCATTGCTGCATCAGAGGA GAAGGTTTACATCAGGAATTCAAAAATTACTAAGAGGATGGTGATTCAACTCCAGGACCTTAGGGGAAATATCCATTGTG TGCTTGAAGGAGAACATGTGGAAACATTTTTGGAGTATTTGTCTTCAAACTGGACAGAAAAACCTATGATGGTTATACAG TTTGTCAAAGTTTTCACCCACAGAGGGAGACCATTCATTGATTGCATACCACCTGCAACCAAAATGTACATTGAGCCTGT TATTGAGGAATCAGTTGTGCTAGCTGGAAGGTTGGCAGAAGCTGGATTTCAAAATGGCCCTGTTGAGTTTATAAGTCGTG ATATTGCGTATGCGAATCTTAATGCTGACGTGCTGAAGTTCTACCCAAGGAGAACAATTTCTGAGCTTTTAGTGGAGAAA GAGCAAGGTGTATTTCTTGTTCATGTTGTTGTTGTTGCGGTCTTAAAGGGTGGTTATTGGTGTTATCCTTCTTGTAGATG CCACAATGAGTTGAATTTACGTAATGATGCGTTTGAATGTTCAAAGTGTTCTATGATCTTTGAGAAGATGATTCATAGGT ACCGTGTTAAGATTGAAGTTTTTGATGCTTCCGATAGTGCTGTTTTTGTTCTCTTTGAGAGGGAAGTACAACAATTGATT AGTGTGTCATGTGAAGATTTAGTCAGTAACATTAAGGTGGATGATGATTCTAATGTTGTCTATCCACAAGAATTTGAAGA TCGCATACCTGGAAAAGAGCTTATTTTTAAAATACGTAATGATGGTGGAATTACATATAATGGAGCTGAATGTTACCATG TCCTTGCCATTACTGAGGATCCTGAAGCAATTTCCTTATTTCATGCATTACAATCTAATGATTCAACTGCCAATGCACAA TTTGGGACCAATACCACTGGTGTTGAAAACAATGAAGAGCTGGAAGACAAGGAAGTTGGTGGTTTTTCCTATAATACACC ATTTGAAGATGTGCCTGAAAGTAGCACTGGATCTTTACTTCCCAAACCATTGAAGAGGAAATTGGTGTTGGACTTTGATG ATGAATCTGAGGAGGATGGTAATAATGTCCAAGTTGTGGAAGGTTTCCTGAATGAGAAGAATTCATCTAACTTGGTGCTT TCTGCTGACGAAGACAACATTAGGGTGGAAGTGGATGAGGACAAAAGTATTGATGATGCAGATGATGACTTTGAATGTAC TATGATGGAAATTGCTGAGGAAGATGAGTTAGATGATGAAGCTGAATTGGAGGATGATCTTGCATATGTTGACTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0248900.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVLIGAEGVKIQASICKRHPIRNQIAEGAVYKISNFRIFPNDGVLRFTGHSCRLFFHGCTKMVRTTEDGVIPLNCWSFFD TRHIKIIRDTFTEVIDFVGLVIAASEEKVYIRNSKITKRMVIQLQDLRGNIHCVLEGEHVETFLEYLSSNWTEKPMMVIQ FVKVFTHRGRPFIDCIPPATKMYIEPVIEESVVLAGRLAEAGFQNGPVEFISRDIAYANLNADVLKFYPRRTISELLVEK EQGVFLVHVVVVAVLKGGYWCYPSCRCHNELNLRNDAFECSKCSMIFEKMIHRYRVKIEVFDASDSAVFVLFEREVQQLI SVSCEDLVSNIKVDDDSNVVYPQEFEDRIPGKELIFKIRNDGGITYNGAECYHVLAITEDPEAISLFHALQSNDSTANAQ FGTNTTGVENNEELEDKEVGGFSYNTPFEDVPESSTGSLLPKPLKRKLVLDFDDESEEDGNNVQVVEGFLNEKNSSNLVL SADEDNIRVEVDEDKSIDDADDDFECTMMEIAEEDELDDEAELEDDLAYVD
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 392 | 392 | 8.1E-49 | – | |
| PANTHER | 1 | 392 | 392 | 8.1E-49 | – | |
| Gene3D | 70 | 205 | 136 | 1.3E-10 | – | |
| CDD | 96 | 190 | 95 | 9.1529E-9 | – | |
| Gene3D | 225 | 377 | 153 | 5.6E-15 | – | |
| SUPERFAMILY | 227 | 363 | 137 | 8.74E-19 | ||
| Pfam | 251 | 359 | 109 | 4.1E-10 | ||
| CDD | 260 | 359 | 100 | 3.51471E-18 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0248900.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…