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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0391000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0391000.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Zinc finger FYVE domain-containing protein 26; TAIR: AT2G25730.2 zinc finger FYVE domain protein; Swiss-Prot: sp|Q551A3|Y6689_DICDI Protein DDB_G0276689; TrEMBL-Plants: tr|K7KTN0|K7KTN0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0391000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:87467317..87511963) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATTATTAGTTTGTCTAGTAATAAATATTTTTTCGTAATAAAGTACTTTTATTGGACATGAAATGAGATAATTTCTTAGC TCAGTAAGTTCCATTCCCCCGTTCTCCCTCTCTCAGACCCTCTCTGCTTGCTTCAATTTTCAGCTTCATCTGAATTTTCA ATTTTCCCATCACCATTTTCTCGCGAACCAAACAGAAAATCACAGCACCACAAAACACAACAGATTCAATCGGTTTCAAA TGGAGTGAAATCATCTCTCACCGCGATGGGCAAAGAAACCGAAATCCTCTCTCGCCTCGCCGCGAACCACCTCCACCTCG CCCAATTCGAACCCCTCCGAGCCGTTCTCCTCGCCCTCCGATCCCGAGACCGCGACCTCGCCCGCGATATTCTCCAAACC ATCGTCGCTCGATCGGGCCGGTTCCCCAACATCGCCTGGTCCACCTCTTGCCCCTCCCCGGCTCACCTCACCTACCTGTC AACGCTCGAGTTGCTGCAATTCGACGGTGATGCTTCCTCCGCGTGGAGTTTCGACCCCGAAACGCTGCGGTTACGCGCCG AGTTTTTGTTACTGGTTCAGAATTTGATCGACCTAGTGTCGGAGAATGAGGGTTTATTGGACAAAGATGGAGGTGAATGG GAAATGTGTAGAAGAGTGTTGGATAGGGGTATGGAGTTGGGTGTGAAGAGGCTGAGTGTGGATGAGGATGGTGGTGGGAG CGAGAGGAGTGAGACTAGTGTTGCTCCGGTTGAAGAAGACGAGTTGATGAGTTTGCGGAAGCTGGTTTTGAACCATGCGG ATATTTTTGATGCATTGTGTGGGAATATACATAGGCAAATTAGGCACTGGGAGTGTGAGGATCCTGGTTTAGCAGTTTCT GTGAGGGGAGGTGAGGGCTCGGAGGTGGAGGAGGATGTTAGGATGCTCAGTGGGATACAGAGGACTGTTCAGGTTGTACA 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AATTCTTGTTCCCAAGAGGAAGCCATTAGACATTTGGAACATGCTAAGATGCATTTTGACGACGGATTGTCTGCTAGGCA CAAAGGTGGGGAATCTACCAAGCTTGTCACAAAAGGTCTGAGAGGAAAAAGTGCCTCTGAAAAGCTTACTGAAGAAGGTC TTGTCAAATTCTCTACTAGGGTATCAATTCAGGTTGAAGTTGTTAAATCCTTTAATGACTCAGAAGGACCACAATGGAAT CACTCACTTTTTGGCAATCCAAATGATGCAGAAACTTTCAGACGTAGGTGCAAAATTGCAGAGATTCTTGTTGAGAAGAA TTTTGATTTGGCATTCCAAGTAATCTATGAATTTAATCTTCCTGCTGTTGATATATACGCTGGTGTTGCTGCATCTCTTG CTGAGAGAAAAAGAGGCAGCCAATTGACAGAATTCTTTAGAAACATCAAAGGCACAATAGATGATGAAGATTGGGACCAG GTATTGGGTGCTGCAATAAATGTATATGCCAATAAGCATAAAGAACGGCCAGACCGTCTAATAGACATGTTAACTAGCAG CCACAGGAAGGTGCTTGCTTGTGTAGTTTGTGGTCGTTTAAAAAGCGCGTTTCAAATTGCTTCACGGAGTGGAAGCGTAG CTGATGTTCAATATGTTGCTCATCAGGCACTGCATGTCAATGCACTTCCTGTGCTTGATATGTGTAAGCAATGGTTGGCT CAGTACATGTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0391000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGKETEILSRLAANHLHLAQFEPLRAVLLALRSRDRDLARDILQTIVARSGRFPNIAWSTSCPSPAHLTYLSTLELLQFD GDASSAWSFDPETLRLRAEFLLLVQNLIDLVSENEGLLDKDGGEWEMCRRVLDRGMELGVKRLSVDEDGGGSERSETSVA PVEEDELMSLRKLVLNHADIFDALCGNIHRQIRHWECEDPGLAVSVRGGEGSEVEEDVRMLSGIQRTVQVVHLDAMRESI KAGEAEGAVSHIRFLHFDHGLEQSEYRIVLKDLLKLVLSKSEKFGESWLIMRNQLLKIYSEALSSNCMDIVRMMQSIHDE LLSEEIETDRVQTDSFIPHPLVRLQKYLAELKPGKNIDEMALSLNEVVRSCKTEMYHFARVSGVHVLECIMDTALSAVKR EQLEEASNVLQLFPQLQPLVAAMGWDLLAGKIAARRKLMQLLWTSKSQVLRLEESSLYGNKSDEMSCVEHLCDTLCYQLD LASFVARVNSGKSWNSKLSLVLSGKELAFGDEDAYIDPFVENFVLERLSVQTPLRVLFDVVPGIKFQEAIELISMQPIAS TLEAWKRKQDVELMHMRYALEAIVLALGAMEKSMSDEIETHQDVPVFHLKDLQSHLDAISNLPRKIFMVNVIISLLHMDN TSVNLMHCGSPGSDSKLINACSSEDSSSTRSEGGNKMVISFTGLLLDILRRNIPSSMVELENTLDGGENTTSSQVLEWRM SISKRFIEEFEWRLSILQHLLPLSERQWRWKEALTVLRAAPSKLLNLCMQKAKFDIGEEAVHRFSLSAEDKATLELAEWV DGACKKASVDDVVSRVQDLDFSSLRSQLGPLATILLCIDVAATSAKSAGMSQELLDQAQTMLSEIYPGGSPKVGSTYWDQ ILEVGVISVSRRLLKRLHEFLEQDNPPALQAILSGDIVITSVKESHRQEQRERALALLHQMIEDAHTGKRQFLSGKLHNL ARAVADEETEPSTARGEGLYADRGVISNSDKDIVLGLGLRVDKQTPLSSTGPQSAGYDIKDSGKRIFAPLSAKSVTYLSQ FVLHVAAIGDVVDGTDTTHDFNFFSVIYEWPKDLLTRLVFERGSTDAAEKVAEIMHADFVHEVITACVPPVYPPRSGHGW ACIPVVPTFPKSSSENKVLSPSSKDAKPNCYCRSSATPGVTLYPLQLDVVKHLAKISPVRSVLACVFGSSILYNSSSSSI SSSLSDGFQQAPDADRLFYEFALDQSERFPTLNRWIQMQTNLHRVSEFAVTANQTADDGNLEARTSVKRVREHDSETELD ADDIVNSSTIPVALSDLNTQEVEVTDFWHDSSKSEAAQLDTTVFLSFDWDNEEPYQKAVDRLIDEGKLMDALALSDRFLR DGASDKLLQLVIERAEEIHSNSAQRQGFGGRYIWSNSWQYCLRLKDKQLAARLALRYVHSWELDAALDVLTMCSCHLPQN DSIREEVLQMKQDLQRYSHILSADDHYTSWQEVEADCKEDPEGLALRLAGKGAVSAALKVAESAGLSIDLRRELQGRQLV KLLTADPLTGGGPAEASRFLSSLRDTDDALPVAMGAMQLLPNLRSKQLLVHFFLKRREGNLSDAEISRLNSWALGLRVLA VLPVPWQQRCSSLHEHPHLILEVLLMRKQLQSATLILKEFPSLRDNHVITTYATKAIAVSISSPPREHRISVSGSRPKQK ARSGAPSRSSFTSSLSNLQKEARRAFSWAPKNTVDKNAPKDVYRKRKSSGLSPSDRGAWEAMTGIQEDRISSVSADGQER LPSVSITEEWMLTGDPLKDENIRSSHRYESAPDIILFKALLALCSDESVSAKIALDLCINQMKNVLSSQQMPENASMETI GRAYHATETFVQGLLYAKSLLRKLSGVHELPSNWERNRDADDTSSDAGSSSVGSQSTDELSEILSQADVWLGRAELLQSL LGSGIAASLDDIADGESAAHLRDRLVVEERYSMAVYTCKKCKIDVFPVWNAWGHALLRMERYGHARVKFKQALQLYKGDS GPVILEIINTIEGGPPVDVSAVRSMYEHLAKSAPTILDDSLSADSYLNILYMPSTLPRSERSRRSQVSANNNSIYSRDFE DGPRSNLDNVRYTECVNYFQDYARQHLLGFMFRHGHYHDACFLFFPPDAVPQPPQPSIMSGVSSSSPQRLDSLATDYGTI DDLCELCIGYGAMPILEEVISTRMSSTNSEDAVVNQYTVTALARICLYCETHKHFNYLYRFQVIKKDHVAAGLCCIQLFM NSCSQEEAIRHLEHAKMHFDDGLSARHKGGESTKLVTKGLRGKSASEKLTEEGLVKFSTRVSIQVEVVKSFNDSEGPQWN HSLFGNPNDAETFRRRCKIAEILVEKNFDLAFQVIYEFNLPAVDIYAGVAASLAERKRGSQLTEFFRNIKGTIDDEDWDQ VLGAAINVYANKHKERPDRLIDMLTSSHRKVLACVVCGRLKSAFQIASRSGSVADVQYVAHQALHVNALPVLDMCKQWLA QYM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 2462 | 2462 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 1667 | 1694 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 1676 | 1694 | 19 | - | – | |
| MobiDBLite | 1719 | 1739 | 21 | - | – | |
| MobiDBLite | 1873 | 1899 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 1884 | 1899 | 16 | - | – | |
| Coils | 2479 | 2483 | 5 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0391000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…