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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0391000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0391000.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Zinc finger FYVE domain-containing protein 26; TAIR: AT2G25730.2 zinc finger FYVE domain protein; Swiss-Prot: sp|Q551A3|Y6689_DICDI Protein DDB_G0276689; TrEMBL-Plants: tr|K7KTN0|K7KTN0_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0391000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:87469977..87511698) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGGCAAAGAAACCGAAATCCTCTCTCGCCTCGCCGCGAACCACCTCCACCTCGCCCAATTCGAACCCCTCCGAGCCGT TCTCCTCGCCCTCCGATCCCGAGACCGCGACCTCGCCCGCGATATTCTCCAAACCATCGTCGCTCGATCGGGCCGGTTCC CCAACATCGCCTGGTCCACCTCTTGCCCCTCCCCGGCTCACCTCACCTACCTGTCAACGCTCGAGTTGCTGCAATTCGAC GGTGATGCTTCCTCCGCGTGGAGTTTCGACCCCGAAACGCTGCGGTTACGCGCCGAGTTTTTGTTACTGGTTCAGAATTT GATCGACCTAGTGTCGGAGAATGAGGGTTTATTGGACAAAGATGGAGGTGAATGGGAAATGTGTAGAAGAGTGTTGGATA GGGGTATGGAGTTGGGTGTGAAGAGGCTGAGTGTGGATGAGGATGGTGGTGGGAGCGAGAGGAGTGAGACTAGTGTTGCT CCGGTTGAAGAAGACGAGTTGATGAGTTTGCGGAAGCTGGTTTTGAACCATGCGGATATTTTTGATGCATTGTGTGGGAA TATACATAGGCAAATTAGGCACTGGGAGTGTGAGGATCCTGGTTTAGCAGTTTCTGTGAGGGGAGGTGAGGGCTCGGAGG TGGAGGAGGATGTTAGGATGCTCAGTGGGATACAGAGGACTGTTCAGGTTGTACATTTGGATGCTATGAGGGAGAGTATT AAAGCCGGTGAAGCGGAAGGCGCGGTTTCTCATATACGTTTTCTCCATTTCGATCATGGACTTGAGCAATCGGAGTACCG GTATGCTAGTCTTTTATTCCTTTCTGCATAGGGTTGCTTTTGGAATTGTGTAAATATATACATGGTTTGTCTTGTGTCTT ACTTGTCTAGTGAGTTGCCCCTACTTAGTGCACATCAGGACCCATGTATCTGCCCAGGGAGTTCTGAGTATCCAGTCTCT 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Protein sequence (LotjaGi1g1v0391000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MGKETEILSRLAANHLHLAQFEPLRAVLLALRSRDRDLARDILQTIVARSGRFPNIAWSTSCPSPAHLTYLSTLELLQFD GDASSAWSFDPETLRLRAEFLLLVQNLIDLVSENEGLLDKDGGEWEMCRRVLDRGMELGVKRLSVDEDGGGSERSETSVA PVEEDELMSLRKLVLNHADIFDALCGNIHRQIRHWECEDPGLAVSVRGGEGSEVEEDVRMLSGIQRTVQVVHLDAMRESI KAGEAEGAVSHIRFLHFDHGLEQSEYRIVLKDLLKLVLSKSEKFGESWLIMRNQLLKIYSEALSSNCMDIVRMMQSIHDE LLSEEIETDRVQTDSFIPHPLVRLQKYLAELKPGKNIDEMALSLNEVVRSCKTEMYHFARVSGVHVLECIMDTALSAVKR EQLEEASNVLQLFPQLQPLVAAMGWDLLAGKIAARRKLMQLLWTSKSQVLRLEESSLYGNKSDEMSCVEHLCDTLCYQLD LASFVARVNSGKSWNSKLSLVLSGKELAFGDEDAYIDPFVENFVLERLSVQTPLRVLFDVVPGIKFQEAIELISMQPIAS TLEAWKRKQDVELMHMRYALEAIVLALGAMEKSMSDEIETHQDVPVFHLKDLQSHLDAISNLPRKIFMVNVIISLLHMDN TSVNLMHCGSPGSDSKLINACSSEDSSSTRSEGGNKMVISFTGLLLDILRRNIPSSMVELENTLDGGENTTSSQVLEWRM SISKRFIEEFEWRLSILQHLLPLSERQWRWKEALTVLRAAPSKLLNLCMQKAKFDIGEEAVHRFSLSAEDKATLELAEWV DGACKKVDDVVSRVQDLDFSSLRSQLGPLATILLCIDVAATSAKSAGMSQELLDQAQTMLSEIYPGGSPKVGSTYWDQIL EVGVISVSRRLLKRLHEFLEQDNPPALQAILSGDIVITSVKESHRQEQRERALALLHQMIEDAHTGKRQFLSGKLHNLAR AVADEETEPSTARGEGLYADRGVISNSDKDIVLGLGLRVDKQTPLSSTGPQSAGYDIKDSGKRIFAPLSAKSVTYLSQFV LHVAAIGDVVDGTDTTHDFNFFSVIYEWPKDLLTRLVFERGSTDAAEKVAEIMHADFVHEVITACVPPVYPPRSGHGWAC IPVVPTFPKSSSENKVLSPSSKDAKPNCYCRSSATPGVTLYPLQLDVVKHLAKISPVRSVLACVFGSSILYNSSSSSISS SLSDGFQQAPDADRLFYEFALDQSERFPTLNRWIQMQTNLHRVSEFAVTANQTADDGNLEARTSVKRVREHDSETELDAD DIVNSSTIPVALSDLNTQEVEVTDFWHDSSKSEAAQLDTTVFLSFDWDNEEPYQKAVDRLIDEGKLMDALALSDRFLRDG ASDKLLQLVIERAEEIHSNSAQRQGFGGRYIWSNSWQYCLRLKDKQLAARLALRYVHSWELDAALDVLTMCSCHLPQNDS IREEVLQMKQDLQRYSHILSADDHYTSWQEVEADCKEDPEGLALRLAGKGAVSAALKVAESAGLSIDLRRELQGRQLVKL LTADPLTGGGPAEASRFLSSLRDTDDALPVAMGAMQLLPNLRSKQLLVHFFLKRREGNLSDAEISRLNSWALGLRVLAVL PVPWQQRCSSLHEHPHLILEVLLMRKQLQSATLILKEFPSLRDNHVITTYATKAIAVSISSPPREHRISVSGSRPKQKAR SGAPSRSSFTSSLSNLQKEARRAFSWAPKNTVDKNAPKDVYRKRKSSGLSPSDRGAWEAMTGIQEDRISSVSADGQERLP SVSITEEWMLTGDPALLALCSDESVSAKIALDLCINQMKNVLSSQQMPENASMETIGRAYHATETFVQGLLYAKSLLRKL SGVHELPSNWERNRDADDTSSDAGSSSVGSQSTDELSEILSQADVWLGRAELLQSLLGSGIAASLDDIADGESAAHLRDR LVVEERYSMAVYTCKKCKIDVFPVWNAWGHALLRMERYGHARVKFKQALQLYKGDSGPVILEIINTIEGGPPVDVSAVRS MYEHLAKSAPTILDDSLSADSYLNILYMPSTLPRSERSRRSQVSANNNSIYSRDFEDGPRSNLDNVRYTECVNYFQDYAR QHLLGFMFRHGHYHDACFLFFPPDAVPQPPQPSIMSGVSSSSPQRLDSLATDYGTIDDLCELCIGYGAMPILEEVISTRM SSTNSEDAVVNQYTVTALARICLYCETHKHFNYLYRFQVIKKDHVAAGLCCIQLFMNSCSQEEAIRHLEHAKMHFDDGLS ARHKGGESTKLVTKGLRGKSASEKLTEEGLVKFSTRVSIQVEVVKSFNDSEGPQWNHSLFGNPNDAETFRRRCKIAEILV EKNFDLAFQVIYEFNLPAVDIYAGVAASLAERKRGSQLTEFFRNIKGTIDDEDWDQVLGAAINVYANKHKERPDRLIDML TSSHRKVLACVVCGRLKSAFQIASRSGSVADVQYVAHQLLIVSRAYQYHPHLTYLGFTVTTSTTNVLECVFNRVCC
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
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| MobiDBLite | 1849 | 1875 | 27 | - | – | |
| MobiDBLite | 1860 | 1875 | 16 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0391000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
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