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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0411400 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0411400.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein FAM135B family; TAIR: AT1G58350.1 Putative serine esterase family protein; Swiss-Prot: sp|Q641I1|F135B_XENLA Protein FAM135B; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2PKG0|A0A0B2PKG0_GLYSO Protein FAM135A-like protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0411400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:90204527..90216082) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTGGATTAAACTCATTTCATCTCACAAATCTTTCCAAATTCAAATTCACTGCAATCAATCACAATTTCATACACAACAA ACAACACACGCCCCAGAATAGAATAATCTCCTACCCCTTTCTGTTCTTCATTTCCCCCCTTCTTTTTTTCTCTATGTAAC GAGTTTCATTATCACAATTACGATTCAAATTTGTTGTTATACCATCATACAGATGACTATGATGGTGAATAATGTGAATG TTGGTGGTATATGTATACATGGGGTAACAGCTATAATGGGAAGATGCTTGTTGGTTTATTTGAAACATTGAAAAATTAAG AATTGAATTTTGATGTAGAGGGTTTGTCTGATGTAATGCCTCGCTCTGTTAAGGTTAAGCCGGTGGTTATGTTGGATACT GTACAGGAGATTGGTGTATATGTTCATAGGTTTCACAATCTTGATCTCTTTAAGCAGGGGTACACATATGTTTTTGTTTT ATACTTTTTCAATTTTTTATGTTTGAATTTATAACTTAATGATGATGTAATGTTTTTTGTTATGTAGATGGTATCGGATT AAGATTACTGTGAGATGGGAGGACAGTGAAAATCTCTCTTTTGGAATTCCTGCTAGAGTTGTTCAATATGAAGGTAAATT CATCAAAATCATGCTCAATCCTGCTATATTATGTTTTACACCCCAGCTAGGATGTTTCATCTTTAAGTTTTGAAACTTTG ACAGGGTGATCACAACTTTAAAATCTTGGTGGTTGATTTTATACCCAATACTTTGATTTTTTTTTAATTTATAATTTCTA TCCTTAGGCTTATAACTATGTGTTTAACTAGGACCGATGTGCTTACTTATGAATTATTTTATGGAATTTGTTTGATGTGG TTACTCTTTCTAGCTAGGATGAGTTCTTTAATGATATGGATATTTTTTTTTCCATTGGGGGTGCATCAATTTCCTCAATA 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TCTAAAAGTTATAAGACATGATACGACTACAATACAACATATAAAACAAGTTTAATATCAACACAAAATACAAATCCTAA ATTAGAACAAATTTACCAATAATACTTCACAAGACAACTTTGTTTAGAATCATTACATTCTATCTAATCATTGTGGTACT ATACTTGTATTGGTACAAAGTTAATAAATGATTGAAAGATGTAGGCAAGAAGTGTCTAAAATATTTCCACTAATATGATA CATATTGATACCAAATTACCAATACTTCAACCATTTTAAAGTATGGATGCTTATTATATGTCTATGTTGCTTCACGCAGT CTGGCACAGTACCTGGTGTTCAAACAGATGAGTTTTTCCTTGTTGTATGATATCTTTTACTTCATCTAACAAGCATAGTA AGAAAGGGGGATATATTTTATGCCCATGTCTTAACTTATGACATGCAAACGTTTTTTTCGTAGAAGCGTATTATCTGATG TCTGAACATGTTAAAGACAATATCTAGCCAATAATTTTCTTTTCAACATAATCTGTTAAGTTAAAAGCAAACATAAATGT CATATAAACTAATTTTATACCTAAAAAATAGGATTGGAGAAATGAAGACCAACTCTTCACATCCAAAGGGATGAATGCAC TTTATGAAAAGTTAACAAGAGCAAAAAAATGAAAATTACATAATAAAGACTCTCAAATAGAATCCAAGCCTCAAGAAAAA CCCACCCAATAACTCTACTATTATTATTCACTACCACATTCCCTCTCTTTCTCTACTTTTAAATATTTTTTCTGTTCCTC TCTCCCCGGTTGCCACATGTCTATGAAATTATCAAAGACTAGAGTATCTCCCCTGCAAAACTTCATTCTACGTAATACTT GATATCATGGCATGCTTTTGCATCATAGCAACATCGATGGACAAACAAGACTAATTTTGAGGTTTATGCCTTCATACACT 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AGCTGCCATCGGGATTGGGATTGCGGTTTTCAACTTCGGAAGAACGGAGACGATCCGAATCGGGACTGTATGAAGGGCTT AGAAGGTTCATTTCCTCCCATTCCTCTGAGGTTATATCAGCATAAATGGTCAGCTGGTTTTCGTAGGTGGCGCCTTCAAG AGTTTTCTTGAAGGCATTGAACCTGAAGAGTTTCTGTTCTTCCGAAGAGTATGTTTTGTGATATTTCCTGCACCAGCTTT CGAACAGATCTCTGACTTTCGTTTCAGAATTGCGATAGCGATCGAGATTGAGCCTTTCGTCTACAGAGGAAAGAATAATA ACACAGACAACATAACAAAACGTGAAATTATGTATGAATTTTAACGTAAACAACACACTCTATTCATTCATTATTATTTA GACCAAACTGGAAGAATTTGAAATAACACTGAATTGATAAATTGAAACTTTTGTCTACAGAGGAAAGAAAAATAACACAG TCAACATAACAAAACATGAAATTATGTAACGAAAACACACACACTCGAATTTGAAATAACAGTGAATTCATATTTTTTAG GTTTCAAGAGGAAAGTATGAATTGATGATTCAATTGTAAAGTGAAAGCATATACATATATATATATATATGACATGTTGG GATCTGGTTTACAGTTTTACCTTCAGGTTAAGGTTCATGTTCACCCTGAGAAGGGAAATCGAAGGGATTGAAATAGATGG CGCCAGTGGAGGAAGGAGCGAAGGTCGATGATCGCCGCCGAGGGAAGCGGAAAGAGGAAGCATGATTGGGGTTTGCGCCT ACGGAGGAAGAGACACGGACGCCCCCAAGCCAATGCATCGGAAGGCGGCGGTTGACATGGCGGAGTGCGAGGGTTAAAGC GGCGGCTGTCGGCATCTTTTGTGAAACGAATGGCGTGAACGAACGAATGGGATCTGATTTGTTTTGTGCTCAGCAAATCC TATTCCTTCTCATATAGGCCCAAAATTATTAAGCCC
CDS sequence (LotjaGi1g1v0411400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCTCGCTCTGTTAAGGTTAAGCCGGTGGTTATGTTGGATACTGTACAGGAGATTGGTGTATATGTTCATAGGTTTCA CAATCTTGATCTCTTTAAGCAGGGATGGTATCGGATTAAGATTACTGTGAGATGGGAGGACAGTGAAAATCTCTCTTTTG GAATTCCTGCTAGAGTTGTTCAATATGAAGCTCCTGACCTGGATCAACGCAATATATATGGTGTATGGAAGATTGATGAT ACTGATAATAGTTTCTCATCACAGACCTTTCGGATAAAATATGCTAGGCAGGATGTTCATTTATGTATGATGGTCTCATT CATCTTACCTCGTAGTAGATTTGCGGATTTACCTTCAACTGCTGTTATTTTAAAGTTTGAGCTTCTTTATGCTCCTACAC TTGAGAATGGAACCGATGTGCAAGCTTCTTTAGATGATTCCCCTGCGGCTATCCATGAATTTCGAATACCTCCTAAAGCT CTTTTAGGACTGCATTCGTATTGTCCCGTCTATTTTGATGCTTTACATGCAGTGCTTGTTGATGTGAGTGTACATGTTAG TCTACTAAAAGCTGCCTCTTTCTCATCTGCATCGAAGGTACCCAGGGATTTGATAGAGCAGCTTCCCAAGATGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0411400.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPRSVKVKPVVMLDTVQEIGVYVHRFHNLDLFKQGWYRIKITVRWEDSENLSFGIPARVVQYEAPDLDQRNIYGVWKIDD TDNSFSSQTFRIKYARQDVHLCMMVSFILPRSRFADLPSTAVILKFELLYAPTLENGTDVQASLDDSPAAIHEFRIPPKA LLGLHSYCPVYFDALHAVLVDVSVHVSLLKAASFSSASKVPRDLIEQLPKM
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 8 | 204 | 197 | 9.4E-110 | – | |
| PANTHER | 8 | 204 | 197 | 9.4E-110 | – | |
| Pfam | 124 | 188 | 65 | 4.5E-16 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0411400.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…