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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0536300 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0536300.3 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | SANT domain-containing protein 2; TAIR: AT3G12590.1 hypothetical protein; Swiss-Prot: sp|Q89B37|GYRB_BUCBP DNA gyrase subunit B; TrEMBL-Plants: tr|K7K7B9|K7K7B9_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0536300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:106492561..106512878) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CAGATTCTACCAACCAAACAAGACCCGACCCCAAATGGATTCGATTTCCAGCTCTACTTCACAGTTAACCACCGGCATCT CCAGGCTCAGATCCTCCTCCATCAGGAAGCTTCCGGAGCCCCTTCGTCGCGCCGTCGCCGACTGCCTCTCCTCCCCCCTC ACCTCCGCCACCGAACCTTCCAGAACTCTTCGGGTCTGTAATTCCTCCCTTCCCTCTCCGCATTTCGCTTTCTACATTTC CTAGTTTTAGTGAATTTTTTTTGGAATTCGCATGGTTACATGAATAATTGAGTCTATTTTGTTTGTTTCATCACCATAAT GTGACCTTGCTTGTTTGTTAGAATTAGAAGAGTAAAGGGTTATTCCTTTTCACTCCCCAATCCCTATGGCTAGGAAACCT AGAAAATGAGGATCATTGAGTAAGCTTAGCTTCTGAGAAAATGGGGATGGGGCAGTTCTGTCAATTCAAAAATTCAGTAG AGAATTATAGAGTGATAACAATTGAGAGAGATATAGGATGGGAACGATGGCTTAAACATAAACAGCAGAGTTAGTTGTAA TTTGTAATCTGTCTGTGTGTCATTTTCGGCACTTAGAAGAGGATGGCGGGAGTGTAAAATTAGTGTTCTATGAATGCTTG GATAACGCATCATAGCAACTTCCTGTCGGAAACTTAATTAGATTCTGCTTCGATCCTTATTTTTCTTCTTTGATTTAGTC TGTGAGGGATTCCGGATGTGGTTTCTTCAGTTTGTTGCTTATAGTATAAGTTAACAATTTTAAATGGAATGAGGCATACA CGTGTAAGAAGTTTTTAAAGCGTTATCCGGGTAAACGGGCATTCTTGCCTTTGTTTTAAATTCATGATGCTGGCATTGTA TCAACACGTGTAGGGAAAAGTTTTATCTTTATCCCATAATTTGTAACGCAAATATAGCTTTATTTATTTCCTCGCATTTA 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TGATAAAATGGATTTATGTCAGGTGAAGAAGCATTTTATATATTTGTAGTAAATTAAATTACTTTCTACAAAATCTTCAA TCACATGTATATTTCAGTAACTGAAAGATTTGTTAATATTGTCACCGATTAATTTCTTCCCAAAAAAAAATTTAAATACA GTTTGTTTATATAAATTGTTGGAGCGGTGTTTGGAGTCTGTTCTATTTGGTTTCACATTTGGGGCCTCTGTTTATGTATT ATTTGGCATATTATTCATTATCTTTTCTGCTCAACGCTTTCTCTGTTTCTAAACAGATGTGTGACATACTGTTCTCTCAA TTGTGCCTAAGAGTTCCTTCTTCTACAACTGTGCCCTATGGAGATGATCTGCAACATAGCAGAAATTTAAATCAGACTAG TGTAAGCAAAAATTATGACAGTGATAATCATGTTGAACAAGATAGCTTTTACTGGGATGAACACAAGAAGGAAGAAGCTA ATAAAAAATCTGGCTACCCTAATAACTACCATCTTGATCATGAGAGTGCATCAATGACAGCTCTTCTCCAAGGACGAGCC ATTGTCCCAATGCAATTGATTGCACGTGTTCCTGCTGCCTTACTATATTGGCCACTAATTCAATTGGCAGGAGCAGCAGC AGATGATATCGCATTAGGTGTCGCGGTTGGAAGTAAAGGTAGAGGAAACCTTCCTGGTGCTACATCGGATATTCGGGCCG TACTTCTCCTGCTTCTTATTGGTAAATGCTCAGCAGATCCTATTGCTTTCCAGGAAGTTGGCCAGGAACAATTTTTTAGG TGATTCAAAACTTCTATCCTGTGTGTGAACTAGTTGGTCTTCTTATTTTGTGACCTTTATAAGCATGGGTCTTCTTGCAT CTGGCAGGGAACTTTTGGATGACACAGATTCAAGAGTGGCCTATTATTCTTCTGCGTTTCTTCTGAAGGTATGGATTTTT ATTGACTTGGTTTTAGAAATTGATAGGACCTTAAATTCCATCTTTTTTAATAATTGTCCATTGCTGCAGCGAATGATGAC GGAGAAGCCAGAGAAATATCAACACATGCTTCAGAATCTTGTTGTTAAAGCTCAACAGGTACCATTGTTTTTTGATGATT TGCGTGAAGCTCTCGTTCTTCTATTAGTAAAGTGGTGATTAACATTTAATCTTGTGCATAAATGAGATTCATATTTAAGT TGTCTTTTATATAATTTCAATTTCATCACACTGATGAAGCACAAAAGTGGTAACAATTGGCTTCCGTAGTCTTGAGAATT TGGGCTAGGCCTTACTCCACCCCAAACCGTAACCCAATCTATGAGATCAACTCACACACACAAACACTCACACACACACA CACACCTCTCATGCCCAAGAATGGACATTTGGAGTGTGAAGTTTGCAAGACCCGACACCTGGTGTGACACAATAACAGAT CTAAGTGACCCAATATAGATATGGTACAATGAGTGTGTTGAGCAACCAATTATCCCAAAAGCTTAAGCTATTGGGCAAGG GCCACATGAATGGTTTTCTATTATATTTCTAACACGCCCCCCCACGCAAGAGCCCACTTGGGCTTGAAGCGTGGATAATG CAAAAGCCCACCTACCATGTCCATGTCAAAGTAACCAATTATCCCAAAAACTTAAGCTATTGGGTAAGGGCCACATGAAT GGTTTTATATTATATTTCTAACGGTGAATTTTCGAGTTGTCACAAATTAATTATGACTTCGGGAGAACTACATATCATTG TTGATGTCTCTATGGAGTTCTAGTTGACTAATCTCCTCCCCAAAATAAAGAAGAAAAAAGAAAAAAAATCAAGGGACTTT ATAAGGTTAATTTCATTGTCTTCTTTAGATAAAAGTAATTTACTTCTCTAGATGTTTGTTTTCTTTGAAATTTTCTCAAT 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CDS sequence (LotjaGi1g1v0536300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGATTCGATTTCCAGCTCTACTTCACAGTTAACCACCGGCATCTCCAGGCTCAGATCCTCCTCCATCAGGAAGCTTCC GGAGCCCCTTCGTCGCGCCGTCGCCGACTGCCTCTCCTCCCCCCTCACCTCCGCCACCGAACCTTCCAGAACTCTTCGGG ACTATCTGAAAGGCCCTGCAACTAAAGACATGGCTTATAGTGCAATTCTGGAACATACTCTTGCTGAGAGGGAGCGCAGT CCTGCAGTAGTCACAAGGTGTGTGGCACTATTGAAGCGGTATCTCCTAAGATACAAACCGAGTGAAGAGACGTTACTTCA AATAGATCGTTTTTGTTCAACCATAATTGCTGAGTGTTTTATTCACCCAAATCAACCATGGTCCCGATCATTGAATCGTC AATCTGGTGCATCAGCCTCATCCACAAATACATCTCCTTTACCTGTATCTAGTGTTGCTTCCGAGGCACTTGTGAAGTCT CTGAGTTATGTGCGTTCACTAGTGGCTCAACACACTCCCAAACGGCTTTTTCAATTAGCTTCATTTGCTGGACCGCCTTC TTCGTCCGGGCAATCACTGCCAACATTGTCATCTTTGCTGAGTAAATCCTTCAACACCCAACTAAGTCCTTCAAATGTTC CAGAAGCACCAACTCTTGCTGGTGTTCCAGAGTCGTTAGAGAAGGATTCAATTGCTCCATCTGTGTCAAAGATGTCGAAA ATAGAAAAGGTTGATGAAAAAGACGAACTAAGATTCATTGCCCAGGATGTTCTGAAATGGCGCTGGCTTGAGGAACCACA ATCACCATCAATTGGGACTGAAAGTGATCGTGCTGTGCATTCCCAATTCATGACAGCACATAATTTCTTAGAAGTAGGTG CCGCAGCTTTACTTGTCGGAGACATGGAATCCAAGATGAAGGGGCAACCATGGAAATTTTTTGGAACTGATGATATGCCT TACCTGGATCAGTTGTTACAATCTTCTCCTGTAACACCAATTACTAATTCTGCATCTGCTCGTCCCCACCTCAGAGCAAT AACAGCATCTAAACGCACAAAAGCAAGCTCTCATCAGATTTGGGAGGATTTTCCTGTGACTACATTCCGTCCCCGAGCTC GACAGCTTTTCCAGTATCGTCATTACAGTGAGCAACAACCTCTACGGCTGAACCCTGCTGAAGTACATGAAGTTATTGCT GCAGTTTGCTCAGAGGCTTCTTCGCCGAACAACAATGTCATGACAGTGACAAGTAGTCTAAGCAATAACAGTAGAAAACC ATCAACAGATGTGGCTGTTAGTGTGCTCATTAAACTAGTTATTGACATGTATGTTTTAGATTCTCGGACAGCTGCTCCTC TCATTCTTTCTATGCTTGAGGAGATACTCAGTTCTTCTAAAACAGGTTGCAGGATTCGTGCTTTTGATTTGATTCTAAAC CTTGGGGTTCATGCTCATCTTCTGGAACCGATGATTGATGATGGTGCTTCCACTATTGAAGAAGAATATTCTCAAGAATC GTATTATGACAGCACCACTCAAGCTCAAGTTATGGTACAGGAAAGCATAAAAGAAAATTCTCAGAACAAATCAGACACCG TCTCTGCTATTAAGAATTTTGAGTCTTGGATTTTAAATATTCTGCATGAGATACTACTTCTTCTTGTTCAGACTGAAGAA AAGGATGAATCTGTCTGGGCATCTGCACTCAGCTGTTTGCTTTATTTTGTCTGCGATAGAGGGAAGATCTGGAGAAATCG TTTACTAGGTCTTGACATAAGGGTTCTGAAGGCACTTATAAGAATCAGCAGGGAGAATTCTTGGGCAGAATTAGTTCATT GTAAGCTTGTTTCCATGTTAATCAACATGTTGTATGAAGTTCCTGATGAAGTTACTGAGCCTGCACCTAGAAAACCAAAG TTTCTCGTGGATCAACTTGATCTGATTGGAGGAGTTCAATTTATTTTTCTCGAGTACTCCCTGGCAAACTCAAGAGAAGA GAGGAAAAACCTGTATTCAGTGCTTTTTGATTACATTCTGCATCAAATAAATGAAACATGTATAGCTAGAGGAGACAACG AATATAGTGATGATGAAATCCAACCTCTTGCTGCTCTGCTTGCTCAAACAAATGCACCTGAAGCATTTTATATTTCTATC AAACTTGGGGTAGAAGGCATTGGGGAGATTTTGAGAAGATCAATTGCGTCTGCCCTCTCCAGATATCCCAACAGTGAACG ACTGAATACGCTATTGGAAATTCTGACAGAGAAATTTGACACTGTCATAAGTTCTTTCACTCATTTGGACAAAGAGTTCT CTCATATGATTCAGATAACCAAATCTCATAAGTTTCTGGAAAATATGGAAGGTGTGGCTCTTAGAAATGACATCGGTTTG CAGGCAAAGCACTCATGGGCTACTTTACATTCCCTTATTCATTCGGAAATAATTTCTTACCGTCAAAATGGGTATATCTG GTTAGGGGATCTGCTTATTGCTGAAATCAGTAGGGAAAGAGTAGGAGATATTTGGTCGAATATCAGATACTTCCACCAGA AAATTGCTCAAGCTGGAACTCAAGATTCTTTGGATACATCAGATGTTCCTTTGTCCATCTTACTTATGTGCGGCCTTTTA AAGTCAAAATACAACAGAATTAGATGGGGATTTTTGTTTGTTCTTGAAAGACTACTTATGAGATGCAAATTTTTGTTAGA TGAGCAAGAAATGCTGATATCAAACAGCAGGGATCTGGATCATGAGAAGAAAGATTGGCATCTTGAGAAAGCCAATGCAG TGATTGACATTATGAGCAGTGGTTTGTCTTTGGTGTTTCAGATAAATGAAACAGACCGCATCAATATTCTGAAAATGTGT GACATACTGTTCTCTCAATTGTGCCTAAGAGTTCCTTCTTCTACAACTGTGCCCTATGGAGATGATCTGCAACATAGCAG AAATTTAAATCAGACTAGTGTAAGCAAAAATTATGACAGTGATAATCATGTTGAACAAGATAGCTTTTACTGGGATGAAC ACAAGAAGGAAGAAGCTAATAAAAAATCTGGCTACCCTAATAACTACCATCTTGATCATGAGAGTGCATCAATGACAGCT CTTCTCCAAGGACGAGCCATTGTCCCAATGCAATTGATTGCACGTGTTCCTGCTGCCTTACTATATTGGCCACTAATTCA ATTGGCAGGAGCAGCAGCAGATGATATCGCATTAGGTGTCGCGGTTGGAAGTAAAGGTAGAGGAAACCTTCCTGGTGCTA CATCGGATATTCGGGCCGTACTTCTCCTGCTTCTTATTGGTAAATGCTCAGCAGATCCTATTGCTTTCCAGGAAGTTGGC CAGGAACAATTTTTTAGGGAACTTTTGGATGACACAGATTCAAGAGTGGCCTATTATTCTTCTGCGTTTCTTCTGAAGCG AATGATGACGGAGAAGCCAGAGAAATATCAACACATGCTTCAGAATCTTGTTGTTAAAGCTCAACAGAGTAACAATGAAA AACTGTTAGAAAATCCATACCTTCAAATGCGTGGCATACTTCAACTGGCTAGTGATCTTGGGATTGACTTGTGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0536300.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDSISSSTSQLTTGISRLRSSSIRKLPEPLRRAVADCLSSPLTSATEPSRTLRDYLKGPATKDMAYSAILEHTLAERERS PAVVTRCVALLKRYLLRYKPSEETLLQIDRFCSTIIAECFIHPNQPWSRSLNRQSGASASSTNTSPLPVSSVASEALVKS LSYVRSLVAQHTPKRLFQLASFAGPPSSSGQSLPTLSSLLSKSFNTQLSPSNVPEAPTLAGVPESLEKDSIAPSVSKMSK IEKVDEKDELRFIAQDVLKWRWLEEPQSPSIGTESDRAVHSQFMTAHNFLEVGAAALLVGDMESKMKGQPWKFFGTDDMP YLDQLLQSSPVTPITNSASARPHLRAITASKRTKASSHQIWEDFPVTTFRPRARQLFQYRHYSEQQPLRLNPAEVHEVIA AVCSEASSPNNNVMTVTSSLSNNSRKPSTDVAVSVLIKLVIDMYVLDSRTAAPLILSMLEEILSSSKTGCRIRAFDLILN LGVHAHLLEPMIDDGASTIEEEYSQESYYDSTTQAQVMVQESIKENSQNKSDTVSAIKNFESWILNILHEILLLLVQTEE KDESVWASALSCLLYFVCDRGKIWRNRLLGLDIRVLKALIRISRENSWAELVHCKLVSMLINMLYEVPDEVTEPAPRKPK FLVDQLDLIGGVQFIFLEYSLANSREERKNLYSVLFDYILHQINETCIARGDNEYSDDEIQPLAALLAQTNAPEAFYISI KLGVEGIGEILRRSIASALSRYPNSERLNTLLEILTEKFDTVISSFTHLDKEFSHMIQITKSHKFLENMEGVALRNDIGL QAKHSWATLHSLIHSEIISYRQNGYIWLGDLLIAEISRERVGDIWSNIRYFHQKIAQAGTQDSLDTSDVPLSILLMCGLL KSKYNRIRWGFLFVLERLLMRCKFLLDEQEMLISNSRDLDHEKKDWHLEKANAVIDIMSSGLSLVFQINETDRINILKMC DILFSQLCLRVPSSTTVPYGDDLQHSRNLNQTSVSKNYDSDNHVEQDSFYWDEHKKEEANKKSGYPNNYHLDHESASMTA LLQGRAIVPMQLIARVPAALLYWPLIQLAGAAADDIALGVAVGSKGRGNLPGATSDIRAVLLLLLIGKCSADPIAFQEVG QEQFFRELLDDTDSRVAYYSSAFLLKRMMTEKPEKYQHMLQNLVVKAQQSNNEKLLENPYLQMRGILQLASDLGIDL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 5 | 1194 | 1190 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 419 | 1158 | 740 | 1.37E-5 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0536300.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…