Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0626100 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0626100.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | FBD-associated F-box protein; TAIR: AT4G26340.1 F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8H1R7|FDL27_ARATH F-box/FBD/LRR-repeat protein At4g26340; TrEMBL-Plants: tr|I3S460|I3S460_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0626100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:117462729..117472536) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCTATGTCCATTGTATCTGACTTATAAAATGAGATGCTTGTACACCGTGGATATGATAGCATGTTTCTTGTACATTTTTT CTGTAGAAAAACGTTAAAATATAAAATAACATGAGTATACTATATATAAGTTAGATGTCAAATCAAAGGACGCAGGGTCA CAACAGTGTAATCAAAGAGGTCTATGTAGCCAGCTATGTCCATTGGAGACGTTGATGATTCCCAAAGAAAAATTTGAAAT GACTCCAAATCTGATCTTTATTTTACTGGTGTGTTGAAAAGTTGACGCTGCCACGGCTCCACGCATTCTTTCTTTCTTTT CATCCTAGAAATATATGATTATGAAAATAGCATAACTGAGAAAATCCATTGCCTTCGTTTCCTAACTCATTTTTCTTCCT TCTATCATCTTAACGCACGGCGGAGGATCTTGGATGCCTGCTTCCATGCTGCCTGTAGAGGCTGAGCAGACTTGTGTTAT TTGGGTCTGTTTTAGCATTATCCAGTCCCACACCGGCTAGACTTTGAACAGTAGAAGTGCTTATAAACAAATACTCAGCA AGTAGGTTCGTCCCTTCGGGGACATCCGATAAAATTGGAACGATACAGAGAAGATTAGCATGGCCCCTGCGCAAGGATGA CACGCACAAATCGAGAAATGGTCCAAATTTTTTTGAATTTTCATTTCTCTGCGAAGAAGCTCAACTGTGTACTCCCAGGT TTCCTTCTTCCTTGAACACGATATCCCACTTCATCTCGCGTCCCACATCGGTTTGGTATCTTAGCATTTGGGTGAGATCT CACAAGTGGGAAGAGAGGTATGGAGTGAGAGAGAATGGATCTCTGGAGTTAAATGTGCTGACAGCAGGGGATGTGATATT ATAGTCTAATGAACTTGATGGATCATAGAAATTAGGATAAAAGTTTTTTTTTTTGTTACAATTAGGAGAAAAGTTTGAGT ACATATGAGAGGTATATATAGTAATCAAGGATTTTGTGATTAAATCTTAGGCTGTTCTAACAGAAAAGAGGCCAATCTTA TGATCTATAGGAAAAGCTTAGTGAAAGGGGCTACAAGATAACATAAGAGATAGAATTCATGGAGATATTCTTGTGAGGTT GGAGAAGACTAGTATATTATGCTGCAGTAGGTATTAAATTAGTACCTCCTCAGATAGCGTTTATTTTCAAATATTATATT GGGAATTACTTTAAGATTGTTAATGGGGGTGAATTGAAAATGTTGAACTAGGCTTGGGTGGGGTGCACCAGGCCCTTGCA ATAGTGTATGACATGGGCGACGCTTGAGGATCCCAGTAGCAAGCTACTGTGGTGGACCCTCCCCTAAAAAAATTAATTTA ATATCGTGTGAGCCATTGGCTCACATATCAGATATTAAACTGATAAAAACAGATACTACACTTGATCTTAGCCAAAAGGC CGAGAAAGGTATGCTTCTTCCATTGCCATGTCTCTGCTTTTATATCTATTGTATGTGCTTTGATTGTGCTGCACAATCAA TGTGGGACTTGAAAGGTGATGCAGTGAGAAACAGAAATGTAATTGAGTAACATGAAGACAAATTACTTTTTTGAAATCGA AGACAAATTACTTGGCTTTCTTCTAATGTGTATATCCTTTTAATCCCTACAAAGACATCAAAAGAAGTTTTGTTTGCTTA TATGCTTGTCAGATTCCTTAATTGTGGGTATCTTGCATTAAAGAATATGAAACTGGGTATATTGCTTGTTATGTGGTCTT ATTTCGTTTGGCCTTGTAACACTCTACAACAGAACACTTGAGTTTAGTGTGCGTTCTTGACTCCAATACTTTCTACCTGT TGAGACCTCGTATTTTCCGTGTTTATTTTCATGTTAAATGGGGATTTGGAAGTCCTATCTTGCAACTCATGCACCTCTTT CAACTTTATGAATGACTAAACCATTAATAATTTGTTGCACATCATAGCCCTGTTGTAGTACGCTTGATGAGTGATTTAAG ATAATTTGCTGCTCTCCATAGCCCATGTTGGGTCCATGATGTTAGAGAAACAGTTTGGTTCAATTAGTGATTTTTATATG GGAAAGTAGTGCAATTTTCTGAATTCTGATACAAATCGGATGAGTATTAATTTTAAATCCATGCCCAGTGGGTTGCCAGA AATTTTCATGACTAAGCTGTAAGTTCTTTTAAGATAAATTATTTGTTTCTCCTTACCATACATTTACAAAGAATCATTGG AATATGAATATCTTTCTAGCTTCTGTTACTTTGCTTTGGGAGAAGAACTTTGCCAGTTTATTGTGTTTTTTTATTGATAA AGGATGCTTTTTATTTGCTCCCCAGCTGAGAGTGGGCCGGATTTGTGTTGGTATTTTTAACTACTTGTCTCACTGCTATG TCTGGGCAGGACTTATGTGCACAAATGTATGCTTACCTGCTATGTCTTTCGATAAAATTGGAACGACATAGAGAAGAAAG ATTAGCATGGATACTAATAAAAATCGAGAACTGGTCTAATTTTTTTTCCACCCCAATCTTCTTGCACTGGATCCAAATAT TATCTGATTTTCTTCCATCAAACTAGGTATATTAATGAGTGTTCTCCCTTTTTTATTTTCCTTTAGTTCTAATAGGTTGG CTAATTTGGTTAAACTTATATTGAAGCTGCAGAGTTGTATGTTTTTGTTTCTCTGTGAAAGTTGTCATTTTTTTCTTTCT TCTGGAGGAGTTCTAAGAAATTTCCAGTTTTTTTTGTGTTATTTTTTTATAGAGTTTTGATGTCTTAATTCAGTTCAGTA TCTTAGATGGATAGTCATTGAGTTTAGATTTCACAAGTTGAGAGAGAGAGAGAGAGATTGGATCATTGGAGTAAATTATT TTCTTAGATTTATACAATTACAGAAGACTTCCCCTCCAGCATGCATTTTTCTTATACAATCAGATATGTCATGCTTTTAT TTTTGTCAGTGATTATTGGTAAAATTAATTGCAACATGGTCTAGTCTATCAAATGTCGAATTTTGAACTTGCTCAAGCTA GGCATTATTCATTTTGACATAATTAGATATTGCACTGTTTTATTGAATCTGTGCCAAATAGGTACCATATTACAGTAAAA TATGATGCTTTGGAAAGCTTAAATGGTTAAATTGTGAAGGAGTCTGGTCATATAATAAGTCCAATATGATGTTTTGGAAA GCTTAAATGGTTTAATTATTAAGGAGTCTGGCCATGGAATAAGTTCTACTTGTTGTAGAAAGTCATTTGGCTGACTGAGA ATCTTAGTATTTGGGAAGAACAAGTTTTGAAGGGATTTTAGATTATCTGAGGAACATTATGTTTGGGTGGGGTGCGCCAG GCCCTTACAGTAGTGTAAGGGATGAGCGATGTTTGAAGATCCCAGTAGCAAGCTACTATAGTCGACCCTCTCCCTATAAA AATAAATTTAATAGATTTTACAGTTGAACAATATGCTTCTTAATGATATTTAGATGTCATGAGGTTTCCTACATTTTCAG AAGATCTATGTCTTCCTAACTTATCGTTTTTCTTTCTAGCATACTAACAACATATGCCGGAGGAGTTTGGGTTTGAATGC TTGCTTCTGCTTGCATGCTGCTAATGTTGGGGCTAAGCAGACTTGTGTTATTTCTGTCTGTTTTAGCATTCTCGAGTCCC ACACTGGTTAAATCTTTAATAATATGAGTATTTATAAGAAGAGACTCAGCAATAGGATTTGTCCCTTCGGGGACATCCGA TAAAATTGGAACGATACAGAGAAGATTAGCATGGCCCCTGCGCAAGGATGACACGCATAAATCGAGAAATGGTCCAAATT TTTTTGAATTTTCATTTCTCTACTCAGCTCAGTTGTATTAGGTTCCCTTCTTATTCTTCCATCAATAATGGTGTTCTTCT TCAACACAATGTGTGTTAATACTTTTTAAATGCTCTTCATTTCCCCTTTGCTTACTTGATGTTTTATTTTTTGCTTGTTG TGTTTTAGTCTATCTCAAATGGAGCAATTTAACTGGGTTGATTTGTGCTACAGATGACAGTTTGATCATGTTCTGAATTC TGATACAAACCATAGCCTGAGTTTTTCATGAGTAAGCTGTAATTTCTTTTAACATCAATTAATTGCTCCCTATACCACAC AAACCAGATGAGTATTATTTTAGCTCCATCTCCATGGCCAAGGCATAGCCTGTGTTTTTCATGAGTAAGCTGTAATTTCT TTTAACATCAATTAATTGCTCCCTATGCCACACACTGTTTAAGATCTAAAACTCATTTAAACTGAATCATTAGAAAATTA ATATCTTTATAACTTCTGTTGCTTTGCTTTGAGGGATGAAGCTGGCCTCTTTGTGTTGCTCTTAGCTTTGTATGCGATGT CCTACACTCCTACTTCATTTGGTGTTCCACACCGGTTGAGCTAACACATTATTAGTGCTTATAAACACGGAAGCTTGCAC CTCAGTCCACAATCTTGGAGGGATACAGAGAAGCTTACTAGATTACTTTTTTCTCATTCAAAGTTGACATGTTTTTCCAG TTCTTCTGTGTCATTTTATTTTTCTAGAATTTTTTGTATTCATAGTTTAATATCTTAGTTAGAATAACATTTGGGTGATC TCCCAGGTTGGCAGAGGCATGGAGAGAGAGAGAATGGATCTTTGGAGTTTTTTTTTTTGATAACAGGATCTTTGGAGTTA TTTGTGCTGTTAGTTAGCTGTTTAATTTAGGGTAGTGATGAAGGAATCACAATGGCAGCAGGGGATGTGATATTGGAGTC TCTAACGAACTTTTAAGTATATGACTATGAGAGGATGCCAATCTCATGATTGATATATATAGTATTACGCTCTCATATGA AAGGCTGGAGCTTAGTGAAAGGAGCAACAAGACTACATAAAAGATATAATTGACGAAGATGATTCTTTAACATAATTGAA ACTTCAAAAATTGTAGCTTGTTTGGGCTATAGAACCAGTGTTATATCTGGAATTGAATTTGAAAATGTTGAACTAGGTTT GGGTGGGGTGCGCCAGGCCCTTGCAGTAGTGTAAGGCATGGGCGACGCTTGAGGATCCCAGTAGCAAGCTACTGTGGTGG ACCCTCCCCCTAAAAAAATTAATTTAATATCGTGTGAGCCATTGGCTCACATATCAGATATTAAACTGATAAGAACAGAT ACTACACTTGATCTTAGCCAAAAGGCCGAGAAAGGTATGCTTCTTCCTCTGCCTTGACTCTTCTTTTATATCCAATGCAT GTGCTTTAGTTGTGCTGCACAACCAATGTGGGACTTACACAGTGAGAAACAGAATTGTCATTGAGTATTGCCGTTGTGGT TACTTTTCTATGCAGGCATGCATATATTTTCATATATTTTTGGGGGCTTCTGTAACATATTCCCAATCTTAGCTGTTGTG CTTGCATGATAAACTAATTATTTGGACAAGAACAAGTTTTTAAGTGATTTGGGATTATTTATCAGTATATATATGATATG GGCATCTGCGCTAGGTTGCTGGTTTGGTTACTTTTATTTCTGATAGAACCCAACCCAGAGCAAGAAGAAAACTGGTATTA TTCAGTATAGAAATTCACAATGTGGCTGAGAAATCCAAGAGTCTCAGCCACTCTCCCTAAACCCAATTCCAAATGATTCC AAAGATTCTAATCTCTCTTAGCTCACTCCTATTTATAAATACTTATTCCACCCTTACTTGAACCAACTCTCAATTGACTT AATTACTAACACCGTAACTAACCATACGAGTGTAGGCGTAGCTATCAATTTCACTCATGCAATCTGGGTAAGAGTGGTAC AGACAGGAGGGACTTGTGTTATAACACTTAACTAATGAACACTTAAGTTTCTTGTGCCTTATTTACATGATTGTGTTGAT GATGCTGTGACTGCTTCATTTTTGTTTTACTTCTTGCTGCTGATTAATGGAGCTTAATCCATTGAATTCTTTATTGGCAA TGTCTGCATATAAAGTAAATCCTTATGGTAGTATACTATTCGCAAAAAAATGAACTTTTATACAGTTGTTCTGTATCATA AATATCCTTTTCTGTTTTTATCCATCTAAATTGCAAAAAATGTCTGCGTATTGAATACTTTCTGAAAACCCCTTATCAGT CTATCCTTATTTTCTTCAGTTGGCTAGATGAGAAATAAAGCTTTTATTTTGCTAATACTATTTTCATTTGGTTGTTTAAA TGAGATCTATCATGGTTTTATTTATTTCCGTAACTATGAGTGAAATTAATTGCAATTTGGTCCATTCTATCAAATGTCAA ATTTTGAACTTCCTCAAGCTTAGGCATTATTCATTTCTTACATAAATTAGATAAAGACATGTTCTTTTGCACTGTTTTGC TGATTCTGTGCCAAATCTGTACTATATTACAGTAATAATATGATGTTTTGAATGCTTAAATAATTAAAGAATCTTGGTAA TGGATTATGTCCTAATTGTCTGTAAAGTTATTTCATTTTGCAAATTTACACTAAACATTGGTAATGGATTATGTCCTAAT TGTCTGTAAGGTTATTTCATTCATTCCAATATACACGAAACATTGTACAACCTCGCTTTTGCACTTCTCTATCCAAGCTT CCATTTATTTTCATATATTTTTTGGGGTTTCTTTAAAAATAATTGCAATCTTACAAAGATGTTTTTAAGGGCTTTTCCAT TATCTGCTATTGGACTAGATTTGGGTGGGTGCAGGTCCTATAATAAAGATTAGTTATCCTATCTAGAATTGAAAATCTTG AACTAGGTTTGGGTGGGGTGCGCCAGGCCCTTGCAGTAGTGTAAGGCATGGGCGTCGCTTGAGGATCCCAATAGCAAGCA ACTGTGATGGACCCTCCCCCTTATAAAACTAATTTAATATCGTGTGGACCATTGGCCCACATATCAGATATTAAACTGAT AAGAACAGATACTACACTTGATCTTAGTCAAAAGGCCGAGAAAGGTATGCTTCTACCATTGTCATGCATCTGCTTTTAAA TGTAATGTAGGTGCTTTGGCTGAGATGCACAACCAATGTGGGACTTGAAAGGTGGTACAGTGAGAAACAGCAATGTTATT GAGTATTTTGCAGTTGTGGTTACTATATCAGTAGTAGTTCTTCCATCTTTCTCTTGTATGTCTTTTGCATGTTTTGACTT TTGATGACTATGCTCTAACCTCGGGGTGCCTTTTACTGCTGATAGTGTGGGTAGTTTGGGAACAAAGGGCACTTCATCAA ATCCTAAGTTAAAGGTGCAAGTGGGCAAACTTTGTATTTTAAAGACTTTCTTGGCTGTGTTGTGGTTTCTAGATTCCAAT TTCCTGATCAATCCTCATTTCATGTCATATTACACAATCTTACACTCCTTTTATTCTCTGCATTGTGTACTTCCCGATGC TTGGGTGTATCAAATTGACCTTCGTGAAAGACTTCAGTAATGTGCAGTTTATTTAGGCCTTTGGTGAAATTGGTTTGAGC AGAATGCATTTTTGGGTGTTTCAGATCTCTTTCTCATTTATGACTTTTATTTTCTGCTTACTTGTGTGAAAGATTTTACT GGTGAATTTGACTGATTCATAAATATACTTATCTACTATATGAAGCTGCGGTTTCCTACACTTGAGGTGGAAATTATTTC TTTTATGCTTTGCACTGAACATTGTACAGACATGCACTTCTATGGAATCGAATGATATGAGGATTTGGTTCAGCGGTTAT GATAAAAATTACATTTCTCAGCTTTTCATAACTGTACTGAAAGTTTATTGTTATGTGCAATTTGAGTGTAAAAAGCTGGT GATCCATATTTTTTTACTCCAGTCTTATTCCATTGGGTCCAAATATTATCCAATTTTTCTTCAATGAAACTAGGATATTA ATGCAGGTTCTCCTTTTTTTTTTTACTTCTAATTTGTTTGGCCATCTATTTCTGCATTTGCTTCATCATTTACTTATAAT TCTCTATTCAAAATCTTTTGCTTTATGATATAACATTCTGACCTAATTTCTTCATGCTTATGAGTTATAACATGACATTC AAAGTTGGTTCTCTGATAGTGAAAGTGAAGAGATGGTTGGCATCACCGGCGAAAATGGACTATGATGAAGAAAACATTGG GTGATAAAGTAATATGGGAAACTCTGCAAGGTCTCTGTACTTTGCATGTAATGGAAAGTCCTAAAGATCTCAGTCATGTC ATCAAGTAAGTTTGCGCTTGTTATAATAAAATTGTATTTCGTGTAATGCAAGGAACAGACTTAATTTAATGTGTTTAGAC TTTAGAATGCTTGCATTGTGTTGTAATATTGCTCAGCTATATGCTACCATAGGATGCTCTCATTAGTCAATGAATATTAG ATATTCTTTAAATAAGAAAAAGGTATTCAAATACAACTTTCATTATTTTTGGGGGAGCCGCATTGATAAGAATAAAAACA AATTCTATTTAAAATTACATATAAAATGCGTTTGTATTATATTAAAAAAATGACTAACTATCTAAAAAAGAGATTAATTT TTAGAGATTTTTTAGAATAACATAAACTGATTTGTGTATAGAGAAAAATGATAATGCACCGACGATGTAATGTTTTTTTT GGGAGCTAAATCCTTTTGCATGCTCCATCAATGGTATGATTACTTACCCCATTAATGGTATGATTACTTACTCCATCACT TTAGGGGAGCTAAATCCTTTTGCATGCTCCTCACATTGGTGTGCACCCCCTCTGTAGGAACTGGGACCCCTTTATTTAAT GGGGAATTTGCACTCACCTTTCATGAGTTTGTTATTTGAGTTTAATTTTGATGCACCGACGGTGTTTTATGGAGTTTCTT CATGGATGCCCAATTCTTGAAAATCTGGAAGCATGTCATGTATTCTTTTATGACGGTTCGTTTGACGGGAAATTTAAAAC TTTACCGAAATTGGTTAGAGCACATGTTATTGACATGAGAAAATTTCAGATTCCTGTGAAAGCTTATTCTAATGTCAAGT TTCTGCGCTTAGACAAGGTTTGTAATTTGTATATGGTAAAGGAGAATGTTTAGTCTGTTATTTGTTTTCCATCAGACTGT GGAAAATGTTCTGATAATTTCTCTTTGGACCTCTTGCAGTGGGATGAAGATATTCCTATGTTTCCCAATTTAATTCATAT GGAGCTCCGCTTCTTCAAATCTCGATGGAATTCGGTGCTTGATATGCTCAATCATTGCCCTCAACTTCAAACTTTTGTCC TTGAATCCGAGTTTTATGCTTCCGACGTCGAGTTTTTCCCAACCACACATGCAGTTCCTGAATGCTTTTCTTCACAACTC AGAAAGTGCATTATTACAAATTATAGAAGTGGTGATTGTCATTTGAGATTTGCAAAGTATGTTATGCAAAATTCAACATC GTTACGTACAATGATTTGCAGTAAGCCTTACTGCAACGATAATCCAGACCAGCTTGAGATGTTAAAAGAATTAGCCTTTG CAACTTGTGAACTTTTATTTAAGTAAATTTTATGGCTGGGTGGTTAGTTAGTACTAGGAAGTTATTAATCTTGGTCTCTT GGATGACTGCATTTGTTAGTAGTTCTAAATTTAATGTGTCTGCTGTTTTTGGAACTTTTGATGGAGGTAAACTTTTTGTG CTGTTATGATTTTGATGGACTAACTTTGAGTTACATCTTCGTATACTTGTTCTCCTGTTTTTGTTTCAAAAATTGCTGAT CTGATGCAGAACAGTAACTTTTGGATATGTAATAGAACTGAATAGGGA
CDS sequence (LotjaGi1g1v0626100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTTCCCAATTTAATTCATATGGAGCTCCGCTTCTTCAAATCTCGATGGAATTCGGTGCTTGATATGCTCAATCATTG CCCTCAACTTCAAACTTTTGTCCTTGAATCCGAGTTTTATGCTTCCGACGTCGAGTTTTTCCCAACCACACATGCAGTTC CTGAATGCTTTTCTTCACAACTCAGAAAGTGCATTATTACAAATTATAGAAGTGGTGATTGTCATTTGAGATTTGCAAAG TATGTTATGCAAAATTCAACATCGTTACGTACAATGATTTGCAGTAAGCCTTACTGCAACGATAATCCAGACCAGCTTGA GATGTTAAAAGAATTAGCCTTTGCAACTTGTGAACTTTTATTTAAGTAA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0626100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MFPNLIHMELRFFKSRWNSVLDMLNHCPQLQTFVLESEFYASDVEFFPTTHAVPECFSSQLRKCIITNYRSGDCHLRFAK YVMQNSTSLRTMICSKPYCNDNPDQLEMLKELAFATCELLFK
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 2 | 114 | 113 | 1.8E-29 | – | |
| PANTHER | 2 | 114 | 113 | 1.8E-29 | – | |
| Pfam | 53 | 92 | 40 | 1.0E-10 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0626100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…