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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0721000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0721000.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ARM repeat superfamily protein, putative; TAIR: AT3G57570.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q7L311|ARMX2_HUMAN Armadillo repeat-containing X-linked protein 2; TrEMBL-Plants: tr|I1N927|I1N927_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0721000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:129177926..129200098) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AAAAAGAACAAAAAAACACTTATATTCAAATGTACCAATGAAGCACAATTTATAATCTACCAAAACAAAAGAAGCACAAG CTTATAGAAAGTCATGTTACTGTATAAAAAAAATAGAAAGTCATGTTAAGCTTAAAATAATATCAATCATGAGATTCAAA TATCTAACCAATATAGACATCTCATGTACACCATAATTTTCCATCCATCTCTCTTTGTTTCAGGTCACATCATATAGGAG GAATCATGAAAGTAATACTATCACTTCCGAAGTCCGATTCTACGACCCGTGTAGTAACTCTTTGACCACATGGAACCCAA ACTCCAAATTTGGCATCCACCGGCGGCAAGTTCTTCAATGGCGGCGGAGGCAGAGCAGCCATCGCCTGAGGCCGCGAAGG AGGCGGAGCCACCATCATCTGTGGCGGCCCAGGAATCATCTCACAGTATCTTTGGCGCGCAATCAGGTTAAGCTTCAAAT TCTCCATGGAATTCTTGAACTGCTCAACACTATCCAAATCCATGTCGTCAATGAGGGTTTCCCACCAAGAAGGAAACACA GAACCCTTCATCTCTTTCTCCTCCATTATCGCTTGCAGCTTCCTCTGCTCTTCTTTCAACCGTTCCTGCACAGCCTCATA CTCAGAACTAAGCGCTTCCACCTTCTCCTCCCCCACCTCCTCCCGCCGCCGCGCCTTCCCTCCAGTGAGAAACCGCTGTA TGACGGCGTCCGGAGAGGGGTAGCCGCACGTGAAAATCTCACCGCCGTCGTTGTTCTTTGAGGTTACAATCACCGCGGTT TCCGATTGGCAGAGAATGGAGAGCTCGGTGACCTTGTTGAAGAGCCCGTTCTTCCGCTTGGAAAACGACAACTGATCGCG TCGTTTGTCTGCTTGCGTTTTCTTCTTCTCCGTGGTGGTGTTTCGTTTGGATCGTGGTTGTGAAGGTGCCATTGCAATTC 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GCAACTGTTGTGAAATTCTTGAGTTATATCAGTGAAGACCTGGCAAATGTTGCTGATCTTGTATTGCATCATGTTATGTT GCATGTTAGAGAACAGAAGAAGTGAGTCTATGTATTACATTTTTTGTTATAATAAAATTTCTTAGTGCTTCTAACTACTT GTTAAAGATAAGTGATGTTACCTTTAACCTAATTACTATTAAAAAGTGTAGCTGTTATATTTCCCCCTTATATATGATTG TGAGCTTCAGATCTTTAACTATAACCTGAAAGAGCTGTATCTGTTTGTGTCAAATCTGGGATGCAATGATGGGACATATA ATAAGACAGGTAAATTCGTACTTGTAAAGCCAACTGCTGATAAAGAAAGAATATTGATTTAATTGAAGAAACTTAGAGTG GGATATCAATGGGATGCAGTTTTCAGAATTTGTCTTCAGTTGCACGTGGAAATAGTTTTGTATGCTCCTGTGCAACGCCA AAGAAAAGGGTTGGGAATAATACAGTTTTGAGGACTGTATATTAATATTTTATATTTGAGTTGTGCTAAATTTATGGAGC TGATTGGTTTGGGGGCGTACATATTATTTTATGATGCTTGGTTGGTTTGCCTCATAATACATTAAAGCTTATGTGAGCTC TAATCTCTATGAATTGTGTTTGATCATGAGTACACCCTTACTTTCGTCCTCATATCTCAACCTTGGCTCGCATTGTTATT TTAGTCACATACAATAAAGAAACATCATAAAAGTCCTCAAACTATCTTCCGGCGGTCACTTTAATCTGTGGATGCATGAA AAGCAAAGTGTAAAAAATATTCACTGATTGTATGGTAGTTGTGGATATGGATATATTTAAATTGTCTTTGTCCTACATTG GAAAATTAGGATTTTGTAGCAGTTCTTTTTCGCTCCTATGATGCTGCATACATGACTCAATGGTTCGATCATTTGTTGCA GGATTCATGAAAGTTTCTTATCAAGATGGGAGTCTAGAACCTATACCAGTGATGAGTTTGAAGAAATGCAGCGATCTCTG TTTGAGCGTCTCTGCCCGTTGCTCATAATTAAGATGCTTCCCATGAAAACTTTCAATGACCTGAATTCATCAATTATGTA TGGAAAACTCGGTCAAAATGTGATTCATGGTATATATTCATGCCTCATTTATTTTCCTTTCTGATTGTTGTGATGGATAT TTGTTGTATCACTTCATACTTCTAGTTATTTGCATGCCAAGATTTAGTGGGTCCGTTACTTTAGGTACTTGAAACTATAG CAATAACTGACGTTTCACGGAAAAGATAATAAAAGGTTCACAAGAGAAATCTTACTACTATAACATTTCATACTTAAGGT TCAGTTACAAAATCATGACTCTGGAATCTAGATTTCAATCCTACCTATCTATCTCAGTTCCTTGAATATCATGCATAAAC CTGTCTATCAGACTCGAGTATACATATTTTTCCTTTTAACCCATCATAATTTTCATGTGATGTCGTTACAATTTTTTTTC TTCTTGTAAGGTAGATTCAGACAGCGGGGACACTGAGACTAGTTACAAGTGTATTGCAAATCTCCTTCTAAACAGGTTGG TCCTTGAACAATTAGCATACAGTCATATCCTTCCATTAAGCAGTACAGGAGCCCGATGCATGTTTCATGCTATTCATTTG TTTCAGGGCATTTTGTGAATTTGAATTTGAAGATGTTCGGAAGCTCTCTGCTGAGCTGTGCGGACGCATTCATCCACAAG TAATGACTTTTTTAATCAAATATTGAACTTTTGGTGAACACATCAGTGTTTTTTTCTCTTAAAGAAGTAGTGCTACCTTG ATTGAGAACTTTTAGAAGCAATTCCAAAATCACCAGGGATGAATTTTCATTTGGATGTAGTTCTCAGTTCTGTAAAATTA TATAAATCTTTAGATTACACTTGTTCCTCTTTTTGACAGATGCATTCTGAATCACATGGCACCTCAGGAAACCTTATTTT GGCAGTTTTTAGGGATTACTTTAACTATTCGTTGCTGTTTGATTTTTTAGGTCTTAATCCCATTTGTTTGCTCCAAGTTA GAGGTGGCAATGGATTCTAAAGATATAGTGAAGATAAAAGCCTGTTTATTTTCAATATGCACATCCCTTGTGGTAATTAT TTTTCTCCATCAATATATAGATTGCCATGTTCTGCTGTTAAAAGTCTGTTTCATTTTCTTGCATTATCTGATTCAATTTA GCTTACGGTGAAGTGGCTTTTTTGGATTTATAGGTCAGAGGCTGGGAGTCACTTTCCCATCCTTCTATGCTTGCAATTAG AAGGATGATTGAAACAGTGCTGTTATGGCCTTGCCTGAATGCTGATTCAGGTCTGAAACTATTTTAGTTTCTAATTTCCT TCAATTTGACGTGAAGGCAAACTCATTTTAATGAATATAAATTTCAGTTTCTAAAGCACAACATGGATGCATTGATTGTC TAGCACTGATGATATGTGCTGAACTACAAGCTAAGGAATCAATCAAAGACTCCACGCCAGACAGAATTACGGTTGCTGAG AAGAAAGGTATCATTTATGTGTATCCTGAATATAAGCAAGGAAATTCTACTGTGTAGTTCAATTTGCATTCTTCATCTCC AACCTGTATTCTTCTTCTGCAGGGAATTCTGTTGTCACTTATATGATACACCAGTTCGTGAATGACAAGGAGCAGGCATC TATTCCTGAGTTGGGTGATGGTGTTGCTGCTGTTCCTCTCTCTTTTCGTCTGTGCATGGGTAATGTTCTCATCAGCGCTA GCCAGAAGATTTCAAAGTCTTGCAAGAAGCGCTTTGCAGCACAAGTTCTTCCTTTTCTTCTTCATTCTCTTGAGGTACCA AACCATAGCATATTTAGTTCTTGATTACCTTTTAGTATGATTTTAATATAGTTCTTGAAACTTTACGATCATTCTTCCCG GGTTATGAAAAACTAGTGTTTTGTCAACAGTTTGAAATGAAGTCAGAGATTAGAGCAGCATGCATCCAGGTTCTATTTTC AGCTGTCTATCATCTAGGATATGCAGTTCTTCCTTATGCATCTGAGCTTCTCAAAATCTCGCTAAAGGCCCTAAGAAAGG AGTCAGAGAAGGTAAATTAACTTTGATCTTCTACATTAATAGCATGATGTATGTAATTTTATCAGGATAAACAATTATGC AAAAGTCTCTCCTATTGTTTATTTACATGCTAGATCTAACATAGGGTTCAATATATCAAATTTAATTCTTGGTTGGTGTC TGTGAATCCTGTGACGTGAAATGAATTACCAGGCATATACTAAGATTTTCACCAACCTCTTCGCATAATAACATTTATGA TTAATGTTCAGCAGGAAAGGATGGCAGGTGCGAAGCTAATAGCATCTCTTATGGCCAGCGAAGATGTGATTTTGGAAAAA ATATCAGGTGGACTATTAGAAGCAAGGTCCGTACTTTCAACTGTTTCCTCATCAGATCCATCACTTGAATTACGACAGCT TTGCTCCAAGTTGCTAGCATGCATATCTTCTCCATGAGCTGCGAATAACATTTTCTGAGTATGTTATAGAAGATCTCACT TAGTTGCGGTATCACTCTCCCTGTTATTTTTTATCTTTTAAATTGTACATAAATTCTCTTTGTATGGGCAGTTAAAATAT TTGAAACAGATTTCATGGCTTGCCTTGTTGAATGGTCATGAGAAGTAGTTATAACCGTGAGCATGTTGTATATATACAGT ACAGTGTAACTGTTATTATTAGATTAATGTACCCTCAAAACACCCGCCCACCCACTCTGATATATTTTAGGGGTGTAGAT AGACGTTCATATTATAATATATCAATACAATGCAGCCTCAAATAAGGTAGAAGATTACAAGCCACGCTTGTTTTAATAAA AACAGGTTATTTG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0721000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGACTTTATATTTTCTGCCCCTCGTTCTTTTAAGAATGAAGCTAAAATCTGGTTTTATTGGTAGAGTAAGCAGAAAACA GAGTCAGCCCCTTGAGATTGAGAGTGCGCGCAGAGCAGAAGCAGAGAAGAGAACAATGGAAGAAGCATCATCATCATCAT CATCATCATCATCATCAGGTGGTAGCAGTGAACAACAAGAGTTACTGCTATGGAAATCGGACCCCCAACCCGAATCCATC GTCTCCGTCACGCTCGCACGCGCCGTCACCTCTCTCCTCACAACCCGCCCCACCAAACTCCACGACTCCATTTCTCGCCT ATCACCTTCCCCCACTCCTCCTTCCACCGCTTCCCTCGAACACTCCCTCCGCTTCTTCCACACCTTCGTCACCGACGCCG CCGCCGCCAACAATCTCACTTCCCTCGACCAACTCCTCCTTCCCATCATCCACAGCTTGTTGAAGTCCAAGGACACCAAA CGCGGTGGCCAAGCCATGATTCTGCTCAGCTGGCTCTTCCAGGACGAGCTTCTCTTCGTGCCCGTTGCTGAAGCGCTTGC TGGCATTGTTGCCAGAAAGCGCGACGACCGGTATGTGTTGTTTGGTTGGTGTCTCCTTGTTCGGAGTCTTGTAGAGTATG ATAGTTCTGTTCATCAATCCATGCTTGCTGGAATAAGGGAGAGATATGGTGATTTGTTGAAGATACTATCGACCCGCTTG CCTGATTTGGCAGGCATTGTAAGTAATGAAAGCACTCTGCAGGATGGTTTTCAGTTGCCATCTCGCCTTGGAGTGTCTGC CGCTGACTGTTTGTTGTCCATTTCTGGAGCATTAACAAAAGTGGCTGAGCTTGATGGTAAGAAGTCAAGATTAAATACTA GAGCAAAAGATCAGGCAATTGCTTTTGTACAATCTCCTAGTGTTGAAAAGAAGGTGAAAATGGGTTCAAAATCTTTGTTG ATGTCAAAGTTTGAAAGGGACTATATTCTTTGGAACCATTTAGATCACCTTATATGTTTGGTGCAAAGACTCCTTTCTTG GAGCAAAAAAAGCCGTTTATTACATGCTCAAGGATTGGAGCAAGTTCTGAAATGGCTGGAGGAGATAAAGGGTCACTATG GGTCCTTGCTACCTGAGGCAGATTGTAATGCTCTGAAGTCTGGGGATTTACTACTATGCTCTTGCTGGAAGCATTATAGC ATGCTATTACACTTGGAAGATCATAAGTTTTCTCAGCATTACAAGGAACTCTTGGACCAGTATTTATCTGGAATTCAGTA TTATATGGACAACCATGCTGGTGGGTATACTGACAACAAGGATGGTGGGTTGGAGACAATGAAGTTTTTTTTGAACTGTC TATGCTTACTACTGGGACGTCTAGATAGCAAGAGATTTGAAGGAACAGTGTCAGAATTTGGAATGAATATCTCACGCATT CTAGTACCACAGCTCAACTGCAGTGATGAAGATGTGGTAGTTGGGGTTGTTTCAATATTCAAGGCAATTATTTTGAAGCC AGATTACTCAGAAGAAGACACACTCACTGACAGTAGACAGGCGAATCTTGTGATACCTTTTCTGCTTCACCTTCTAGATG AACAGGACGGTCCAGCTAGAGCTGTTGTTTTGCTGATAGCAGAATACTGCTCAATGAGCAAAGATGATAAGTGCCTTATG GAAGTTCTAAAGCGCCTTGCTTCTGGAAACATTTCACAGAGAAGAAATGCTTTGGACGTTATATCAGAGATCTTAAATAT ATCATCAGAGTCACAGAAATTATTGCCTTATTCTGCTTGGCAAGATATTGCCAACAAATTGCTTGGGCTGCTTGGAGATG AAGAAATTTTGATTCGTGAGCAAACATCCAAGTTGCTTCCATTGATAGACCCATTGTTGTACTTGCCTGCATTGGTTGGT CTTGTTTACTCTTCTGGTGAGAGCCAATCATCTGCTAGTGATGCCATCATTGGCGTCCTCAAACGACACAACCAGAGAAT TGAAATTGTATTCTTGCTTCTTGACTGTCTTAGCAACATCAGCCATAGCCCGGATCTTTCAGAGTCCACCGGAGATAAAG GATCAAAGTTGGATGCTGACCGAGTACTCAAACTGGTTCCAGAATGGTCTAAAAGTGTCCAGGACTGGAACTCCTTAATT GGACCAGTGGTTGACAAGATGTTCACAGATCCATCAAATGCAACTGTTGTGAAATTCTTGAGTTATATCAGTGAAGACCT GGCAAATGTTGCTGATCTTGTATTGCATCATGTTATGTTGCATGTTAGAGAACAGAAGAAGATTCATGAAAGTTTCTTAT CAAGATGGGAGTCTAGAACCTATACCAGTGATGAGTTTGAAGAAATGCAGCGATCTCTGTTTGAGCGTCTCTGCCCGTTG CTCATAATTAAGATGCTTCCCATGAAAACTTTCAATGACCTGAATTCATCAATTATGTATGGAAAACTCGGTCAAAATGT GATTCATGATTCAGACAGCGGGGACACTGAGACTAGTTACAAGTGTATTGCAAATCTCCTTCTAAACAGGGCATTTTGTG AATTTGAATTTGAAGATGTTCGGAAGCTCTCTGCTGAGCTGTGCGGACGCATTCATCCACAAGTCTTAATCCCATTTGTT TGCTCCAAGTTAGAGGTGGCAATGGATTCTAAAGATATAGTGAAGATAAAAGCCTGTTTATTTTCAATATGCACATCCCT TGTGGTCAGAGGCTGGGAGTCACTTTCCCATCCTTCTATGCTTGCAATTAGAAGGATGATTGAAACAGTGCTGTTATGGC CTTGCCTGAATGCTGATTCAGTTTCTAAAGCACAACATGGATGCATTGATTGTCTAGCACTGATGATATGTGCTGAACTA CAAGCTAAGGAATCAATCAAAGACTCCACGCCAGACAGAATTACGGTTGCTGAGAAGAAAGGGAATTCTGTTGTCACTTA TATGATACACCAGTTCGTGAATGACAAGGAGCAGGCATCTATTCCTGAGTTGGGTGATGGTGTTGCTGCTGTTCCTCTCT CTTTTCGTCTGTGCATGGGTAATGTTCTCATCAGCGCTAGCCAGAAGATTTCAAAGTCTTGCAAGAAGCGCTTTGCAGCA CAAGTTCTTCCTTTTCTTCTTCATTCTCTTGAGTTTGAAATGAAGTCAGAGATTAGAGCAGCATGCATCCAGGTTCTATT TTCAGCTGTCTATCATCTAGGATATGCAGTTCTTCCTTATGCATCTGAGCTTCTCAAAATCTCGCTAAAGGCCCTAAGAA AGGAGTCAGAGAAGGAAAGGATGGCAGGTGCGAAGCTAATAGCATCTCTTATGGCCAGCGAAGATGTGATTTTGGAAAAA ATATCAGGTGGACTATTAGAAGCAAGGTCCGTACTTTCAACTGTTTCCTCATCAGATCCATCACTTGAATTACGACAGCT TTGCTCCAAGTTGCTAGCATGCATATCTTCTCCATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0721000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MTLYFLPLVLLRMKLKSGFIGRVSRKQSQPLEIESARRAEAEKRTMEEASSSSSSSSSSGGSSEQQELLLWKSDPQPESI VSVTLARAVTSLLTTRPTKLHDSISRLSPSPTPPSTASLEHSLRFFHTFVTDAAAANNLTSLDQLLLPIIHSLLKSKDTK RGGQAMILLSWLFQDELLFVPVAEALAGIVARKRDDRYVLFGWCLLVRSLVEYDSSVHQSMLAGIRERYGDLLKILSTRL PDLAGIVSNESTLQDGFQLPSRLGVSAADCLLSISGALTKVAELDGKKSRLNTRAKDQAIAFVQSPSVEKKVKMGSKSLL MSKFERDYILWNHLDHLICLVQRLLSWSKKSRLLHAQGLEQVLKWLEEIKGHYGSLLPEADCNALKSGDLLLCSCWKHYS MLLHLEDHKFSQHYKELLDQYLSGIQYYMDNHAGGYTDNKDGGLETMKFFLNCLCLLLGRLDSKRFEGTVSEFGMNISRI LVPQLNCSDEDVVVGVVSIFKAIILKPDYSEEDTLTDSRQANLVIPFLLHLLDEQDGPARAVVLLIAEYCSMSKDDKCLM EVLKRLASGNISQRRNALDVISEILNISSESQKLLPYSAWQDIANKLLGLLGDEEILIREQTSKLLPLIDPLLYLPALVG LVYSSGESQSSASDAIIGVLKRHNQRIEIVFLLLDCLSNISHSPDLSESTGDKGSKLDADRVLKLVPEWSKSVQDWNSLI GPVVDKMFTDPSNATVVKFLSYISEDLANVADLVLHHVMLHVREQKKIHESFLSRWESRTYTSDEFEEMQRSLFERLCPL LIIKMLPMKTFNDLNSSIMYGKLGQNVIHDSDSGDTETSYKCIANLLLNRAFCEFEFEDVRKLSAELCGRIHPQVLIPFV CSKLEVAMDSKDIVKIKACLFSICTSLVVRGWESLSHPSMLAIRRMIETVLLWPCLNADSVSKAQHGCIDCLALMICAEL QAKESIKDSTPDRITVAEKKGNSVVTYMIHQFVNDKEQASIPELGDGVAAVPLSFRLCMGNVLISASQKISKSCKKRFAA QVLPFLLHSLEFEMKSEIRAACIQVLFSAVYHLGYAVLPYASELLKISLKALRKESEKERMAGAKLIASLMASEDVILEK ISGGLLEARSVLSTVSSSDPSLELRQLCSKLLACISSP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 30 | 68 | 39 | - | – | |
| MobiDBLite | 31 | 47 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 48 | 68 | 21 | - | – | |
| PANTHER | 66 | 1157 | 1092 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 142 | 1156 | 1015 | 1.92E-16 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0721000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…