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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi1g1v0721000 |
| Transcript ID | LotjaGi1g1v0721000.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ARM repeat superfamily protein, putative; TAIR: AT3G57570.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|Q53684|YOE2_STRAT Uncharacterized lipoprotein in oleD 5'region; TrEMBL-Plants: tr|I1N927|I1N927_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi1g1v0721000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr1:129178100..129200071) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGACATCTCATGTACACCATAATTTTCCATCCATCTCTCTTTGTTTCAGGTCACATCATATAGGAGGAATCATGAAAGTA ATACTATCACTTCCGAAGTCCGATTCTACGACCCGTGTAGTAACTCTTTGACCACATGGAACCCAAACTCCAAATTTGGC ATCCACCGGCGGCAAGTTCTTCAATGGCGGCGGAGGCAGAGCAGCCATCGCCTGAGGCCGCGAAGGAGGCGGAGCCACCA TCATCTGTGGCGGCCCAGGAATCATCTCACAGTATCTTTGGCGCGCAATCAGGTTAAGCTTCAAATTCTCCATGGAATTC TTGAACTGCTCAACACTATCCAAATCCATGTCGTCAATGAGGGTTTCCCACCAAGAAGGAAACACAGAACCCTTCATCTC TTTCTCCTCCATTATCGCTTGCAGCTTCCTCTGCTCTTCTTTCAACCGTTCCTGCACAGCCTCATACTCAGAACTAAGCG CTTCCACCTTCTCCTCCCCCACCTCCTCCCGCCGCCGCGCCTTCCCTCCAGTGAGAAACCGCTGTATGACGGCGTCCGGA GAGGGGTAGCCGCACGTGAAAATCTCACCGCCGTCGTTGTTCTTTGAGGTTACAATCACCGCGGTTTCCGATTGGCAGAG AATGGAGAGCTCGGTGACCTTGTTGAAGAGCCCGTTCTTCCGCTTGGAAAACGACAACTGATCGCGTCGTTTGTCTGCTT GCGTTTTCTTCTTCTCCGTGGTGGTGTTTCGTTTGGATCGTGGTTGTGAAGGTGCCATTGCAATTCAAGAACAAGAACAA GAAAACAGAGTGGGGAAGAAGAAGAAAGTAAGTTTTAACTTAACTTTTAGCACACTCTTACAATAATTTGGGTTTTGTAA TTACTAATTTGCTTTGTATATATATATATAGTTCTCTAGTTGTCTTAAATTCAATAGAGTTTTTTTTTTTTGAAAACAAA 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ATGTTACCTTTAACCTAATTACTATTAAAAAGTGTAGCTGTTATATTTCCCCCTTATATATGATTGTGAGCTTCAGATCT TTAACTATAACCTGAAAGAGCTGTATCTGTTTGTGTCAAATCTGGGATGCAATGATGGGACATATAATAAGACAGGTAAA TTCGTACTTGTAAAGCCAACTGCTGATAAAGAAAGAATATTGATTTAATTGAAGAAACTTAGAGTGGGATATCAATGGGA TGCAGTTTTCAGAATTTGTCTTCAGTTGCACGTGGAAATAGTTTTGTATGCTCCTGTGCAACGCCAAAGAAAAGGGTTGG GAATAATACAGTTTTGAGGACTGTATATTAATATTTTATATTTGAGTTGTGCTAAATTTATGGAGCTGATTGGTTTGGGG GCGTACATATTATTTTATGATGCTTGGTTGGTTTGCCTCATAATACATTAAAGCTTATGTGAGCTCTAATCTCTATGAAT TGTGTTTGATCATGAGTACACCCTTACTTTCGTCCTCATATCTCAACCTTGGCTCGCATTGTTATTTTAGTCACATACAA TAAAGAAACATCATAAAAGTCCTCAAACTATCTTCCGGCGGTCACTTTAATCTGTGGATGCATGAAAAGCAAAGTGTAAA AAATATTCACTGATTGTATGGTAGTTGTGGATATGGATATATTTAAATTGTCTTTGTCCTACATTGGAAAATTAGGATTT TGTAGCAGTTCTTTTTCGCTCCTATGATGCTGCATACATGACTCAATGGTTCGATCATTTGTTGCAGGATTCATGAAAGT TTCTTATCAAGATGGGAGTCTAGAACCTATACCAGTGATGAGTTTGAAGAAATGCAGCGATCTCTGTTTGAGCGTCTCTG CCCGTTGCTCATAATTAAGATGCTTCCCATGAAAACTTTCAATGACCTGAATTCATCAATTATGTATGGAAAACTCGGTC 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TAGGATATGCAGTTCTTCCTTATGCATCTGAGCTTCTCAAAATCTCGCTAAAGGCCCTAAGAAAGGAGTCAGAGAAGGTA AATTAACTTTGATCTTCTACATTAATAGCATGATGTATGTAATTTTATCAGGATAAACAATTATGCAAAAGTCTCTCCTA TTGTTTATTTACATGCTAGATCTAACATAGGGTTCAATATATCAAATTTAATTCTTGGTTGGTGTCTGTGAATCCTGTGA CGTGAAATGAATTACCAGGCATATACTAAGATTTTCACCAACCTCTTCGCATAATAACATTTATGATTAATGTTCAGCAG GAAAGGATGGCAGGTGCGAAGCTAATAGCATCTCTTATGGCCAGCGAAGATGTGATTTTGGAAAAAATATCAGGTGGACT ATTAGAAGCAAGGTCCGTACTTTCAACTGTTTCCTCATCAGATCCATCACTTGAATTACGACAGCTTTGCTCCAAGTTGC TAGCATGCATATCTTCTCCATGAGCTGCGAATAACATTTTCTGAGTATGTTATAGAAGATCTCACTTAGTTGCGGTATCA CTCTCCCTGTTATTTTTTATCTTTTAAATTGTACATAAATTCTCTTTGTATGGGCAGTTAAAATATTTGAAACAGATTTC ATGGCTTGCCTTGTTGAATGGTCATGAGAAGTAGTTATAACCGTGAGCATGTTGTATATATACAGTACAGTGTAACTGTT ATTATTAGATTAATGTACCCTCAAAACACCCGCCCACCCACTCTGATATATTTTAGGGGTGTAGATAGACGTTCATATTA TAATATATCAATACAATGCAGCCTCAAATAAGGTAGAAGATTACAAGCCACG
CDS sequence (LotjaGi1g1v0721000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGAAGCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCAGGTGGTAGCAGTGAACAACAAGAGTTACTGCTATGGAA ATCGGACCCCCAACCCGAATCCATCGTCTCCGTCACGCTCGCACGCGCCGTCACCTCTCTCCTCACAACCCGCCCCACCA AACTCCACGACTCCATTTCTCGCCTATCACCTTCCCCCACTCCTCCTTCCACCGCTTCCCTCGAACACTCCCTCCGCTTC TTCCACACCTTCGTCACCGACGCCGCCGCCGCCAACAATCTCACTTCCCTCGACCAACTCCTCCTTCCCATCATCCACAG CTTGTTGAAGTCCAAGGACACCAAACGCGGTGGCCAAGCCATGATTCTGCTCAGCTGGCTCTTCCAGGACGAGCTTCTCT TCGTGCCCGTTGCTGAAGCGCTTGCTGGCATTGTTGCCAGAAAGCGCGACGACCGGTATGTGTTGTTTGGTTGGTGTCTC CTTGTTCGGAGTCTTGTAGAGTATGATAGTTCTGTTCATCAATCCATGCTTGCTGGAATAAGGGAGAGATATGGTGATTT GTTGAAGATACTATCGACCCGCTTGCCTGATTTGGCAGGCATTGTAAGTAATGAAAGCACTCTGCAGGATGGTTTTCAGT TGCCATCTCGCCTTGGAGTGTCTGCCGCTGACTGTTTGTTGTCCATTTCTGGAGCATTAACAAAAGTGGCTGAGCTTGAT GGTAAGAAGTCAAGATTAAATACTAGAGCAAAAGATCAGGCAATTGCTTTTGTACAATCTCCTAGTGTTGAAAAGAAGGT GAAAATGGGTTCAAAATCTTTGTTGATGTCAAAGTTTGAAAGGGACTATATTCTTTGGAACCATTTAGATCACCTTATAT GTTTGGTGCAAAGACTCCTTTCTTGGAGCAAAAAAAGCCGTTTATTACATGCTCAAGGATTGGAGCAAGTTCTGAAATGG CTGGAGGAGATAAAGGGTCACTATGGGTCCTTGCTACCTGAGGCAGATTGTAATGCTCTGAAGTCTGGGGATTTACTACT ATGCTCTTGCTGGAAGCATTATAGCATGCTATTACACTTGGAAGATCATAAGTTTTCTCAGCATTACAAGGAACTCTTGG ACCAGTATTTATCTGGAATTCAGTATTATATGGACAACCATGCTGGTGGGTATACTGACAACAAGGATGGTGGGTTGGAG ACAATGAAGTTTTTTTTGAACTGTCTATGCTTACTACTGGGACGTCTAGATAGCAAGAGATTTGAAGGAACAGTGTCAGA ATTTGGAATGAATATCTCACGCATTCTAGTACCACAGCTCAACTGCAGTGATGAAGATGTGGTAGTTGGGGTTGTTTCAA TATTCAAGGCAATTATTTTGAAGCCAGATTACTCAGAAGAAGACACACTCACTGACAGTAGACAGGCGAATCTTGTGATA CCTTTTCTGCTTCACCTTCTAGATGAACAGGACGGTCCAGCTAGAGCTGTTGTTTTGCTGATAGCAGAATACTGCTCAAT GAGCAAAGATGATAAGTGCCTTATGGAAGTTCTAAAGCGCCTTGCTTCTGGAAACATTTCACAGAGAAGAAATGCTTTGG ACGTTATATCAGAGATCTTAAATATATCATCAGAGTCACAGAAATTATTGCCTTATTCTGCTTGGCAAGATATTGCCAAC AAATTGCTTGGGCTGCTTGGAGATGAAGAAATTTTGATTCGTGAGCAAACATCCAAGTTGCTTCCATTGATAGACCCATT GTTGTACTTGCCTGCATTGGTTGGTCTTGTTTACTCTTCTGGTGAGAGCCAATCATCTGCTAGTGATGCCATCATTGGCG TCCTCAAACGACACAACCAGAGAATTGAAATTGTATTCTTGCTTCTTGACTGTCTTAGCAACATCAGCCATAGCCCGGAT CTTTCAGAGTCCACCGGAGATAAAGGATCAAAGTTGGATGCTGACCGAGTACTCAAACTGGTTCCAGAATGGTCTAAAAG TGTCCAGGACTGGAACTCCTTAATTGGACCAGTGGTTGACAAGATGTTCACAGATCCATCAAATGCAACTGTTGTGAAAT TCTTGAGTTATATCAGTGAAGACCTGGCAAATGTTGCTGATCTTGTATTGCATCATGTTATGTTGCATGTTAGAGAACAG AAGAAGATTCATGAAAGTTTCTTATCAAGATGGGAGTCTAGAACCTATACCAGTGATGAGTTTGAAGAAATGCAGCGATC TCTGTTTGAGCGTCTCTGCCCGTTGCTCATAATTAAGATGCTTCCCATGAAAACTTTCAATGACCTGAATTCATCAATTA TGTATGGAAAACTCGGTCAAAATGTGATTCATGATTCAGACAGCGGGGACACTGAGACTAGTTACAAGTGTATTGCAAAT CTCCTTCTAAACAGGGCATTTTGTGAATTTGAATTTGAAGATGTTCGGAAGCTCTCTGCTGAGCTGTGCGGACGCATTCA TCCACAAGTCTTAATCCCATTTGTTTGCTCCAAGTTAGAGGTGGCAATGGATTCTAAAGATATAGTGAAGATAAAAGCCT GTTTATTTTCAATATGCACATCCCTTGTGGTCAGAGGCTGGGAGTCACTTTCCCATCCTTCTATGCTTGCAATTAGAAGG ATGATTGAAACAGTGCTGTTATGGCCTTGCCTGAATGCTGATTCAGTTTCTAAAGCACAACATGGATGCATTGATTGTCT AGCACTGATGATATGTGCTGAACTACAAGCTAAGGAATCAATCAAAGACTCCACGCCAGACAGAATTACGGTTGCTGAGA AGAAAGGGAATTCTGTTGTCACTTATATGATACACCAGTTCGTGAATGACAAGGAGCAGGCATCTATTCCTGAGTTGGGT GATGGTGTTGCTGCTGTTCCTCTCTCTTTTCGTCTGTGCATGGGTAATGTTCTCATCAGCGCTAGCCAGAAGATTTCAAA GTCTTGCAAGAAGCGCTTTGCAGCACAAGTTCTTCCTTTTCTTCTTCATTCTCTTGAGTTTGAAATGAAGTCAGAGATTA GAGCAGCATGCATCCAGGTTCTATTTTCAGCTGTCTATCATCTAGGATATGCAGTTCTTCCTTATGCATCTGAGCTTCTC AAAATCTCGCTAAAGGCCCTAAGAAAGGAGTCAGAGAAGGAAAGGATGGCAGGTGCGAAGCTAATAGCATCTCTTATGGC CAGCGAAGATGTGATTTTGGAAAAAATATCAGGTGGACTATTAGAAGCAAGGTCCGTACTTTCAACTGTTTCCTCATCAG ATCCATCACTTGAATTACGACAGCTTTGCTCCAAGTTGCTAGCATGCATATCTTCTCCATGA
Protein sequence (LotjaGi1g1v0721000.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEEASSSSSSSSSSGGSSEQQELLLWKSDPQPESIVSVTLARAVTSLLTTRPTKLHDSISRLSPSPTPPSTASLEHSLRF FHTFVTDAAAANNLTSLDQLLLPIIHSLLKSKDTKRGGQAMILLSWLFQDELLFVPVAEALAGIVARKRDDRYVLFGWCL LVRSLVEYDSSVHQSMLAGIRERYGDLLKILSTRLPDLAGIVSNESTLQDGFQLPSRLGVSAADCLLSISGALTKVAELD GKKSRLNTRAKDQAIAFVQSPSVEKKVKMGSKSLLMSKFERDYILWNHLDHLICLVQRLLSWSKKSRLLHAQGLEQVLKW LEEIKGHYGSLLPEADCNALKSGDLLLCSCWKHYSMLLHLEDHKFSQHYKELLDQYLSGIQYYMDNHAGGYTDNKDGGLE TMKFFLNCLCLLLGRLDSKRFEGTVSEFGMNISRILVPQLNCSDEDVVVGVVSIFKAIILKPDYSEEDTLTDSRQANLVI PFLLHLLDEQDGPARAVVLLIAEYCSMSKDDKCLMEVLKRLASGNISQRRNALDVISEILNISSESQKLLPYSAWQDIAN KLLGLLGDEEILIREQTSKLLPLIDPLLYLPALVGLVYSSGESQSSASDAIIGVLKRHNQRIEIVFLLLDCLSNISHSPD LSESTGDKGSKLDADRVLKLVPEWSKSVQDWNSLIGPVVDKMFTDPSNATVVKFLSYISEDLANVADLVLHHVMLHVREQ KKIHESFLSRWESRTYTSDEFEEMQRSLFERLCPLLIIKMLPMKTFNDLNSSIMYGKLGQNVIHDSDSGDTETSYKCIAN LLLNRAFCEFEFEDVRKLSAELCGRIHPQVLIPFVCSKLEVAMDSKDIVKIKACLFSICTSLVVRGWESLSHPSMLAIRR MIETVLLWPCLNADSVSKAQHGCIDCLALMICAELQAKESIKDSTPDRITVAEKKGNSVVTYMIHQFVNDKEQASIPELG DGVAAVPLSFRLCMGNVLISASQKISKSCKKRFAAQVLPFLLHSLEFEMKSEIRAACIQVLFSAVYHLGYAVLPYASELL KISLKALRKESEKERMAGAKLIASLMASEDVILEKISGGLLEARSVLSTVSSSDPSLELRQLCSKLLACISSP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 25 | 25 | - | – | |
| PANTHER | 21 | 1112 | 1092 | 0.0 | – | |
| SUPERFAMILY | 406 | 1111 | 706 | 1.91E-14 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi1g1v0721000.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…