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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0128600 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0128600.1 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Polypyrimidine tract-binding-like protein; TAIR: AT1G43190.1 polypyrimidine tract-binding protein 3; Swiss-Prot: sp|Q6ICX4|PTBP3_ARATH Polypyrimidine tract-binding protein homolog 3; TrEMBL-Plants: tr|I1JDD2|I1JDD2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0128600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:47070561..47098651) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGGCTGAACCTTCTAAGGTCATTCACGTTCGAAATGTGGGGCATGAGATATCTGAAGTAAACTCTCTCTCTCTCTCTCT CTCTCTCTCTGCTTTGCTCTATGATCATGTCGTTTATACTTGTTATTTGATTTTGCAATAAGATGCTGCCATGGCTTTAC CTTTTTACCATCGGCTTGTATGCATTTTCTCTAGCTCTGTTATGACTAGAATGGTGATTTTTGTGATATTTAATTATTCA CTCTTGTCGGGGAAAGTAGCTGTTCTGGACTTATGGAATCAGTTCTGTATTTCGTATTTCTTATATTGATTGTAACTGTT TTTGTAGCTCTAATGTGGATCCCTAAATATCAGTGTTGTAAAGTATAGGCTATGGCGGAATCCCAGCAAGCCGCCATGGC GCATATATCGTCATAATCAGCCATCATTATTTGTCAATCATGGCGCGTTTATGGTTTTCCGCCATCCGCCTTTAGCAACA CTGTAAATGTGGACTTTTCATCACCACCCCCCGTTTCTGAATTTGCCTTACCTCCCTTCGAACTGTAAACTGAGACACAT CCCAGTTGGCAGTGCTGTTTGTTGTGGAAACACTGGTCTAAGCCATCGTTGAGTAATCCAAGGGAAAAGGGGAAGGGGAG AGGCTATGCCATAAGGAATAGTGGAAAGGGTGGAGAAGAATGTAAGGGGAAGAGGGAGAGATCTGTGATACCTAAAGAAG GGAAATTAAGGGGGGAGGTTTTATGAGATAGTAGGAGAGAAAACATCTAAAAATGTTTGGTTAGTATAGGAAGATGCAGT TTTTAGTTTCTCGGCCTATTGGGAGAAGAAAGATAAATTGCCAGTAAATGTGAACATGTAATTAATATATAAAAAGGTAT ATCTTGTGCAGTTTTTAAAAATAATTTATCTTAAAGTGTACTGATTAATATTATAAAATATATTACAAACTTAAATACGG 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GGAGACTTCACCTGTGAGTCTGTGACTGACAGATCAAGGACCAAGATACATGGGGTCTAAAATTGTATTATGATAACTTT TTTTTTTGAAAATAAAAAAGTTAACTTCAACCGTGGTTGGTGGCTCTATAGTGTGATAGAGATTTGTCCCTTTTACACAT TTTGTGGAAATATTTACTTCTAATTTTGTTTTTTTTAAAAGAAATATTCACAAGGAATTGGACTTCGAATATTATTTTAT TGCAATGAATTTTCTTGTTACATCAAAGTATAATTGTTGAAATTTAAAAATGCATTATTATCTTTGTAAATTAGTGCTAT TCTAGGCCTTAGCTGCTTTAGAAACTATTGTAACTCGAAACTGTCCTGCTTATAATACCTTGCAACTTGAAGTTGTTTTC AGACCCAAGAGGATTCTCACTGGATTAATCATTTCCAATTTCATCTTGCAATCCCTGCTTTGAAAGCAAAAGCTCTATGA AATCGTTTCTTCTCTTCAAGTGACAAATTATCAAAACTAATTTCTTGTCCTGTAGGAAAAAAAATCAAACCAATTGAGAC ACATGTTGATTGGTACGCGATGAAATGGTGCTCATAGGACTGTATGTAAACTATATGCCTATTAATAAGCATTCTCTTCA ATTCTAAAATTCTTCTTTTGTATAGAGTAATTAAATTGATTGTTTGTAAATTGCTTGTTCCTGAAGCGTTTATTGCCGGT GATAAACAACTTTTGGAGGTTAAACCGCCACAAGTTTCTGCCTTTCTAATAAAAAAGAATCCAATGGTCGTAGACCACTA GAAACAGTGAACAATATATTTGAGGAGTCGAGAGTAGGTCCCATAACTATTGTGAATAGATACAAACTTTAATTTTACAA ACCAAGACAAAAAGAAGACACATCTCAGAAATAACTCAAATCAATAAAACTACTTAAAATAAAATGCTAAGACTAAATCT AAATTTTGACAGCATATACGCGACAAATTAACATCTTTAAAGTCTATTTCCTTTCTTCTAATTTTTAAAACTTCAATATC ATTAAGACAATAATTTTCAGCTTCTAATAGATTAATGGAATCAATAACACAACATATGACGGAGTTGCAGACTTCATAGG CTGTTTCAGAACATCTAATAACTAAAATTAATATAACATAACTTCAGCTCTCAACAACATTCTAAAGTCTTCAAAACCAT TATCTGCAAATCATCCACTTCGCTTCAACATGCCAAGTGGCGAAACCATGCCTCGCTTCTGCATTCAGAACAGCCATAGC CAGCACCATAGCAGGATATGTCACCATTGATGACCCTACCTTCTTTCATGACCAACTCATAAAAAACATGAAAAAGATTT GCATAAAGGAGGATAAAAGAGTATGGGTGAAGAGACTTACAGTTAAATGAGTGATGGAAAAAAACCCTCTTTTATTCAAG CACACACAGAATTCCCAAAAATATGTTAATTTGTTAAGTTAAACAGTCATAGTCAATCCTACCACTCTGTAAAATCAACA AAAAAGTTACTTCACCATTATGTACTAAATTGAAGCAGAAATCAGCTTTTACCTTTAAAGATATATTATCAAACAAAACC AAAGAAAGAAATTGCTTCAGCTCCCTTCTGATTCAAGAAGCTGTATCAAAAGAAAAATGCTTCAGCTCATTTCTGATTCA AGTTAGCTCTCAGAATTAAATTCCTTCAGCTCATTTCTTATAACATCCACAAAGGCAATAAATTGAAAAGCCTTCTTAGA TAATCAAAGCAAACTCTATCTTTGTTGCCTCTAACAATTAAATTGTAGTATGTAACATTGTAGAGATTCATTTTCTCACC TGAAACATCTATCCAGCTGCTTCATGCTCTCATCAAAGAAAATCTTGTGGACAAACTTCCATTAATTCGGTTTTGATATC CTATAATTCTTTAAGGCTTTAGTAGTAACACATTTAAAAGAAAATCTTGTTGACAAACTTCCGTTAATTCCCCACTGCTG TTCCACTGTCGTATTTACATGTTAGATTTCCTCTCCGACCAATCTTTGTGTGCTGGATTCCCTCTCCCACCTCTCTTTTG TGTGAAGACTGCAGGTTAATAACATATCAAAATAATTAAACTGCTAAAAAAAAGAGTTTTTATAAGAACCAAAAACGTAC TGAACCAAGAACCAAAATAAACTATTAAAGATGCACCAACTGAGAAAGTTGTTAATTACTCTACACAGGAGAGACTTTCG TAAATTAGTTGCGTGCTACAAAATCATATCCCACTTAGCTCTTTCACAAAGTTCGTACACAAATTGTCTTTCCAAAACAA GCTAATAGAAGTCACAATACACGAGCTTTAAGAGAACTCTTCCACCAAAATTCTACCACTGATATTCCATGTAAGTGAAA CAAAATATCCAGTACAGTTTGAATTTAGCAGAAATAGACATATAAAGGATATTCCTACTATTCTCTTAATTGAAGCTTTT TTACAAAAACCATAGAGGTTCACTTTCTAGGCATACTTAAAGGGGGCCATTTACGTTCAAACAACTAGCAACCATCGGTA AAAGCAAAATCAAGGAGTTCCCAAAATTTCAAATAACACGAGTAATTACCAACTGAATTTTTCCAACTGTATTTTTTTTT ATCCAAGCTCTACTTGCGGACTTCCCCATCTTGCCCAAGGTTCTGTATTGGTTTTAATAGAAAATCAAAATCAAAATCAA AAGGAAATATAGAGAACTGCAAATTTATAATAAACTTCATAAACTGCATGATAGCAAAACAACTAAAAACCAGATATAGT GAAAGTGAAAACATAAAGGCAAAGATGCTTCAATCTTTATGAGGGAGTAAACTTCAAACAATGTAACATAGGATACAAAA CCCATTTTTCCCCTTTATATTTCACCGCAAAAGGTGAGCATGGTTTAACTCAAAGGTTCTCAAGATAAACCAATCCTCAA GCTAATCAACCATACCATCATCAAGCAAACACATAAACTGAAGCAAACAGTGCAACCCAGTTAATTCTATCATCTAAAGC AAACAATACAATGCAAGGTGCATACAATGTCAACCCCATCATCAAGCATGTTACGGTGGCAAGCAGTGAGCACCTACAAC TAAAACAATACAAAAACATAACATGAAAAAGAAACTCAAGACAAAGCTGGCTGAATGGAAGGGGTGAGAAACAGAGAAAC CCTCAAACTCGTTCTCCGGCAAATGCCACGATTATTGAGACTTGGTAGAAAGGCCCTCGAAGAACACCAACAAACACCCA GCGAGTGGAAGTGTCCCCCGTAGGCTGCAAGCAGAAACTCGCCTGCGACATGGGTCTCATGAACCTCTTACATTGTGTTT GGACGGAGGATTGTAGAAATCCAAGAGATTTTAAATTCTAGGGAATTTAATTGATTCAATTGAATTCCCTTGATTTTCAA ATTCCCTTGTTTGGATAAGGTGATTAAATTCCATCAATTTTAAAATTCTTTGTTTGGGTAATGCTAGGGAATTCAATTGA ATCAATTGAATTTCCTTTATCTTATTTTTTTAATGTAATTAATATTATTTGGATAATTATAATAAAAAAACTTAACTTAA AATTAACCCAGAATTTTATAATCGGCCCAAACCCCCTGAATTGACTCAAAAATCTGAAATTAGTTGGATCACAAATTTCT AATACATTCATGGAGATATCACATTTCCTATTACTTTAAATTTAAAACTGTGTTTTTAACAAGTGCTAACATCAATCCAA ATGAAAATTAAATAAAAGAAAGTCTCAACAGTAACAAGTGCTAACATCAATCCAAATGAAAGTTAAATAAAAAAAAGTCT CAACAGTAACAAGTGCTAACATCAATCCAAATGAAAATTAAATAAAAGAAAGTCTCAACAGTGGCATAGTGGAAAGTTGG AAACACTACAAATGGGTCCATAAACTATAGCAAATCACGAATCAGTGCATAAAAGCTAAGATGTAATCTTTCTTTCTCTC AATGGGAAGAGCTTTCAAAATCTCCAACTTATTTGGATTTTCTGAAAGCCAATCCACTACTTTTAGCCATTGAGTGCCAT TAAGGTCCGGAATGTTCTTTAGCTCATCCATCACATCATGAACCACTTCTTGGACATTTTTCACCCCTTTTCTAGTTGCT TGTACAAATTCACTCAATGACTCAGCCACTTTATTCATTGAAGTAATTATCCCATTCTTTTCTCCACTTTTTCCCTTTTT GAATTCCATTGGTTGTTTGCTTTTCCTTGTTGTAGAGCTTTGTTCATCAGCATCAATATCCACAATATAAGCTCCATCCT CATTTGCTTCTTTGCTCATGATGTCATCTGCATCCAAGGATGTCTCTGCTCCAATTCCCGTTGCTCTATCTTTAGCACAC AAGTCTACAATGTCATCCCAATTAGCAATCACCTTAAATCGGAACCTCTTAGCGTCATTATGTGACTACAAAGAAAATAG ACAGCATATTAATACTAACACAAACAATAATTTAATTAAATAGTAATAACATTAAAAATCACAAACAATAATTTCAAACA AGGGAATTTGAAAATCAAGGGAATTCAATTGAATCAATTAAATTCCCTAGAATTTAAAATCCCTTGGATTTCTACAATCC TCCGTCCAAACACAATGTTTCTGAAAATAAACAGAATATACTTATACAAGACAACATACTAAGCATTTAACTAATAATTG GATGAATCAAGCCACAGTTAGTTCTGATCAATCTTTCAATTAATATTAATAGGATAAAAAACTTGGAAACAAGGCTCTTC CAAGTGAGCCAACACACACAACAGAACAAAGCAACTACAGAAATAAACAAGAAACAACATAAGAAATGGAAAAACAGATA ACAGACACAACAAACAAGGTAGAAAGCAAAGACAACTGATAACATGTTGTCCCTAAACTAAGTTTCTCCTATGTTGATAT TCAACAAACATATCCATTGCTAAAGTGTCCCGAAACGTTGTCCATGCCTCAGATACTTGAATAGTTGTGACCTCATTTGC AACATTACTTGTAATTGTTTCCCCATGTTGACTGGTTAACTCTTCATCAACAACCGATAAAAGCTCCAAGTCTTGGACCT CTAAAATTGGGTCATATTGTTGCTCATCTCTTATAAAATTGTGCAGTACGAAACAAGCGTTAATCATTCTTATTTGTGTT TTTATATCAAAAAAAGATGGAGTTCTTAATATACTTCATCGTTTTTTCAATATCCCAAATGATCTTTCAATTACATTCCT TGCACTTGCACTTGCATGACGGAGATTGAACAACTCCTTGTAGTTTTGAGGGGTGTTTCCAATCCACTCATTGAGATGAT ATCTTGTCCCTCAATAAGGTGCTAAAAATCCCGGGCCATTTGTATATCCTGCGTCGACCAGAAAGTATTTACCTGCGATG GTTTTTTTCCAAGAAAACAAAAATCATATAATTGTATTTAATATAGTAAAAAAAGTATCAAGGTTGAGAATATTACCATT CGGAATTTGAAGGTGATTTTGACGACGTAAAGCATCTCGCAATACTCGTGAATCTCCTGCCGAGCCTTCCCAACCAGGTA ACACGTAAATAAACTTTAAATCTGGACCACAAACCCCTAACACATTCGTAGAGATGTCACCCTTTCTATTACGGTATCTA GGTTTATCTTCTGCTGCCACTGTTACTGGAATATGTGTCCCATCAAGTGCTCCAATCGAATTCTAAAAAAGTTTAAAAAT CATAAATAAGTTGTAATTACTAGAAATCTCATATAATTACTCAAGCTTGTGATAAGTTTACCTGAAACCATCTCCATTTG TATGCCTCAGAGCCCTCTAGATTATTATGGTCTTGAAACTTCAAATATTCCCCACTCACTTTCATCACAGCTCGTAGGAC ATTGTTGAATTGCCTACTTATTGTTTCTTTGGATCTATAATAGGTAAAGTGCACTACTCTGTACTTTAGGTTGTGAGCAA GGATGTGCAAAAACATTGCCACTGCTTCAATCGTTGGGACATTTCTTGTTCTTACCAACTGTCCTTTATCTTGTAAAATT CCACAAAGTTTAAAAAATGCCCTTTTACTGACTCTTAATTGTTCAATGCAATCACTTTCAGTTCCTCTATATAGACGATT AAGGAAATTGCGTCTTTCCAATTCCCAATTTCGGGACGGTTCCTTAACAAAATGCATCTCATGATACCAAGCTACTACAC CTAAAAGCATAGCAACGACACTAGCAACAATGAATGTTATTTGCTCCTGCAATTTTGCCTCTTCTTCTTCATTTCTTTTA CGTTTTCGTAAAAGAACTGAAGTGTCAACTACTCTAAGATCCATTTGTTAACTATAAAAAAAACATATAATAAAACATCA ATATCGCATGACACTATAAAGAAAATAGGAAGTAAGAGAAGCTAACTCAATCAGATTCAGAATCAGCTAGTTTAAACATA AAATGGATAAGATGTGATTAAAAAGGACAAGGGATGTGTACAAGCTCACTAAGAAAATGTGAAGAGTTAAGTTAAAACAT TCTCTAAATAATAGCGTGGAGCTTAAGAAATATGCTTAAAAATGACAACTGAATGAATTGGTATGGAACAAACTCCAATA AAAATATAACCAATGCATAATCAATTAAATCAACAGAAGTTAAGTATACTGTTGTAATAAAAGACAATAGGCAAAGAGAT TTTTTCAGCACAAAAATAAAATATAGATACCCCTGTGTAGCAAATTATTGACCTTCAGAAAAATAGATTGCAAGCACAGT CCATAAAAAACACTCATTATGGTTTGCTCATCTTTCAAACAAACATGCTTCTAGGACTCAGAAACCTTCAACATCATTTA TAAAGTGAAGTGCTCAATATTTAGGCTCAGCATAAGATGTTTACCAAATCTATTTCTCTTTCATTAAATCAAATTTAAAA AATGTAATGATTATGATACAGACCTACCAGAAGATGCCAACAATATTTTTAAAAGAGAAAGAGAAAGCAACAAGTCCCTT ATAGTTCATATTAGTTGCAGTAACTAAGAATATTATTTATCTGTTATGAAAATATATTAGACAAACCAGCAGTATGTAGA AACTGTAAAAAAACACTGCAAGTCAGCGTGAAGACAAATATGATTATTTAGGAAGTGACTGAGGACTGTAGTTATATTCC GAACATGCCTAATTGCCTATTTCAATGGTATGACAAGAAGCTGCAACATAATTTTGGTAGTCATCCTTAGAAGATATAGT GAAGTTTTCAATAACTAAAATATGCAGACAGAAGAAATGCTAAATATTGAGAATTCATACCATTGATGTCATCCAGAGAG ACAAATGATGGGTGTAATTGCACAACAGCTTGGATTAGTCTGGATTTCGCAAGTTCAACCACAACCTTAGCTGAAGGAAA GAAGAGAAAGACTACACTCTGTGAGTTTGATTGCTTAGTTGTGTTCATAATTTCAAACCAAACCAGAAACTACACCTAAG AGAAGCTGAAAGTGCTATATAGTATATCAATATGCAAACAAGAGGAGGGGAAAATTTAAGCATATTTCTTAAACATTTTT AGAGCACTCCTCCTACTTTTGTTCTATGCTTGAGGAATGCAATGCACCTTATTATATATATCTATCATGCTATTGCTACT TGCTATAAAATTACTCTTTCATCAAACTCCTTCTCTGCGTATTGGGTTTTTGTCCCTTTGTTTATCCCCAAAACCATCCT AATCTAGAAATACACCTACAAAAGCAGACCATCACCATGGAAGCAGATCCAGTTTGAGCAATTCTTATGTAACTCTAATT ATTGTTTTGGTAAAAAAATAGAAACTATTGTCTTCCTCACCTATGTTCATCTGCTTCTGAACCAGGCACAAAATGGGGAA AAAACATGACAAACCCAGTACACCTATGTTCATCTGCTTCTGAACCAGGCACAAAATGGAGCAAAAAACATGACAAACCC AGTACACCTATGTTCACACCTATGTTCATCTGCTTCTGAACCAGGCACAAAATGGAGCAAAAAACATGACAAACCCAGTA CTGGCATCAACAAACAAAACTCAAGACAAGAACAAAACAGATATTTCAACTCCAAAAACAAAATCAAATTCGAAAAAACA ACAACAATAATGCAAAATTGGTGAAAGAATCAAGAGATTGTACCTGAATCAAGGGGGAAGAAACTCCATGAATCGGGAGA GCAAGAACGAGAGAGCGAGATGGCAGAGAGAGTGAGATCGGGAGAGCGAGATTGCAGAGAGGGTGAGATCGGGATTTGCA GAGAACGAGATTGCAGAGAACGAGATCGCGAGCGAGAGCAAGAGAGCGAGAGTGAGATCGGGAGCGAGAGCGAGAGCGAG ATCGGGTGGATTTTCCAATTACTTCCTATTCTGAGGGTATTCTGATTACCCCATAATCCCTTAATTAAATTACCTCTTTT AATTACCAGTATTTTCAGAATTCCACAAATAAATATCCAAACAAGGTATTTCAATTTAAGGGATTTAAAATACCCTCTAG AATTACATTCCCCCCAAAAATCACCCCATCCAAACACAACCTTAGGGTCATGCTCGCAAACACAATTGGAGCCATCAACG ACATCACAGAGTTTGTCGTAGCCGAACGGCATATTCCCGGTGCCGGCGAATAGGGCGAGGGCGTCGCGATTGGGAGGGTG AAAGCAGTTAGGTTGTAGAATTGGGGCGTTGGAAAGAATGGATGCACAGCGGCGGCGGTCGTGAATGAACAACGGCGAGG TGGAGGTGATGATTGAAATAAACACAACAGGGAGAGATTAGGGTTTACATGGAAAAGTTTTCAAAATGTAATTTTGATTT GATTTTCAGTTATAATTTAATTGTTTTACAGTAAATACTTAATTACCTAATGACAATTACATGAAAGTATAGGGACTGAA ATTGGGATTTTAGAAAACTTGTTGGTTTGACTCATGGCACACGCTTAAACGGATTTCTATTGGGCCACGTAGCAGTGGCA TCACTGCCTCCTCTTTTAGGGTGGCATCTTATAATTCGCCTTTGTTTATATGTTAGTGATTATATATCTTATCAAAGATG TGTATTATCTATACTAATTAAAAATTTAGTGTTGTCTGTTATAGTTGTGCCTGTAGAAATGCATACTTATTTCATTAATA CTGGATTAGAAAGTGCACATTAGCTGGATTTGGAATTAGATTCTTTAGTGCATGTTTAGTTTTGAGTATCTTGAAAATCA TTGTTTTGTATAACACTAAGTTATAGCCTTTGCCAAAGCTATGTGTTTGGAAGATCTTCAATACAAAATCAAACACATTA TAAGTCATCTACAAATCATGTGTTAATATCTATTATAGCCTGCAAATTATTATGTATGTCTTCTGCTCTTGTCATGCTTG TCATGAAAATTTGAAATATAGGGAGCCATGTTGTTTGGGAAGCGATTGGAAGTTAACTTCTCGAAGCATGCAAACATAAC CCAAGGTGATGATACACATGAGTATGTGAATTCAAATCTCAACCGATTCAATCGCAATGCTGCTAAAAACTATCGGTACT GCTGCTCACCGACAAAGATGATCCACTTGTCCACCCTCCCGCAAGACATTGCCGAAGAAGAGATTGTTAGCCTTTTGGAG GAGCATGGAACCATTGTCAACAGCAAGTTATTTGAGATGAATGGTAAAAAGCAGGCTCTTGTTCAGTTTGAGACTGAGGA GCAAGCTACTGAGGCCCTTGTGTGCAAGCATGCAAGCCCCCTTTCTGGCTCGATAGTCCGCATCTCCTTTTCCCAGTTGC AGAATATATGA
CDS sequence (LotjaGi2g1v0128600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCTGTATCCTATAACAGTGGATGTACTACATCAAGTGTTTTCTCCCAATGGATATGTGGAAAAGATTGTAACGTTTCA GAAGTCAGCTGGCTTTCAGGCTCTCATCCAATTTCAATCCTGTCAAAGTGCTATTACTGCCAGAAGTACACTTCAGGGAC GCAATATTTATGATGGTTGCTGTCAGCTGGACATTCAATTCTCAAACCTTGATGAGTTACAAGTGAACTTCAATAATGAT CGGTCAAGGGACTTCACAAACCCAAATCTGCCTACAGAGCAGAAAGGCCGATCTTCACAACCTGGATATGGTGATGCAGG AGGCATGTACGGGGCTGGACCCAGGGGAGTTGGATTCTCACAGATGACAAATGCTGCTGCAATTGCAACTGCCTTTGGAG GAGGTTTGCCTCCTGGAATAACTGGAACAAATGACAGATGCAGAGTTCTTGTGGCAAATCTCAACCCTGATAGAATTGAC GAGGACAAACTGTTCAACTTGTTCTCCATTTATGGGAACATTGTCAGAATTAAACTTCTCCGAAATAAACCAGATCATGC ACTTGTCCAGATGGGGGATGGTTTCCAAGCTGAGTTGGCAGTACACTTGGGACAAGGAGCCATGTTGTTTGGGAAGCGAT TGGAAGTTAACTTCTCGAAGCATGCAAACATAACCCAAGGTGATGATACACATGAGTATGTGAATTCAAATCTCAACCGA TTCAATCGCAATGCTGCTAAAAACTATCGGTACTGCTGCTCACCGACAAAGATGATCCACTTGTCCACCCTCCCGCAAGA CATTGCCGAAGAAGAGATTGTTAGCCTTTTGGAGGAGCATGGAACCATTGTCAACAGCAAGTTATTTGAGATGAATGGTA AAAAGCAGGCTCTTGTTCAGTTTGAGACTGAGGAGCAAGCTACTGAGGCCCTTGTGTGCAAGCATGCAAGCCCCCTTTCT GGCTCGATAGTCCGCATCTCCTTTTCCCAGTTGCAGAATATATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0128600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLYPITVDVLHQVFSPNGYVEKIVTFQKSAGFQALIQFQSCQSAITARSTLQGRNIYDGCCQLDIQFSNLDELQVNFNND RSRDFTNPNLPTEQKGRSSQPGYGDAGGMYGAGPRGVGFSQMTNAAAIATAFGGGLPPGITGTNDRCRVLVANLNPDRID EDKLFNLFSIYGNIVRIKLLRNKPDHALVQMGDGFQAELAVHLGQGAMLFGKRLEVNFSKHANITQGDDTHEYVNSNLNR FNRNAAKNYRYCCSPTKMIHLSTLPQDIAEEEIVSLLEEHGTIVNSKLFEMNGKKQALVQFETEEQATEALVCKHASPLS GSIVRISFSQLQNI
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 334 | 334 | 7.4E-156 | – | |
| PANTHER | 1 | 334 | 334 | 7.4E-156 | – | |
| Gene3D | 1 | 95 | 95 | 7.9E-30 | ||
| Pfam | 2 | 68 | 67 | 1.6E-17 | ||
| SUPERFAMILY | 3 | 91 | 89 | 3.76E-15 | ||
| MobiDBLite | 80 | 107 | 28 | - | – | |
| MobiDBLite | 80 | 99 | 20 | - | – | |
| Pfam | 134 | 230 | 97 | 2.5E-29 | – | |
| Gene3D | 141 | 239 | 99 | 2.3E-23 | ||
| SUPERFAMILY | 145 | 330 | 186 | 9.61E-20 | ||
| ProSiteProfiles | 147 | 221 | 75 | 12.151 | ||
| SMART | 148 | 217 | 70 | 4.5E-12 | ||
| Gene3D | 241 | 334 | 94 | 2.8E-14 | ||
| CDD | 250 | 328 | 79 | 6.28149E-46 | – | |
| ProSiteProfiles | 257 | 331 | 75 | 11.281 | ||
| SMART | 258 | 327 | 70 | 6.4E-7 | ||
| Pfam | 262 | 321 | 60 | 5.3E-8 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleic acid binding | Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0128600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…