Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0128600 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0128600.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Polypyrimidine tract-binding-like protein; TAIR: AT1G43190.1 polypyrimidine tract-binding protein 3; Swiss-Prot: sp|Q6ICX4|PTBP3_ARATH Polypyrimidine tract-binding protein homolog 3; TrEMBL-Plants: tr|I1JDD2|I1JDD2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0128600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:47080030..47099400) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CATGAAGCGAGGCCTCAATGGAGATCTCTTTGGTAGCTGGGCCTTCAATTCCCCACAGGAGCTTCAAAGAGCTTTAAATC ATGATAAATTCGTCCAGCAACCTTGATTGTAGGGGTACTTATATTTATTGCGTTTTATTATTAGGAAACCGCCCCACACT CCAAGGCTCTGACAAGCTTCACGTGCTTTCGGTGTTTTTTTCTTCCTAGCTTAGTCAGTGCTTGTGTTGTCTTGTCCTAG GCTTGGTTTTTTTCTCCCATAGCTTTAATATTGATGAGTAGGGCCATATGTCTTCTGTTTTTGACCTTGACCGGTCTATC TTTCCCTGCAGTGTCATCAATTGTACTTTCTGGCCTCTGGCCTTCATGAATGAAATTGCATTCTCTCTCTGCGCGTCCCT CACTTGCTCTCTTCAGCCAGGTTCTCTCTTTCTCTCTTCATATCTGCTTCTCAGTGTTAGCATCTCATTGGCAATTGTTT TTTCACCTCTTTGTTTGAGAACGCCCCACGATTTATCTCGAATGCTGATATATTGTGAACTGGGTTTTGTAAAGAAATTG GAATGGGTGCATATTGTATAGCTATCCTTTTTTGTATTAATTTTTTTAGGGTTGTTGTTGAGTTTCAGAGTGAGCATTTT CATGCATATGCCTAAACGTGACTAGGGAACTGTTGGAGTTTGATCATTGAAGCTACCCTATATGTTGACTATTGAGTGTT TTGTGTTCTGTTGCTATAGGTAATTTGCGATGGCTGAACCTTCTAAGGTCATTCACGTTCGAAATGTGGGGCATGAGATA TCTGAAGTAAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGCTTTGCTCTATGATCATGTCGTTTATACTTGTTATTTGAT TTTGCAATAAGATGCTGCCATGGCTTTACCTTTTTACCATCGGCTTGTATGCATTTTCTCTAGCTCTGTTATGACTAGAA TGGTGATTTTTGTGATATTTAATTATTCACTCTTGTCGGGGAAAGTAGCTGTTCTGGACTTATGGAATCAGTTCTGTATT TCGTATTTCTTATATTGATTGTAACTGTTTTTGTAGCTCTAATGTGGATCCCTAAATATCAGTGTTGTAAAGTATAGGCT ATGGCGGAATCCCAGCAAGCCGCCATGGCGCATATATCGTCATAATCAGCCATCATTATTTGTCAATCATGGCGCGTTTA TGGTTTTCCGCCATCCGCCTTTAGCAACACTGTAAATGTGGACTTTTCATCACCACCCCCCGTTTCTGAATTTGCCTTAC CTCCCTTCGAACTGTAAACTGAGACACATCCCAGTTGGCAGTGCTGTTTGTTGTGGAAACACTGGTCTAAGCCATCGTTG AGTAATCCAAGGGAAAAGGGGAAGGGGAGAGGCTATGCCATAAGGAATAGTGGAAAGGGTGGAGAAGAATGTAAGGGGAA GAGGGAGAGATCTGTGATACCTAAAGAAGGGAAATTAAGGGGGGAGGTTTTATGAGATAGTAGGAGAGAAAACATCTAAA AATGTTTGGTTAGTATAGGAAGATGCAGTTTTTAGTTTCTCGGCCTATTGGGAGAAGAAAGATAAATTGCCAGTAAATGT GAACATGTAATTAATATATAAAAAGGTATATCTTGTGCAGTTTTTAAAAATAATTTATCTTAAAGTGTACTGATTAATAT TATAAAATATATTACAAACTTAAATACGGTAGAAACAAGTAAACCCCACTTACCCTAGCTTTGGCTCGGTAACGTACCAC ATGTCTCCACCTGTCAGGGGCAGAGCTTCTCCATGACTAGGCTACCCCCAATTTTTTGAAAAAATTTACATACACCGCAC ACATTATTATAACTAATCTATTTAAATATTTATCTTGTATTTATCTTGTAGTTAAAGTCATTGTGAAACATTGCTTAATC CACTTTACAGTTACATTCCTACTTTGATATGTTAATTGTCTCCCCTTAATAGCACCATTTTTCTTGTTAATTAATGATAT CATCAATTAACTACTAGTCTATAGTTATCTTGTTTAATTGTTTTTTTGTTAACTTATTTCCTTTTCACATATACTAAGAC TACAAAAATGATAAATATTGAACACAATGTATAAGAATTTAAGTATCATAGTCCAAATGAAGCAGGTATCAACAATTACT GCACATGTGCAAATCACTTCTATCTCTCATAATAAGAAAAATCCATGAAGGATGGAAAAACATGATAGAGGATGGGTAAT TTTGTGAAGCAATGAAAGAAAACTTGCAAAAAATAAAGCTTTCATGGAATTCTACAGCATTAGAAAATCTAACTAAGAGA TCTTAATGGGGTGCTTGCTTAAGTCAAAGAAGACATTGGCTGAACACCAAAGATGAGCTGGATCGGCTTTCCTGTTCCGA CTTTAAGTTGAGTTTTTATCTTCAATGGTTTATGAGTTGTAGTTATCTGGTTGCAGAATGATTTGCTTCAGCTATTTCAG CCTTTTGGAGTCATAACAAAGCTTGTAATGTTGCGTGCCAAAAATCAGGTTTTCTTCATGCCTTCATGCGAAACATTGCG TTCCTAATATTCTTAGAATTTGAGAATGAATCATTTTATCATTTATTTCCTGTACACTCTGTCATCCTTGCAGGCACTTC TCCAAATGCAAGATGTTCCTTCCGCAGTTAGTGCTTTACAATTTTATGCAAATGTTCAGCCAAGCATAAGGTATATATAT TGTATATTTTTCTTTTAAATCCGTATGTGAGTCCCTTGAATGTACTGTTTCTGAAACTTGATCCCGTCATATTTTTGAAA TTTGGAAAGCACTATTCATTCCTATTGATGTTAAGAAATCACCATTGTTTACATAATCATCATTTTGTTTTGCTATAGGG GGAGAAATGTTTATGTCCAGTTTTCCTCACATCAAGAACTAACTACAATGGATCAGACTCAAGCACGAGAAGATGAGGTT GGCATTTTTTGTTTTTTAGTTGAAAAATATATACCTGAACTCCGTTGGTTATGTTTTTGCCGTATATTATCTTAGACTTT TCAATATGATGAGTTTAATTAAAATGTTAGGTTTTGTAGTCTTCTCTTACTCTTTATCATGAGCTTCTCTATTGGTCTAT TTATTCTCCGCTCTCTCTCTCTTCTCCTTCTAATGCTGTCTACTGTTGGCAACTCTCTGGATGCATAGCCAAATCGAATT CTCTTGGTTACAGTTCATCACATGCTGTATCCTATAACAGTGGATGTACTACATCAAGTGTTTTCTCCCAATGGATATGT GGAAAAGATTGTAACGTTTCAGAAGTCAGCTGGTCAGATTCTCTCAAATTTCTTCCTTTCTCTTTCTTTCTTTTTCCTAT GAAGCGTTTTTTGTCTTGAGGCTATATGGGATGAATTGCGGACATATTTGGTTCATGCAAATATTTACTTTGAAATATAT CAATTTTTTATATAAATAGGAAATGATAGAAAAAGTTTCTTTGGTTTTAATGGAATTATATTTCTGGTTTTTCTAATGAG TCATGGAATGGATGCTTTTATTCAACGCAATATACATATGCCCTGTAATTAGATATGAGGAGTGAGGACTGTCACTGCAT TTATTGTTGCGGATGAAGATTATCTTTATATTTGGTTTTTGCATGTTTTGTGTATGTGTTCTACTATTTGTTTCATTCTG TGTTTGAAATGTTGTGTAGGCTTTCAGGCTCTCATCCAATTTCAATCCTGTCAAAGTGCTATTACTGCCAGAAGTACACT TCAGGTTTTTAACATTCACATTGAGCTTGGTGCTCTCCTTGGGTTGTTAATTATGATATCTTTCTTCTGAATGATTAATG TACTTCTGGCAATTTCTAGGGACGCAATATTTATGATGGTTGCTGTCAGCTGGACATTCAATTCTCAAAGTAGGTTAAAT TTATCACAGCAATTTCATGTATATTGGTTTCAGGGTTTAGAAAATTATGCTATGGTCCTGTTTCCCTTACTTTGTTGGCC ATTAAATTGTTGTTTATTGCAGCCTTGATGAGTTACAAGTGAACTTCAATAATGATCGGTCAAGGTGATTTAGTCAGTTC TTTTGTTTTGTTTTTTGCTTTTTTCAAACAAATTGTACTTCCTAATCTCTTATTTAACATTGTATTTATTGTTACCGAGT TTATTCCTCATTTCGACAGGGACTTCACAAACCCAAATCTGCCTACAGAGCAGAAAGGCCGATCTTCACAAGTATGTTCT GCGATATTCTTTTCTTTATTTTCTTGTTGATCTTTGTTAAGTTCATTCTAACATTTTTTCCTACATGTTCTGGTAAATAG CCTGGATATGGTGATGCAGGAGGCATGTACGGGGCTGGACCCAGGGGAGGTGCTAAATATTTTAAATTGCTTTGGTTGGT TTGCTTTCATTTTCTTCTTATGCTATTTTCAAAAGTACTAATATTTATCTTTTTTTTTTTACAGTTGGATTCTCACAGGT AGGTGGTACTTTCAGACCAAGTTGAAGGTCTCATTTGCGACTATTGATGCACAGTTGAATATTTAAGCAAGTTATTATCA GGTTGCATCTTATGAAAAGTAGCATTAGAAATGTGTTATTGATGCACAGTTGAATAGGTTGGAAGTTATTATCAATTTGC ATCTCATGAAAACTAGCATCAGAAATGTATGACGGTTGATGTCTCTTAAAAAAAGGGGCAACTTGGTGATTGAAAGATCC CGCCTCGCTGGGCACAGCGCCATTATGCATCTATTGCTAGCAATCTTTGACCTTCATTTACCCATAGATATATTAATAAT TAATAAATCTGAATATGCTAAAGAACTTGTTTGCCCGAGTGTGACAACTAATTTGGAATTTGGAGTTTGAGTTTATTGAA TTTGGTTGTAAGTTGACTGTAGACATGTATGTAAATAAACTTTGAAAAATATATACTTAATGCATGTTTGGTTTAGCATA ATTTTGGATTTTTTTTTTCAAAACCTCTTTTTGATTATTAGTTGTTTGGAATACAATAACCCTCCACATATGTATTTTGG TTTTGAATTATAGATGACAAATGCTGCTGCAATTGCAACTGCCTTTGGAGGAGGTTTGCCTCCTGGAATAACTGGAACAA ATGACAGATGCAGAGTTCTTGTGGCAAATCTCAACCCTGATGTAAGTACATTGTCTTTAAGGGAGGTTTGCCTCTTTGGC TTTTTTTTTTTTCCTAAACATTTCTTTCATATTTGACTTGAAATTCGTTTATTTCAGAGAATTGACGAGGACAAACTGTT CAACTTGTTCTCCATTTATGGGAACATTGTCAGAATTAAACTTCTCCGAAATAAACCAGATCATGCACTTGTCCAGATGG GGGATGGTTTCCAAGCTGAGTTGGCAGTACACTTGATAAGAACCTTTGGAGAACCACACCACAAAAGCTAGCTGTTGTAG TTGGAGAGCCCAATGCCTTATAAACCCCACATTAGAATCCCATACTTCCAATGTGGGACTCAAGTCCCATACCTTGGCAA TGGGGTCCTAACAACACTTTTTGAAGGTTTGTTTTGTTTATGGCGAACACTTAGGGGCCACACCCGTTTTAGGAGGCAGC AATGCCACCCGTATGTGGCACCATAGGAAACTGACCTGTGTCATCTCATGCCTTGTCAGCGTTTGACCAGGGAAGATTTT CACTTCTCACACTTTAGTCCCTGTACTTTGCTTTATTTATAAAATTGTATTTAATTATTTATCGAAAATAATTATGAAAT TCTAATAAACGTAAAATCAATCTGAAATACATCTTTTCTTTGTCCTTCGTCTTCTTCCTTCATCCACCGCACCCAACCGG TGGTGGTTCCAACACGGTCCTCAACCACAAATCTATTCTAAACCCTAACTCGTCATGCATCTTCTGTTTTGATAAAATCC TTTTTTTCTCTTTTTACATTCAGATTTAATTTATAATGGGTTCTTGTACATAAACCCTAACACACACAACAATCTTCAGC AATGGCCGAGGAAGATAGCTACAACCTCTCTTCTTCCTCACAAGACGAAATCTCCCTTTTCCTCCGTCAGATTCTTCTCT GTTCATCCTCTTCTTCCAACCCCAATATGCCTCCATCCTCCAACTCACCCCTTCATTCCACCGCCGGAGCCTTTCTCTCC GCTCCGCCTCACCCACTGCTTGCTGCAAATGTGTCCTCCTCCTCTCTAGGTATCAGTGAGAACGAGGCTGATGAATATGA CTGTGAAAGTGAGGTATTGCTTCCTTCTCTTCAAACTTTCCTTTCCCTTTCCTCTGCATCTTTGTGAAACTGGTGGCCTA AAAAATTGTTACTTGGATTCTGGGTATGTTACTGGTTGGGATCTTTGTGAAATTGGTGCTAAGAAGGGAGGATTTTGTTG CTTTTTTTTTGGGATTTGATTTTAAGTGAAAAACTATGTTCATTTTTTAGGTACATTTGTTTGATGATTTCTCTGAATGA AGGAGGGCATTGAAGCATTGGGTGAAGAGGTTAGGACAAAGTCTGTTCCTTCTTCTAGGAGCTCATCTAAAAGGACTAGA GCAGCAGAGGTTCTTAATTTGTCTGGAAAGGTTTGTGATTTTTTTGTTGATGGCTATTTGTTGACTTGTGTTTGGTTTTA CACATGCTGATGTGATTTTCCTTGTGTGCCTGGGCTTGTTTGGCAGAGGAGAAGGAGCAGGATCAATGAGAATATGAAGG CTTTGCAAAATCTAATTCCAAACTCTAACAAGGTACATGAGTTTCTTCAACCTTGGTGAGAATGGGTGTGTTTTGTGATT CATAGTTAGTCTTATTGTGGTGTGTTGTGTTTTTGTGTGGCAGACTGATAAGGCTTTCATGCTTGATGAAGCTATTGATT ACCTTAAACAGCTTCAGCTCCAAGTACAGGTCTGGATTTCTTTTCTATGCTACATTTTTGTCCTGTTTGGGGGAGGCTGT GAGATTCATTTTCTCCTGTTCATCCCAAATTAAATTGAAATCTCCATGAAGTTCCTAGTTCATGAGTTTTGATGTTCTGA CTTGTATCCTTCTTGTCTCCTATTATTTTTCTGTGAGCAGTGTATGTATGGGAAACTGAACAATATAGGAAAATTTGAGA AAAAGCCTTTTTGGAACTGTTTGTCTTCAGGCAAAACATAACTGATATTCTTTTTTTTTTTGTATAATCTGCTACCATTT ATGCTGAAGCCTGTAGCACAATAATCAATGTCGATTCTGCTCATAGCTGCAAGTTTTAGTTTCCAAAGCATTACAAACAT TTGAAGTGCCATTGTTTATCTTTGCTGATTTACATACCCAGATAATTCTCTAGTAGTTTCTTTTTATTGCTATTTGCTTA TATATGTAAGCCTCAAGTGCTGTTGGAATTGACTTCTATGTTGAATTTTGATGAAGATATCTTGAATGAACTATAAGTAG CAACGGACATGGAAAGTTTGTGCGATAAAAACCATGTGTGAAGATTAATTTTTGTTACTCAAAGTAAAAGGAAACCTTCA CTGAAGGTAGCACTACAACTAATTAGTTCTCTTTTAAAGAATTAACCTAAATCTTGTGATAAATATTTCAGATGCTGTCA TTGAGAAATGGATTGAGTTTGCATCCTATTTGCCTCAAGTTCTTATATAAATTCGATGGAAAGTACTTAAAAGATGTTTT GGAAAGGAATATACGTATTTAGTATTTACATTATCTTTTCTCGTCATATGAGTTCATTGCTATGGGATTTTCATCCGCAT TTGCTTTCAATTGTTTGTCTGCATCTGGGCTTCAACATTGATCATTGTTGTGCTTGTGTGTTGAATTTATATGGAAATTA TTAAGGCTTTAAACCTGGAATATGATGAATATTTTAAAATATTAGAAGTGAAGATATGATTAGTCATGACTCACGTATTT AGGAACACTAACTTTATTTTTCTGGACTAGTGCTAATAAGTATGCTTAATTTATGCCAGTCTAAATGATTTTATCATAAC CCTAATGGCAGGTCTACTCTCTAGTTAACACATTGTGTATTTTTGTGTGTTTGAGTGATAGAAGCTCATATCTATAGTTG GAATCTCATTGAAAGTTATGTAATCAAAATCCTATATCTGTTACTCCACAACTAAAATAAACCACGCATCCATGTAAAAA ATGACCATTCAAACATTTATGTACTCATGATAATGTCAACACAAACAACTCATAAACACAATACACATAACACACATAGC ATATATATATAGATAATGTCAACACAAACGACTCATGATAACAACATAGTACAAATGACATCACAATCATAAAATTAATA GTAATTAGAGTAAAATCATCAAACTGTAATAGTACAATCCTTCACCTTCTTCTCATGCTCTCGGGTCTTGCTGGGTCTAC AATTGCTTGTCCCTGCAAATATGGTACAAATAAAACAATGACATGTATAATATAATATATTTACAAAAGCATATAAAACC TGCAGAATTAACAATAATAAAATAAAAAGTATAGTCCATAATGCAGAATGATAGAATCATACAAAAAAGATCTGGCATAT TCAAGCCGCCGGCCATGGTCTTTCACAGAGAGAAAGCTTCTCATTTCTTTGTTGGTAAGGACACCAATGACCTGAGATAC ACGGAGACTAGACATCCCGATCTCCATCAAAGTATCCCGACAAGCTCTTTGAAGGTTTAAACTCACCTTACCACGGGCAT GACCAGAACTTCTACTATTGTCAATTTCACTGCTACTGATTTCATGGGCGAATATGAGAATAACCAGGCCATGGTCCAAC AATCGCCTTATTAGATCATGCTGAGGCCATTCCTCAACGTTGCCCCTAGCGTTTCTAGCCTGTAAGAATAAAACAAAAAA TACTATATCACCTCTAGAATGTACTAAAAGTAAAGAAATAGAAACCGACATTCACAAGTCGGTGGAACAAAGCCTATAAA TAGGCATGTAATTCAAAATTTAGAAGTGTGGAGAACACTAATCACCTCTCCACAATGTACTACTAGCTAGCCTTGTATAC CATTGGAACTATACGTTTCCAACCAGTGCTACACTTTTCAAGTGTTTATAAACATTTTCTATATATTTTAAATTCTAACA AATTTCAATCTCAAATGTTTCAGTCGGTTCCCCAAGGCTTGACAAGTTTTCCCTTCATTTCGATGAATGTCATCGTTGAA GAGTGTGACCATTACTTCCCAGACCCCTATGTTTTTCAATGGGTCAGACTCTCTCATTTCTATTCCTCGGAACTCTCTAT CTTCTTTTTGGCCTTAAGTGCCAGCTTCAAGAGTTTATTGTCCAATCTATCGTTCTATCCTTGTTGTCTGATTGTGCTCG GAAACCCATTCTGCAAATGATCATGTAGTAAGTTAGATTTTATTCACATAAATATTACAAATTTTCTAAAAATAAGATAT TAACCCTACCAGATTGTGATTCATTCTTTGAAATATTGGAATGGAGTAAGGGAAGAAGAGTGAGGAGGTGATGTGGGCTA AGAGAGTGAGTGAGGCGGGTGTTAGTGTGTGAGGTAGTTAGAGTGAAACAGAGAGTGAGTATGTGTTTGTTTGGATTAAA TGGTTTTAGTAATAAGAAGAGGTTTTTAGATTCACAACCGTAGGGTGCTTATGTATTCTAAGGATAGTAATAAAGAGAAT AACCAGAACTTCTACTATTGTCAATTTCACTGCTACTGATTTCATGGGCGAATATGAGAATAACCAGGCCATGGTCCAAC AATCGCCTTATTAGATCATGCTGAGGCCATTCCTCAACGTTGCCCCTAGCGTTTCTAGCCTGTAAGAATAAAACAAAAAA TACTATATCACCTCTAGAATGTACTAAAAGTAAAGAAATAGAAACCGACATTCACAAGTCGGTGGAACAAAGCCTATAAA TAGGCATGTAATTCAAAATTTAGAGGTGTGGAGAACACTAATCACCTCTCCACAATGTACTACTAGCTAGCCTTGTATAC CATTGGAACTATACGTTTCCAACCGAGAGTGTTAGTGTGTGAGGTAGTTAGAGTGAAACAGAGAGTGAGTATGTGTTTGT TTGGATTAAATGGTTTTAGTAATAAGAAGAGGTTTTTAGATTCACAACCGTAGGGTGCTTATGTATTCTAAGGATAGTAA TAAAGATTATTAAAAAGTGACTTCCCAAGTGTACCTTATCGAAGGTACACTTGGAAGTCACTTTTTAATAATCTTTATTA CTATCCTTAGAATACATAAACACCCTACGGTTGTGAATCTAAAAACCTCTTCTTATCACCAAAATCATTCATTCCAAACA AACACATACTCACTCTCTGTCTCACTATCTCTCACTACATCACACACTCTTTGTCTCACTCTCTCACTACCTCACACACT AACACCCGCCTCACTCACTCTCTTAACCCACATCACCGCCTCACTCTTCTTCCCTTACTCCATTCCAATATTTCAAAGAA TGAATCACAATCTGGTAGGGTTAATATCTTATTTTTGGAAAATTTGTAATATTTATGTGAATAAAATCTAACTTACTACA TGATCATTTGCAGAATGGGTTTCCGAGTACAATCAGACAACAAGGATGGAACGATAGATTGGACAATAAACTCTTGAAGC TGGCACTTAGGGCCAAAAAGAAGATAGGAGAGTTCCGTGGAATAGAAATGAGAGAGTCTGACCCATTGAAAAACATAGGG GTCTGGGAAGTAATGGTCACACTCTTCAACGATGACATTCATCGAAATGAAGGGAAAACTTGTCAAGCCTTGGGGAACCG ACTGAAACATTTGAGATTGAAATTTGTTAGAATTTAAAATATATAGAAAATGTTTATAAACACTTGAAAAGTGTAGCACT GGTTGGAAACGTATAGTTCCAATGGTATACAAGGCTAGCTAGTAGTACATTGTGGAGAGGTGATTAGTGTTCTCCACACC TCTAAATTTTGAATTACATGCCTATTTATAGGCTTTGTTCCACCGACTTGTGAATGTCGGTTTTTATTTCATTAATTTTA GTACATTCTAGAGGTGATATAGTATTTTTTGTTTTATTCTTACAGGCTAGAAACGCTAGGGGCAATGTTGAGGAATGGCC TCAGCATGATCTAATAAGGCGATTGTTGGACCATGGCCTGGTTATTCCCATATTCGCCCATGAAATCAGTAGCAGTGAAA TTGACAATAGTAGAAGTTCTGGTCATGCCCGTGGTAAGGTGAGTTTAAACCTTCAAAGAGCTTGTCGGGATACTTTGATG GAGATCGGGATGTCTAGTTTCCGTGTATCTCAGGTCATTGGTGTCCTTACCAACAAAGAAATGAGAAGCTTTCTCTCTGT GAAAGACCATGGCCGGCGGCTTGAATATGCCAGATCTTTTTTGTATGATTTTATCATTCTGCATTATGGACTATACTTTT TATTTTATTATTGTTAATTCTGCAGGTTTTATATGCTTTTGTAAATATATTATATTATACATGTCATTGTTTTATTTGTA CCATATTTGCAGGGACAAGCAATTGTAGACCCAGCAAGACCCGAGAGCATGAGAAGAAGGTGAAGGATTGTACTATTACA GTTTGATGATTTTACTTTAATTACTATTATTTTTATGATTGTGATGTCATTTGTACTATGTTGTTATCATGAGTCGTTTG TGTTGACATTATCTATATATATGCTATGTGTATTGTGTTTATGAGTTGTTTGTGTTGACATTATCCTGAGTACATAAATG TTTGAATGGTCATTTTTTACATGGATGCGTGGTTTATTTTAGTTGTGGAGTAACAGATATAGGATTTTGATTACATAACT TTCAATGAGATTCCAACTATAGATATGAGCTTCTATCACTCAAACACACAAAAATTCACAATGTGTTAACTAGAGAGTAG ACCCTGCCATTAGGGTTATGATAAAATCATTTAGACTTTAGACCGATAAAGGAAACATAAATAAAAATGCAAATGAATGA AAATTGTTGAACAGAGTATGGAAAAGGCTACTCTGAAATGAGCTTGTTTATCTACTTTTAAATTTGTATGGGTTAAGATT ACATTGTATTTTAAATCAAATTAACCGTGGATATCCACATCATAATGAATCTAACATAAATCAGTAAGGAAATCATTATT GCTTTAAAAGAGGGAGGGGAGTTAGCTATTATTCTTGTATTGATTTAGAAATAGGAAATGTAAACAAAATGAGAATTTAA GCAAAAAAATCAGAATAGAGTTTCTATTATGATGGGTCTAGCAATTAGCATGTGAAAAATATAATTTTTGCTTCGACGGG GAATCCAATAACTATAATGATGTTGTTGAAAAAAAATCTGGTAAAAGTTGCTTGTGCATCATGCAGTGTTCCATTGGTGA CATATTAACATGCAGTTATGAACATGGAGTTTTTCTTTGCAAAAAGCTCTTGTATTCGTTTGATAAGTATATAATGGAAA TCTCCTGCTTGAACTTAAAGAAAAGTGTGTTATCCATCCACAATTTGTTTTGCAGGATGCAGGAGACCCGGAATCAGCAA ATTTGCTTCAATTAGACATGATGTAAATTAACCACTTTAACCACTATTAGCTAGTAGTACTTGTTATTTAAGCTTTTCGT AGTTCTATCCTATCCTATTCGTGGACCTATAACCCAAAGTTGGACTTGGTTGGTCCCATCCTCTATCTAGGTACTGAATT AGCTAGCTTATGGTGTTTGGCAACTGTGTGGCCAGAAAAACAGAATCATGAGTGTATTATAGTGGTTATTATTATCATTT ATGTTGAATGAGTATGTTATATTAACTTTTGGTGTTGTGCACACATTTCATCTACATTAATGTAGAAGCTACAACTTGAA CCTTCAACAAAATATATATATATATATATATATATATATATATATAATGGATGGATTACATTGAAATGAGCAGATAAAAT ATGTTCTAGTGACATTGAGTTAAGCTTAACTTTTAAATTTGATCTATTATTGTGAAGCTAGTGCTGGTTTTAGAGTGAAT TGAACCTGGAAAGAGGGATAAACTTTCTAAATGGTGTTCAGATGGAAGTAGGGTCAGGGGAGTATCCAGGATTTTTCCGT TGGAGGGGCGAAATAAAATCTGAAGTGAGAGAAGTGGTCCTAATTGCAATTTATTGCATTAATAGGGGCCATCCCATGGA TGTGGCGATGATCATTTCTGAGAAGATTTACCCACACTACAATGTGGGTAAGGAGAAGCCACGTCCTATCTTTCCTCACT TGATTACTGCTTTGATTCATGATGTTAGGGAGAAGGCTAGGAGACCTGCATTTCCTGTGCAGCAGAGGTTGTTGGTTTCC CCCATGCTGAGCAAGGGTCGGGTGAACCAACTCTTTCAAGATTGGATGTCTAGGATGCCTCAAGAGGATGAGGAAGAGGA GGATCCGACAGAGCCAGCGGAAGAAGAAGAGGAGGTTAATGAAGTGGTTGATCCTTCACCGGCTTGGATGGTGGTCGCTT TCATGCGGATGTTTTTGAGGCAAGATCGCCTTCACCGGGATCTTGATCTCCACTGGAGGGGAGGAAGCACCTCAGATCCT GGATACCAAGGCCCAATGGATTTCAATTCATTGGAGCAGGGGATGATTGATTTGAGCATAATGAATGACGCCGGAGTTCA TCCGGATTATGGTGATGGAGTGGGTGACCATGGCCCCATGGAGTGATTGTGATGAGGTAATTCTATCTTAGTTTAGGTCA TGCATCTTTAGCATATATTTTTCATTTGTGGATTTTGTTTTCTTTTTATCATGCATCGTTTAGTTAATTGTTTTTATTTG TTTTGGGTCTTTTACTCCCTATACTCACATGTTTTTGGCTGCTAAGTTGTGCTTCCCTACTTGTGTCGGTTTTGGAAAAT TTGTTTCTTGTGGTTACTCATGTTGTTTTGGGGATGAGTGATTGTATGTTGGGGAAGAGAGGAGGAGACTTCGGTCTTCC GAGTGTTTCTTTAGAAATGAGTTGATTTGAGTCCATTAAGGGTTTATCTTTGACCCTTCACTATAAAATTTTCCTGGAGG ATCCTAACTCACTGACAATTCTTGGTTCTGTATTGATTTCACACTTTGCATGCTTTGTGAGACTTGCACTATTCATGAGA CTTATAGGTTTTTGAACCTCAGAGTTTTTCTTGGCTTAAATATTTGTCCCTAGTTGTCCCTTTTGAGCCTATTGAAGATT TCTTTGTTAGCTAAATGATTGGGATGGATGATAGGTTGGATTATGGGGAGTGTTGGTCCTTACATTATGTTGGAGCTAAT AATTAAAGTTTGAAAATGTCTCTTGTCCCAAGGAAAAAATGGAAAAGAAAAAAGAAAGAGAACTCCTAATCAAAGTTGGA GTGGGAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAAGATCTTGAAAAGGGGTCAAGAGACTTGTGCTAAAAGGTTTGTTGTTGAGAGC TCTGGGGGTTACTATTTGGATCACACTCAATGTGCTTTAAAGCCTTAGTTTTCCTTAAGGACCAACCACCTTGTACTTCA CCAAGCCACACATTTCAACCTTTGTGAAGTCTCTTTGAATTTGTGCATGTTTGATCTTTGTTGCTATTATGTGAATGACA TCCAGAACCTATGAACTTGCTTGTGTGCTTAGTGCACTAAATTATATCTCATCCTAGGATTTTAGATCTATATGTTTCTC ATGATGGACTCTATACTCTTCTCTTTTCAAAAAGTTGCATGAGGTGGGTTATTGGATCTTTTCTTTTGGAACCAGCTGTA GTTACTCTTTCCCCTAGTTTTTTGGGTAGTATCCTTTGTGAAGGCACTTGTTTGGGAGCATTTCTTGCGCTTGAGGGCAA GCAAGTGTTTTCTACGCTCGAGGGCGAGCTGTCGTTGAGTATAGTGGTGTGATGACCCTATGTTAGTAGTTGTTTTAGGG TCATTTCTTTGAGTGTTTTGAGTCTTTTTCTTTGTCTCATGTAGTGTTTCTCATGCATTTTTGTGTTTATTTGAGTTTGA GTCAAGTTTTAATAATTTTATGGTTTTATGAGGGTTGTTTTTGCATTTTTTATAGAGTTTAGGACTTGCATGAGTTTTGG CATGATTTTGTGAGGACTAAGGTGGTTAAAATCCCATTGAATTTCTTGATTTTACTCCTTGTCTTGGTCCTTTAGTGCTG CAGCAGGTAACTTATGGAAAAGCAAGGTCAAGATGCAAAGGAATTGAAGAAAGCATTCAAAGGGGGTTACAAAAAGCTGA AAAGCCACCAAGAGCGTGCAGCTGGCGCTCAAGTGCCAGCACTCCAGAAGCTGGAGTTTTGCTTCTGCCTCATGGGCGCT CAAGCGCCCCAGGGCAGCGCTTGAGCGCCCCAGCTCGACTTTTTTGCCTATAAATAAGGCTTTAGGCCATTTTGTTCAGA ACTTCTGATTTTTACTTAGATTTTTACCAAGTATTGAAGCTTAGGAAGTGCTTTTAGGGCTTGTGAGAGGCTTCCTCCTT GTATTTTCCAGGTTTTCTTTACATCTCTTTGTATGGATTCACTAGCCATGAGTGGCTAGACTCTTCTTTTGCTTTGGGTT CAATGTGATTTCATGAATTTCTAGACTTAATTCCTATCTCTATGCTCTTGTTCTTGAATCTATCTTACATTTCAATTCTT TTATGCATGATAAGCTTGGGTGCACCTTTGCTTAAAACTAAATTGCAATCATATTGGAAGATTGTTGTAATTTGGGGACT TGGGTTAGAATTGACCTCTCTTTGCTTGCTTCTAGGAATAGAGTGAGGGATTGGTTTTGTTGGCCTGAAAATTGCATGCT TATAAACCTCATATAAATGACTAAGTACACAAGGAATTGAGCTTAGCTTTTAGTATGGGAGAATTGCTCATGTGAGGAAT CAATGAGTGAATATCTAGGCTATAACAATAATGGAATGATTCTTCTTGTACCTTAAGAACTGTTAAGAAAGCTTTGCTTA ATTTTTTTTTTCCAGAGGCTTCTCTCTTTGGATGAAGTACATTGTAGGTATAAGCTTTAGAAGATTTTAGTCATCCTTAT ACTTGAAGACCATTGATTCTCAATTTCTCCTCTCATTCTCGGCCACTGTTTCAGTTTTGTTCACCTCAAATCTCTGAATG TCGATCTCTTGCCGTTTTTAGGTTATTGTGTTTGTATGTTTTCAAGCAATCAACATTTCATTTCGTCTCCGTTGCCATCG CCGATTTCTACCGCCGGTGAGTTGTCTCCCCTCTCATTTTCCTCCACTATTCCAGGTCTATGCTCTGTCTCGATGTTAGG AGGGATACATATACGATGATGTTGATGTTATATTAAAGATCTTAGCTGGCTTCGTACCTCGCAGGGCGCTTTGGCACGGG TGAGAACTTGTTAAGTGCAGTATTCACAATATTTGATGAAGTCATGCTTTTATCATTTATAACTGTTAATGTCAATCCAT GATGCTTTCTAAAATGTTCTCGACAACCACCATTTATAACTAGTCGATTGTGAGTAATAGTCTAAAATGTAATCTGATGC TTTCTCTTCCTTTTGGGTGTTAGAATTGGATATTAGAGTGTCACACCCAGAGGAAGCTGGTTGAAATTGAAAGTTACCTT ATGCATGCTGGAAAACCAAGAAGGTGATATAATTGTGTACATACTAGTAAATAGATGGGACCTTAGCTTAAATCACTTTC TGGCATCTTATGAGTGCTATACTGATTGCCACATGCATCTTGTTCGTAACTTTTTACATGAAATTTGAGCTTTTGAAGAA ACCAAAAAGATTATGTGTTCTGGTGACTTGCAGTCTTGCATCTTAAATTGACATTTCAAACTATTCTCTTTACTCTTATT TTTCCTGGAAAATATGGTTTTGGAATCTAATTGCAATTCAAAAATAGATATCTCTATGATCTACTGACTATTTAATTATA GTCTTTTTTACTCAAGTATATTGAGATTATCTATTTTTAATTATTTCTGGAAAATAATCCATACTTCTTTTAGGTGTTTT AAAAAAGCCTTCTTCGCATTCATCTTCTTCACTCTTCACTGAAATGTATATAAAGAGGTATTACAATAAATTAGCTAATA GCCTACATATGTTATATCAGATGTCATTATGAGGTGGTTGTTGCTGACCTCCAATCCCCACTCCCACACCATTATCTCAG TCTAATTTTACATCTGATCAATCCTTGTGAATTCTATGGGTGAATGCAGAACAATGTGAGACAACAAAAATAGCTGCATA AGGGATTCTGACTTATTTGCAAGATATAATATGTTCTCTTGAGGAGGAAAAAGGTAATGTGCATATCGAAAACTGATTGT CACTCTTATTAGTTAGCAAGCAACTTCTCTGGAATTTGCTGTCAATGAGGAAGCTAGTACAAGTCAAACTTCCGCTGCAT ATGGATTTTAATTTTGTATACAGACATTTCTTTAAGTTCTTTCAGAAAAAAACTGTGTTTGAAACTACATTATTATTTAA CTATTCAATTGAATTTCCTTAGAGGGTGAATTTTTTTGCAGATGTTTAAGTATGTCAATTATCATTTGAGTGCTCTGTAA CGATTATGTCAATTGCAACCTATCTGGATATGAGGTCAGCTAACTGGATAACCTTTGACCCATCCTTGCATCCTCTTAAC TCTGTCTCTTCTCTTCTCATTTTAGAAATATTGTAAATGATACATAACATAATATGGCTGATCTTAGCTTCTCTATTTTG TTTATTTGCTCCTGTGTACTTGGGAAGATAGTGAAATCTGGGTGTCAAGCTTGGGTAAAAAACTAGTATGAAAAATTCAC AGTGGATAATTAATTTATGCTAATTGAAAATTTGCGAACTCCCTAATTTTTTAATGGATGGTTGTGAGTTGTATGATCGG AGATGTGTGAATCGAAACGAACCCCTTTAGGTTGCATTGACTTGTAAGTGTACACATTCCAAACTTATATTCACGATATG ATGTTGGCTTCAAAATGCATATTAAATATGGGCTTTGGACCTTGTGAAGTTTGTTAAGAGAACATGAAGCAGCCAACTAA AAAGGAGCATCAATGACTATATGTTTGGATAGTTTAAAATCTGTTGTGTTGCTGAAAATGAATTTGATACCCTGGCTAAT ATGCAGGCTTATCTGAAGCGACACACTTCATATATCCATGGTCTGAGAGACCGGTATCTAAGATTTCTGACCAAGACCCC ACCTAGTAGAGTTTACGGAGTCTTATGCATCTAGATGCAAGCATCTTATATTGTAAATGTTTATGTTTCTTTTGAGTGTA GATTTGTAACATCTTTTTATGCAGTAAAACCTGATGGTGAAAGTTGAGTTTTAATACCCTTATAAAGTAGCAGGAATGAT TCTCATATTATGGTCTAATTTCACAATGATCCATTCATTAGTTTGATAAAGTTTAATTCATATACAGTTCTTGTGGTTCT GGAAGCATTTTTTGTCATGCACCTTTTGGGAATTGGTCTAATGATTATAATATGAAACTTGGCAGTTTGAGAAGTTTTGT TGCTTCCTTGTTATTTTTATTTTATTTTGTGTCTTTTATATTTTTTGTTTAGGATGGTGAGGGATTGTACCCAATTTATC TTCCTTCTTAAAGCATGTTTATCAGAAATAGATCAATTTCTTTTTCTGGGGTTATGAAATTTCATGGTATTTTTATGCCT TTACGTGAAGTGCAGGTGAATCTTTGTTATAACAGATTGTTGTATGCTTGGTATGATAGGCTATGATTTGCTTAAGGAAA TCAAGGAATCTTCATCCTTGAGATACATACCAGTGGTGATTAGGTCATTTGAGAATGTGCTTTCAAGGATTAACAAATGC TTGGAGGAAGGAGTAGAGGAATTTTTTCTTGAAGCCTGTGTACATCCTATTATAGATCAACAGAAACAACACTACAAGCC AATAATAACAGGAGGAAGGCCATGGAAGAGGAGACTTCACCTGTGAGTCTGTGACTGACAGATCAAGGACCAAGATACAT GGGGTCTAAAATTGTATTATGATAACTTTTTTTTTTGAAAATAAAAAAGTTAACTTCAACCGTGGTTGGTGGCTCTATAG TGTGATAGAGATTTGTCCCTTTTACACATTTTGTGGAAATATTTACTTCTAATTTTGTTTTTTTTAAAAGAAATATTCAC AAGGAATTGGACTTCGAATATTATTTTATTGCAATGAATTTTCTTGTTACATCAAAGTATAATTGTTGAAATTTAAAAAT GCATTATTATCTTTGTAAATTAGTGCTATTCTAGGCCTTAGCTGCTTTAGAAACTATTGTAACTCGAAACTGTCCTGCTT ATAATACCTTG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0128600.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTGAACCTTCTAAGGTCATTCACGTTCGAAATGTGGGGCATGAGATATCTGAAAATGATTTGCTTCAGCTATTTCA GCCTTTTGGAGTCATAACAAAGCTTGTAATGTTGCGTGCCAAAAATCAGGCACTTCTCCAAATGCAAGATGTTCCTTCCG CAGTTAGTGCTTTACAATTTTATGCAAATGTTCAGCCAAGCATAAGGGGGAGAAATGTTTATGTCCAGTTTTCCTCACAT CAAGAACTAACTACAATGGATCAGACTCAAGCACGAGAAGATGAGCCAAATCGAATTCTCTTGGTTACAGTTCATCACAT GCTGTATCCTATAACAGTGGATGTACTACATCAAGTGTTTTCTCCCAATGGATATGTGGAAAAGATTGTAACGTTTCAGA AGTCAGCTGGCTTTCAGGCTCTCATCCAATTTCAATCCTGTCAAAGTGCTATTACTGCCAGAAGTACACTTCAGGGACGC AATATTTATGATGGTTGCTGTCAGCTGGACATTCAATTCTCAAACCTTGATGAGTTACAAGTGAACTTCAATAATGATCG GTCAAGGGACTTCACAAACCCAAATCTGCCTACAGAGCAGAAAGGCCGATCTTCACAACCTGGATATGGTGATGCAGGAG GCATGTACGGGGCTGGACCCAGGGGAGTTGGATTCTCACAGGTAGGTGGTACTTTCAGACCAAGTTGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0128600.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAEPSKVIHVRNVGHEISENDLLQLFQPFGVITKLVMLRAKNQALLQMQDVPSAVSALQFYANVQPSIRGRNVYVQFSSH QELTTMDQTQAREDEPNRILLVTVHHMLYPITVDVLHQVFSPNGYVEKIVTFQKSAGFQALIQFQSCQSAITARSTLQGR NIYDGCCQLDIQFSNLDELQVNFNNDRSRDFTNPNLPTEQKGRSSQPGYGDAGGMYGAGPRGVGFSQVGGTFRPS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Gene3D | 1 | 90 | 90 | 6.0E-25 | ||
| PANTHER | 3 | 209 | 207 | 1.8E-105 | – | |
| PANTHER | 3 | 209 | 207 | 1.8E-105 | – | |
| SUPERFAMILY | 3 | 87 | 85 | 1.48E-19 | ||
| ProSiteProfiles | 6 | 80 | 75 | 11.008 | ||
| SMART | 7 | 76 | 70 | 2.0E-7 | ||
| Pfam | 9 | 59 | 51 | 1.7E-6 | ||
| Gene3D | 93 | 200 | 108 | 4.8E-34 | ||
| SUPERFAMILY | 95 | 197 | 103 | 3.39E-17 | ||
| Pfam | 97 | 174 | 78 | 1.0E-21 | ||
| SMART | 101 | 170 | 70 | 2.8 | ||
| MobiDBLite | 186 | 205 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 186 | 235 | 50 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Nucleic acid binding | Interacting selectively and non-covalently with any nucleic acid. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0128600.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…