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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0207200 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0207200.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class), putative; TAIR: AT4G09980.2 Methyltransferase MT-A70 family protein; Swiss-Prot: sp|Q94AI4|METL1_ARATH Methyltransferase-like protein 1; TrEMBL-Plants: tr|K7MH68|K7MH68_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0207200 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:65112744..65127460) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGGTCTAAAGCCAGATACAGTCCTTATTCTTCGTTCAACCATATCACCATCAGTTATCCAAAAACTGGAGAAGGATCTTG AAGGTAAAAGATGCCTTCTATATTTTTGGCTTGATAAGGTGATTGATTTCTTTGTAGAAGGAGTTAACAAATCTGGCTTA TTATCCCAAATTCAGATGATAGGATTAACCCCTTGATCCTTTTAGTTGTCGCGTTAGTCGGTCATATGAGGATATGAAGC TATCGCCTGTTTTTTTATATCAATATGATGTATCAGTTTAGAGATAGCTTCTACATAATAGAATACTGGTTGAGATCACA TCTCAGATTCCTCTCCCTGTTTTCTCTAGCTCTCCCACTCCTCATTTTCTTGGAATCTCTACCTTTCCCAATTTGAATAA ACCTTAAATGGTGGTTTCTGGTTTCAAATGTATGTATAACATGTTTTAGGGCAGGGTAAATTCCTGGACGACAATATAGA TATATGGTTTTCCTTAGCCCATGCACTATATTATCTAATATAAATTTGCTCAGTTATACAAGACTGTTGCCTATTTTCCT TTCTACATTGTACTGGCAGCTAAGTAATTATGATTGTGCAGAATATGTAAAAACTGGACAAGTTTTTTTTTTCTTAGAAA TTTGGATTTTTTGTAGCATGAAATGCACCATTAGCAACTTTACTGGCCCAAATTTAAATTCCTTAGAAAATATTACTTTT TCAGAATTAATTTATTTCATTCATGGTTGTCCAAATATTTTTCCTTCAATTTTCCAACGGCCCACTGCTTTAACTGGTGG TATTGTTCTATGTGATGCTTGTCTTGTATTTTTTATCTTTTGTGTTTTCAAAAGAAAAAAAACAATCTTTTGTATTTTCA TTATGGTTTCCTTGGACAGCTATAATGTTCAGAATGCTGAGAAATTTCCTCTGATTTGAGTTAGTCATAGTAAGGGGACC 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0207200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTTGGTGAGGCAGGAACTGGGTGCGGATGTAGACATTCTTCTTGAATTGCGAAACTTACAGATTCCAGAGTGGTTTGA GCACCAGAACAGGGGTCCATCTGCGTCACTTTCTTTCTGGTTTCGTAACGAATTCCCTGACATCTTACTATGTATTGCTT CTCCATCTTACTATGTACTCAGAGTAAATTCCTTCATCAATGGCTCTTCAGGTCAACAATTCATACTAAATTGGGGTTGT ACTCTTCTTAAGAGGGTAAGCAAAACATGCACCGAAAAATGCAGGATATCAAAAAATGAGTGGAATCATGTGGAGTTTAG GACTCAAAGGGGCTTTGATTGTGGAATTGGAATTCATGTATTCAAAGAGCAAAACATGCAGGATATACGATTCACGAATC CTTTAGACTTGAACTTGGCACCGCTTGAAGAGGAAGGTTAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0207200.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MLVRQELGADVDILLELRNLQIPEWFEHQNRGPSASLSFWFRNEFPDILLCIASPSYYVLRVNSFINGSSGQQFILNWGC TLLKRVSKTCTEKCRISKNEWNHVEFRTQRGFDCGIGIHVFKEQNMQDIRFTNPLDLNLAPLEEEG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 13 | 116 | 104 | 9.1E-14 | – | |
| PANTHER | 13 | 116 | 104 | 9.1E-14 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0207200.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…