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LotjaGi2g1v0272100.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0272100
Transcript ID LotjaGi2g1v0272100.1
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein furry like; TAIR: AT5G15680.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O94915|FRYL_HUMAN Protein furry homolog-like; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2RFU8|A0A0B2RFU8_GLYSO Protein furry like; Found in the gene: LotjaGi2g1v0272100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:74300347..74318267) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

GGTAGTACTAGTAGGGTCACCGCGACGACAGACATCGAAGCTGCAGCAGAACCTGGTGTCCAATTACAAATTACAAATTA CAATTAGATCCTTCTCTCAAATTCTGAACCTAACCTCGAATTGAATCCACCTTCATCATTCTTCTCTGAATTTCATTTCA TTTCATTTCATTTCCTCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCCTCTCGCAATCTAGTGATTGTGGAAGTGAAACCAGAAGAAGAA GAACGTGAATCAAAAATGAAGGCAGGGAGTGCTGCCAAGTTGATCGTCGACGCTCTGCTTCAGCGCTTCCTCCCTCTCGC ACGACGCCGTATCGAAACCGCTCAAGCTCAGGATGGCCAGTATCTGCGTCCATCTGATCCCGCTTACGAGCAAGTTCTCG ATTCCCTCGCCATGATTGCTCGCCACACTCCTGTTCCTCTTCTTGAAGCTTTGTTGAGATGGAGAGAAAGGTACTTCTTC TTATTTTGCCCTAATCAATCAATTTTGGTGTGTTAAATTGTTCTCGCAATTTCGAGTCGAAAACCCTCACTACCAAGTAC TGCATTCACTTAATTGCTTTGCTAAATGCTAACTCAGTTTGATTGTTTTAATTTCTTTGTAGTGAATCACCAAAGGGTGC TAATGATGCATCTACGTTCCAGAGAAAGGTTGGTTACATGTCCTTCGTTCTTCATGTTTCGGTTTTGATTAGGGTTAGTT AGTTAGGTTTCAGATCAGTGATTGATTGTGTGTTTTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGGTTCAGCTTGCGGTGGAGTG CATATTTTGCTCGGCTTGCATTCGCTTCGTGGAGTGTTGTCCGCAAGAGGGGCTTACTGGTTTGTACTTTGTTTTGTTTG TAATTTGTTTGTTCAACACTTTGTGTGCTTTGCAATTTGTTGTCAGGATGAGTTTTTTACCCTTATGACGTTGCGGCTTT 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TGTGGTCAATATTGGTAACCCATGATTGTATAATTAATTCCATTTGCTGTATGTGTATATATTCTATCCAAGATGAATTA GGGTTTGCTCCAGGACAGTGGTTGTACATAAACACCTAGTTACTGGGATGGCAGTTTTGTAACTTTCTGTGTAATTGTAG ACAATAGACAACATCCTTTTGATGTCAAATATCATGCGTAATTTAACTTCGATGATAACGTTGCTATACTCTTCTTCAGG TGTGCCCTCTATCTTATAAGATTTTCTTCTTCGTATTACTTATTTTCCTTTATTTTTTTTGAGAATAAATCTCACAGGAG CGTAGTGGGTATTAAGTAAACCATTATGAATTATCATCAAAAGGTTTGTAAAGAAGCAGAGTGGAAAGAAGAGAGGAGAA AAAAAAATGAGTATAAAATAAGTCGCTATCCTAAACTTTTTACACCTTCATTTCTAAACTTTTTTTTAATAAACAAGGCT TAAATACTCTAGGGATCCCTGAAATTGTACCCCGTATCAAAATAAGTCCTTGAAATTTTTTTTTCCGATTCCGGATCCCT GGAATTGTTTTTTTAATCAGAATAAGTCCCTACGCCGGAGAAGATGGTGGTTGACGACGGCGGTCATGGCGGCGCTACGA C 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0272100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGAAGGCAGGGAGTGCTGCCAAGTTGATCGTCGACGCTCTGCTTCAGCGCTTCCTCCCTCTCGCACGACGCCGTATCGA AACCGCTCAAGCTCAGGATGGCCAGTATCTGCGTCCATCTGATCCCGCTTACGAGCAAGTTCTCGATTCCCTCGCCATGA TTGCTCGCCACACTCCTGTTCCTCTTCTTGAAGCTTTGTTGAGATGGAGAGAAAGTGAATCACCAAAGGGTGCTAATGAT GCATCTACGTTCCAGAGAAAGCTTGCGGTGGAGTGCATATTTTGCTCGGCTTGCATTCGCTTCGTGGAGTGTTGTCCGCA AGAGGGGCTTACTGAGAAGCTGTGGTCTGGACTTGAAAATTTTGTTTTTGACTGGCTAATCAATGCGGACAGGGTTGTTA GTCAGGTTGAGTATCCCTCACTGGTTGATCTGAGGGGGCTTCTTCTGGACTTAGTTGCTCAACTCCTCGGTGCTCTATCA CGTATCAGGTTTAGTTCTGTTACAGAGCGGTTTTTCATGGAACTCAACACCCGTCGGATTGACACTAGTGCCGCTAGGAG TGAAACACTTAGTATCATTAATGGGATGCGCTACCTGAAGCTTGGGGTTAAAACCGAGGGTGGATTGAATGCATCTGCCT CCTTTGTGGCAAAAGCAAATCCTTTAAACCGTGCTCCTCATAAACGGAAAAGTGAGCTCCACCATGCTCTGTGCAATATG CTTTCAAACATCCTAGCGCCTCTTGCAGATGGTGGGAAAGGCCAGTGGCCACCTACTGGTGTAGAGCCAGCCCTCCAATT GTGGTTTGAAGCTGTTGGACGTATAAGACTTCAGCTCATGCATTGGATGGATAAACAGAACAAACACATTGCAGTTGGGT ACCCATTGGTAACTATTCTTCTTTGTCTTGGGGATCCTCAAATATTCCACAACAACTTGAGTTCTCACATGGAGCAACTC TATAGACATCTCAGGGATAAAAACCATCGTTTCATGGCTTTGGATTGTCTTCATCGAGTTTTAAGGTTTTATTTGACTGT CCATGCATCTAACCAGGCCCCAAATCGTATTTGGGATTACTTAGACAGTGTAACATTGCAACTCTTAGCTGCTCTAAGGA AAGGAATGCTTACTCAGGATGTCCAACATGATAAACTTGTTGAATTCTGTGTAACTATAGCTGAACATAACCTTGATTTT ACCATGAACCATATGATACTAGAGTTGCTTAAGCAAGACAGCCCCAGTGAAGCAAAGGTTATTGGTCTTCGTGCATTGCT TGCCATTGTCATGCTGCCTTCAAGTCCGCATTTTGGTTTGGATATATTTAAAGGTCATGGTATTGGTCACTACATTCCGA AAGTGAAAGCTGCCATTGAGTCAATATTAAGGTCATGTCATAAAACCTATAGTCAAGCACTTCTGACATCTTCAAGGACC ACAATAGATGCGGTGACCAAGGAAAAGTCTCAAGGGTATCTGTTCCGCTCTGTGCTAAAGTGCATCCCATATCTAATCGA AGAAGTTGGTCGAAGTGATAAAATTACTGAAATAATACCACAACATGGCATAAGCATTGACCCTGGTGTTCGTGAGGAAG CTGTGCAAGTACTAAACCGTATTGTGAAATACCTACCCCACCGTCGTTTTGCAGTAATGAAGGGCATGGCCAACTTCATA TTAAGACTTCCTGATGAATTTCCTCTTCTCATTCAAACGTCATTAGGTCGCCTATTGGAACTCATGCGGTTTTGGAGATC TTGTTTAATAGACGATAGGATGCAACTTGATGCAGATGGAAACTCTCTGGGGCATGAAACTGAGAGATTCAGAAAGCCTA CCTTCCCACAATCAGGCGAAGCAATTGAATTTCGTGCATCAGAAATTGATGCAGTTGGCCTCATATTCCTTAGTTCTGTT GATAGTCAAATTAGGCATACAGCATTAGAATTATTGCGTTGTGTTCGTGCGCTGAGGAATGATATTCGGGACCTGACTAT ACAGGAGCAACCAAATCATATTTGGAAATATGAAGCTGAACCTATATTTATTATTGATGTTCTGGAAGAACATGGGGATG AGATTGTTCAGAACTGCTACTGGGACTCAGGGCGACCATTTGATTTAAAACGAGAACCTGATGCCATTCCTCCTGAAGTG ACTCTTCAATCTATAATTTTTGAGAGCCCAGACAAGAACAGGTGGGCTCGGTGTCTCAGTGAGTTAGTCAAGTATGCTGC TGAGCTTTGTCCAAGCTCCGTCCAAGAAGCAAAGATAGAGGTTATGCAACGTCTTACTCATATCACACCTTTTGAATTGG GTGGAAAAGCTCATCAATCACAGGATGTTGATAATAAACTGGACCAGTGGCTTATGTATGCCATGTTTGTCTGTTCATGC CCACCAGTTGCTCGAGAGTCTAGTGGAATTGGAGCAACCAAAGATCTTTACCATCTTATTTTCCCTTCACTAAAATCGGG ATCTGATGCACATGTTCATGCAGCCACCATGGCTCTTGGCCGCTCACACTTGGAAGCATGTGAAATCATGTTCAGCGAGC TTGCTTCTTTTATTGAGGAGGTTTCTTCCGAAACAGAAGGAAAACCAAAGTGGAAGAGTCAAAAGTCTCGCCGGGAAGAA CTCCGTGTCCATATTGCAAATATTTATCGTACTGTTGCAGAAAATGTTTGGCCTGGCATGCTTGTGCGCAAGCCAGTTTT CCGTCTCCATTATCTTAAATTCATTGAAGAGACAACTAGACTGATATCAACATCTTCTGAAAGTTTTCAAGACACGCAAC CATTCCGCTATGCCCTTGCTTGTGTTATAAGATCCTTAGCCCCTGAATTTGTTGATTCAAAATCTGAGAAATTTGACGTT AGAACCAGAAAGCGCCTATTTGATCTTCTTCTCTCGTGGTGTGATGACACAGGCAGTACTTGGGGTCAGGATGGTGTAAG TGACTATAGACGTGAAGTTGATCGTTACAAGTCTTCTCAACATGCACGGTCAAAAGATTCTGTGGATAAATTATCATTTG ACAAAGAACTGAATGAACAGGTTGAGGCAATCCAGTGGGCATCCATGAATGCTATAGCCTCACTTTTATATGGACCGTGT TTTGATGACAGTGCAAAGAAAATGAGTGGACGTGTGATATATTGGATTAATGCTTTGTTTTTGGAACCCACACCCAGGGC TCCATTTGGTTTCTCACCAGCTGATCCAAGAACTCCATCATATACCAAGTATCAGGGGGAAGGTGGCCGGGGAAACACTG GTCGTGATAGGCTTAGGGGTGGCCATCACCGTGTCTCTTTAGCAAAATTAGCTTTGAAGAATCTTTTGCTTACAAATTTG GACCTGTTTCCCTCCTGCATTGATCAGTGCTACTACTCTAATTCTTCTGTAGCTGATGGGTACTTCAGTGTACTGGCAGA GGTCTACATGCGCCAAGAGATACCAAACTGTGAAATACAGAGACTCTTGAGTCTGATCCTTTACAAGGTTGTGGATCCAT CTAGACAAATTCGGGATGATGCCCTTCAAATGCTTGAGACACTTTCTGTGCGTGAATGGGCTGAGGATGGCATTGATGGC TCAGGTAGTTATCGAGCTGCTGTTGTTGGTAATCTTCCTGATTCCTATCAACAATTCCAGTACAAGCTTTCCTGTAAACT AGCCAAAGATCATCCTGAATTAAGCCAACTTCTTTGCGAGGAGATTATGCTGAGGCAATTAGATGCTGTTGATATAATTG CTCAGCATCAGGTCTTGACATGCATGGCTCCATGGATTGAGAACCTTAATTTCTGGAAACTCAAGGAAGGCTGGAGTGAA AGGTTATTGAAAAGTTTTTACTATGTAACATCGCGACATGGAGACCAGTTTCCTGATGAAATCGAGAAACTTTGGAGCAC AATTGCTAGCAAAAATAGGAATATCAGTCCTGTTTTAGATTTCTTGATCACAAAAGGAATTGAAGATTGTGATTCAAATG CATCAACTGAAATAAGTGGTGCATTTGCCACATACTTCAGTGTTGCAAAGCGGGTAAGTCTATATTTAGCGCGAATATGC CCTCAACGGACTATAGATCACCTAGTTTTCCAGTTGTCTCAGCGACTACTAGAGGATAGCATTGAGCTAGTTGGGCCAAG TGCAAGTAAGGGTGATTGCAATGCAAATTTTGTGTTAGAATTCTCACAAGGTCCTGCTGTGGCCCAAATGGCATCTGTCA TGGATAACCAACCACACATGTCCCCATTGCTTGTAAGAGGTTCTCTTGATGGTCCACTAAGAAATGTTAGCGGGAGCTTG AGCTGGAGAACAGCTGGTATGACTGGCCGGAGTGTATCAGGTCCATTAAGTCCTATGCCTCCAGAGTTAAATATTGTTCC AGTAAGTACAGGGCGATCAGGGCAACTTCTGCCATCATTGGTTAACATGTCGGGGCCCTTGATGGGTGTTAGAAGCTCAA CAGGGAGTCTGCGGAGCCGCCATGTTTCCCGGGACAGTGGAGATTATCTTGTTGATACTCCAAATTCAGGTGAAGATGCA GGGGGAGCTGTGAATGCAAAAGAATTACAATCAGCCTTACAGGGTCATCAGCAGCATTCACTTACGCATGCAGACATAGC ACTGATTCTTCTTGCTGAAATTGCATATGAGAATGATGAAGACTTCCGCCAATACTTGCCTCTACTCTTTCATGTCATCT TTGTTTCAATGGATAGTTCCGAAGACATTGTGCTAGAGCATTGTCAGCATTTGCTGGTTAATCTATTATATTCCCTTGCT GGCCGCCACTTGGAGCAGTATGAGGTGGAAAATAATGATAGGGAGAACAAACAACAGGTTGTGAGCCTGATTAAATATGT TCAATCAAAGCGAGGAAGCATGATGTGGGAGAATGAGGATCCAACAGTTGTCAGAACCGAGCTTCCAAGCGCAGCTCTTC TTTCTGCCCTAGTTCAGAGCATGGTGGATGCTATCTTCTTCCAAGGAGACCTTCGTGAGACTTGGGGAGAAGAAGCACTT AAGTGGGCTATGGAGTGCACATCAAGACACCTTGCCTGTCGTTCACATCAGATCTACCGTGCACTTCGTCCGAGTGTAAC AAGTGATGCTTGTGTATCCCTTCTTCGGTGCCTCCATAGATGTCTAGGAAATCCAGTACCTCAAGTTTTGGGATTTCTTA TGGAAATTTTAATGACATTGCAAGTTATGGTGGAAAATATGGAGCCAGAGAAAGTGATACTCTATCCTCAGCTATTCTGG GGGTGTGTTGCTATGATGCACACAGATTTTGTACATGTCTACCGCCAGGTTCTAGAGCTCTTCTCTAAGGTGATTGACCG TTTATCTTTCCGTGACCGCACAACAGAAAATGTGCTCCTTTCAAGCATGCCTAGGGATGAACTTGAGACAGGTGATATAG GAGAATTTCAACGTACAGAATCTAAAAGTGGCTATGAACCTCTACAAGAGGGGAGTTTGCCAGCATTTGAAGGGGTGCAG CCTCTTGTTCTTAAAGGACTTATGTCGAGCGTCAGTCACTGCGTCTCTATCGACGTCCTCTCTCGTATCACAGTGCATTC CTGTGATTCTATATTTGGTGATACTGAGACAAGACTCCTGATGCACATTATAGGGTTACTTCCTTGGCTCTGTCTTCAAC TCAGCAAAGACCCAGTGATGGGTCCTGCTTCACCCCTCCAACATCAATATCAAAAGGCTTGCTCTGTTGCTTCCAATATT GCAATTTGGTGCCGAGCGAAATCTCAGGACGAATTAGCTACTGTATTTATGATTTACTCTCGAGGAGAGATTAAGAGCAT TGATAATTTTCTGGCTTGTGTTTCACCACTACTATGCAATGAATGGTTTCCAAAACATTCAACTTTGGCCTTTGGACACT TACTAAGGCTACTAGAAAAGGGACCAGTCGAGTATCAACGTGTCATTCTACTCATGCTCAAAGCTCTCCTCCAGCACACT CCAATGGACGCCGCCCAGAGCCCGCATATCTATGCAATTGTGTCCCAACTGGTGGAAAGCACTTTGTGTTGGGAGGCACT GAGTGTGTTAGAAGCCCTTCTACAAAGTTGCAGTTCATTGACCGGTTCTCACCCACTTGAGCCTGGTTCATTTGAGAACG GAATTGGTGGAACTGAAGAGAAGTTGCTTGCTCCGCAAACCTCGTTCAAGGCCCGCAGTGGGCCCCTGCAGTACGGTATG GGCTCAGGACTGGTCTCAGTTCTTGGACAGGGTGGGCCAACTGAGCCTGGGATGTCGCAAAGAGAGGTAACTTTGCAGAA TACTCGTCTGATTCTCGGTCGGGTATTGGACAGAAGTGCATTAGGTAAGAGAAAAGATCACAAAAAGTTAGTCCCTTTTG TGGTCAATATTGGTAACCCATGA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0272100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MKAGSAAKLIVDALLQRFLPLARRRIETAQAQDGQYLRPSDPAYEQVLDSLAMIARHTPVPLLEALLRWRESESPKGAND ASTFQRKLAVECIFCSACIRFVECCPQEGLTEKLWSGLENFVFDWLINADRVVSQVEYPSLVDLRGLLLDLVAQLLGALS RIRFSSVTERFFMELNTRRIDTSAARSETLSIINGMRYLKLGVKTEGGLNASASFVAKANPLNRAPHKRKSELHHALCNM LSNILAPLADGGKGQWPPTGVEPALQLWFEAVGRIRLQLMHWMDKQNKHIAVGYPLVTILLCLGDPQIFHNNLSSHMEQL YRHLRDKNHRFMALDCLHRVLRFYLTVHASNQAPNRIWDYLDSVTLQLLAALRKGMLTQDVQHDKLVEFCVTIAEHNLDF TMNHMILELLKQDSPSEAKVIGLRALLAIVMLPSSPHFGLDIFKGHGIGHYIPKVKAAIESILRSCHKTYSQALLTSSRT TIDAVTKEKSQGYLFRSVLKCIPYLIEEVGRSDKITEIIPQHGISIDPGVREEAVQVLNRIVKYLPHRRFAVMKGMANFI LRLPDEFPLLIQTSLGRLLELMRFWRSCLIDDRMQLDADGNSLGHETERFRKPTFPQSGEAIEFRASEIDAVGLIFLSSV DSQIRHTALELLRCVRALRNDIRDLTIQEQPNHIWKYEAEPIFIIDVLEEHGDEIVQNCYWDSGRPFDLKREPDAIPPEV TLQSIIFESPDKNRWARCLSELVKYAAELCPSSVQEAKIEVMQRLTHITPFELGGKAHQSQDVDNKLDQWLMYAMFVCSC PPVARESSGIGATKDLYHLIFPSLKSGSDAHVHAATMALGRSHLEACEIMFSELASFIEEVSSETEGKPKWKSQKSRREE LRVHIANIYRTVAENVWPGMLVRKPVFRLHYLKFIEETTRLISTSSESFQDTQPFRYALACVIRSLAPEFVDSKSEKFDV RTRKRLFDLLLSWCDDTGSTWGQDGVSDYRREVDRYKSSQHARSKDSVDKLSFDKELNEQVEAIQWASMNAIASLLYGPC FDDSAKKMSGRVIYWINALFLEPTPRAPFGFSPADPRTPSYTKYQGEGGRGNTGRDRLRGGHHRVSLAKLALKNLLLTNL DLFPSCIDQCYYSNSSVADGYFSVLAEVYMRQEIPNCEIQRLLSLILYKVVDPSRQIRDDALQMLETLSVREWAEDGIDG SGSYRAAVVGNLPDSYQQFQYKLSCKLAKDHPELSQLLCEEIMLRQLDAVDIIAQHQVLTCMAPWIENLNFWKLKEGWSE RLLKSFYYVTSRHGDQFPDEIEKLWSTIASKNRNISPVLDFLITKGIEDCDSNASTEISGAFATYFSVAKRVSLYLARIC PQRTIDHLVFQLSQRLLEDSIELVGPSASKGDCNANFVLEFSQGPAVAQMASVMDNQPHMSPLLVRGSLDGPLRNVSGSL SWRTAGMTGRSVSGPLSPMPPELNIVPVSTGRSGQLLPSLVNMSGPLMGVRSSTGSLRSRHVSRDSGDYLVDTPNSGEDA GGAVNAKELQSALQGHQQHSLTHADIALILLAEIAYENDEDFRQYLPLLFHVIFVSMDSSEDIVLEHCQHLLVNLLYSLA GRHLEQYEVENNDRENKQQVVSLIKYVQSKRGSMMWENEDPTVVRTELPSAALLSALVQSMVDAIFFQGDLRETWGEEAL KWAMECTSRHLACRSHQIYRALRPSVTSDACVSLLRCLHRCLGNPVPQVLGFLMEILMTLQVMVENMEPEKVILYPQLFW GCVAMMHTDFVHVYRQVLELFSKVIDRLSFRDRTTENVLLSSMPRDELETGDIGEFQRTESKSGYEPLQEGSLPAFEGVQ PLVLKGLMSSVSHCVSIDVLSRITVHSCDSIFGDTETRLLMHIIGLLPWLCLQLSKDPVMGPASPLQHQYQKACSVASNI AIWCRAKSQDELATVFMIYSRGEIKSIDNFLACVSPLLCNEWFPKHSTLAFGHLLRLLEKGPVEYQRVILLMLKALLQHT PMDAAQSPHIYAIVSQLVESTLCWEALSVLEALLQSCSSLTGSHPLEPGSFENGIGGTEEKLLAPQTSFKARSGPLQYGM GSGLVSVLGQGGPTEPGMSQREVTLQNTRLILGRVLDRSALGKRKDHKKLVPFVVNIGNP 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 2139 2139 0.0
PANTHER 1 2139 2139 0.0
Pfam 85 585 501 2.4E-107
SUPERFAMILY 299 1315 1017 2.76E-10
Pfam 622 1731 1110 0.0
SUPERFAMILY 1139 2038 900 3.58E-13
MobiDBLite 1492 1522 31 -
Pfam 1756 2038 283 7.9E-82

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Biological process Cell morphogenesis The developmental process in which the size or shape of a cell is generated and organized.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0272100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…