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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0272100 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0272100.2 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein furry like; TAIR: AT5G15680.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O94915|FRYL_HUMAN Protein furry homolog-like; TrEMBL-Plants: tr|A0A072UHB3|A0A072UHB3_MEDTR Armadillo/beta-catenin-like repeat protein; Found in the gene: LotjaGi2g1v0272100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:74300602..74311905) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAAGGCAGGGAGTGCTGCCAAGTTGATCGTCGACGCTCTGCTTCAGCGCTTCCTCCCTCTCGCACGACGCCGTATCGA AACCGCTCAAGCTCAGGATGGCCAGTATCTGCGTCCATCTGATCCCGCTTACGAGCAAGTTCTCGATTCCCTCGCCATGA TTGCTCGCCACACTCCTGTTCCTCTTCTTGAAGCTTTGTTGAGATGGAGAGAAAGGTACTTCTTCTTATTTTGCCCTAAT CAATCAATTTTGGTGTGTTAAATTGTTCTCGCAATTTCGAGTCGAAAACCCTCACTACCAAGTACTGCATTCACTTAATT GCTTTGCTAAATGCTAACTCAGTTTGATTGTTTTAATTTCTTTGTAGTGAATCACCAAAGGGTGCTAATGATGCATCTAC GTTCCAGAGAAAGGTTGGTTACATGTCCTTCGTTCTTCATGTTTCGGTTTTGATTAGGGTTAGTTAGTTAGGTTTCAGAT CAGTGATTGATTGTGTGTTTTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGGTTCAGCTTGCGGTGGAGTGCATATTTTGCTCGGC TTGCATTCGCTTCGTGGAGTGTTGTCCGCAAGAGGGGCTTACTGGTTTGTACTTTGTTTTGTTTGTAATTTGTTTGTTCA ACACTTTGTGTGCTTTGCAATTTGTTGTCAGGATGAGTTTTTTACCCTTATGACGTTGCGGCTTTGTTCTTTTCTGCAGA GAAGCTGTGGTCTGGACTTGAAAATTTTGTTTTTGACTGGCTAATCAATGCGGACAGGTAATGCTGTTATCAATGGAAAT AGCTACTTTGAAAATGCTCATAGTTAATAATCTGTTTCTAGTATAACTGTTCTCCGTAAACTCCGGGGGGGAAGGGTCCC AAGTTCGGGTCCTGGATTAGCGTTAGAGTGGAGATGCTGGTCTCTTGATCCTCTTAGCTTCTTATAGGCTTTTCCATGGT CTCTTGTGTTACCACACGTGTTGCTATAATGATGTCGGTTATTACATATTTAAGTGGAGTATTGATTAGCTTAAATGTCT TCGGGGGTTACAGGCGGCTATTTATTGTCGTCAGTTATGGCTTTCTTGACTCTCGGGTTTCTATTCGCTGGCCACGTGGT TCTCTAAACCATATATTCATAGTAAAAAGTGTCTCTTCGACCGGGTTATTGTAAGAGATAACTCGGGAGGTACAAAAACT ATATATAACCGTTCCTTGAGCTATTGGGCATTTTTCATTCTGTGTCTGAATAGTATACTATAACAGCCCCTTGAGCTATT GGGCATTTTTCACTTAACAGTTCCAATTTCTTGCTATGCTATTGCTCGTTTCCATGTAGAATGTTGCAGCTGTGTGAAGA AACAAAAGTTAAAATGTTAAATATGGACATCTGTTAATAAAATAAGAGCTTCGGGCAAGTTTTTCCGAGCTTTAAGATCG TAACTATTGCTTGTTGGAGTCTTCATGTCTGTAATAGTTGTGTAGTCCTCGTGCAACTCTTCTTCTCATTTTGATTTTAG GGTGCTTAACATTGGGTGTGCTCAATGTAGTTTCAGAATCGAAAGTAAAAAGATTGTTGATTAATTTTCCATACTTTTAT CCTCTTATTTATATATATGAAACTTTGGTGTGAACTTCTATTGCAGGGTTGTTAGTCAGGTTGAGTATCCCTCACTGGTT GATCTGAGGGGGCTTCTTCTGGACTTAGTTGCTCAACTCCTCGGTGCTCTATCACGTATCAGGTATCTTATTTATCACTG AGTTGTACTTGAAATCAACTGAGTATGATAAACAATTCTTTGACCATTATGAGGTTAAGACACATTTAATGATAAGACCA TCATGTTAATCAAATTCATTTGCTTTTCATGCATGCACACAACTTTTCTAGGTTTGATGAATTATAAACTGAACTGACCT 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GGGGCATGAAACTGAGAGATTCAGAAAGCCTACCTTCCCACAATCAGGCGAAGCAATTGAATTTCGTGCATCAGAAATTG ATGCAGTTGGCCTCATATTCCTTAGTTCTGTTGATAGTCAAATTAGGCATACAGCATTAGAATTATTGCGTTGTGTTCGT GCGCTGAGGAATGATATTCGGGACCTGACTATACAGGAGCAACCAAATCATATTTGGAAATATGAAGCTGAACCTATATT TATTATTGATGTTCTGGAAGAACATGGGGTACTCAAATTTCCCTTATATTTTATTTTATGTCAAAGTCAATTTTCTCAGA ATGTTTTTCTTTGTCTTATTCTTGGCTACACTTTATCCTTTATTTTATTTATTTATTTATATTGAGGTTCAATCATGTCA TATTGAGCCTTTTTTTCCTGAATAAAACTTCGAATATATGGGTATTACAGGATGAGATTGTTCAGAACTGCTACTGGGAC TCAGGGCGACCATTTGATTTAAAACGAGAACCTGATGCCATTCCTCCTGAAGTGACTCTTCAATCTATAATTTTTGAGAG CCCAGACAAGAACAGGTGGGCTCGGTGTCTCAGTGAGTTAGTCAAGTATGCTGCTGAGCTTTGTCCAAGCTCCGTCCAAG AAGCAAAGTAAGTATGTGTTTCTTTTTCATTTTTCTGCCTTTGTTGAAGTCCAAGCTTCGAAGAACTAAGATATTTTAGT GAAAAATAATAGGCAACATGGACTGTAACTCATACACTTCTCCCCTCTTTTTTACTCACTTACCGCAAGGGATATAAATT GTCTTGGATTCCTTTTTGTGTTTTTTTTAGAGAATGCAAGGGTGGGGCAGCTGTGGCTTGCTTCCATGTAGCTGACCCCG CTTAGAGGAAAAAAGGCTTTATCAGTTGTATAATCTTAAAATTTTCATTCTAGCCATTTAATTAATTGTTGTGTGGTACT TGAGTTTTCTAGGGTAATGATTAAACTAATGTTATAGTATTTTTACCAGTAACTTTCATGTTCATTATTTTAATAAAAAT TGCACCGAATGATTCACGATTTTAATGGAGAAAAAGTATCTTTACTCACTTATATTGCTCCTCCCTCCCCCATTTAGTCT GTTTCTAATTCCCTGGCCAAACTTTGTGATATCTCTTATTATGGGCAGGATAGAGGTTATGCAACGTCTTACTCATATCA CACCTTTTGAATTGGGTGGAAAAGCTCATCAATCACAGGATGTTGATAATAAACTGGACCAGTGGCTTATGTATGCCATG TTTGTCTGTTCATGCCCACCAGTTGCTCGAGAGTCTAGTGGAATTGGAGCAACCAAAGATCTTTACCATCTTATTTTCCC TTCACTAAAATCGGGATCTGATGCACATGTTGTAAGTACACCGAACTAAACTTATATATAAGTATAGCATGACAAGCTGA CTATGTCATTGTATATGAAGAGTTGCGTGCATCTTTGATAAGTCTTCTATTTTTTATTTCCACATTTCTTACTAAAAAAA GTATACAACAAGCTGAGAATTTCTTGTGTTCTTTTTACCATATTCCAATTTTGCTTTCATTTTATTAAAACTGTTTTTAG CTCCTTACTAGATTTAATGGTAAGAATTGAGAAAGATCAATCAAGTCTTTCATTTGAAAAAATAAATTCAATATAAAGTT GTGTTTGAGTTACTTAGTGTTTGTGTTAAGTTTTCATACTTAGTGTTCTCTATTGATTTATTTTAATTATATACTTTTGT GCCCACCAGTTTTAAAACACTTTTATAAGAAGTATCAAATATTATTCCTTCATTTTACTTTATCTCTTCGATTTTCTTTG TAGTTTTTCTAATTGACGTATAAATGCTGGGGGAAGGTAAACTTCGAATAACCTAATTTACATATCCACCCCCGAATTTT ATCCCCAATAATTTTAAATGATTTTTTTTTGCTCGAAGTTATACTTTAACTTTGTACTTGTTCTAAGATATTAAGTTTTC TCTTTCGTGTGAGATAGGGCTTTATTTTCAAGACATGGTTACTGGGTTATTATGGTTTGGTAGCTCAACCGTGTCGGCCT GAATATTAAAACCAATGTATTTGTAAAAGCTTAGGAACTGATAGGTACCAGAAGGAATCTAAGAGAAGAAATGTAGAACA GAAACCAATTTTAATTGAATTGAACTGGAAACTGGGAAAACCCAGGTTCAAAGAAGGTAATTACAAGAAAATGAACTATA GCAAGGCAAGTTAGGGAGTTCCTTTTCTCTCCCCAATCCCAGACCCAGTATTTACCTCCCTCCCTCTCCTTCCTATCTCT CTTTTATTTACACCCCAGATCCTATGCTCACACAGGCCTTGCCCACATCACATGAGCCTTGCACTCCTCTCTCCTATCCA TCTTAGCTTGGCAGTTGTGCTGAGTGGTATTTTGAGTGGGATATTTAGTCATTTATGTTTTTATGCTGAAGACCTGAGAG ATGTTTACATGCCCATGATCATTACCTACGTCCTTTTCCCAAAGGTTTTTTGCAGCATGCTTATTAGAAAATACTGAAAA TTCTTGTGCATGTCCCTCACAAACACTTATTTTACTATTCCCAAAATAAGCTGCATGGAAATGCATGCATAGGATTCATG TGTCTAATAGTTTATATGATATTTTGACTGGAGCATACTGTTTGTAATTTAATGGAAGTATTATTGGTCCAGCAGCTAAT TGGAGATAGATTAAGGGATTGACTTGTGCTTGTTGGAAAATGATTTGGAGTTTTCAAGGGATTTTTCTAACACAGTTGTA GGGCAATGGGGGCAGCTTTTATACGTTGATTTTTTGTTATTCTTGGTTGTGTTATTTTTTGTTTTTCTTGTTTGTGGAAG GCTGCCTACAATAGACCCACAATAGGTCTGGTCTTTCCTTTCCTTGGAGCCTGCAAAGTTGGGAGCTTTATAGCACAAAT GTGGATGATCTCTTTATTCCAAATTCCTTGTAATATTTTTATTGGCTTAACCATTTTCTTCTAACCAGATTAGTTTATAT GATGTTAGGAAGCTGAACTTGGTTTTTTTATGTTTTATTACTTGCATTGTGCCTGTTGAAAATTTCTTTTGTTAGATTTC TTCTTTACTGTTGAAAGGAATCCTTTGAAGTTTGCTAGTTCTGATTATTCTTTTTTTTTCAATGGGAACGGTATTAGGAG GACTGATGGCTGTTAATATCTGCAATTTTATTGATTTAAAGGCATTTGAAATATTCTGCTATCACTCATTTTCCTGCTAT TTTTTTATGTATCAAATCTATATATTGCTGAGGATGTTTGTCATTTAGCATTGCTGAGGATGTTTGTGATTTAGCATGCA GCCACCATGGCTCTTGGCCGCTCACACTTGGAAGCATGTGAAATCATGTTCAGCGAGCTTGCTTCTTTTATTGAGGAGGT TTCTTCCGAAACAGAAGGAAAACCAAAGTGGAAGGTATTATTATGAATCTGTAAATTTTGTTTTTTGTGTGTTCTATCAG TCATCGAGGGAGGTAGTAATCTTAAATTATAAATGATAAGGATAATGTAATATTAAAAAAATATAATTTTGAATTCTTTG GACCTTTAGCAGATGCCCACTTAG
CDS sequence (LotjaGi2g1v0272100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGGCAGGGAGTGCTGCCAAGTTGATCGTCGACGCTCTGCTTCAGCGCTTCCTCCCTCTCGCACGACGCCGTATCGA AACCGCTCAAGCTCAGGATGGCCAGTATCTGCGTCCATCTGATCCCGCTTACGAGCAAGTTCTCGATTCCCTCGCCATGA TTGCTCGCCACACTCCTGTTCCTCTTCTTGAAGCTTTGTTGAGATGGAGAGAAAGTGAATCACCAAAGGGTGCTAATGAT GCATCTACGTTCCAGAGAAAGCTTGCGGTGGAGTGCATATTTTGCTCGGCTTGCATTCGCTTCGTGGAGTGTTGTCCGCA AGAGGGGCTTACTGAGAAGCTGTGGTCTGGACTTGAAAATTTTGTTTTTGACTGGCTAATCAATGCGGACAGGGTTGTTA GTCAGGTTGAGTATCCCTCACTGGTTGATCTGAGGGGGCTTCTTCTGGACTTAGTTGCTCAACTCCTCGGTGCTCTATCA CGTATCAGGTTTAGTTCTGTTACAGAGCGGTTTTTCATGGAACTCAACACCCGTCGGATTGACACTAGTGCCGCTAGGAG TGAAACACTTAGTATCATTAATGGGATGCGCTACCTGAAGCTTGGGGTTAAAACCGAGGGTGGATTGAATGCATCTGCCT CCTTTGTGGCAAAAGCAAATCCTTTAAACCGTGCTCCTCATAAACGGAAAAGTGAGCTCCACCATGCTCTGTGCAATATG CTTTCAAACATCCTAGCGCCTCTTGCAGATGGTGGGAAAGGCCAGTGGCCACCTACTGGTGTAGAGCCAGCCCTCCAATT GTGGTTTGAAGCTGTTGGACGTATAAGACTTCAGCTCATGCATTGGATGGATAAACAGAACAAACACATTGCAGTTGGGT ACCCATTGGTAACTATTCTTCTTTGTCTTGGGGATCCTCAAATATTCCACAACAACTTGAGTTCTCACATGGAGCAACTC TATAGACATCTCAGGGATAAAAACCATCGTTTCATGGCTTTGGATTGTCTTCATCGAGTTTTAAGGTTTTATTTGACTGT CCATGCATCTAACCAGGCCCCAAATCGTATTTGGGATTACTTAGACAGTGTAACATTGCAACTCTTAGCTGCTCTAAGGA AAGGAATGCTTACTCAGGATGTCCAACATGATAAACTTGTTGAATTCTGTGTAACTATAGCTGAACATAACCTTGATTTT ACCATGAACCATATGATACTAGAGTTGCTTAAGCAAGACAGCCCCAGTGAAGCAAAGGTTATTGGTCTTCGTGCATTGCT TGCCATTGTCATGCTGCCTTCAAGTCCGCATTTTGGTTTGGATATATTTAAAGGTCATGGTATTGGTCACTACATTCCGA AAGTGAAAGCTGCCATTGAGTCAATATTAAGGTCATGTCATAAAACCTATAGTCAAGCACTTCTGACATCTTCAAGGACC ACAATAGATGCGGTGACCAAGGAAAAGTCTCAAGGGTATCTGTTCCGCTCTGTGCTAAAGTGCATCCCATATCTAATCGA AGAAGTTGGTCGAAGTGATAAAATTACTGAAATAATACCACAACATGGCATAAGCATTGACCCTGGTGTTCGTGAGGAAG CTGTGCAAGTACTAAACCGTATTGTGAAATACCTACCCCACCGTCGTTTTGCAGTAATGAAGGGCATGGCCAACTTCATA TTAAGACTTCCTGATGAATTTCCTCTTCTCATTCAAACGTCATTAGGTCGCCTATTGGAACTCATGCGGTTTTGGAGATC TTGTTTAATAGACGATAGGATGCAACTTGATGCAGATGGAAACTCTCTGGGGCATGAAACTGAGAGATTCAGAAAGCCTA CCTTCCCACAATCAGGCGAAGCAATTGAATTTCGTGCATCAGAAATTGATGCAGTTGGCCTCATATTCCTTAGTTCTGTT GATAGTCAAATTAGGCATACAGCATTAGAATTATTGCGTTGTGTTCGTGCGCTGAGGAATGATATTCGGGACCTGACTAT ACAGGAGCAACCAAATCATATTTGGAAATATGAAGCTGAACCTATATTTATTATTGATGTTCTGGAAGAACATGGGGATG AGATTGTTCAGAACTGCTACTGGGACTCAGGGCGACCATTTGATTTAAAACGAGAACCTGATGCCATTCCTCCTGAAGTG ACTCTTCAATCTATAATTTTTGAGAGCCCAGACAAGAACAGGTGGGCTCGGTGTCTCAGTGAGTTAGTCAAGTATGCTGC TGAGCTTTGTCCAAGCTCCGTCCAAGAAGCAAAGATAGAGGTTATGCAACGTCTTACTCATATCACACCTTTTGAATTGG GTGGAAAAGCTCATCAATCACAGGATGTTGATAATAAACTGGACCAGTGGCTTATGTATGCCATGTTTGTCTGTTCATGC CCACCAGTTGCTCGAGAGTCTAGTGGAATTGGAGCAACCAAAGATCTTTACCATCTTATTTTCCCTTCACTAAAATCGGG ATCTGATGCACATGTTCATGCAGCCACCATGGCTCTTGGCCGCTCACACTTGGAAGCATGTGAAATCATGTTCAGCGAGC TTGCTTCTTTTATTGAGGAGGTTTCTTCCGAAACAGAAGGAAAACCAAAGTGGAAGGTATTATTATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0272100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKAGSAAKLIVDALLQRFLPLARRRIETAQAQDGQYLRPSDPAYEQVLDSLAMIARHTPVPLLEALLRWRESESPKGAND ASTFQRKLAVECIFCSACIRFVECCPQEGLTEKLWSGLENFVFDWLINADRVVSQVEYPSLVDLRGLLLDLVAQLLGALS RIRFSSVTERFFMELNTRRIDTSAARSETLSIINGMRYLKLGVKTEGGLNASASFVAKANPLNRAPHKRKSELHHALCNM LSNILAPLADGGKGQWPPTGVEPALQLWFEAVGRIRLQLMHWMDKQNKHIAVGYPLVTILLCLGDPQIFHNNLSSHMEQL YRHLRDKNHRFMALDCLHRVLRFYLTVHASNQAPNRIWDYLDSVTLQLLAALRKGMLTQDVQHDKLVEFCVTIAEHNLDF TMNHMILELLKQDSPSEAKVIGLRALLAIVMLPSSPHFGLDIFKGHGIGHYIPKVKAAIESILRSCHKTYSQALLTSSRT TIDAVTKEKSQGYLFRSVLKCIPYLIEEVGRSDKITEIIPQHGISIDPGVREEAVQVLNRIVKYLPHRRFAVMKGMANFI LRLPDEFPLLIQTSLGRLLELMRFWRSCLIDDRMQLDADGNSLGHETERFRKPTFPQSGEAIEFRASEIDAVGLIFLSSV DSQIRHTALELLRCVRALRNDIRDLTIQEQPNHIWKYEAEPIFIIDVLEEHGDEIVQNCYWDSGRPFDLKREPDAIPPEV TLQSIIFESPDKNRWARCLSELVKYAAELCPSSVQEAKIEVMQRLTHITPFELGGKAHQSQDVDNKLDQWLMYAMFVCSC PPVARESSGIGATKDLYHLIFPSLKSGSDAHVHAATMALGRSHLEACEIMFSELASFIEEVSSETEGKPKWKVLL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 873 | 873 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 873 | 873 | 0.0 | ||
| Pfam | 85 | 585 | 501 | 3.5E-108 | ||
| SUPERFAMILY | 295 | 842 | 548 | 8.23E-10 | ||
| Pfam | 622 | 872 | 251 | 1.4E-134 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Cell morphogenesis | The developmental process in which the size or shape of a cell is generated and organized. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0272100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…