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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0272100 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0272100.4 |
| Related isoforms 3 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Protein furry like; TAIR: AT5G15680.1 ARM repeat superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O94915|FRYL_HUMAN Protein furry homolog-like; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2RFU8|A0A0B2RFU8_GLYSO Protein furry like; Found in the gene: LotjaGi2g1v0272100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:74300602..74317651) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATGAAGGCAGGGAGTGCTGCCAAGTTGATCGTCGACGCTCTGCTTCAGCGCTTCCTCCCTCTCGCACGACGCCGTATCGA AACCGCTCAAGCTCAGGATGGCCAGTATCTGCGTCCATCTGATCCCGCTTACGAGCAAGTTCTCGATTCCCTCGCCATGA TTGCTCGCCACACTCCTGTTCCTCTTCTTGAAGCTTTGTTGAGATGGAGAGAAAGGTACTTCTTCTTATTTTGCCCTAAT CAATCAATTTTGGTGTGTTAAATTGTTCTCGCAATTTCGAGTCGAAAACCCTCACTACCAAGTACTGCATTCACTTAATT GCTTTGCTAAATGCTAACTCAGTTTGATTGTTTTAATTTCTTTGTAGTGAATCACCAAAGGGTGCTAATGATGCATCTAC GTTCCAGAGAAAGGTTGGTTACATGTCCTTCGTTCTTCATGTTTCGGTTTTGATTAGGGTTAGTTAGTTAGGTTTCAGAT CAGTGATTGATTGTGTGTTTTGTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGGGTTCAGCTTGCGGTGGAGTGCATATTTTGCTCGGC TTGCATTCGCTTCGTGGAGTGTTGTCCGCAAGAGGGGCTTACTGGTTTGTACTTTGTTTTGTTTGTAATTTGTTTGTTCA ACACTTTGTGTGCTTTGCAATTTGTTGTCAGGATGAGTTTTTTACCCTTATGACGTTGCGGCTTTGTTCTTTTCTGCAGA GAAGCTGTGGTCTGGACTTGAAAATTTTGTTTTTGACTGGCTAATCAATGCGGACAGGTAATGCTGTTATCAATGGAAAT AGCTACTTTGAAAATGCTCATAGTTAATAATCTGTTTCTAGTATAACTGTTCTCCGTAAACTCCGGGGGGGAAGGGTCCC AAGTTCGGGTCCTGGATTAGCGTTAGAGTGGAGATGCTGGTCTCTTGATCCTCTTAGCTTCTTATAGGCTTTTCCATGGT 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0272100.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAAGGCAGGGAGTGCTGCCAAGTTGATCGTCGACGCTCTGCTTCAGCGCTTCCTCCCTCTCGCACGACGCCGTATCGA AACCGCTCAAGCTCAGGATGGCCAGTATCTGCGTCCATCTGATCCCGCTTACGAGCAAGTTCTCGATTCCCTCGCCATGA TTGCTCGCCACACTCCTGTTCCTCTTCTTGAAGCTTTGTTGAGATGGAGAGAAAGTGAATCACCAAAGGGTGCTAATGAT GCATCTACGTTCCAGAGAAAGCTTGCGGTGGAGTGCATATTTTGCTCGGCTTGCATTCGCTTCGTGGAGTGTTGTCCGCA AGAGGGGCTTACTGAGAAGCTGTGGTCTGGACTTGAAAATTTTGTTTTTGACTGGCTAATCAATGCGGACAGGGTTGTTA GTCAGGTTGAGTATCCCTCACTGGTTGATCTGAGGGGGCTTCTTCTGGACTTAGTTGCTCAACTCCTCGGTGCTCTATCA CGTATCAGGTTTAGTTCTGTTACAGAGCGGTTTTTCATGGAACTCAACACCCGTCGGATTGACACTAGTGCCGCTAGGAG TGAAACACTTAGTATCATTAATGGGATGCGCTACCTGAAGCTTGGGGTTAAAACCGAGGGTGGATTGAATGCATCTGCCT CCTTTGTGGCAAAAGCAAATCCTTTAAACCGTGCTCCTCATAAACGGAAAAGTGAGCTCCACCATGCTCTGTGCAATATG CTTTCAAACATCCTAGCGCCTCTTGCAGATGGTGGGAAAGGCCAGTGGCCACCTACTGGTGTAGAGCCAGCCCTCCAATT GTGGTTTGAAGCTGTTGGACGTATAAGACTTCAGCTCATGCATTGGATGGATAAACAGAACAAACACATTGCAGTTGGGT ACCCATTGGTAACTATTCTTCTTTGTCTTGGGGATCCTCAAATATTCCACAACAACTTGAGTTCTCACATGGAGCAACTC TATAGACATCTCAGGGATAAAAACCATCGTTTCATGGCTTTGGATTGTCTTCATCGAGTTTTAAGGTTTTATTTGACTGT CCATGCATCTAACCAGGCCCCAAATCGTATTTGGGATTACTTAGACAGTGTAACATTGCAACTCTTAGCTGCTCTAAGGA AAGGAATGCTTACTCAGGATGTCCAACATGATAAACTTGTTGAATTCTGTGTAACTATAGCTGAACATAACCTTGATTTT ACCATGAACCATATGATACTAGAGTTGCTTAAGCAAGACAGCCCCAGTGAAGCAAAGGTTATTGGTCTTCGTGCATTGCT TGCCATTGTCATGCTGCCTTCAAGTCCGCATTTTGGTTTGGATATATTTAAAGGTCATGGTATTGGTCACTACATTCCGA AAGTGAAAGCTGCCATTGAGTCAATATTAAGGTCATGTCATAAAACCTATAGTCAAGCACTTCTGACATCTTCAAGGACC ACAATAGATGCGGTGACCAAGGAAAAGTCTCAAGGGTATCTGTTCCGCTCTGTGCTAAAGTGCATCCCATATCTAATCGA AGAAGTTGGTCGAAGTGATAAAATTACTGAAATAATACCACAACATGGCATAAGCATTGACCCTGGTGTTCGTGAGGAAG CTGTGCAAGTACTAAACCGTATTGTGAAATACCTACCCCACCGTCGTTTTGCAGTAATGAAGGGCATGGCCAACTTCATA TTAAGACTTCCTGATGAATTTCCTCTTCTCATTCAAACGTCATTAGGTCGCCTATTGGAACTCATGCGGTTTTGGAGATC TTGTTTAATAGACGATAGGATGCAACTTGATGCAGATGGAAACTCTCTGGGGCATGAAACTGAGAGATTCAGAAAGCCTA CCTTCCCACAATCAGGCGAAGCAATTGAATTTCGTGCATCAGAAATTGATGCAGTTGGCCTCATATTCCTTAGTTCTGTT GATAGTCAAATTAGGCATACAGCATTAGAATTATTGCGTTGTGTTCGTGCGCTGAGGAATGATATTCGGGACCTGACTAT ACAGGAGCAACCAAATCATATTTGGAAATATGAAGCTGAACCTATATTTATTATTGATGTTCTGGAAGAACATGGGGTAC TCAAATTTCCCTTATATTTTGATGAGATTGTTCAGAACTGCTACTGGGACTCAGGGCGACCATTTGATTTAAAACGAGAA CCTGATGCCATTCCTCCTGAAGTGACTCTTCAATCTATAATTTTTGAGAGCCCAGACAAGAACAGGTGGGCTCGGTGTCT CAGTGAGTTAGTCAAGTATGCTGCTGAGCTTTGTCCAAGCTCCGTCCAAGAAGCAAAGATAGAGGTTATGCAACGTCTTA CTCATATCACACCTTTTGAATTGGGTGGAAAAGCTCATCAATCACAGGATGTTGATAATAAACTGGACCAGTGGCTTATG TATGCCATGTTTGTCTGTTCATGCCCACCAGTTGCTCGAGAGTCTAGTGGAATTGGAGCAACCAAAGATCTTTACCATCT TATTTTCCCTTCACTAAAATCGGGATCTGATGCACATGTTCATGCAGCCACCATGGCTCTTGGCCGCTCACACTTGGAAG CATGTGAAATCATGTTCAGCGAGCTTGCTTCTTTTATTGAGGAGGTTTCTTCCGAAACAGAAGGAAAACCAAAGTGGAAG AGTCAAAAGTCTCGCCGGGAAGAACTCCGTGTCCATATTGCAAATATTTATCGTACTGTTGCAGAAAATGTTTGGCCTGG CATGCTTGTGCGCAAGCCAGTTTTCCGTCTCCATTATCTTAAATTCATTGAAGAGACAACTAGACTGATATCAACATCTT CTGAAAGTTTTCAAGACACGCAACCATTCCGCTATGCCCTTGCTTGTGTTATAAGATCCTTAGCCCCTGAATTTGTTGAT TCAAAATCTGAGAAATTTGACGTTAGAACCAGAAAGCGCCTATTTGATCTTCTTCTCTCGTGGTGTGATGACACAGGCAG TACTTGGGGTCAGGATGGTGTAAGTGACTATAGACGTGAAGTTGATCGTTACAAGTCTTCTCAACATGCACGGTCAAAAG ATTCTGTGGATAAATTATCATTTGACAAAGAACTGAATGAACAGGTTGAGGCAATCCAGTGGGCATCCATGAATGCTATA GCCTCACTTTTATATGGACCGTGTTTTGATGACAGTGCAAAGAAAATGAGTGGACGTGTGATATATTGGATTAATGCTTT GTTTTTGGAACCCACACCCAGGGCTCCATTTGGTTTCTCACCAGCTGATCCAAGAACTCCATCATATACCAAGTATCAGG GGGAAGGTGGCCGGGGAAACACTGGTCGTGATAGGCTTAGGGGTGGCCATCACCGTGTCTCTTTAGCAAAATTAGCTTTG AAGAATCTTTTGCTTACAAATTTGGACCTGTTTCCCTCCTGCATTGATCAGTGCTACTACTCTAATTCTTCTGTAGCTGA TGGGTACTTCAGTGTACTGGCAGAGGTCTACATGCGCCAAGAGATACCAAACTGTGAAATACAGAGACTCTTGAGTCTGA TCCTTTACAAGGTTGTGGATCCATCTAGACAAATTCGGGATGATGCCCTTCAAATGCTTGAGACACTTTCTGTGCGTGAA TGGGCTGAGGATGGCATTGATGGCTCAGGTAGTTATCGAGCTGCTGTTGTTGGTAATCTTCCTGATTCCTATCAACAATT CCAGTACAAGCTTTCCTGTAAACTAGCCAAAGATCATCCTGAATTAAGCCAACTTCTTTGCGAGGAGATTATGCTGAGGC AATTAGATGCTGTTGATATAATTGCTCAGCATCAGGTCTTGACATGCATGGCTCCATGGATTGAGAACCTTAATTTCTGG AAACTCAAGGAAGGCTGGAGTGAAAGGTTATTGAAAAGTTTTTACTATGTAACATCGCGACATGGAGACCAGTTTCCTGA TGAAATCGAGAAACTTTGGAGCACAATTGCTAGCAAAAATAGGAATATCAGTCCTGTTTTAGATTTCTTGATCACAAAAG GAATTGAAGATTGTGATTCAAATGCATCAACTGAAATAAGTGGTGCATTTGCCACATACTTCAGTGTTGCAAAGCGGGTA AGTCTATATTTAGCGCGAATATGCCCTCAACGGACTATAGATCACCTAGTTTTCCAGTTGTCTCAGCGACTACTAGAGGA TAGCATTGAGCTAGTTGGGCCAAGTGCAAGTAAGGGTGATTGCAATGCAAATTTTGTGTTAGAATTCTCACAAGGTCCTG CTGTGGCCCAAATGGCATCTGTCATGGATAACCAACCACACATGTCCCCATTGCTTGTAAGAGGTTCTCTTGATGGTCCA CTAAGAAATGTTAGCGGGAGCTTGAGCTGGAGAACAGCTGGTATGACTGGCCGGAGTGTATCAGGTCCATTAAGTCCTAT GCCTCCAGAGTTAAATATTGTTCCAGTAAGTACAGGGCGATCAGGGCAACTTCTGCCATCATTGGTTAACATGTCGGGGC CCTTGATGGGTGTTAGAAGCTCAACAGGGAGTCTGCGGAGCCGCCATGTTTCCCGGGACAGTGGAGATTATCTTGTTGAT ACTCCAAATTCAGGTGAAGATGCAGGGGGAGCTGTGAATGCAAAAGAATTACAATCAGCCTTACAGGGTCATCAGCAGCA TTCACTTACGCATGCAGACATAGCACTGATTCTTCTTGCTGAAATTGCATATGAGAATGATGAAGACTTCCGCCAATACT TGCCTCTACTCTTTCATGTCATCTTTGTTTCAATGGATAGTTCCGAAGACATTGTGCTAGAGCATTGTCAGCATTTGCTG GTTAATCTATTATATTCCCTTGCTGGCCGCCACTTGGAGCAGTATGAGGTGGAAAATAATGATAGGGAGAACAAACAACA GGTTGTGAGCCTGATTAAATATGTTCAATCAAAGCGAGGAAGCATGATGTGGGAGAATGAGGATCCAACAGTTGTCAGAA CCGAGCTTCCAAGCGCAGCTCTTCTTTCTGCCCTAGTTCAGAGCATGGTGGATGCTATCTTCTTCCAAGGAGACCTTCGT GAGACTTGGGGAGAAGAAGCACTTAAGTGGGCTATGGAGTGCACATCAAGACACCTTGCCTGTCGTTCACATCAGATCTA CCGTGCACTTCGTCCGAGTGTAACAAGTGATGCTTGTGTATCCCTTCTTCGGTGCCTCCATAGATGTCTAGGAAATCCAG TACCTCAAGTTTTGGGATTTCTTATGGAAATTTTAATGACATTGCAAGTTATGGTGGAAAATATGGAGCCAGAGAAAGTG ATACTCTATCCTCAGCTATTCTGGGGGTGTGTTGCTATGATGCACACAGATTTTGTACATGTCTACCGCCAGGTTCTAGA GCTCTTCTCTAAGGTGATTGACCGTTTATCTTTCCGTGACCGCACAACAGAAAATGTGCTCCTTTCAAGCATGCCTAGGG ATGAACTTGAGACAGGTGATATAGGAGAATTTCAACGTACAGAATCTAAAAGTGGCTATGAACCTCTACAAGAGGGGAGT TTGCCAGCATTTGAAGGGGTGCAGCCTCTTGTTCTTAAAGGACTTATGTCGAGCGTCAGTCACTGCGTCTCTATCGACGT CCTCTCTCGTATCACAGTGCATTCCTGTGATTCTATATTTGGTGATACTGAGACAAGACTCCTGATGCACATTATAGGGT TACTTCCTTGGCTCTGTCTTCAACTCAGCAAAGACCCAGTGATGGGTCCTGCTTCACCCCTCCAACATCAATATCAAAAG GCTTGCTCTGTTGCTTCCAATATTGCAATTTGGTGCCGAGCGAAATCTCAGGACGAATTAGCTACTGTATTTATGATTTA CTCTCGAGGAGAGATTAAGAGCATTGATAATTTTCTGGCTTGTGTTTCACCACTACTATGCAATGAATGGTTTCCAAAAC ATTCAACTTTGGCCTTTGGACACTTACTAAGGCTACTAGAAAAGGGACCAGTCGAGTATCAACGTGTCATTCTACTCATG CTCAAAGCTCTCCTCCAGCACACTCCAATGGACGCCGCCCAGAGCCCGCATATCTATGCAATTGTGTCCCAACTGGTGGA AAGCACTTTGTGTTGGGAGGCACTGAGTGTGTTAGAAGCCCTTCTACAAAGTTGCAGTTCATTGACCGGTTCTCACCCAC TTGAGCCTGGTTCATTTGAGAACGGAATTGGTGGAACTGAAGAGAAGTTGCTTGCTCCGCAAACCTCGTTCAAGGCCCGC AGTGGGCCCCTGCAGTACGGTATGGGCTCAGGACTGGTCTCAGTTCTTGGACAGGGTGGGCCAACTGAGCCTGGGATGTC GCAAAGAGAGGTAACTTTGCAGAATACTCGTCTGATTCTCGGTCGGGTATTGGACAGAAGTGCATTAGGTAAGAGAAAAG ATCACAAAAAGTTAGTCCCTTTTGTGGTCAATATTGGTAACCCATGA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0272100.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MKAGSAAKLIVDALLQRFLPLARRRIETAQAQDGQYLRPSDPAYEQVLDSLAMIARHTPVPLLEALLRWRESESPKGAND ASTFQRKLAVECIFCSACIRFVECCPQEGLTEKLWSGLENFVFDWLINADRVVSQVEYPSLVDLRGLLLDLVAQLLGALS RIRFSSVTERFFMELNTRRIDTSAARSETLSIINGMRYLKLGVKTEGGLNASASFVAKANPLNRAPHKRKSELHHALCNM LSNILAPLADGGKGQWPPTGVEPALQLWFEAVGRIRLQLMHWMDKQNKHIAVGYPLVTILLCLGDPQIFHNNLSSHMEQL YRHLRDKNHRFMALDCLHRVLRFYLTVHASNQAPNRIWDYLDSVTLQLLAALRKGMLTQDVQHDKLVEFCVTIAEHNLDF TMNHMILELLKQDSPSEAKVIGLRALLAIVMLPSSPHFGLDIFKGHGIGHYIPKVKAAIESILRSCHKTYSQALLTSSRT TIDAVTKEKSQGYLFRSVLKCIPYLIEEVGRSDKITEIIPQHGISIDPGVREEAVQVLNRIVKYLPHRRFAVMKGMANFI LRLPDEFPLLIQTSLGRLLELMRFWRSCLIDDRMQLDADGNSLGHETERFRKPTFPQSGEAIEFRASEIDAVGLIFLSSV DSQIRHTALELLRCVRALRNDIRDLTIQEQPNHIWKYEAEPIFIIDVLEEHGVLKFPLYFDEIVQNCYWDSGRPFDLKRE PDAIPPEVTLQSIIFESPDKNRWARCLSELVKYAAELCPSSVQEAKIEVMQRLTHITPFELGGKAHQSQDVDNKLDQWLM YAMFVCSCPPVARESSGIGATKDLYHLIFPSLKSGSDAHVHAATMALGRSHLEACEIMFSELASFIEEVSSETEGKPKWK SQKSRREELRVHIANIYRTVAENVWPGMLVRKPVFRLHYLKFIEETTRLISTSSESFQDTQPFRYALACVIRSLAPEFVD SKSEKFDVRTRKRLFDLLLSWCDDTGSTWGQDGVSDYRREVDRYKSSQHARSKDSVDKLSFDKELNEQVEAIQWASMNAI ASLLYGPCFDDSAKKMSGRVIYWINALFLEPTPRAPFGFSPADPRTPSYTKYQGEGGRGNTGRDRLRGGHHRVSLAKLAL KNLLLTNLDLFPSCIDQCYYSNSSVADGYFSVLAEVYMRQEIPNCEIQRLLSLILYKVVDPSRQIRDDALQMLETLSVRE WAEDGIDGSGSYRAAVVGNLPDSYQQFQYKLSCKLAKDHPELSQLLCEEIMLRQLDAVDIIAQHQVLTCMAPWIENLNFW KLKEGWSERLLKSFYYVTSRHGDQFPDEIEKLWSTIASKNRNISPVLDFLITKGIEDCDSNASTEISGAFATYFSVAKRV SLYLARICPQRTIDHLVFQLSQRLLEDSIELVGPSASKGDCNANFVLEFSQGPAVAQMASVMDNQPHMSPLLVRGSLDGP LRNVSGSLSWRTAGMTGRSVSGPLSPMPPELNIVPVSTGRSGQLLPSLVNMSGPLMGVRSSTGSLRSRHVSRDSGDYLVD TPNSGEDAGGAVNAKELQSALQGHQQHSLTHADIALILLAEIAYENDEDFRQYLPLLFHVIFVSMDSSEDIVLEHCQHLL VNLLYSLAGRHLEQYEVENNDRENKQQVVSLIKYVQSKRGSMMWENEDPTVVRTELPSAALLSALVQSMVDAIFFQGDLR ETWGEEALKWAMECTSRHLACRSHQIYRALRPSVTSDACVSLLRCLHRCLGNPVPQVLGFLMEILMTLQVMVENMEPEKV ILYPQLFWGCVAMMHTDFVHVYRQVLELFSKVIDRLSFRDRTTENVLLSSMPRDELETGDIGEFQRTESKSGYEPLQEGS LPAFEGVQPLVLKGLMSSVSHCVSIDVLSRITVHSCDSIFGDTETRLLMHIIGLLPWLCLQLSKDPVMGPASPLQHQYQK ACSVASNIAIWCRAKSQDELATVFMIYSRGEIKSIDNFLACVSPLLCNEWFPKHSTLAFGHLLRLLEKGPVEYQRVILLM LKALLQHTPMDAAQSPHIYAIVSQLVESTLCWEALSVLEALLQSCSSLTGSHPLEPGSFENGIGGTEEKLLAPQTSFKAR SGPLQYGMGSGLVSVLGQGGPTEPGMSQREVTLQNTRLILGRVLDRSALGKRKDHKKLVPFVVNIGNP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 2147 | 2147 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 2147 | 2147 | 0.0 | ||
| Pfam | 85 | 585 | 501 | 2.4E-107 | ||
| SUPERFAMILY | 299 | 1322 | 1024 | 5.23E-10 | ||
| Pfam | 622 | 1739 | 1118 | 0.0 | ||
| SUPERFAMILY | 1147 | 2046 | 900 | 1.11E-13 | ||
| MobiDBLite | 1500 | 1530 | 31 | - | – | |
| Pfam | 1764 | 2046 | 283 | 7.9E-82 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Cell morphogenesis | The developmental process in which the size or shape of a cell is generated and organized. |
Expression pattern of LotjaGi2g1v0272100.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…