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LotjaGi2g1v0356300.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi2g1v0356300
Transcript ID LotjaGi2g1v0356300.1
Related isoforms 2
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein GRIP; TAIR: AT5G66030.1 Golgi-localized GRIP domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q8S2T0|GRIP_ARATH Protein GRIP; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2S9J7|A0A0B2S9J7_GLYSO Protein GRIP; Found in the gene: LotjaGi2g1v0356300
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr2:83262014..83275920) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CCCGGATCTGTATAAGTGAAACCTAAGTATTCTGCTTGTGCAGTACAATATATGCAGCATCTTACATATTAATTTAACAG TAACATGGCAATTACAATGTTACATTACATAATATAGCTCTCTTCACAGTCTTTTTCAGGTCGGGTTTCCGAGTTCAACT GTTTGTTTGAGGTTGTGTGCGGGTGTGGGTACGGGTCGGGTGAACCCGAAACCCAATGGGTTCGGGTGTGGGTTTAAGTT CACCACCCATTTCGGGTTCGGGTGCGGGTGCGGGTGTGGGTTTTTGATTTCGGGTTTGGGTTTGGGTTTGGCAAAACCCG CACCCTACTCGACCCATTGCCATCCCTAATATTTTCTGCTTCTGTTTTAAGATGTTTGCCTAAGTTGTTAAGTCTACAAA TACAAGAATGCAAGGAGTTAAAGAAAATCATTGAAGATGATGATGTGGAGGATATTCATCAGGAAATGTACTCAAAATCC CTTTCTCCAAAGACATGCTTCCCAAATCTAGTAGTATTGGGTGTTGACAATTGCATCAAGTTAAAGTGTGTATTTCCGGT TTCCTTTTGTAAAGAGCTTCCCGAGCTAAAAATTTTACATATAGAAAGAGCACCTGAGCTAGAGGAAATATTTGGAAGTG AAGGTGATCAAAAAGTTGAGATTCCAAAGCTAAACTTTGTAGTATTTATTGATCTACCAAGTCTTTGCCAGCAGAGGATT CAATTTCAGACTATACAACATTATTTGGTACGGAATTGTCCAAAACTCTCTTTGTCTCCAACGTTGTTAACGTGGTACGG ATTCAATGCAGTATTAAATGAAACAACGTACCCAACAGGTACACAGTACACACTATAATTATATTTTATTTTATTTTATT TCTTATTAATCAAAGCATTACATACATGTTTGTTGTTAATATATGCATGCATGCGTGGAATCATAAAATATAATTCAACA 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TCTTCCTTTAAAAATTTGCTGCTAGAAAATTGTTGTGCTGATTGTAGCGGGTCTCTTGTATCTTAAGGAATGCCAATAAT TTTTTTCCATCTCTGAAGTTGCATAAGAATTATAAAACTGTTAGCTGTCAAAGAAATGTACTTTGAGAAAGAAAACTTTG ATGTTAATAATATGTGCACTTACCTGTATACTATAGGACCGCACCAAAGATTGATTTGAGCCACTGTCCTTTTTAACTTT GTCTTGGATGTGCTTACTGAACAAATCTATAGGCCTGTGCTGTGATACATGTTCTTTTTTTAAGATGATATATTCCTAAT TGGAGAGTTGAAAAGAAACTGTAAAGGTAGAGATATGAAAACAAGCTTCAAAACTCAAAAGTGCATGACCTTCATTTATA TAGAAGTAACACAGAGTATTTAAGTTCAGCTAAAGGCACATTAGTTCTATCTTGGGGGTGAAAATTGGAGACCATATCAT TCACTAATCACGTCGTTGAAGTATCTTGATTCCACCATACAAAATAATGGGGAAATGAGATGAGGTGTAAGCCATAGGAT TCAAGCGGAGTGGATGTAAGGATAAGTGCTTTGAGTATAATTTATTACAGAAACGTACCACTCAAGTTCGATGGGAATTT TTAATACAGCTATATGAAACATGTAATGTTATATGGAATGAAATGCTGAGCAATAAAAAGCTAATACGAATCAAGCTCAA TGTGGTAAAGATGAGAATTTTATGATGGATGAGGTGACACACAAGATACTATGGAGGGCATATCATATGGAGGGCTGTTC AATAGTTAGAAGTAGAAGGAGGACAATAAAAGCTATTGGCCAAATCATTAAGAAGAATCTGGGTTTAATTAGTTTCTCTT CAGACATGATTTACAGAAGAAAATTATTATGTCATTTGATTCATGTAGTTGACCCTACCTTGTGAGAAAAAGGCTTTTGT TCTACTTGTTGTTGGGTATAAGTGCGTTTTCTTAATTTAGAATTTTATGCTGCACAAATTATGTAATGTCATATGGCATC ACTGTTGCGTGAGAGAACATTTTCTTAAGCTGTATCTTTTTTCTTTTCTTCTCTGTAATCACAACTTAATATAGTCTGAG AACATTTTTCGTACGCTGTATCTTTTATTACTTCAACGAATCTGATATTTTTATTACTTTATATATCATAACAATATAGC CTTTAATTGACAATTGTTCATGGAAATATGGCTTGACCTCAATCATTATTTTTGAATGTTATTCGATCTGTTCCTTGGCA ACATAACATGTGAAGATTAGATGCGTATCGTCAAACTGCATGATGCATGTCTGCTTTATGATGTGGGGTTTTGCATCTCT GCAGATCAGCAGTCTTGAGAGGGAGTTTTCTTCATACAAAGTTCGTGCACATGCACTTCTTCAAAAGAAGGATGCAGACC TGGCTGCAGCTCAAGACTCTGAACAACTCAAAGCTCTTGAGGAAGCTCTGAAAGTACATGCTTCTCATATTCTCAAGAAG AGAAAATAGTTCAATTAATATATATATATTAATCACCAATCGCATTCTCAATTTTCTTTAGGAAGCTGAAAATGAAGTCT TATCAATAACAGAAGAAAGGGATAGAGTTCTTCAAGATCTTCAATCTTCTGCCTCTAATCATGAGAGAGAACTTGCAGAA AGGTGTCATTATTATTAACAAATCTTATTGGGCCTGTATACTTGATATGTCACTTTAAATGCTATACTGATGACAAACAT ATTGCTGGAAACAAAAGATGAATAACAATTAAATGATTTTGTGAAAAACTAGCTTTATCCCATTGGTTTGTGCTTTACTG CGGGGGCTAAATATTGGATACACTACAATAGTTACCTTTTTTTTTTCCTTTCTGGAGTGAAGCATTAAGGCTCACATTTT ATGAATTTCAGAGACACGGCCCTTGAAAATGTCAAGCAACATATAAGGAGCTTAGAAATAAAGCTTGATTCAGCCAGTGC TCAGCACCTAAAAGAGAAAGAGGAATGGGGACTAAGCCTTCAAAATGTAGAAGAAACCTGGAGAAGTAATACTCTCTTGC ACTTGGTTAAATAATTGTTTATACTTTCTTTGATTCCCTTACCTATATGAATATGGCATCAAACGTTGCAGTCAGATGCG AGGCGATGAAGGCTGAAAATGAAGCAACTGTTGCAGAAGCTACGCAGAAGGAACTGGAAGAGCTCAAACAGCGATGTAAA AAACTGAAGGTAATCTGCAAATTGTCACCTGTGCTTGGACTTTTTCCTCCCCCCTAATAGTGTTTTTTCCCATCTTTATT ATTTTGTGCTAACTGACTCTATAACTTGTAGGAAGAGCATGCTTCATTTCATGATCTTGCTGATAGAATGATTGAGGACA AAGACAGTGAAATATCCAGACTTTTAGATGAAAATAAAAATCTTCGCCAGTCTCTTCAATCAAGGCCAGCAGTATGTTTT TTTATCTTCTTTTATGATATCATGAAAGTTAAGTCATTGGTAATGTTTCATACTGAACATTTTCATGGTCTTGTGTATTT ATTCTACTGGTGTCACTATGCTGTCAAATGATCTCAGCTTGATCAAAATGATTATTATAGCACAGGTATTAATTTAATTA CAGTATGATAGTATATGTTCTACTTGTAGAGTTTGGTTAAAGTATTTCCTCAAGTGTATGAACACTTGATTGTATTGTTG CCATGCCTATGCTATTTGTTATTAGAAGTCAACTGTCTAGGGGTGATGAGTGACATTTTATCTTCTACTGTTATGTACAG CCTTGCATAAATTGGATTCAACAAACTTAAGTCCCTCAGCTGCAGAGCAACAAATTCTGGTATAGCATTCTTCAGTTCAA TTCTTAGCTTAATTTTATTTATATCTGTAAGACATTGTAAAGATATTTAATATTTAAGTATCTAAGAAAGTTGCATATAG AAATTTAGTCAGTTTTGAGAAAGCGAATACAACTGTTTCAGTTGTCCCAATGACAGGACCCTGGATCCTCTATTTTTTTT CCTCTTTTTTTCCGGGGGGAGGGTGTTGTAAGAAATAATGAATCTGGAAGAGAGATTTTTAATTCAGAGTATACAAGACT TTCTTACATGCACTCTCACATCTATTTTAATATATTTTGGAGGATTCATCATTGTATCTTGGTTTTGATATTTGTCATAA TTTCAGATTTTGGCTAGACAACAAGCCCAAAGAGAGGAAGAGTTGGCACAGTCACAGCGCCATATTTTAGCACTTCAAGT AAGTCTTTGTCTCCTTAGAGTGTTCATCACTTACACTTACTGCCCCCTTCTTTAATGCTATATATAATATAATACTGCTA ATTCAGGATGAAATTGAGGAGCTTGAACGTGAGAATCGTCTCCACAGCCAACAGGTATATGTGTGTGCAAACTGCAAAAT TTAATTGTCTTTCATATGAAAGTATGGAATGAATGGCTCAACATTGATTGTTACTTTAACTGCACGACTTATATTCTGGG TTAATTTAAAACTGAAGTTCTAATGTGATTTTATGTTTGTAGATAAAATCACTTGACAAAGAAAGAAAATCAATACCATG GATAGTGTTAATAATAGGTAGACCTGAGGGTCAAATAATGCTGCTACTATTAGGATCAGGATGAATAGCCTAAAGTTGAT ATGGTGGAAGAGGCAATGAAGTTGAACTTAGATTTAAGGACTTCAATAGTGCTTTGACTGTGTACCTTTTTCAGCAATTG ATCTCCTAAACCGAACACTTAATTATGCATCAAAAAACTTATAAACAATCAGATACTTAAATGGAATTCTTAGTTGTGCT CGTTTTCCATGAAATAATTCAGACTTGAATCTGTTTTTGGTCCCTTAAAATTTGACATTTTCTGGAATATCAGTCCCTCT TCCCCCCCCCCCCCCCCCCCATTTTTAGTCTCTTCCAAGGTTCTTTTAGGGACTTAATTTTTTTTGAAGTTACATTACAT TAAATCCAAAGAATATAATATTCAGAGATAAAAAATATATTTAAGCCAAATTAAGCAGAAAATGTTCTCATGCTACGTGT TTTTAAAATTTGTGACTATTGAAAAATAAATATTTGAGCATTCTTTGAATTAGTGGTTCAAACTATTTAATTATTATTAA ACATCTCAGCATATAACAACCTACGTATATTGATTTCTATATATTATGACTTTAGGAAGCAGTGTTAAAGGCTGAGCTTC GCGACATGGAAAGAGCAAAGAAAAGGGAAGGTGTAGATATGACGTATTTGAAAAATATTATCTTGAAACTTCTTGAGACA GGTATGAATTTCAAAAGATAAATAAATAAATTAAGAGGTCCCTTTTTTTAATCTCCTTGGCATTTTCTAACTAGTATTGA GAAGCAAGTGTAATTAATATGAACATTTTCTTTGATCAGGTGAAGTGGAGGTATTGCTACCAGTTGTTGGGATGCTGCTT CAGTTTAGTCCAGAAGAGGTAATATAATCTTCTACTCTGCATCCCTAGGGCTTTTATTTGGTAGAGATAGGACGGGGAAA TTTATTGGGGGAATGCAAAGTAAAGAGGTGACAGACATCTCCTGAATTAAATTTGAGAGTTTTTATTAGACATCACTTTG AAGTCATTTTAAGTTGCAAAAATCATTTGACCAAGACTGAATATCCTCCAATGAGATGTAGGCAACTAGGCTCATCAATT GGCACTATAGTGAAGTAATCCTTATGTTTTAACTTTTAAACACGTTTTCTGTATACCAAGACTTTCAAATATATGTTGAG GCATTTAATTGGATGGTAAATTTTTTGCTCAAAACAGTGCTTCAAAAAGTTTTGCTGTCATACAACTCTTTTGTCTTTGG TCTTCCCATAATTTTCCTGATATTATCTTTAACAAGATGTCCTTCAGAAGAATCAAAAGCTGTTACTTAATTATTTTTAC GTTGCAGCAATTTCTTAGTGCCTAATTGAGTGTGAATTATATCTATTCCAAAAGTTATGTACACGAATGAAACTGAAATT CTGAAAATTGATTGCAAGTGCAGATGCAGAAGTGTCAACAGACATATCGTAACACAGCAGATGTTCCGCCGACTCCAAGT CCAACAAGTGATGCTTCAGGATCTGGCCTATCTCTTTTCTCAAGGTTCCCATTTTCATAATCGTGTAAATCGGAATGCTG GAGAATTCTTTTGCTGATGTTCTTCTATCTTCCATCTCGAGTGTAGTATGTTAATTTACTTACTGTTACTAAGAAAGCAG ATTTGTATCTGTAAATTAAATTAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGAGGTGATCGTAGGTGGGTTACAAGTTTCAACAGCA ACTGTTCAGTTGTAGTGTTTGGAAGGCTATATAAGCTGGAAAGAAACATTAAAGATACTATACAACAAATATCACAACAG GGTGGGAGAAGTCACAGGGTGTTCTGCCTTTTATCTGGTTGAGGGACAACAATATAATTCATTTTTTACCATTGTCGAAG AGTTTTGCTAGAAAACTGTAACATATTTTATATGTATATGAATTTCCAATTTGGCAAGGCCAGAGGAATGAAAGTTCTCC TTTTGGTTCCATAATTGTAAATCATAACAATGGTTTTTCAGTATTTTCATGTAGTTTTGTTGTTTCATTCATTCGTTAGA ATTTTCATACGGGCATATGGCTTGGATCCTCTCTGCTGACATGAGCACTTAAGAGATATCAGCCGTGCAAAATATTGTAG GAGGAAAATATTTAACATTTTAAACAACTGAGGTCTTACTCTAGTAGTCATGTCATTGGAGATGATCCATTTCCAAAGTG GTGTATTAGCAGGACATAGAAGGGGAAACAAACTTAAATAATCATACCAAGAGAGTAGAGATCTCACATAGGGGGGAAGT GAACCCCATCGAAGGGGGAGAAGCCCTTTTGATAGTAAGTGGTTATTGTGCTATTCCCTGCTAGATTATTCTTTAAAAAG TATGTTTGTTTTTAGATTTAACCCCTTGAAAGTTATAGTGTCACTTTAGATGATAAAATAAGCTATTATAATTGTTCATT GAGAAAACAATGAGTGGGATTTAAAGAACATTATAATTTATTATGCATGTACAAGTATAGAATCAGGTTCAGAACCATCG ACAATAGTTGTAATGACTTATTTCCTCACTTTAGTAGAGTTAAATCTTTTGTTTCTTGGTCACAATA 

CDS sequence (LotjaGi2g1v0356300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCATCAGATGAAGGTGATAATAGTGTTGGAATGACGGAAGTTCATGCGGAAGTTTCAGTTTCGTCTATTCCCGAGGA GGATTTGCGTGATGTGAATCATAAATACAAAGATGGAAGCAATGTAAATCTGATTTTGGAAAATGGCTTCTCTGATGGGA AAGAAGGTCAGGTTGATGATACGCACGATGAGCTTCTACAAATGGCTGTTGACCTTAGATTTCAGAATGAGTTCTTGAAG TCCCAGTTTGAGGGATTTAGCAATGTAAATACTGTACCTAGTGGCTTTAATACAGAGAAAGGAGTCGGTGACAGGGAAGA TGGGGAATCCGACATCGTGAAAGAACTCCAGGAAAGGTTAGAATTGTTGAATAAAGAATTTCTAGAAGAAAAACAAACAA GAATTGCGTCCGAAGAGGCTTTGAAGCACCTTCAAGTGGCGTACTCAGAGGCAGAAGCACAAGCCCAAAAACTCTCTGAA AAGCTTGTAGAAGCTCAAACAAAATTGGAGCAAGAAATAAAAGAACGTGAAGAGAAGTACTCTGAACTTGACTCCAAGTT TAATAGGCTTCACAAACGAGCAAAACAACGTATTCAAGATATTCAAAAGGAAAAAGATGATCTTGAGGCACGATTCTCTG AGATCAATGAAACTGCTGAGCGAGCATCATCCCAACAGTCAGCATTGCAACAAGAGTTAGACCGCACAAGGAAACAAGCA AATGAGGCATTGAAAGCCATGGATAGTGACAGGCAACATTTAAGAAGTGAAAACAACAAACTTAGAGATACCGTTGAGGA TTTACGGCGTTCATTGCAACCTAAAGAGAGTGCTCTCGAGGCAATGCAACTGTCACTTGCAGAAAAGGAACAGATGTTGG AAGATATGCGAGGGTTGCTTCAGGCTGCTGATGAAAAAAGGCAAGCTGCACTAGCTGAGCTCTCAGCAAAACATCAAAAG AATATAGAAAGTTTAGAGGCTCAACTTAATGATGCATTCTCCGATAGAAGAAAGGCAACTGAATCCATTTCTTCACTGCA GGTTCTAGTTGCAGAGAAAGAATCGAGAATTGCAGAAATGGAGGCAGCATCAACTGGAGAAGCGGCACGACTCAGAGCAG CTGTGGAAAGTGTGAAGGGAGAGCTCTCTCACCTCAAACAAGAGCATGAAAAAGAAAGGGAAAGCTGGCAGAGTGCATCT CAAGCACTTAAGGCAAAACTTGAAATTGCCGAGAGCAACTGCATACGTGCCGAAGTTGAAGTTGCCAAAATAAGAAGTCA ATTTGAATCGGAGCTATCTTCACAATCCAGGATCCTCAGTATGAAAGATGCCGAATTGTTGGCTGCGAAGGAAGAGATCA GCAGTCTTGAGAGGGAGTTTTCTTCATACAAAGTTCGTGCACATGCACTTCTTCAAAAGAAGGATGCAGACCTGGCTGCA GCTCAAGACTCTGAACAACTCAAAGCTCTTGAGGAAGCTCTGAAAGAAGCTGAAAATGAAGTCTTATCAATAACAGAAGA AAGGGATAGAGTTCTTCAAGATCTTCAATCTTCTGCCTCTAATCATGAGAGAGAACTTGCAGAAAGAGACACGGCCCTTG AAAATGTCAAGCAACATATAAGGAGCTTAGAAATAAAGCTTGATTCAGCCAGTGCTCAGCACCTAAAAGAGAAAGAGGAA TGGGGACTAAGCCTTCAAAATGTAGAAGAAACCTGGAGAATCAGATGCGAGGCGATGAAGGCTGAAAATGAAGCAACTGT TGCAGAAGCTACGCAGAAGGAACTGGAAGAGCTCAAACAGCGATGTAAAAAACTGAAGGAAGAGCATGCTTCATTTCATG ATCTTGCTGATAGAATGATTGAGGACAAAGACAGTGAAATATCCAGACTTTTAGATGAAAATAAAAATCTTCGCCAGTCT CTTCAATCAAGGCCAGCACTTGATCAAAATGATTATTATAGCACAGCCTTGCATAAATTGGATTCAACAAACTTAAGTCC CTCAGCTGCAGAGCAACAAATTCTGATTTTGGCTAGACAACAAGCCCAAAGAGAGGAAGAGTTGGCACAGTCACAGCGCC ATATTTTAGCACTTCAAGATGAAATTGAGGAGCTTGAACGTGAGAATCGTCTCCACAGCCAACAGGAAGCAGTGTTAAAG GCTGAGCTTCGCGACATGGAAAGAGCAAAGAAAAGGGAAGGTGTAGATATGACGTATTTGAAAAATATTATCTTGAAACT TCTTGAGACAGGTGAAGTGGAGGTATTGCTACCAGTTGTTGGGATGCTGCTTCAGTTTAGTCCAGAAGAGATGCAGAAGT GTCAACAGACATATCGTAACACAGCAGATGTTCCGCCGACTCCAAGTCCAACAAGTGATGCTTCAGGATCTGGCCTATCT CTTTTCTCAAGGTTCCCATTTTCATAA 

Protein sequence (LotjaGi2g1v0356300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MASDEGDNSVGMTEVHAEVSVSSIPEEDLRDVNHKYKDGSNVNLILENGFSDGKEGQVDDTHDELLQMAVDLRFQNEFLK SQFEGFSNVNTVPSGFNTEKGVGDREDGESDIVKELQERLELLNKEFLEEKQTRIASEEALKHLQVAYSEAEAQAQKLSE KLVEAQTKLEQEIKEREEKYSELDSKFNRLHKRAKQRIQDIQKEKDDLEARFSEINETAERASSQQSALQQELDRTRKQA NEALKAMDSDRQHLRSENNKLRDTVEDLRRSLQPKESALEAMQLSLAEKEQMLEDMRGLLQAADEKRQAALAELSAKHQK NIESLEAQLNDAFSDRRKATESISSLQVLVAEKESRIAEMEAASTGEAARLRAAVESVKGELSHLKQEHEKERESWQSAS QALKAKLEIAESNCIRAEVEVAKIRSQFESELSSQSRILSMKDAELLAAKEEISSLEREFSSYKVRAHALLQKKDADLAA AQDSEQLKALEEALKEAENEVLSITEERDRVLQDLQSSASNHERELAERDTALENVKQHIRSLEIKLDSASAQHLKEKEE WGLSLQNVEETWRIRCEAMKAENEATVAEATQKELEELKQRCKKLKEEHASFHDLADRMIEDKDSEISRLLDENKNLRQS LQSRPALDQNDYYSTALHKLDSTNLSPSAAEQQILILARQQAQREEELAQSQRHILALQDEIEELERENRLHSQQEAVLK AELRDMERAKKREGVDMTYLKNIILKLLETGEVEVLLPVVGMLLQFSPEEMQKCQQTYRNTADVPPTPSPTSDASGSGLS LFSRFPFS 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
MobiDBLite 1 26 26 -
PANTHER 32 808 777 0.0
PANTHER 32 808 777 0.0
Coils 106 133 28 -
Coils 141 271 131 -
MobiDBLite 246 265 20 -
Coils 279 363 85 -
Coils 368 427 60 -
Coils 439 466 28 -
Coils 473 514 42 -
Coils 533 560 28 -
Coils 578 615 38 -
Coils 620 640 21 -
Coils 688 732 45 -
ProSiteProfiles 730 777 48 12.269
SMART 733 777 45 2.2E-17
Pfam 734 773 40 5.4E-12
MobiDBLite 776 799 24 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi2g1v0356300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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