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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi2g1v0367000 |
| Transcript ID | LotjaGi2g1v0367000.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | E3 UFM1-protein ligase 1 like; TAIR: AT3G46220.1 E3 UFM1-protein ligase-like protein; Swiss-Prot: sp|Q9LX73|UFL1_ARATH E3 UFM1-protein ligase 1 homolog; TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2QP99|A0A0B2QP99_GLYSO E3 UFM1-protein ligase 1 like; Found in the gene: LotjaGi2g1v0367000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr2:86415186..86433009) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GGGGTATAAATGTATTTTTGCACTTAAGGGGATGGTGTGGATAGTAAAGAGGGATGGTCCAAATAGTCTCTGCCGATATT TTAAGTGTATAAAAAAAGGAAAAAAACATTCATCAAAATGAAAAAAAAATGAAGTGACAACCGTCATAGTTTGAGGCGTC ACATAAAACCGAAGTCTCGGTGATCAAAACCCAGAACCGGAAGAAGAAGAAGAAGGAGCAGAAGATACGCATAGCAATTT CCTGAATCATGGACAACGAATTGCTGGAGCTTCAGCGACAATTCGAGTTCGCACAGCAAGCAAAATCAAGCATCCGATTA TCTGATCGGAACGTCGTCGAATTGGTCCAGAAACTGCAGCAACTCCAAATCATCGATTTCGACCTTCTCCACACTGTTTC CGGCAAAGAATACATCACTCTCGTTCGTTTTCCCCTTTTCCTTTTCTCGATTAGGTTTTCTCATTCGCAATTTCATTGAA TTTGAATTTCATCACTAATCAAATGCTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTGTTATTAATGTGATTAGGA TCAACTGAGAAATGAGATGGTGGAGGAGGTGAACAAATTAGGGCGAATTTCTGTCATCGATCTTGCTGAAGCTACTGGAG TGGACTTGTTCTATGTTGAGAAGCTCGCTCACAGCATTGTAACCGATCACCGAGAATTCATGTTGACGCAAGGGGAAATC ATCACGGAATCGTATTGGGACTCGACCGCGGAAGAGATTAACGAGCGGCTTCAGGAATGCAGCCAGATTGCACTCACAGA AATTGCGGGACAACTGAATGTTGGTTTGGACCTTGTTGCCTCAGTGTTGGAGCCGCGCCTGGGAACTATTGTAAGTTTTT TGTGATGGCATTGTGTTTGGAATGACGAAATGATTGATTTGATGACCGGTTATTTTGGATATAGGTGAAAGGAAGGCTTG 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CDS sequence (LotjaGi2g1v0367000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGACAACGAATTGCTGGAGCTTCAGCGACAATTCGAGTTCGCACAGCAAGCAAAATCAAGCATCCGATTATCTGATCG GAACGTCGTCGAATTGGTCCAGAAACTGCAGCAACTCCAAATCATCGATTTCGACCTTCTCCACACTGTTTCCGGCAAAG AATACATCACTCTCGATCAACTGAGAAATGAGATGGTGGAGGAGGTGAACAAATTAGGGCGAATTTCTGTCATCGATCTT GCTGAAGCTACTGGAGTGGACTTGTTCTATGTTGAGAAGCTCGCTCACAGCATTGTAACCGATCACCGAGAATTCATGTT GACGCAAGGGGAAATCATCACGGAATCGTATTGGGACTCGACCGCGGAAGAGATTAACGAGCGGCTTCAGGAATGCAGCC AGATTGCACTCACAGAAATTGCGGGACAACTGAATGTTGGTTTGGACCTTGTTGCCTCAGTGTTGGAGCCGCGCCTGGGA ACTATTGTGAAAGGAAGGCTTGAAGGTGGTCAATTGTACACCCCTGCATATGTTGCTCGTGTTAGTGCTATGGTTCGTGG CGCTGCCAGGGGAATCACGGTTCCGACGAATCTGGCGGTGTTGTGGAGCTCCTTGCAGCAGTTGCTGCAAGAAATGGATG GAGCTAGTGGTGTGGCTGTTGAAGGAGCTTTCTTCCAGTCGTTGTTTAATGGACTTGTGAAGGGAGGGGAGATTTTAGGG TCGGTTCGTGCTGGAGTGCATTGGACACCCGCTGTATTTGCTGTTGCTCAAAAGGAATCTGTGGATTCATTCTTTTCACA GAATTCTTTTATCAACTATGAGGTTCTGCACAAACTTGGAATTCCCCAGCCCATTCAATTTTTGCAGTCCAGATATCCTG AAGGCAAACCTCTTGTTACAACATTTGTTCACCCATCTATGATCGAGATGCTAGATACTACTACTGAGGATGCTCTTGAG CGTGGTACCTGGAGTGATTCTCTTTCTTTATTGCCCTCATCATTTACGCCTCAAGATGCATCTAAAATGTTGTCCCTCTG TCAATCTGTTCAATTGGCTCTTAAGTCTAACAAAGCACACATTTTTGGGGATGTTTATGTGTTCAGCAGCAGCTTTATGA AGGAAATCTGTGATCGCATGGTAAAAAAATTGGAGACGTTGGGCATTTTAGGGTCTTCTGGCACTGCGATACCTGGTGAT TCACAATCAGCCAATGAAGCAAAAGTAGGGTTTGATTCAAGTAGGTTGAATGAATCTAATGAAATGGTGAGTGATGGTGG TGCCAGCAGGCATGCTGATAAAGGGTCAAAGAAGAAAAAGGGTAAAGCCTCTGGAAATGCAGCAAATCAATCTGAAAGTG GTCCAGATAACCAAGAACAGACTTCCACAAAATCTAAGAAAAGCCAGAGAAGGGGTAAGGATACATCTTCACAAATGTCA GTTTCAAAGCCAAGTTCTAGGAAAGAATCACTTCAAATGAAAGAGGATAATCACAGTAGTCCCTCAGAAGAATGGATCAT GCAGAAGATTGCAACCTTGATTCCTGATTTGGAAGAACAAGGTATGGATGATCCTGAAACAATTCTTAGGCCTTTGGCTA ACAGATTAAGGCCTACTATAATAAGTTCTTGGATGGAGAAAAAGAAGGCATTACTTGCAGACAATGCAGAAAGAATGAGA CATTTACTTGATAATTTGCAGAAGAAGCTTGATGAGTCTTTCTTAAACATGCAGCTGTATGAAAAAGCCTTAGAATTGTT TGAAGATGACCAATCAACATCTGTTGTTCTGCATAGGCATTTACTAAGGACTGTAGCAGCTCCTATGGTGGATATGCTTC TTCATAACCTGGATGAGCACAACAAATTAAAGAATGGACTTGATGTGCAGGAAGCTCCAAATTCCGAATCTGTTTCATTT AGTCCTGGAGACAGAGCTGCAGTTTCTAAGAGTTTTCCAGGAGCTCTTGCTGCTGTAGAAGCATTGGAAGGAAAGAGGAT GGAAGTATTCATGGATGCATTTAGAATGGTAACAGAAGAGAGTGGGTTACCTTTGAAAAAACTTGACAAGAAACTAGAAA GGACACTTTTACATTCATATCGGAAGGAATTGACATCTCAAGTTTCTGCTGAGACTGACCCTGTGTCACTTTTGCCAAAA GTTGTGTCTTTACTCTATATCCAGGTTCACCACAAAGCTCTTCAAGCCCCTGGAAGGGCCATTTCGGTTGCAGTTTCCCA ATTGAAGGATAAGCTAGATGAGTCGGCATACAAGATTTTAACTGATTATCAATCTGCTACTGTGACTCTTTTGGCACTAT TATCAGCTGCACCTGATGATGAGGAGAGTTGTGCATCCGATAGAATTTTAAGTAAAAGGGAGCTTCTGGAGAGCAAAATG CCGGACCTCAAAAGTTTGGTTTTGAGCACCTCACAGCCTTCATAA
Protein sequence (LotjaGi2g1v0367000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MDNELLELQRQFEFAQQAKSSIRLSDRNVVELVQKLQQLQIIDFDLLHTVSGKEYITLDQLRNEMVEEVNKLGRISVIDL AEATGVDLFYVEKLAHSIVTDHREFMLTQGEIITESYWDSTAEEINERLQECSQIALTEIAGQLNVGLDLVASVLEPRLG TIVKGRLEGGQLYTPAYVARVSAMVRGAARGITVPTNLAVLWSSLQQLLQEMDGASGVAVEGAFFQSLFNGLVKGGEILG SVRAGVHWTPAVFAVAQKESVDSFFSQNSFINYEVLHKLGIPQPIQFLQSRYPEGKPLVTTFVHPSMIEMLDTTTEDALE RGTWSDSLSLLPSSFTPQDASKMLSLCQSVQLALKSNKAHIFGDVYVFSSSFMKEICDRMVKKLETLGILGSSGTAIPGD SQSANEAKVGFDSSRLNESNEMVSDGGASRHADKGSKKKKGKASGNAANQSESGPDNQEQTSTKSKKSQRRGKDTSSQMS VSKPSSRKESLQMKEDNHSSPSEEWIMQKIATLIPDLEEQGMDDPETILRPLANRLRPTIISSWMEKKKALLADNAERMR HLLDNLQKKLDESFLNMQLYEKALELFEDDQSTSVVLHRHLLRTVAAPMVDMLLHNLDEHNKLKNGLDVQEAPNSESVSF SPGDRAAVSKSFPGALAAVEALEGKRMEVFMDAFRMVTEESGLPLKKLDKKLERTLLHSYRKELTSQVSAETDPVSLLPK VVSLLYIQVHHKALQAPGRAISVAVSQLKDKLDESAYKILTDYQSATVTLLALLSAAPDDEESCASDRILSKRELLESKM PDLKSLVLSTSQPS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 808 | 808 | 3.7E-253 | – | |
| Pfam | 4 | 288 | 285 | 1.6E-94 | ||
| MobiDBLite | 393 | 502 | 110 | - | – | |
| MobiDBLite | 395 | 424 | 30 | - | – | |
| MobiDBLite | 443 | 462 | 20 | - | – | |
| MobiDBLite | 488 | 502 | 15 | - | – | |
| Coils | 549 | 583 | 35 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi2g1v0367000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…