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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0057700 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0057700.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class), putative; TAIR: AT5G17880.1 disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class); Swiss-Prot: sp|Q40392|TMVRN_NICGU TMV resistance protein N; TrEMBL-Plants: tr|A0A151RE93|A0A151RE93_CAJCA TMV resistance protein N; Found in the gene: LotjaGi3g1v0057700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:5979025..6001958) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACAAAAAAGAAAAGACTGCAGCTAGTTGGTCGTTTATATATATTGCCTTAACAACTTGTAACCAATTGACGACAACTAAT GTTCACACTTGATATTTCTCTTGGCCTCACTTTCAGTATTAAATACCGATCAGGACGACATATGCAAAATATGCAACCAA TCAACAACCTGTGTGCTAGCTTCAGATGACGCGTTAGTCAAATCCAGTTTTTTATTTTTGAAATAAGAATTTGCCTCAAG AAAGGTGAGTGTCAACAAATCACACCCTATACTAACTACAATATTTTCATAGTATTTATTGATTCATTGCAATTAATAAA CATTAGTGTCACTGTTTTCTCTCCCCCATCGATCTGCGCTTAGAAATTTCACTGTATTTTCGCAAGCAAGGAGCCTAATT AAGGCAAATGTTATTTAAAAACAATAAATAATGAAATGAGTGTGAATGCATCGTGTTATAAAAATGCCAATGACAAGCAC ATACACACCCACTAACATTTGCAAAGCAAGACAGAGAGCAACAAATATTAATTTTTTTCCCACCACTCCCACTGTCATGG ATGAATTCTTCTATGATGTTTTCCTGAGTTTTAGAGGTGAAGGTGGAACCCGCTACGGGTTCACAGATCATCTCTTCACT GCTTTGAGGCAAAAGGGAATCCACACTTTCAGAGATGATAAGGAGCTGAAAATTGGAGCAGAAATCGGACCTGCTCTTTT GAAAGCAATCAGAAATTCCAGAATGTTAATTGTTGTTCTGTGCCAGAACTATGCATCTTCCACTTGGTGTCTAAACGAAC TCGTTGAGATTATTGACTGTTATGACAAGAAAGGAACGCAGGTTTTGATTGTTTTTTATAAGGTGGAACCTTCTGATGTG TGGGAACTCAAGAATAGTTATGCAGATGCCATGGCTGAACATGAAATGAGATTTGGAAAAGACTCGAAGGAGGTCAAAAC 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AGGTTTTACTACACTTTCCTATATATTTTACTATGTTTTACAACAGCATCAAGTCCTTAATGTATTTCAGCCAAAAAATT CTCCTTGGGGATGCTTTCACAATTAGTTACCATTTTGGTAATTGTATCTTTTTTTTTTTATTCCATTGACTGGTTTACTT GATAATCCCATGTAATATTTAATTTTTTTTCAACACTAGACCAATTTTAACTGTTTAGTAAAAGGCCTAATTCTACTACT CATTAATTATTTGGCTTAACAGTTTACTATCTTTTCAATGTCAGGTTTTTAAAGAGACAGAAAGAATACAGGTCGTGATG CCAAAAACAGAAATTCCGAATTGGTTTGACTGTGTTGGAAGTGAAGATATTCTGGTTTTCTGGGCTCGCCACAAGTTCCC TATTATTGCACTAGCATTTGGGCTCCATGAGATACAAATGGACAGCTCAGCATTCTTCCCTGGAATCATATCAGCTAACC AGTCCCACAATGTTGGCCTGTACTTGTTTATAGACGGCCAAGAAATATGTCACAAAGATTACAATGTTGGGAAAAATCAT GTGTTAGTGTGTGAGTTAAGGGCTTTGTTCAATGATGAAGAGTGGAAGGGTCTTGATGCGCGCCTTGGAGATGATTGGAA GCCTGTTCAGGTTCAATGTAAATCAAACTTGATATTGAATCGTTGGGGAGTTTATGTCTACAAGAGGAAAACTAATGCTG ATGATATCCGGTTTAGTTTTCCCGATTCAATAGACAATGTGCCATCATCATGTTTGGTTCCAAAACCAACTCCAGATCAG AAAATAAAACAAGGTCTTGATTTTGTTGAAATATTTGGCCAGTATTTGAATACTCTTAAATTAGAGCAATCTGCCTATGT TGCAAATGAGCTATTGAGATGGTGGAGGAATTCTAAGGGTGATGTCAAAGAGGAAGTTTCATCCTCTACATATGGAGCTA GTTTAATGCAAGAACACGAACAATGTTTGTGGGATTTGGCACATATTTTAGAGATGATGGAGAATGTAGCAAAACACATC ACTGATTCAAAAGTTCAAAGTGCAGGCCAGTTGGTGATACAATTATTGATGGCGCGTGCACAACCTATGAAGGAAAAAGG CCATGAGACGTTGCACATTAATACAAGCATTCCTGTTATACTGGAGGAATGTGAGTACCACCCTTGTACAGATTTAGCAG AAGCTCCGAGACGTCGCTATTGGGGAAGCGTGGAGCTAGAAGAAGGAGATCCATTTGTGTGGAGAATTTGGAAAAGCAAA GAATCCTTTCAGGAGAGGGTAAGCATTGTTTTGTCAAAATATCAGCATACCTCTACAGAGGGAGCTTCAAGCTCTTGCCA TGGGGGATCCTTGGAGGAAGAAAACAAATATCCTCCTGCATTGGAAGAATTAACTAGGAGGATAGAGCAAGATGCAATGA GGTTGAACAAATCTTATGGGAAGTTGAAGGCTTATTTTGTTCCAATAGATGTCCCAGTTTCTGACAAATATAATTTGGAA ACAGCAATCATCAGAGGACAAGAAAGGTTGGGAAGGTTAGGGTCTAATTTCAACAAGACACCTTATGGGAAGTTGAGGGT GGCGCATGATGATGCTCTGGATACTGTTCATATGCAGCCTGAGTTGAGGGTGGAGCATGATGATGCTTTAGGTACTGTTC ATATGCAGCCTGAGTTGAGGGTGGATCATGATGCTCAGAACACTAGTCAGAGTCAGAAGCAATATGAGTTGGGGGTGAAG CATGTTGCTCAGAGTCAGAGCACTGTCCAGAATCAAAGTAAGAAGGGTTGGACTAAGATTCTTAATTGGTGGATCCGCTG ATGCCTGACGCTCTTGTACTCCCAGCGATGCGATAGGCAAATCCATTAAGGCCACAGCCAATTATGTGATTGCATTAAAA TTGATTTAGATGATATTCATATACGACTTTTTGTACCCCTCGGGTGTAAGCTTCAGCCTTTTAATCTCCTCCCAACAGAT TTGAGAGTGCACTTGTGAAGCAAAGTAGGAGGACAAAGGACAGTCTTTTTTATCCAACCCTTTATGCTTTGAATCTGAAA AGAAAAGATGTCAAACTTTTCAACTGCATTAAGGTATCTGTTTTAGCTACATCCTGAAATGTTTTAGCTTTTTATCTTTT GCTATTGAATGAATGAACTTGTTTATTGGGTGGTCAGTATGTATGCGTGTATCCTGTCGTTAAACTATGTGCTATGAAGC AGAAGAGGATGATAGGATCCTTGATTCTGACACCACTGGCCAAGTGCTTTCAAGGTCCCAGCAGTGGGATAATAATATTG CTGCTAAAATTGCTGAGTTTACAGCAACTTTTGAGAAACAAGCACTTGCCTTCAACATAATATCCCAAAAGAGAAACTTG GGTGAATTCCGGTCTGAGGAGAGATTGATGATTGAACAGGCACTTCTCCAAGAAGAAAAGCGAGCTCTGATGGCCGGTCG TGAAGCACATGAGGCTAAACTTCGGATGGCAGCAATGTATCAAGCTGAGCAGGCCCGGGCAGAATCACACTCTCATGCTG AAATGATGTCGCGAGCCCCCATAAGAGGGAGTGCACTTGGGTCCCAAGGCAGTGGTGATATGATGGGCCATGACATGGGA GAGCAGGATCAGGGAGGTAACCCAGGTGATATGATGAATGGATGGGGGAACAATGCACAGAGAGAAGAGAAGGAGCCATC TGAGGATTTCTTGAATGATGAAGCTGAGAATGGAGACACAGGCACACAGGATGGTTGGCGTGAAGTTGGTGAATTTGATT TGAATGCTAGGTGATTCTCCATAGTGACTGTATAAAACTTTTAAGGGAGAGTTTGAATTATGTTAAGAGATCAATATCCG TTTTAAAAGAATCATTGTCCTTGGTATCTTCAAGTTACCTATCTTAAGATTACTTTCTCGATCAATATCCATTCACAGGG GGGAAGGAAAACTATTGAACCAGTCAAATGTTGAATTGGATGAATGTTCAGTTTATGCTCCTAGATTAGTGTAGTGCACA TGATTGGATTATTAGCTCCAATGGAGTGTTATATAAGCATACAAATTAAGTCCAATATGTATAGGAAACTTTGGTTTCAA AAAAAAAACTATGTGCTATGATAATATACAGTTTAGCTATCCTTTTGTTTCCTTGGAAACATAAATTACAGTGTAAGTTT GGAAACCATCTACAGTTAATTTTGAAGACAAAATCAATTCTGATGAGAAGCTTATGTGAGTAACTTTTGGGTTTTAGAAC CGATTCTGATGAAAGATAAGCTAATCCAAAACATGCTAATAGTCTCTTTTAAGACTTGTACGGTTAACATCATGTAGTAT TGATTGCTGTAATAATGGATCTTCAAAAGGAGTACTTTGCTGAGGCATTTGTGCCTATAGGACATCTTCTGTGCATTTCA TATCATCCAATTTTATTGTCAGTACGATCAATGGCTGCTCCTATAGGAGCTACATTAGCGCTCAAGTTGGACCAAGATTC TTAATTGGATTCGACGCTGACACTCTTGTACCCCTGGTGATATGGTAGGTAAATTCATTAAGGGCACAACCAAATTATGT GATCACACTAAAATCTCAGAATCCTCCAAAAGATTTGAAGCACAAGTGCATTTGTCAGGTGAAGTAGGAGGACAAAGCAC ATAGTGAACTGTTTAATAGTGAACTTGTTTATTGGGTGGTAAGTATGTATGGTG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0057700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAATATCTCCCAATGTCAATCCATAACTCACATACCAAACCTGTCTGGAGCAAAAAGCTTAAGAGCATTGACACTTGA CAGATGTTATAAATTGGAAGGGTTTGATAAATCCTTTGGATTATACATGACAAATCTTGTGTATTTAAGTGCATCGGAGT GCACCATGCTAAAAAGTTTTGTGCCAACAATGTACTTTCCATCTCTCGAAGTTCTTTCATTTAACTTCTGCACATCACTT GAAAGCTTCCCTGACGTAAAACGGAAGATGGATAAGCTGTTAAAGATTCACCTGAAAAATACTTCTATTAAAGAGTTCCC GAACTCCATTCCTAAACTTACTGGGCTTGAGTATGTAGACCTGTCAAATTGTGAAGGGGTCAGAGATTTATCAAGAAGCT TTTTATTGTTGCCAAAACTTGTCACGTTAAAAGTTGATGGATGTTCTCAACTTGGACAATCATTTAAAAAGTTCAAAGAG AGCCTTTCAGTGGGAAATCCTTGCTCAAGTTTAAAGGCACTATATTTCAGCAAGGCTAATCTATCATATGAAGATCTTTA CACAATTCTTGAAATATTTCCAAAATTGGAATTCTTGAATGTACCGCACAATGCATTTGTATCCCTCCCAGAATGCATCA AAGGATCTTTGCTGCTGAAAAGTCTTGACATAAGCTTTTGCAGGAACCTTGTGGAAATCCCAGAACTTCCATTAACTGTT CAGAATGTAGATGCAAGATACTGTCAGTCCTTAAGTACAACAGCATCAAGTGTGCTATGGTTTTTAAAGAGACAGAAAGA ATACAGGTCGTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0057700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MNISQCQSITHIPNLSGAKSLRALTLDRCYKLEGFDKSFGLYMTNLVYLSASECTMLKSFVPTMYFPSLEVLSFNFCTSL ESFPDVKRKMDKLLKIHLKNTSIKEFPNSIPKLTGLEYVDLSNCEGVRDLSRSFLLLPKLVTLKVDGCSQLGQSFKKFKE SLSVGNPCSSLKALYFSKANLSYEDLYTILEIFPKLEFLNVPHNAFVSLPECIKGSLLLKSLDISFCRNLVEIPELPLTV QNVDARYCQSLSTTASSVLWFLKRQKEYRS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 261 | 261 | 1.2E-110 | – | |
| PANTHER | 1 | 261 | 261 | 1.2E-110 | – | |
| Gene3D | 1 | 91 | 91 | 3.4E-13 | ||
| SUPERFAMILY | 3 | 248 | 246 | 2.28E-30 | – | |
| Gene3D | 92 | 266 | 175 | 1.4E-22 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0057700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…