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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0131500 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0131500.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Nuclear-pore anchor-like protein; TAIR: AT1G79280.1 nuclear pore anchor; Swiss-Prot: sp|A4GSN8|NUA_ARATH Nuclear-pore anchor; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0IMY2|A0A0R0IMY2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0131500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:16422724..16455504) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GCTTCATTCCCTTCCCTCTTCATTTTCCTTTTCATCTCTCTTAACACACTCACTCTCTTTCAATTTCTCGATTAGGGCAT CGGCGTTTCCCCTACGAGATGCCGCTATTTATCTCCGACGAGGAGTTTTCGCGGTGCTCCGGCGACACCACCGCCGTCGC CGCCAAGGCGGACTCCTACATCCGCAGCCTCCTCCTCGAACTCGACACCGTCCGCGCCAAAGCTGACGCCTCCGACATCA ACGCCGAGCAGAACTGCTCTCTCATCGAGCAGAAGTATCTCTCTCTCGCCGCCGAATTCTCCAAGCTCGAGTCGCATGTT TCCGACCTCCAATCGTCTCTCGATCAGCGCCAACGAGAACTCTCCGATGTGCAGTCGCAGAATCACCAATTTCAGCTGCA ACTGGTTCGAATCGAATTACCAGAAACCTCGAAAATTCGTAAGCGAAACGCTCTTATTGTTGCTTTGTTGTTTGATTGTT TTTGGTTTTTTTTTTGTTAGGTTGAGAAGGATAGGGAGATTGAGAGGTTGAAGACGGAGGTGAACGAGCTGCATAAGGCG AAGAGACAGTTGATTGAATTGAACGAGCAGAAGGATTCGGAGCATAGCGAGAAGAGCGCTACCATCAAGAGCTATCTTGA TAAATTTGTGAGTATCTGTTTCTCTGCTTGTTTTGGTTTGGTTTGGTTTGGTTTTCTTGGTTAAGGCTCTGTGATTTTTA TGTTGTGTTTCAATGGTGTTATTGAAGATTCGTTTGTCGGAAAATGCTGCGCTTAAGGAAGCACGATTAACTGAAGCTGA GGCCGAATTGGTGCGGTCGCGTGCTGCTTGTGCTCGCCTTGAACAGGTTATTTTCTTAGTATTTTTCGTGTTTGTCGTTT GTTTTTCATACGTTAAGAGCTACCCGTTTGTTTGTCCTGGCAAATGGCTTATTTCTAAACGGAATTGGAAAATGTTTTCA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0131500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCCGCTATTTATCTCCGACGAGGAGTTTTCGCGGTGCTCCGGCGACACCACCGCCGTCGCCGCCAAGGCGGACTCCTA CATCCGCAGCCTCCTCCTCGAACTCGACACCGTCCGCGCCAAAGCTGACGCCTCCGACATCAACGCCGAGCAGAACTGCT CTCTCATCGAGCAGAAGTATCTCTCTCTCGCCGCCGAATTCTCCAAGCTCGAGTCGCATGTTTCCGACCTCCAATCGTCT CTCGATCAGCGCCAACGAGAACTCTCCGATGTGCAGTCGCAGAATCACCAATTTCAGCTGCAACTGGTTGAGAAGGATAG GGAGATTGAGAGGTTGAAGACGGAGGTGAACGAGCTGCATAAGGCGAAGAGACAGTTGATTGAATTGAACGAGCAGAAGG ATTCGGAGCATAGCGAGAAGAGCGCTACCATCAAGAGCTATCTTGATAAATTTATTCGTTTGTCGGAAAATGCTGCGCTT AAGGAAGCACGATTAACTGAAGCTGAGGCCGAATTGGTGCGGTCGCGTGCTGCTTGTGCTCGCCTTGAACAGGAGAAGGA GATTGTTGAGAGGCAGAATGCTTGGCTTAACGAGGAGTTAACGGCTAAAGTTAACAGTTTCAATGAGCTGCGCAAGAGAC ATACTGAATTGGATACTGATTTGACTTCCAAGCTTGCAGATGTAGAGAGACAATTCAGTGAATGCTCTAAATCTTTAGAG TGGAATAAGGGTAGAGTGAAGGAGCTGGAAATAAAGCTTAAATCTATGCAAGAGGAATTAATTACAGCTAAAGATGCAGC TGCAGCCAATGAAGAGCGATTCTCTGCTGAGATCTCCACTGTCAATAAGCTTAATGAGCTCTATAAAGAGAGTTCGGAGG AGTGGTCTAGAAAAGCAGCGGACCTTGAGGGTGGGGTAAAAGCTATGGAGTCATACCTAAAGCAAGTTGAAGATGATTAT AAAGAGAAACTTGAGAAGGAATCATCTGCTAGAAAGCAGGTTGAAAAGGAGGCTGCTGATTTGAAAGAAAAGCTTGAGAA GTTTGAAGCAGAAATTGAGGCAAGCAAGAAGAGTAATGAACTAATTAATCTTCCACTCAGCAGTTTCTCTACTGAACCGT TGCTGACATCTATTGTAGCTGATGGCATGGTTGAGGAAAATAACATGCTAGTGCCAAAAATTCCTTTTGGTGTTTCCGGA ACAGCATTAGCCGCTTCACTTCTGCGAGATGGATGGAGTTTGGCAAAAATGTATGCAAAATACCAAGAGGCTGTTGATGC ATTTAGACATGAACAATTGGGAAGGAAGGAGTCAGAGGCAATATTGCAACGGGTTCTATACGAGTTAGAGGAGAAAGCAG AAGCTATAATAGATGAAAGAGTGGAACATGAAAAGATGGTTGACACATACTCCTTGATGAGCCAAAAATTGCAAAACTCC CTCAATGATAATTCAAACTTGGAGAAAACCATTCAAGAACTGAAGGCTGACCTCAAACGGCATGAACGAGAATACAATCT TGCACAGAAAGAAAATGACGACCTTCGTAAACAGGTCACAGTACTTTTGAAGGAATGCCGAGACATACAACTTCGTTCTG GGTCAAATGGTAATGATGTTGTTGATGTTGCATCAAATATTGCTTTAAGGACAAGTAGAGGGACCGAACCTGAAGATGTC ATATCAGACCACATTTTAACCTTCAAGGACATAAATGGATTAGTTGAGCAGAATGTCCAACTCAGAAGCCTTGTACGCAG TCTTTCTGGCCAAATTGAAAATCAGGAGGTGGAATACAAGGAGAAGCTTGAAATGGAGCTAAAAAAACATACTGAAGAAG CTGGTTCTAAAGTCGCAGCTGTTCTTCAGAGAGCAGAAGAACAAGGGAACATGATTGAATCACTTCATGCATCTGTTGCG ATGTATAAGAGGTTGTATGAGGAGGAGCATAGTCTTCATCTGTCTCATGCACATTCTTCAGAAGCTCTTGCAGCTGTTTC AGAAGTTAGAAGAAACAATCTTAAGACTTCAATTGAAAGTTCACAGGAAATTGCAAAGAAATCCCTGGAAAAAGCTGCTG AGCGTGTAAGATCCCTTGAGGATGATTTAGCAAAGTCTAGGAGTGAGATTATTGTCTTACGAACAGAACGTGACAAGATA TTGCTTGAAGCAAATTTCGCTAGAGAGAGGCTTGATAGCTCCATGAAGGAAATTGAACACCAGAAAGCTGAAGCAAAAGG AATCCTAGCAAGAAATGTAGAGTTTTCCCAGCTAATTGTTGACTACCAACGCAAGTTGCGTGAAAGCTCTGATTCCCTTA ATGCTGCTGAGGAGTTGACTCGGAAACTTTCTATGGAGTTGTCAATTTTAAAGCATGAAAAGGAAGTCATATCAAATGCT GAAAAGAGAGCTTCTGATGAGGTTCGCAGTTTATCTGAAAGGGTGCAGAGCTTGCAGGCTAGTTTGAGTACCATACAGAG TGCCGAGGAAGTTCGAGAGGAAGCAAGAGCTGCTGAGAAGGTAAAACAAGAAGAATATATAAAGAAATTGGAGAGGGAAT GGGCTGAGGCCAAGAAAGAGTTACAGGACGAGCGTGAAAATGTGCAGAGACTCACACTAGACCGGGAGCAGGCCATGAAA AATTATATGAGACAGGTTGAGGATACACATAAAGAGTTAGCTAATGCATTGAGCGCAGTTGCATCTGCTGAATCTAGAGC TTCTGTTGCAGAGGTAAAGCTTTCCAGCCTTCAAAGAAAAATGGGTCCCTCAAATGAAAAGCTTGTCGAAGTCGATGGTG TGAGTGGACCTTCCACTTTATCCAGTGATGAGGTTGTTGCTGAGTTGCAAACCGCAAAGGAGGAGATTGAAAAACTTAAA GAGGAGGCGCAAGCTAACAAAGCTCATATGCTGCAGTATAAGAGCATTGCTGAGGTGAATGAAGATGCAATGAAACAGAT AGAAATTGCTCATGATAATTACAAGATAGAGGTTGACAATGCAAAAAAGGCACTAGAACTTGAAGTTCATGCACTTAGAG AGAAGGTTTCAGAGCTCGAAAATGAATCAAGTTTGAAATTTGAAGAAGTGGCATCTGCAACTGCAGGAAAAGAAGAGGCT CTTACATCTGCGCTGGCTGAAATCTCAAATCTCAAAGAAGAAATCTTAAACAGATGTTCTCAAATTTCAGCAATGGAACT TCAGATCTCTGATTTAAAAGAACAGCTGGACAAGGAGCACCAGAAATGGCGTGCTGCTCAAACCAATTACGAAAGACAGG TTATTCTCCAATCTGAAACAATTCAGGAGTTGACAAAAACATCGGAAGCGCTAGCTTTGCTGCAGGAGGAGGCATCTAAA CTACGTACATTAGCTGATGCTCAGAAAATTGAAAATAGGGAATTAAAGGCCAAGTGGGAAGAGGAGAAGGCAGGTCTTGA GAGGTCCAAGAATGATGCTGAGAAGAAATATGATGAAATCAATGAACAGAATAAAATACTACATAGCCAACTTGAGGCTT TGCATATTCAATGGGCTGAGAAGGAGCGTAATGCAGCTGGAATTTCATCTGGAAGTAGCAGTGCAGATACATTTAGTGAT GCTGGCCTTCAAAATGTTATTAGTTATCTCCGACGTTCAAAAGAAATTGCAGTAACAGAAGTTTCGTTGTTAAAGCAGGA AAAATTGCGATTACAATCTCAACTTGAGAGTGCTTTGAAGGCATCAGAGTCTGCGCATGCATCTCTAGAAGCTGAGCGTG CAAAATCAAGATCATTTTTGTTTTCTGAAGAAGAGTTCAAATCATTGCAGCTTCAGCTCAGGGAAATAAACTTGCTTCGC GAGAGTAATGTGCAGCTCAGGGAAGAAAATAAGTACAATTTTGAGGAGTGTCAGAAATTGCGTGAAGTAGCACAGAAAGC AAGAGTTGAGACAGAGAATCTAGAGAATCTTCTAAGGGAAAGAGAAATTTTGCTGGAAAGTCACAATAAAGAAATTGAAA CACTAAAATTGGAAAAAGATAATCTCAATTACAAGGTTACTGAGTTGCTTGAAAGGTGTAAAAATGTTGACGTGGAGGAT TATGATCGAGTGAAGAAACTTGTTAGAGATTTGCAGGATAAATTGAGAGATAGGGATGCTCAGATTGAGGAAACTGCTAA AGTTCTTTCAGAAAAGCAGGATTCTGTTTCACGTCTAGAGCAAGACCTTTCCAATTGCAGATCAGAGCTTATGGAGAGGG AGAAAAGAATTAACGACATTCTGCATACTGAGGCTAACCTAAAACAGGATACGGAGAAGCATAGGAAATTGCTGGCTCAG TTTAAGAAGAAGATAGATGCTTTGTCAAGGGAAAAGGAAGACCTAGTTAAAGAAAATCAGCAACTTTCTAAACAATTGGA TGAAATTAAAGGTAAAAGGTTGACAAGTGATACAACTGCTGAACAAGCAATGAAGGAGGAAATGGACACCAGAATACAGA CTCTGGAAAAAACAGTGGCAAGACTAAGAGATGAAGTAAAGAAGGAGAGGGAAGACAAGAATATGGAGAGAAACAGGAGA TTGAAGACTGAAAAGGCCATAAAAGACTCTTACAACAATGTTGAGCAGGAGAAAAAACAGTTTATTAATGAACTTGAGAG GCATAAGGAAGCTCTGAAGCGGTTATCAGATGAAGTGGAAAAACTTAAGATTGTTGTTGGCAATCTTCCCGAGGGATCCG ATGTAGCCCAACTTCTTTCTGGACCCAATGTCGATGACTTCTCTGCTATTTATATGTCCGCTGTTGAAAATTTTGAAAAG GTAGCTCAATCAGTAATTAGCGAGTTTGGAGGCCGTGGCAATCTTGGAGATGCAACAGCAACTACAGATGGTTCAGCAGC TGCTACAGGTTCTGTGGTCCATGCTCAATCTCAAAGCATTATACCCTTGGCGGCCTCTGGAACAAGCAACTTACCACCTA AAGCCACTGGGGAAAGTGAGAAAAGACTTGCATTGCCTAAATCTGTTGTTGAAACTCGTAAGGCAGGTAGGAGGTTGGTC AGGCCACGACTTGTAAAACAGGATGAGCCACAAGGTGATGTAGAAATGTCTGAAACTGAAGGGCTAGGGGGCAAACCTGG GCCTTCTAGTGACACAGAAACACAAAGCAATTTGGCTCTATCATCTCAACCATTGGCTCGTAAACGTGTTGCTCCTACCT CCACTTCTGAACTACTTGAAGAATCTGTAGCTCCTGGTGACAAGAGCTCTGAACCTTTGGTAAAGAAGTCTAGAGGAGTA GAGTCCCAAGAAGAGACTGGCGAAGAACCACCTGCTGCAACTTCAGAATTTAGTGGCAGTCACCCAGCAACTGAAGAATC ATTTGAAAGTGGGGAGCTGCCTCAAGGCCAAAATGAGGAACTCGGTGATGCTCAAAATGATGACGGTGAGACTGCTGTTA GTAAAGATGAGGAGTCGAAAGATCCGCAACAGTTCGATGGTACTACGAGTCAAGAGGAATTACAAGGTGACAAGACTGGA ATTTCAGAAGAGAATCCAGATCAATCCGCTGAAGCAAAAATACTCTCTGATGAGATGCAGATGGATCACCCTGAGCCAGA CAACCAGCAGCCGGGTAGTGACAGAGAGGAGGGAGAAATGTTGCCAGAGACCGGAGATTCTGAAGGTGAACCCCAAGAAT CTCGGGAAGGTCCATCTGACCCTGTTGCATCCCCTGAACCTTCCCCGGCTAGGGTTGATGATGAAGGTTTAGAGGCTGGT GAGATCAATTCTCCTGATCTGTCGAGTGAGGATAAGAATGATGAGGGTGACTTGGTTGAGGAGGCAGCTGATGGTTCGGA TAAGTTAATTGATGTTAACGAAACTACATCAGTTGAGAGTGATCCGGTGGCTGAGCCTGCGCCTGTTGCGAGTGAGAGTA CTTTGACGAGTGGTGCTGCTGAAAGTAGCTCCTCCAAATCAAACTTACCTGTTCCAAAGCAAGGGACCACCGGTACACCC TCTGAAACTGGAGAGTCAAGGCAGGCATCACCAATTAATCCATCAACGACAATAAACTTACAAGAGCGAGCCCGGCAGAG GGCTCAATTGAGACAGGCAGGACAGGAAAGGGCGACTTCTGCCACTCCTAGAGGTCGTGGAAGACCTAATATCCGTGGCG GTCGAATTGTTCGAGGTCGTGGTGGACGGCGTCCGCCGCCTCATGCTGATGCTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0131500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MPLFISDEEFSRCSGDTTAVAAKADSYIRSLLLELDTVRAKADASDINAEQNCSLIEQKYLSLAAEFSKLESHVSDLQSS LDQRQRELSDVQSQNHQFQLQLVEKDREIERLKTEVNELHKAKRQLIELNEQKDSEHSEKSATIKSYLDKFIRLSENAAL KEARLTEAEAELVRSRAACARLEQEKEIVERQNAWLNEELTAKVNSFNELRKRHTELDTDLTSKLADVERQFSECSKSLE WNKGRVKELEIKLKSMQEELITAKDAAAANEERFSAEISTVNKLNELYKESSEEWSRKAADLEGGVKAMESYLKQVEDDY KEKLEKESSARKQVEKEAADLKEKLEKFEAEIEASKKSNELINLPLSSFSTEPLLTSIVADGMVEENNMLVPKIPFGVSG TALAASLLRDGWSLAKMYAKYQEAVDAFRHEQLGRKESEAILQRVLYELEEKAEAIIDERVEHEKMVDTYSLMSQKLQNS LNDNSNLEKTIQELKADLKRHEREYNLAQKENDDLRKQVTVLLKECRDIQLRSGSNGNDVVDVASNIALRTSRGTEPEDV ISDHILTFKDINGLVEQNVQLRSLVRSLSGQIENQEVEYKEKLEMELKKHTEEAGSKVAAVLQRAEEQGNMIESLHASVA MYKRLYEEEHSLHLSHAHSSEALAAVSEVRRNNLKTSIESSQEIAKKSLEKAAERVRSLEDDLAKSRSEIIVLRTERDKI LLEANFARERLDSSMKEIEHQKAEAKGILARNVEFSQLIVDYQRKLRESSDSLNAAEELTRKLSMELSILKHEKEVISNA EKRASDEVRSLSERVQSLQASLSTIQSAEEVREEARAAEKVKQEEYIKKLEREWAEAKKELQDERENVQRLTLDREQAMK NYMRQVEDTHKELANALSAVASAESRASVAEVKLSSLQRKMGPSNEKLVEVDGVSGPSTLSSDEVVAELQTAKEEIEKLK EEAQANKAHMLQYKSIAEVNEDAMKQIEIAHDNYKIEVDNAKKALELEVHALREKVSELENESSLKFEEVASATAGKEEA LTSALAEISNLKEEILNRCSQISAMELQISDLKEQLDKEHQKWRAAQTNYERQVILQSETIQELTKTSEALALLQEEASK LRTLADAQKIENRELKAKWEEEKAGLERSKNDAEKKYDEINEQNKILHSQLEALHIQWAEKERNAAGISSGSSSADTFSD AGLQNVISYLRRSKEIAVTEVSLLKQEKLRLQSQLESALKASESAHASLEAERAKSRSFLFSEEEFKSLQLQLREINLLR ESNVQLREENKYNFEECQKLREVAQKARVETENLENLLREREILLESHNKEIETLKLEKDNLNYKVTELLERCKNVDVED YDRVKKLVRDLQDKLRDRDAQIEETAKVLSEKQDSVSRLEQDLSNCRSELMEREKRINDILHTEANLKQDTEKHRKLLAQ FKKKIDALSREKEDLVKENQQLSKQLDEIKGKRLTSDTTAEQAMKEEMDTRIQTLEKTVARLRDEVKKEREDKNMERNRR LKTEKAIKDSYNNVEQEKKQFINELERHKEALKRLSDEVEKLKIVVGNLPEGSDVAQLLSGPNVDDFSAIYMSAVENFEK VAQSVISEFGGRGNLGDATATTDGSAAATGSVVHAQSQSIIPLAASGTSNLPPKATGESEKRLALPKSVVETRKAGRRLV RPRLVKQDEPQGDVEMSETEGLGGKPGPSSDTETQSNLALSSQPLARKRVAPTSTSELLEESVAPGDKSSEPLVKKSRGV ESQEETGEEPPAATSEFSGSHPATEESFESGELPQGQNEELGDAQNDDGETAVSKDEESKDPQQFDGTTSQEELQGDKTG ISEENPDQSAEAKILSDEMQMDHPEPDNQQPGSDREEGEMLPETGDSEGEPQESREGPSDPVASPEPSPARVDDEGLEAG EINSPDLSSEDKNDEGDLVEEAADGSDKLIDVNETTSVESDPVAEPAPVASESTLTSGAAESSSSKSNLPVPKQGTTGTP SETGESRQASPINPSTTINLQERARQRAQLRQAGQERATSATPRGRGRPNIRGGRIVRGRGGRRPPPHADA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 1931 | 1931 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 1 | 1931 | 1931 | 0.0 | – | |
| Coils | 74 | 139 | 66 | - | – | |
| Coils | 151 | 199 | 49 | - | – | |
| Coils | 239 | 273 | 35 | - | – | |
| Coils | 306 | 358 | 53 | - | – | |
| Coils | 446 | 466 | 21 | - | – | |
| Coils | 477 | 525 | 49 | - | – | |
| Coils | 682 | 716 | 35 | - | – | |
| Coils | 724 | 744 | 21 | - | – | |
| Coils | 759 | 793 | 35 | - | – | |
| Coils | 801 | 821 | 21 | - | – | |
| Coils | 825 | 920 | 96 | - | – | |
| Coils | 942 | 969 | 28 | - | – | |
| Coils | 984 | 1022 | 39 | - | – | |
| Pfam | 1047 | 1174 | 128 | 1.9E-24 | ||
| Coils | 1062 | 1093 | 32 | - | – | |
| Coils | 1111 | 1177 | 67 | - | – | |
| Coils | 1221 | 1252 | 32 | - | – | |
| Coils | 1269 | 1289 | 21 | - | – | |
| Coils | 1297 | 1352 | 56 | - | – | |
| Coils | 1382 | 1416 | 35 | - | – | |
| Coils | 1431 | 1472 | 42 | - | – | |
| Coils | 1485 | 1519 | 35 | - | – | |
| Coils | 1531 | 1565 | 35 | - | – | |
| MobiDBLite | 1644 | 2071 | 428 | - | – | |
| MobiDBLite | 1660 | 1693 | 34 | - | – | |
| MobiDBLite | 1708 | 1740 | 33 | - | – | |
| MobiDBLite | 1751 | 1765 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1777 | 1802 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 1809 | 1823 | 15 | - | – | |
| MobiDBLite | 1824 | 1846 | 23 | - | – | |
| MobiDBLite | 1856 | 1895 | 40 | - | – | |
| MobiDBLite | 1970 | 2039 | 70 | - | – | |
| Coils | 2071 | 2071 | 1 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Biological process | Protein import into nucleus | The directed movement of a protein from the cytoplasm to the nucleus. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0131500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…