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LotjaGi3g1v0219700.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0219700
Transcript ID LotjaGi3g1v0219700.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Methyltransferase-like protein; TAIR: AT3G11480.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|A4GE70|DXMT1_COFCA 3,7-dimethylxanthine N-methyltransferase; TrEMBL-Plants: tr|I3T2M7|I3T2M7_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0219700
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:33106830..33132572) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTTCCCACGACAGCACTAGAAGCAAATTAAAGGACAACCACTTTAATTAATTGGGTAAAGCTTCTTAATTTCTTTCCGTT TTTGGGTTGATATTGAGCTTCTCCTATGTACATATAGGATCATATATTCATCTGTTATTAGAACCTTGCATGTGATCATT ATTAATTATCACTTAAACCATCTTTTTGTTCAGTGGGAATAAATAATATTTGAGTCTTGGATCACAATAGGTGGCAAATT GTGATTTTGACGTTTAACACGAAATGACGAAATCTATCAGGAAAATGTATTTTTAATCGGTGTTAAATTGTTTTGAAAAC TTGCATACATGTGAATGTTGAACTTTTGAGTTCCCACATACTCGCGGATTTAAGTGCCACAGACTCGAACCCGGTCAATT TTATCTGTTTAATTTGATTTGTGTTCAGCAACACTTATTAAAATCATTTTTTTACATAATAGATTTTTCAAATAAACTAA TCAAAATATTTTTTTTCAAATAATTTGTTTTCAATTTTTTTAAATAATAATATGTTAAAATGTCGATACAAATGAGTGAA TTTGTTTCAAATTAAAATAATGATTTTTAGCTTTCTAAAAAGAAGATTTTATAGAGATTTTTATGAAAATTATGATATGA TTTGTGTTCATTTACTCTAATAAAAATAACATTTTTATCTTCTCTCATCTATTATAATAAATTTTAATTAAAATAGCTTT TTTAAATAATATGTTTTTAGTTTTTTTGAAATAATAAGTTTTTAAAAAACTGAAACAAACAATTTAACTTTTAAAAAAAA TGAATTCTTAATTAAATAAAATGTTTTTTCTCATAAATCTTAGGAAAAAAAACACACTCTAAATGCTTTGATTTTTATTT TATGTTTGCTCCATTTAGTATGTATGACGATTTGCAGGAGGATAAATCAATTGTCCACAACATTAACTATGTAGGAAATC 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ATGATCTTTGGCCAGATGAGAATGGAAAGTATCCTTTAGCTATTTATACAATGTCCAATCAAGGAAAGAAATCCGTTTTA ACAAGTTTAAGCAATATCACAGTGCCAGATGGTTATTCAAGCAACATTTCTAGGTGCATTGATTTGGACAATTTTCGAGT GAGCGGGATGCTTAAAAGCCACGATTTTCATGTATTGATGGAGCAATTGCTACCGCTGGCCATGCGAACAACATTGCCCA ACGAAGTCTCAAAAGTTTTTAATGGATTGGGCTCATTCTTTAGGCAATTGTGCGGAAAAGCTTTGAGTGTGGCTGATTTA GATCGAATGCAGCATGATATTGTGCTCACTCTATGTAACATGGAAATTTTATTTCCCCCTTCATTCTTTACTATCATGAT CCATTTAGTTGTTCACCTTGTTGAGGAAGCTAAACTTGGAGGCCCCATATATTACCGATGGATGTACCCTGTAGAGAGGC AAAACATGAACTAGTTCTATTTTTTTTTTTTAATTTCGTGATTTCTACCGTGATATACATCAACTATCAAATGTCTCTTT TGATTAGGTACTTATGATTGCTCAAATCATATGTGCGCAAGAGGGCACAACCCACAGGCTCCATTGCAGAAGGTTACCTA ATGCAAGAAATCCTAACATTTTGTTCAAGGTACCTCAATGATATTGAGACCGTATGGAATCGACCACGTCGTGTTGATGA TGAACCTAATGATATGCAACCGGAAACACAGGTAGCTGAATTTTTTCCTAAAGTGGGAAAACCAGTTGGTCGCTCTTCAT ATTTCACCCTTTCATCCATTGAAAGGTTACAAGCTCATCGACATATTCTAACCAATTGCTCAATAGTTGATCAATATGAA CAGTAAGCACTTCAAACGACATACTTGATCCATTTTTTTACATGCCTACTAACTTATATCTATATAGGGAATATAGAGAT ATTGTGCGGAGGAAACTAAGAAGGCACACAAGGAGTGCGACTGAGATAGACAAGAAGGTTCATAAAGAGTTTTTCGGTTG GTTCTATAATCATGTAAGAAACAACTCAATCAACGTCAAATGAATATTCATGCATGTTTGTATTAAACACGCCACTAACA CGTGTATTATGTTTAGATTTTTAATAATGCAGACACCCTTGGCGAGGCAGATAAATCGATTCTTCTCATACTTGCTGAAG GGCCTGATTGTCGAGCTAGAAGGTTCACTGCATATAATGTTAACGGATATAAATTTCGTACATTAGTTCGAGACAAAGGA TTGAGAACCCAAAATAGTGGGGTTTTTGGTTCATTTGGCACTAGAAGTTACTCAAGCAGTAGTGATTCCCAAATGAGATT TGGAGGGGTCCCTTATTATGAGAAACTGATAGACATAATTGAAATCAGCTACGATGGCTTATTCACAATTCCTTTATTTA AATGTAAATGGGCTAATACCACTAATCCTAGAGGTATGAAAAAAGATGATTTGGGTTTTACCTCTATTAACTTCACAAGA CCAATACACACGGGAGATCATGAAGACGATGAGCCTTATATTAAAGCTTCTGAAGCCTAGATGGTTTTTTATGTTGATGA TGAGAAAGAAAATGGTTGGAGTATACCTTTGCATGTGAAGCCAAGGGACTTATATGACATGGGTGAAGAGATTAGTGTAT CAGATGAGGCATATCCATCATCTAACTTGGAGGAAATTTTTCCGAATAATACTGAACCTATACAATTGGCAATAGTTGTC ACAAATGATGATCCTTTATATTATATCATTGATGGAAATATCGATGAAGATGATTTTCAAGATTATATAGTTACATGATC TGATCCTTTGGATAATACTTGCAATTCACTTATATTATTACCAGAAGATGTTTTAACTTGTGAGGTTCTTTTGATGTTAT TCTTTATATATAGTTGTCTTGTCTTCCTTCATAGTGCTAACATTTTGGTTTTACAGGTATGGCTAAAAGAAAGAGACATT GTCTTAGGACTTCTTCTTCAGCAACAACACCCCAATAATCTGTTTCTGCACGTCACAGCGACCTTATATCGCAGCATGTT GACCATGTGCAACAGCTTAGTGAGTCTATACCGCAGCATAGTGAGCCTATACCGCAGCACAATGAGCCTATACCGCAGCA TAGTGCACCTATAATCAAGGAGGTTCAAAATCAACAGCCCACACAACGTGCTCAGAAGTCTACAAAAAAATGGGACATGG ACCTTATTGGTATGCGATTCATTTCTTAACACTTTCTACAATATTTTCCTTTGCACATACAACTAGTTAACATACATCAT TCTTGTTTAGTTTGTAATTTTTGAAATAATTATTACTTTTCAAAATCATAAGCTTCAATACATTAGTACTTTTCTCATAA GAACTTAATATATATATATATATAATTTCACATAGGCATTAATGTAGTTCCTTATTTCATCTTCCATAAAAATTCAAATA TTCTCAATTTGATGTGTGTGAAGTTCAAAAGTAGCAGGATATGGTTACAAATTGACCACCAGTAGAAAATACCCCATCAG ATCTGGCCCCATCGTTTATTGGGTATTTCAGCACAGAATTTACATTACTAGCTAGCTTGGTAATAAGTCATCTTTTTGTG ATGGACATGATTAAATTTGTGTATTGCAATGTCTCTATCTCCATGATTTGGGATATCTTCCTTCCGAACCTTGTGAATAA TTCATGCATGATGTCTTTGCCAAACGAAAATGAGAAAAGAGGTTCCATGACAGCTCTGAGGGACTTGGAAATCAAATCTC CTCTCACTTTGTTATCAAGAATAGAAACATCAATGTCATCTGGAAGGTGTGAATTCCAACTTATTTGAATAGTTTTCAAT GTTTGAATGGTAAATGATCCTTCTTCCTCAATTATTTGTTTAACTTCCTCCATCGTAGGACAATATAAAGGCATATTAAA GCAATCCAATGATGTCTTCTCAATCAAACCCTACATATTAGTTAAGAGGTTACTAATAAATACCAAGACAAGTTACAAAA AAATATTTTTACATTTTGGCCGGTTCGTGAAAATTTTATAATTAAGATAATACAAAATTAATTTTGTTACCTACCTCTAA GACCATGTCATTGAGTACGATACCAATTAAGACTCCAGAATCGCCTATTTCAAATAAAGCATTTTTTCTTCCAAGGAAAG ATAGTACCATACTTCCACCAAGTATTAGTTCATCTGAACGTGAACCGAGAAACAATTTGAAATCTCTTTGAAATTGCTCA AAATATGATTTGTAGACTATTGCAGGGCTTGTATATGTTAAATGAATATGACCCTTGTTTAGTGGTTCTTCTCCCATAGT CAATTCTTCGGGAGCCTGTCAGGGAAAAAGCAATATCATATGTGTGTGTGAGTGAGAGATCCACATAAATGATTTTATTT TGGTATGTGTGTGTGAGTGAGAGATACACATATATGATTTTCGCAAACATAAATTTAACAAATTTAATATAAAATGACCT GTGAGAGCCAGTGAAGACTACTGGAAGAATGAAAGAAATGGATGCAATTATTAGGAAAAAGTCTTCCATAAAAGTTCCCC GGAGTTGCATTTATAAGGCATGATCCAACGTTGTCTCCTCTCTCTTGTATCCTTTGGTAGAAATCAGGAAGTAACTTGAA GATACCGTTAAAATCGTTTCCAAAAAGATCATTAAGATAAACTTGAAGTATAGGCGCCTCACGATTTAAACTCATTACAG TCTCATTAATGATACCCAATATTTTGTACACAACAAGAAGTGCATTTGGTCCTGAAGAGCAACCTAATTCGACCACTTTC AAATTACTTTTATAAGTGGTTTGATGCAACAATCTCTTAATACTTTCTTCTAGAATAAGCTCTGTTCCCAATATCACTTT TCTCTGAAAAATAAAATAAAATAAGTAACAACTACAACAATAATATATAATAATAATATGGGGTTACAATGAACTAAGGT TTCAAAATAAGGATTTTTTTTTTATGGAAAACAAAGCTTTTTTAATTATGGATGTAATGAATTGAAAGAATTTATATTTT ATTACATTTTCTTTCTCAACTCATTTTTCCATCAACTCTTACCACTTAAGTTATCATTTGAAAAGAGTTTAAACTTTAAA TAGAAGAAGAACTAAATGGACATAATGGGGGAGGGGGAAATGTATATTGAGTAATTCCTATCACTTATGGCTACAATGTT CTTTGTCTCTCATTAAAAAAATGGTTCTTTATCTCTTGATAAATTAACCTGATGACAAGTTAAATATTAATTTGATCTTT TTACTTAAGATAGTATTAATTAATGACAAAACATCAATCAAACATAGTTACTATGCAGCTAGTACTTATGACAATGAAGA CCTTAAACCAAAATTTAAAAATAAAAAGAAATAGATCGATGTAATATTAGCTCATTCATTATTATTGTAATGCATCTAAA TTTTAAATATTCTTATGATAGTGTGAGAAAGAAAGTACTTGAAATGTGGAGTTTTTTGCATAGCTTGTTTCTTCCCCTTC TCCATTCATGTGAAGAACTTGTTCCATTGACATTGGGGGCAAACTCCTAATACTGCACAGGGCAAGGCCAAAATAATTGT ACATACATGCCAACATTTAATATTGTGTTTACTTACAAATTATACTCCATCTGTTTTTATTTGCTAACGAGATTATTTTG ATCATTTCATGTTTTATGCATGCATACAAATATAAAATCTAACTTACCAATATAACTTAAAAGGACAATTTTTCTTGTTA ACAAAACACACATTAACACTTACAAAAGTCAAAGCACGGATAGAAGAGGTAAGCTATTTTTAAAAAGTACTAAGTTGTTG TCTAAAAAAGTACTAAGTTTTCAATGTGTGAGTTAAAATGTGTAAAATGATAATGTGAGAAACTGAGAATAGACTATTCA TATTTTCTTTAACTATTAAATTCCTTTTGCAATTTTGAGTTGGCAGAGAAAGCTCTCATACCATGTATTTAACGAGTTGT GTTTAACTTAAGCCCAAGATATTGGGTCAATGTAGAATAACCTGTGCCATTTAATCTGCCTACTTGGTGGTAAAGTATAC ATATTTAAATATAACTGTCTAATTTATTTGGCTTGATAAACCTTTTGTTGGTTTATATTCTTTAAGATTATATAATTTAT AATCTTGAAACACTCTCTAATGGCTCGGCCTAGGTGGTCGCCGCACCGTTCACCCTCCTGGCGCGATGGCAACCCCTCCT CAATCTCTATTTCTCATTTTCTTCCCTTACTACAGTTTCCTTTCTCTCTAACCGGGCACTGTCCCTCCCTTGCGCTGCCC CTAGTGTGTTTTCTCCTTCCTTTTTTCGTCTTTCTTGCTCCCGGAGTCTCTATGTTGTCGGTTCTATATTGGGGTCACTT GTTCCTTCCAGATCTGGTTTCGATGGGACTTTTCCCGTTCGGTGTAACACCCCGTTTTTAATTAAAATAATATTCATATT TTATTTTAAATAAGATTATATCATATGGTGGTTTATTAGGCGATATAATAATACTTTAATGAAATAAAATATTTTCTGTG ATGCTGGGTGTGTTTTATGAAATGGAAGAGAGTTAGGGGGTGAAAGTTAGGATTAAAAATGGAGACAAGGACTAGGAGAG ATTTTGGGGTTTTTAGTTTAGCCCTTGAGGAATTAGGTTTAGATGGTTAATTAAGGATGGGGCAGCAACTATAGAAAAAA AAGAAAAGAAAAGAAAGAAGAGTTGAAGCTGCTCGCGTGAAAGAAGAAGAAGAAGGGAGGAGAGTCGCTGTCGCGTGGAG GAAATAAGGAGAAGAAGGGGAGAGGCGCGGCGGTGATCGTGGAGAGGAAGAGGAGAGGCCGAGAATCAAGAAGAAAAGGG TCTAGGAGGCTTTGTACCGGTGTCATAGAAGGTAAGGGTCTGAATTTACCTTGTATAATTGTAGTATAACAGAAGTTGAG TTTAACATGAAGGAAACCCCAACTTCTTTGAAAATTCAGAACTGAGATACTGTGTTGAGTGTTAACATGTGGTGAGCAAA ATTGATTTTGAGCGAAATTGACGTTCTGGGGGAAAATTGGGTTATGTTTCTGCCCGCAGATACCATAACAGCTTGTGCTG TAGAGAGCATAACTCTCTCTACAGAATTCCAAATTGGGTGAAACCAATTTTGTATGAAAGCTAACTCATAGTGTTATGTT GGGTAGTATTTTCAAAAAATTTGGACTGCTCGTTCAGTACCAGAATTATCTGCAAGTTCACTCTGCTTCTGCCCACAGAC ACCCTAACAGCCTGTTCTGTAGAGAGCATAACTCTCTCTACAGAATTCCAAATTGAGTGAAACCAATTTTTTATGAAAGC TAACTCATAGGATTATGTTTGGTAATATTTTCATAATTTTTGGACTGCTCGTTTAGTACAAGAATTATCCGCAAGTTTGC TATGTTTCTGTTTATTTCTGGAATTGATTCTGGAACTGTTCTAGTAATTAATGTGAGACATTTGGTGATTTTGTGTTGTT AGCTTGTCGGTAAAATAGTGAATGATTTGATAATTATATTGAAGTGTTATTTTGTGCAATTTTGGTGTGATTTCCATTAT GAAATTTGGTGAGAAAATATGTTATATATTTGGGGCTGGAGTGGTCTCAAATTTGCATGTTTTAATTTATGAGTTTTTGC ACGAAATACACTTCATTTAGTCAAGAGGCAACGTGTCGGTTTTCCTCGGAAAACTTGGGCTTGTCCCAGAACTGGAGTGG TTCTGGAAGTCTGGTGTGGACTTCATTGGTTGTTAACTGTATGGAGTTGACGCGGTGATACCGCTAAGGTTAACAATTGG TACCACATGCATGCATTGGAGTCTCACACACTAAGTTTCACGTTTTTCAGTGGTTTATGTGTTTGGTGAATTGTTGGTGA ATTTTTTTGCTGTTGTGGTGAAGTCGTGAAGTTGAATTATTATTCTTCTTAAAGCTTATAATTTTCCGAAGTAATAATAA GAATTGTGAAACTGTCTTGAGAGCAAATATTATAATTACTCAGATTTTAAAGAAAATGTGAAGAGTTTATAAAGAAGAAT CTGAATAGTTTACTTGCTCTTTGTTATGCTATATTTTATGCAATGTAAGTTCTTACCCTTCTTTTGGAATGATGTTCTAT GCGACATCGTACAGGTACTGGAGGTAGAGATGTTGCTCATGAGGAATAGCTTCGGAGAGTCTTAGTTTATGTTATTATTA TTATCATAATAAAATAAAGTGTCTTGCTCTGTAATGTAACATTGGGTAGATATTTTACGTTACTTTTGCTTTTCTGTTGA GAGGATTTTATAACCTCTCCTTATGGAAGTTGTTGAATAATTTTCTAAATTATGGCGATGTTGTACTGTTGATGGCCGAA GTGCTTAAGGAATTGATTTATGAGTATGATGGATTTTATTGGAATAACATGGAAGATAAACCT 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0219700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGAGAAGGAGCAGAAACAAGTTATGCAAAAAACTCCACATTCCAACGGTATCTTCAAGTTACTTCCTGATTTCTACCA AGGGGTACAAGAGAGAGGACACAACAATGGAGCATGCCTTATACATGCAACTCCAGGGAACTTCTATGGGAGACTTTTTC CGAACAATTACATCAATTTCTTTCATTCTTCCAGTAGTCTTCATTGGCTCTCACAGGCTCCAGAAGAATTGACTACGGGA GAAGAACCACTAAACAAGGGTCATATTCATATAACAAATACAAGCCCTGAAATAGTCTATAAAGCATATTTTGAGCAATT TCAAAGAGATTTTAAATTGTTTCTAAGATCACGTTCAGATGAACTAACTGTTGGTGGAAGTATGTTACTATCTTTCCTTG GAAGAGAAAATTCTTTATTTGAAATAGGTACTTCAGGAGCCTTAATTGGGATGATACTCAATGACATGGTCTTAGAGGGT TTGGTTGAAGAGACAACATTGGATTATTTTAATATGCCTTTATATTGTCCTACAATGGAGGAAGTTAAACAAATAATTGA GGGAGAAGGATCATTTACCCTTCAAACATTGAAAACTATCCAAATAAGTTGGAATTCACATCTTCCAGATGACATTGATG TTTCTGTTCTTGATAACAAAATGAGAGGATATTTGATTGCCAAATCCCTTAGAGCTGTCATGGAACCTCTTTTGTCATTT GCATTTGGCAATAATATCATGGACGAATTATTCTCAAGGTTCGGAAAGAAGATTTCCCAAATCATGGAGATGGAGACATT GCAATACACAACTTTGATCATGTATATGACAAAAATATGA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0219700.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MEKEQKQVMQKTPHSNGIFKLLPDFYQGVQERGHNNGACLIHATPGNFYGRLFPNNYINFFHSSSSLHWLSQAPEELTTG EEPLNKGHIHITNTSPEIVYKAYFEQFQRDFKLFLRSRSDELTVGGSMLLSFLGRENSLFEIGTSGALIGMILNDMVLEG LVEETTLDYFNMPLYCPTMEEVKQIIEGEGSFTLQTLKTIQISWNSHLPDDIDVSVLDNKMRGYLIAKSLRAVMEPLLSF AFGNNIMDELFSRFGKKISQIMEMETLQYTTLIMYMTKI 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 16 203 188 1.0E-83
PANTHER 16 278 263 2.8E-119
Pfam 16 278 263 7.8E-84
PANTHER 16 278 263 2.8E-119
SUPERFAMILY 16 278 263 1.91E-76
Gene3D 72 262 191 1.0E-83

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Methyltransferase activity Catalysis of the transfer of a methyl group to an acceptor molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0219700.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…