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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0259000 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0259000.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Gb|AAF01580.1; TAIR: AT3G03560.1 hypothetical protein; Swiss-Prot: sp|F4IIU4|AIR9_ARATH 187-kDa microtubule-associated protein AIR9; TrEMBL-Plants: tr|A0A072TLF7|A0A072TLF7_MEDTR Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0259000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:45660204..45682833) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CCCCTACCTAGAGCGACATCAAAAGAAACACACATTGAAACGTCTTAATGAGTATTTAAATACGAATTGAATTAACGTAA AAACATATTCATCTTAATTTCAATTTCATTCACCATTTAGTACCAATTTTGCCTCATTCATTCATTTCACTTATTTTCTT TCTCTGAAAAAGTCTTAGATTTTTCTAAATTTCCCGATTTCTTGACGTGTCTCACATTTCCATTCCCATTCAAGTTCTGA ATCTGCCCCCATATAACATCTGGGTTTTCTCTCTCGCTCTCCATGTTTTCCTCACAATCTCATTTTTTGAGGTCCAACAC AGACTAAGGTCGTTGGTTGGTTGCCAACGTTGTTGCACTTGCTGTCGGTTAGTCCCTGCTTCTAATTACGTATCTGGTTG TTGTCGTTATTGTTTGAATGATGTGCTCTGTGATGCCCGCGTGTTCTAAGCTTGATTTTTTCATTCTGTGATGTTTTTGT CTAATCTTTGGAATTGCAATTGGGTCCTCTCCTATGTTGATTGTGTGTCTGCTTGAGAATTTTGGGTTGTCAGTGTGGTC AAATGGATTAAATTTGTCAATTTGAGAGCTTCTTTGCTGATCGTGCTGCTAATTGGATAGTTCTACATACAAGTTGTTCA TGTTCATTTTGGGTTGTCACTACATGATTGTGTGGTGTAATTGTTGCTATTTGTCTGGAATATTTTTTATGTGCTAATTG AATGATCAATGTCCAGTGAGTTTTTTATGTGTGCTTTTACTTGGTCATATGAGAAGTGACATATTACTAATCAAGAATTT TGCTTTAGGGCATTGAAAAAGTTGTTAACTCTTTGGTATCTGTTTCTTCATAAAGCATTTCCTGGTATGAATTGGATATA CCGAAATCTTGATTTTGTGGACCTGAATAAGGGGATCAAATGAGGCAAAATGCAGGAATTTATTGCTAATAATGGAAAGA 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CAGGGGAATGAAGGGAAACCTCAAAATCTTAAGGAAGGGGCTTAGAACACCAATAATGAAGGAAAAATCCCTGAAAGGAA ATAAAATGGGGGACAAAGACTTACTCAAACAGAGAAGTAGCAGCTTGACCAGTTTCATTTTTCTTTTCTAACTAAGGCTT AGTATCCACAGTCACAGTCTTAGTGTAAGAACTAGATTTGAAGTGATTATTTGATTTTCCTTTATTATTCCAAACCATAT TCTTCAATCATGATTGACTTTAGAATTAAATCAGACAGAGACTTCAATTCATAAAGTTTTACCTCCACTTGTATCTCCTC CTTCAAGCCATTCATGAAAATTCCCCTTGCAAATTCTTGATCAATGGCCTTCAAAGCTCCAACATATTTCTCGAACTCTT CCACGAATTCCACCACTGTCCCTGTTTGTTTGAGTGCCAGCAACAACTCAAAGGGATTCTGCGAACCACTGCCAGCTTGA ACCCGTCCCAAGTCAGTTCAGGATTGCACCTAGCCCACCAGTGCTACCAGCTCAACGCTCTACCCTCCATGGCCACCAGC GTCACACGCAACTTTTCCTCCTCTGGAACGCTTCGTAACTCAAGTATCGCTCCAATCGGTGTGTCCAACCGTACGCGCCG TCGCCGGAGAAAATCGGAATCTCGAGTTTCCTCCACCTATCGCGCTCGACGTGGTCACCCAGGGTCCTTCCGCCGCCGTC GCTGGATTTCGCTTCATCCCTTCGAACGGTTCCGCCGCCGCTGGAGTCGATCTTAGCCGCGAGAGCAGCCAATTGATCCT CCGTACGTTTTGCGCGCGCCTCTGCCAGTTCCAATCGTGTGCGCCATTCCTCTCGCTCCTGCTCCCAATCGTTCGAATCT CTCACCATGCTTCTTGTCTTCATGCAATGCGCAGTTGAAGGAAGCAGAAATCAGGGCACCTGAACGGTGCTCTGATACCA GTGATAGATCTGGTACTGTGAACCAGAGAGAAAACCAAGAATTATGAGGAAGAAGATGAACACTATAGAACTGTGTATTG AAACCTGAGAGAGAAAACAATTACAAGTTTGCAAATGGTTACAGAGATGTCAACTGAATTGCCCTAACTAATTTATATTC GTAACTAATCTGCTAGGAATTACAGCTGGCATTACAGCTGGCACAGCTCAGCAAAACGGAATCACATCACAACTCACAAG AGCTAAGAGCTATATAGCTCGGTTCCTTCTTTCATTAACTTCGCTAATAGGGGGCCGAACTTGACTAGCAATCCTATCAG GATGACTATTAACTAAAATAAGACGAAAATGAATTAAGAAAGGCTTAAATCGGTTGAAAGTAAATAAAGTGCCGTAAAGG TAAATTGCTGAAAGACTGTAAATGAAACTTAAAGGCTGAAAAGATAAATGTGGGAAATTTGTAGTTTGATTGATTGATGA GTTGTGTCGTGTACAAATGACCCTTTCTCTATTTATAGAGGCAAATTCGGCTAACCTACAGCGGTTAATAACTTCCGACA CTACCTATGTTGCCCGGTATAATTACATTTTGTGGGGTGTTGGGAGTTACTTCCTCTGATCAGCATAGAAGCTTTGGTAA AGCCGAGCTTCCTGCTTCGGCTGGTTCTTCAAATAGTAACCGCTTTCCCTATTTTCAAGGATGAACCATCACATGCAGGC CTTCTAGGACCTATGCAAAATATTTCCATTGTGGCCCCAAGGCCTGTGCACCTTCCTCCAATTTTGTCGAAGTTCAAACC TTTAGCCGATTCCTGTCCTGCTCGATCAACCGCTCACTTCCTTCGGCTAAAACCTCTCGTGGCTCACCAGCCACGCTGGC AAGCTAGATGTTTCGACTGTTTTCTAGCTGTTACACATTTTTGAGTGCTAACAGACGTTAAGGGTTCCCTTTCCTCTTCC CTCTTATTCTTCAATATCTGCCAGGGAGTGCTGACCTCACCTTTGTGTAAGATTAGAGGCTCAATTCCTCATTTCTAATT GGAGAGAAGCATTCTTTTTAAAGAAACAAAAAAAATTGCTGGTTCTAATGTTCATTTGATTGATTAAAAGCTATGTAATA TAGCTTGGAGGCAAAAATCTCATGAAATTTGCGTAAATGTTAAATTACTGTTTATGAAAAGAGCTCGTGAGTTTCAATCT GGCGCTTCATATTATTCATTTGACACTACATTTTTCTGTGTTGAACTTCAGCTATTTGTTATTTCCTGTTTAAAGAGTTA CACGCCCTTCCTGTCATGTATTTTCTGCAGATTAAAGTTCCGTGTGGTCTCTCAACGCAATTTGTGCTAACATGCTCGAA TGGATCTTCTCATCCTCTAAGCACATATAGTGTCAGGTAATAATGTCAACTGTGTGTCACTTTCATACTCATTGCATGCA ATTATTGTAGTCTTTTGCACTCCTAAACAAAGATTATTAATTTTAGTGTTGGAAGTCACATACCATTTGAATTATTCATC ATTTGGATTAGGTTCAAGTAGCATTAGAAACATATTAAATAAATTAACTAGTTCAGAGGCAGCATTGGAACCTTAGCTTC CTAGGAAATGTTCTTAGCTTATTTATTATTCCTGTAAATGAAAGATCGTAATGTGTATCCTCATTTGTAGGGTTCACTTA ACTCATGCAATTCAGTAAATTCAATTTTCTTATTCCGTAATTTCTGAATGATGTCAGTTCTGCTAGTGATTGCATTGCAA CATTGAATTTCTTGCATATGCAATTTGATTTGAAACACCCTTACAGAAAGTACAAATTTGAATGTTAATCCATTTTACAA ACATGTTTTAACAATTTACATTCCCTTTTTCTTTGTAGAATGCGAGACACGCTTGTGTTAACCATGCGAATCTTCCAGAG TAAGGTATTCCGTATTCTATCTTGTTCATACAATTGCTTGTACATCATTGGCAATAATGACATGTAGTTGAGAAATATTT ATGAAGAGAGGGATTGACACAAAATTTTAACCTGGCAAAGTCATGTGAAGTCTTTAATATGAAAGGTTCCTAATCCCGCC ATGGATTTTATTAGAGCATTATCTCTGCAGCTGCCAATTTACCGTAATGAAATTGTTCTGATACTCTTTCTTCAAACAAC TTGTCACCAGAATTCTTTTTTATCTTCTTTAATAATTTTTTGGCTTTCAATTTACGATCGATCGTGTTCGTTTTCTTACA TTTTTTTATGCGAAATTATTTCAATAATAATTCTGTATAATTGTTTGCTATCAGTTTCTCTGACAAAACATTTATTCTGC CTGGCCTTGTTTTGAGGGTACACAGGCATTGGATGACAAAAGGAAAGGGAGGGCATGACCTCAGGTTACCATGTCCAAGC CTGCTCTTCACGCATGGTACAAAATAAAAGAAAAATACAAAACAGAGAAAATTTTACAGTCGCATTTATTTTGTATTTTG GTTATATTTGGGATAACTCTAGTTTACTGTCTTGTAAAAAACAGAAGTAGCATATAGAAAGGTAAGAAAATGTAGCATTT GAAGAAAGCACTAACAATGTGCAACATTTTTTCCAACAAAAAATTACAATGTAACATTGTATCTCAGTGAAAGTGTGAGA AAATTGCTTTAGTTAAATCAGAACTCCATATTCAGCCTAGCTTAACTACCCTCTTTTCTTTGTTCAGGTTTTGTGTGCAA GTATCGTAACAAGGATCTGTAGTTTTACATTTCTTAAAATATTAGATTGCATTTTGTTATTTGCTACACATATTTACAGA GACATCAAGTTATAGCAGTATAAAACTTTAGCACTTTTAGACCATTAATAACAATAACAATGTGATTAATACCTATTCAT CCATTGAATTATAATTATTTATTATCTAGATTATTTTTATCCAACTTATAAACTTCGGCTTAAAGGATCAATTGGCCCTG TAATTGTAAAGGAAATCAGTTCCGATCCCTGAAAAAATTTCACATCAACTTGGGTCCCGAATTTTTTTTTTAATTCAATT AAGGACAAAGTGTGTTTGAAGCTGATGTGTCTCATTTTTTATCTCGTCAGCTTATCCACGTGGCTTTTTCAATTATTTTT TTAAAATCTAATAATGCCACATGTTATAATTAATTGAAAATCAAGAATGTTCTTCAGCTTTGCCTTTTGCATAAAGTCTC ATCCTTTTTCTAGGTCGATAGTCTTGCCGCACTCATAGACATTCCAGCAAACTAAAATTCAATGCAGACACCAAAATCAC CAAAATCTGCAACCAAATGATCATAAATCCTAATTAAATAAATTTCAATCAAACAATTCCAATAATATACAAAATGCCTA AAAACCAAAACCTAATAATTCCCGAAACTTAAAACATTCCCAGTGATCCAATTGAATTTCTCGAAACCAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0259000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTTCTGTTAAAAGCTTTTCGCAGGGGCTTAAAAATGATGAGATTCAGGGTCAACGCTCTGAAATTCTAGGCAGGCA CAATTTTGAAACACAGCTGGCTCAAAGCAATTTCAAAAGCAATGATGCTCTCAATCACATGCAAGACCAAGACACTATGG AACTTTACTCACAAGCGAGGGGGCAAGAAGAAGAGATCCTCTCCCTTCACGAACAGATTGCTATTGCCTGTATGAAGGAA ATGCAACTTTTGAACGAGAAATGCAAACTAGAGAGGCAATTTTCTGAACTAAGAATGGCAGTTGATGACAAGCAAAATGA AGCCATCACGTCTGCGTCTAATGAGTTGGCTCAAAGGAAAGGATATCTTGAAGAAAATTTAAAACTTGCTCATGATTTGA AAGTTGCAGAGGATGAGAGATATATCTTTATGTCATCTATGCTGGGACTGCTGGCAGAATATGGTCTATGGCCTCGTGTT ATGAATGCATCTTCAATATCCAACTATGTGAAGCATTTACACGATCAGTTACAATGGAGGATTCGAAACTCACATGATAG AATTGGAGAGTTGACTGCTGTTCTAGAAACTCATGCTGATAATGGTAATCCTGTTGTTGAAAGTCCAGGTTCTGGAAATT TGACAAGTCACATTCATAATGAATTCATGTTCCAGCATAACTATCCCCAGCAAAATCTTACTGGGAATGAACAAATTCCT CAACCAATGAGCAATATCACAGGGTATATGAACCCAGTTCTTAATGGTGGGTATATGAATCCAATTATTGATAGTGACAT AAACAGGACATTCCAAAGGCTCAATCAGGAGATTTCTAAGGCTGATAGGGAAGTATCTTCTTCTTTCCATCATGATTCAA TTGATAAAATTGGAGCGCATGAGAGAACTAGAGAGAGAAATTTTGTAAATGGCAAGTTGTATCAACCTCCACCTGAGCAT GATGAGACTGCTTCCTCTGTTTCTGAAGATGGCCCTGGAATTGAGAATTTTCAAATTTGTGGTGAGGCTATTCCTGGAGA AAAACTTCTTGGATGTGGTTATCCAGTCCGTGGAACTTCTCTTTGTATGTTTCAGTGGGTTCGGCATCTTCAGGATGGCA CTAGGCAGTATATTGAAGGAGCCACAAATCCAGAGTATGTAGTTACAGCCGATGATGTTGATAAGTTGATAGCAGTTGAG TGTATTCCAATGGATGACAAAGGCCATCAGGGGGAGCTAGTGAGGCTTTTTGCTAATGATCAGAACAAAATAAAATGTGA CCCAGAAATGCAACTTGAGATTGACACAAATCTGGCTAAAGGAGAAGCAACGTTCAGTGTTCTACTTCTGATGGATTCTT CTGAAAATTGGGAACAAGCAACTCTATTCTTAAGACGATCAGGATACCAAATTAAAATAAGTGGTACTGAAGGTCCAGTA GTTGCTGAGAAATTCTCAAAGGACTTATCGATTAAAGTTCCGTGTGGTCTCTCAACGCAATTTGTGCTAACATGCTCGAA TGGATCTTCTCATCCTCTAAGCACATATAGTGTCAGAATGCGAGACACGCTTGTGTTAACCATGCGAATCTTCCAGAGTA AGGCATTGGATGACAAAAGGAAAGGGAGGGCATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0259000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSVKSFSQGLKNDEIQGQRSEILGRHNFETQLAQSNFKSNDALNHMQDQDTMELYSQARGQEEEILSLHEQIAIACMKE MQLLNEKCKLERQFSELRMAVDDKQNEAITSASNELAQRKGYLEENLKLAHDLKVAEDERYIFMSSMLGLLAEYGLWPRV MNASSISNYVKHLHDQLQWRIRNSHDRIGELTAVLETHADNGNPVVESPGSGNLTSHIHNEFMFQHNYPQQNLTGNEQIP QPMSNITGYMNPVLNGGYMNPIIDSDINRTFQRLNQEISKADREVSSSFHHDSIDKIGAHERTRERNFVNGKLYQPPPEH DETASSVSEDGPGIENFQICGEAIPGEKLLGCGYPVRGTSLCMFQWVRHLQDGTRQYIEGATNPEYVVTADDVDKLIAVE CIPMDDKGHQGELVRLFANDQNKIKCDPEMQLEIDTNLAKGEATFSVLLLMDSSENWEQATLFLRRSGYQIKISGTEGPV VAEKFSKDLSIKVPCGLSTQFVLTCSNGSSHPLSTYSVRMRDTLVLTMRIFQSKALDDKRKGRA
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 3 | 541 | 539 | 3.9E-195 | – | |
| PANTHER | 3 | 541 | 539 | 3.9E-195 | – | |
| MobiDBLite | 311 | 331 | 21 | - | – | |
| Gene3D | 325 | 412 | 88 | 2.4E-9 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0259000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…