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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0294400 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0294400.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Aleurone layer morphogenesis protein; TAIR: AT1G05950.1 hypothetical protein; Swiss-Prot: sp|O43079|AP1B1_SCHPO AP-1 complex subunit beta-1; TrEMBL-Plants: tr|A0A072VBT1|A0A072VBT1_MEDTR Aleurone layer morphogenesis protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0294400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:60199052..60212325) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACAGCAATTCTCACTCCTCCTCACTTCACAGAAACCTCAACCTGCTGTTGCAACTACAAGAACCTGTAAGCGTTCATCAC TTTCGCCATTTTCACTTTCTTCTGCTTCTTCTTCCTTTTCACTCTTACGGTCTTACCCACTTTTTCCTTTGCAGCCTTCA ATTTTATATTATTTTTTTCCATAATCTTCTACTTCACATTTTGATTTTCTGCTCTGAATTCTCCTCTAAGATTTTTTACT TTAACTGTGCAATTGCATGCACATAATTTTTTGACCGAGTAAGATTTTTGTTTTTTTTTTATTTGTCACTCTTGCACAGG TTCATGTAAAGTGTAGCTCCTTTTCAGTCAACCACACCAGTAAAATCCCCAAGTAAATCCCTGTTTCTCTCATTGTGTTT TCATGATTCAAAAAAAGTTTTTTTTTTATATGATCTATGACAATGTAGAAGCATTTCTGAAACTCTTGTTTGGTGAGGTT GTATTTTTGGGAATTGTAGTTGTAGAGCATGCATGTACTAGCACAGACTGGATTTTTGTCAGATCATGTTAGTCCATGTT TTGATACTAATTGACTCTATGGTGACTGAACTTTCAACCTAGTTTTTAGTATGTTTGGATCAACATATCTTTTCTTAGTA TCAAGAATAAACTATGACCAGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAGAATAAACTATGACACCTAGAAGCTTCTCCGCAGAATTGA TTTTAGCTTTAGAATTAATAGGCAAAGAATTTGAAAATATTCACTTGCTCGATTTGTTGGCTTGTCTTCAAATTTCTTTA CCCTTTTTTTCGTTCGCCAGCCATAGATTTCAATAGTGATCGCCCCATCTTATCTTTTGTTTGTGAGTGTTTTGTGTTGT AACTGATAGTATATGCTTGTCCTGTCATCTGTAATCTGTGTTTCAAATCTTGCGTTATATGTGGCAGCTGTAGCTCTTTG 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CGTATTAAAAAATAGTGTAGCTTCTAATTCTAGTTCCTCAAGAGACAATTCCACCAGTTCAAGAAGTCTATCTCTACTAA TATCTCAGAACAAAAGTTGGAAGTTGGAATACACCTAAGCCGAACTCTCTATATTTTAAGGACCTATTTTGTTTTTCTAA TGAATACAGGAGTGTCCACCAATTCCTTTCACATGATGAAGAACAAGGTTGTAAAGAAATATTTGAGATTTTTGGAGTTA TACCCCAAATGTATAGAAGGCGTGTCCCGAATGTATCAGACAATGATATCTATTGAAAAAAATGGGAGGATACTTCTGCA TATGTCTCTACGAGCATTGTATGCCTATTTTCTTCATATTCATAAATAAGAAGAATCGTCTTATTCTTCCATATTTTAAA ATTTACCTTCATTGAAATGTTTCTTCCATTTTGTATACTAAATTTTTTTAACCTTTGGAGGCTTCTATCCTTCTGGTGTA TTTGGGTTTGTTTCAAACCAAATCATAAGTAAATAAAATAAAATTTCAATTCATATTTGATTTAGAAATTGTAAGTATCA CTAGTATATAACTATATAATTTATACAAATGTATGCGGAGGTCATTGTTTGCATCATTGTTAATTTATTCTTTGATTTTC TGGTCATCCGTATCAGGTGCACTCTGTTGTGTTACTATACAACTACTACCACCGGAAACAGCATCCAGAGCTAGCATTTC TGACATTTGATGAATTTTGCAAGTTGGCTGTGGAACTGAAACCAACTCTGTCAGCACATATAAAATCCAAGCAGATACCA GATGAAATGGAGCTTGTTGATGAGGATGAGCGGCCGTCGCTAACAGAAAATGAGATCTTGAATGCATGTAATACATGTGC GTGCTTAGATGCATCGAAAAATGTACCTGATACAGAGGGATGGCCCATTTCTAAAGTTGTTGTCCTTTTAATCGACAATA 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GTCTTTGAATGCCAACTAGTATATTAACTTCTATAGTTATTTTAATTTTTCATGAACATCTTTAGATGGCTACTTGTTAG GATATTCTTACAGTCTGATCATAAGGATGTATCTATTCTTATTCTAGTTTTATACAATAGGAAATCATAGAATGATGACT GTGGCAAGCAGATCTGCACCATCTTTTTGCTCTTGAAGTGGTACTTGGGTTCTGGACTTGGATATTTGATACTTCCTATA CTTTTAAATGATTGTCATTAAAGAAGTAAATAATATTTTATATCTCTTCTTTGGATAGGTTGCAGGGTCCTTTGGTCCAA AGGAGTTTTAACAGTTGGATTGTCACCTCTGTTGTTGAGTACTTCCATATGCTTCCATATTCTGAGATAATCTCGGAGTG GATTTCTAGGTTGGTCTAGCTCTTTCCCATTTTATAGTGACTGATTTAGATTGAGTTGCCGTATTTTCACTATTTTACAT CCTATATTTCGCAAGGGGTGCTATTTTAGTTTTTGCTTCATCAAGTTTGCTTCTTGACCTGAGTTCATATGTCTGGCAGC CAAGGAGTTGGAAAATAAAGTATAACTACTATGCAATCATTTTACCAAATTAGGTGATCATGAATATGATACTAAACCGT GAAGTTAGAAATGCTGATTAACAATGACACTCTGAGTTGCTTGATTGGGCAGTTTGCACTTTGCTGTAATAGATTGTGTG CTCATAAGTCTCAGAAACTTGACACGACGTTTTTGACTTTATTGATCATTTCCTTTTTTTTTTGTGCTTCTTTCTGTATT TTTTGGTGTCACATGTTCTTCCTTTGTAGAGAAACATCCTCACACAGTTTGCAAGCTTCAAAGATGGCAGAGAACAATGT GATGGCGGAGAGCCCTGAAGTGACAGAATTGTATGTAAGTGGCGAGGGCTTGTCTGTTTGCCTTGATAACCAGCCAAGAT GTGATACTACGGAAGATCTTAATCAGAAGGAGAACAATGGCTGCAAGGAAGCCCGGGATATGGATGTGGACAACTCTTTA GTTCTTCCATCGGAAGATATAGAGGAATGCCAGAATATCACTAACAATTTACAAGTTGTTGAATATAAAGAAATAGAAAA TTCATCTGTGCAACATTACTCAAATGGATCCACAAGCCCATTCGAGGTTTGAAATTTAACTACTGTTTATCTGTTTCCTT CTTCTACTGCATTACCCTTTGGGGTTACTTGTGTTTTACCTTTCTCTTTGGGCTTGCCCTCATTGGAATGTTGTTTTAAT AAAAGATAAACATATGATAGAAATTAATGAAGCATAATTTCTTTCTAACTGTACTATTCACAGTCTCTCTGACAAAGATA GAGAGACTACAAATTGTTTAAGGATGCAGATATATTCTATAAAATTTTCACAATTGCATTATATTCATCAAGTTCATTAT TGTTGCTTTTCTCATGCATGCTCATCTTTGTTGCTGAATCTTAATAATATCTCTCTGCTTGTAAAATCTATTTCTAAATG AATCTGTCGTGGGTAAACTTAACTGATTTAACATCTGAATTCTACAAACTAGTATGGACAAAAAAATGTCATTGATCACT CTACTTTTCCTTTTAGTTTTTTTTTTCTATATATTAAAAAGTAGTTTTAACTCTTAAAGCTATATTGCAGTGTTTGTCAT CTCTCATCCAGCTACATGGCATTGGGTTTGAGGCTAAGAAGGTTGATTCAATGATCATCCCTGAGGGTGGAATCAATGAT CAATCTGCTCTTGATAAGATCTGTGCCAATACCACTCTCGAAAATAATTCCATAGAAGACTGTGCCTTGATTGCAAAAAA ATCTAACTTGGATCTTGATAAGCTCCAAATTTTTCTTGCTTCAAAGATGAAGACATTGTCACAAACTGCCCTCAATGCTC TTATAGGAAAGAGGAATGCACTGGTAAGAACCTGTTCATTGCATTTTATAATGACAAGAATGTTTATATTCACTCAGTAG CTATGCATGGATCCCTAGGACATGCACAAGATCATATACACTTGAATATGTATTTGAAACTTGACTGAATCAGTTGTGTT CTTATTACTGCCATTATTGAATTAACGCACTACCTCGAACTTTTATATTTAACAATAACATGCATATCACAGTTCACTTT TATATTTAACAATACTGCCATTATGTTTGTACTGTTATTTGTTCAGTTTGTATTAGACCATTAAACAGTGTTCTACGTAT TTCTACCATGGAATGCACCCATAGTCGTAGCTGCTATACTGGCTTTCCTTAATCTAAGGGTTTGCTTCCTCATATTATTT GAAGGCAAAAGCTCTGCATTTCAATTTGAAAGCTCTTCATTTAAATTTATCACAGACTTAGTCTCCTTGTGCAGGCTCTT CAGCTCCGCATGATAGCAGATGAGATTGCTCTGTGTGATATGAAAATTCAGAGAATCAGTGGTATGTTTTCCGTTACTAT ATTGCCCTTACGTTTTTATTTTGCTTCTATGGTGCATTTCTCTATAGTAGGGTTCTTTTTTCTCCTTCAACCTATTCAAT GTTTCTTTGTTCAGCATCATTCATTTTATGATAGATTTTTCTGATCGAGTATCAGAAAACCTCTTAGCCAGATATGATTC TGGTTTAGGACAGTGATTATTGGCTCCTTATAGGCATTCACCCCCATTTCATTGTCACATCTAACTATTGGGGTTTTTCT GGGAATATCTGGTGTTGGATCATGACTTAGGAACCGTTTGGAAGAGCTTATCTTATTATGCAAGTGTTGGGAGAGCTTAT GTAAATAGTTTATGGCCTACTGATAAGTGATAAGTTGTTTTGTGCTTATTTTCATTATAGCTATGGATAAACTCTTATTC CTACTTACAACTTATTTTGAGCTTATTTGAATAAACTTATCTAAATAGCTTATGAGTAAGCGCGTAATTGAATTGTTTAT CTAGACACACCCTTAATAACATAATTTCCAACTTATTCTATCATTTTATTCTTGAACTGAATCTAAAGCTGCTTTGACTT TGAGAGCGTTAAAAAATTTATGCGAAAATGCTCTATTAATGAAGATCCACTTCTTTGCCTTAGCACCAGAAGATTATAAC TGCAGAGATTTATTCCTATTCCCATTACATTTTCGCCCATGTGAAAGATGAAAAGTTATTGCTTGTGTTTTTGTTATCTT AACGAACGTAGGTGGCGAAGATGTCTTGGCATTAAAGATAGATTCTATAATAGAAGGCTGTAATGATACATGGGTAAGAA ATCAAGGAAGTATGTGCCCACTTATTGAGGATCAATGCTTTCCTCCATATGCTAAGAGGAAAAGATTGACAGATGCCGTG CTTATGCAAAGTCCTTGCCAGGCAAGACTCTAATTAACGACTAGTATTAATTTTTTATTTTCTATAACCATGCTTAGTTT GAAAATATGTTGATCCTTGTTTGTGGTGCATTTATATGATTACTCTCTGGTTTCATGAAATTGAGTAAGATAGGAGAAAA TGGGCCGAATATGCTTGTTTTATTCGCGAGCTACTTGACTTATTAGTTATAGCAGTAGATCTCAACTGTTTCCTTCATAT TTACACAAGTAACTTTGAATTGTGTTTAACCTTGCAGGAACTAGATGGTGTATGTCATGCAAATAACTGGATCCTACCAA CTTATAGTTTATCGCAATCAGCTGGTAAGACTGATCACTAGCCTAGATGTAGAATCCTGTAGTTGTATAAAATCAAGTGT GACTTATGCAATGCAACATTATCTTGGTGTTGTTAATTACTTTAAAAAGAAGAGATCAAATAGCATTTATAGCATATTTG TATGAGCTTCTTTTTCCTCAAAATCAATTTTGAAACTCAAAAGCTACTCACATAAGCTTCTCTCCATAATTGATTATGGC TTTGGAATCAACTCTAGAAGGATTTCCAAACATGCACTTCATCATTACGCATATAATGGTCCTTTTTTTAAACTTTATGA TATTGAATGATCATTAATTGTTAATTTGTTGAGGAAAATAAATTATGAAACTCAAAAGCTACTCATAGAAGCTTCTTGTC AGAATTGATTATGGCTTTAGAATCAATTGTAGAGAAGTTTTCAAACATGCACTTAATCATTTCCCATATAACCGTCCTTT TCTTATCCACACTATGCTGTTGAGTGACAATTAGTTGTTTTCTTTTTTTGTTGAGAGATTATCATATTACTTGATTTGCA TATAAATTTGTTGTGAACCTTTTTGAAGGTGGATTCCAAGCTAATTTAACAGTTAAAGGACCTGACTTTGAGAGTTCATG TGGGGGTAACATTTGTTGCCATCCTCGTGAAGCTAGAGAATCAGCTGCTGCTCAGATGTTGGTCAACTTAAGAAGTATGG CAAGATCAGCTCAGTGAATTTGGCTTAATTTCGAATTTGGAAGCGTAGAAAGGGCTTGTTTTTTGGGTGTGTTTGCCTTT GGATTCTCAAGGTTTTGCAGACAGTGTTGTTATGGTTGATTGGTAAATCGATCTACATATATTAGGTACCGTTTGTCGTG ACTTTTTTTTTGTCTGTCTTAAAAGCTACTTTTAAGTAAAAAGATTCAACTAAGTTTAATAAAGCTTCTAAGTA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0294400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCTTCATCAGATGTATGCCCCCCTGAGGATGCAGTGAAGGCATTCATAGAACACTTGGTTGATTCAATGCTGCCATC AAAACCGACTCAAGATAATCCCTCACTATCTCAACTGCAGGAAGTTGCAAAACAAGTGCGCTCTGTTGTGTTACTATACA ACTACTACCATCGGAAACAGCATCCAGAGCTAGCATTTCTGGCATTTGATGAATTTTGCAAGTTGGCTGTGGATCTGAAT CCAACTCTGTCAGCACATATAAAACCCAAGCAGATACCTGATGAAATGAAGCTTGTTGATGCGGATGTGCGGCCGTCGTT AATAGAAAAAGAGATCTTGAATGCTTGTAATATATGTGCGTGCTTGGATGCATCGAAAAATGTACCTGATATAGAGGGAT GGCCCATTTCTAAAGTTTCTGTCCTTTTAATCGACAATAAGAACGAAAACTTCTATTTGAATTTTGGTTCAATCACTCAG GGGGTATGGTCAATGGTTGAAAAAGATATGGGTACCTCTGCTCAAAGTTGTGAAGTAGCTACTAAATTTTTTTATACATA CAAAAAGAGAAAATCTGTTCAGAAGACTTCAAAAAATGAATTAAATGTCGGTGAAGACAGATTTTTGCAAGCTGGGTATG CTGCTGTAAAGGAAGCTGCAGGTGTGAATAAGACTGATATTATGCTTTTGGAAAGCTACACTGTTTATTCTCAGAGCAAG GAAAAGACAGCTTCTCGCTTTTATATAATGAAGTGCTCTCAGACTCAGTTGATCAATAAGGAGTTCACTCCAATTCCTAT CAAAGATGTAATTGAAAGGTTGCAGGGTCCTTTGGTCCAAAGGAGTTTTAACAGTTGGATTGTCACCTCTGTTGTTGAGT ACTTCCATATGCTTCCATATTCTGAGATAATCTCGGAGTGGATTTCTAGAGAAACATCCTCACACAGTTTGCAAGCTTCA AAGATGGCAGAGAACAATGTGATGGCGGAGAGCCCTGAAGTGACAGAATTGTATGTAAGTGGCGAGGGCTTGTCTGTTTG CCTTGATAACCAGCCAAGATGTGATACTACGGAAGATCTTAATCAGAAGGAGAACAATGGCTGCAAGGAAGCCCGGGATA TGGATGTGGACAACTCTTTAGTTCTTCCATCGGAAGATATAGAGGAATGCCAGAATATCACTAACAATTTACAAGTTGTT GAATATAAAGAAATAGAAAATTCATCTGTGCAACATTACTCAAATGGATCCACAAGCCCATTCGAGTGTTTGTCATCTCT CATCCAGCTACATGGCATTGGGTTTGAGGCTAAGAAGGTTGATTCAATGATCATCCCTGAGGGTGGAATCAATGATCAAT CTGCTCTTGATAAGATCTGTGCCAATACCACTCTCGAAAATAATTCCATAGAAGACTGTGCCTTGATTGCAAAAAAATCT AACTTGGATCTTGATAAGCTCCAAATTTTTCTTGCTTCAAAGATGAAGACATTGTCACAAACTGCCCTCAATGCTCTTAT AGGAAAGAGGAATGCACTGGCTCTTCAGCTCCGCATGATAGCAGATGAGATTGCTCTGTGTGATATGAAAATTCAGAGAA TCAGTGGTGGCGAAGATGTCTTGGCATTAAAGATAGATTCTATAATAGAAGGCTGTAATGATACATGGGTAAGAAATCAA GGAAGTATGTGCCCACTTATTGAGGATCAATGCTTTCCTCCATATGCTAAGAGGAAAAGATTGACAGATGCCGTGCTTAT GCAAAGTCCTTGCCAGGAACTAGATGGTGTATGTCATGCAAATAACTGGATCCTACCAACTTATAGTTTATCGCAATCAG CTGGTGGATTCCAAGCTAATTTAACAGTTAAAGGACCTGACTTTGAGAGTTCATGTGGGGGTAACATTTGTTGCCATCCT CGTGAAGCTAGAGAATCAGCTGCTGCTCAGATGTTGGTCAACTTAAGAAGTATGGCAAGATCAGCTCAGTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0294400.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MASSDVCPPEDAVKAFIEHLVDSMLPSKPTQDNPSLSQLQEVAKQVRSVVLLYNYYHRKQHPELAFLAFDEFCKLAVDLN PTLSAHIKPKQIPDEMKLVDADVRPSLIEKEILNACNICACLDASKNVPDIEGWPISKVSVLLIDNKNENFYLNFGSITQ GVWSMVEKDMGTSAQSCEVATKFFYTYKKRKSVQKTSKNELNVGEDRFLQAGYAAVKEAAGVNKTDIMLLESYTVYSQSK EKTASRFYIMKCSQTQLINKEFTPIPIKDVIERLQGPLVQRSFNSWIVTSVVEYFHMLPYSEIISEWISRETSSHSLQAS KMAENNVMAESPEVTELYVSGEGLSVCLDNQPRCDTTEDLNQKENNGCKEARDMDVDNSLVLPSEDIEECQNITNNLQVV EYKEIENSSVQHYSNGSTSPFECLSSLIQLHGIGFEAKKVDSMIIPEGGINDQSALDKICANTTLENNSIEDCALIAKKS NLDLDKLQIFLASKMKTLSQTALNALIGKRNALALQLRMIADEIALCDMKIQRISGGEDVLALKIDSIIEGCNDTWVRNQ GSMCPLIEDQCFPPYAKRKRLTDAVLMQSPCQELDGVCHANNWILPTYSLSQSAGGFQANLTVKGPDFESSCGGNICCHP REARESAAAQMLVNLRSMARSAQ
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 423 | 423 | 1.1E-278 | – | |
| PANTHER | 1 | 423 | 423 | 1.1E-278 | – | |
| PANTHER | 442 | 659 | 218 | 1.1E-278 | – | |
| PANTHER | 442 | 659 | 218 | 1.1E-278 | – | |
| Gene3D | 576 | 659 | 84 | 6.4E-6 | – | |
| SUPERFAMILY | 588 | 655 | 68 | 3.18E-5 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0294400.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…