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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0310600 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0310600.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | p-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; TAIR: AT1G50140.1 P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|E3P6S4|NAU1A_AIPDI Delta-aiptatoxin-Adi1a; TrEMBL-Plants: tr|K7LSQ6|K7LSQ6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0310600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:65809211..65820103) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AGGTGATTCACTTAAATTGTATCATATAAATTCAAATAATAAATCAAAATTCACAACCCTAGAATCAAATTTACCACTCC AATATTCAATGTCTTTGAGGAGAATACTGTGCACTCATCGGAGATGGGTCTTGTTGCAGCCGCCATCTAAATACTACTTG TTTAGACCAAAATTCTGCGATCATCTATGCTTTCATTCCTTGCCCCCAAAGACCACTGCTAAAGAAGTTGCTTCACAAAG GTGTAGTGAAAGCCTTAAGAGTTCTCAGTTACATGCTTACAGTTCTGAAAGCGATGCAAGTAGAAATAAACAAAACAAGT CTCAGGAAGATGTTAAGCACTGCAATGCACATGAAAGGAGAGAATCACCCTGTTTTGACAGAAGAGATGAGTTTAAAATT GAGATTTTGACAAGAATTGTTCCGTGGGAGAAAATTAACGTTTCTTGGGACACTTTTCCATATCCCATAGAGTAATTACT TACTTATTATTCCTTTTTATATATATATATTTTTTTTATCTTAATGTGGAATTAAGTTGTTGTATGTTTCCATCTGTAGT GAGCATACAAAAAGTCTTCTGGTGGAATTTGCTGATTCACACTTGAGATATAATAAGTTTGCTTCATCTTTTGGTACTGG CCTTGCATCTTCAAGTGGAAGAATATTGCTTCAGAGTATTCCCGGTCTGTTATTTATTCCACTTATTTATCAACTGTCAA ATAATTACATTTCTGTTAATAAAAAACACCATCTTTTAAGCAATCTCTCTATGAAGATGATTGCCAGAATCATTCATTTC CCTATAGACATAAAAACTATCTGCAAGGCTGCTCTCTCTCACACACACACACACTCTTTCAGAATCGAGATTATTCTTTC CAAATTGAAAGCATTTCCCCTTCTCTTACTTGCAAATTGAGAGCGAACATCCTATTTGAGCTGGAAAGGCTTGCACTGTT 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AGTCTGGCAGCCAAGGATCTAACCCGAACCTGGCCTTCAAGCCATTCCAGGCCTCCATATGATCTCCTCCCCAACAAAGT TCCAGCTGGGAAAACCCCTCTCCACCAATTAGAGCTACTTTTAGGCTTTGAGAACATTGGGAGTGCACCATACACTTAGA CTTAAGCAACTGAGCCCACAAATCATCATTGTGAGTACAGATTCCCCAACTTACCTTCATTATGAAAGCCAAGTTGACTT CCCTAGCAGACCTAAGCCCAAGGCCTCCTTGTAAAGTTGGGCAGCAAATTCTGTAACAAGATAGCAGATGAATTTTCCTG CTATTGTTAGTATTTCCCCATACAAAGTCTCTGACCTTCCTATCAATGCTACCACAAAGTAGACATAAGGAGAAGGTTAG TTTGCATAACATATGTAGGTAGGGATGATAAAACAGATTAGATAAATTAAGTCTTCCAGCAAAGGAGAGGTTCCTCATCA TCCACTCATATAACCTCCTATTTGCTCTCTTGGTCAAATACTGAAAAGTTTGCTTGGAAACTAGACTCTTATATGGTGGA GAAGTACCCCAAGATATTTCCTCAGGTCATCAGCTCTAAGAAAACCCATTTCAGAACTCAATTGATCTCTCTCACAGAAG AATGCACATTCATAGAAAAACAAACCCTTGTCTTTTCCTTACTTAATTTCTTATCCGAACATATACAAAAACAATCCATG GAAGCTTTGACTCCCTCTACTTGATCTAGGTTAGCTTCAGCAAAAGAACATTAAATCATCTACAAATAATAAATGAAAGA GAGGAGGACCATCAAGAGTCTCTCCATGTTAGAAGGATCACCGAAGACACACTTTTTTTTTTTTACAAATTTTAAATTTT GAGATTTTCATTCTTCTTGTGCTATTTTTGTGTTTTTCTTCTTTCCATGTTTTAATTTGAAAATTGGGGGAGTGATGGAA 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TGAGAGAGATAGGAAGAAAAGGAAAAGTATGAGCGAGAAAGTATGAGATGTGATAGATGGTAAGAAGAGAGAGATAGAAA TAAAAAGAGATGGAAATGAAGTGTTTTAAAAATGAGGTGTGTATATATCATTACTGATTTTCATTAACTACAAAATTTCC GTGGGGGCACTTGACCCCACGAGCTTCTTAGTGCATCCGTCCCTGGGCGGGAGGGCTTACCTTTTGCAGGGGACATTTGT GATTGTTAATTAATCTTGTCCACATTTTCCTTGTTTGAGTTTAAGCAATCCAAGAAGTCTGTGTCATGAATTTCCACTCC AGATCCTGAGCCTTTAACAACGGCCTTGATGGGGCTATTAGGCCCTGCCAAATTGCCCAACATTTTTTTCGATCCTACAT CCCTGGCCATTTTTGAGAATTGACTCAAAGCAATATGAGACTTGGCCTGCAGAACACCATGTTTAGATTTTTTGTTTCCA CCACTTCTTCCCTTAACCTTCTTTGAAAACCCAATAAAACCCTGCACATTAAGGGCCTCACTCTCTTTCACTTCCAAATT CTGATCCTTTATTTTTGGAGAAGATTGCTCAGGAATTACAAGAGGGATTGGATTGCACCTGCCACAGTGCCCTGAACAGA GCCTTTAACTTCAGAAGTACCTCCCAGCACACCTTTGGTGCTCAGATCTGCAGTTTATTATACAAAGCATCATACCTTGC AACCTTCTTTCTCACAGAACCACCCTGCCCAGCACTAGAGTTCCTAGGAGGCCCCATCCTTGGTCTCCTATTTTTCTGAA CAAGCATCAAAGGCCCAAATTCTTCAGCAGAATCCTTGATAAAGTTCTTCCCCAAGCTTCTACTACGTGCAGTTTTCACC TGTTTCTCCTTCATGATCTCTTTTGCAGTTAGGTTACAAGCGCCCACTTATGTCCATAACGGCCACAATGAAAGCATGCG AAATGTAACCCCTCATTCTCAACCGGAAGCCTTCTCTTGTGAATACTAACTCTAGATACCAACACTTAGTGAAATCGACA ATGAAAGCATGCGAGAAGAGGAATTCTTCACAGTTCACACTAGAGGTTTCCTTCTTGGCGGCCATTCCCGGTATTCTGAT TGAAATAACCGTTTTTTCTCTCTAACTTTCTTGCTCTAACTTTCTCTCTATTCTCTAATAGTATATGGGTTTCTAGCATC ACACTATATATGGTTACTTAGTGATGCTATCTCATGACACGGTTACCATTATAGTTTGATATTCCTTGAAGCTTATCTGT TAGATTGTTTTTTATTGACAAACACTGTAAATTGCATGCAAATGAGAATTATTTATTTCTCATGCAGGTATTGCTTTTAT CCAATTTTAACCAATTTTGGATGTATTGCAGCAGGCCTTTAGCTAATGGTCAGAGAGGAGAGGTGTATGAGGTTAATGGA GATCGAGTCTCTGTCATTTTGGATATTAATGAGGATGAGCTGGAAAGTGTTGATAATAGAAAGCCACCAATTTGTTGGAC TAATGTTAACAACATTGAGCATGATCTTGATGCTCCATCAGAGGATTGCTACATAGCAATGGAGGCTTTATGTGAGGTGG TATTTTTCAATTTTTGGAACCAAAACCAATTTTGGATTAGTAATAATAATAGGTAGACATCACCATGACTGACTGTTGGT TTTGCAGGTTTTACATTCCGAACAACCACTTATTGTCTATTTTCCAGATGGTTTGCATAAATCAGTTCCGAAGTCAATCC AAAGTGAGTTTTTTCACAAGGTCCAAGAGAAGTTTGAACTGCTATCTGGCCCCATAGTACTGATTTGTGGGCAAAACAAA GCTCAGTCGAAAGGACAATTAGTAAGCTTTAATTTTTATTTATATTCTAAAAGTCTCCTACTGATTTGCATCATTTTGAC TTTTCTTATTTATCATATTTGACAGACAATGATACTTTCAACTTTGCTTGCGTTGCTAAGTTGGTAATGATGTTAGAAAT AAAGTTAATAATAATTAGAAAATAAAGGTTAAAAAATGAATGGTCATGAGTTAGTATGCATTAAGGAGAATTATGTGTTT AAGGGCCATCATTCTTTGTTATGTAACCACTAAGCATTTACCATGTCTATTAAGTATTTTTAATTGAGTAATTATGTAGT TGTTATGTGTTTATCATTATAAATGGAAGACCATCTCATGTAGCATGTGAGGAGAAATAATGAGTTCCTCATTTTCTATA TTCTCCATCTTTTATTTTTCCAACAAATGATTCCTATCTTTCTACATTTTTTTGCATTAGTTCAAAAATAGTATTCCATG GTTTCAAATTTTGCTTCTATTAAATCACTTCTTCTTCTTCTACTTAGATCCCCTAATATGTTGATAAATGTAAAGTCGTT GAATTTTTTCATGGTTGAAATTTATGTCAACCTTATCTCCTCCCAAATTTATTGAATTCATTTTCATAATTGTTCACAGC TTTTTTCTATGAATAAAGGGCAAAAGACATCAAAAGATGGTGAATTTTACAAGCCCTTTAATGTGTTGTCTATACAGCCA CCTAAGGTAAATTTTAAGTATATCTATTATTAGTTTCATTATATCGTGGTTTATGTCATCTGAAATTCTGTATGACTCTT TACAGGATGAGAAACTACTGGCAATATTCAAGAAACAACTTGAGGAAGATAGGAAAATTGTGATTTCACAAAGATATTTG AAGAAACTACGGAAAGTAATTCTCTTATTTCTGAAGCGTCTATTGTTACCTTGCGGATGACTGATCATATGTGTGTGTGT GATGACATATGGAATCTCTTAATATGTTATATTCCATCAATGTACATTTATAGCAAGCTGGACTTTCTTGTTCTAGGTTC TCGACGAAAATCAGCTGTCGTCAGTGGACCTCTTGCATGTAGATACTGATGGTGTCATTTTGACTAAGCAAAGTAAGAAA CTCTACTTAGATTTTAAAACTGTTAGAATTAGTTACATTAAATTACTCGTAGATATGATTAAGATACAATTTTCCTGCAA CACCAAACACTTCTCTTGCAGATCAAGATAAATCCAGATGAAGATCCAATTCAGAAAGAGAGTCTTGGCTAATATGGGGT TGCTGTCCTTTTGGGTGGTAATACAATTTAAGTTTATTGGACTGTGATTGTTTGTTTTGGTGGGGTTACTGTCAAAGCTG GCTTTCCATTTCAATTGGCTTGGCTTCATAGGGTCTTTGGCTTTAATGTTGGGGTTGATCTAGGACTAGTAGTGGGGAAG GTGCTGTAGGTTTGGGTGTGGTCCGTCTATTTTGGTTTAGGTGCAGCTATGTCTGCAGTTTTCTTTTTTCTTGTTCTTTT GGCTTGTTAGTTTTTTCTTGTTTCTTTTCTTCGTATTGGGTTGAAGTACCCCTTGTACTTCCTATCAATACAATCATTGC TTATCTAAAAAAAAAAAAAATTCAGAAAGAGAGTGAAATATCTTTACTTGAAAAATAATGTGGCTAAACTTTAATTTTAA TAAGTGAAAGGATTTGTTTAGAACTAATTTTAAGTTTATTTTCATAAATAAATTTATTTCTAAAATTAATATTAATGTTG ACTCATTTACACGTGGCCATTTATTATTGGTCCAACTCAGTTTTGGTGTGTTACCTTAAGCTGGGTTAGAGCATCTACAT TCATCATACTGACTAAAATATCTACATTTCATTTTTTTTATAGGGTTAAGGGTCATATTAGTCATTTTGTTTGTAAAAAC GTTTGATTTTGGTCCCTTAGTCAAAAAATCGCCAGTAATTATATTATAAACCGCTAGTAACTGTAAAAAAAACCGCAACT AATCGTCATTTTTTTACTAAGGGACCAAAATCAAACACTTTTATAAACACAGGGACTAATATGACCCAAAATCAAACATC TACATTTCCCATAATACCACATCATCTACACCACTTTACTAATTTTTTTACTACAACCCAACAACTCTTAAATTTTCTAT AGTGGATCCCTCCATCAACATAACATTTGTATATTTTATTATTTATCTCCATTTTAATCTAATTATATTAATTGTAAGTG CTTGTAATAAATACAAGTTCAATTTTCAAGTCTAGTGTAGAGTATCTATTCCCACATACTTATTTTTGTCATGTTGGAAT TGAATATGTATTCCAATGGTAATAGATACTCATATGAGTATGTATTTAACATTAGATACTACCATTGGAGATGCTCTTAA GGTACCACAACAAGCACCATTTTTTTTAAGTGAGTGTTTCGTTATGTTCTGTTTTGTTCCACCTTTTTCAACGGAATCAA AGTGTTTCGTTCCTGGAGCTTTTTGTCCTGTTCTGTTCCATTCTAAAAACATAACAAACACAGAATGAAACACATATGCC ATATTTCGTTCCCTTCCAAACTGTCTACCAAACGCTATACCTAGAGATGCACTTCCAAAACCTGCCCTAGAAGATATGGT TTCATTGCCACTGATAGAGAGTTTTCTATCAACCTAGTTAGATGGACCATCTGAGTCAGAGGTCAGAACCTTCAATGTTG GTAGAAGACTCTTCAGATTCAATTTCAGCAGGGGATACCACTTCAAGTTCGATATCATTACCCTCATGATATTTTTAATA ACATGATGCACACTTTGAATTGTAGTTGGATAAACTTCATCTTCAGAAAGCCTTGAAGTTTCTCCTTCCCGGTGTTTCAA TCTGTGTAGGGTGTACATTCATCTAAGTCTCATGTTGTAATGACTCTTACTCCGGCTAGTGTTGGCAGTTTACAACTTTG GAGGCTATAACAAATATATACATTTCCTATCATGTTTATGACTTCATGCCCATTTGTTAGTGTGCTAGCATGTGAAATCT TGATGCATACTCAGAATTTAGTAAAGATGTTTCATATTTGAGACATGGAAAAGCAGTAAATTGTATTTTTTTTTCTTCTG ATGAGTGACAGAACCACCTTTGAAGAGTGGTCTTGCAATTATGTATGACATAATCTTGCTCATACTTATTAATATTCATT ATGTTCCTTTTATCTTATTCTCTCTTTGCTTACTTTGGTGATTATGGATTAACTAATCACCAACATATTAGAGATTTTAA GATTTAATTTAAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0310600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCTTTGAGGAGAATACTGTGCACTCATCGGAGATGGGTCTTGTTGCAGCCGCCATCTAAATACTACTTGTTTAGACC AAAATTCTGCGATCATCTATGCTTTCATTCCTTGCCCCCAAAGACCACTGCTAAAGAAGTTGCTTCACAAAGGTGTAGTG AAAGCCTTAAGAGTTCTCAGTTACATGCTTACAGTTCTGAAAGCGATGCAAGTAGAAATAAACAAAACAAGTCTCAGGAA GATGTTAAGCACTGCAATGCACATGAAAGGAGAGAATCACCCTGTTTTGACAGAAGAGATGAGTTTAAAATTGAGATTTT GACAAGAATTGTTCCGTGGGAGAAAATTAACGTTTCTTGGGACACTTTTCCATATCCCATAGATGAGCATACAAAAAGTC TTCTGGTGGAATTTGCTGATTCACACTTGAGATATAATAAGTTTGCTTCATCTTTTGGTACTGGCCTTGCATCTTCAAGT GGAAGAATATTGCTTCAGAGTATTCCCGGCACTGAGCGTTATCAGGAGAGATTAGTTAGAGCTCTTGCACAACATTTACA AGTTCCTTTGTTGGTGTTTGATAGAAGCATCCTTACTGCTTATGATATTGAAGAGCCAGATGTTAGTGAAGATGAAAGTG AAGATGCAGAGGCTTCTGCCAAAGCAGTCCTTGAGAAAATTAAAGCTGCTGTTCAGAAACTTGTCCCATATAACGTTGAA GAGTTGCCGAAGGATATATCTGGGAAGGAAGGTTCTCTGGAGTCAGACTCAGAGAATGAGGAAAGGTGGTCGAGCGACTC CGATGTTGAGTCAGATGCTACTGAAAATGAAGATGCAGTGGCTTCTGCCGAAGCAGTCGTTGAGAAAATTAAAGCGGCTG TTCAGAAACTTGTCCCATATAATGTTGAAGAATCGTCGGAGGATATATCTGGGGAGGAAGGTTCTCTGGAGTCAGAGAAT GAGGAAGGGTGGTCGACCTATTCCGATGCCGAGTCACATGCTAGTGAAAATGAAGATGCAGAGGCTTCTGCCGAAGCAGT CGTTGAGAAAATTAAAGCGGCTGTTCAGAAACTTGTCCCATATAATGTTGAAGAATTGCCGAAGATAATCTCTGGAGAGT CTGAGACTTCCAAGTCTAATGATGGCAAGTTCGATGATAAATTTGAATGTCAACTAAGAAAAGGCGACCGTGTGAAGTAC ATTGGGCCAGATATTCCAGTTACAGCTGATGATAGCAGGCCTTTAGCTAATGGTCAGAGAGGAGAGGTGTATGAGGTTAA TGGAGATCGAGTCTCTGTCATTTTGGATATTAATGAGGATGAGCTGGAAAGTGTTGATAATAGAAAGCCACCAATTTGTT GGACTAATGTTAACAACATTGAGCATGATCTTGATGCTCCATCAGAGGATTGCTACATAGCAATGGAGGCTTTATGTGAG GTTTTACATTCCGAACAACCACTTATTGTCTATTTTCCAGATGGTTTGCATAAATCAGTTCCGAAGTCAATCCAAAGTGA GTTTTTTCACAAGGTCCAAGAGAAGTTTGAACTGCTATCTGGCCCCATAGTACTGATTTGTGGGCAAAACAAAGCTCAGT CGAAAGGACAATTACTTTTTTCTATGAATAAAGGGCAAAAGACATCAAAAGATGGTGAATTTTACAAGCCCTTTAATGTG TTGTCTATACAGCCACCTAAGGATGAGAAACTACTGGCAATATTCAAGAAACAACTTGAGGAAGATAGGAAAATTGTGAT TTCACAAAGATATTTGAAGAAACTACGGAAAGTTCTCGACGAAAATCAGCTGTCGTCAGTGGACCTCTTGCATGTAGATA CTGATGGTGTCATTTTGACTAAGCAAAATCAAGATAAATCCAGATGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0310600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSLRRILCTHRRWVLLQPPSKYYLFRPKFCDHLCFHSLPPKTTAKEVASQRCSESLKSSQLHAYSSESDASRNKQNKSQE DVKHCNAHERRESPCFDRRDEFKIEILTRIVPWEKINVSWDTFPYPIDEHTKSLLVEFADSHLRYNKFASSFGTGLASSS GRILLQSIPGTERYQERLVRALAQHLQVPLLVFDRSILTAYDIEEPDVSEDESEDAEASAKAVLEKIKAAVQKLVPYNVE ELPKDISGKEGSLESDSENEERWSSDSDVESDATENEDAVASAEAVVEKIKAAVQKLVPYNVEESSEDISGEEGSLESEN EEGWSTYSDAESHASENEDAEASAEAVVEKIKAAVQKLVPYNVEELPKIISGESETSKSNDGKFDDKFECQLRKGDRVKY IGPDIPVTADDSRPLANGQRGEVYEVNGDRVSVILDINEDELESVDNRKPPICWTNVNNIEHDLDAPSEDCYIAMEALCE VLHSEQPLIVYFPDGLHKSVPKSIQSEFFHKVQEKFELLSGPIVLICGQNKAQSKGQLLFSMNKGQKTSKDGEFYKPFNV LSIQPPKDEKLLAIFKKQLEEDRKIVISQRYLKKLRKVLDENQLSSVDLLHVDTDGVILTKQNQDKSR
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 51 | 280 | 230 | 7.2E-137 | – | |
| PANTHER | 51 | 280 | 230 | 7.2E-137 | – | |
| MobiDBLite | 63 | 86 | 24 | - | – | |
| MobiDBLite | 245 | 281 | 37 | - | – | |
| MobiDBLite | 245 | 269 | 25 | - | – | |
| MobiDBLite | 303 | 341 | 39 | - | – | |
| PANTHER | 332 | 626 | 295 | 7.2E-137 | – | |
| PANTHER | 332 | 626 | 295 | 7.2E-137 | – | |
| Coils | 337 | 357 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0310600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…