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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0335800 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0335800.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Malonyl-[acyl]-carrier protein] O-methyltransferase; TAIR: AT1G22800.1 S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; Swiss-Prot: sp|O80543|Y1280_ARATH Putative methyltransferase At1g22800; TrEMBL-Plants: tr|I3T7V3|I3T7V3_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0335800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:70572788..70590270) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ATCTGTTTATTTATTATTTATTTATTATATACACTAAAATCATATTTTTGGCCCATAAAAATTTGTTGAGGGTAAAATAC ACGCATCCACATATACCCTCGGAGCCTTTTGCCCTTTTGAGATATTTAGGAAAAATGTACAAGTTAAAATTGTTCACTAC ATATATCTTTCAGTTATCACTAATCACGAAAATAGTACCCCATGGCCCATGCTACATAGCCAATTTTAAAATGGAAGCTT GTATAGATGGGGTTCATGCTATACTCATAAAGGAAGCATAGAAGTTAAACACTGCGGTAATAGAGATAGAGAGATCCATT GATCTGAGTCATTCAACAACAGGTTTAACCCGTTCAAGTGCCTAATAATCCAATCCCAATATCTTTGAAACAATGTTAAG AGACTCAGTTGACTTAAACTTTATGCAAAATTAGTTCTTTACAATTTTCTCTAGCCTACCAGGGGCTTTGTTAATCACAC ATCAAGATAGGCTTTGTACTAATTTCAAACAACATAAGTTTTCATTTACTGAAAGCTGAAATCATAAAATAACTGTTGAA TAAGTATCGAATAAATAAGATAAGATCACCTTGTAGTCCCCAGATTGAAATCCAGTGCTGTGATCAATAAAGTAAGGAAC CTGTAGAGGACAACTTTCTGATTCATGAAGGATTCAAGTTGATAAATCAGAAAATGACCAAGAATAGAACAAAGAAAAGG ACACGAAAATTCCAGCCCCAATCATTATTATTAATCCATTACTATTTCCAATTCCAGTACCTAAAAAACACAACTAAGAA CTAACTAGACACATTATTCTGTAAAGTGGCTTTGTCAATATATGTTTCAAAATAATTATCAAGGCATAAAGTCACTAAAA ATTTAAACAATGGCATTCAAAGGCTACTTCGTGTCCATAGTAATGTTGTGCTTAATTTAATCTTGTCATTTGTGATTTTT 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TGTTGATTAACACATCGTTCAACTGTTGGACCTTGACCTCATATAAAATGAAAAATTGGCTACCGTAAAAAAACACAATA TTTGGTAACACTATTTGTATTGGTAAAAATTCATATGAAATTTTAGTAAATTGAAGTCTCACTCTTAATTTAGTGTGTCC TTCATAGATTGGAATAATAAAACAGATGAGGTTGAAAAACAAG
CDS sequence (LotjaGi3g1v0335800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGAGGATTGTTGTCACTCTTCCGTAGAAAACCACTCTCATTCCCTCCATTCTCTTTCTCTCCATTCTCCACCTCGGA ATCCAAGCTCAAAGTCTTCAATCGTGAACTCAAGCGCACACAGCGCGATCGAGCTGCATGGTTGATGCCGCCGAACGACC CTCTGCTTCACACTGTTGCTGAAAATCTATCGGATCGCTTGCAGGATTGTAAGAAGAATTTTCCAACTGCTTTATGTTTG GGAGGCTCATTGCAAGCTATCACGAGCTCGCTTCGTGGCCGCGGTGCCATAGAAAAACTAATTGTGATGGATGCCTCCCA TGACATGGTACAAGCTTGTAAGAATGCGAACCACGGGTTGAACAATAATGGTATGGAGACTATGTATTTGGTTGGCGATG AAGAATTCTTGCCTATCAAAGAAAGCTCTGTGGATTTGGTTATTAGTTGCTTGGGGCTACACTGGACTAACGATCTGCCT GGAGCAATGATACAGTCTAGATTGGCATTGAAACCTGATGGCTTATTTTTAGCAGCTATTCTCGGTGGAGAAACATTAAA GGAGCTCAGAATAGCGTGTACTATTGCACAAATGGAGCGTGAAGGTGGTATCAGTCCACGAGTATCACCTTTGGCACAGG TTCGAGATGCTGGGAATCTTTTGACTAGGGCAGGGTTCACCCTTCCGGGTGTTGATGTCGATGAGTATGTAGTTAAATAT GATAGTGCTCTGGAGCTTATAGAACATCTCCGTGCAATGGGTGAAACAAATGCTCATTCTCAAATGAACACTATACTAAA GAGGGACACAGCCTTAGCAACTGCAGCTATTTATGATTCAATGTTTGCAGAAGAAGATGGTACTGTACCTGCAACCTTTC AGGTTATATACATGACCGGATGGAGGGAACACCCTTCTCAGCAGAAAGCAAAACGAAGGGGGTCAGCTACTGTATCTTTC ACTGATATTCAGAAGCAATTTGGTAGCCAGAATTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0335800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRGLLSLFRRKPLSFPPFSFSPFSTSESKLKVFNRELKRTQRDRAAWLMPPNDPLLHTVAENLSDRLQDCKKNFPTALCL GGSLQAITSSLRGRGAIEKLIVMDASHDMVQACKNANHGLNNNGMETMYLVGDEEFLPIKESSVDLVISCLGLHWTNDLP GAMIQSRLALKPDGLFLAAILGGETLKELRIACTIAQMEREGGISPRVSPLAQVRDAGNLLTRAGFTLPGVDVDEYVVKY DSALELIEHLRAMGETNAHSQMNTILKRDTALATAAIYDSMFAEEDGTVPATFQVIYMTGWREHPSQQKAKRRGSATVSF TDIQKQFGSQN
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| SignalP_GRAM_POSITIVE | 1 | 14 | 14 | - | – | |
| PANTHER | 25 | 328 | 304 | 1.6E-136 | – | |
| PANTHER | 25 | 328 | 304 | 1.6E-136 | – | |
| CDD | 76 | 181 | 106 | 2.37381E-8 | – | |
| Gene3D | 76 | 286 | 211 | 1.2E-14 | – | |
| SUPERFAMILY | 79 | 256 | 178 | 4.8E-18 | ||
| Pfam | 82 | 177 | 96 | 6.4E-10 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Methyltransferase activity | Catalysis of the transfer of a methyl group to an acceptor molecule. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0335800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…