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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0392100 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0392100.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Proline-, glutamic acid-and leucine-rich protein 1; TAIR: AT1G30240.2 proline-, glutamic acid/leucine-rich protein; Swiss-Prot: sp|Q58HI1|PELP1_XENLA Proline-, glutamic acid- and leucine-rich protein 1; TrEMBL-Plants: tr|K7KZW9|K7KZW9_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0392100 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:79061241..79081057) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTAGTTCCTCACTTGACCAAAGCTAAAACCCCTACACCGCATAAGGCCACCTTGTCCCTCCTCCGCCGCAACCGTGTTCT CCTCTCCCTTTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCTCTCTGTCTCAGAAAGTGTTTTTCATTGCACGTTGGAAGCTTGTTATTGC TGCCAACAATGGCGGCCTTTGATCACTTCGGGGGCATGGACGATGTTGAACTCAAACCCCGCTTGCTTCGCACCCTTATC AGTGACCACCTCCGTGACAAGAAGCGACCCTCTTTCAACCCCTCTGCGTTATCCAAGGTCATCTCTCTGATCAGAACACA TTCTCTTTTATCTGAGTCTTTTACAGAATCCATGGCCCCCGAGCTTGTTGAAGAATGGAAATCCGCTGTTACATCATGGG TCGAACGCATTGAGACCCTCCTTGAGAGCTCCACGGTAAATTTCATTACTCTATTGGATTGTTGTTTTGAATGAATTTAT TGATGTTTTTATCTGTGTGAAAACCATTTTGGTTTACACTTGAAGATTGGAGTTCTTTTTTGTATACTCAGCTTTTTGAT ACAGATTAGTTTACACTTGAAGATTGAAGTTCATTTTTTGTTATCTGCGTTCACAGAGTTGGTTAATTGACATGGCTTAA TTTTCCTTTTCCAGCTAGATAAATGTTGGGCAGGTATATCTTTGCTGGGGGTTACTTGCGAGCTGTGCAGCGATGATCGT TTCGTAGACTCTTACTCTTCGTGGTTCGATAAGTTGAAGAAAAAACTACAGGTTATAAGTTGTTTTGCCAGTGCACATAA TTCTCTTTCAAGTTTTCTTTGTTTTCCCTTTTGGGGTATCAAATGCTGCTCACTGGTTTGCTGTTGCTTTGGGCTATATC TGAACTTAGACCTGAGTAATGCTCTAAATTTGATATACCCTAGCTACTATGTTCAATTTTTTTTTTCGACGCACCTTTAA 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TGGTGTAAATAAGACATTTCAATGATAGTTATTAGTGTTACAAGATGTTTAAGGTTTTATAACTTGAAGAATTGGTGTTG CGGTTGTTGGAAAGTATCTCCTGTCTTGTGTTGTATACTTGCTGTTAATAAATAATAATTATTATATATTACATGATTTA TATCTAATTCCTAGAAGCTAGGATTCAAATTAGGTCTTTATTAGCAACAGAAAATATTACTTCAAAAAAAAGGTAACAAC AAATATGCAAAACATAATTAGCATCAATAAATTATGTTTCTTCCGTGTAGAATTATGATTATCTAATAAATATTAGCATT TTAGATTCCTGATGTGACTTTCTGATAGCAATTCAAACCTTTCTCTTGCCCACAATTTCATGTTATATTATGTTAATCTT CCTCCCTGTTTGATTAAAAATTATGAAATCTGTGCGTGTAGGAAGGCAACAAACAGGAACTAAACTTGCTGAGTTCTGTG CCCATGCTCTGTTAACCTTGGAAGTGCTGATACATCCTAGGGCACTTCCACTATTAAATTATGACTGTGCAATTAACAAT GAAGCTCAGCGCAATTTCCAAGATGAATACACTAGCTGGAACAGCGGCGGCGCATTTGGTTTACCACAAACTGCACCTCC AGACTATGAAGATAATTTATATGCTAGTTGGCTGGGAAATGGCAATAATGAAGCTGATATGTCATTGGCTAAAGAGGCAG AACACACCAAAAGGCCTTCTGAAGCTTGCAGAGATAATGACCCCAAAGTGCTTTCTGCAAACCTGTCCTCTGACACCATC ATCCAAGAGAGGAGTGAGATGGCACCTGAGACTGCCACCGGCAAAGATGTTGAAATGAGGACCGAGGAGGGTGCGTTCAG TTTCATGTCAGGTCAACCCGGAGATTCTACGGTGCTATTTAAAGAACCCGTCTCTTGCACCACAAGCATCCCTGACATTG ACGCTCACTTCGGTGCTGTAGCTACTGAGATATCTGAGAGGGTTGTTTCTGACAGTGCCATGCCTGATAGGAACAGTTCA TTGATAGGAACATCAGACTCCAAAAGGACCAGGGAATTTGCATTTAAATTAGATTATGGCAGCTCAGAGGCTGAGGATGA TCCTTTTCCTGCTATTGTGGATGCAGACCCAGATACAGACTCTGAATAAGGGGGAGATTTTCTTAATTGCTTTTTGATCC AAAGAAGCATAAAGAACTGTAGTTCATAAATACCTTGTAACTTGAGAACTTTTGTAATCTGTTATACTATCTGGTTTTCC TTAGGTAATGCGTTATGCAAATTTTGAATGACCAAGGGAAGTGTGGATTATATATTGCGGAATAATATTTCATGTAATTC CCGATTATAAATTTTGGGATTTAAATTTGTTTATATCTCGGGAAGTTAATTTCCAGAACTATGTTTCAGTGATATGATAT TATTCTGGTATTGGGTCTGATGCTAAAAATTTGTTTCCAGAATTAAGAGAGAGCTTCGTAATGTTTACCGTTTTCAAAAA CTGAAAACATGTTTTTAGAAACAGTTCTCATTTTAGTTTTTTAATTAAAAAACTAAA
CDS sequence (LotjaGi3g1v0392100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGGCCTTTGATCACTTCGGGGGCATGGACGATGTTGAACTCAAACCCCGCTTGCTTCGCACCCTTATCAGTGACCA CCTCCGTGACAAGAAGCGACCCTCTTTCAACCCCTCTGCGTTATCCAAGGTCATCTCTCTGATCAGAACACATTCTCTTT TATCTGAGTCTTTTACAGAATCCATGGCCCCCGAGCTTGTTGAAGAATGGAAATCCGCTGTTACATCATGGGTCGAACGC ATTGAGACCCTCCTTGAGAGCTCCACGCTAGATAAATGTTGGGCAGGTATATCTTTGCTGGGGGTTACTTGCGAGCTGTG CAGCGATGATCGTTTCGTAGACTCTTACTCTTCGTGGTTCGATAAGTTGAAGAAAAAACTACAGCCACCAGCAGATTCGG ATCTAGTGAGGGTGGCTTGTTGCGCTTCAATATCTGATCTATTTGCAAGGTTAAGTGGATTTCCTAAGCTCAAGAAAGAC TGTGTTGTGAAAGTCGTTCAGCCTGTTTTGAGGATGTTACAAGATGACAACTCAGAGGCAATTTTGGAAGCTGCAGTTCA TGTGTTATGTACCATATTAACTTCATTTCGATCTTCTATTCAACATCATGATAATGATAAAGCTGTTGAATCTGCTATTG CTTCAAAACTTTTGTCCGGAGGATTCAGTCCTGATATGCTGAAGAATCTTGTACACTGCCTTGCATTACTTCCAAAATCA AGAGGAGATGAAGAAAGCTGGTCTTTGATGATGCAGAAGGTTTTGATTTTAATAAATGATCAATTAAATTTGGCATTTCA AGGTTTAGAAGAAGACACCAAACGTAATGAGGTTAGTAGATTGTTGGTTCCCCCTGGAACACATCCTCCACCACCTTTAG GAGGACATATTTTGGCAGAAGCTAGTAACAAAGAAGCAAAGAGGTCTGAACAATCTCTAATGTCTAATGTCTCAGTGCTT ATGTTTGGCTGTTGCACAATGCTTACAAATTCATATCCTGTTAAGGTAAACGTACCTGTACGCTCGCTATTGGCCCTTGT TGAGAGAATTTTGAGTGTAAATGGCTCTTTGCCACAAATGTCTTTTCCATTCATGACCTCGATGCAGCAAGAGAACATCT GTTCAGAACTTCCAGTTTTGCACTTGTGTAGCATGGAATTGCTTATGGCTGTCATAAAGGGCAGTGGAAGTGAACTAATA CCACATGCTGCCTCTATTGTGCGTATCATCACACAGTACTTCAAGACATGTGCATTGCCTGAATTAAGGATTAAGGTCTA TTCAGTGACAAAGACTCTGCTCATATCCATGGGTGTTGGAATAGCTATGTACCTCGAGCAGGAAGTTGTCAACAATGCTA TTGCTGATCTGAGCACCATTAAGAATAAGAATAGTGTCACATTGAATGGTTCAAATTCAGACGTCTCTGTTAGAGTGCCA CCACCAACAAATCATAGAAAAAGGAAGCATAGCAGTAATGCTGGGTCTCTTCAGGAGCATGTCGAAAGTGTTGGTTTAGG AGTGAAAGATCCCAAGAACCGTCCACTAACTCCAATTTCTCTGAGGATAGCTGCACTCGAGGCATTAGAAGCTCTTGTTA CTGTGGCTGGTGCTTTAAGATCTGAACGGTGGAGACAAAAAGTTGATAGTCTTTTGATGGACATAGCAAATGATTCTTTC AAAGAAGGACCATCTAGTGAAGAAATAAGTGTGCTTCAGCAAAAGGATCCTGCTGCAACTGCCGCAGATTTGCAGCTTGC TGCATTGCGTGCTCTTTTGGCATCTTTTCTTTCGTTTGCTCGGGTGCGACCTCCATATATATCCCAGGGCCTTGGACTAT TCCGTAGAGGAAGGCAACAAACAGGAACTAAACTTGCTGAGTTCTGTGCCCATGCTCTGTTAACCTTGGAAGTGCTGATA CATCCTAGGGCACTTCCACTATTAAATTATGACTGTGCAATTAACAATGAAGCTCAGCGCAATTTCCAAGATGAATACAC TAGCTGGAACAGCGGCGGCGCATTTGGTTTACCACAAACTGCACCTCCAGACTATGAAGATAATTTATATGCTAGTTGGC TGGGAAATGGCAATAATGAAGCTGATATGTCATTGGCTAAAGAGGCAGAACACACCAAAAGGCCTTCTGAAGCTTGCAGA GATAATGACCCCAAAGTGCTTTCTGCAAACCTGTCCTCTGACACCATCATCCAAGAGAGGAGTGAGATGGCACCTGAGAC TGCCACCGGCAAAGATGTTGAAATGAGGACCGAGGAGGGTGCGTTCAGTTTCATGTCAGGTCAACCCGGAGATTCTACGG TGCTATTTAAAGAACCCGTCTCTTGCACCACAAGCATCCCTGACATTGACGCTCACTTCGGTGCTGTAGCTACTGAGATA TCTGAGAGGGTTGTTTCTGACAGTGCCATGCCTGATAGGAACAGTTCATTGATAGGAACATCAGACTCCAAAAGGACCAG GGAATTTGCATTTAAATTAGATTATGGCAGCTCAGAGGCTGAGGATGATCCTTTTCCTGCTATTGTGGATGCAGACCCAG ATACAGACTCTGAATAA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0392100.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAAFDHFGGMDDVELKPRLLRTLISDHLRDKKRPSFNPSALSKVISLIRTHSLLSESFTESMAPELVEEWKSAVTSWVER IETLLESSTLDKCWAGISLLGVTCELCSDDRFVDSYSSWFDKLKKKLQPPADSDLVRVACCASISDLFARLSGFPKLKKD CVVKVVQPVLRMLQDDNSEAILEAAVHVLCTILTSFRSSIQHHDNDKAVESAIASKLLSGGFSPDMLKNLVHCLALLPKS RGDEESWSLMMQKVLILINDQLNLAFQGLEEDTKRNEVSRLLVPPGTHPPPPLGGHILAEASNKEAKRSEQSLMSNVSVL MFGCCTMLTNSYPVKVNVPVRSLLALVERILSVNGSLPQMSFPFMTSMQQENICSELPVLHLCSMELLMAVIKGSGSELI PHAASIVRIITQYFKTCALPELRIKVYSVTKTLLISMGVGIAMYLEQEVVNNAIADLSTIKNKNSVTLNGSNSDVSVRVP PPTNHRKRKHSSNAGSLQEHVESVGLGVKDPKNRPLTPISLRIAALEALEALVTVAGALRSERWRQKVDSLLMDIANDSF KEGPSSEEISVLQQKDPAATAADLQLAALRALLASFLSFARVRPPYISQGLGLFRRGRQQTGTKLAEFCAHALLTLEVLI HPRALPLLNYDCAINNEAQRNFQDEYTSWNSGGAFGLPQTAPPDYEDNLYASWLGNGNNEADMSLAKEAEHTKRPSEACR DNDPKVLSANLSSDTIIQERSEMAPETATGKDVEMRTEEGAFSFMSGQPGDSTVLFKEPVSCTTSIPDIDAHFGAVATEI SERVVSDSAMPDRNSSLIGTSDSKRTREFAFKLDYGSSEAEDDPFPAIVDADPDTDSE
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Pfam | 18 | 220 | 203 | 7.8E-34 | ||
| PANTHER | 32 | 856 | 825 | 5.9E-201 | – | |
| SUPERFAMILY | 71 | 557 | 487 | 9.36E-16 | ||
| MobiDBLite | 471 | 496 | 26 | - | – | |
| MobiDBLite | 835 | 858 | 24 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi3g1v0392100.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…