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LotjaGi3g1v0497100.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi3g1v0497100
Transcript ID LotjaGi3g1v0497100.2
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Beta-glucosidase; TAIR: AT2G44450.2 beta glucosidase 15; Swiss-Prot: sp|Q7XKV2|BGL13_ORYSJ Beta-glucosidase 13; TrEMBL-Plants: tr|K7LPI2|K7LPI2_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0497100
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr3:91544897..91555328) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

AAGGGAAAATAAGTGCCGGTATAAACCAAGAAGGAATCAAGTATTACAACAACCTGATCAATGAGCTACTGCATAATGGT CATGAGTACTCTATTCTTTATTCTTATATCATCACATCCATGATGTTCAAATTCATAATAAATTGATGGGGTTAATTCAG GTCTTCAACCATTTGTGACCATTTTCCATTGGGATCTTCCCATAGCCTTACAAGACGAGTATAGTGGCTTCTCGAGTCCT CATATCATGTAAGTGGCATGACACAACATGGATTGTAGGAATCAGAATCCTCTCATATGTTGATATTCCACGTGACATTG TTAGCTACAATTTTGTGTCTATTTCTCTCATCATATTTATTAAATAGATTGTACTCTATTTATGAAGGAGAAAAAGACAC AAAATTTTATATGGCAATGTCATGCAACATAAAAGTATCTTGGTCCAGATTGTAGTAGTGTTGAACACGCATTTTTATGT GTAGAAATGATTTTCAAGACTATGCGGAACTTTGCTTCAAGGAGTTTGGAGATAGAGTGAAGCATTGGAGTACTCTTAAT GAGCCATACAGTTACAGTTCGATTTTTAATGAGCCCTACCTGACCTCGCACTATCAACTCCTTGCTCATGCAGCTGCTGT CAAAATTTATAAAACCAAATACCAGGTGCAGTGCTAGTCCACGGGAGGACCCAGTCTCTAATTCTTTCTCCATTAATGGT CCAATTTATTAGTGTGTGATTGGATATTAATTGAGTACTGCACTCTAAACGAACTTTCATCTCAATCTATAAGAGTTTAG TTCACTTTTCTTTTCTACAAATTGAGTGCTAACATTTGTTTGCATTGTTGTCAATGATTATCTAAACATAAGCCATATTA GTTGAAGGTTGTAGCAATCTTGTTCATTATTATGAAACGTTCAAAACATTAAAAAGTTGAATATGAGCAGGCTTCTCAGA AAGGTTTTATAGGAATCACCTTAAACAGTAACTGGTTCTTGCCATTCTCAAATGACAAATCAGACCATCATGCTGCCCAG CGTGCTCTTGATTTCATGTTCGGATGGTAAGTAAACAGTATTCAATTCTATTCTATTCTACGGTCTTTCTATGTGTGTCT TGCTTCTTAGTACATATTTGGAAACTCTTCTACAATTGATTATGAAGTCAGAATCAATTATAGAGATAAGCTTCTAAGTG GCTTCCAAGTTTCCGAATTCATTATAATGTAAGATAAACTGATCCAAACTTGTTATTTGATTTGGTTGCAGGTATATGCA GCCACTCACGACAGGAAAGTATCCAGAAACCATGATGTCTTTGGTGGGAAATAGATTACCAAACTTCACTGAGGAGCAAT CCAAGCTACTTGCTGGATCATTTGATTTTATTGGAATAAATTACTACACCAGTAATTATGCTGCAGATATACCTCATTCA AAGAATGACAAAAGCATACCGAGCTACTCCACAGATTCTCATGCCAACTTAACATGTAAGAACACTTGATTACAACTCTT AATGAAGAAATCATAAATTACATGCCCTTTTTCTCCTTTTGGAAAGAGTTAGGACCTCATGGAATCCTGCATTCGGTTAA TTAGGGCCGCATTGGACGACTCAGATTTGAAGAGATAACTATACACTTAAAATAGTCTCTTCAAATCTCTACTGTCCAAT ATCGGACCCCTGACTTCACCGAATTGAGGATTCTTGGATTGCTAAGAGTCCAAAGTCTAAAATTAAGGGGCAACATAATT TATGATCTAGAAGTTAAGGAGTTCATTAAATTGAATTAACGTTAAAAGCACTGATAGAGTGATTAATCTGCTAATGCCTT TGATAAATCTGTTGTTATGACTTATGACAGTTGAGCGTAATGGGATACCAATTGGACCTAGGGTACGTTATACTCTCCTT 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CAATCAACAATAACCATAATTCCACTCCGTGTGTGAACTGGCAATAGTCATATATATGCTTTCTTAATTAGTAATTGGTG TAACTGCATGCAGAAACGATATTGGATAGAAGCAATGGAGATGTAGCTGTTGATCAGTATCATCGCTATAAGGTAAGATT CAAATGGCTGTTGATATTTTAACACCATTCTTTCAATCTTGTAAGTAAAAGATGAGAACTTTTATCTAACAACCTAAGTA TCAAAAAAGTGCCTTGCATGATATTGAAATCTATATGGAACCAGTAAATTCTTCACATATCAAGCTCAACTAAAGCCTTC TTTTAAGGAGCATATCAGTAAATTGCTCTCAAGTTTTTGTATCTATTATGCTTACCAATTTTACATGCTAATAGGAAGAT GTTCAGATCATGAAGTATATGAATACAGATGCTTACAGATTCTCCATCTCTTGGTCAAGGATATTGCCAAGTAAGCTAAT GTTGGATTTACTTGCACCCTTATGACTTACAGCTACTAATTTAATCTTTCATTTACCTGAACCACTCTAATAAATATGCA GAAGGAAAAATAAGTGCGGGTATAAACCAAGAAGGAATCAAGTATTACAACAACCTGATCAATGAGCTACTAGACAATGG TCATAAATAATCCATTCTTTATTACATCCATGATGTTCAAATTCATAATAAATTGATGGAATTAATTCAGGTCTTCAACC ATTTGTGACACTTTTCCATTGGGATCTTCCCCAAGCCTTACAAGATGAGTATAGTGGCTTCTCGAGTCCTCATATCATGT AAGTGGCATGACCCAACATGGATTGTAGGAATCAGAATCCTCTCATGTGTTGATATTCCACATGACATTGTTAGCTTTAA TTTTTGTGTATACTTCTCTCATCATATTTGTTAAATAGGTTGCAGTCTATTTATGAAGAGAGGGAAATAAACACAAAATT TTACATGGCAATGTCATGCCGTATGAAAGTATTCTGATCTGGATTGTAGTAGTGTTGAACCGCATTTCTATGTGTAGAAA TGGTTTTCAAGACTACGCAGAGCTTTGCTTCAAGGAATTTGGAGATAGAGTGAAGCATTGGATCACTCTTAATGAGCCAT GGAGTTACAGTTTGGGTTTTAATGAACCTTATGTGACCTCACACTATCAACTCCTTGCTCATGCAGCTGCTGTCAAAATT TATAAAACCAAATATCAGGTACAGTGGTGGTCTACAGCATCTTGTTTTTCCATAGAATCAATTTCTGACACCCAAAAATG AGAAGTGCTACATGGCTCAAAATATTAGTTCATGAATCTAACGAATTATAATTACAACCAATTATGTTTGTTTGCAATAC AGTAAATTTTATGACTCAGACAAATTCAGAAATTAATAACCAATCAAAATAGAGTAAGGCTCCGCGACAAACTTCGTTTC GTGCCGTTGAGCAATTTCCCCCAAAAATTACTTACAGAAGCTTCTTCCATAACTGATTCTGACTTTAGAATCAATTGTAA AAGGACTTCAAAACTTGTTAATCTTTCTCCATTAATGGTCCAATTTATTAGTTCTAGCAATCTTGTTCTTTATTATGAAA TGTTCAAGACATTAAAAAGTTGAACATGAGCAGGCATCTCAGAAAGGTTTCATAGGCATCACCTTAAACTCTCACTGGTT CTTGCCATTCTCAAATGACAAATCCGACCATCATGCCGCCCAGCGTGCTCTTGATTTCATGTTTGGATGGTAAGTAAATA CTACTAGTCTTCTCTACTGTCTTTCTGTTTGTCTTGCTTCTTAGTTGATTTGGTTGCAGGTTTATGCAGCCACTGACAAC AGGAAAGTATCCAAAAACCATGATGTCTTTGGTGGAAAATCGATTACCAAACTTCTCTGAGGAGCAATCCAAGCTACTTG CTGGCTCATTTGATTTTATTGGACTAAATTACTACACTACTAATTATGCTGCACATATACCTCATCCAAATAATGACAAA AGCAAACCGAGCTACTACACAGATTCTCATGCCAACTTAACAAGTAAGAACAACTTGATTACAACTCTTAATGAAGAATC ATAAATTAAGGACCTCATGAAATCTTGCATTCAGTTAGGGTCCGCATTAGACGGATCAGATTTGAAGAGGTTACTATACA CTTAAAATAGTCTCTTTAAATCTCACCCCATTGTCAGACAGCTGCGGACTCCTGACTTCACTGAATTGAGGTTTCTTTGA TTGCTGGGAATCCAAAATTTTAAAATTAATGGGCAACATAATTTATGACCAAGAGGTCAAGGAGTTCATTGAACTGAATT AACGTTAAAGCACTGATAGAATGATTAATCTGTGATACCGCCTTTGATTTTGTATTTCATGAAGTCTGTTGTTATGACTA ATGACAGCTGAGCGTAACGGGACACTAATTGGACCAAGGGTACGTTTCACTCTCCTTGATTTGCTGTTATATCTCAAATA CCTTGATTTGTTTGGTTGATGAAGAATAGAGAAACATCATTTATATGCAGGCTGCTTCAGATTGGCTATATGTTTATCCA AAGGGGATTCGAGAACTGTTGTTGTACATAAAGAGAAAGTATAACAACCCTTTGATTTACATAACAGAAAATGGTAATGC TTTAATTATGTTCTTTTTAATTTCCAAACACATCACTTTTCCATAATTATTTTGTCTTTTTTATTCTCTTCCTAGTCACA TTAAATGTCTACTAAAATGTCCATATTTCAATTAAATTATAGGCATGGATGAATTCAATGATCCAAAATTATCACTTGAA GAGGCACTTAAGGATACTTACAGAATTGATTACTTCTACCGTCATCTTTATTATATTTCAGCTGCAATCAAGTAACTGGC CTCCTGTCTTTACTTATTTCACAATCTAATCAAATGCATCTTAACTCTATTGTTAATTACTATTGATTTGTTGGCTTTTG TTGCAAAGGAATGGTGTGAAAGTACAAGGATACTTTGCATGGTCACTTTTGGACAACTTTGAATGGAATTCTGGCTACAC CGTGCGTTTTGGAATTAACTTCGTCGATTACAAGGATAATTTGAAAAGACATCAAAAGCTCTCTGCCCACTGGTTTAGGA ACTTTCTTAAAAAATATTAAACTTATTGCATGATTTCATGATGATCCTCAATAATATGATGTGAACTTGATTGTTATTCA AGAACTTCAATTTTAAATAATTTTCCGAAGTTACAAGTATTTATGTTTGTATCATAATTGTTTTAGTTTTTCATGGTGTT CTGTTATGGTTAAAATGTTACTATATTTTAGGATGGTGCAAATATTTATTGTGGATCTTTATGTGTTTAGTTTTCCGTCT CACTCCCACTCTTTGGATCAACTTCTGCCACTCTTAGAATCAACTCCGGACTTGCAAAATCTACTCTCATCATCTTTTCA CTCAACATTGTTTCTGCTACAAAAGTGGTCACATAATATGTAATGAAGATGGGTCCCTTTATTATACAATCCTCAGTTTC CGATGGCACCATACCACTGTTTTTTATGGGTTGTTGCAGGTATAGCCTGCAATAATTCATTAGTCCATTTTTCAAAATGA CATGTAATTAGTCGTTTTGGAAAGGAGTGAAAGTGACTCTCCTTAGTGTGTGTTTGCAGTTGCACGTTCAATCCAATAGA TTTGGAATTTGTATTTTTCCGTTGAAGTTTTC 

CDS sequence (LotjaGi3g1v0497100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGTTTGGATGGTTTATGCAGCCACTGACAACAGGAAAGTATCCAAAAACCATGATGTCTTTGGTGGAAAATCGATTACC AAACTTCTCTGAGGAGCAATCCAAGCTACTTGCTGGCTCATTTGATTTTATTGGACTAAATTACTACACTACTAATTATG CTGCACATATACCTCATCCAAATAATGACAAAAGCAAACCGAGCTACTACACAGATTCTCATGCCAACTTAACAACTGAG CGTAACGGGACACTAATTGGACCAAGGGCTGCTTCAGATTGGCTATATGTTTATCCAAAGGGGATTCGAGAACTGTTGTT GTACATAAAGAGAAAGTATAACAACCCTTTGATTTACATAACAGAAAATGGCATGGATGAATTCAATGATCCAAAATTAT CACTTGAAGAGGCACTTAAGGATACTTACAGAATTGATTACTTCTACCGTCATCTTTATTATATTTCAGCTGCAATCAAG AATGGTGTGAAAGTACAAGGATACTTTGCATGGTCACTTTTGGACAACTTTGAATGGAATTCTGGCTACACCGTGCGTTT TGGAATTAACTTCGTCGATTACAAGGATAATTTGAAAAGACATCAAAAGCTCTCTGCCCACTGGTTTAGGAACTTTCTTA AAAAATATTAA 

Protein sequence (LotjaGi3g1v0497100.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MFGWFMQPLTTGKYPKTMMSLVENRLPNFSEEQSKLLAGSFDFIGLNYYTTNYAAHIPHPNNDKSKPSYYTDSHANLTTE RNGTLIGPRAASDWLYVYPKGIRELLLYIKRKYNNPLIYITENGMDEFNDPKLSLEEALKDTYRIDYFYRHLYYISAAIK NGVKVQGYFAWSLLDNFEWNSGYTVRFGINFVDYKDNLKRHQKLSAHWFRNFLKKY 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 215 215 9.0E-119
PANTHER 1 215 215 9.0E-119
SUPERFAMILY 1 214 214 1.02E-73
Gene3D 1 215 215 1.7E-89
Pfam 3 215 213 1.2E-58
PRINTS 40 54 15 6.6E-25
PRINTS 118 126 9 6.6E-25
PRINTS 141 152 12 6.6E-25
PRINTS 162 179 18 6.6E-25
PRINTS 186 198 13 6.6E-25

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds Catalysis of the hydrolysis of any O-glycosyl bond.
Biological process Carbohydrate metabolic process The chemical reactions and pathways involving carbohydrates, any of a group of organic compounds based of the general formula Cx(H2O)y. Includes the formation of carbohydrate derivatives by the addition of a carbohydrate residue to another molecule.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi3g1v0497100.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…