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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi3g1v0556800 |
| Transcript ID | LotjaGi3g1v0556800.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Phosphoinositide phosphatase family protein; TAIR: AT1G22620.1 Phosphoinositide phosphatase family protein; Swiss-Prot: sp|Q7XZU3|SAC1_ARATH Phosphoinositide phosphatase SAC1; TrEMBL-Plants: tr|I1LNN4|I1LNN4_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi3g1v0556800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr3:97458985..97478196) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CTGAAACAGAGACTCAGATGGAGCGGGCTATAGCGACAGTGCAAGAGATAGGTTAGGTTGAGATTGTCTTAAGGGTTTTC AATTTCCATTTTTACCCTTTTATCATCCAACCAATCTTATCCATCAAATTAAAGAATATTTCAAGATTCTCCATAGGGAC TTGTACCACCACCTCCTCCTAAAAAAAAAAAAACTTACAATATGGTGTGTTGACTCTAGTTTTGTGGGCGGGGTAAAAAT CGGGACGATAACGGACGGGTTCCCGTAAAAGGGGCGTAGAGGCAAGGCAAGAACAGAACAGAACAGACAGACAGACGGAG GATTGGGAATGAAGTAGTAGTGAGAATTGGAATTTGAATTTAGAGATGTCGTCGAATTGCGAGAACATGAATTCCAATTC CAGTTCCGTCGATCCAGACTCTTACGCCCTGGAGAAGTTCAAACTGTACGAAACCAGAGCTAGGTTTTACCTGATCGGAA GTGATCGGAACAAGAGGTTCTTCCGTGTTCTCAAAATCGATCGTTCAGAACCCTCCGATCTCAATCTCAGCCAAGACCCT GTCCTCTATTCCCCCCAAGAAATCAAGAGCTTGCTTCAGCGTATTGCTGAGGGTAACAAGGCCACTGGCGGTCTCTCTTT CGTCGCCAAGGTGTTCGGGATAGCCGGTGAGTCAGTTAATTCAACAATTCCATTCAATCCCTAATTATTCATTCATCATC TTCTAATTAATTGAATTGAATTGATTCTCTAGGCTGCATCAAGTTCCTCGAGTCCTACTACTTGATTCTTGTTACTAAGC GCAAACAAATTGGTTCTGTATGCGGTCATGCAATCTATAGCATCAAGGAGAGCCAATTCATAACCATTCCACATGTTTCC ATTCAATCTGATTTAGCTCACTCTAAAACTGAGCTCAGGTAAGGTACTCATTTTTTACCATTATTCTTATTTTACATTTA 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CDS sequence (LotjaGi3g1v0556800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGTCGTCGAATTGCGAGAACATGAATTCCAATTCCAGTTCCGTCGATCCAGACTCTTACGCCCTGGAGAAGTTCAAACT GTACGAAACCAGAGCTAGGTTTTACCTGATCGGAAGTGATCGGAACAAGAGGTTCTTCCGTGTTCTCAAAATCGATCGTT CAGAACCCTCCGATCTCAATCTCAGCCAAGACCCTGTCCTCTATTCCCCCCAAGAAATCAAGAGCTTGCTTCAGCGTATT GCTGAGGGTAACAAGGCCACTGGCGGTCTCTCTTTCGTCGCCAAGGTGTTCGGGATAGCCGGCTGCATCAAGTTCCTCGA GTCCTACTACTTGATTCTTGTTACTAAGCGCAAACAAATTGGTTCTGTATGCGGTCATGCAATCTATAGCATCAAGGAGA GCCAATTCATAACCATTCCACATGTTTCCATTCAATCTGATTTAGCTCACTCTAAAACTGAGCTCAGGTACAAAAAGCTT TTGTCCAGTGTTGACTTGACCAAGGATTTTTTCTTCAGTTACACTTACCCTATAATGCAAAGTTTGCAAAACAACGTCTT GTCCAATCAACAACCAGGGATGCCCTATGATAATATTTTTGTTTGGAATGCCTATTTAACCCAACCAATCAGATCAAGAT GCAATAACACCATTTGGACCATAGCTTTAGTTCATGGTCATTTTAGGCAGATTCGCCTATCAATTTTTGGTAGGGACTTC AGTGTTTCCTTGATTTCTAGACGATCTAGACATTTTGCAGGGACACGTTACTTAAAAAGGGGAGTGAATGATCGTGGCAG GGTTGCTAACGATGTTGAGACAGAGCAGATTGTTCTTGATGAAGAAGCTGGCTCTTGCAAGGGCAAAATGAGTTCAGTTG TGCAAATGCGGGGATCAATACCGCTTTTCTGGTCACAGGAAGCATCGAGATTTAGCCCTAAGCCTGACATAATTTTGCAG AGGTATGATCCAACATACCAGGCAACTAAATTGCATTTTGAAGATCTTGCTATGAGATATGGAAATCCAATTATTGTTCT TAATTTGATTAAGACAGTTGAGAAGCGACCTCGAGAAATGATGCTAAGGCGTGAATTTGCAAATGCTGTTGGGTATTTAA ACCAAATTCTACCGGTAGAGCACCATCTTAGATTTATTCACTGGGACTTTCACAAGTTTGCAAAAAGCAAGTCTGCCAAT GTTCTGGCTGTTTTAGGAGCCGTAGCAAGTGAAGCGCTTGATTTAACAGGTTTTTACTACAGTGGCAAACCCAGCATAAT AAAGAGGGCCAACAAGAGCAATCAAACAAGCACAGGAAGGGAAACTTCGCTGAGAGATCTGAGAGCTAGTTCTGGGGATC TTGCAAGGATTGGAAGCAATAGTGAAATTCTAAATTCTATGGTTAAACGAGACCGAGAGACTGACATGAACCATGAGAAC AAAAAAGATAATTTTAGTAGTGAAGCTCCACATTTTCAGAGTGGAGTTCTTCGTACTAACTGCATCGATTGCTTGGACCG TACAAATGTCGCCCAGTATGCTTACGGTCTACAAGCTTTAGGGCGACAGCTCCATGCAATGGGTTTGACTGATGTGCCGA AAGTGGATCCTGATAGTAGTATTGCTGCAGCTCTAATGGATATGTATCAAAGTATGGGAGATGCTCTTGCCCAGCAGTAT GGTGGTTCTGCAGCTCACAACACTGTGTTTCCAGAGAGGCAGGGAAAGTGGAAAGCAACAACACAATCAAGAGAGTTCTT GAAATCCATAAAACGATACTATAGCAATGCTTACACGGATGGTGAAAAACAAGATGCAATAAACCTATTTTTAGGATACT TCCAACCACAGGAAGGGAAACCTGCTCTCTGGGAGCTTGATTCAGATTATTATCTCCATGTATCGGGGATTGGGGATGAT TTAATCCCTGAGAAGTGTTCTGAACCAAATCTTAAGCCTTCTGGGAGAGTTGGAATAGTCTTCACCCCTGTACCGGCTTG TAGAGATGACTTTTCGCGCATAAAGTTGACATCGTTTGACAAGTTAATTGAGAAGACCTGTAGTACAATTAAGAATGTAA GACTTTGCAGTGAGCTTGATCAGAAACCAGGTGGTGGTTCTGGAAACAGTGGTGTAGCACCTGATGCAGCTGAGATACAG CTTAAAAGCCCAAATTGGCTTTTTGGCCAAAGAAAGTATGAAGAAGGTTCCTCTACTGCAAAAGTTGCTTCTCGTGAAAC TGAAATTGAAGGATCTCATGCTAATGGCTTTTGCAACTTGAATTGGCTTTCCTCTGGTAATGACATGAATGAAGAGGATG TTTTCCAAAGGTACTTTACAATGACCTCAGTAGACGAGGCCAACGGTTGGTATGGAGGTACTCTCCTTGGTGATCAAGAT GAAAGCAGTGAGATATATAAACATTATGCTGAGTTATGTCAGGGACCTGCCTTGGAACTTTTCCAAAATGATCCCGAGAG GGAGCAACACTACGCGGATGCTCTAATGAGTTCCTCTGAGATTGTTAATGATGCTGCAATTGCAGCTGAAATGGAAGCCA CTCTAAAGGAGTATGACCAAGTTGGTGCCGACCTTGGGATAATTCCCTCATCTTGTAAATTCTTTGCTGATGACCCAAGT TGGTTAACAAGATGGTTAATTGGGGAAGAAAAGGTACCAAGGATATCTTGA
Protein sequence (LotjaGi3g1v0556800.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSSNCENMNSNSSSVDPDSYALEKFKLYETRARFYLIGSDRNKRFFRVLKIDRSEPSDLNLSQDPVLYSPQEIKSLLQRI AEGNKATGGLSFVAKVFGIAGCIKFLESYYLILVTKRKQIGSVCGHAIYSIKESQFITIPHVSIQSDLAHSKTELRYKKL LSSVDLTKDFFFSYTYPIMQSLQNNVLSNQQPGMPYDNIFVWNAYLTQPIRSRCNNTIWTIALVHGHFRQIRLSIFGRDF SVSLISRRSRHFAGTRYLKRGVNDRGRVANDVETEQIVLDEEAGSCKGKMSSVVQMRGSIPLFWSQEASRFSPKPDIILQ RYDPTYQATKLHFEDLAMRYGNPIIVLNLIKTVEKRPREMMLRREFANAVGYLNQILPVEHHLRFIHWDFHKFAKSKSAN VLAVLGAVASEALDLTGFYYSGKPSIIKRANKSNQTSTGRETSLRDLRASSGDLARIGSNSEILNSMVKRDRETDMNHEN KKDNFSSEAPHFQSGVLRTNCIDCLDRTNVAQYAYGLQALGRQLHAMGLTDVPKVDPDSSIAAALMDMYQSMGDALAQQY GGSAAHNTVFPERQGKWKATTQSREFLKSIKRYYSNAYTDGEKQDAINLFLGYFQPQEGKPALWELDSDYYLHVSGIGDD LIPEKCSEPNLKPSGRVGIVFTPVPACRDDFSRIKLTSFDKLIEKTCSTIKNVRLCSELDQKPGGGSGNSGVAPDAAEIQ LKSPNWLFGQRKYEEGSSTAKVASRETEIEGSHANGFCNLNWLSSGNDMNEEDVFQRYFTMTSVDEANGWYGGTLLGDQD ESSEIYKHYAELCQGPALELFQNDPEREQHYADALMSSSEIVNDAAIAAEMEATLKEYDQVGADLGIIPSSCKFFADDPS WLTRWLIGEEKVPRIS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 17 | 869 | 853 | 0.0 | – | |
| Pfam | 97 | 393 | 297 | 8.4E-77 | ||
| ProSiteProfiles | 161 | 562 | 402 | 76.424 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Phosphoric ester hydrolase activity | Catalysis of the reaction: RPO-R' + H2O = RPOOH + R'H. This reaction is the hydrolysis of any phosphoric ester bond, any ester formed from orthophosphoric acid, O=P(OH)3. |
Expression pattern of LotjaGi3g1v0556800.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…