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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0125500 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0125500.2 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Zinc finger, B-box; TAIR: AT4G38960.1 B-box type zinc finger family protein; Swiss-Prot: sp|C0SVM5|BBX19_ARATH B-box zinc finger protein 19; TrEMBL-Plants: tr|I1J8N5|I1J8N5_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0125500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:18265724..18308010) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
CACTAATCAAAATCTTTCCGTATTATCTTCCTTCATTAAGCAACACCAACACAACCATTAGTAACAACACGCAATATACA AGAAAAACGCAATATAACATTATTATTACTATAACAATAATATTATTGTTATTATTACTACATATCAGTATTTTCTTTAG AACAAGAATGAATAAGTTCAAGTGTACGTTCCTCTCTTTTAGTAGTATCTGACTTCAAGTTCTCTTTGCATTTGTTGGAC ATATGAAGCAATGAAAGTGAGAGACTGAGAGGGTTGATCAAATTCAATTATGCGAACTCTTTGTGACGCTTGTGAGAGCG CCGCTGCTATTGTTTTTTGCGCTGCGGATGAGGCTGCGCTATGCAGTGCCTGTGATGAGAAGGTAGTGTTGTAGACTTGT AGTTATATTTTCATCTTTTTCATCCGATGTTGGATTTCTTAACACTGTTTTGGTATTGAATATATTGATTAATGCTCACA GTATGTGCTTGTGTTTCCCCTGAGATCACCAACTGAGCACACTGATATTTTCTGAAGTCTATGATGATGTTTCATTAGTA ATGTGTCATGTGACAATTATGGAAGATTTAAAATCTTGGGTTAAACTTGGAGAAGTAAATATGTGTGCCTGTGAGGTGCC TCAAATTGAAGGTCTTGCAATTTCATAAGTATACTTCAATCAGATGCATCTTGCTCTTGCTCTGAATATCTACAGAAGCA ACTTGCCTTAATTTTTTACTTCTATCCATCATGATTTTGACTTTACCGTGGTTTTCAAATTAAAGCATGCAATAAGTTGG TTTCCTTTGTATCTTGTAAATATGCTAAACTTTGGAGTGATAGGTTCACATGTGTAATAAGCTAGCTAGCCGGCATGTAA GGGTTAGTCTTGCAAGTCCAAGTGATGTTCCTCGCTGTGACATTTGTGAGAATGCACCTGGTAATTAACTTAACTAGTTT 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GGCTTAATATGCTTAGAAAGGTATATCTAATTCAATGACTTTTTTTATTGAATAATTGAATGGCTATGACAGAGAAAAAT AACTATGATAATAGGCCCAAGTCGAGGCCCAAGCACAGAGGTCCACTGTGTTAAAGAGAACTAGCTTAATTAATTTCTAG CCCATCTGGTGGTTGTTTTAATAATCCAAACCCAACCTAACGAGTTTAGATATTATATCAATATTGAACAAGTGAAAAAT TCTGACAACACTTATTTAACGGTTTTTTTTCTTTCTGATTTAGCGAAGTTTATATATGGACTCCATTTCCAATTTAGTAG AATCTACATAATTTTCAACCATTTAAAGAAAATAGCGTCGAAAAGAGAATGTTAAAGTGAGTGTTACGTAGTAGCACTTC CTCTTGAGCAGTTTAATTATTGAGATGTCTTCAGTCTTCTTTGAAAGAAATGTCTCATGTGATGCATTAAATTAATTGAT TCAATAATTAAATAAATGAATGTATTGTTTGATATTTAAGTGAAGTGACATAACTCTTGAATAAAGAGATATGACTTTAT ATGAAAGAAAATAACTATTGATGAAGGACTTAAAACATTGTCTCTATCTCTGCCCATAAAGTAAAAGTATGTCTCTATAA TTGTCATCACGAATGAAAGAGGATAGAAGGAACGGAAGGAAATAGAAGAGTTTCTCCATTTTTGAAGAACATAGAATCTA CACACATTCTACAAGATCAAATGGGATCAATCACACTCATGAATAGAGGTTAGTACTCCATAACCATTCTTATTGTGTGA AGACTGAATTTTTAAGATCCATCTTCTACATGCTTTATGCTTTAGTATGATTAAGTTTACAAACTCTACTAAGAACAACA ACAATAAATTGACAAAGAAAATCAGGTGCCAAAAGTCCAGAATGAGCTGCATTATACACCTTCTAAAAAAATTGTCAAAC CCCTGTTCTATACAACAACAATGTTGGAGCAGCGGAAGTAAAGTAGTGGAAAATATAGGAGAAGACTTGAACTTTTTATT TTTCTGATTTTCTTAATGAAGAACTTACAATGCTTCTCTATTAATACTAGAGAATAGAGAAGATAAAAGGATGTAACTCA TGCAATTACATAAAAGACATTAACCTCTAACATTATTACGTTTGTAACCATTAAGTATTAATATGCTTGTAACCCCTAAG AAATGCATAAAGACACTTAAACAAAATGTAACAAACAATTGCAAATTAACTATCATTTAACAAACAATGAACTTAAAAAT GAAAAATCAGGCCACTAAATAAATGTCTACAACTAATTCTCATCCATGCATAAGGAATAAAATTCCTGCTGCATATTCTC CACTAGCTAACCTAAGATTAGAAGGTCTTATATTCTTGTGGTTCCAATTGCCTTGAACAGTAAGCACAAGTGCTAAAACT ATTACTACCTACCTGTCAGATTGAAGCATCTCCTAGCACATTACAGACACCATAAATGCATCCATGCTAATTGCCTTTCA TTTAGAAGCGTTTTACCTTCACAATGTGCTTTAGGTTGAAGCTACGGATTATCTTTCTGACATCCCTCCTAATGGAGAAG AATGCTGAGAGTAGCACAACATACATTGCTGGATAGATATGGATACCTGTATCATGACTGAAACCAGATTTTCCCATAAT CAGACCCCACATCAGAAGTAGTATTCCAAAAAGGCTCATTCTCCCCGGTTTTATCAAACCTGCTATTGCTCCTCCCACAG CCAAATAGCTTCCAGCCAGAACCTGCAAGAGGGACCCAAAATGAAAATGAATACCAAAGCTAAACTTTTCAGGGTGTTTA TCAATACTAGTAGATGCATTGTTCTCAGTAACTAATCAATTGTCAACCTCAAGGTGTTGGAGATCAGATGTGGCAGACAT AGCTCTTGCCCTAAAATTATGCAACTTGAGCAAATTTGCATAGGTTGGGATGCTTTTCTGCTTGCAAATTGCCTTTGCAA AAGCACCAGGGTAGAGAAGAGTCTTCACTATGAAAAGAGGGAAGACCTCACTTGCAATTAACTGAGAAGATGTCACTTCT AATGGTGTCTTACATATTCCCATTCTACATGGAACCCTGTGTAATAAATGGGGGCACTTTGAGAGTATCATCACCATAAT GCAAATAGAATTTAAAAGCAATACTTTCATAACATGATGAATGCGTCGAGATACAAGTTCTCTCAACAAAGAATCCCAAA GAGGTAAATCCAACCTCCGGCAAAACAAAAAACAAACAAATCAAAGTACACGAAACCATTCAAAAGATAGAAACCCATAA TACTTTTAGAACTATATTTCAAGCTTTTGTGGGGTTAATAATTGCAGGAATAAAGGGTTCCACACATACATTATTATCAT GACCCTGAATCAGAGGGGACAATGCAATAATGAACCCAATTAATATTAGTATACTAGGAGTAATTTATAACAATGAGTGG ATTTTGCACCTCTTTCTGTTAGTCCAATGAGGTGCTCTATGAATTGCTCTAAATCAAAACATCAGAAAACTAGTGCACAA AAATTGAAAGATACACATTGGAAGAAGGTACATTAACCCCAACATGTGGAAATTTAATCCAAAATAATCTGATTTCAAGA AAAATACAATCTTGTTTCTGACAGAAGATTAAAAAAATTAGAAAGAAAATGACAAGAAACACAGTCTTTGGATACAAACA AAAATTGAAACAAGAGGCACATTACAAAATAGGGATTTAAGGGAAATGGTGTGATACCTAAAAATGGGAATTTGGAAAAT GACGATAAAGAAATACGTTGAAAAAGCAATGGAGCTTATGAGGGTGGCCAATCTTGTAGAAAAAGCCATTGCAGCATTTT GGATTTCTGTTGATTGAAAGGCTTTGTTTGTTTTACGTGAAGAAAGTGAGGGAAATAAAAAAAAAAGATGAAGAAGAAGA AGAAAAGAGTGATATTGTTATGCAACAATTATAGACGAAATGTAAGAACATAAGGATTCACCGTAATTTTTGTTGACTGA ATTCCAACTATTGTACAGTAATTAAATTTCAAGATTAAATATAAGATGAAAATGTAGGCCATTTGTAACAAATAGCATGC ATTGCTCCAGGCATCTATATTTGTATCTCGAAGAAAAAATAATTTAATTCCATAAATATAAATATTAAAAGGATTTATAT CTTGACTATTATTGAATATAATAAAATTTTGTGTGGTTGGGATCTTGTTTGGTGATCCATGGAATTTTTCTGGGATTTCT TTAGGCGTTTTATCTTTTATGGTCGGAGTTTTTGTTCAATCCACGTTGTAGATTATAACTTACTGGGGATTTGTACTTTA CAATCTTTTTTCAGATTGTTCATGTATCAATATAAATCATTTTTCTTTCGGGGAAAAAAATCACCAACACAATTGACCTC TAACATAAAAAATCAACCAAGTTCAAATTATTTAGCATCTTCCACGATCTATGCATCTTACATTCACCCAACAAATAACT ACCGACAAATCACTTTTAATAATAATATGCCTCATATTATAATGTTGACAAAATAAAAAAGCATGTAAAATAGTTTTTAC ATCCACTTCAAATAAACAATAAAAATATCATTATTTATTTTAAAACTTATAATTACGATTTAAAATTATTCAATTTTAGA AAAAGAGGTACCTTTAATTTAGAAATGGAGTTTCCAAGATTAGTTTAAAATATCTGCATTTTTTGTAGTTTTTATTTTAT ATTGTATAAAAAAAATTATATAAAAAGGATGAGGTAGTTGTCTATATATAACAAAGATTCCAAGCCCACAAAAGTTTAAG GAAAGGAAAATGGCTCTGTTTGTAAGAAGTTTTCTTTTACTTTGCATGTTTATGTTACCATCAATCTGCAATGGTGCTTT TCATAAAACACATGTGAAGGTCATAAATTCTTTACATGGAAATTTGGATCTAACCATTCACATCAAGTCTAAAGATGATG ATCTTGGAGTGCATGTTCTCCATCCGGGTGATTTCTATGAATGGGGTTTTAGAACCAGCTTTATTGCCTCAACATTATTC TTTGGTACATTTCAATGGGAAAATGTCACTAAAAGGTTTGATATATACAAACGAGAGAGGGATGAGCCAACATGCTCAGT GTGATTGGTTTATAAAACAAGAGGGGCCATGTTTCAACGCAGTACCCGCGAGCCCTCAATGTTATCCATGGAATAGTACT TAGAAATTGTTTGTGTTTGACTTTCGTATAAATGGATTGATTGTACATCCAGGATTGACATAAGTAAAGAGAGATGAATA AAATTAAAAAAATCTTTAGTATATATGTTTTCATTGTTTTCATGGTTAGATTGATTTGTCAATTTCTACTTTATTTGTAT ATTTATTTTTCCATTTTCTTCTCATGATTGTGACTTGGAAACCCCGGGCGTCTCCCCTTCTCTTCTTTCCTCCTGAAACT AGTATTCCCTTCTCTAGTTTCACACACCACTATGAGACCATCGAAGACAACACCAATCACTACCATGTGGCACAGTGTGA GAATTGGGGCTTCGCATAGCAATTAGCAAGTCACATGGTCACGTTACATCACATGATCATGATTAGATCTAACAATAATG AATTTTTCTTTCAGTTATATTTCACTCGCTTTTCTCTATGTAGCGCATGACAACTATAGCTATCGTCAAAGTTCCTTTTT CTCCTTGCATATTTACTCCTACATAGTCACATTACGTCACCTACATTAATGTAATATCCCCTATTTTATAAAATATTTTT ATTTTACGAGAAGGGATCAAGCTACGCTAGGAACAACTTATCAAAGTTACTCCACTTGATAATTTTTTATATATTCTTTT TTGATACAGCTCATAAAGAGAAAAAAAGACGGGCAAGCGCCCGAGCTATCTGAATTTGACAAATCCGACCATTGAATTAA AAAAAAAAAATCAACCAGTAGATCAAGTGTAAAAAATTCATAACATTTAAAAATCATTCGATACTTCATCGGCAAATCTT AATCTGATTGATAATATACATATTAAAATATAAATAAATATCGACTATACAATACATAGCTTCAAATTTCTGATTTAACA AAAATTCAATTGTTAGATTTATCAAACTCGTCTCCTTTGAAACGTTATCAAGTGGAGTAACTATTGTTGAGCTACTTTTG AAGTAAGTGATCCCTAGTCAATATCTTTTATTCAAAATAAATATCTTTTGTTTAAAATGGTAATATTTTATTAGATATCT TTACTTTCTTACAAAGTATCTTTTACTTTTAAGGAAAAAAACAAAAAATTAAATGAGGTGTTTATTGCGCCCACTTTTCT TTTTTCTAATTCAACTTAATGCATTGACTTGAAGTGCGTGAAAATAGTCAAAAGGAGGACGGGGCCATTTAAAAAAAAGT TGTGAATTAAAGTTTATATACTTTTGATGTAAATTTTTTGTATTGATATATAATAGTTGTTTGATACGTTCCAAACTAAT TTTTTTAAGTCAAGTCCGGATCAATTCCATTAAACTGAAGAGTAGATGTCTATAAAGATAACTTCATCCCACCATAAATT GGATGGGTAATCAACAACTAAAAACGCTAAAACATGAGTTGAGTTATTTACTCTTATATTAACATCTGAAAAGGTAATAG AACTAAATGCATCAGCAATTGTCCTGCAGTCTTGGATGATTAGGTCTATATCATGCCTTCTTCTTTTGTCGTTCATACCA CTGATCATGACTAGAGAGACACTGCCTTAAAGCCATGGCGTCCGCCACATTGGGATCCCATTGCTGAGTCTCCAAGTGCG ATGTCGCTACAATGAGGCGTGCATTGTGTGAGCGCACCACCATACCAAATCCAGTTGAGTATGCTCCCGATCAGCCGATA TCTAAATTAACTTTAATTAGTACATCCCTTAGGAGGTGGAGTCCAGATGTTAGTGCGCAATAAATCACGTTGAATATGTT TGGGTATATATCTTCCCAATCCTTTAGATTGACCATGCCTCTTTACATTGCTTTCACAGGCTCCAGAGAGAAACTAAAGT ATAGTAAAATAACACAAGAAATGAGGGTTTGAATTGTGTTCTTGTAAAACTTGAGTTTTCAAACGATTATAAGTTTATAA AATGTTTTTTGCAATCGTTTGGTGCAGCAGATAAGTGCGTGAAGTAATAAACGATGAAAGACACAGGCAATATATCCTGG TTCACCCACAAACGATGGAGCTACGTTCAGTCCTTGGCTTAACCAAGATTTCCACTAAAAAGTTTCAAGGACTTCTCCTA CATCAAGTATTCGATAGGACTTCTCCCACAACAAGTATTAGACATGACTCCTCTCAACCAAGTGTTCTACAGGACTTCTC CTAACAAGTATTAGACAAGACTTCTACCAACAACTATTGTTCAGAACTTCACCTAAGATCTTTTTCAAGATCGTTTGGCT CTACAGGGTTCTCTTCTCACAAGAGGGATAGTAGAAATTGCCAAGGACATGAACTACAAAGTGTTTGAGAGAATTTGACT CTGATGTGTACGTTGTATTCTTGTTCTAGAGAGATTTGAGTATGAAGATTTGACTCTTAAGTGTTTCTCTCAAACGATGT GGGGACTTTTTTTTCTTGCTTACTTGAAGAAGATTTTTTTTTTGTATATCGGAAAATACTTGAAGAAGATTTTAATTCAA 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CDS sequence (LotjaGi4g1v0125500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCGAACTCTTTGTGACGCTTGTGAGAGCGCCGCTGCTATTGTTTTTTGCGCTGCGGATGAGGCTGCGCTATGCAGTGC CTGTGATGAGAAGGTTCACATGTGTAATAAGCTAGCTAGCCGGCATGTAAGGGTTAGTCTTGCAAGTCCAAGTGATGTTC CTCGCTGTGACATTTGTGAGAATGCACCTGCCTTCTTCTATTGCGAGACAGATGGAACTTCCCTTTGTTTGCAGTGTGAT ATCATTGTTCATGTTGGAGGTAAAAGAACACATGGAAGATACCTTCTTTTTAGGCAAAGAATTGAGTTTCCAGGAGATAA ACCTGGTCATGCAGAAAGCCCAGTTTCCCATCCTTTGAATCCAGGTGGGACTAAGAGAGGAGCAAATCCACTACCCCAAA TGAAATTGGGAGAAATACAACAAAATCACAGGATGGTTCCATCATCAGAAGCTGATGCAATGAGGGAAACCAAAATGATT GACTTGAACATGAAGCCTCACAAAATTGACGAACAAACATCAAATAATCAGCCATAA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0125500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MRTLCDACESAAAIVFCAADEAALCSACDEKVHMCNKLASRHVRVSLASPSDVPRCDICENAPAFFYCETDGTSLCLQCD IIVHVGGKRTHGRYLLFRQRIEFPGDKPGHAESPVSHPLNPGGTKRGANPLPQMKLGEIQQNHRMVPSSEADAMRETKMI DLNMKPHKIDEQTSNNQP
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 177 | 177 | 1.3E-95 | – | |
| SMART | 1 | 47 | 47 | 3.9E-8 | ||
| ProSiteProfiles | 1 | 47 | 47 | 10.367 | ||
| PANTHER | 1 | 177 | 177 | 1.3E-95 | – | |
| Gene3D | 2 | 92 | 91 | 9.7E-8 | – | |
| Pfam | 3 | 46 | 44 | 5.3E-6 | ||
| CDD | 3 | 47 | 45 | 1.34069E-6 | ||
| SUPERFAMILY | 48 | 86 | 39 | 7.63E-6 | – | |
| SMART | 51 | 96 | 46 | 6.7E-11 | ||
| ProSiteProfiles | 51 | 96 | 46 | 9.101 | ||
| Pfam | 52 | 85 | 34 | 5.7E-8 | ||
| CDD | 54 | 84 | 31 | 2.16355E-7 | ||
| MobiDBLite | 106 | 131 | 26 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Zinc ion binding | Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions. |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0125500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…