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LotjaGi4g1v0234000.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi4g1v0234000
Transcript ID LotjaGi4g1v0234000.3
Related isoforms 6
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Pantothenate kinase, putative; TAIR: AT4G32180.1 pantothenate kinase 2; Swiss-Prot: sp|Q8L5Y9|PANK2_ARATH Pantothenate kinase 2; TrEMBL-Plants: tr|A0A151S842|A0A151S842_CAJCA Pantothenate kinase 2; Found in the gene: LotjaGi4g1v0234000
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr4:54688613..54698573) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

ACAGGAACAGGCACAGCCAACACTCCAATTCACAGGTCGAGTTCACGGCCACAACTGGATCTTAGCAAAGCAGCGATTCA AGGAAATGTGGAAGACAGGGATCCCACTATTTTGTTACCTAACCAATCTCATGATATATCTCATTTGGCTCTTGACATTG GAGGTGCTGTATTCAGTATCCAATTTCATTGACATCACATTTATATTTATATTTCATGTTTCTTAGTTCTTTAATTTCAC TTCAATGTTATTTCAATTGGCTGGAAACTAGTTTCTTAAGATTGTTTAAATTATGTTATCAGGGTCTTTGATAAAGTTGG TGTACTTTTCAAGACATGAAGACCATTCAACTAATGATAAAAGGATGAGAAGGTTGAGAAGTTTGAAGGATAAACTGGGA TTTCCCAATGGTAACAGGAGAAGCTATCCTATTCTTGGTGGGAGGCTTCATTTTGTCAAGTTTGAGACTAACAAGATCAA TGAATGCTTAGATTTTATCTATTCAAAGAATCTTCACCATGGTCGTATTACTGTCTTGTTCAATTAACTTTATTTTTAGT CAGTCTTTTCTCTGCCACATTGGATAATGTTTTTTAGTTGTTTTCTTTCTATGAGATAATTCAACTATACTTTGAGAACT AGTGAATCTAAAGTTGTGGATTTTTTTCTTTCTTATAGGTAGGGAATCATCGAATACCATAATTAAGGTGAGTTTGATTC TCTGACTGTTTTTTCTGTCACAATGGTGTTTCAATGCCCTAATGTGTCCACTTTGTGACATAGGCTACTGGTGGTGGAGC ATTCAAATATGCTGAACTTTTTAAAGAGAAACTCGGGCTTAGCCTTGACAAAGAAGATGAAATGGCTTGTCTTGTAGCCG GAGCCAATTTCTTGCTCAAGGTGGATCTAATTTTTAAAATAATATGTTTTCTCTTGTATTCTGTTTAAGAATCATCTTGA 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TCCATAAATATCAACTGAACACTTAATTTTTGTTGTAAATGAGCTATTCATTTTATGTTGGAAAAAAGTTCATATTAGTT CTTTAGAGTTTGTAAGTCTTTTATTTAGTAGGATTTGATAGAAAATATGCTGATTTTAAAGTTTATTCTTTTTCTGTAGA AAGATTTTCCCCAAAAAGACTTTTCATCCAACTACAACCTAAAAAAGCATGGACAAAAATCTCTAAACATGGAATATAAT CTATGATCATTATTTATAGAATAATGCTTTCTGGCAATATATCAAGATTATCTTCCTTCAGTAGTTTTCATGCTCTGTTC AACTATTTGTTCCTCCAATGATTTCCTGACCAATTGTGTTGTTTCTATCTCTTCTGTGAAGATATCTTACTTGACTGCAC TGCAATTTGGATTGAAGCGTATCTTTTTTGGAGGTTTTTTCACAAGGGGTCATGCCTATACCATGGATGCTATTTCTTTT GCAATACATTTCTGGTACATAATGATGACCAGAGATTTTTTTGTTTGTTTTTAATTTAATTATTATTTTGTGTTGAGATT TATATATTTATCATTCAGGTCTAAAGGGGCTACACAAGCAATGTTCTTGCGACATGAAGGATTTCTGGGAGCATTAGGTG CATTTATGAGCTATGAAAAGCATGGTTTAGATGACCTCATGGTGCATCAGTTAGTTGAAAGATTCCCAATGGGAGCTCCA TATACAGGAGGCAAGATTCAGGGCCCACCACATAGGAATTTGAATGAGAAGGCAAGTGAGAGGAATTGGAAAACTTTGGT GTCTGCTAGTCACCGGCTTGAGATAAATGAACTAATTAAATGCACTTACTTATATTTTATGGTGTAAATCTGAAGCCAAT TTGATAAGAATGGTATTTTTGGCTACCAATTTTGGTATCATTAAGATTGTGCCACTTTGTTGAGTCACTGGTTTCTCTTG 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GGTGTTCTCCATCTAGTACCAACCTTAGAGGTCTTTCCTTTATTAGCAGACCCAAAAATGTATGCACGATTACTTAACAC TCTGGCATTTTTTAGAGTGAAGTTATATTGGAACTCTCTTTTACTTTTAGGTTTCATAGCATACTTTTTATAAGGTGATT TCTTGTTATCAATATTCTACTAATCTATTCTTAAAACATAAATTATGATTCTACAGATATGAGCCTAATACTATTGATCT CTCAGATCACAGCGAATTAGAGTAAGTACCATATTGTGAACTGTAAACAAATTTTAACTTCATTGTCCTTTAAGGCTTCA ACTGTCTTTAGTGTGTGGCTTATGTGGCTAATGAAAATTTGTATATCTGATGTAGATATTGGTTCAAGATTTTGTCTGAT CACTTGCCAGATCTTGTGGACAAGGTAATCGTGTGTCCTAACACCCAGCCTTTCTGCATATGCTTGTATGTCTCTTCATG TATTACAAATGCAATAAAATTAGACCACAGAGACATCCTTGCATAAATATGAAATTAAAGCATGAAAGGTAGACCTAAGT TCTGCTTATGAAAAAGTTACAATCTCTGCCAGTAACCTAGCTGATTATGAATAAGTAATAATAGCATGAAAGATAAACTC TTTTCCTGTTTGGTTTATTTTTTCTGCCTTGTTCACCTTGTTCAAAGCATAGTATGGAGAAAAAATTGCTTGGATTCCCC CCCCCCCTAAAGTAGTATATGATTGTAAGGTTCTCAACTAAAATGTCAGGCTGTCGCAAGTGAAGGTGGGACTGATGATG CCAAAAGAAGGGGCGATGCTTTTGCTCGTGCATTTTCTGCTCACCTGGTTAGGTAAAACAGTCTTGAGATTCCTTTTTTC ATGACTTCCTACAATTATCGAAGCATGACTATATATCTGGTTAACTTGATGCAATGTTGCTAACTTAATTAATTATTTTA 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GTGCTTGAGAGAATTCCATTTTGTCGATGCCTACATAAGCATAAAGCAGAGGTAATTATGTTTTATCTATATTGAGCAAT ATATATGAGATCTTTTACTTGGCCTATAGATGTAACTGACAGCCTTTTGAGTCACTATGTTGCATGTGTAGATTTTTTCT TTTTTTTAGCCCTTTGGCCTCTAGATGTAACTAACAGCCTTTTGGCCTCTAGATGTTTTATCTCCATTTGAATTATTTTA ATTTTAGTTCGAAAAGATTTGTTAAGGGTAATTTGTTTTTCATCTAGCCAAACCCTTATATGGTAGCCATGAAAACCTGG ATAAATGTTTAAATTTTATCTAAATGAACTTGTTGAGTATTTAGTTCTTAATAGAAAAATTAGCCTTGTTTGATCCATAT AGTCAATCCTAGAAAATTTTATTTGTTAATGTTGCATCATAAAAGATACAAGCTTTAGATGTACAACTTTAATCTTAAAA AAAAAAAAAAGCAGACACTTCCCGGTTGTCAATGTGAACGCAAGTTCAAATGATCTTCAGACCTGCATTCTCCTAAAAAA ATCCTTATTCTTGATCTCTTAAATTCGTTATTGGTGTGTATATGCATATCACAGGGAAAATGAAGCTTCACTTGCTGTTT TACCTGATTTGTTGATGGAGCTTGATAGTTTGGATGAGGTATGCTTAACTATTACTATAACCCTCTGAATTTAGCATGGT GGGAGGAATTAATATTGGTTCCATCTTGTGAAGTACATATGGCTGGTACATGCAACTAATGCATCATTCCTTTTTGAGTA AATGTTTTCAATATACAAGTGAGTAGAAGTGACACTGTATGTATTTCATTTTTTATGCCATGCTAGGTCTAAACACAGTC TTGTCACATAAGTGTAGTCTTTTTGGTTCAGTTGCGTGCCTAAGCCACCCTAGCTTTGCATACATAAATCATGTCCGCGT GTAAACTAATTCTGAAAACCTTTTGTTGCAGGAAACTAGACTACTTACTTTAATTGAAGGTGTTCTTGCTGCAAACATTT TTGACTGGGGATCTCGTGCATGTGTGGATCTCTATCATGAAGGAACTATTATTGAAATTTACAGAATGAGTCGCAATAAA ATGCAGAGACCTTGGCGAGTAGGTGCATTTCATCATATCCATTGATGAGGATATTTTATTTCTAAATTTATTTATCATTG TTGATGGTTGAATACTAAGCTAATTTTTTTTTTGTCATCTAGGTGGACAATTTTGATGCCTTTAAAGAGAGAATGTTGGG GACTGGGGACAAGAAACTTCCCCCACACAGAAGAGCTTTACTTTTTGTGGATAATGCAGGTGCTGACATTGTTCTAGGGA TGCTTCCCTTGGCACGAGAGCTCCTCCGCCGTGGAACTGAAGTGAGTTCTCTTTTTGAAGAAAATTTGAAGTTACTATAC TGGACTAGATACTAAATTTCCCAACAAATTATTTGATTTAATTTTAGATTCTTCATGATTTTAATAAATGCTGTACTGGT GTTTTGATTGAGTAAAGGTGTTCTAGAATTACCTTGTTCACTTGATAAATATGTAAACTGAATCTTAACAAGATCTTCAA TAGCTGAAAATCTTATGATATATTCCCGAATTCTGACACCCCCTCCCAAAAACAATCTTGTTATGATTTCATATGTCAAA GTAAATTTATGACTGCTATCATCAAGCAAATTAGGAGATTTTTTTTATTGTTTTGGCTGCTATGCAGTCATTTGATCCTA TGCTTACTAGTTGTGTGATGTTAATATGAAAATAATGAATGAGTGCAGGTGGTTCTGGTAGCAAATTCCCTTCCTGCTTT AAATGATGTGACTGCAATGGAGCTTCCTGATATTGTTGCTGAGGCTGCCAAGGTTTGTGTATTTTGATGAACTTAATTTG TTATCTCTGGAACATTTGTGATGTTCCGAGAGCCCCTTGTAAAATTCTTCTGAATGTCTACCATCAATCAGTTACTTCTC TTTTTGTGTCTTCCCCTTGAGGTAAAATGACATGCTTGCTAAACTTCTGGTAAAGAATCCTTGCAGATAAAATTCGGCAT GCAATGATGTTATACCAAACACACTTTCTTACTGTCGTGTATTGAACGAAAACTTCTGTACCTGCATGTCTTGTCACTTT CCATATTTGTTGGAATTTCTTTTTCCTTCTTCACTTCATGACCTTCCCTTTACTTTTGTGTATCATAAATATAATCCAAC CAAATAAACTTTTGCATGAATTTATGATATGTAATAGTTATGCTTTTCTTCTTGACATCAGCTGTCAAGTATCTAGTGTG GTATCATTGATAAAAGTAAAAAAAGTATCTATTATGGTATCTGATTTAAAGTGTACTTGCAAAGATCCTGACTTCGCGAA CCTTATGTTTGATGTCAATTTGTTTATGATGTTGAATACACATTACTAATTCTTCTACATTACAGCACTGTGACATTCTT AGGCGAGCGGCTGAATCGGGAGGCTTGCTTGTGGATGCAATGACCTATACCTTAGATAGTCCCAGACAAAATTTGCCTTC GGTTCCCTTGATGGTTGTTGAGAATGGGTGTGGTAGTCCTTGTATAGACTTAAGGCAGGTCAGCTCTGAGCTGGCTGCTG CTGCAAAAGGTGCAGATCTGGTGAGTAAACCATTCTATTTATGTTTAGAAAATCAAGGAGAAGAGCATATTCTAACTTCG TTTTATCCATTTGGTAGATAATTTTGGAAGGGATGGGTAGATCTCTTCATACAAACCTCAATGCTCGATTTCAGTGTGAT GCTTTAAAGGTATGGTCATCATCTTGGTTTAAACTTTATAAGGATTTAATTTATATGCAACATCCAATGATATTTTGTCA TTTTTTATTTATTAATGATGTGGTAAAATAGTGAATCCTGATTGAATGTATGTGAAAAACTTTTTTACACTATCAATGAA TTGTTATTAAACTCTTGTGTTTTACAATCAGCTGACACTCGTCATTGTGTTCTGGTGTATAGTTACTTAGCTAATGCTAC TCTAAGATTTCTTCTCCTATCTATGATGCTTGTCTTGTCTTTAAAACTTAACTGTCCCTGTAATCACTAATGGCTCCTTT GACACATTTTTCCCCTTATATATTTTGTTAGCTTGCAATGGTGAAAAACCAGAGATTGGCTGAAAAGTTAGTTAAAGGGA ATATATACGACTGTGTTTGCAAATACGAGCCTGCAAATTGA 

CDS sequence (LotjaGi4g1v0234000.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCTTAGATTTTATCTATTCAAAGAATCTTCACCATGGTGGATTTTTTTCTTTCTTATAGGTAGGGAATCATCGAATAC CATAATTAAGGCTACTGGTGGTGGAGCATTCAAATATGCTGAACTTTTTAAAGAGAAACTCGGGCTTAGCCTTGACAAAG AAGATGAAATGGCTTGTCTTGTAGCCGGAGCCAATTTCTTGCTCAAGGCAATTCGCCATGAAGCTTTTACACACATGGAG GGTCAGAAAGAGTTTGTTCAAATTGATTCTAATGAGTTGTATCCTTATCTTCTAGTTAATATTGGATCAGGTGTTAGTAT GATCAAGGTTGATGGGGATGGCAAATTTGAGAGGGTTAGTGGAACAAATGTAGGTGGTGGTACTTACTGGGGCTTGGGAA GGCTGTTAACAAAGTGCAAGAGCTTTGATGAGTTACTCGAGCTGAGTCAGAAAGGAGACAACAGAAACACAGATATGCTA GTTGGAGACATTTATGGGGGTATGGACTATTCTAAGATTGGCCTATCGGCTTCTACAATTGCGTCAAGTTTTGGCAAGGC TACACTGGAAGGAAAGGAGCTTGAAGATTACAGACCTGAAGATATATCACTCGCTCTGCTACGGATGATTTCATACAACA TTGGCCAGATATCTTACTTGACTGCACTGCAATTTGGATTGAAGCGTATCTTTTTTGGAGGTTTTTTCACAAGGGGTCAT GCCTATACCATGGATGCTATTTCTTTTGCAATACATTTCTGGTCTAAAGGGGCTACACAAGCAATGTTCTTGCGACATGA AGGATTTCTGGGAGCATTAGGTGCATTTATGAGCTATGAAAAGCATGGTTTAGATGACCTCATGGTGCATCAGTTAGTTG AAAGATTCCCAATGGGAGCTCCATATACAGGAGGCAAGATTCAGGGCCCACCACATAGGAATTTGAATGAGAAGGCAAGT GAGAGGAATTGGAAAACTTTGGTGTCTGCTCTTTGA 

Protein sequence (LotjaGi4g1v0234000.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MLRFYLFKESSPWWIFFFLIGRESSNTIIKATGGGAFKYAELFKEKLGLSLDKEDEMACLVAGANFLLKAIRHEAFTHME GQKEFVQIDSNELYPYLLVNIGSGVSMIKVDGDGKFERVSGTNVGGGTYWGLGRLLTKCKSFDELLELSQKGDNRNTDML VGDIYGGMDYSKIGLSASTIASSFGKATLEGKELEDYRPEDISLALLRMISYNIGQISYLTALQFGLKRIFFGGFFTRGH AYTMDAISFAIHFWSKGATQAMFLRHEGFLGALGAFMSYEKHGLDDLMVHQLVERFPMGAPYTGGKIQGPPHRNLNEKAS ERNWKTLVSAL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
TIGRFAM 22 278 257 9.0E-99
PANTHER 23 304 282 1.3E-157
Gene3D 23 277 255 6.1E-112
PANTHER 23 304 282 1.3E-157
Pfam 24 277 254 9.3E-114
SUPERFAMILY 46 279 234 1.59E-69
Gene3D 76 271 196 6.1E-112
Gene3D 156 200 45 6.1E-112

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Pantothenate kinase activity Catalysis of the reaction: ATP + pantothenate = ADP + D-4'-phosphopantothenate.
Molecular function ATP binding Interacting selectively and non-covalently with ATP, adenosine 5'-triphosphate, a universally important coenzyme and enzyme regulator.
Biological process Coenzyme A biosynthetic process The chemical reactions and pathways resulting in the formation of coenzyme A, 3'-phosphoadenosine-(5')diphospho(4')pantatheine, an acyl carrier in many acylation and acyl-transfer reactions in which the intermediate is a thiol ester.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi4g1v0234000.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

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