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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi4g1v0240300 |
| Transcript ID | LotjaGi4g1v0240300.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | DNA damage-binding protein 1; TAIR: AT4G05420.1 damaged DNA binding protein 1A; Swiss-Prot: sp|Q9M0V3|DDB1A_ARATH DNA damage-binding protein 1a; TrEMBL-Plants: tr|A0A0L9TEV9|A0A0L9TEV9_PHAAN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi4g1v0240300 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr4:56595874..56617954) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTCACTTCCTGGCTAAAACCAGTGAAAACCGAACGAAAACTCACAGCACACAACGAGGGCTTCGAACTTCGCTCGTGGTT CGTGGTGAGGGTTTGTTTACAGTTGCAGCACCCTAAGGAAGAAGCTAGGTAACGCTCTGTGGTTCTCACTGTGAGAACTG AGATTCGTAGCAATCAGCATCGTTAATGAAGAGTGAAGAAGAAGAAGAAAACGATGAGTACATGGAACTACGTCGTCACA GCTCACAAACCCACCAACGTTACCCATTCTTGCGTCGGCAATTTCACCGGCCCTCAAGACCTCAATCTCATCGTCGCGTA AATTCGATACTCCACTCTCTCATTCATTCTTAGGGTTTCTCCTCACTCACTCTTCAATTTTATTCATTCATTCCTCTTTG TTTTTCTTCCAGGAAATGCACCCGTATCGAGATTCATTTGCTCTCTCCTCAGGGCTTGCAGGTACATCCCATTTCTTTCT TGTTTTCTACTCTCTTTGCATGTTCCTTCTTGGTTGAATTTGTAATAGAGTAAGATGAATGTGAAATTTCTCTTTGCAGC CCATGTTAGATGTGCCCATTTATGGAAGAATTGCCACCCTTGAACTCTTCCGCCCTCATGTAAGAAAGAACAAACCATCT ACTTTTCTTGAATTTTATCTATTTTTTTTGTAATTTTATTCTGACATAATAGTCCCCTCTTTGCTGGTTTGGTCTCAAAC AGGGTGAAGCACAGGATTATCTGTTTGTTGCGACTAAGCGATACAAGTTCTGTGTTCTTCAATGGGATCCTGAGACTTCT GAACTTGTTACAAGGTATGAATGAGAAGAAATATTAATTGTAATTAATATATATTTTTTTTTAAAAATTCATCAATTATT GATGCTGGGGTGTCAGCTGCTTGTTAGTGCTAATCCGTTTAGTTAGTTTAGGAAGCAGAAGTTTGTATGCTGTGTGTGAA 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TGACAGACTAACAAGGGTTGTCAAAGAAGATGGTTTTGTTCAATGCCAAACAGACCATACTATGTTTGCTAAGCACTCTA TGGATGGGAAGATAGCCTTATTCATTGTCTATGTTGACGATATCGTTATTACAGGAGACGATTATGACCAAATCAAACGT CTAAAGAGTCTTTTAGCAAACGAATTTGAGGTCAAGGATTTGGGCCAGCTAAAGAACTTTCTAGGGATGGAAATTGCTCG GACAAAGAATGACATTTATGTTTCTCAGAGGAAGTACACTCTGGATTTACTTAAAGAAACAGGGATGCTCGGATGCAAAG CAGCTAATACACCCATAGAGCTGGTCAAAAGAAGTGAAGAGGAAAGTATACCAGCTGATAAAGATAGATATCAAAGTCTG GTTGGAAAATTAATTTATCTAACTCACACCAGGCTTGATATTGGCTTTGCTGTAAGCTTGGCTAGTCGCTTCATGTCAAA CCCAACTGAGACTCACATGAAGACTGTGAACAGAATCCTCCAATACCTAAAGGGATCACCTGGTCGAGGACTTTATTTTC AGAAGAACTCAAACAGAGGCATTGAAGTCTACACTGATTCAGATTGGGCAGGTTGCTTATCTGACAGGAAATCTACCATA GGCTATTGCACCTTTGTATGGGGAAATATGGTAACTTGGAGAAGTAAGAAACAATCTGTAGTAGCTAGGAGTAGTGCAGA AGCTTAATTCAGAGCTATGGCACAAGGTATTTGTGAAGGAATTTGGCTCAAACGAATGCTGGATGAGATCAGAATTCCTA CCAATTACACCATGAGAATACTGTGTGACAACAAGGCTGCTATAAGCATTGCTAAGAATCCAGTTCACCATGATAGGACA AAGCATGTGGAGATTGATAGGCATTTCATTAAGGAGAAAATTGATCAAGAGATTATACGTGTTGATCACATTCCATCATG CAAGCAAACAGCAGACATTATGACTAAAGCTCTTCCAAGGAACATATATGAAAATATTAGATCCAATCTGGGTATGATAG ATATCTTCCACCCAGATTGAGGGGGAGTGTTGAAAGTCAAATGCAATTAATTAACACACTAATTAGAATAATTAGAGTCT GATTTGTACAGCTAATTAGGACTTTTATGTCAATGTTATTAGCATTCATAGAGAGAATATTTTCCCTGATTTTTAGGCTA GAATAGTGCCCAGGTCTTTAGTCATTTGTATTCTATAAATACTGCTCATGTATCATTTTACCAATCAATATAATATCATA CATTTTCCGCACATGATTGTATAACTATGCTGCATGATTTGAATGATTTATCTGGCCTTTTTAATTGTTCTTTTTAATTT ACCATTCTTGTTCCTTATGCTTATTTTACTATTACATTACAGAAACTTATCTGGTAACCAAATTCATGGATGCATTCCGG CTTCAATTGGAACAATAACTACTTTACAAGTGTTGTAAGTGACTTCTTGTTCTCCCTCTTCTTAGTGTTATAGTTTTGCA AAGTAACGAGAGTGAGAGAAAATAGAGAGAGAAGATTTTTAGGGAAATAATATTTGTTTGTATATAACTGAGAGCAATAC ATGTCTTTATATAGAAAACATAAAAGACCTAACTTAATAATATTATGGAATAGATAGCAATAATACAGTGAAAATCCATG TTGCAAAATCACTATGATTTGTCAAAGTTAATGGCTAAATTTACATTAAAAAAGGTTTGGAAAGAAAAGGAATCAGATGT CTAAGATTTTAAATAGAAGATTAATGTTTTGAGGGCAACATTACTTTTGTTCTCAATATTCTGTAATCATCAGTCAATTT ATTAAATTCTGAATTTCTACACCTATACGTCAATGACTCAATTTCTTCTTGCTTTGTGTTAAAAACTCTAAGAACTGAAA TTGTATTCTGTTATTGTATTTCTGAAAGGTGAATCTTACAGTGAACATCACTAGGCTATATATAGAGATAGAGGGAGAGA AGCTTGCGCAGCAAGCTATCCTAAGAGAGAGAATCAGTTATCAGTTACACAGTAACTGAGTCTGTTACAGCTAACTAATT CTATTACACTTACTAACAGACTGCCATGTCAGCACGTGACTACATATACTCTAATACTTTGATTTAAATTGCTTTATATT AGCTTGATTGTGAGATTACTGGAAGTTTTGAATCCTTGCTTTGGCTATCATGGTAATATTATTTTTGAATGTCATGCACA CATGCAGGGACCTTTCTTCTAACTTTTTCAACGGATCAATTCCTGAAAGCCTTGGAGAGTTGACATCGTTACAAAAACTG TAAGATTGCTTGGACTTTTAACTTGAATAAGACAAATAAGAAGACAAGAGTTTTGTATTAAAAAAATACTTATGCAGGAA CCTTAATGGCAACTCATTGTCTGGAAGTGTACCCGATACTCTGATTTTTCAAAATCACAAGTTCAAGTATGATTTCATTG TATCTCCTTGTTACTTCTCAACTTTCTTTACGATTAAATTGTTTGTTAAATCTACACTTGTATGCTGCAGTTTTGGCAAT AATTCTGGATTATGTGGTATACCTAGTCTAGTCTCCTGTGTAACTCCTGCTAGTGCTAAAGTTGGTATGAGGATAGCAGC TCGAGTCAGTATATGGATAGGAGGATTTCTACTGATTATCGGTTGTATAGTCTTCTGCGGTTGGAGGTGAGATATTAATT TATGTTATCATAGGACAATTATTTCTGGGATTAAAGAAAAATCACCCGTTCGTCAATTTTTCTTGTTAGATATTTCACAC GTAAGCCCCAAGGGTACGAGAGGGGAATACAGTTGGGGGACGAGAGTGGAATACAGTTGGGGGACTTGGGGGACAAGAAT CAAGGTGAACACTCGGATCATGAGCCCTTGGTCGAAACACAAGAATCAACAACAGTTCCAACACAAGAATCAACAACAGT TCCAAGGAGATCTGCGAGAATACAGAATCAAAAGAGCAAGTAAAAGTCAAAGGATAGGTGAGAACACATGTGTAACCTTA GGTCTAAATTATAACCTTTTCTTTCTCCTACTTATTGATTTATTAATTACTAATTATTATCCTATTTTCTTTATAATTCA TTGCATATTGGTGGTTATAATTGTTACATATTATACTCTAAATGAACGTCATTTCCATTAAAATTCCTTAGTTTTGGGAA GTGAGAAGATGTTTTTAGTGAGTCAAAATTCCATGTAATGGTCTTTTGTGCAATCGTTCATGAATAACATTTTGTTGTGT GAATTTAAGTGATGAATTATCATAACTCATAAGTCATAACTTTGTATTTGTTGAACAGGAGCATCAAAGAACTTCTTGTG GCATCTTGGTTTAGTCTCTCTAGGTTGAAACATGAGCATCAAAGAACTTCTTGTGGCATCTTGGTTTAGTCTCTCTAGGT TGAAACATGAGCATCATAACTTCTTGTGACAACTTGGTTTAGTATCTCAGTACATTGAAATGAATTAGTTTTACTTCTTG TATGGGTTAGTGGTTATCAAGGACTGTACTAATGGATTAGTTTGACTTCTTGTATGGGTTAGTGGTTATCAGGGACTGTA CTAATGGATCAGTTATTTGTGTACATACTCTTTTAAGTACTCTACGCTTCATTTTTTGAAGCACTTGGTTCATGCTGGAA TTCTATTTAAAATTTAAGCTTTCATGGAAATCATGATTGTTAGAATTCTCCAAAATTAGCTCCTGTAATGCTGCCATAAA ATTCAGATTGTAACCCTCTAGGTGACGTCTAAGATTTGCCTGGCCCAAGGATTTGGAATCTAGAAAATAGAATAATCCTA ACCATAAGGAGTCAACTCTTATATCTATTGCATAGACTTCACTCAACGATTATTGTGGATTAGAATAGTGACTTGTGGTT CAATTTTGTTGAATATATTTGAATTGAATTATGGGGAGTGATCAATTACTGGAGTGTCCAATTTCAAAGCTTTTGTTTTC ATCAGGACCTTTATGCAGCAGAAACATCGTTTGGTTTTGTGATTTGTATAGTAGTTTCTAATGTCTATTGTATGCAGTTG GTCTTAATCTTGCTGTGTTTTCCCTGTAGCGTTTTGGTTTCCTCTTTCTTTTTGCTTTGGAAGCCTATACTAATAAGGGG TTTGGTTTGGTTTTTTTGCAGCAGGTTCTAATCTTAAAGGTTTTTTCTATATCAGGGAGCCACCCAGATTTTGTTCAGTT CTCTATCTTGCTAAGTTGTAAATGAAAGTCTAAATTGTAACTGTTTTACTTTCTGAAGTTTTCAGGTAAAGATATCTTCT AAAGCTAATACAGTTGCAACACGCATACAAAACATAAAGTTACCATCTTATTCATGGCTGCAGAGCATTTTAAATTGTAT GCGGCAAGTGTCTTTTACCGTTTCCTAATTGTTTTTATTTACTTTAGTTGGGTACATACGTTGAAAGTATTTTCAAGGAT GTGAAAAATCCAACCTTGATTGCTTTCATCTATTTTGTACTATAGTTTATTACGATTGTTCTTTGCCTTGCTTTCTTTGT TGGAGAAGGTGGCTTTAATTCTGGGTTGAGGAAGATGTATGCTTTAGCACCCTTAGATGTTTTGCTTATACAAAGCAAGA CATATCAATAAGCAATCAACCTTATGTCTACGCCTTCAAACAACCTTATGTCTATTTCTTTTGGTTTCAAAGAAAAACTA AACCACCTTATGTCTATAAAGCATCTTATCGTTTTGAAGGAGTCTACGCATCTTTAAATGTTAAGTTTTTTTTTTATAGG T
CDS sequence (LotjaGi4g1v0240300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGTACATGGAACTACGTCGTCACAGCTCACAAACCCACCAACGTTACCCATTCTTGCGTCGGCAATTTCACCGGCCC TCAAGACCTCAATCTCATCGTCGCGAAATGCACCCGTATCGAGATTCATTTGCTCTCTCCTCAGGGCTTGCAGCCCATGT TAGATGTGCCCATTTATGGAAGAATTGCCACCCTTGAACTCTTCCGCCCTCATGGTGAAGCACAGGATTATCTGTTTGTT GCGACTAAGCGATACAAGTTCTGTGTTCTTCAATGGGATCCTGAGACTTCTGAACTTGTTACAAGGGCTATGGGGGATGT GTCTGATCGTATAGGACGACCCACAGATAATGGACAGATTGGCATTATCGATCCTGATTGTAGGTTGATTGGACTCCATT TGTATGATGGCTTGTTTAAAGTTATTCCCTTCGATAATAAAGGACAACTCAAGGAAGCGTTTAATATTAGGCTTGAGGAG CTCCAAGTTTTGGATATTAAATTTCTCTTTGGTTGTTCAAAGCCAACTTTTGTGGTTCTTTACCAGGACAACAGAGATGC TCGTCATGTGAAGACGTATGAGGTTGCTCTGAAGGATAAAGATTTTGTTGAGGGTCCATGGTCCCAGAACAACCTTGATA ATGGGGCTGATTTATTGATACCAGTTCCCCCTCCTCTTTGTGGTGTGCTTATTATTGGTGAAGAAACCATAGTATTCTGT AGTGCCAATGCTTTCAAAGCTATTCCAATCAGACCTTCAATTACAAAAGCATATGGAAGAGTTGATCCTGATGGTTCTAG ATATTTACTTGGTGACCATACGGGGTTGCTTAGTCTGCTTGTAATAACCCATGAGAAAGAAAAGGTTACAGGACTGAAAA TTGAGGCCCTTGGGGAGACTTCCATTGCATCTACAATATCATACCTAGATAATGCATTTGTCTACATTGGTTCAAGTTAT GGAGATTCTCAGCTTATAAAACTAAATCTACAGCCTGATGCAAAAGGCTCTTATGTGGATGTTTTGGAAAGGTATGTCAA TTTGGGGCCAATTGTTGATTTCTCTGTGGTAGACCTTGAAAGGCAAGGCCAAGGTCAGGTTGTAACCTGCTCTGGAGCTT ACAAGGATGGTTCTCTTCGTGTTGTCCGTCATGAAATAGGGATCAATGAACAGGTCAGTTCCCTTCCTATCGGCCCAGTG TGGGACCTCTGCACCTGA
Protein sequence (LotjaGi4g1v0240300.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSTWNYVVTAHKPTNVTHSCVGNFTGPQDLNLIVAKCTRIEIHLLSPQGLQPMLDVPIYGRIATLELFRPHGEAQDYLFV ATKRYKFCVLQWDPETSELVTRAMGDVSDRIGRPTDNGQIGIIDPDCRLIGLHLYDGLFKVIPFDNKGQLKEAFNIRLEE LQVLDIKFLFGCSKPTFVVLYQDNRDARHVKTYEVALKDKDFVEGPWSQNNLDNGADLLIPVPPPLCGVLIIGEETIVFC SANAFKAIPIRPSITKAYGRVDPDGSRYLLGDHTGLLSLLVITHEKEKVTGLKIEALGETSIASTISYLDNAFVYIGSSY GDSQLIKLNLQPDAKGSYVDVLERYVNLGPIVDFSVVDLERQGQGQVVTCSGAYKDGSLRVVRHEIGINEQVSSLPIGPV WDLCT
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 3 | 393 | 391 | 8.9E-195 | – | |
| PANTHER | 3 | 393 | 391 | 8.9E-195 | – | |
| Gene3D | 6 | 385 | 380 | 6.4E-163 | ||
| Gene3D | 15 | 347 | 333 | 6.4E-163 | ||
| Pfam | 76 | 397 | 322 | 8.8E-71 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi4g1v0240300.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…