Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi5g1v0272600 |
Transcript ID | LotjaGi5g1v0272600.2 |
Related isoforms 1 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | DNL-type zinc finger protein; TAIR: AT3G54826.1 Zim17-type zinc finger protein; Swiss-Prot: sp|Q0IH40|DNLZ_XENLA DNL-type zinc finger protein; TrEMBL-Plants: tr|I3SDC8|I3SDC8_LOTJA Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0272600 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:58606035..58617356) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTTATTTTTAACCCATGGGCTGAAACAAAAATTAGGGAGCAAGAAAGCACCATGGCCCAAAACACCTTATAATAGCTTGT GACCATTCTCCACCGCCATCGGAGCGGAGCAACAATCGCAGTAACATGGCGACGCCGGCAATCATGTCGCAGTTGCGGAG GCGATTCATCTCAAGCCAAATCCCTAATCACGGCAACTCCATCACTCAAGGCATGCCTTCAATTTTCCTCTACCTCTGCA AAAATTTTGTGTTTGTTTTGTGTGTGTGCTGTTATCGTTGTTGTAGATTTTCTCAACTTCAAGCTTTTTCATACTACCCT TTTGTTGGTTTTAGAAAATTCGGAAATTCCATGGCTACTTCAACTTGTGTATAAAATTTTAGTCCATTCCACTGTTCAAT AATTGATTGGAAGCAAAATAATTAATAAACTATTTTTCATGCATGAATGGTTGGCTTCATATCATTATTGATAGATAATG TTGCAATTAACTGCTAATTCAGTGCTATCTAGACTTGTTATTCTTAACCACCATGAATTTTTTTTTTTTGCTTCAAGTGC TTTCAGTACTACCCTGAATTTGATAAGAGTCTAAAAGCAATGAAGCTTTTGGGGGGAAAACACTTTTAGGGTTTATAAAT ATATTTTAATATTTGGAATTTTGCATCTACTCAAATGTGAAGCAAATGGTGTTTTCAGATTAACAGGAAAGATTAGATAT TGTAAGCTTGAGTTGAACCTGCTCTTAGAATGGTTAATGCTAGTTCAGTTAGCATGCTTTAAATTACCTGTGATAGATGG TTACGACTCCCGGTTATTTTTAAAATACCTCATTTTCGCTGAGTTCAGTTGAGTTATCCATTGGAATTTGGAAGCATATT TGCAGGGAGGTTAATTTTGTGGCGGATGCCTTTGCTAAGAATGCTTTATCCTTGCCTATGATGTTTCACCTGACTTTTGT GTAGTTCCATTTATGTTTGATTCTGCAGTACTTTGTGTATGCTGGGCTAGTTTCCCTTGTTTTAGGCTTTTAGCAGCGGT TTTTATATAAACAAAAAAAAAACTGATTTCTTCCTCTTTATTCATTTAGAGGTAAATTATGATTCTGATTAACTTAATGT TCATTTCAAGTTAAAGCCACTTTTGATCATTCACCTAAGAGGATCTTGTGCATTAAAAAATGGAGATGTTTGTACTATTC TTTCCCATGTGTGGAAGTTTTTCTTATTAATAGGTTATGTTGTTTATTGGCAGCATCCTCTTGGCATTCTTCTATCGGTA CAATGTTAGACAGATATGGACTTCATAAAAAGGGGTTCTTCTCTACGGATACAAATCCAGACAAACATGTTTGTGAAGAT GCTGACTCCTCAAAGCCTAGTGTGATCCCAGATAATGCTCCTACATCCATGAGCACTAATGAGAACTCTGAGTCTGGTGT AAAGTTTTCTGCTAACTCCAGTTTGAAAACTTCCTCAAGGCATGACCTTGCTATGATTTTCACCTGCAAAGTTTGTGAAA CGAGATCTATTAAAACAGTTTGTCGTGAATCGTATGAGAAAGGTGTTGTGGTAGCAAGGTGCGGAGGGTGTAATAATCAT CACTTGATTGCTGATCACCTTGGATGGTTTGGTGAACCCAGAAGCATCGAGGACTTCCTGGCTGCACGTGGAGAAGATGT AAAGAAAGGTTCAATTGATACACTGAATCTTACACTGGAAGATATTGCTGGAAAACAGCCTGCATTAGGGTAGCACCTAG ATTTTGGAAGGGTCAGGGAATGTAACTTGACTTGGTGTTTGCAACTCAATTCTTCTGTTTCTTGATTATCCTGATACTAA AAAAGTGACATTTTCTTAATTGTTTTTTTGTGCTTACTGAAGTAATGCTTGAGATTATGCATAAACATTAAACAGCCAAA TAAAATGCGTCTGCTAGGAAAATTATAACCAAAATCTTGTTTATCCAGCATTAATTTGTATCCACGGCTCCGCGCGCATG CAAATCACATTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTATGTAATTGGGAAGTGAGGAACTGGAGGAAACAACCTAGAAAATAGT TGTGTGGCATCATGTGGTTTTCTTGTAGCTGCTCTATCTGCTCAAAGGAGAATGCTGACCCCAGATCAGATCCTGCCATG ATGAAAGTCTGATTATCATGTTTCCTTTGAGACTTGAGAGTGTGATATAAATGAGTGACATAGAAGGAATTCGTGGATTT TCATTGAAACGAAGGCATATATTAGTATGTGCCTCATTTAGTCGCAGCAAAGAGCTAATATGAGTTTGTTAAGGTTTTCA TTATTTTTTTTATCAATGTTCTAGTGAGTTGTCGAATATTTGTGAACTGAAAGTATATTTTAAATACTCTAACTATTTGT TAAAATAATTAACTTTATATGAGAATATTATATCGAAAAAAAGATTTCATTAAGACTTATAGTCAGCCAAATGACACTTA CAAATGACACTCACATATGGAGAAATAGATGAATGAATCCTATTGGAGAGATTATGCAATGCTATAGCATAAACAATACA AATAATAACATAACATGCTCATCAACCAAACCCACTGAAAAAGCTCTATCATGGTACTCTCTAATCCACAAAGTTGAGTA TTGATACATCTAGGATATGTTGAAGAGTGGAAGAATGATCTTTATATGAGAAATAAAGTCTAAGAAATAATACTTGGAAA TAATTTTTTTAACTATATGCTAACTAGATAACTCAAACCAAACTAACTCATTTACTAGCAAACAATCTTATTAAATTCGG ACCGGTAATGTTGATCTACACCTCATTGAACAATGCCACATGATGGATGGACGATGTCTCATATGTACAATTTTAAAATT TTAATATTCAAGTTTAATACATGTTCACAACTATTATTAAAAAAACATAATTTTAGACAACATAAGAGGATAATAAACCT ATTTTTCTAATGAAAACTATCGGGCAAAACTAAATAGTGAAATTTCATCAAGAAAATAAAAATAAAAAGTAATATAAAAA ACCTAATGCTTTCATGTGATGTCTTCGAATGTGGAGATTGAAAATATGCGTGTACAATTAAAATTAACATACTTCAAGAG TTAATTGTGAAAGAAATGCACGATTTACCGAACCCTAAAATACAAAAATAATATATATATATATATATATATATATAGGG ACCCTATATATATATATATATAGTTATTTGAGAATAGAGGTCGATGACCTAAATGTTTCTTCGTGTTTTTCACGTCCTTG ATCTTCCTCTAACCATATGCCGCCGCCCGTCTTCTTTCTTTTCTTCAGTTTTCTCTAGTGTCGTTTGTCTCGCAATCAAA TGAACCAAGTGACAATAAAAAAGGGTGAATGTAATTGTAAGTACCATAGTTTTTTCCTTATGAAAATCTGCAATATCTTG TTAATACATAGAAGCTCGACCAATTGTGTATTTTAGAATTTGGGCTAGAATTTGAAGGATTCAATGATTCATTGATATGT GTTGTAATGGAATTGGATAGAGTCATGTTCATATTAGGGCTTTGTCCATGTACTTAAAAAATGTTATATGACATTTTGTA TCTACAAAAATATTATTAAGTAATCCAGACAAATAACTCTCTTGTGGATGCTATGAGGGAAATAAATTAGTTGTTGACAA AAAGGGGAAATAAATTAGTTCAAAACCCAAATTATATTTTGATGGAGAAAACCTGCTTTAATCATGTTTAGGGAAAAACG AACCCGAAGAAGCAGTGACGGTAATGAGTTTTGAGATACTGATATCCACAGTGAACATGTCTTGTACAATAATTATAATT TGAATTATAATAGTAGTTAAATAATAATAATAATAAGCTTGTATTTTTTTTTTACATCGACAAGATAAACTATAACCGTC TAGGGTTGATCTCTGGACTTTTTCATTCCCAAATCTCAATCCATATGTCCACAATTACTTACCAATTGAGCTATACTTCA AAAACTTAGCTTATATATTTTGTTAAAAATATGATTAAATTTTAAAATTACTTATACTTTTAAGATTATTAATGACGTCC ATTTTCATAAATTATTTGAATGAAAATGTCTTTGGTTTATTTAAAAATTTGTAAAAGGGAACAAGGTCAAAGAAAGAGTT TTAAAAATAAGGAGTACATGGAATTTTCCCGAAGTCGACATGAACATAATTAGGTTTTATATTTTCATGACCGCTTCTAA ACTCACCTTAGCTCTTAACGGAGAGTCTTAGACAATAAAAGGTAAACATATCCCCGAGGCCCCGACCCACTCCTATTGTG GCGCTTTATAATAGCTTTTTTCATAACTTTTAGCAAAGCGCCACAATAGGAGTGGGTCGGGGCCTCGGGGGTATGTTTAC CTTTCATTGTCTATTTCCCTATTGTGGCGCTTTGCTAAAAGTTATGAAAAAAACTATTATAAAAATAATCCAATTTATTT TAAATTCAATCTTCAAGTACATAATCTTTTTTCTGTCAAGTTTTTTATATTTCCCGTCAAAAAAATTTGTTCAATATTTA TTATATTTGGTCAATATTTTATAATCAAGTTTATCTAGCTATCCATCACATCACACGATATTTTATTTTTAACCCATGGG CTGAAACAAAAATTAGGGAGCAAGAAAGCACCATGGCCCAAAACACCTTATAATAGCTTGTGACCATTCTCCACCGCCAT CGGAGCGGAGCAACAATCGCAGTAACATGGCGACGCCGGCAATCATGTCGCAGTTGCGGAGGCGATTCATCTCAAGCCAA ATCCCTAATCACGGCAACTCCATCACTCAAGGCATGCCTTCAATTTTCCTCTACCTCTGCAAAAATTTTGTGTTTGTTTT GTGTGTGTGCTGTTATCGTTGTTGTAGATTTTCTCAACTTCAAGCTTTTTCATACTACCCTTTTGTTGGTTTTAGAAAAT TCGGAAATTCCATGGCTACTTCAACTTGTGTATAAAATTTTAGTCCATTCCACTGTTCAATAATTGATTGGAAGCAAAAT AATTAATAAACTATTTTTCATGCATGAATGGTTGGCTTCATATCATTATTGATAGATAATGTTGCAATTAACTGCTAATT CAGTGCTATCTAGACTTGTTATTCTTAACCACCATGAATTTTTTTTTTTTGCTTCAAGTGCTTTCAGTACTACCCTGAAT TTGATAAGAGTCTAAAAGCAATGAAGCTTTTGGGGGGAAAACACTTTTAGGGTTTATAAATATATTTTAATATTTGGAAT TTTGCATCTACTCAAATGTGAAGCAAATGGTGTTTTCAGATTAACAGGAAAGATTAGATATTGTAAGCTTGAGTTGAACC TGCTCTTAGAATGGTTAATGCTAGTTCAGTTAGCATGCTTTAAATTACCTGTGATAGATGGTTACGACTCCCGGTTATTT TTAAAATACCTCATTTTCGCTGAGTTCAGTTGAGTTATCCATTGGAATTTGGAAGCATATTTGCAGGGAGGTTAATTTTG TGGCGGATGCCTTTGCTAAGAATGCTTTATCCTTGCCTATGATGTTTCACCTGACTTTTGTGTAGTTCCATTTATGTTTG ATTCTGCAGTACTTTGTGTATGCTGGGCTAGTTTCCCTTGTTTTAGGCTTTTAGCAGCGGTTTTTATATAAACAAAAAAA AAACTGATTTCTTCCTCTTTATTCATTTAGAGGTAAATTATGATTCTGATTAACTTAATGTTCATTTCAAGTTAAAGCCA CTTTTGATCATTCACCTAAGAGGATCTTGTGCATTAAAAAATGGAGATGTTTGTACTATTCTTTCCCATGTGTGGAAGTT TTTCTTATTAATAGGTTATGTTGTTTATTGGCAGCATCCTCTTGGCATTCTTCTATCGGTACAATGTTAGACAGATATGG ACTTCATAAAAAGGGGTTCTTCTCTACGGATACAAATCCAGACAAACATGTTTGTGAAGATGCTGACTCCTCAAAGCCTA GTGTGATCCCAGATAATGCTCCTACATCCATGAGCACTAATGAGAACTCTGAGTCTGGTGTAAAGTTTTCTGCTAACTCC AGTTTGAAAACTTCCTCAAGGCATGACCTTGCTATGATTTTCACCTGCAAAGTTTGTGAAACGAGATCTATTAAAACAGT TTGTCGTGAATCGTATGAGAAAGGTGTTGTGGTAGCAAGGTGCGGAGGGTGTAATAATCATCACTTGATTGCTGATCACC TTGGATGGTTTGGTGAACCCAGAAGCATCGAGGACTTCCTGGCTGCACGTGGAGAAGATGTAAAGAAAGGTTCAATTGAT ACACTGAATCTTACACTGGAAGATATTGCTGGAAAACAGCCTGCATTAGGGTAGCACCTAGATTTTGGAAGGGTCAGGGA ATGTAACTTGACTTGGTGTTTGCAACTCAATTCTTCTGTTTCTTGATTATCCTGATACTAAAAAAGTGACATTTTCTTAA TTGTTTTTTTGTGCTTACTGAAGTAATGCTTGAGATTATGCATAAACATTAAACAGCCAAATAAAATGCGTCTGCTAGGA AAATTATAACCAAAATCTTGTTTATCCAGCATTAATTTGTATCCACGGCTCCGCGCGCATGCAAATCACATTTTACTAAG ATCAATGTAGTTGTATGTAATTGGGAAGTGAGGAACTGGAGGAAACAACCTAGAAAATAGTTGTGTGGCATCATGTGGTT TTCTTGTAGCTGCTCTATCTGCTCAAAGGAGAATGCTGACCCCAGATCAGATCCTGCCATGATGAAAGTCTGATTATCAT GTTTCCTTTGAGACTTGAGAGTGTGATATAAATGAGTGACATAGAAGGAATTCGTGGATTTTCATTGAAACGAAGGCATA TATTAGTATGTGCCTCATTTAGTCGCAGCAAAGAGCTAATATGAGTTTGTTAAGGTTTTCATTATTTTTTTTATCAATGT TCTAGTGAGTTGTCGAATATTTGTGAACTGAAAGTATATTTTAAATACTCTAACTATTTGTTAAAATAATTAACTTTATA TGAGAATATTATATCGAAAAAAAGATTTCATTAAGACTTATAGTCAGCCAAATGACACTTACAAATGACACTCACATATG GAGAAATAGATGAATGAATCCTATTGGAGAGATTATGCAATGCTATAGCATAAACAATACAAATAATAACATAACATGCT CATCAACCAAACCCACTGAAAAAGCTCTATCATGGTACTCTCTAATCCACAAAGTTGAGTATTGATACATCTAGGATATG TTGAAGAGTGGAAGAATGATCTTTATATGAGAAATAAAGTCTAAGAAATAATACTTGGAAATAATTTTTTTAACTATATG CTAACTAGATAACTCAAACCAAACTAACTCATTTACTAGCAAACAATCTTATTAAATTCGGACCGGTAATGTTGATCTAC ACCTCATTGAACAATGCCACATGATGGATGGACGATGTCTCATATGTACAATTTTAAAATTTTAATATTCAAGTTTAATA CATGTTCACAACTATTATTAAAAAAACATAATTTTAGACAACATAAGAGGATAATAAACCTATTTTTCTAATGAAAACTA TCGGGCAAAACTAAATAGTGAAATTTCATCAAGAAAATAAAAATAAAAAGTAATATAAAAAACCTAATGCTTTCATGTGA TGTCTTCGAATGTGGAGATTGAAAATATGCGTGTACAATTAAAATTAACATACTTCAAGAGTTAATTGTGAAAGAAATGC ACGATTTACCGAACCCTAAAATACAAAAATAATATATATATATATATATATATATAGGGACCCTATATATATATATATAG TTATTTGAGAATAGAGGTCGATGACCTAAATGTTTCTTCGTGTTTTTCACGTCCTTGATCTTCCTCTAACCATATGCCGC CGCCCGTCTTCTTTCTTTTCTTCAGTTTTCTCTAGTGTCGTTTGTCTCGCAATCAAATGAACCAAGTGACAATAAAAAAG GGTGAATGTAATTGTAAGTACCATAGTTTTTTCCTTATGAAAATCTGCAATATCTTGTTAATACATAGAAGCTCGACCAA TTGTGTATTTTAGAATTTGGGCTAGAATTTGAAGGATTCAATGATTCATTGATATGTGTTGTAATGGAATTGGATAGAGT CATGTTCATATTAGGGCTTTGTCCATGTACTTAAAAAATGTTATATGACATTTTGTATCTACAAAAATATTATTAAGTAA TCCAGACAAATAACTCTCTTGTGGATGCTATGAGGGAAATAAATTAGTTGTTGACAAAAAGGGGAAATAAATTAGTTCAA AACCCAAATTATATTTTGATGGAGAAAACCTGCTTTAATCATGTTTAGGGAAAAACGAACCCGAAGAAGCAGTGACGGTA ATGAGTTTTGAGATACTGATATCCACAGTGAACATGTCTTGTACAATAATTATAATTTGAATTATAATAGTAGTTAAATA ATAATAATAATAAGCTTGTATTTTTTTTTTACATCGACAAGATAAACTATAACCGTCTAGGGTTGATCTCTGGACTTTTT CATTCCCAAATCTCAATCCATATGTCCACAATTACTTACCAATTGAGCTATACTTCAAAAACTTAGCTTATATATTTTGT TAAAAATATGATTAAATTTTAAAATTACTTATACTTTTAAGATTATTAATGACGTCCATTTTCATAAATTATTTGAATGA AAATGTCTTTGGTTTATTTAAAAATTTGTAAAAGGGAACAAGGTCAAAGAAAGAGTTTTAAAAATAAGGAGTACATGGAA TTTTCCCGAAGTCGACATGAACATAATTAGGTTTTATATTTTCATGACCGCTTCTAAACTCACCTTAGCTCTTAACGGAG AGTCTTAGACAATAAAAGGTAAACATATCCCCGAGGCCCCGACCCACTCCTATTGTGGCGCTTTATAATAGTTTTTTTCA TAACTTTTAGCAAAGCGCCACAATAGGAGTGGGTCGGGGCCTCGGGGGTATGTTTACCTTTCATTGTCTATTTCCCTATT GTGGCGCTTTGCTAAAAGTTATGAAAAAAACTATTATAAAAATAATCCAATTTATTTTAAATTCAATCTTCAAGTACATA ATCTTTTTTCTGTCAAGTTTTTTATATTTCCCGTCAAAAAAATTTGTTCAATATTTATTATATTTGGTCAATATTTTATA ATCAAGTTTATCTAGCTATCCATCACATCACACGATATTTTATTTTTAACCCATGGGCTGAAACAAAAATTAGGGAGCAA GAAAGCACCATGGCCCAAAACACCTTATAATAGCTTGTGACCATTCTCCACCGCCATCGGAGCGGAGCAACAATCGCAGT AACATGGCGACGCCGGCAATCATGTCGCAGTTGCGGAGGCGATTCATCTCAAGCCAAATCCCTAATCACGGCAACTCCAT CACTCAAGGCATGCCTTCAATTTTCCTCTACCTCTGCAAAAATTTTGTGTTTGTTTTGTGTGTGTGCTGTTATCGTTGTT GTAGATTTTCTCAACTTCAAGCTTTTTCATACTACCCTTTTGTTGGTTTTAGAAAATTCGGAAATTCCATGGCTACTTCA ACTTGTGTATAAAATTTTAGTCCATTCCACTGTTCAATAATTGATTGGAAGCAAAATAATTAATAAACTATTTTTCATGC ATGAATGGTTGGCTTCATATCATTATTGATAGATAATGTTGCAATTAACTGCTAATTCAGTGCTATCTAGACTTGTTATT CTTAACCACCATGAATTTTTTTTTTTTGCTTCAAGTGCTTTCAGTACTACCCTGAATTTGATAAGAGTCTAAAAGCAATG AAGCTTTTGGGGGGAAAACACTTTTAGGGTTTATAAATATATTTTAATATTTGGAATTTTGCATCTACTCAAATGTGAAG CAAATGGTGTTTTCAGATTAACAGGAAAGATTAGATATTGTAAGCTTGAGTTGAACCTGCTCTTAGAATGGTTAATGCTA GTTCAGTTAGCATGCTTTAAATTACCTGTGATAGATGGTTACGACTCCCGGTTATTTTTAAAATACCTCATTTTCGCTGA GTTCAGTTGAGTTATCCATTGGAATTTGGAAGCATATTTGCAGGGAGGTTAATTTTGTGGCGGATGCCTTTGCTAAGAAT GCTTTATCCTTGCCTATGATGTTTCACCTGACTTTTGTGTAGTTCCATTTATGTTTGATTCTGCAGTACTTTGTGTATGC TGGGCTAGTTTCCCTTGTTTTAGGCTTTTAGCAGCGGTTTTTATATAAACAAAAAAAAAACTGATTTCTTCCTCTTTATT CATTTAGAGGTAAATTATGATTCTGATTAACTTAATGTTCATTTCAAGTTAAAGCCACTTTTGATCATTCACCTAAGAGG ATCTTGTGCATTAAAAAATGGAGATGTTTGTACTATTCTTTCCCATGTGTGGAAGTTTTTCTTATTAATAGGTTATGTTG TTTATTGGCAGCATCCTCTTGGCATTCTTCTATCGGTACAATGTTAGACAGATATGGACTTCATAAAAAGGGGTTCTTCT CTACGGATACAAATCCAGACAAACATGTTTGTGAAGATGCTGACTCCTCAAAGCCTAGTGTGATCCCAGATAATGCTCCT ACATCCATGAGCACTAATGAGAACTCTGAGTCTGGTGTAAAGTTTTCTGCTAACTCCAGTTTGAAAACTTCCTCAAGGCA TGACCTTGCTATGATTTTCACCTGCAAAGTTTGTGAAACGAGATCTATTAAAACAGTTTGTCGTGAATCGTATGAGAAAG GTGTTGTGGTAGCAAGGTGCGGAGGGTGTAATAATCATCACTTGATTGCTGATCACCTTGGATGGTTTGGTGAACCCAGA AGCATCGAGGACTTCCTGGCTGCACGTGGAGAAGATGTAAAGAAAGGTTCAATTGATACACTGAATCTTACACTGGAAGA TATTGCTGGAAAACAGCCTGCATTAGGGTAGCACCTAGATTTTGGAAGGGTCAGGGAATGTAACTTGACTTGGTGTTTGC AACTCAATTCTTCTGTTTCTTGATTATCCTGATACTAAAAAAGTGACATTTTCTTAATTGTTTTTTTGTGCTTACTGAAG TAATGCTTGAGATTATGCATAAACATTAAACAGCCAAATAAAATGCGTCTGCTAGGAAAATTATAACCAAAATCTTGTTT ATCCAGCATTAATTTGTATCCACGGCTCCGCGCGCATGCAAATCACATTTTACTAAGATCAATGTAGTTGTATGTAATTG GGAAGTGAGGAACTGGAGGAAACAACCTAGAAAATAGTTGTG
CDS sequence (LotjaGi5g1v0272600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGACGCCGGCAATCATGTCGCAGTTGCGGAGGCGATTCATCTCAAGCCAAATCCCTAATCACGGCAACTCCATCAC TCAAGCATCCTCTTGGCATTCTTCTATCGGTACAATGTTAGACAGATATGGACTTCATAAAAAGGGGTTCTTCTCTACGG ATACAAATCCAGACAAACATGTTTGTGAAGATGCTGACTCCTCAAAGCCTAGTGTGATCCCAGATAATGCTCCTACATCC ATGAGCACTAATGAGAACTCTGAGTCTGGTGTAAAGTTTTCTGCTAACTCCAGTTTGAAAACTTCCTCAAGGCATGACCT TGCTATGATTTTCACCTGCAAAGTTTGTGAAACGAGATCTATTAAAACAGTTTGTCGTGAATCGTATGAGAAAGGTGTTG TGGTAGCAAGGTGCGGAGGGTGTAATAATCATCACTTGATTGCTGATCACCTTGGATGGTTTGGTGAACCCAGAAGCATC GAGGACTTCCTGGCTGCACGTGGAGAAGATGTAAAGAAAGGTTCAATTGATACACTGAATCTTACACTGGAAGATATTGC TGGAAAACAGCCTGCATTAGGGTAG
Protein sequence (LotjaGi5g1v0272600.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATPAIMSQLRRRFISSQIPNHGNSITQASSWHSSIGTMLDRYGLHKKGFFSTDTNPDKHVCEDADSSKPSVIPDNAPTS MSTNENSESGVKFSANSSLKTSSRHDLAMIFTCKVCETRSIKTVCRESYEKGVVVARCGGCNNHHLIADHLGWFGEPRSI EDFLAARGEDVKKGSIDTLNLTLEDIAGKQPALG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
PANTHER | 4 | 191 | 188 | 3.1E-55 | – | |
PANTHER | 4 | 191 | 188 | 3.1E-55 | ||
MobiDBLite | 63 | 91 | 29 | - | – | |
MobiDBLite | 72 | 91 | 20 | - | – | |
ProSiteProfiles | 102 | 194 | 93 | 17.426 | ||
Pfam | 109 | 169 | 61 | 4.7E-26 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
---|---|---|---|---|
Molecular function | Zinc ion binding | Interacting selectively and non-covalently with zinc (Zn) ions. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0272600.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…