Your browser is unable to support new features implemented in HTML5 and CSS3 to render this site as intended. Your experience may suffer from functionality degradation but the site should remain usable. We strongly recommend the latest version of Google Chrome, OS X Safari or Mozilla Firefox. As Safari is bundled with OS X, if you are unable to upgrade to a newer version of OS X, we recommend using an open source browser. Dismiss message
| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0287000 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0287000.1 |
| Related isoforms 2 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Aldolase superfamily protein; TAIR: AT1G60460.2 hypothetical protein; Swiss-Prot: sp|Q13613|MTMR1_HUMAN Myotubularin-related protein 1; TrEMBL-Plants: tr|A0A0R0GB89|A0A0R0GB89_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0287000 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:60368840..60378536) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TCTCTCTGCATTTTATGTCACATCACCTATCATATCACTCATTTATCTCTCTTTTCTTTATAATTTGGTGAGGTGGAGGT GGAATTGGTTTGTGAAAATATTATTATTCGATATCTGGTGGTGTGATCTTATCATCTGCATGAAGCGTTAAACAGTCATT GAAGCCACTCACACAAAACTCAAACTCACTCGCCATGTATTGCTTATCAATAAAGAAACCCATTGTTGCCAGTTCCACTC TTCCCCCTAAACCCGATTCTTCTTCTTCTTCTTCTCCTCCGCAACCAATCAACCCCAGTCCCCAAAAACCACCTTCTTCC GCCGCCGGAAAACCCCCAATTTCCTCTTTACCGCGAAACAGGCTCCGCCGTCGACTGCCACAACCCTCCGTCATCCGAAT GGAACGCATCGTCGGCACCGGAAGCTTCCGAGACGGCGAACCCGAGCCCAAGTACACTCTGCTCTGCTTCTTCTCTTCAT TATTACTGATTAATTAATTATGTAGAAATGTAGAATATATGTTAATGATTGTGTTAGTAAAAATGAGTTGCTAATCCAAA CTGGAATTCCAAGTGCTCATGTTCTATAGTGAAGGATTTAGCTTCTGTAAAGTGTAAAGTGAAGAGTGAAGTTTGGAATT ATAACTGTTGATAAGAAAATCCATGGTTGAGATTTTCATTATATTGTTATATGTGTGTGCACATGCATTGTTTCACAATC ACAAACTATTTTCTAATGTATAGTTATCGATGCACGATATCCGCTAAAGTTATTGTATTTTATCTTCAAAAGTGCACTGG AGTCGGATCTCTAATTGGAAAGGTATTATTTTCATTAATTTATCCCTGGAGTTTGGCCAGAAAGTAAATCTAAGTGCTCT ATAGGGAAGGACTAAGCTCCCCTAGAGTGAGGAGAGCACTCGGAAGAATGAAGTGTTGAATCATAAAGTGTTGATCAGAA AATCATGGTTGAAACTTGAGATTTCAATAAGTGCATAAATTGTCATATACGCATATGTATTGCATCATAAACTATTTTCC AATCAACAGCTATCATTGCACTTTATCCTCTAAAGTAATGTTCGGCAGCCAAATCTGTAATTGAAAAAAGTATCATTTTC ATTGAATTCTTATTAGTATTTTCCTTGCTAGAAATCATGTTAAGAGTTAATTGGAGTTAGTTGAAAATATAACTAGGTTC AGTTATGGTTGTGATAGGAAGGTTAGGTCCAACTATATGTAGTTGGTACTTGGTATCCCCTGTATACTGTAATTCAATTG GTTTAGAGACACTTAATAAACATTTAGATTGGCTACCTTTCTATTCTCCCTCTATTTTTCTTAAGACTCTCTTACACTTT CTTGGTTTAACCACTATCAGATTTAAATGCGTTTACAATCAATTTCATTGAAATGCACCATTTTGATTCCAATTTTTATG TTTTCATTTTTTAACCTTTTTGGCTTTTAATAATGAACAGAGATTCAGACGTAAGGAAGACTATTTTTGACTTGTTCTTG GGGCAAGCATTTGAAGGGCCGGTTGAGAAGAAGCTGAGAGAAACAGGAGAGTGGGTGGCTGCCAATAGCGAGGCCAGATT GCGTTCCGCTGGTAGTTATTTTCCTTAATATTTGTCCCTTTAGCTAGAATTGTACCCTTTTCAACACCCTTGCTGTCATA AATTATAGCGACACATTCTCTTATCTTATTCCTTTTTAACACCACATTATATTGTTGAAGAAAGTTTACGACTCCCAGAA ATTAGAGTAGATCTTACCTGAGACTAACGTGATTTAGTAGGACCCTCATAATAAAAAAATTGTTGAATAGAGTGTGTTAG AGTTTTGTTTGTAATGTTCCTTTTTCTGTTATTATATATTTCTTTTTGTTTAGGCTTTTGTCTGTGATTGAAAGTTATAT CATGTGCTGGGATATATATTGGTTATTTTATTGTTTTGATATGAAGAAATGGCATGTAAATTTTTTGTTGAATTAATTTT GTGTAATGGTAGAAGAATTTCTCATGTTACTGAATACTGGCTAAAACACACTGGACTGTAATAGGGTAAGACCGCCCATA ACCAAAGTGTCTTGTACAAGAGGGACTTAACAGTTAGAATAATAGAATGGAACTTAAATTCTTATAGTAACTCCCTATTG GACCAGAATAGAAGTTAATTGTAGCTGCCAATGTAGATATATATTGAGTAGTATAAGAAAGAAGAGGCAGATTTGGCTTT GTATAGTTTCGTTTGGGAGAGGAACTGAGCTTCTCTAATTACTCAGTACTTTTAGAATTTGCATTGTTCTCTGAAACCTA CAGTGTGTTTAATTAATATGTGTTGTTTATGTAATAATAAATGAATTCTTTCTCTTAGTTCTATTTACCAGTTAAGTCTG GCTACTTATGAATTATGATTATGAATTAGTATTGAAAATATTGAAGATGTTTTATGAAGTTCCAAGAAGTGTGTTGAAAA GAGCGAGTTATGGAATTTGTTACTGACAATTTCTTCTGCTGCGACTTTGACTTGTCTTTGTTGGGACTTTTGTCTTGGTG ACCGCCAATGGAAAGTGTTTTACATTTTTTATTGTTTGTTGTGAAATGATGACGTGTCATTTTTTGGTGAATTAGTTTAA GTATGTTTCTGGAAGGATTTCTCAACTTACTGTCCGAATCACTTAGGCTGCTTCTGAATTTATAGTTGAAGTTTTCAAGA TTTTGGTTGAAGTAGTTTGTTTAGGTGCTTGCTATGAATTTCAAAAAATTGAGCCTGCTCAAGGTTCTGTACAGCTTGAG GAATTGTGAGTTGCCTCTTGAGGAAGTTCAGGGACTAGCTGGAATTCTGGAGCTTTTACTGTTTACCTTTTTCTTTTGTG GATTATCAGGTTCAGGTCTGCCTCACTGCTTTTTGTAGTGTTATTTTTTCAAAAGGCCTTCAACTAACCATCACTTACAA TGAAGATACTTGACATTAATTTTCAGCAAAAAGATCCTGGTATGAGGTTTAGACTTTATACGATAACTTGGGTACAAATT GCTTGTTAACATTAAATTGTATGGTGAGACTTGTATGTTAACATTTGTGCACCCATAGTCTTCCATCAATCATAATATTG TTAGGTGTCTTTCCTTGCCACGATGGAATGAAGATATTCCAAATAACAATGTATTTTTATGATCCAATTCTTTTTTCTGC CTTGAAACATGAACTCCATTCAGAACATCCGGGGATTTTGTTGCTAAGGGACACTTACCAATGACAGTCTCAGTTAGTAG TGTTTTTTTTTTGGAATAGTTGGAAATGGTTGGACTGGTTTGTTGGGACCTAAGTTTCTATTTCCTATTCTTGAGCAATA AGAAATTTCTATCTCTGCTTCCAGGATCACATTAATTCTGGGTTTAGGTTTCTATTAGTGTAATTTTTCTACTGATACTA CCAGTTCTAATATCAGTAGTTATTTCCTTTATGGGTTTAGGATTCTATTCTTCTATCCTAACAACTAACCAACTAAAGTG GGTTACAATTAGTTTTTTCCTTTACTCTGTTTTCACCCAACATACACTTGTTTAATGAGAGTTTTAAGCATATGGCTATC AAATACCTTACAGGTTATTTAAATTAACCTATTCTTTCATTTACTATTGATCTTTGAAACCCAATGTGTCTAGCCCTCGT GTTATAATTTTCTATTTCTAGGTTTTTAACCATTTTAAAATAGTCTCAAATATGAAATAGTTGTTGATAATTCTTTTCTT TCTCTCTTATTTATTTATTAATTTAAATTGTTGCAGGAAAAGGGACTCTAATGTTCATGTTTGTGTGGATGCTACCAATT TGGGCTATATTACTCATATTAGCTACTGGAACCATCAAGTTACCATTCAGTAGCCCTTTTCTTGATGAGATCCTCTTGTG AGCATAGGCCAGCTACTTTTTGTAGATTCAGTGGTAGTAAATTACTTAAGGTTGTGTTTGGATGGGGTGATTTTTGGGGG GAATGTAATTCTAGAGGGTATTTTAAATCCCTTAAATTGAAATACCTTGTTTGGATATTTATTTGTGGAATTCTGAAAAT ACTGGTAATTAAAAGAGGTAATTTAATTAAGGGATTATGGAGTAATCAGAATACCCTCAAAATAGGAAGTAATTGGAAAA TCCACCCAATCTCGCTCTCGCTCTCGCTCCTGATCTCACTCTCGCTCTCTTGCTCTCGCTAGCGATCTCGTTCTCTGCAA TCTCGTTCTCTGCAAATCTCGTTCTCTGCAATCTCGCTCTCCCGATCTCACTCTCTCTGCAATCTCGCTCTCTCGTTCTT GCTCTCCCGATTCATGGAGTTTCTTCCCCCTTGATTCAGGTACAATCTCTTGATTCTTTCACCAATTTTGCATTATTGTT GTTGTTTTTTCGAATTTGATTTTGTTTTTGGAGTTGAAATACCTGTTTTGTTCTTGTCTTGAGTTTTGTTTGTTGATGCT AGTACTGGGTTTGTCATGTTTTTTGCTCCATTTTGTGCCTGGTTCAGAAGCAGATGAACATAGGTGTGAACATAGGTGTA CTGGGTTTGTCATGTTTTTTGCTCCATTTTGTGCCTGGTTCAGAAGCAGATGAACATAGGTGTACTGGGTTTGTCATGTT TTTTCTCCATTTTGTGCCTGGTTCAGAAGCAGATGAACATAGGTACCTTCTTCGCCATAAGCATTTGAGTATCTTCCATC GTAGGGGACTCAATCTTGATGGTTTCTTCAAGTACCTCTTCAGTGATGATAATCCACCTCTGTTACCTTCTATTGGGGTA AACTAAACCTTGTGATTTGTGTGTTCTTGTTCTGTGTAGTTTTGAACATGAGTGAGAGCTATGGATTTGGTTTTATATGG TTTCCTATTGTGGATTTTACTAAATTTATGACCCTTTTCATTTTGTGTTCTTCATAGTACTCATGATAGTTCTTAACAAC TAGTAATGTCAAATTTATGGTGAATTTGTAGCGAGTCTGTTTCATTTTGGTGCTAAGTGTGTAGTTTTAATCATTTAAGT GGGTGTTGGACAGAACCCATTGTCTATTGGAATTTGTAAATTTGTAGACTTGAAGCTATAAGGTAAAATATAACAAAGGG TTTTGCTTGGGCCATGTTTTAGATATTGGAATTTGGGGTGAACCTTGTCTTGTTTGTTTGGATTTGTATATTCTTGTCCT GTGTAGTTTAACATGAGAGAGAGCTCTGGATTTGGTTTTATATGCTTTCCAATCGTGGATGCTATTCTTATTAGAGTGGA TTGTGCCAGATTTAGTACCTTCTTTCCTTTTGTGTTCTTCATACTCATAATGTTTAAGAAATATGCTTAAATTTTCCCCT CCTCTTGTTTGCATATTGATATACTATATAGCACTTTCAGCTTCTCTTAGGTGTAGTTTCTGGTTTGGTTTGAAATTATG AACACAACTAAGCAATCAAACTCACAGAGTGTAGTCTTTCTCTTCTTTCCTTCAGCTAAGGTTGTGGTAGAACTTGCGAA ATCCAGACTAATCCTTGCTTTCCTCAATTTTCAGGCACAAAACATCACTTTTGGTGAGCATGTCAAGAGATTCTAAGGTT CTTGTTTTCCTGTCTTTTATGTTGTCATGTCCATTTACTTGTCTATCTACTTAATTTTGAATTTTCATTTACACTGTCAA TTCTTCCTTTCCTGTCCTAACATGCTTTGATTGTTTCAATAGGACTATAGGTACTAATCAATAAGTTGTTTGTGTGTGTT GTAAAATCTAAAAGAGGAATAAAGTTATCTGTGAAGTTCAGTTTATAAAAAATAGTTTTCCTAGCGGAAGCTAACAGAGA TCTAGAGTGTTTTTTCCTTACTAAATGAATATTTATGTCTTTCTAGTATTCAATCATTATTTTTATACTATTTGATTAAT CTGACGTATAATTTGTAGCTTCAAATTGATTGCCATGGCAAGTTCATACTTTTTAGATATTTCTTTCACTTCAATGCTCC AGTACTTTTTACTTTTTTAGAGAATGTTTTAACTTAACTCTTCACATTTTCTTAGTGAGCTTGTACACATCCCTTGTCCT TTTTAATCACATCTTATCCATTTTATGTTTAAACTAGCTGATTCTGAATCTGATTGAGTTAGCTTCTCTTACTTCCTATT TTCTTTATAGTGTCATGCAATATTGATGTTTTATTATATGTTTTTTTTATAGTTAACAAATGGATCTTAGAGTAGTTGAC ACTTCAGTTCTTTTACGAAAACGTAAAAGAAATGAAGAAGAAGAGGCAAAATTGCAAGAGCAAATAACATTCATTGTTGC TAGTGTCGTTGCTATGCTTTTAGGTGTAGTAGCTTGGTATCATGAGATGCATTTTGTTAAGGAACCGTCCCGAAATTGGG AATTGGAAAGACGCAATTTCCTTAATCGTCTATATAGAGGAACTGAAAGTGATTGCATTGAACAATTAAGAGTCAGTAAA AGGGCATTTTTTAAACTTTGTGGAATTTTACAAGATAAATGACAGTTGGTAAGAACAAGAAATGTCCCAACGATTGAAGC AGTGGCAATGTTTTTGCACATCCTTGCTCACAACCTAAAGTACAGAGTAGTGCACTTTACCTATTATAGATCCAAAGAAA CAATAAGTAGGCAATTCAACAATGTCCTACGAGCTATGATGAAAGTGAGTGGGGAATATTTGAAGTTTCAAGACCATAAT AATCTAGAGGGCTCTGAGGCATACAAATGGAGATGGTTTAAGGTAAACTTATCACAAGCTTGAGTAATTATGAGATTTCT AGTAATTACAACTTATTTATGATTTTTAAACTTTTTTAGAATTCGATTGGAGCACTTGATGGGACACATATTCCAGTAAC AGTGGCAGCAGAAGATAAACCTAGATACCGTAATAGAAAGGGTGACATCTCTACGAATGTGTTAGGGGTTTGTGGTCCAG ATTTAAAGTTTATTTACGTGTTACCTGGTTGGGAAGGCTCGGCAGGAGATTCACGAGTATTGCGAGATGCTTTACGTCGT CAAAATCACCTTCAAATTCCGAATGGTAATATTCTCAACCTTGATACTTTTTTTACTATATTAAATACAATTATATGATT TTTGTTTTCTTGGAAAAAAACCATCGCAGGTAAATACTTTCTGGTCGACGCAGGATATACAAATGGCCCAGGATTTTTAG CACCTTATCGAGGGACTAGATATCATCTCAATGAGTGGATTGGAAACACCCCTCAAAACTACAAGGAGTTGTTCAATCTC CGTCATGCAAGTGCAAGGAATGTAATTGAAAGATCATTTGGGATATTGAAAAAACGATGGAGTATATTAAGAACTCCATC TTTTTTGATATAAAAACACAAATAAGAATGATTAACGCTTGTTTCGTACTGCACAATTTTATAAGAGATGAGCAACAATA TGACCCAATTTTAGAGGTCCAGGACTTGGAGCTTTTATCGGTTGTTGATGAAGAGTTAACCAGTCAACATGGGGAAACAA TTACAAGTAATGTTGCAAATGAGGTCACAACTATTCAAGTATCTGAGGCATGGACAACGTTTCGGGACACTTTAGCAATG GATATGTTTGTTGAATATCAACATAGGAGAAACTTAGTTTAGGGACAACATGTTATCAGTTGTCTTTGCTTTCTACCTTG TTTGTTGTGTCTGTTATCTGTTTTTCCATTTCTTATGTGTTTCTTGTTTATTTTTGTAGTTGCTTTGTTCTGTTGTGTGT GTTGGCTCACTTGGAAGAGCCTTGTTTCCAAGCTTTTTATCCTATTAATATTAATTGAATGATTGATCAGAACTAACTGT GGCTTGATTCATCCAATTATTAGTTAAATGCTTAGTATGTTGTCTTGTATATGTATATTCTGTTTATTTTCAGAAACTCT TCATGTTTATTTATTTTCAAACAGGGTTACAGCTGGACCAGAGACTTGGACAGTGAGGAGCTATTGGAACAGTTGCTATA TTGACTTGTTGGTTGCCGGGTAATATTTTATAACTTGAGGATATTCATCATCTTTTTGTTATTTGATCTGTTTGCTGTGG ACACTTCAATTAGGTTCAAGTGCTCTATTTTTCTTCTGGTTATTAGTAATTGTCTAATGTTTGTTTATGTTTGAAGGAGA GATGAGGGGAAAAAGGAAAATGACGGAAGCTAGTAATGAGGATAAGAAAGATGATAGCAGAGCTTACTTTACTTGGAACT TGGAGATGGACCGTGCACTTGCTGATATACTTAGAGATCAAAGAAGCATGGGAAACAAGAGTGATGGTGCATGGAAAGGA GTGGCATATAACACTGCAGCTCAAATATTGTCTTCACGCTTCAATTTGCAACTTATTGGAGAGAATGTTAAAAACCGCAT CAAGCTGTGGAGATCATGGTATGGCATTGTTAGTGACATCCTTAGTCAAAGTGGTTTTGATTGGGATGGAACCAAATATA TGATTTCAGTTTCAAATGAAGATGCATGGAATGAGTATGTCAAGGTAATGATTTTTAATGTTATTACTATTTAATTAAAT TATTGTTTGTGTTAGTATTAATATGCTGTCTATTTTCTTTGTAGTCACATAATGACGCTAAGAGGTTCCGATTTAAGGTG ATTGCTAATTGGGATGACATTGTAGACTTGTGTGCTAAAGATAGAGCAACGGGAATTGGAGCAGAGACATCCTTGGATGC AGATGACATCATGAGCAAAGAAGCAAATGAGGATGGAGCTTATATTGTGGATATTGATGCTGATGAACAAAGCTCTACAA CAAGGAAAAGCAAACAACCAATGGAATTCAAAAAGGGAAAAAGTGGAGAAAAGAATGGGATAATTACTTCAATGAATAAA GTGGCTGAGTCATTGAGTGAATTTGTACAAGCAACTAGAAAAGGGGTGAAAAATGTCCAAGAAGTGGTTCATGATGTGAT GGATGAGCTAAAGAACATTCCGGACCTTAATGGCACTCAATGGCTAAAAGCAGTGGATTGGCTTTCAGAAAATCCAAATA AGTTGGAGATTTTGAAAGCTCTTCCCATTGAGAGAAAGAAAGATTACATCTTAGCTTTTATGCACTGATTCGTGATTTGC TATAGTTTATGGACCCATTTGTAGTGTTTCCAACTTTCCACTATGCCACTGTTGAGACTTTCTTTTATTTAATTTTCATT TGGATTGATGTTAGCACTTGTTACTGTTGAGACTTTTTTTTATTTAATTTTCATTTGGATTGATGTGAGCACTTGTTACT GTTGAGACTTTCTTTTATTTAATTTTCATTTGGATTGATGTTAGCACTTGTTAAAAACACAGTTTTAAATTTAAAGTAAT AGGAAATGTGATATCTCCGTGAATGTATTAGAAATTTGTGATCCAACTAATTTCAGATTTTTTAGTCAATTCAGGGGGTT TGGGCCGATTATAAAATTCTGGGTTAATTTTAAGTTAAGTTTTTTTATTATAATTATCCAAATAATATTAATTAGATTAA AAAAGTAAGATAAAGGAAATTCAATTGATTCAATTGAATTCCCTAGCATTACCCAAACAAAGAATTTTAAAATTGATGGA ATTTAATCACCTTATCCAAACAAGGGAATTTGAAAATCAAGGGAATTCAATTGAATCAATTAAATTCCCTAGAATTTAAA ATCCCTTGGATTTCTAC
CDS sequence (LotjaGi5g1v0287000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGAGCAAAGAAGCAAATGAGGATGGAGCTTATATTGTGGATATTGATGCTGATGAACAAAGCTCTACAACAAGGAAAAG CAAACAACCAATGGAATTCAAAAAGGGAAAAAGTGGAGAAAAGAATGGGATAATTACTTCAATGAATAAAGTGGCTGAGT CATTGAGTGAATTTGTACAAGCAACTAGAAAAGGGGTGAAAAATGTCCAAGAAGTGGTTCATGATGTGATGGATGAGCTA AAGAACATTCCGGACCTTAATGGCACTCAATGGCTAAAAGCAGTGGATTGGCTTTCAGAAAATCCAAATAAGTTGGAGAT TTTGAAAGCTCTTCCCATTGAGAGAAAGAAAGATTACATCTTAGCTTTTATGCACTGA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0287000.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MSKEANEDGAYIVDIDADEQSSTTRKSKQPMEFKKGKSGEKNGIITSMNKVAESLSEFVQATRKGVKNVQEVVHDVMDEL KNIPDLNGTQWLKAVDWLSENPNKLEILKALPIERKKDYILAFMH
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 120 | 120 | 5.4E-15 | – | |
| PANTHER | 1 | 120 | 120 | 5.4E-15 | – | |
| MobiDBLite | 1 | 41 | 41 | - | – | |
| MobiDBLite | 19 | 39 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi5g1v0287000.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…