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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi5g1v0299800 |
| Transcript ID | LotjaGi5g1v0299800.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Tripeptidyl-peptidase 2; TAIR: AT4G20850.1 tripeptidyl peptidase ii; Swiss-Prot: sp|F4JVN6|TPPII_ARATH Tripeptidyl-peptidase 2; TrEMBL-Plants: tr|I1LDQ6|I1LDQ6_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi5g1v0299800 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr5:61669166..61679248) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TATCCTAACCGCTCCTCCACCGCCACCGCCGCCGCCACCACCACCATAACACCACCACACCACACATTACGTTATGCATA ATCAACACACGCTCTTACTCAGATTCCCCACATTGCCCTCTCCCTCTGTCATCGTCCTTCATCTCACAGAGGCAAAGCTC AGCTTCAACACGAGAAGAATACACACTGCGAGAACCTTCTTCAGAAGAAGCAACTGGGTTCTCCCCAAGGCAATGTCTAC TAGCTCTTCCTTCAGCTCTCGCTTTGGTGGCGGCGATGATGACACCACCACCACCACCACCAACAACAACAACAACAACA ATAACGGTGCTTCTTTCCGCAACTTCAAGCTGAACGAGTCAACATTCTTGGCTTCGCTCATGCCCAAGACAGAGATTGGC GTTGACCGGTTTCTCCATTCTCACCCACACTATGATGGACGCGGTGCTCTCATCGCTATCTTCGGTACCCATTTCGTAAA GCTCTTCATTTTTTGTTGTTGATGTTGATATTGAACATGGGTAGGTGTTGGTTTCCAATTTGAGTACTGGGAGTGGATGA TTAGGTGATTCTGCAGCTTTAGCTGATAGTTTTATGGGAATCAGTAATTTGAAATTGAAGGAGGGTTGGGTGGGGCAGGA ATCAGTTGGTTTAAAAATTTAAATATCTAATTGTACCCTTTGGTTTTGATCATTGATTCAATATGTGTACTTGGTTGGAG TCTGAATCCAAGTGGGCAAGTGGTAATCTTTCACTTGGTTTGGGTGGTTTATGTTTCATGATATCAGTGGTGCTGGATTC CTTCCTGAATATGGTTGCGGTGAAGCTAGATTAAAATATAAGCATTAACACGCAACAGAACTCGTACAGGCGAGCTTGGA ATTATTGGATGTCATAGTATTATGGAGCTGAAATGCTAGTCGAATTTGAATACTCTCAACCAATAAAGAGTTCAGTTGCA TTGTTTGAAACATTGTTTCTCGATAAGTTTTTATGTTAATTCAGTTAATTGTGTAGTCTTTTGTCAAGTAAAATTATTGA ACTTATAAGTTATCAGGAGTGTAAAAGCACTAAGTAACATTAAGTTCTGAGATTTGAAATAGCAAGTCTAGTGGTTTGGG TTTGTCTCACAGTTATTCAAGTGGGAAGGGAATATCTAGTCAAAGACAAAACTAAAAGATCAGTTTTCTTTTGAAAAGGG ATTTTTTTTTCCTGTTGTTTTGAAATATGTTGTGAGGTAAAATTTGTTAGAGTGCCAAGTAGTTGTTAGAAAGTAACACA GTATCTCTGTTTCAAGCACATTGTTTGCTATTGATGCAAACACATGGAATCAGTACAGTAATTACAATGAACTTGGAAAA ATATAACCTGCTGACCAGATAATTGGTTGGAAATCAATTGGTTAGAGTAATGTTATTTAATGCTTTAGAAAGTTTATTTG GTTGGAGTCTGAAATTTAAATATCTAATTGGACCCTTTGCTTTTGATCATTGATTAAATATGTGTACTTGGTTGGAGTCT GAATCCAAGTGAGCAAGTGGTAATCTTTCACTTGGTTTGGGTGGTTTATGTTTCATGATATCAGTGGTGCTGGATTCCTT CCTGAATATGGTTGCGGTGAAGCTAGATTAAAATATAAGCATTAACATGTAACAGAACTCGTACATGCAAGCTTGGAATT ATTGGATGTCATAGTATTATGGAGCTGAAATGCTAGTCGAATTTGAATACTCTCAAACAACACGCTTGCCCTTTCTGAGC ATTATTAGTGATTAGCATTTTGTGTTGTGTCAATATTTCGATGTCTGGGATTTGGTACATCTTGACATATGCAATCATTA CTAAGTTCGCACTCTTGTTTTCTTAGTCTTAGCACTGTCTATTCTCTTGTTTTTAAGAGGGGGGTGGGGTTAAAATCGAC CCTGCTCCCATTTTATCAATTGTAAATTTTGCATAGATGCAATTTCCACCACTTGTTATGTTGGTCTTGGTTCCCATCTA CTTTTCCCTTTCCACAAGTTTCATAGACTAATATCTATTGTGCAGTTGTGCTTGTATTCTGATTTCTGATATGTTTAGTG TTATGCTGTAATTGGTAGTGCCCTGCTGGTTAATATTACAAATTAATCATTACTTCATAAGATATGTGTTGTTTCAGATT CTGGTGTAGACCCGGCTGCTACGGGATTACAGGTTACCTCAGATGGGAAGCCGAAAATTCTTGATATTCTTGATTGGTAG AAGCAACTTGGCACTGTGAATTTTAACTGTTATATGTATCCTGGTTTGCCAATCAATGAGATGCCTTTTTTTAATCTTCA GCACTGGGAGCGGTGATATTGATACCTCAAAGGTGGTGAACGCAGATGCTGATGGTTGTATTTCTGGGGCATCAGGTTAG TGCAAGGGAATAAATTATGGTTAGAAGAAATTGATCAGTATATTGTTGTATTTGCAACTTGCAAGTAACTTCACTAATAA ATAATAGAACAACAAAACTTCATGTCTCTAGTCTCTACATGCACAGCTTGTGATGACTGCAAGCTGCTTATTATCCATCT TTGATGAATCAGTGGTGTCACAATTGCTCGCTTTTCACACCTCATTTTTTAATGCAAAAAGGATAGCTATAATAAACTTA AGCAGTTATCCTGATTAGGGAAATCTGAAGTCAAATTAATACCCGAATTATATGTGCAGTAAATACTTGATTTCAATTAG CTCAATGTAGTAGCAAAAATGAAGCATTTTTTTCCTTTTCCTTCTGCCCGCTGGGTGCTCCCTTAGGATTAAAATACATG TAAACATTGTTACATATTTTCCCTTCCTTCTTCCAAGTCAAAGAATGTGCACCACACGTTAAGCTTGTCTGTGCTTAAAC 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TCACATTAAAATAAGGCGTCTATACTTTATTGTGGTTATTTCCCTACGTCCTGGTCCCACTCAGTATTTATTTAATTGGG TTTTCTTACTCAGATGGCAGTGATGTTTTATGTTTTAGAGCTATGATGATAAGGGGCCTGCCATAGATGCTGTCGTCTGG TATGATGGAGAAGTTTGGAGGGTTGCTCTTGACACACAGAGTCTTCAGGATGATCCAGATTGTGGGAAGCTTGCTAACTT TGTACCCTTAACTAACTATAGGTAATCTTGGTTGTTGGTGTTAGCCTAAATTTTACTGTGAAATTAGCAGATACTCATTT TTGGACAGTGGATTTCCTACTTCAGCAGGGGGCTGAAAATTTCACACTAAGTAAAATTAATAATGACTAAGTGAACAAGA CAATATAAATAATTTTAGGGTGGGGGGATACTACATTTAAATACTACTTTATTGAGAATTTTTTTCTCGAGGGGGGGGGG GGGGGCAACCCCTTCTTAATATGCCTGGGCCCGCCCCTGTACTTTAGATTCCCCATGTCCTATAGACATAAAACATCAAT CAACCTTCTCTTTTTTTGCCATGGGCTTATAATCCTCAAATAGGTACTTTGAGTTGTTACTTAGTTAGAGGGTTAAGGGT TAGTATTGTCAGATTTTCACAACATCTTTTTAGTAGTTTCTCTTAATGTTTATGAGGTCTTCCTCTACCCCATTTAATTG GATTATCTTCTCATTGATCCACTTTTTTGAGCTATCTTGCTGAAGCCTCTATTGATCTCCTTCTCACATGACCAAACCAC CTAGTTAAGTTCCCATTATCTTCTTCTATTCAATAGGTGCTATTCCAAAGCACCTCAACATTCTTTTCTCGTCATCATGA ATAATGCTGGGAAAAATACAAATAATGAAAATTATTATCTTCGAGCAAGTAACAACCTGATAATCATGCAATAAAGCTCA 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GCTTGAATACACTTGGTATATTTGCTTCTCTCTGGAAACCTTAAAATTGGATGTCATTGTATACTTTTTGTATTTTCACT TCGTTGCTCTGGGTTTGCATATCATTGCATGATTTATGGAAAATTATTTGCAGGTCTAGCCGAGGACCAACAGCTGATGG AGATCTTGGTGTCTGTGTGAGTGCTCCTGGTGGTGCTATTGCTTCTGTCCCTACTTGGACTCTTCAACGGCGCATGCTCA TGAATGGGACATCAATGGCATCTCCGTCAGCTTGTGGTGGAATTGCATTGCTCATAAGTGCAATGAAGGTTCTCGCATGT TGTTCTTATTTATATTGTATTCGTATGATGTAGTGGGTTGTACTTTGCGGTTTGCAGACATATGCATAATTTTCTGATGT GTATGATCTGCTTGTAGGCTGAAGGAATTCCTGTGAGTCCATATATTGTGAGGAAGGCCCTTGAGAATACATCTGTTCCC ATAGGCAATTCACCTGAGGATAAATTATCTACTGGGCAAGGGCTGATGCAAGTTGACAAGTTCGATTTTTTTCCCAGTCT TTTATCTTCAGGAAAAAAAAATAGTAAATGGTAATTTTGTAAGATTTGGTATTGATCTGAATCAAATACTCAATTGACAG GTGTTATGAATATATACAGCAGTCTCAAAATATTCCATATGTTTGGTATCAAATAAACGTCAAGCAATCTGGAAAATCAA GTGAGTTTACATTCTTTTCTTTCCTGGAAAATGCCTTCCCATTTTGAGAAACAATAGATAGGAAATCTTTCGGCTTCCCT TTATGTGTTTTTTCATGTTTATACAATTATAAAGCATGTTATATACTACAGATAATTAAAATATTTGAGGATTTTTCAAT TTGTTATATATATATATATATATTTCAAATTAGAATTTTTGATGCACTTAATTTGAAATGAACTTTGTCTTGCCTAAATT GTCTTGTAACCCATGATTAGAGTGAAAATGAATTGGCTTCTAAAACAAAATTGTGAACCCTTTTTTTTGTTAGGTGAAAG TGTTTTTGACTTATAGGTAGTTTAGAAAGTTCCATTTTGGCACATGGATGAAAACCTCATAAAATTTTTGTATGCTAAAA GGAATATAATAACACCATTCTCCTCTTGAGATTAATATAATAACACCATTTATTAGCAAAAAAATAATTTAATTATTGGT AAAAACTATCTTGTAATGACTACAATCCAAATCCTGCACTGCACCTATAGTAAAGAGGTCTCTTAAATAATGTGATTAAT CTGACGAGTTTCAGACTTTGTGCTTAATTAAAGTGAGAAAAATAAAAAAATGACATAAAATGAAGGTTTATATGAAACTT GGAGGAAAATAATTTGTATTGATCTTAGTAAAATATTATAATAACGTAGGAGCATGTATTGAAAATTGACAAAATTATGT CCCTCTATGATTGTTGATGGCAGATCCTTCATCACGGGGCATCTACTTGAGAGAGGCTGCTGCTTGCCAACAAGCTACTG AGGTGAGAGCATTCTTTTGGTGTGCCTTGATGATCCGAGCATATTTTTGCCTCAGATCCTTGAAATCTTTAATTTGTAAA ATGGATTAAAGATTGGATTGTGGGAAAACAAATAACTGATGACCCATAGTTGTATCACTCTCATGCTTGGATAGAATGAT AAGAAGTTGTTGATATGAGTAACAAGATTAATTTACCTTGCTTTTTAGGGTGATGAATTGACAATAAAATAAAAGTAGTA TTTGCTGAAATTTTGCTTGTTAGAAAAGTTTTCAAGGAGATATATAACTCTTACAATTGCTCTTAGGCTGCCGTGTTTAG GAACCCAAAATTCAGAATTGAAAGAATCTATTATTATTGAATAAAAAAATAGGAGAGTAATCTCCTCCAAGGGTTTCCCC TTACAACTGAGTCAATGCTCTGTTTTCCCAAATCTAAATGTCTCCCCCTCCAATCTCACATTGCCCTAATTATATATCTA TCTAATCCCCTCCTAGTAACTACTAACTAAAACAGCCATAAGTCAGACTAACTACCAAGTCCAATCAGGCCCATTAACAT TGAACTGTCAGATTATATCCGAACACAATTGGTCCTGACTGCTGATAGATGCTTTTAGTTTTCCACGTTGTGTATATATA TTATCAAATCTATCCATATACTAATCTTCTTATCAGTTAAAAGTAAATTTTAGTGTTACCAGTATCACTCTGTGCTCTCA ATTGGTAAAATTTCTTTATAATTTGTGGTCCTTATTGACAGTGGATGGTGCAAGTTGATCCAATATTTCACGAAGATGCC GACAAGTTTGAAGAATTAGTTGTGTTTGAGGAGTGCATTGAGTTACACTCATCAGATAGGACAGTAATTAAAGCCCCCGA GTATCTACTGCTCACTCACAATGGTCGTACCTTCAAGTTAGTCAGCTTTCCTTCATCATTATCCTTTCATTCTTTGTGTA AGATGTAATGCCTAATTTTTTTATAATTATGGAATTTTAGAAAATCATTAGGCCTTACCATATGGTGTAATTTTTTAATA GGACCATAACAACATATTTATTGAAATTTTATGATAATGAATAAAAGAACATTCGTGTATAGTTTAGCCGCATTATTTTT TAGGTTTTGAAAGTTGACTTTACATCCATGATTACATGGAAATATTAGTTGTATGGAGAAATACTCTTGATGAATTAAGT AAAATCTGATGACCTTATTAATATAACCTTAATAAATTAAGATAAATTGACATAAATAAATCACGTATGTTCTGACAGGT TTTGGAGAGCTAGGAATGTGTGTGTGTGTGAAGTGAAGTGCTCTTTATTTTATGGTTTAGATTACACGTATAATCAGATT 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CDS sequence (LotjaGi5g1v0299800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGCATAATCAACACACGCTCTTACTCAGATTCCCCACATTGCCCTCTCCCTCTGTCATCGTCCTTCATCTCACAGAGGC AAAGCTCAGCTTCAACACGAGAAGAATACACACTGCGAGAACCTTCTTCAGAAGAAGCAACTGGGTTCTCCCCAAGGCAA TGTCTACTAGCTCTTCCTTCAGCTCTCGCTTTGGTGGCGGCGATGATGACACCACCACCACCACCACCAACAACAACAAC AACAACAATAACGGTGCTTCTTTCCGCAACTTCAAGCTGAACGAGTCAACATTCTTGGCTTCGCTCATGCCCAAGACAGA GATTGGCGTTGACCGGTTTCTCCATTCTCACCCACACTATGATGGACGCGGTGCTCTCATCGCTATCTTCGATTCTGGTG TAGACCCGGCTGCTACGGGATTACAGGTTACCTCAGATGGGAAGCCGAAAATTCTTGATATTCTTGATTGCACTGGGAGC GGTGATATTGATACCTCAAAGGTGGTGAACGCAGATGCTGATGGTTGTATTTCTGGGGCATCAGGGGCATCTTTGGTTAT CAATACTTCATGGAAAAATCCTTCTTGTGAATGGCATGTGGGTTATAAATTGGTTTATGAGCTCTTCACTGAAAAATTAA CTTCTCGTATGAAGAAAGAAAGAAGGAAAAAGTGGGACAAGAAAAACCAGGAGGAAATTGCTAAGGCTGTAAAACAACTT AATGATTTTGATCAGCAACACATGAAGGTGGAGAATGTTAAACTCAAAAAGGCTCGCGGAGATCTACAGAGTAGGCTTGA TCTTCTTAAAAAGCAATTTGAGGACAGAGAGGAAGTATGGTGTCTTCAGCAAACTAGATGCTTGTACATTTGTTGTGAAT GTCTATAA
Protein sequence (LotjaGi5g1v0299800.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MHNQHTLLLRFPTLPSPSVIVLHLTEAKLSFNTRRIHTARTFFRRSNWVLPKAMSTSSSFSSRFGGGDDDTTTTTTNNNN NNNNGASFRNFKLNESTFLASLMPKTEIGVDRFLHSHPHYDGRGALIAIFDSGVDPAATGLQVTSDGKPKILDILDCTGS GDIDTSKVVNADADGCISGASGASLVINTSWKNPSCEWHVGYKLVYELFTEKLTSRMKKERRKKWDKKNQEEIAKAVKQL NDFDQQHMKVENVKLKKARGDLQSRLDLLKKQFEDREEVWCLQQTRCLYICCECL
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 56 | 88 | 33 | - | – | |
| PANTHER | 80 | 276 | 197 | 2.7E-112 | – | |
| PANTHER | 80 | 276 | 197 | 2.7E-112 | – | |
| Gene3D | 105 | 199 | 95 | 1.7E-9 | ||
| SUPERFAMILY | 108 | 163 | 56 | 2.5E-5 | ||
| Pfam | 122 | 213 | 92 | 1.4E-7 | ||
| Coils | 252 | 272 | 21 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Serine-type endopeptidase activity | Catalysis of the hydrolysis of internal, alpha-peptide bonds in a polypeptide chain by a catalytic mechanism that involves a catalytic triad consisting of a serine nucleophile that is activated by a proton relay involving an acidic residue (e.g. aspartate or glutamate) and a basic residue (usually histidine). | ||
| Biological process | Proteolysis | The hydrolysis of proteins into smaller polypeptides and/or amino acids by cleavage of their peptide bonds. |
Expression pattern of LotjaGi5g1v0299800.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…