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LotjaGi6g1v0033200.3

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0033200
Transcript ID LotjaGi6g1v0033200.3
Related isoforms 3
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Protein misato like 1; TAIR: AT4G37190.2 plasma membrane, autoregulation-binding site, misato segment II, myosin-like, tubulin/FtsZ protein; Swiss-Prot: sp|Q2YDW2|MSTO1_MOUSE Protein misato homolog 1; TrEMBL-Plants: tr|K7LN96|K7LN96_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0033200
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:6227758..6244457) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTACCCCACCGGCCAACCTCTTTCATCATCTTCTTCAGCCGCACACAC TGTTGAACCCAGTTTCCCTCCTTCCTTCTTCAGTTCGCCGGCCGCCGCCGTCACGCCGCCACCCGCCACCCGCCACCCGC CCCTGGGCCCTGGTTCGATCTCAAGTCTCATTCTCAGACTCTCAGTCTCTCACCATTAAGAACTCAGCCCCCGGCGCGGC GACTCAGCCCACACGCACCACCCCTGACCTGACCAGTCTCTGTTTCGTGCACCCACTGCACAGCTCTGCCTTGATTTTGC AGGTAAAAGATTTGATTCCATATTTTGGATAGTTGTTGGTTCTGCAATTTTGAATCAATGGAGACTGGAGAGTTGTTGTT GCTGACTCGCTGCTGCAATTTTGAATCAATTATCAATGGAACTATGGATTATGGAATGCAAGTTACAGACTTACAGACAT TTATGAGTTAATAGAGTTATGGAACCTTGCTGCAATGGGGCAATGTTTGTTCGTTGCTTTCTGTTTTGGCTTCTAAGTTG AATTCGTTTTTGTCTTTTGGCCAATGTTAGTGGTTCCGCCACTGCTTGTATTGTTCTATCGGTAATGCTTATTCATTGTA GTTTCTATGTTGAAAAACTGGTTGAGTCTTTGTGTTGTCCATACCCAATTATTTATATGGTTTCAGCTGCTGTTTCACCT TGATTGGCTTATGAATGACTCATGATAGTGAATTATAACAACATATTTAATACCAAATAGAAAAGCCTTCAAATGCTTAA TTTTTGGTAATTTTGATGGTTAGGTTGATTTATCAAAGATGTCTTCCCAATCTATCCTTTAGTTTTATCACCAACAATAT ATACTAACTTACCGTACCTAGGATTTTTTTTTTTTTTAAATTTCATATTTGTACCCGGTACCGTACCCATATCTGTGCAT CCTAGTTCCTAGATGCTATGTTTCTGAATTAACTCATCTTCTTTATTTCTCTGAAGCAATTGATGCGATTCTGCAGCTGA TACGAAGTCAATATGAAAGAAATAGTAACTCTACAAATTGGTGATTTTGCCAACTTCATTGGCTCTCACTTCTGGAACTT TCAGGTTTCAATATTTTTATTCTCAAAGTTTGTCTTTCTGATTATCTTTAACTGAAATAACTCTTTAACTGAAATAAATT TGGAGTGTTTCTTTAATATTGCATCTGTGTTCGATTGTTAGGATGAGTTGCTTGGATTAGCTGGGGACACTCATGGTGAT TCAGTTTTCAACAGTCAGGATCTTAACATGGACGTGCTTTATCGTACTGGTGAGACACAGGTGCTGCAATGGGGATAGAT GATCTGAATCTGTAGATTAGAAGCATTTGCTGTTCTACTTACATTTCCCTCAAATGTGTGCAGGGCATCCATACTTATAC TCCTCGCCTAGTTTCCATAAACTTGAGAGGTATTCAATTTCACTTTATGTATTTTTAAATTATTGAAGAATGAAGAAACA TATCAGCGCTGTTCTTGCTTTGTTCATTGGGTCTATTTGTGGTTGTGAAGAATTCATGGTTAGTCTTACATTCAACTGAA TTCTGAAAGGGAATACTGACTTTAAAAAAATGTAGTAACGTGGCCTATGTAATTGAAAGGTTCGTTGGTAATTGTTTAGA TATTGTGACTCCATTCAACTTGTTTTTTCTTTTGAGGATATAGAAATCAGATGAGCATGTTATATTGATAAGGAAAATTG TAAACAATATGAGACAAGAGGACTCACACTTGACATGGTTATATCTTACTTTGTACATGGAATCTGAGGAAGAGCAAGAT ATTCATCATAAAACTTGTGAAGCCTGATACAGTGCCAAAAGCAGAAGGAAACTTATTTTGTTGTTGTGAACAATTATGAT 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GATTGATGCCTTGGTGTTGGAACTAGGAGGTTTGGACATGGTATTGGGGGTGTCCTGGCTGAGCACACTTGGAAAAGTGG TAATGGACTGGAAACTACTCACTATGCAATTTGTCCATGGAAATCAGGTAGTCAAGTTGCAAGGGCTAGGAGGAAAAGGG AGTAATCACAGTTTTCTACACTCATTCCTCATGGACAAGCAGTACAGAGGTGGTATGGAGTGGTGGTGGTCTCATCTGAA TTCCGCAGAAGTGACCAATACTGAGGTAGAAACACCAAGAGAGCTTATGGAGACACTGGAAGAGTTTCAAGAGGTATTTA GGAGCAAGATTCAACTGCCACCAGAGAGGTCTAAGGTGCATCAGATAAAGCTTTTCCCTGAGCAGGAGACCATCAATGTG AGGCCTTATAGGTATCCTCACCATCAAAAAGAAGAGATTGAGAGGCAAGTGGCAGAGTTAATGGAGGCAGGAATCATCAG ACCTAGCATGAGTGCTTATTCAAGTCCTGTGATCTTGGTAAAGAAGAAAGACAAGAGCTGGAGGATGTGTGTTGACTACA GAGCTTTAAATAAGGCCACCATTCCAGATAAGTATCCAATTCCGATAGTTGATGAGCTGCTGGATGAATTAAATGGAGCT TCAATTTTCTCTAAAATAGACCTGAAATCTGGCTATCATCAAATCAGGGTGCATGAGGATGACATAGAAAAAACTGCATT TAGAACCCATAATGGACATTATGAATACTTAGTGATGCCATTTGGGCTGATGAATGCTCCAGCTACATTTCAAGCAGTAA TGAATGATATTTTCAGACCTTACTTACGGAAATTCGTGTTGGTCTTTTTTGATGATATACTAATCTATAGTAAAGACTTA CCTGAACACCTCACTCATTTGAAGTTGGTACTATCTGTCTTGTTAGCTAATTGTTTTGTGGCTAATCAGACCAAATGCAA 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TTAGGTAGGAATGCAAAAGAGGGTCAGAGACTATGTCAGAGCTTGTGATGTTTGTCAAAGACACAAATACAGCGCCTTAA GCCCTGGAGGCTTGTTACAACCTCTTCCAATCCCTAATGCTGTGTGGGAAGACTTGTCTCTTGACTTCATTACAGGTCTA CCCAAATCCAAGGGCTTTGAAGCAGTACTGGTGGTTGTGGACAGGCTGTCAAAATACAGTCATTTTATTCTGCTCAAGCA TCCCTATACAGCCAAGTCTATTGCAGAAGTGTTTGTAAGAGAGGTGGTGCGCCTCCATGGGATTCCTAATTCAGTCATAA GTGATAGGGATCCTATTTTTGTTAGCCATTTCTGGTCTGAACTCTTTAAGCTGCAGGGGACCAAACTGAAAATGAGCTCG GCTTACCATCCGGAACTGATGGACAAACAGAGGTCATAAACAGGTGTTTGGAAAGCTACCTGAGGTGTTTTGCTTCTGAT CATCCCAAGTCTTGGTCACATTGGATTTCCTGGGCAGAATTTTGGTACAATACTACTTTTCATAGCTCAATTGGACAGAC ACCCTTTGAGGTAGTCTATGGAAGACAAGCACCCCCTATTGTCAAGTTCTTATCCAATGAGACTAAGGTAGCCGCTGTGG CCCTAGAGCTAAATGAAAGAGATGAAGCCCTGCGACAGCTAAGGGGTCATTTACAGAAGGCTCAAGAACAAATGGCTATT TATGCAAATAAGAAGCGGAGGGATTTGTCCTTTGCAGTAGGAGAGTGGGTATTTCTCAAACTGAGACCCCACAGGCAGCA TTCTGTGGTGAAGAGGATCAATCAGAAGCTTGCTGCCAGGTTTTATGGACCTTTTCAGATAGAGGCCAAGGTAGGAGCAG TTGCTTATAGGCTGAAGTTGCCTGCAGAGTCCAAAATCCACCCAGTTTTTCACATTTCTCTGTTAAAGAAGGCTGTGGGA 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TCATAAATCATAATAGTGAATTTTCAGAGTCTTTGAGTAATGGCATTTTTGATTGCCTCTTCATTCATCCCATGAGGAGC CTTAACCACAACGTCTTGCAGCATCATCTCTTTGACATTCGACATGGTGGCATGGAGAATTTTCAAACGGAGATCTCTAA TAGCATCCATCAACCTTGCAATTGGGTAGTTCACGTTCAGGCTCTGAACACTAATAATTGCCTCTGTCCCCAAAATCTTC ACATCAACAGCCACGGTTTTGACATCCTCAGAAGTTTCTTGTTTAGAACTCTCAGCACGGTTCTCTAATCCTCTTTCTAA ACAATTAATCTTGGCCTTGAGTTCATTGATGTAGGAAACTGCGTCAGAAAGCAAGGACGCTTTGTCCATCTTGGACACGG TTGGAACAGCAGATCGAAGAGCATAGAATTTCTGATTCAGTTTCTCCCGTCTCTGCCTTTCAGCCTCAACATGATTCACC GAAAACTGACCGCCTCGCCGAAACATCGTTGAAGCATTTTTTTCCAAAGTTGCCTCAACCTCAACCTCAGCCTTAGCATC TGATGAGTCTGAGGAAGACCCATTATTTGCCTTGTGTTTGCCCTTATCAAACTCGATCACGTTCGGCTGCAAATGGTCAA ATACTGATTTCACCATTTGCAGCAGGTTGTGGTCGAGTTTAAACGTGTCTGTTGAGCCAAGCTCAACCACACCGTTTGCT ATGGAAACGCAAACTGAAGTTTGAATTCCGTGCTCGCGAGCTTCTCTAACTCGACCACACTTTTCTAATTGAGACTCATT CATCGCCCCACTCAACCAGACATCCACCCCGGAGCTGAAAGCGCAACCAATAACACCATCCCCCGAGCTAAATGACCGAG TCTGTGACACCGTGTAGAACCATTCAATGCTCTCACGTTCTTCTCTGGCTTTTGCTTTCGTGCCATGGAAGTAGCCACCG CCCCATTGTAATGTCACATTGGAATTGCTGTTGTCTCTGGTGGTGGCTTGCCAGAATATTGCGTACACCCACCACTCAGG ACGGTTCTGAAGGATGATTTGGAGACGCTGCTGAAGCACGTTTGAGGCTTCTTGCCTCGTTGAAACAAAGGATGAAACAC CCATCAATTCTTTGCTCTGCCCTTCCATTTTTCTTTTGCTAATTTACTTTGTTCGTGCAATGTGATGTAGCTTTCTGTTT TGGTAAAAGAAATGGTCTTCTTTAACTGACTCAAAATTGGAGTACAAGTGTACTATAAGATTTCAAATATATATGATAAA ATGGACAAGGAAAATCCACCACAGACTACAGAGAAATGCAGACATAATCTGGTCACATTCAAGGAACACATAAGTTTCAT CATCAGTCATCACTTCATGCAAGCGCCACAAACTGTTTATGTTATTAAAAAAAGGCATACTTATAGGTTTAATTGAAGCC ACCACGCGTCAATGGGAGTTTAAAAACCTCCACCACAATATATACCTGATTTTTTCTCAAAACATACATAAATTACATAC ATAAATTGTGGCACTTAAAAACCACCACAAAACTTGGATCGAAAATATGTTGCTAACTCGAATGCTATGATTACATAACA TTTTCCTTTATAAAATAAGAGTCGCTATTTGTGAGCACCAACAACACTTGCAGTTGAAAGCGTTTGTGATGAGTGTTGTT AAACTCGCGAGTAAACTCTTAAACTCGTACGAGTCTACGTTTTTAGGTGCCAAAAAACGAGTTAATTCACAGGTAAACTC GAAATTTTCTTGACTCAAGCAAACTCGTGTCAAACTCGATAGGCTCGTGAAAACTCGCGAGTTTACTCCGAGTTAACGAG TCAAGGAGGAAATTGAATTTTACACTAAATCCCCAAATTAAAAGGTAATTTAGGGTTTAGATCGAGTTTCTTCTCTCATT TTCTCAGAGTTCTGACCTCAACCATCCTTCTCCTTGCTTAGAACATGAGCAACACTGAGCCAAACTTACTATCAATTTTG CTCTGTTATGTTTGTTTTTGTTTTCAATTCTTTTTTCAATTCATTGTTCATTCATTTGATTCTTTTTCATTTCAAAAAGA ATATTGAACTATGCTTCAGTATGGAGTTGAGTGTTAAATTTATTTTGTTAATGTCCCCTTGATGGTTGTAATATGTGTTC TAAATACACCATGGCAAATTTTTTATTTTGTAGACTCTTACGAGTCTACGAGTTAATTCGGCGAAACGAGTTTACCTCCC CAAAACGTGTATACCTAGACACTTGAGTTTGACAACCTTGTTTGTGATCACTCGAGTTTTTTATTTTTATTTCTACCGCT GCAATTTATGGCCATCATCCACCACAAATTACATGTGTCCGCCAAAAGCAGTTATAAACACCAATCATTTTCTGGGAATA TAATTTATTGACATATAAATTTCACTTCTATTTTAGATAAAGATAAACTAAATGAGTTGACACAATGGTTCAACATTTAT TCCCTTAAGGAAATGGTTGAGGGTTCAAATCTTAACCCTTGTGAATGAAAAAAGTCATTAGTTATCCCCCTACTAATTAG TGTGCTGACCGTGGAACGCGAGATTAGTCTGACGGCTATCAATGGAAATAGAAAAAAAAAAGATGGAGATAGAGATATAT AGTTATGATTGAGAAATATAACGTATGATATGATAAGAAAAGTCAAGATAAATTAAAAGGAAAAAAAGCAAATTAGTCCC CCTGAAGTTTGAGTCACGAGCGACTTAGATCTTGACGTTTTAAAAGATGCATTTATGTCCTTAAAGTTTTTAACGTGTGT AAAATAACCATTTTTTAATGTTTTTGTTAAATTTTAACATAATTTATCACATTACATGCACATAATATTTTCTCCCTAAA TTATCCTTGTAAATTAATCATTCTCACATAAAAATGCTTGCTTTTTTTTTTTTATCCTGATATGAATAGTCTAAATGGTA CTTGATGGATTAAAATTTCACAAGTCCTGGGTTCAAATCCTACTGGTATCTAGATACCAAAAAAAAATGCTTGGTTTTTT TTACCACCATGATATATGAGCCTATAAAAAAATGATACTTCCTGAATTTTTTCTATTAATTCCTAAGTTTTTAATTTCCA CCATGTAAAATGGGAAAATGTTTGATTTTTTTTACAACTATTGTTAGAGTAAGTTTGGCTTTCAATTTTTGTATAAACAA TATTAATCAACATTTTTAACGTTATATTAACATATTTTTATAATTAAACATGTAAAACGG 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0033200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGTGATTCAGTTTTCAACAGTCAGGATCTTAACATGGACGTGCTTTATCGTACTGGGCATCCATACTTATACTCCTCG CCTAGTTTCCATAAACTTGAGAGGATCCCTTGGATCTATGAGTTCATGTGGTACATTGTATAAGGAGGTTGCTCCCACAA CATCAGATGTTGTGACCTGGACAGGTAGAGTTTCCACCCAAGCCTCTCAGTCTCACCAAAGAAATTTATTTCTACAAAGA CTTAATGAAGAAGAGGAAAATATGAATTTGGCAAATGAGACTAGCAGCACAAACAATGGTTCTCAGAGTGAGTATCAGGA TAAGGATATAATTCAATGTCTAGAAAATGGCGTTAAGTTTTGGACTGACTACTCAAAAGTACATTATCACCCCCAAAGTT TACATGAATTAAATGGAATTTGGACGGATGCTGAGGAATTTGACAATTATGGAATCAGAAGGGATTCCTTTGCTTGGGCT TCACAAGGGGAAGAAATTAGTGGCAGGCTTCGTTTTTTTGTTGAAGAGTGTGACAATATACAGGGATTTCAATTTGTTGT TGATGACTCTGGTGGTTTCTCTGCTGTGGCTGCTGAATTTTTAGAGAATATTGCAGATGAATACCCAAATACTCCTGTCT TGCTGTATGCAGTCCAAGGCTCTAGTTCACATAAAATTTTGAGCAGGAAGCGTACAATCTCAGCGGAGCTTCATGATGCT GTATCGTTTTCAAGACTATCATCCTTCTGTAAACTTATTGTACCTGTTGGTCTGCCCACCTTAAGCAAAAGTAAAGCTTC TAAGTTCCTCCACATTGATGATGAGCAGCATTTCCATTCAAGTGCAGTTTATGCTGCAGCCCTACACTCCATTAGTCTTC CTTTCCGAATGGTACCAGTAGGGCCTGCTACAGATGCATATTCGGTTTCTGGAGCTGTGGATTTTCATGAAGTCATACAA ATGTTATCAGGGCACGGAAGGCAGAATATGGTGTCAGTTCTTGATGTTGCTATGCCCCTACCTGCTTTAACGGGGGAACA GAATGAATCGTCTTTGATAGGGAATTTGCATCCATTGACCCCACAGACAGCAGAGGATGTTGAGGACATGCAGGCAATTG AGCACATAGCAGTCCATGGAGCTTTTGCATCAGAAGGTCGCCGTGCTTCAGTCTGTGAGGTAAAGGATACAGTAGATGCT GCTTATCAACGTGCCAATACAAGACCAATGTTCTGCCATCTATCAGTTGCTCCTTGTCCCCTGCCAATTCCCCTGCCTTT TCCATCAATCTTCCGGAACCAAGTTGGCCAGCATGGCGAATTCATGGCTGGTCAAATGTCTAGTACTTCATCAAAAGGAT CCCTTGACGTCCATTCCATTCCCATGGCTGCCAGATTACGTTCAACCAGTGCTGTCTTACCACTTCTTGAGAGCAAATTG CGAAACCTGAATCGATTTGGTATTGCACGAGGAGCAGCTGGGGCAGAGTTGCTTAGAAGTTGGGGTTTTGGAAAGGAAGA AGCGGAGGAAATGGGAGAGATATTATCTAAAATGGTTGCGGCTTTGAGTCCTCCTCAGTTCTCTTCCGATTCAGATTAG 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0033200.3) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MVIQFSTVRILTWTCFIVLGIHTYTPRLVSINLRGSLGSMSSCGTLYKEVAPTTSDVVTWTGRVSTQASQSHQRNLFLQR LNEEEENMNLANETSSTNNGSQSEYQDKDIIQCLENGVKFWTDYSKVHYHPQSLHELNGIWTDAEEFDNYGIRRDSFAWA SQGEEISGRLRFFVEECDNIQGFQFVVDDSGGFSAVAAEFLENIADEYPNTPVLLYAVQGSSSHKILSRKRTISAELHDA VSFSRLSSFCKLIVPVGLPTLSKSKASKFLHIDDEQHFHSSAVYAAALHSISLPFRMVPVGPATDAYSVSGAVDFHEVIQ MLSGHGRQNMVSVLDVAMPLPALTGEQNESSLIGNLHPLTPQTAEDVEDMQAIEHIAVHGAFASEGRRASVCEVKDTVDA AYQRANTRPMFCHLSVAPCPLPIPLPFPSIFRNQVGQHGEFMAGQMSSTSSKGSLDVHSIPMAARLRSTSAVLPLLESKL RNLNRFGIARGAAGAELLRSWGFGKEEAEEMGEILSKMVAALSPPQFSSDSD 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
SUPERFAMILY 16 297 282 3.05E-23
CDD 20 513 494 1.27993E-143
PANTHER 20 531 512 1.6E-168
Pfam 21 82 62 2.9E-9
Coils 74 94 21 -
Pfam 116 296 181 6.2E-24

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0033200.3, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…