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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0092400 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0092400.4 |
| Related isoforms 6 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | ATP synthase subunit B; TAIR: AT5G10320.2 ATP synthase subunit B; Swiss-Prot: sp|A6Q7Y7|SYP_SULNB Proline--tRNA ligase; TrEMBL-Plants: tr|G7J3Q0|G7J3Q0_MEDTR Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0092400 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:19957764..19970129) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTGCTCGCAAGTAAAATCAGCCTAAGGCAAACATTGTAGTCGTGAGTGACGGTAGTGTCAGTGTGGAGGAGAATGGAAGA GTTACGGAAACTTGAAAAAGTACAGAGAATGGTGGAATTCATGGAATCACGCGGCGTATCAGTTTCAACCTCCGATCATC ACTCCAACCGCTTCCTCGCTAATCTCATGCTCTTCTTAATCGAACCACCACCGTGTGGCTCCGCCGCCGCCGTCGGAGAA TCTGAACTTGGAATGGACCACAAGTGCCGCTTGGTTTCTCACCTCATGCCTACAGTGAGTTCCACTTCTCTCTCTCTCTC TCTCTCTCTGCATTCACCCCAAATTTTAACTTCTCCATTTTGCAGCTCTCATCTTCGTTTCTTGAGGATGCGCAACAACA CCTTGTCACCGAACAACATAATACTGGTGATTTGTTTTTTTTATGTATTTTCACGCATGTTTTAATTTTATGATATTTAA TCAAGTTTTTTGAATTGAATTTTCACTTTTTACATAGGTTTTCAACAAAATCATGGTGGAAATGCTTTGCTAAGTTGCAG TCAGAAGAAGGAACGTAGTTTGTTGCCATGTTGTAATGAAAACATGGCCATGGTGAGTCTGGATTCCATGGAAAAGGCAA ATTCTACCCTTGAGGATTTTGTAAGTATATATTCCAAAAGTAATGTCTTTGTTATGACTTGGTAATCTGTTATAATGCTG TTAGAAATCCCACATTGGCTAGAGATATGACCAAAAAACGTTTATAAAGGGTAGATCAATCGTCAACTATTGAGCTTGCT TTTGTGTTGAGTTAGACCTCACTAATTCTGATAAATGCTTTGGCGGATATGTGACAACACAACAATTATTGGTATAGTGG ATGTGGGCTATAACCTCATGATCTTTACTTGCATTGTTAAAGTTCTAGAGTTTCCACTTTGGACAGAGGGGTTTTACTAA 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AGAGCCAACTTCGCGAACCACCATGACCATGGCGTTAAAGCTGCGACTTCCAACCTCATCAACTTAATCAGATTCAAGAG AAAGAAAGGGATGAGATTTTGAAATAGGGAACAAAGGAGCCTGCTGGCCTTGGAGTCTGTGGATCGACATGATTGGTGGC CACCAGGGAGCTCGCGGCAGCTGGATGTTGGACCTGTGGTTTATACACGGTTCAGAGGTAACGGAAACATCCAGCTTGGC TGGGTTATGGGGGGTGAGGCCACGGTGGTTGCTAAGGCATCTCAAGGTGGCACAAGGGTTTGCAGTGTTTGGATTGGGTT TTGGAGGGGGTTTGTTTATTTGTTGGTTGCGGTGTTGGTTGGGTTGCTGCCGGTGGAGCAATGATGGTTTTGGGTTTTGG CCAGTGCTGGTCGTGGTGGTCACTAGATCGGTGTGGTGGCTCCGTGGCAAAGGGCAGTGGCGGAGGTTATTGTGAGGGTT TGAGTGGTTGATGAGGGAAAGGGACGTTGGAGAGGTTGCTGGGCTGGTTTGGTTGATGTTTATCTGATTTAATGTTGCTT TAATTTGAAGTGGGTGGTTTCTAGTTATAGTTGTTGAAGAAATCATCAACACTTTGATTATTGTTTCTGTTGTGGATGAA GAAGTGAGGGTGGTTCATAGAGGCGATGGCTGAGGCATGGAGGAGCAAAAATGCAGTTATAGTGAAGAGGACAATGAAGA CCAACTAATTACATTGCAATTACATTTTCCTAATCATATAAATATAGTAACTAATTATACTTGATTTAAAAATCCAGCTG GACACATATGACATACGTTTGGACGTCACTTAACAGAATGACTCAATTTTCACAAATAAAATTTTTTGAGACCAAAAATA TCAGGGACCGGAATCGCACAATCGCGATAGATGAGCAACGAAAAATACAATTAAGCCTTTAGTAAAACAAGAGAAATGCT AATAATATTGTCTTTAGTTCTTATCTCAACACACTTATTATTATCTATGTAATCACATGGTCTTAGTTTCACTAATATGG TGGGTCTAGTTATTTACCGGGACCATCCTGAGATCTCAATCGTTCATAGCATCTCTCGTAAAACCATATCCAGCGTAAAC TGTTTTACATAGACCTAGAATTATATTTGCTCATTTTACCTTTTTTTTATCAATTTTAATTTTAATTCTTATATTATTCT AAAATGGTGAAATATACTTTGATGTCTGTAAACTTATATGCACTATCAATATATAGTTATTATAACTTGTTTATTTGCAT GTTGGAATCCGATTGTTTTAGGGTGTATTTGTATTTTTGTCAGCGCAAATTCTAAGGGTGTGTTTGTATTAACTTTATTT CCAACGTGAAAACAAAATGTGCATGCGAAAGTGGGACAACTTTTAAACAAACATGCTCTAAGTTAGTTTGAATTTGCCTT TGACATCCATGTCTCTTGTATCATTGAACTAAATGTGTTTTTCATCAACTTGAATGTAATTACAAACACATTTATTCCTT ATGTGTTTTTCACATTTCCTTATAATATATGACTTTGGACCTCTCTTTTTTCTATCTCATTTCTCATTTCCGTTCACTTC ACACTCACATTTTACAAGGGGTTTAAATGTGGTGTAATACACTCATTATTGTATAATACTCCAGGCTAAATGCATTAGTG AGGCTGAAAATAAGTATGAAAGTTTGCTGGAATTACTGGATCCGCAGCTGTCTATGAACTACCAGAAAAGATGTGCAGAA GCCACCAAAGAAGGTATTTTATTGGAATCTGTCAATGCATTTCTGGTAGTATAACTAGACCCTAACTGTACCCCACCATT ATTTATGGGCAACCAATTTTTTTAGGTGGAAGGGTATCAGAAAATCCTCTAGGCACGTGGAGTATTCCAGCCGTGATTCA AGATGAAGAATTATACAGATCCATGTTGAAATCACATACTTCCTAAATGTGACCTGAACCGTGTCAATGATGACTTGTTT GGTTCCATGGTGAATAGTCTAGAATTACTTCTGGTTAGAAGTTAAGTACATGTTTTGATACACTGCGGAAAACCACGATG AAGTTAAAATCATGGTGGACAGCCACAAAAGCTAAAAAAAGTTGTTTCTATCCACCTTGATTTTGGCTCACCATGATTTT TCATCGTGTATCCAAACATGCATCAAATCTCTTAACTTCAGAATGACCATGCCTTGAATTCTATGCAAATCGTAAAACCA AACATCCACGGAGGACCAGACCCAGGTTGGGTTAAAATGGGGCAGTTTCTTCTCCCAAGATAAATTTTTTCCTGATTAGA ATTGTATTTAAATGTTGTTTTAGCCGCTCCCACAAATTTTTTATTTTCTCTTCTAACTCGGGACAATTAACTTTGCTTAA TGTGAATTTTCACTCCCCTTATTTTTTCTGGTTCTGTCCCTGCATCTACCGTGATGATCATGCTAACCAATTCTAGTGGC TTAAAAATGTCCTCTTCATGTCCACCTAGATGATCATCGGACTCAAAGATCTCGAGTTGAATTCAGAACAAAAAATTATT TAATGGCATTTTTTTCTCTGTGCGGTGACTTTGTTAATAAGATTCAAGATTGCATATTGAGAAATATCGTCACTCCCGAG AAGCAACTAAGCAAGCTAAAACCAGGCTAGTTCTTCTCCTGTTAGCAAATGAGCAGGCTAAAACTTAAGACCTAGTAGCA AGTGTGATAAGTGAGATAGAAAGAGAGCATTATTGGTCTAAGTAGA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0092400.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAAGAGTTACGGAAACTTGAAAAAGTACAGAGAATGGTGGAATTCATGGAATCACGCGGCGTATCAGTTTCAACCTC CGATCATCACTCCAACCGCTTCCTCGCTAATCTCATGCTCTTCTTAATCGAACCACCACCGTGTGGCTCCGCCGCCGCCG TCGGAGAATCTGAACTTGGAATGGACCACAAGTGCCGCTTGGTTTCTCACCTCATGCCTACACTCTCATCTTCGTTTCTT GAGGATGCGCAACAACACCTTGTCACCGAACAACATAATACTGGTTTTCAACAAAATCATGGTGGAAATGCTTTGCTAAG TTGCAGTCAGAAGAAGGAACGTAGTTTGTTGCCATGTTGTAATGAAAACATGGCCATGGTGAGTCTGGATTCCATGGAAA AGGCAAATTCTACCCTTGAGGATTTTTGCAGATCTTATTTTATGTTTCATGGGTTGGATGTAAGCAAGCCACAATCAATA TTCAAATATTTACCCATTCTTTCATTCACAGAAAGTTATATTTATCAGCTGGATAAAATGAATGAGAAGTTGCAACAAAC ACCAGCAACAGAAGATGAGAAAGCAACTCACGATTTGGTCTCTTGCTTCTCAAATGACCCAGTTGGACCACTGGTGACTA TTTTTGAGCATAAAGGCCTTTTGACTGGAAGGATAAAAGACGAACTTAGACTTGGAGAAGAGTATTGGGCTCTTGAAAGA AAGCTCTGTCATGCAATGACAAACAAGGAGGAGATTCTTGTTGATGATGTGATGAAGGCTATTCATTTAAAGTCTTTTGA TTATCGAGTGCTGAATCTTCTTCTCTATGAACTGCGAGGAGCTAAGGTTGAGGACTTACATATGGAGTTTCTTTCAGTTT CAGAATTCTTAGTGGAAGTTTCTGATGATCTTCTTGCTGCAGGTATGACTACGAGGATGATGTTTTAG
Protein sequence (LotjaGi6g1v0092400.4) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEELRKLEKVQRMVEFMESRGVSVSTSDHHSNRFLANLMLFLIEPPPCGSAAAVGESELGMDHKCRLVSHLMPTLSSSFL EDAQQHLVTEQHNTGFQQNHGGNALLSCSQKKERSLLPCCNENMAMVSLDSMEKANSTLEDFCRSYFMFHGLDVSKPQSI FKYLPILSFTESYIYQLDKMNEKLQQTPATEDEKATHDLVSCFSNDPVGPLVTIFEHKGLLTGRIKDELRLGEEYWALER KLCHAMTNKEEILVDDVMKAIHLKSFDYRVLNLLLYELRGAKVEDLHMEFLSVSEFLVEVSDDLLAAGMTTRMMF
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 1 | 305 | 305 | 1.6E-123 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0092400.4, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…