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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0160700 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0160700.2 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Polyprotein; TAIR: AT5G57610.1 kinase superfamily with octicosapeptide/Phox/Bem1p domain-containing protein; Swiss-Prot: sp|Q6XKE6|POLG_PVCV2 Genome polyprotein; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SQH9|A0A151SQH9_CAJCA Polyprotein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0160700 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:44372094..44390544) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
GTGTGGTTCGTATCAAAAGGATCGGCATTTGCTAGTGTGGCATCTGAATGTTTTCAAATGAAACCTTGAGTTATTTGAAT CATGAAATGGCTATAGAAACAAACATATTTGATAGCATCATTGAAGAGTTGTGCTTATGAACACGGTGCTACCACTACAA CAAAAAGCATGTTTAGCGGCAATAAAAACTGCCAACCACAATTTGGCTGTTGTATGGAGTCGGTAAAAGGTTTCACGGCA ATTGTACCGGGTGTTATTTCCGGGTTTCCTTATTGCCACAAAAAGTGTTGTTGGAGCGAGTTCTTTGGCAGCAAATTACT TGTGGCATTCATTTAGAAAAAAAATGTTATTTCAATTTCCCGTTCCCAATTTTCATATCCGATCCCTCACTCTCGTTTCT CCCTCTCACTCTCTCTCGGTTTGAACCCTAGATCCACCCTTGATTTCAACCCTGTTTCCACTCTCGATTTCAACCCTAAA ATCCCCTCTCGATTCTCTTCCTGATTCCTCAATCTCCAGTGTTTTCACGGGAAAACGTTCGAACTCAGCTCCACTTTTTC GGCGCCGCAGCTGCACTCGTTTTCTCATGTAATTCAATCCCTAACTAATTTCTCTCAATTAGATCTCTGTTCCTCTTTCA ATTTTCACGATCTCCTTGCAATTTCGCATTTCAATGAAATTTTCATGTTCGATTTAATTTGCATCTTGAGTTTCGATCGT AAAGCAATGAACACACTGCATGATTTTTTTGTTTAATTTACTTATATAGTTTGGTTGTTGATTCAATTTTTCTGTGTAGC AATTTATTTTGTTTGATTCAATTAGCTACTGCAAAGAGTGGTGTTGGTGTGGCTTCAATGGGAGTGATGAGACCGGAGCT GGTGATGAAGTCTATTGTCCCTGTTGTTATGGCTAGAGTTTTGGGTATTTATGGACTTATTATTGCTGTTATTATCAGTA 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CTATAATTTGTTCTTTGTCAAAAACTCTTTGTTTCAAAATACCACCAAAGCCAATATCTGAGGCATCAGTTTCAATAATC TTGAAAGCTTCAGGATTTGGGAGATAAAGACAAGGGAGAATTTTGACACGGAGTTTGAATTGCTTAACCCCGTTGGTATG AATATCAGACCAAGGTGGAGGATCCTTCTTGAGTCTATCATGAAGGGGTTTGATTATAGTGCTGAGTTGAGGACAGAAGT CAGCAACATAATTGAGACATCTCAAGAACCTTTGTAGTTGGGTTTTGTCTATGATTTGATCAGGAAATTTGTCAGTGAAC TCAATGGCTCTATTGATGGGGATGATTGTTCCTTGATGAATATTGTGACCAAGGAATCTGATTTTGGTTTGGAACAAGCT GACCTTTGTTTTAGAAACTGCCAGACCATTCCTTTTGATTATGGAAATGAATGTATTGAGGTGTTTGAAATGTTGGTCTA TAGTTTGAGAAAAGATCAGAACATCATCAATGTAAACAATTGTGAATTTAGAATAGGGATTGAAGATTTCGTTCATAATC CTTTGAAATTCAGAAGGGGCATTTTTTAACCCAAAAGGCATAAGATTCCACTCGTATTGTCCGAAAGGGACAGTAAAAGC GGTTTTATACCTATCCTTTTCCTGCAATTGGATTTGCCAGAATCCAGACTTCATGTCAAATTTTGAAAATATCTTAGCAT CATGCAGTCTGGCTAGGAGGATCTTTCTTGTTTGGAATAGGATATCTAATCCAACAAAGAGCTTGATTGAGGGGCTTGTA GTTGATAACAAGCCTAGGGGTTCCTCGTTCTATCTCAGCCTGTTTGTTGACATAAAAGGCTGCACAGGACCAGGGACTCT TGCTTTTGCGAATCAATTTTTTCTTTAGAAGATCATTGATTTCTCTTTGGCAAAATTGGAGAAGTTCTTCATTCATTTGG ATTGGCCTTGCTTTAGTTGGGATTTGTTTATCAGAAAAATCCTTTTCATAAGGAAGATCAGCCATATGGCACTTCCTTTC CCAAAAAGCATTAGGCAAATCAGAACAAATGCTGGATTGAATGTTTTTCAAAATATCTTCAATCCTAGATTTGACTAAAG ACTGTTGTAATTGAACTTCAATATTTTTGTAAGAGATTTCTTCTTTGAGGA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0160700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCGATGATACTTACAGGTAAGGAAGGTTTGTCTTTCCTAATGCTTCGCTATTTTTCTTCCAAGCTTTCATTCAAATC TTCCCAACCCTCTTCTTCTTCCATCGATCATCATCATCATCAATCTAATCAATTAAAATCAAAAAATGTTTTCAAAGAAG AAATTCATTTTGAAGACATCAATCAAGATCTCGATAACTGGGAAATTCCAAAAATTTCTCATACTGAGATCTATAAACCA AATGGATCTTTTTTCAAAAGATCAGATTTCATCATCAAAACGGTTGAACAAACCTATAAACTCAAAACGGATGATGAAGA AATCCACCTGCTTTCTGAGAAAAGCATTAAGGATCATATCTATAAGAATTTCAACTATCTACATATAGGTAGTGTTAATG TAGGTCTAAAACCCATGACTAGGAAGTCTCTAGATATTGCTGTACTTCTTTATCTAAGGGATGTTAGACATAATCGGTTC CATGACTCCCTCTTAGGTACGGTTGAAACCAGCCTGAGCAATGGACCAATCTTTTTCAATTGTTTCCCTGACCTAACGGT TAGTTTGGATGATAAAAACATCCTTGACGTTCTCTTCCTAAATATCAAGCTTCACGACCTTGATATGAAGGATGATTCCA TCCCTATCTCTTTAATCTATAGGGTTCAATACAAAGTAATGAACTCTATCAAATCTTATTTCTTGCGAACAAATTGTGAG AAATCTGGAGAAACCACCCTTTTCCTTACTGACTATGATAAGGCCAATGTTATTGTTCCTAAAACCATCCAATGGAGCGA TATCACCCTTCCTGAGAAATGGTCCTTAGAAAAGGCTGCTCCAGCTCAACCTGTTGAAACCCCTGAGTTTCGTGAAATTA TCCAACACCAATCAGGTCAAGTGGATCTTATCTTTGATAGGAGAAATTCAAAGAGGGGTTCGGAAGCAGAAGAAGGGGGA TAA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0160700.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MAMILTGKEGLSFLMLRYFSSKLSFKSSQPSSSSIDHHHHQSNQLKSKNVFKEEIHFEDINQDLDNWEIPKISHTEIYKP NGSFFKRSDFIIKTVEQTYKLKTDDEEIHLLSEKSIKDHIYKNFNYLHIGSVNVGLKPMTRKSLDIAVLLYLRDVRHNRF HDSLLGTVETSLSNGPIFFNCFPDLTVSLDDKNILDVLFLNIKLHDLDMKDDSIPISLIYRVQYKVMNSIKSYFLRTNCE KSGETTLFLTDYDKANVIVPKTIQWSDITLPEKWSLEKAAPAQPVETPEFREIIQHQSGQVDLIFDRRNSKRGSEAEEGG
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| PANTHER | 39 | 308 | 270 | 4.1E-51 | – | |
| PANTHER | 39 | 308 | 270 | 4.1E-51 | – | |
| Pfam | 73 | 235 | 163 | 9.0E-22 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0160700.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…