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LotjaGi6g1v0206500.1

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0206500
Transcript ID LotjaGi6g1v0206500.1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Reductase 1; TAIR: AT1G59950.1 NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein; Swiss-Prot: sp|P26690|6DCS_SOYBN NAD(P)H-dependent 6'-deoxychalcone synthase; TrEMBL-Plants: tr|A0A151SBZ1|A0A151SBZ1_CAJCA NAD(P)H-dependent 6'-deoxychalcone synthase; Found in the gene: LotjaGi6g1v0206500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:50365031..50388270) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

CTGGCCCATTGCTTTGAAGCCTGGAAATTGGGACATGCCTTATGATGAAGAGGCCATGGCCCCATTTGACTTGAAGGGTG TGTGGACAAAAATGGAGGAATGCCAACAACTGGGGCTTACAAAAGGCATTGGAGTCAGCAACTTCAGTTGCAAAAAACTT GAAAATTTGCTCTCATTTGCCAATATTCCTCCTGCTGTCAACCAAGTAAGCTCACAACCTCATAATGGATATCTCTCTAC TTTTCTTTAGTCATGATTAAACTTTCAATTGCTGGATATATGATATTACACCATCAAATCAAAAACAGATTAGGATGAAT CCTACTTGGCAGCAAAAGAAGTTAAAAGACTACTGCCAAGCAAAAGGAATATTCATAACTGCCTACTCTCCTTTGGGAGC CAAAGGTACCGTTTGGGGTACCAATGATGTTATGGACAATGAATTGCTCAAGGAAATTGCAAATGCTCATGGAAAATCTT TTGCTCAGGTATCCATTATAACTTTCTTTCACATGAAAAAGTTTAACTTATATTTCGTTTTTTATAAACTTATACTTTTT AATCTTAATCTAAGTGAGTTTTTATTCCCATTTTGGTCAAAGCAAACATGCTTAGGAACATATAAAATAATAAAATAGAA GAAAAAATTCTAATAATCATATAGAGATATAGTTTAGCAATTTGAATTAGTACGACCATATTTGAGTTAGTGATGACACA TAAGAAATTATTAGGTTTTTTATTGCGGAACCAAACATACTTTTCTAACTTCTCCAAAAAGGGATCATGAGATTTTCCAC AGTAAATGAAACACACTACACGTCTACCATTTAGATATTCATAATATTTTAAAACAATGCGATTTCTACATAGATGATTA ACACAACCATGTTATTCTTTGAACCAAAAAACAAACACTACCCTACACATGATATACCTTGTGGACTTGTGATTAATTAA 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CTTTTGGGTATTTAAACATGGTTTAATTATTTTGTTATGTTTCACCAATATTTGGATGATTACTTTTCAAATGTGGGTTT TTTTCACACATGGGTGTGACCACACGTTTATTTCAGTATTTGTGGTTACAACGTTTATTTATGAGTTATACTTTCCGCAT GTTTTTATTATGGTAATTTGTCTTTTATGTTCACTAAAGGATTTCATACCACTAAGTAAGGATTAATAACTGGACGACGA AAATTCTTACGAAAACTACGTGATTTGGGTTACTGTGTGACACTCGAGAAATCGGGGCGTTACAAATAGTGCTAAAAACT AAGAATTAAGAATCTAGCATTGGAGATGCTCTAATCATAAAAAAAAGACTTTGTCACCATACACCCTCCGGTCACATATA TAAGCAAAAAATAATTTTTAGGTTCATTTATTTAATGAATGTAATGACTAGATACATTCATTAAATGAATGAATCTAAAA AGTTTTTTTTTCTTATATATGTGACCGGATGGTGTACATCTTAACAATTGACTTTTATTAATTATTTTGATGTCATTTAA AACCATTAAATGTCAAATTAATACAATAATTTTTTTTAATAAAGTCAAAATTGATTTTTTTAACTATTCTAATTTCATTA ATAACTATTAAATGCAATATTAATTTACATTAATTATTTTTAAAATTAGGAAATTATTTAATATTTAAAATATTATAAAA TTAGAAAATAATTAACGTATTAAATACGCTGATTATGATAAATAAATATTTAAATTACGTGGTCATAATGTGATTTGGCT GATGATATCTATAAGAGTCAAAAGATGTTGGTATGATGCACTATAATCCATTTGATACTCACAACCTTACGAGTTGTCGT GTGACACCAAAACATGACTTCATCACTAATCGTTCCAAATGTGGTGCTCTCCAACAACCGAAACTTGCCGGTGATTGGAC TCAGAACTGCTACCATCTTAGGCTCCGCTGCCGGCAATGACACCACCAAGGTGGCAGTGCTAGAGGCTATTAAGCTCGGT TACAGGAACTTTGACACAACTTCGATTTATGGGTCAGAGGAGGCACTTGGAGAAGCCATAGCTGAAGCATTAAAACTTGG CCTCGTTGGGTCTAGAGATGAACTCTTTGTCACTTCCAAGCTCTGGTGCTCTGATAATCATCCTGATTTTGTTCTTCCTG CTTTGAAGAAAACACATCACTAAGGACAACTATTGTCAATTTAAATTATGATCATTAGATATCTTCTCTGAATTTTCCTT TATATATGAACTGAGTATTGTTGTTCTTCAAAATTAGAGCTTTCAATTTGGGTTTCTAACCCACCAGTCATCCCAGTCTA ATCTGACTAGTAAGAAAAATGATGCAATGCGTTAGTATTATTATTAAATTATGTTGGATTTGAATATTTTGTTTTAACTT TAAACATTTGATCTGTGTTATAATATTAATATTTTAAATATTTTTCACCGGACTAAATAAATCATAAGTAGATTTTCATA ACATTTTCACTTTTGATTCATTTCTTCATATTTTAGTCTTTTACACCCAAAAACAATGAGCCAACCCATGATAGGTTGAG TTTAGTTGATAAATTTCTCACTTATTTAAATACGAGCGCGACGAGCTCAATCTGCAATGAGCCAACCCATATGGGTCAGA CTGTTTTGTATTGATAACGCTAAAAATTATCTTGTTTGGGTACATGATTTAAAATTTTGTATTTGAATAATTTTCATTAA AGATTGGTTAATTGATTGATATTTTAAATGATAGATACTTAATTTTTTTTAGGGTGTGTTTGCAAGTTTGATTTTTAAGG AGAGGGATGAAAAATGAGAGACTTATGACAATTTTTCACATTGTTTGACTTTGAGAGTTTTTAAATAAGGGAGTTTGAGT TTGAAGAATTGTTGAAAAACTTCTCCAATACACTCATGCAATTAGTTTGTGGAGTTCCCCTAAATTGAGGATTTTGGTGA AATTTTGAGCTTCCAAACAAGGGAAGGACATACGGGTCAGGCTGTCTTGTATTGACAACTCTAAAAATTACTCTGTTTGG GTATAGGATTTAAAATTTTGTATTTGAATAATTTTCACCAAAAATTGATCAATTGATTAATATTTTAAATGATAGATACT TAATTTTTCTTAGGGTGTGATTGCAAGTTTGATTTTTAAGGAGAGGGAGGAGAAATAAGAGACTTATGGCAAATTTTCAC ATTGTTTGACTTTGGGAGTTTTTTTAATAAGGGAGTAAGAGTTTAGAGAATTGTTGAAAAACTCCTCCAATACACTCCTT TAATTAGTTTGTGGAGTTCCTCTAAATTTAGGATTTTGGTGGAATTTTGAGCTTCCGAACAAGGGAAGGACATACCCTCC CCCTAACATTCCCTTTAAGTAATATCTAATAAGTTCTGTGTATGAAAAAATCGTAAGTGTAGTTCTATCTAGATGCGTAT AATTTCACAATGATAATTATATTGGAAAAAAAAACTAATTTAATTTACTTTAACTCTTTAACTAAACATAACTTTTTTAT TTGTTAAAGTACATGTTTTTGTGGCTAAAGCTAATGCAGGTCATTGATTTGTTTTTTTTTTGTCAAACAGGTCACTGAAA TTAGAATATATAGATCTTTATTTGATCCACTGGCCCATTGCGTTGAAGCCTGGAAATTGGGACACGCCTTATGATGAAGA GGTCATGGCCCCATTTGACTTGAAGGGTGTATGGACAAAAATGGAGGAATGCCAACAACTGGGGCTTACAAAAGGCATTG GAGTCAGCAACTTCAGTTACAAAAAACTTGAAAATTTGCTCTCATTTGCCAATATTCCTCCTGTTGTCAACCAAGTAAGC TCACAACCTCATATTGGATATCTCTCTACTTTTCTTTAGTCATGATTAAACTTTCAATTGCTGGATATATGATATTACAC CATCAAATCAAAAACAGATTAGGATGAATCCTACTTGGCACTAAAAGAAGTTAAAAGACTACTGCCAAGCAAAAGGAATA CTCATAACTGCCTACTCTCCTTTGGGAGCCAAAGGTACCGTTTGGGGTACCAATGATGTTATGGACAATGAGTTGCTCAA GGAAATTGCAAATGCTCATGGAAAATCTTTTACTCAGGTATCCATTATAACTTTCTTTCTCATGAAAAAGTTTAACTTAT ATTTCGTTTTTTATAAACTTATACTGTTTTAATCTTAATCTAAGTGAGTTTTTATTCCCATTTTGGTCAAAGCAAACATG CTTAGGGAACATATAAAATAATAAAATAGTATAAAAAATTCTAATAATCATATAGAGATATAGTTTAGCAATTTGAATTA GTACGACCATATTTGAGTTAGTGATGACACATAAGAAATTATTAGGTTTTTTATTGCGGAACCAAACATACTTTTCTAAC TTCTCCAAAAAGTGATCATGAGATTTTCCACCGTAAATCAAACACACTACACATCTACCATTTAGATATTCATAATATTT TAAAACAATGCGAGTTCTACATAGATGATTAACACTACCATGTTATTCTTTGTACCAAAAAACAAACACTACCCTACACA TGATATACCTTGTGGACTTGTGATTAATTGATAAAACAAAATTTAAGTATCGGAGTCTATATAAATTATATAAATTAAGT ATATCCATTTATTTTTAAATCATGATTCACGAATGTTTTTCTCACCATATTTAGCTAACATAATACTTTCTGGTGTAATA GGTATGTCTAAGATGGTTGTATGAGGAAGGCGTAACTATGGCAGTTAAGAGCTACAACAAAGAAAGAATGAAGCAAAATC TGGAAATATTTGATTGGTCACTTACAAAAGATGACTATGAAAAAATTAATCAAGTCAAGCAGCACCTTTCATTGAAGTAT GGACCAGCAAAGTTCGTTGAGGACCTTTGGGATGAAGAAAATTAATACATGCAATATGGAACCATATACTAAAGCTTTAT GACTATGAAGAAAAAACAAATACTAAAGCTTCTGCTTTCG 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0206500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGCCTTATGATGAAGAGGCCATGGCCCCATTTGACTTGAAGGGTGTGTGGACAAAAATGGAGGAATGCCAACAACTGGG GCTTACAAAAGGCATTGGAGTCAGCAACTTCAGTTGCAAAAAACTTGAAAATTTGCTCTCATTTGCCAATATTCCTCCTG CTGTCAACCAAATTAGGATGAATCCTACTTGGCAGCAAAAGAAGTTAAAAGACTACTGCCAAGCAAAAGGAATATTCATA ACTGCCTACTCTCCTTTGGGAGCCAAAGGTACCGTTTGGGGTACCAATGATGTTATGGACAATGAATTGCTCAAGGAAAT TGCAAATGCTCATGGAAAATCTTTTGCTCAGGTATGTCTAAGATGGTTGTATGAGGAAGGCGTAACTATGGCAGTTAAGA GCTACAACAAAGAAAGAATGAAGCAAAATCTGGAAATATTTGATTGGTCACTTACAAAAGATGACTATGAAAAAATTAAT CAAGTCAAGCAGCACCTTTCATTGAAGTATGGACCAGCAAAGTTCGTTGAGGACCTTTGGGATGAAGAAAATTAA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0206500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MPYDEEAMAPFDLKGVWTKMEECQQLGLTKGIGVSNFSCKKLENLLSFANIPPAVNQIRMNPTWQQKKLKDYCQAKGIFI TAYSPLGAKGTVWGTNDVMDNELLKEIANAHGKSFAQVCLRWLYEEGVTMAVKSYNKERMKQNLEIFDWSLTKDDYEKIN QVKQHLSLKYGPAKFVEDLWDEEN 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
Gene3D 1 182 182 1.1E-63
PANTHER 5 182 178 9.0E-92
PANTHER 5 182 178 9.0E-92
SUPERFAMILY 10 166 157 2.62E-46
CDD 12 162 151 1.44601E-44
Pfam 14 162 149 1.2E-25
PRINTS 20 37 18 5.1E-29
ProSitePatterns 20 37 18 -
PRINTS 54 83 30 5.1E-29
PRINTS 98 122 25 5.1E-29

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

GO term Namespace Name Definition Relationships
Molecular function Oxidoreductase activity Catalysis of an oxidation-reduction (redox) reaction, a reversible chemical reaction in which the oxidation state of an atom or atoms within a molecule is altered. One substrate acts as a hydrogen or electron donor and becomes oxidized, while the other acts as hydrogen or electron acceptor and becomes reduced.
Biological process Oxidation-reduction process A metabolic process that results in the removal or addition of one or more electrons to or from a substance, with or without the concomitant removal or addition of a proton or protons.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0206500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…