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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0213500 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0213500.1 |
| Related isoforms 1 | |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | Leucine-rich repeat-containing protein 1; TAIR: AT2G34680.1 Outer arm dynein light chain 1 protein; Swiss-Prot: sp|F4IIU4|AIR9_ARATH 187-kDa microtubule-associated protein AIR9; TrEMBL-Plants: tr|V7AY70|V7AY70_PHAVU Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0213500 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:51182139..51204236) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
TTAAAAATTTCAAGAAACCCTACCATACCCTACCCCACACCAAGTCACTTTCCTTTTTGGCTCCATTTTTCTACACCCTC GTTATTGGCTCCAGCTCCTCTGTCCCTCTCATCCCCCTTTTTCTTTTCTCCACCCACTACTACTCTCTCCCCCACACCCT CTCAAAACTCTCTCTATCACTCAAATTCACTTCCATCTTCTTCTGCTTCCTCTACTAGATCTCTTCATTTTCCAGGTACA TTGTGCCACTCACTCAGATCCAACCGTTTTCATTTTCAGTCCCTCATCTCCTTGCTATTTACGCTTCTTACCCTTTTTTG TTTTTTTGTTTTTCCTTTGCATGCAATTTTTAGTTTCTGTGAGTGTTGAAGAAGCTTCGCATATAAATGGAGGAGGCTCC GTTGGAGCAACCGCGTGAAGACGCTGCATCGGAGAACCGGAAGAGCTCCTCGGGAAGCGTGAAGGCTGCGGCGAGAATCG CCGCAACCTCTGGTGGTTCGGTTTCTGCAAGGAAGAAAGTGGAGCCTCGGAATGTATCGGGTTCGGGTGCGGGTACGAAG AGATCGGGTTCGATTGGCGGTTTGGCGAGTTCGGTTTCTGTGCCGCCGAGGCGGAGTAGTACTGGAGGATTGGTACAGAG GCCGTCGGTGCCGGATGGAAGTAGGAAAACGGTTGCTGAATCTGCTGCCGGCGGTCGGAGCAGAGTTTCTTCGGCGGCCG AGCCTGTGCGGAGGTCTTTGCCGGAGTTACGGCGGAGTTCGTTAGCATCGCCGCGTGGTGGTGTCACTGGGAAGCCGGCG GTCTCGCCGGTGAGTTCGGGTTTGAGGACGACCGCTGTGTCTGGTGCGAGTAAGGTGGAAGTTGCGAAGAAGTCGTTAAC TAAGCCGGCATTGTCGTCTCCGGCTTCTGCTTCTTCTTCGTCGAGGAGAATTGGTTCTTCGGCGGTTGGTGGTAGCGGTG 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GATCCCTCACATCCCATTTCCCATTCCTCTCTATGTCCTATGGGACCTCATTTGATCCACAAAAGTGTGTTTTTGTGGGA GAGTTTTCTGAATTGGATTGGAATCAGCTTCATGAGGACTTATCTCTTGGATTTCTCATGTAATCTGAAGCTACGTTGAG TTTTTATATGTTCTGTCTTTTATGAAATGCAGTTTCAGTTGTCAAAATCTTTTGTTTCGAAAGCTGAAATTTTTGAATGA TGACTTTGGAACTATTTTTCATATCTCTAACATGCTCTATGATTCAAGAGCACTCTGAATTTGAAATAGTATGATATACA CGCCCTTTTACCTTGTAATCAATTTCTTTTAATTTAGAAGAATTTAATAGCGACAAGGAATGTACTCATGCCATGTCATT GAAATTCTGTCATGCCATGGGCCAGTTCTCCTAGAAGCCAAGATGTTAGGTGGTGTGGCCTTGCGATGGCTTCATCTATC TATCTAAAAATTATATTTGGGGTGGTACTTATTGGTATTGCATTATTATCAGGAGAATGCTAGTTGCAAACTTGTAATGA TTCTTGTCAAGGCTCATTATTTATATCACATTGACATGGCTGCAGGTTTATTTCATCAGAAGTGGGAGACAATTTTACAT ATGATCCATTACCCAATCAGAGTTCTTGCTCCTATAGGGTGCGGCTCGAGGAAATTGGTCGTTGTTTGAAATGTGAGTGT GTCGTAACTGATGTATTTGGAAGACTGGGTGAGGTAGTATACATTGAGACAGCTCCTGTATTGCCAGGTAATTACTTTGA TTAAAAGGCATTATTGCTTTACAACTGTGCCAAGTGCCATCTTTTGAATTTTAAATAAAAAATAATATCTTTAGTCTGCC TAAATAGCCATAAATATAATTTTATGCTTCCTCCCCTTGGATCTGTCACTGAATGAGATTGAAAAGTCTAAAATGATGCT AGATGAGTGGAGAAGGACTTCAGCCGGATTCGTAAGAACAAGGGTAACATACCAAATTATGCGAATTGTAGGGTGATTAA GCTCATGGCCTTTCTATGAAATTAGGGAATTGCGAAATGACAACTAAGTGGATATTAGGATAATAGACCTAATATTGAAA ACCCATTTGGTTTTATGTTGGAGAGTTCAACCACGATAGTAAGATACTTGCTATGATGATTGATGGTTTGTGAATCATTG GTGAAGGCAACTGTGGGTAAATAACAATAGCCAGGCCACTGATGGTTCTCCTTCATTCCTATCATTTTTGTGTGAAATAG TTGCAGTTCTTTTGCTGGTAATGAAAAATTATTGGGGCCATTCTATATGGCACGATGGGTCAAAGAGATTAATTACATGA ACATGGTTTTAAGTTCAGTAATTTGTAGGTGGGTTATTTAATGATTTTGAAATTTAACAACCAACCAAACAACATTATTT GCCACTCACGATTGTTGTGCCGTGCAAAATTATTCTCCAAATTATTGCTACTTGATGGCCATTTATTTTATAATTAACTC TCTTGCAAGTTTTCTGCCTTACTTATATGTGCATTCTTAGGCATTCCTAGAGTACACAAGCTTGAGATTGAGGGAAGGGG ATTTCATACCAATCTCTATGCTGTTCGTGGCATTTATAGTGGTGGGAAGGAAGGAAAAAGTAGAATCCAGTGGCTTAGAT CAATGGTTGGAAGTCCTGACTTGATCTCTATACCAGGTATGCTAAATCTTTCAGTTTACTCAACTTTTTATTGTTGGAAG TGTTGAAAAGTACTTCAATTGAATTTCGATACATACGCCACATGGACTAAATTGCATATTTTCAAATTTTACCTTGTCTT GCTGTTTGATAATTGGGATGAGGGGTGTTCTGGTTCCCAACATGTCCAAGATCAAAGTTGAGATCCCTTGGTTTTGAGAA TAATTGATGATGCATTAATTTCTCAATTGACTTGGAATATATTTTTGGGTGCATGAATGGCCTATGTCGCAATTAAAGTG AATGGTCTTTCTCTTTACCATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGTTTTCTTC TTATTTTTGGGTTTTCCAGTTCGTTTCATGGTATATTATCCCCAAGATAAAAATATGGCAACAACATAGGGTTGTGCTTG AAATTTATGGCTTTCTCCACCAATCACCAACACTGAATATCTAATTAGAAATCCTAGAAAACATCAAAGAATCTCTCTCC GAAATTTATAGAAAATGCTCCTGGCTGTCCTGTCAAAGAGACCAAACATTCACTAAAGATTCTGTAAAGTTTAGACCAAA GATATCTTGTGACTGAACAGAATAGAAAAGTATGCTAGTCTCGGATAGACAGCTGCATGGTCAGTGACTTTGCTATGAAT TATTTTTATTCATGACCTTTTAAGGCTGTACTTTCGTGAATGAATCTTCCCTATTTTATCTCCATTGCTTGTACTACTTG TTAGATATCTTTGTTAGTCAAAGTTCTTTCCTATGGTTAAATTCCAGGGGAAACAAGCAAAATGTATGAAGCAAATGTTG ATGATGTTGGCTATAGATTGGTGGCTATATATACTCCTGTTAGAGAGGATGGAGTAGAGGGCCAATCAACTTCTGTATCC ACAGATCCAATTGCAGTTGGTAAGTTGAAAGGATTATGTATATGATATCATGGTTTAATATTTAAGCAAATTATCTTATG ACATTAGTAGTGATCTACTGTGAGTTGTGAAGCATTTGTTGGTAGGTAGTTTTTTATAAATGTAATTTTTAGATGAATAA GATATCTTATAGCATCTTGATCGTATCTTATAGTAATTAAGGTAATATTAATTATGGATTCTAAGATGGACAACGGTGTC AACTTCAACACCTGATGAATTATGAGACATGCTCGGATGTCACCTTCGAAACTTGTCGAGACAACATACCAAGGTTTGAC AAGAGTGTTGTTACCTTCAACACCTGATGATGACTGCATAGTGAGCTTGGATCACTAAATGTAACTGATGCGGATGTGGA GAGGACTCTGGTCAAAATATTTTAAAATAGTATCCCCTCATCTTGGACCTATGGGATAGGTCTAGACTGTCACTGGTACT AGTCAAGGTTACAAATATTCAAGGCCAAACAAATGGATCACTTAAATTAACAAGTGATCTTACTTAGTGCATGCACCTCT GTTGGATTATGAATTTGCTATTTTCAAAAACAAAAGTACAATTAATTGCAGTCCACTAATAATTCCATTTCGTAATCCTA GTGTTATGAGGCATAGGAATTCCGAGTAATTTGGCTGGGAAAACCACTGTCTAATCGTTTATTGTAACTTCAATTGCAAA CTAATCAAAATATGTCTGTGTTTATTTCTGTGCATAACACTTCAAATTTCTCTGTTATCTAGTGTCTTTGATGTTTTACC TCTTCATTTTGTAGATATGTTATAGTTTAGAATTTTTCAATTAAAGCACTTTTCTAGGAATTTGCACTCTGAAGGTGGGA ATTATACTGACCTTCAATTCCATGCAGAGCCTGATGTTCTTAAAGAAGTGAAGCAGCACCTTGATCTTGGATCAGTGAAG TTTGAGGTGGGATATATTTATTAGTTTGGTTTTATGGTCATTACCATATTTTGAAAATTTATTGTTGATTTGTATTTTCA CTACCACCATCACAAGGTACAGAAAGAATTAAACTGTGATGGATTTATGTGGATAATTAGTTATTACTGATTAATTGCAA ACCAGTGATTCTAGTCCAACTAAGTTGATGTTGCACTTGTTAGAACCAGAAACCTGTATAGATGCGGCCTTGATTTTTTA TCATACTTTTCTTATTAACATTTCTTACATTTTATATTCCTTAAGTTCATTGCTTGCCTTTCTTGACAGGTATTGTGTGA CAAAGACCAAGGCTCAAAAAAGGTACCTATATTATATAATAAACTTCTCATGATTTCATTTCGACCTAGAATGCATTCAT TTTAAAAGTGGTGGAAGAGCAAAAAGGACTAGCTTGTCCTATTTTTGATGTAATTACTATTTCAGATTTCATCAGTGGGG ACATATGAGAGACGAATACTTGAAATTAACCGGAAAAGGCTCAAGGTGGTAAAGCCTGCCACTAAGACTTCCTTTCCTAA TACAGAAATCCGTGGTAGCTATGCCCCTCCGTTTCACGTAAGTTTGAGTGACTTGAAAAATTCATTTCCCTCATCCACTA TGTCATTTTATTGCCAGATTATAGTTTCCTTGATTTACTTGTGTTTGATCTTTAAATTTATTAGGTGGAGCTCTTCAGAA ATGATCAACACCGTCTAAAAATAGTAGTGGACAGTGAAAATGAAGCAGACTTGATGGTGCACTCCCGACACCTTAGGGAT GTTATTGTTCTTGTGATTCGAGGACTAGCTCAACGATTTAATAGTACTTCCCTCAATTCCCTTCTCAAGATAGAAACATG ATTCTAAATTCTATTTTTACCCCTTTTCTTTTTACATTGTATAGTTGTATATCATCTGGGAAAAAAAGGTTTCTGAGGCC AGTTACCTCACATTTTGCTTGTCCTGAGTGCAAATGTTGTTGTTATGTTGAGAGATCAGCGATTAATGCCTTAATCATTG CAGGCATTGATTACTAGATCTGTGTGTTCACATTGATTGGACAATCACCATTTAAGGTTTTGCATTAAGAATTTCGTGTA TATTTTGGGTCATGACAAGGGGAAGGGTTTGTTAAACAGAAATGCTGAATTTTACGAAAAGAGTAGATTGACGACCAAAG GCAAGAAACTTACGTGGC
CDS sequence (LotjaGi6g1v0213500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGAGGAGGCTCCGTTGGAGCAACCGCGTGAAGACGCTGCATCGGAGAACCGGAAGAGCTCCTCGGGAAGCGTGAAGGC TGCGGCGAGAATCGCCGCAACCTCTGGTGGTTCGGTTTCTGCAAGGAAGAAAGTGGAGCCTCGGAATGTATCGGGTTCGG GTGCGGGTACGAAGAGATCGGGTTCGATTGGCGGTTTGGCGAGTTCGGTTTCTGTGCCGCCGAGGCGGAGTAGTACTGGA GGATTGGTACAGAGGCCGTCGGTGCCGGATGGAAGTAGGAAAACGGTTGCTGAATCTGCTGCCGGCGGTCGGAGCAGAGT TTCTTCGGCGGCCGAGCCTGTGCGGAGGTCTTTGCCGGAGTTACGGCGGAGTTCGTTAGCATCGCCGCGTGGTGGTGTCA CTGGGAAGCCGGCGGTCTCGCCGGTGAGTTCGGGTTTGAGGACGACCGCTGTGTCTGGTGCGAGTAAGGTGGAAGTTGCG AAGAAGTCGTTAACTAAGCCGGCATTGTCGTCTCCGGCTTCTGCTTCTTCTTCGTCGAGGAGAATTGGTTCTTCGGCGGT TGGTGGTAGCGGTGGTTCTGCTAGGAGGACGGTTTCGAATGTCTCCTCGCCGTCATCGTCAGTGTCATCTGCACGTTCGG CCTCTGGGGGGTTGAGAGCGGGCTCGTTGTCGTCGTCTTCGAAGGATAGGAGCTCTGCTCTGCCTGGAAGGAGGAGAGTG GGAACTCCTGACAGCCGTGATTCGCGGTTCGTTGTTCTTCCGCAGATTGAGATTAAGGCCAATGATGAATTGAGATTGGA TCTTAGGGGACACAGGGTTCGCAGTCTCAATGCCAGTGGATTAAACTTATCCTCAAACTTAGAGTTTGTATATCTCCGAG ACAATCTTTTGTCTACCCTGGAAGGAGTAGAAATATTGACGAGAGTGAAGGTTCTTGATTTGAGTTTTAACGATTTTAAG GGTCCTGGATTTGAGCCACTTGAGAATTGTAAAGTACTGCAGCAACTCTATCTTGCTGGAAATCAAATCACATCATTGGC TAGTCTTCCGCAGCTTCCTAATTTGGAGTTCCTCTCAGTAGCTCAAAATAAGTTGAAATCTCTTGCTATGGCAAGTCAAC CTCGACTCCAGGTCTTAGCTGCCAGCAAAAACAGAATTTCTACGCTGAAGGGATTCCCATATTTACCAGCTCTTGAGCAT TTGCGAGTGGAGGAGAATCCTATACTTAAGATGCCTCATGTGGAAGCAGCCTCAATATTGCTTGTTGGGCCTACTTTGAA AAGATACAATGATAGAGACCTTTCTCGTGAGGAAGTGGCAATAGCAAAGCGTTATCCTGCACATACAGCTTTATGTATTA GAGATGGTTGGGAGTTTTGTCGCCCTGAGCATGTTGCAGAGTCAACTTTCCACTTTCTAGTTGAGAAATGGAAGGACCAT ATTCCTCCTGGGTTTCTCCTCAAAGAAGCTTCAATAGATAAACCTTTGGAAGAAGATGTGTGTAGCTGTCACTTCACAAT TATTCATGATGGTGCCTTGAGTACAGACCTGCCATTAATTTTAAAATATCAATGGTTTTGTGGTGATGTAACTCTTTCGA ATTTTTTCCCTATTCCAGATGCTACTGGTGAGATTTACTGGCCAAAGCATAATGACATTGGAAAAGTTTTGAAAGTGGAA TGTACTCCTGTTTTAGGAGAAACAGAATATCCTCCTATATTTGCCATCTCTTCTCGTGTTTCACCAGGGAGTGGAATTCC AAAAGTTGTCAACCTTGAAGTGCACGGAGAGCTGGTAGAAGGAAGTATAATCAGGGGTTGTGCTAAGATTGCATGGTGCG GTGGGACTCCAGGAAAAGGTGTTGCTAGTTGGCTGCGGAGGAAGTGGAATAGCACTCCTGTTGTCATCGCTGGGGCGGAA GATGAGGAGTATCAGCTGACCATTGATGATGTTGATTCAAGTTTAGTTTTCATGTACACGCCAGTAACAGAAGAAGGTGC CAAAGGAGAACCTCAATATAAATATACAGATTTTGTAAGAGCTGCTCCTCCCTCTGTCAGTAACGTAAGGATAGTCGGAG AGGCTGTTGAGGGAAATATTATCAAAGGTGTTGGTGATTATTTTGGTGGAAGGGAGGGTCCCAGCAAATTTGAATGGTTA CGGAAGAACAGGGACGTAGGAGACTTTCTATTAGTGTCAGCTGGTACATCCGAGTATACCTTGACCAAAGAGGATGTTGG TTGTTGCTTGGCTTTTGTATACATGCCAATTAATTTTGAAGGTCAGGAAGGAAAATCTGTGTCAGTAATGTCTCCTGCTG TGAAACAAGCACCCCCAAAAGTATCAAATGCCAAAATAATTGGTGATCTACGTGAGAATGGCAAGATAACTGCTACTGGT ATTGTAACTGGAGGAACTGAAGCATCTAGTAGAGTTCAGTGGTATAAAACATGTTCATCAATTTTGGATGAAAACAGTCT TGAAGCATTAAGTACTTCCAAAATTGCTAAAGCATTCCGCATACCTCTTGGAGCTGTTGGCTGTTACATTGTTGCAAAAT TTACACCAATGACTCCTGATGGTGATGTCGGTGAACCTGCATTTGTGATATCTGATAGAGCAGTTGAGACTCTTCCCCCG AGCTTGAATTTCTTATCTATTATTGGAGATTACTGTGAAGATGGAATATTGACAGCTTCATATGGATATGTTGGAGGCCA TGAAGGAAAAAGTATATATAATTGGTATATTCATGAGGTTGAAGGTGATTTAGGTTCCTTGATACCAGATGTTTCCGGTC TTTTACAGTATCGTATTGCCAAAGAAGCCATTGGAAAATTCATCTCTTTCCAGTGTACTCCAGTACGTGACGATGGCGTT GTAGGTGACCTTAGAATTTGCATGGGCCAGGAGCGTGTTCGTCCTGGAAGCCCGCGATTGCTTTCTTTACACATAGTTGG AAATGCTGTTGAAGGAACAATGCTAAGAATTGAAAAAACATATTGGGGTGGTGATGAGGGAGATTCAATTTACCGCTGGC TTAGGACCAGTTCCGACGGTACACAAAGTGAAATTACGAGTGCCACCACTTCGTCATATGCACCTTCAATTGATGACATT GGCTTCTTTATTTCTGTCTCATGTGAGCCTGTCCGAAGTGATTGGGCTCGTGGACCCATGGTTCTTTCTGAACAAATTGG ACCTATAATACCTGGACCCCCAACTTGTCATATTCTGGAATTCGTTGGATCCATGATAGAGGGGCAGCACTTGAACATGA ATGCCGTGTATAGTGGAGGAGAGAGAGGAGAATGCACCCATGAGTGGTTTAGGGTAAAGGACAATGGTGTACGAGAAAAA ATAAGTGGTCATGATTTTTTGGATTTGACTCTTCAAGATGTCGGTGCATGCATTGAACTACTCTACACCCCTGTGTGCAA AGATGGAAACAAAGGCAGTCCAAAGAGCATAGTATCTGATATGGTTTCTCCTGCGGAACCAAAGGGAATGGACCTTGTCA TTCCTGACTGCTGTGAAGACGAAGAGATTACCCCATTGAGAAAATATTTTGGTGGACATGAAGGAGTTGGAGAATACATT TGGTATCAGACAAAAAATAAGCTTGATGGATCTGCACTATTAGATATAGCTAATGCTTGTGATGCTGAAATATGTGGGAC AGAGCCAACGTATAAACCATCACTTAAGGACGTTGGAACTTATTTGGCCTTGTATTGGGTGCCTACTCGTGCGGACAACA AATGCGGGGAGCCATTGGTTGCAATATGCAGTAACCCAGTTTCTCCTGCTCCTCCAATAGTTTCTAATGTACGCGTGAAA GCGTTGTCTTCGGGAATTTATTCTGGACAAGGTGAATATTTTGGTGGATATGAAGGAGAAAGCCTCTTTAGCTGGTATAG AGAAAATAATGAGGGAACCATTGAACTGATTAACGGGGCAAATTCTAAAACCTATGCAGTTACTGATTCAGATTACAGTT TTCGTTTGTTGTTTGGATATACACCAGTTCGATCAGATTCAGTTGTGGGAGAACTCAGGTTATCTGATCCAACTGATATT GTGTTCCCAGAGCTCCCATACGTGGAGATGATTGCTCTGACAGGAAAGGCAGTTGAAGGCGACATACTTACAGCTGTTGA AGTGATTCCTAATAGTGAGATTCAACAACATGTTTGGAGCAAGTACAAGAAAGATATTAGATATCAATGGTTTATTTCAT CAGAAGTGGGAGACAATTTTACATATGATCCATTACCCAATCAGAGTTCTTGCTCCTATAGGGTGCGGCTCGAGGAAATT GGTCGTTGTTTGAAATGTGAGTGTGTCGTAACTGATGTATTTGGAAGACTGGGTGAGGTAGTATACATTGAGACAGCTCC TGTATTGCCAGGCATTCCTAGAGTACACAAGCTTGAGATTGAGGGAAGGGGATTTCATACCAATCTCTATGCTGTTCGTG GCATTTATAGTGGTGGGAAGGAAGGAAAAAGTAGAATCCAGTGGCTTAGATCAATGGTTGGAAGTCCTGACTTGATCTCT ATACCAGGGGAAACAAGCAAAATGTATGAAGCAAATGTTGATGATGTTGGCTATAGATTGGTGGCTATATATACTCCTGT TAGAGAGGATGGAGTAGAGGGCCAATCAACTTCTGTATCCACAGATCCAATTGCAGTTGAGCCTGATGTTCTTAAAGAAG TGAAGCAGCACCTTGATCTTGGATCAGTGAAGTTTGAGGTATTGTGTGACAAAGACCAAGGCTCAAAAAAGATTTCATCA GTGGGGACATATGAGAGACGAATACTTGAAATTAACCGGAAAAGGCTCAAGGTGGTAAAGCCTGCCACTAAGACTTCCTT TCCTAATACAGAAATCCGTGGTAGCTATGCCCCTCCGTTTCACGTGGAGCTCTTCAGAAATGATCAACACCGTCTAAAAA TAGTAGTGGACAGTGAAAATGAAGCAGACTTGATGGTGCACTCCCGACACCTTAGGGATGTTATTGTTCTTGTGATTCGA GGACTAGCTCAACGATTTAATAGTACTTCCCTCAATTCCCTTCTCAAGATAGAAACATGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0213500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MEEAPLEQPREDAASENRKSSSGSVKAAARIAATSGGSVSARKKVEPRNVSGSGAGTKRSGSIGGLASSVSVPPRRSSTG GLVQRPSVPDGSRKTVAESAAGGRSRVSSAAEPVRRSLPELRRSSLASPRGGVTGKPAVSPVSSGLRTTAVSGASKVEVA KKSLTKPALSSPASASSSSRRIGSSAVGGSGGSARRTVSNVSSPSSSVSSARSASGGLRAGSLSSSSKDRSSALPGRRRV GTPDSRDSRFVVLPQIEIKANDELRLDLRGHRVRSLNASGLNLSSNLEFVYLRDNLLSTLEGVEILTRVKVLDLSFNDFK GPGFEPLENCKVLQQLYLAGNQITSLASLPQLPNLEFLSVAQNKLKSLAMASQPRLQVLAASKNRISTLKGFPYLPALEH LRVEENPILKMPHVEAASILLVGPTLKRYNDRDLSREEVAIAKRYPAHTALCIRDGWEFCRPEHVAESTFHFLVEKWKDH IPPGFLLKEASIDKPLEEDVCSCHFTIIHDGALSTDLPLILKYQWFCGDVTLSNFFPIPDATGEIYWPKHNDIGKVLKVE CTPVLGETEYPPIFAISSRVSPGSGIPKVVNLEVHGELVEGSIIRGCAKIAWCGGTPGKGVASWLRRKWNSTPVVIAGAE DEEYQLTIDDVDSSLVFMYTPVTEEGAKGEPQYKYTDFVRAAPPSVSNVRIVGEAVEGNIIKGVGDYFGGREGPSKFEWL RKNRDVGDFLLVSAGTSEYTLTKEDVGCCLAFVYMPINFEGQEGKSVSVMSPAVKQAPPKVSNAKIIGDLRENGKITATG IVTGGTEASSRVQWYKTCSSILDENSLEALSTSKIAKAFRIPLGAVGCYIVAKFTPMTPDGDVGEPAFVISDRAVETLPP SLNFLSIIGDYCEDGILTASYGYVGGHEGKSIYNWYIHEVEGDLGSLIPDVSGLLQYRIAKEAIGKFISFQCTPVRDDGV VGDLRICMGQERVRPGSPRLLSLHIVGNAVEGTMLRIEKTYWGGDEGDSIYRWLRTSSDGTQSEITSATTSSYAPSIDDI GFFISVSCEPVRSDWARGPMVLSEQIGPIIPGPPTCHILEFVGSMIEGQHLNMNAVYSGGERGECTHEWFRVKDNGVREK ISGHDFLDLTLQDVGACIELLYTPVCKDGNKGSPKSIVSDMVSPAEPKGMDLVIPDCCEDEEITPLRKYFGGHEGVGEYI WYQTKNKLDGSALLDIANACDAEICGTEPTYKPSLKDVGTYLALYWVPTRADNKCGEPLVAICSNPVSPAPPIVSNVRVK ALSSGIYSGQGEYFGGYEGESLFSWYRENNEGTIELINGANSKTYAVTDSDYSFRLLFGYTPVRSDSVVGELRLSDPTDI VFPELPYVEMIALTGKAVEGDILTAVEVIPNSEIQQHVWSKYKKDIRYQWFISSEVGDNFTYDPLPNQSSCSYRVRLEEI GRCLKCECVVTDVFGRLGEVVYIETAPVLPGIPRVHKLEIEGRGFHTNLYAVRGIYSGGKEGKSRIQWLRSMVGSPDLIS IPGETSKMYEANVDDVGYRLVAIYTPVREDGVEGQSTSVSTDPIAVEPDVLKEVKQHLDLGSVKFEVLCDKDQGSKKISS VGTYERRILEINRKRLKVVKPATKTSFPNTEIRGSYAPPFHVELFRNDQHRLKIVVDSENEADLMVHSRHLRDVIVLVIR GLAQRFNSTSLNSLLKIET
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 17 | 17 | - | – | |
| MobiDBLite | 1 | 246 | 246 | - | – | |
| PANTHER | 9 | 1699 | 1691 | 0.0 | – | |
| PANTHER | 9 | 1699 | 1691 | 0.0 | – | |
| MobiDBLite | 53 | 85 | 33 | - | – | |
| MobiDBLite | 167 | 231 | 65 | - | – | |
| Gene3D | 253 | 343 | 91 | 2.0E-13 | ||
| SUPERFAMILY | 265 | 418 | 154 | 2.62E-26 | – | |
| ProSiteProfiles | 286 | 307 | 22 | 7.027 | ||
| ProSiteProfiles | 308 | 328 | 21 | 4.678 | ||
| ProSiteProfiles | 332 | 353 | 22 | 8.636 | ||
| Gene3D | 344 | 443 | 100 | 2.6E-13 | ||
| ProSiteProfiles | 354 | 374 | 21 | 5.271 | ||
| ProSiteProfiles | 375 | 396 | 22 | 6.88 | ||
| ProSiteProfiles | 397 | 418 | 22 | 5.109 | ||
| Gene3D | 976 | 1055 | 80 | 5.8E-9 | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
| GO term | Namespace | Name | Definition | Relationships |
|---|---|---|---|---|
| Molecular function | Protein binding | Interacting selectively and non-covalently with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). |
Expression pattern of LotjaGi6g1v0213500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…