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Field | Value |
---|---|
Gene ID | LotjaGi6g1v0228500 |
Transcript ID | LotjaGi6g1v0228500.1 |
Related isoforms 1 | |
Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
Description | Serine/arginine repetitive matrix protein 2 isoform 1; TAIR: AT4G29790.1 serine/arginine repetitive matrix protein; Swiss-Prot: sp|C6BYK9|ISPG_DESAD 4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase (flavodoxin); TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2RAW0|A0A0B2RAW0_GLYSO Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0228500 |
Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:53443344..53454881) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
AATACATTGCCGATCAAAACACCCTCAGAGCCTCTTCGCCCACCATGGCTTCGTAGGATTTGGAGCTCCGAGCAATATCA AATTCTCCCACGCTGTTTCGATTTTTTCCCCCCAATTTTCCCAAATTCGCAACACCATTTCAAGATTCAAGGTATATCAT TGTTTCTGCGCATCACAAAATTTGATTTTGCTGTTTAATTCAACTTCTAGGGTTTTGATTTTGGGATTTTTATTGCTTTT CCGCGTTTTCAAGGTAGTTCCTAATTTCAATTTTTCATTTTTATGTATTGATTTGAAATTTAGGGTTTCTGTATGTTCTT ACTCCTCTCTGTATCTGTTTTATTTTTTTTATGAACTTTCTAACGAACTAAAATTGAGGTTGTAGAGGAAAAATAGTGTC TTTATGCTTGGTTTTGTCAGAACATGAGTTAGAGAAGTTATGTTCAATGTTGTTGTTGATAGCTGCATGTTTTTCCATTT TAGTTTTTTTATTTTTTATAATATGGTTATTATCAGAACAATTTATGTAGTAAAATTTGAAATGAAAAAAACATTCTTTG AGCAAAAGGAAACTTAGGAAATGGAGGCATAAGCAAATGTTAATATAGGAGCAGGAATATGATGATGAAGTGTAGTTAAT GAGGTCAAGATTTGTGTTTGAAGTTCAGATGGTAACTTGGTAGTTGCAGCAATTAGTGTTTGAAGTGGAGAAGGTATGTT ATGAACTTTCTGTAGTAATTGGATTGCATAGAGTTGTTATTATTTGTCAATATAATTTAGATTTCATCTAGATGCATTAT CGAGCATTTATGCCAATCGAATTGCATTTCTGTATGTAGTTATTAGACTTCCATAAGACAAGTTTAGTTGTGCATTGATT GATTATGGGGTCAATCAATATGACTTGCTTGAGTGTTGAGATGAGCTTGCTTGTCTGTTGTCTGTTGATTTTCTTGTGGT GATTAAATTTAAACTTGAAGTAGTACTCTATGATGAGAGCTGACACTGTTGTCATACAAGAATGAGGACAAGGTCCCATA TGGGGCTGAATCCCAAGCCTTTATGTTTAGTATGCGCATGAATATCTATATCACAGCCATGAGTTTGATTTTTCTGTGTT ATTATTTTGATCCTTTCAGGTAGATTATCCAATTGTTCCCTTGGAATTTGCATTTGCCCTTTATGTGCTATAGCACCACG TCTTTGTCATGCACCACTCTCTGTTCTATATTTTTCGCTATAAGAATGTGCTGGAATTAGTGCAATGGCAACATCCGCCA AGTTTGATCTATCTTCCAGAAGCCCAGATAGACCATTGTACACTGGGCTGCGTGGATCCCACGTAGCTGGTTCCTTAGAT AGATCGGGTAGCTTTCGTGAAAGCATAGAAAATCCAAATCTGTCGACTCTTCCAAACATGTCTAGAAGCAGTTCTTCAGC AACACAAGGGGATGTAATGAGCTTCTTCAATTGTGTGCGTTTCGATCAAAAGTTGGTAGCTCCAGAGCATAAGTCTAATC GTCAAACAGATTATAAACGACATGTCAGTGCTGCTTTTGGAGTTTCACCTGATGAATCTGCTTCTAGTTCTGTAAAAGGC AAGCAATTGCCATCCCCAGCACCAGAAGATATCAAACGACTCAGGGATGGTTTACACGCAAACTTTAGAAGGGCAAGGTA GTTCTTTGTATGTTTTGCTACTTGCAATAAAGTGAGAGTTGTTTAATAACATTGTATAACTCAACAGGGAGCGTGCTAAA ATGTTCAGTGAAGCCTTATCTAGATTCAACAAAGATTTCCCAAATATAACTTCAAAGAAGAGATCTCGGGCCGAAAGTTT TTCTACTGACCGTTCTAGTTTCATGTTAAGTGATCGGTCTGTCTTGGGGCCGAGCATAAGTAAGGTTGGAGTTCAAGGTC ATCCTGTCACAGGTGGTTTTGAACACGAGCAGCAAAAGTTAGAAGAAAGAACCAAAACTGTTGTCCCAAACAAGCGCACT AGAACTTCTTTGGTTGATATAAAGGTATGTGTCTTTACTTTCTATTGAGTTTATTTGCGGGTATTAACACAAATTTTCTC ATCTTTTTATGCCTCTTAATGCTACTCATTTTTGTTTCTTGCTGTTATCATGTTAATACTTAATACTACATGGTTTTAAA TAGTACATAGCTATATATACACAGATTGTTGTAAATTTCAAAGTGTTCCTTATATCGTTGTGTGAATGGGAAGCCTGTTT TAAGTTTTTCTTTCCTAAAGTTTCCTAATAGAATGCTTTCACTCAGGTTCTCTTGTGGAGGTATACTGCCTATTGTGTAG AAATCTATGATGAAATCCTTCCGTATGTATGTTTATTATGTAAATTGTCTTCCACCATTAAGGTTGTATCTATGTCTTTC ATGAATTCTTATGTCTTTTTTGTGTGTTGTTTGATTGATTATATGAAATTGCCAAACTACAGAGTATTCTATTTGGCTTA CAGTTTTTCTGGTCAAGCAAATCATGTGAGAATGTCTTGTGGCTTGATAACTTTGTTTTTAGTTGTTCTATGTTTATATT GAGACTCAGATTTCAGATTAACTGGGTATGCTTTAAAATCTATTGAGCAAAACTGACTTGGGTTTGATAAATTAGATGGA TGTGCGGACTACTTCTCTTGTCAGGCCATCTGGGACTGTAGACAGAGATAAAGAAATGCTACGGGTTGTCAATAATGGCG CGGTCCAGGGTGAGGAACGAACTTTACCGATTGGAGGTGATGGTTGGGAAAAGTCAAAAATGAAGAAGAAGCGTTCTGGC ATCAAACCGGATGGATCTTCAAGTCCAGCATTGACAAAACCTGTTAATATTTTCCAGGAAACTAAACAAGGAATTCAACA 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AAATTACAAGTTTCTTAACTATCATTATTTCATTTTGGTAATTTGTTACTGGTTCGGTACTCATTAATGCTAGATAATAA GATGCTAAATTGCAAAAGATACCTCAGATTAATATAATCACATTAGATACATCACAAAACATGAATCACAGAAGATACAT CACATAATATGATTTACCTTTTATGCGTAAGGATAACAACCACGTGTCATTCCAATCCTAATATTAATTCCCTGCCTTTT ATGTATATTATGCAATATATGGATAATAGGAAATTAAATAAATAAAAGATTCGTTGGCGCTTGCTGTTCATATATATATA AGGGTGCTGTAAGGCTTCAAACCCATCTATAGCTAAAGTACAGAGAATATTGTTGTGAGGGATTCTGCATAGTTATCTCT GATCTTAAGGATTGTCGATGGAAGATATTGTGTAACTAGTCTTTTTCTTTTGTTCTTTTTTATATAATTCCTGTTTATCT TTCTATGATATAGGCTATAAATTTGATACTTCCCCGTATATTTGTCTAGGCCAGGAGTTTCTAATGGATCTGTCGGAGCT GGAAAACCAGACGCCATCTCTCAACAAACTGGGTTGGGGATACGCGTCTCTACCCCTAAAATTGATCTGGACAACAATTC TGCTGTCAATGAGAGGCGGGATCGTACTGTCCATTCAGACAAGGAAAGGGTGAATTTCAGAGCTGTTAACAAGTAAGCAC GCTATGGTGACCTTTTCTTCTGCTTATGATTTCTTACTTTTGAGAAGAAAGTTTTCTTTTTTTTGCTTGGCAATATTTTT TTATTTGTTCATGTTGCTTTCTCCTTTTCTCTTGTTATGGTTGGGTTGTTCATTTGCTCCCTCCATGTGTTATTAGTTCC CATGGATTGTGATTTATTGTGACATTTATTTTGTAATCGTAAATCGATAATTTAATAGGTGTTTTGTGACAATATTGGGG TTGTTTGATTCCCTTCTTAGTTTTCTGAATTCAAAAATCATTTTCAAAAACAATTTTCAAAACCTGTTTGTCAGAAGAAG AAAAGAAAAGAACAGTTTGAACGAGATGTTTTGCATTGTTGAAAGACCTGTGAATTGAAAACTAAAAACAAAAACAGAAA ACATCTCTGAAATGTTTTGGGATTTTAGTTTTAAAACCGTAGATAAGAACTGTTTTAACAGTTTTTAGCAAACAGGCTTT TCTTTATCTATTTTTTAAAAACTAAAAATTGTTATACAAAACAGTGTTTGGCTTTTGTATGGTGTAAAGCACTTGATCTT TTTAAAAGGGTATCCCTTACAAATATGTTGAGGGATTTGGTATCTTTACTAAGGTGGTGTTTATTATTCCTCGATTATTT TTCTTTTCTCTTTCTTAAAGGACGATTGCTTATCTTCCTTTAACTTTGCATTCTTCTCTCTGACTTAATAAAATTATAAT TTCATAAAAAATATTCTTTAATTGATTTAGACGTTTTATTTGTTCTATACCCAGGGCAACTGTTCGTGATGAATATAATT CAGCTAGTCCTAATTCAAGTGCAAAAATTAATACTATTCGGGCACCACGATCAGGTTCGGGAGTTGCCCCGAAGTTGTCT CCAGTTGTCCACAAAACAGCGGTTCCCAATGATGGGGAACTGTCTCATGGTAGCCCCAAGCCCCCTGCTGGTGCTGGCAC TACCAATCGCAAACGTGCGGCATCAGCACGATCATCTTCCCCACCTGTTGTCAAATGGCAGAGGCCGCAAAAGAGCTCCC GCACTGCCAGAAGAACAAATTTGGTGCCTGTTACTTCAAGTAATGACGATTCCCCTGCTTTGGATTCTGTATCTGATGTG ACTGGCAATGATCTTGGGTTGGGATTTCCCAAACGTTTGACTGGCAGTTCTCCTCAGCAAATCAAATCAAAAGGGGAATC 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GGAGTCTTTCTTCAGTTTGATAACTGAGGAGGATATTACTTACTGGAAACAACAGGTATTAATCTTTACCTTTTTAGTGT TTATGAATCATGATTACTTTGCGATTTTTCTTTATTAAGAGTTTGTGTTGGATCATTGGTCAGCAAGGTTCTCTTCACAC TTATGTTCAGTTCAAAATGCTTCAGATTTGTTGTTATCCATAATAAATAGCACTGATGCAACCTTTCGTTGATTATTCAA GAGTTAGATTTTTTTTTACTGTAGGTCCTGATGTTATAAAAACCATGTGGATCATGTTATTTGTTGTATTATGTTTATTC CTTATATTTTTTTTTCTTCACAATTTGATATATATTAAAAAAACTCCTCCAGTCTTGTATAAATTGTTTTAAGTTATTAC TTTTGATTATAGCATTATTTGATTGATCTGAATTTCTTGGACATACCTGTCATAGGAATAATTGATTCAAATTTCTTTAA TAACTCGTTCATATTTCAGACAAATATTGAATCAAGCCCATTGATGCCAACTCCAGTACCTTCAAATATAGATGATTGTG AAGCTGTTGTTAATGGATTTGGGTTGGCTAGATGTGAAAGCGATATTGGACATGGTGCTGAAAGGGGTGCTGGAATTGTT ACAGAACAGTTACAACTATCTAAAGGAGATCGTAATGTAATTCCCCTCAGTCAAAGGATGATATCTGCTTTAATTTCAGA GGAGCGTGGTAGTGAAAATGAAGATTACAAGTTTGATGTGTGTGATAAGGAATTTGAGGCAGATGAGGAGTTGGAACTGA GCAGTTTGGATCCCTACCTACGAGCTAATGATCAGTTTGCATGTCATTCTGCTTACAACGGTTATAGGATAACTGGGAAG CGAAAACATGTTGATACAGAAAATGATATTTCATCTCCTGACTTGAATTCAAGCCAGCCTACCTTGACCTGTTCAGGGTT GGAATACAATACCTTGGATTTGAATGAAAAGCTTCTCTTGGAGCTTAAAAGCATTGGAATTGCCCCAGAACCAGATGTAT GTTACCTTTCTAAGAACTTCTCTGCTATTTTTCATGAGATCTCATCATTCTTGAACCATGTTAAATATCAGATTTGATAA AACTATTCTGTTGTGTCTATAGTCCGTCCAATTGTCTGCTGACCAGTAGACCTAATGAATTTAATTCAAGATGTTCTGTG TTATTGACTTACTGTGAAATCTTTAGTTTGTCTATGTAATACTTATTTTTTTCACTTTTATTTTTCAAGTCCGGAACGTC ACGAACAGATGATGAAGGAATTTGTCAGGATATCACTAGGTTAGAGGAGGATTACCAAAAACAGGTACGCACCGATGCCA AGTTATAATGTGCTAACTGCTAATCGTTGAGTTTAATTTTTTTTGTTTCAAACAACTTTTTATCTGATGTAATTTTCAAG TAATGGATATTTAAGTATTGATTTCCAAGTTTATGGTAAATATATGGATCTGGTTTAGAACCTGACATCCTGTTCACGAA TATCATTTCAAACTTACTGAAGTTAATGTTGATTTTTGTAATCCATCGTACGCTTTTATTTTCATGTGTATCATAGATGT GCAAGAGGAAAGGCATGCTAGATGGATTGGTGAAATCTGCCTCAGTGGCCAAAGAACTTCAAGAAAAGTAATTTCACTGC CATTTGTGCCCTGATTATTTTCTTAATTTAAACTTTTGTGGCTCATTGTTCTGAATGGAAATATGAAACTTTTGTGGCTC ATTGATACACAGGGATTTTGAACAACGTGCTCTGGACAAACTTCTTGAGATGGCTTATGAGAAAAACAAGGTAACCTTCT TAATGTTCAATATCACTTTTTATATATAACCGTCTCTACAGTTTCAAATAAATTTTTAACATTCCAGCCTAGTCAAGTAT CAAGACCTATAGTTGTATTAAAGTAGTTGAAAAGACTGGGGATTTTTATACCAGGCTAATGGGTAGCATGTAGAATGAAG ATATGGTCTATAACTGTCATAGGTTTAACTTATAAGTACAGGACGGGAAGTGGGAAGAGACACACATCAAAGTGTGCAGG ATTTTCTGATGTTTGTATGTAGCCTTAAATGCAGCTGTTAGAATGTATCATACACCTATAAATGTTGATGATCCCATTGT CCTTATAAAACATGGAGGGTTGAGGTTGTTTGCAATATGAAAAAGCCAGTTCGCAACAGGATAGCAACTCTCAATCTTGA ATCACTCTGCTTTTCTAATTCAAACGTGTGACATGTTTGCCCTATTCTTAGTTTAGTGTTTTATCAAAGAAACCACAACT CATGCTGTCTTATTATCTTGTATAAAATACTTAAATTTTCTAGGAAGAGTCAAACACTCCATTGCCAAATAAATGCCATC AAATTAGAAAATTATCTGAACTTTAAATTAAGGTTACAGTTACATGGCAGAGTGAATTGACAATAATTGATTGGCAGGGC TGTCGGCGTCCAAGTTCCTCAAGTGCAAAAAGTGCAAGCAACAGATTGGCCAAGCAAGCTGCGCTTGAATTTGTTAAGCG TACATTGGAAAGATGTAAACAATTTGAAGATACAGGCAAGAGCTGCTTCAACGAGCCCAAATTCAAGGATATGTTCCTTG CTGCTTCTTCCCAGCTGAGCGCTGTTCGGCTAGTTGAAGGCACGGAGACTGAATCCACAAAGCCACAAGCTTCTCCCTTT TCTTCTGAAGCAAGAACAGGTTTCTTTTTCATTATCCTCTCATGTACATGCTCCAATGTATTTTTCTTAGTTGTGTTCTG TATGATCATTTTAGCCAAAATCGTAAATGGCTTTATTGTAAATGTCATATTCTTTGTGGACAATCCTTTGTCCCCTATCC TTAATAAATAATGCCAACTAAGGCATAAGGTACTGACAGCTAAGGAAGAGCTAACTGCCAACTCATAGAGGTGTAATTTT TATTGGGTACGAAGTTGATGACCTTGGGAGGGGAAGATGATTTGAATCCCTTTGCCTGAACGTTACTTCAAGTTTTATGT TTTTTTCCTTTTGTACATTGAGTACAGGCTGAATTTTGATATTTAAGTTATGTGTTTTTTTTTCTGCAGGTTATGTGGCT TCACGGCAGTGTCCTTCACTATTTAGTCAAAATATGAATAACCATGATATCAATTCACCAGATATTCTTCCAGCTATAAA TAACTCATCCAAACAAACTAGCGGGAAGGAAGATTTTTGGTCAAACAGGGTGAAGAAAAGGGAATTGTCCCTTGATGATG TTGGTGGTACTTCAAGTGCTCCATCAGGAGTTGGCGGTTCGCTATCAAGCAGTGCAAGAGGGAAGAGGAGTGAGAGAGAC AGAGATGGAAAAGGGCAGAGCAGGGAAGTGCTATCCAGAAATGGAAATACCAAAGTTGGCCGGCCAGCATTATCTAATGC TAAGGGAGAAAGGAAACCTAAATCTAAGCCTAAGCAGAAAGCATCTCAGCATTCTGTTTCTGTAAATGGCCTCCTTGGCA AGCTATCAGATCATTCTAAACCAGAGTTGCCTTCTGTTTCGAAGTCTAATGAAATGTCTACTAACAGCAATACCAAGGAA AAGGGTGTGTTTGGCTCGGGTGAATCGGATGACCATGAGCCTATTGATCTCTCGAACCTGCAGCTTCCTGGAATAGATGT ACTTGATGGCCAAGGTCAAGATTTTGGTTCATGGTTGAATATTGATGACGATGGATTGCATGATAATGACTGTATGGGCC TTGAAATTCCCATGGATGACCTTTCAGACTTGAATATGACATTATGATAGTTTAAACTTCTTTGTACAGCAGCTTTCTAT ACCAATGACAACGGAAACAAAGTACTTTTAAGAAATGACTAGTTACATAGGATAGTCTTATGGCTAATCCTGGCCTCAAT TAGGTTATATAGATTCTTTGGTAGACTCCCATCTCCTAGTTGTTTTTTGAGTGACCTTTTCAACTGTTTCGGATTTTGCT AGTGTCGAAGTTCATAACTTCCTCTGTAAAGATCTTTCTGTTGAAGGTACAAGTTAGTGTTCCCAGTGATTATGTTAATA AACATGGTCCTGGTTGTAGCAGTTACAAATCAGACAGTAAGGCCTTTGTACATACATTTGATATTTCTAATAAAATCAGC TTTCATTTACTGAATTGCTCTGGCTGGCTACTCTCCGCTCCCCCCACCCCACCCCCTACACCCCCTAAAGGTTCTATTTG GTCATTTGTGTTTTGCAGATGCACCTTTTCAACATGATTCAGGCTCAAGCACATTTTCCCGAGGCTTTCAATGAAAAATT GAGAACTGATGTAACAGTGACCATCTTCTGTGTTTTACCAAATAATGAGGCACTGCTCTTTACACTTTGTCCAGTTTCTG TCCTGCTTATGATTTGTATATGTGAAACAAGTTCTTGTTACTTATCATCACTCGGCCATCTAATATCTGATTTATTAGCT ACAATTCTAAAGCTGTTTTTTTGGATTGTACATTTTCCTGATTTTTGTAATAATCTGTATAAGGTTGTGCCTGGAAACTT TAAATATCCTTCTAGTTTATTATGACTACAGGGATTCTATTGTTGGGTAAGTTATAGCATCTGAATATTGCAGTGGCAAT GTTGGAAACTTGCATGTTCTGGATAGAGTCCACTTTTCTGAGACATTCATATGCTTTGAATTGTTTTACAAAATGTCCTG GTTCCCATCTTTTATTTCAAAGTTCTCATCTCATTGTTTTTTAAGACAGTTTTCTTGTGGTAAAATTCCATGGCGTATCA ATGCTCAATTAACCTGGA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0228500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGCAACATCCGCCAAGTTTGATCTATCTTCCAGAAGCCCAGATAGACCATTGTACACTGGGCTGCGTGGATCCCACGT AGCTGGTTCCTTAGATAGATCGGGTAGCTTTCGTGAAAGCATAGAAAATCCAAATCTGTCGACTCTTCCAAACATGTCTA GAAGCAGTTCTTCAGCAACACAAGGGGATGTAATGAGCTTCTTCAATTGTGTGCGTTTCGATCAAAAGTTGGTAGCTCCA GAGCATAAGTCTAATCGTCAAACAGATTATAAACGACATGTCAGTGCTGCTTTTGGAGTTTCACCTGATGAATCTGCTTC TAGTTCTGTAAAAGGCAAGCAATTGCCATCCCCAGCACCAGAAGATATCAAACGACTCAGGGATGGTTTACACGCAAACT TTAGAAGGGCAAGGGAGCGTGCTAAAATGTTCAGTGAAGCCTTATCTAGATTCAACAAAGATTTCCCAAATATAACTTCA AAGAAGAGATCTCGGGCCGAAAGTTTTTCTACTGACCGTTCTAGTTTCATGTTAAGTGATCGGTCTGTCTTGGGGCCGAG CATAAGTAAGGTTGGAGTTCAAGGTCATCCTGTCACAGGTGGTTTTGAACACGAGCAGCAAAAGTTAGAAGAAAGAACCA AAACTGTTGTCCCAAACAAGCGCACTAGAACTTCTTTGGTTGATATAAAGATGGATGTGCGGACTACTTCTCTTGTCAGG CCATCTGGGACTGTAGACAGAGATAAAGAAATGCTACGGGTTGTCAATAATGGCGCGGTCCAGGGTGAGGAACGAACTTT ACCGATTGGAGGTGATGGTTGGGAAAAGTCAAAAATGAAGAAGAAGCGTTCTGGCATCAAACCGGATGGATCTTCAAGTC CAGCATTGACAAAACCTGTTAATATTTTCCAGGAAACTAAACAAGGAATTCAACAAAGACTAACTACTGATTCTCGGTCG AAATTGAGTAGTGATTCTCATTCTTTCAGGCCAGGAGTTTCTAATGGATCTGTCGGAGCTGGAAAACCAGACGCCATCTC TCAACAAACTGGGTTGGGGATACGCGTCTCTACCCCTAAAATTGATCTGGACAACAATTCTGCTGTCAATGAGAGGCGGG ATCGTACTGTCCATTCAGACAAGGAAAGGGTGAATTTCAGAGCTGTTAACAAGGCAACTGTTCGTGATGAATATAATTCA GCTAGTCCTAATTCAAGTGCAAAAATTAATACTATTCGGGCACCACGATCAGGTTCGGGAGTTGCCCCGAAGTTGTCTCC AGTTGTCCACAAAACAGCGGTTCCCAATGATGGGGAACTGTCTCATGGTAGCCCCAAGCCCCCTGCTGGTGCTGGCACTA CCAATCGCAAACGTGCGGCATCAGCACGATCATCTTCCCCACCTGTTGTCAAATGGCAGAGGCCGCAAAAGAGCTCCCGC ACTGCCAGAAGAACAAATTTGGTGCCTGTTACTTCAAGTAATGACGATTCCCCTGCTTTGGATTCTGTATCTGATGTGAC TGGCAATGATCTTGGGTTGGGATTTCCCAAACGTTTGACTGGCAGTTCTCCTCAGCAAATCAAATCAAAAGGGGAATCTG TATCTTCAGCTGCCTTATCTGAAAGTGAAGAGTCAGGGGTGGCTGAGATTAAATCTAAAGAGAAGGGAAGGAAGCCAGAA GAGATAGATCATAAAGCTGGACAAAGTGTTCAAAAGGTTTCTAACTCGGTCCTTCCAACAAGAAAAGGTAAATTTGCCTC CGGGAACGAGCCTGGAGATGGGGTTCGGAGGCAAGGGAGGACAGGGCGCAATTCTCCTGCCACAAGGTCACTGATGCCAA AGTCATCAGAGAAGCTCGGAAACATAAAGCAACTTAGAAGTTCAAGACAAGGATTTGAGAAGAGTGAAAGCAGGGCAGGT CGTCCACCAACTAGGAAACTTTCTGATCGTAAGGCATATGCACGTCAAAAGCATACAGCTCTTAATGCATCAGCAGATAT TCTTGATGATGGACAAGCAGAGCTATTGGCTGCTGTAAAGGGTGTTATCAGCTCTGCTCATGCTTTTCCTACCCAATTCT GGAGGCAGATGGAGTCTTTCTTCAGTTTGATAACTGAGGAGGATATTACTTACTGGAAACAACAGACAAATATTGAATCA AGCCCATTGATGCCAACTCCAGTACCTTCAAATATAGATGATTGTGAAGCTGTTGTTAATGGATTTGGGTTGGCTAGATG TGAAAGCGATATTGGACATGGTGCTGAAAGGGGTGCTGGAATTGTTACAGAACAGTTACAACTATCTAAAGGAGATCGTA ATGTAATTCCCCTCAGTCAAAGGATGATATCTGCTTTAATTTCAGAGGAGCGTGGTAGTGAAAATGAAGATTACAAGTTT GATGTGTGTGATAAGGAATTTGAGGCAGATGAGGAGTTGGAACTGAGCAGTTTGGATCCCTACCTACGAGCTAATGATCA GTTTGCATGTCATTCTGCTTACAACGGTTATAGGATAACTGGGAAGCGAAAACATGTTGATACAGAAAATGATATTTCAT CTCCTGACTTGAATTCAAGCCAGCCTACCTTGACCTGTTCAGGGTTGGAATACAATACCTTGGATTTGAATGAAAAGCTT CTCTTGGAGCTTAAAAGCATTGGAATTGCCCCAGAACCAGATTCCGGAACGTCACGAACAGATGATGAAGGAATTTGTCA GGATATCACTAGGTTAGAGGAGGATTACCAAAAACAGATGTGCAAGAGGAAAGGCATGCTAGATGGATTGGTGAAATCTG CCTCAGTGGCCAAAGAACTTCAAGAAAAGGATTTTGAACAACGTGCTCTGGACAAACTTCTTGAGATGGCTTATGAGAAA AACAAGGGCTGTCGGCGTCCAAGTTCCTCAAGTGCAAAAAGTGCAAGCAACAGATTGGCCAAGCAAGCTGCGCTTGAATT TGTTAAGCGTACATTGGAAAGATGTAAACAATTTGAAGATACAGGCAAGAGCTGCTTCAACGAGCCCAAATTCAAGGATA TGTTCCTTGCTGCTTCTTCCCAGCTGAGCGCTGTTCGGCTAGTTGAAGGCACGGAGACTGAATCCACAAAGCCACAAGCT TCTCCCTTTTCTTCTGAAGCAAGAACAGGTTATGTGGCTTCACGGCAGTGTCCTTCACTATTTAGTCAAAATATGAATAA CCATGATATCAATTCACCAGATATTCTTCCAGCTATAAATAACTCATCCAAACAAACTAGCGGGAAGGAAGATTTTTGGT CAAACAGGGTGAAGAAAAGGGAATTGTCCCTTGATGATGTTGGTGGTACTTCAAGTGCTCCATCAGGAGTTGGCGGTTCG CTATCAAGCAGTGCAAGAGGGAAGAGGAGTGAGAGAGACAGAGATGGAAAAGGGCAGAGCAGGGAAGTGCTATCCAGAAA TGGAAATACCAAAGTTGGCCGGCCAGCATTATCTAATGCTAAGGGAGAAAGGAAACCTAAATCTAAGCCTAAGCAGAAAG CATCTCAGCATTCTGTTTCTGTAAATGGCCTCCTTGGCAAGCTATCAGATCATTCTAAACCAGAGTTGCCTTCTGTTTCG AAGTCTAATGAAATGTCTACTAACAGCAATACCAAGGAAAAGGGTGTGTTTGGCTCGGGTGAATCGGATGACCATGAGCC TATTGATCTCTCGAACCTGCAGCTTCCTGGAATAGATGTACTTGATGGCCAAGGTCAAGATTTTGGTTCATGGTTGAATA TTGATGACGATGGATTGCATGATAATGACTGTATGGGCCTTGAAATTCCCATGGATGACCTTTCAGACTTGAATATGACA TTATGA
Protein sequence (LotjaGi6g1v0228500.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MATSAKFDLSSRSPDRPLYTGLRGSHVAGSLDRSGSFRESIENPNLSTLPNMSRSSSSATQGDVMSFFNCVRFDQKLVAP EHKSNRQTDYKRHVSAAFGVSPDESASSSVKGKQLPSPAPEDIKRLRDGLHANFRRARERAKMFSEALSRFNKDFPNITS KKRSRAESFSTDRSSFMLSDRSVLGPSISKVGVQGHPVTGGFEHEQQKLEERTKTVVPNKRTRTSLVDIKMDVRTTSLVR PSGTVDRDKEMLRVVNNGAVQGEERTLPIGGDGWEKSKMKKKRSGIKPDGSSSPALTKPVNIFQETKQGIQQRLTTDSRS KLSSDSHSFRPGVSNGSVGAGKPDAISQQTGLGIRVSTPKIDLDNNSAVNERRDRTVHSDKERVNFRAVNKATVRDEYNS ASPNSSAKINTIRAPRSGSGVAPKLSPVVHKTAVPNDGELSHGSPKPPAGAGTTNRKRAASARSSSPPVVKWQRPQKSSR TARRTNLVPVTSSNDDSPALDSVSDVTGNDLGLGFPKRLTGSSPQQIKSKGESVSSAALSESEESGVAEIKSKEKGRKPE EIDHKAGQSVQKVSNSVLPTRKGKFASGNEPGDGVRRQGRTGRNSPATRSLMPKSSEKLGNIKQLRSSRQGFEKSESRAG RPPTRKLSDRKAYARQKHTALNASADILDDGQAELLAAVKGVISSAHAFPTQFWRQMESFFSLITEEDITYWKQQTNIES SPLMPTPVPSNIDDCEAVVNGFGLARCESDIGHGAERGAGIVTEQLQLSKGDRNVIPLSQRMISALISEERGSENEDYKF DVCDKEFEADEELELSSLDPYLRANDQFACHSAYNGYRITGKRKHVDTENDISSPDLNSSQPTLTCSGLEYNTLDLNEKL LLELKSIGIAPEPDSGTSRTDDEGICQDITRLEEDYQKQMCKRKGMLDGLVKSASVAKELQEKDFEQRALDKLLEMAYEK NKGCRRPSSSSAKSASNRLAKQAALEFVKRTLERCKQFEDTGKSCFNEPKFKDMFLAASSQLSAVRLVEGTETESTKPQA SPFSSEARTGYVASRQCPSLFSQNMNNHDINSPDILPAINNSSKQTSGKEDFWSNRVKKRELSLDDVGGTSSAPSGVGGS LSSSARGKRSERDRDGKGQSREVLSRNGNTKVGRPALSNAKGERKPKSKPKQKASQHSVSVNGLLGKLSDHSKPELPSVS KSNEMSTNSNTKEKGVFGSGESDDHEPIDLSNLQLPGIDVLDGQGQDFGSWLNIDDDGLHDNDCMGLEIPMDDLSDLNMT L
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
---|---|---|---|---|---|---|
MobiDBLite | 1 | 60 | 60 | - | – | |
PANTHER | 1 | 1280 | 1280 | 0.0 | – | |
PANTHER | 1 | 1280 | 1280 | 0.0 | – | |
MobiDBLite | 36 | 60 | 25 | - | – | |
MobiDBLite | 101 | 122 | 22 | - | – | |
MobiDBLite | 264 | 299 | 36 | - | – | |
MobiDBLite | 269 | 287 | 19 | - | – | |
MobiDBLite | 313 | 345 | 33 | - | – | |
MobiDBLite | 313 | 333 | 21 | - | – | |
MobiDBLite | 365 | 384 | 20 | - | – | |
MobiDBLite | 366 | 384 | 19 | - | – | |
MobiDBLite | 397 | 413 | 17 | - | – | |
MobiDBLite | 397 | 655 | 259 | - | – | |
MobiDBLite | 457 | 504 | 48 | - | – | |
MobiDBLite | 519 | 542 | 24 | - | – | |
MobiDBLite | 546 | 567 | 22 | - | – | |
MobiDBLite | 568 | 582 | 15 | - | – | |
MobiDBLite | 601 | 628 | 28 | - | – | |
MobiDBLite | 629 | 655 | 27 | - | – | |
MobiDBLite | 1029 | 1049 | 21 | - | – | |
MobiDBLite | 1063 | 1090 | 28 | - | – | |
MobiDBLite | 1063 | 1229 | 167 | - | – | |
MobiDBLite | 1091 | 1105 | 15 | - | – | |
MobiDBLite | 1108 | 1125 | 18 | - | – | |
MobiDBLite | 1126 | 1141 | 16 | - | – | |
MobiDBLite | 1195 | 1216 | 22 | - | – |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0228500.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…