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LotjaGi6g1v0228500.2

Overview

Field Value
Gene ID LotjaGi6g1v0228500
Transcript ID LotjaGi6g1v0228500.2
Related isoforms 1
Lotus japonicus genome version Gifu v1.2
Description Serine/arginine repetitive matrix protein 2 isoform 1; TAIR: AT4G29790.1 serine/arginine repetitive matrix protein; Swiss-Prot: sp|C6BYK9|ISPG_DESAD 4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase (flavodoxin); TrEMBL-Plants: tr|A0A0B2RAW0|A0A0B2RAW0_GLYSO Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0228500
Working Lj name n.a.

Sequence information

Genomic sequence (LjG1.1_chr6:53444004..53454836) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.

TGGCTTCGTAGGATTTGGAGCTCCGAGCAATATCAAATTCTCCCACGCTGTTTCGATTTTTTCCCCCCAATTTTCCCAAA TTCGCAACACCATTTCAAGATTCAAGGTATATCATTGTTTCTGCGCATCACAAAATTTGATTTTGCTGTTTAATTCAACT TCTAGGGTTTTGATTTTGGGATTTTTATTGCTTTTCCGCGTTTTCAAGGTAGTTCCTAATTTCAATTTTTCATTTTTATG TATTGATTTGAAATTTAGGGTTTCTGTATGTTCTTACTCCTCTCTGTATCTGTTTTATTTTTTTTATGAACTTTCTAACG AACTAAAATTGAGGTTGTAGAGGAAAAATAGTGTCTTTATGCTTGGTTTTGTCAGAACATGAGTTAGAGAAGTTATGTTC AATGTTGTTGTTGATAGCTGCATGTTTTTCCATTTTAGTTTTTTTATTTTTTATAATATGGTTATTATCAGAACAATTTA TGTAGTAAAATTTGAAATGAAAAAAACATTCTTTGAGCAAAAGGAAACTTAGGAAATGGAGGCATAAGCAAATGTTAATA TAGGAGCAGGAATATGATGATGAAGTGTAGTTAATGAGGTCAAGATTTGTGTTTGAAGTTCAGATGGTAACTTGGTAGTT GCAGCAATTAGTGTTTGAAGTGGAGAAGGTATGTTATGAACTTTCTGTAGTAATTGGATTGCATAGAGTTGTTATTATTT GTCAATATAATTTAGATTTCATCTAGATGCATTATCGAGCATTTATGCCAATCGAATTGCATTTCTGTATGTAGTTATTA GACTTCCATAAGACAAGTTTAGTTGTGCATTGATTGATTATGGGGTCAATCAATATGACTTGCTTGAGTGTTGAGATGAG CTTGCTTGTCTGTTGTCTGTTGATTTTCTTGTGGTGATTAAATTTAAACTTGAAGTAGTACTCTATGATGAGAGCTGACA CTGTTGTCATACAAGAATGAGGACAAGGTCCCATATGGGGCTGAATCCCAAGCCTTTATGTTTAGTATGCGCATGAATAT CTATATCACAGCCATGAGTTTGATTTTTCTGTGTTATTATTTTGATCCTTTCAGGTAGATTATCCAATTGTTCCCTTGGA ATTTGCATTTGCCCTTTATGTGCTATAGCACCACGTCTTTGTCATGCACCACTCTCTGTTCTATATTTTTCGCTATAAGA ATGTGCTGGAATTAGTGCAATGGCAACATCCGCCAAGTTTGATCTATCTTCCAGAAGCCCAGATAGACCATTGTACACTG GGCTGCGTGGATCCCACGTAGCTGGTTCCTTAGATAGATCGGGTAGCTTTCGTGAAAGCATAGAAAATCCAAATCTGTCG ACTCTTCCAAACATGTCTAGAAGCAGTTCTTCAGCAACACAAGGGGATGTAATGAGCTTCTTCAATTGTGTGCGTTTCGA TCAAAAGTTGGTAGCTCCAGAGCATAAGTCTAATCGTCAAACAGATTATAAACGACATGTCAGTGCTGCTTTTGGAGTTT CACCTGATGAATCTGCTTCTAGTTCTGTAAAAGGCAAGCAATTGCCATCCCCAGCACCAGAAGATATCAAACGACTCAGG GATGGTTTACACGCAAACTTTAGAAGGGCAAGGTAGTTCTTTGTATGTTTTGCTACTTGCAATAAAGTGAGAGTTGTTTA ATAACATTGTATAACTCAACAGGGAGCGTGCTAAAATGTTCAGTGAAGCCTTATCTAGATTCAACAAAGATTTCCCAAAT ATAACTTCAAAGAAGAGATCTCGGGCCGAAAGTTTTTCTACTGACCGTTCTAGTTTCATGTTAAGTGATCGGTCTGTCTT GGGGCCGAGCATAAGTAAGGTTGGAGTTCAAGGTCATCCTGTCACAGGTGGTTTTGAACACGAGCAGCAAAAGTTAGAAG 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AAAAACAATTTTCAAAACCTGTTTGTCAGAAGAAGAAAAGAAAAGAACAGTTTGAACGAGATGTTTTGCATTGTTGAAAG ACCTGTGAATTGAAAACTAAAAACAAAAACAGAAAACATCTCTGAAATGTTTTGGGATTTTAGTTTTAAAACCGTAGATA AGAACTGTTTTAACAGTTTTTAGCAAACAGGCTTTTCTTTATCTATTTTTTAAAAACTAAAAATTGTTATACAAAACAGT GTTTGGCTTTTGTATGGTGTAAAGCACTTGATCTTTTTAAAAGGGTATCCCTTACAAATATGTTGAGGGATTTGGTATCT TTACTAAGGTGGTGTTTATTATTCCTCGATTATTTTTCTTTTCTCTTTCTTAAAGGACGATTGCTTATCTTCCTTTAACT TTGCATTCTTCTCTCTGACTTAATAAAATTATAATTTCATAAAAAATATTCTTTAATTGATTTAGACGTTTTATTTGTTC TATACCCAGGGCAACTGTTCGTGATGAATATAATTCAGCTAGTCCTAATTCAAGTGCAAAAATTAATACTATTCGGGCAC CACGATCAGGTTCGGGAGTTGCCCCGAAGTTGTCTCCAGTTGTCCACAAAACAGCGGTTCCCAATGATGGGGAACTGTCT CATGGTAGCCCCAAGCCCCCTGCTGGTGCTGGCACTACCAATCGCAAACGTGCGGCATCAGCACGATCATCTTCCCCACC TGTTGTCAAATGGCAGAGGCCGCAAAAGAGCTCCCGCACTGCCAGAAGAACAAATTTGGTGCCTGTTACTTCAAGTAATG ACGATTCCCCTGCTTTGGATTCTGTATCTGATGTGACTGGCAATGATCTTGGGTTGGGATTTCCCAAACGTTTGACTGGC AGTTCTCCTCAGCAAATCAAATCAAAAGGGGAATCTGTATCTTCAGCTGCCTTATCTGAAAGTGAAGAGTCAGGGGTGGC TGAGATTAAATCTAAAGAGAAGGGAAGGAAGCCAGAAGAGATAGATCATAAAGCTGGACAAAGTGTTCAAAAGGTTTCTA ACTCGGTCCTTCCAACAAGAAAAGGTAAATTTGCCTCCGGGAACGAGCCTGGAGATGGGGTTCGGAGGCAAGGGAGGACA GGGCGCAATTCTCCTGCCACAAGGTCACTGATGCCAAAGTCATCAGAGAAGCTCGGAAACATAAAGCAACTTAGAAGTTC AAGACAAGGATTTGAGAAGAGTGAAAGGTTAAAATTCTTCTCTCTAAATCTATTTCTTTAGGGCCCATTCTTTATGCTAC TTTTAAAGATAAATAATTTTTTAATATAAGTTGTGTTAAAAAAATTCATGAGAATTATGTAAGTTTTTTCGAAAAAACAT AAAAGAGCTGTTTCAGTGGTTTCGCAAAAGCTAAAGTGATAGAAAAAAACTATCATGAAATATCATTTTTAAGCTTATAT AACCAAGTCCCAGGTTGTTTTTCAATTTGTTTGAGCATACAGATTAAAACCTTATTCTATGAAATCCATGCAGCAGGGCA GGTCGTCCACCAACTAGGAAACTTTCTGATCGTAAGGCATATGCACGTCAAAAGCATACAGCTCTTAATGCATCAGCAGA TATTCTTGGTACTAGTTTAACTTTCCAGAAAAGACTAGTGAGCTCAATTGTTCAATTTTAATACAAGTATATCATTATTT GCTTTTGGTTTTTGGGTCAGATGATGGACAAGCAGAGCTATTGGCTGCTGTAAAGGGTGTTATCAGCTCTGGTAACAATC TTACTAAATTCTATCTAAATGTGTTGCCTAAATATACTTTTTATGTGATGGAGTAGTTCTGAATTTTTTTAATTACTGCA GCTCATGCTTTTCCTACCCAATTCTGGAGGCAGATGGAGTCTTTCTTCAGTTTGATAACTGAGGAGGATATTACTTACTG GAAACAACAGGTATTAATCTTTACCTTTTTAGTGTTTATGAATCATGATTACTTTGCGATTTTTCTTTATTAAGAGTTTG TGTTGGATCATTGGTCAGCAAGGTTCTCTTCACACTTATGTTCAGTTCAAAATGCTTCAGATTTGTTGTTATCCATAATA AATAGCACTGATGCAACCTTTCGTTGATTATTCAAGAGTTAGATTTTTTTTTACTGTAGGTCCTGATGTTATAAAAACCA TGTGGATCATGTTATTTGTTGTATTATGTTTATTCCTTATATTTTTTTTTCTTCACAATTTGATATATATTAAAAAAACT CCTCCAGTCTTGTATAAATTGTTTTAAGTTATTACTTTTGATTATAGCATTATTTGATTGATCTGAATTTCTTGGACATA CCTGTCATAGGAATAATTGATTCAAATTTCTTTAATAACTCGTTCATATTTCAGACAAATATTGAATCAAGCCCATTGAT GCCAACTCCAGTACCTTCAAATATAGATGATTGTGAAGCTGTTGTTAATGGATTTGGGTTGGCTAGATGTGAAAGCGATA TTGGACATGGTGCTGAAAGGGGTGCTGGAATTGTTACAGAACAGTTACAACTATCTAAAGGAGATCGTAATGTAATTCCC CTCAGTCAAAGGATGATATCTGCTTTAATTTCAGAGGAGCGTGGTAGTGAAAATGAAGATTACAAGTTTGATGTGTGTGA TAAGGAATTTGAGGCAGATGAGGAGTTGGAACTGAGCAGTTTGGATCCCTACCTACGAGCTAATGATCAGTTTGCATGTC ATTCTGCTTACAACGGTTATAGGATAACTGGGAAGCGAAAACATGTTGATACAGAAAATGATATTTCATCTCCTGACTTG AATTCAAGCCAGCCTACCTTGACCTGTTCAGGGTTGGAATACAATACCTTGGATTTGAATGAAAAGCTTCTCTTGGAGCT TAAAAGCATTGGAATTGCCCCAGAACCAGATGTATGTTACCTTTCTAAGAACTTCTCTGCTATTTTTCATGAGATCTCAT CATTCTTGAACCATGTTAAATATCAGATTTGATAAAACTATTCTGTTGTGTCTATAGTCCGTCCAATTGTCTGCTGACCA GTAGACCTAATGAATTTAATTCAAGATGTTCTGTGTTATTGACTTACTGTGAAATCTTTAGTTTGTCTATGTAATACTTA TTTTTTTCACTTTTATTTTTCAAGTCCGGAACGTCACGAACAGATGATGAAGGAATTTGTCAGGATATCACTAGGTTAGA GGAGGATTACCAAAAACAGGTACGCACCGATGCCAAGTTATAATGTGCTAACTGCTAATCGTTGAGTTTAATTTTTTTTG TTTCAAACAACTTTTTATCTGATGTAATTTTCAAGTAATGGATATTTAAGTATTGATTTCCAAGTTTATGGTAAATATAT GGATCTGGTTTAGAACCTGACATCCTGTTCACGAATATCATTTCAAACTTACTGAAGTTAATGTTGATTTTTGTAATCCA TCGTACGCTTTTATTTTCATGTGTATCATAGATGTGCAAGAGGAAAGGCATGCTAGATGGATTGGTGAAATCTGCCTCAG TGGCCAAAGAACTTCAAGAAAAGTAATTTCACTGCCATTTGTGCCCTGATTATTTTCTTAATTTAAACTTTTGTGGCTCA TTGTTCTGAATGGAAATATGAAACTTTTGTGGCTCATTGATACACAGGGATTTTGAACAACGTGCTCTGGACAAACTTCT TGAGATGGCTTATGAGAAAAACAAGGTAACCTTCTTAATGTTCAATATCACTTTTTATATATAACCGTCTCTACAGTTTC AAATAAATTTTTAACATTCCAGCCTAGTCAAGTATCAAGACCTATAGTTGTATTAAAGTAGTTGAAAAGACTGGGGATTT TTATACCAGGCTAATGGGTAGCATGTAGAATGAAGATATGGTCTATAACTGTCATAGGTTTAACTTATAAGTACAGGACG GGAAGTGGGAAGAGACACACATCAAAGTGTGCAGGATTTTCTGATGTTTGTATGTAGCCTTAAATGCAGCTGTTAGAATG TATCATACACCTATAAATGTTGATGATCCCATTGTCCTTATAAAACATGGAGGGTTGAGGTTGTTTGCAATATGAAAAAG CCAGTTCGCAACAGGATAGCAACTCTCAATCTTGAATCACTCTGCTTTTCTAATTCAAACGTGTGACATGTTTGCCCTAT TCTTAGTTTAGTGTTTTATCAAAGAAACCACAACTCATGCTGTCTTATTATCTTGTATAAAATACTTAAATTTTCTAGGA AGAGTCAAACACTCCATTGCCAAATAAATGCCATCAAATTAGAAAATTATCTGAACTTTAAATTAAGGTTACAGTTACAT GGCAGAGTGAATTGACAATAATTGATTGGCAGGGCTGTCGGCGTCCAAGTTCCTCAAGTGCAAAAAGTGCAAGCAACAGA TTGGCCAAGCAAGCTGCGCTTGAATTTGTTAAGCGTACATTGGAAAGATGTAAACAATTTGAAGATACAGGCAAGAGCTG CTTCAACGAGCCCAAATTCAAGGATATGTTCCTTGCTGCTTCTTCCCAGCTGAGCGCTGTTCGGCTAGTTGAAGGCACGG AGACTGAATCCACAAAGCCACAAGCTTCTCCCTTTTCTTCTGAAGCAAGAACAGGTTTCTTTTTCATTATCCTCTCATGT ACATGCTCCAATGTATTTTTCTTAGTTGTGTTCTGTATGATCATTTTAGCCAAAATCGTAAATGGCTTTATTGTAAATGT CATATTCTTTGTGGACAATCCTTTGTCCCCTATCCTTAATAAATAATGCCAACTAAGGCATAAGGTACTGACAGCTAAGG AAGAGCTAACTGCCAACTCATAGAGGTGTAATTTTTATTGGGTACGAAGTTGATGACCTTGGGAGGGGAAGATGATTTGA ATCCCTTTGCCTGAACGTTACTTCAAGTTTTATGTTTTTTTCCTTTTGTACATTGAGTACAGGCTGAATTTTGATATTTA AGTTATGTGTTTTTTTTTCTGCAGGTTATGTGGCTTCACGGCAGTGTCCTTCACTATTTAGTCAAAATATGAATAACCAT GATATCAATTCACCAGATATTCTTCCAGCTATAAATAACTCATCCAAACAAACTAGCGGGAAGGAAGATTTTTGGTCAAA CAGGGTGAAGAAAAGGGAATTGTCCCTTGATGATGTTGGTGGTACTTCAAGTGCTCCATCAGGAGTTGGCGGTTCGCTAT CAAGCAGTGCAAGAGGGAAGAGGAGTGAGAGAGACAGAGATGGAAAAGGGCAGAGCAGGGAAGTGCTATCCAGAAATGGA AATACCAAAGTTGGCCGGCCAGCATTATCTAATGCTAAGGGAGAAAGGAAACCTAAATCTAAGCCTAAGCAGAAAGCATC TCAGCATTCTGTTTCTGTAAATGGCCTCCTTGGCAAGCTATCAGATCATTCTAAACCAGAGTTGCCTTCTGTTTCGAAGT CTAATGAAATGTCTACTAACAGCAATACCAAGGAAAAGGGTGTGTTTGGCTCGGGTGAATCGGATGACCATGAGCCTATT GATCTCTCGAACCTGCAGCTTCCTGGAATAGATGTACTTGATGGCCAAGGTCAAGATTTTGGTTCATGGTTGAATATTGA TGACGATGGATTGCATGATAATGACTGTATGGGCCTTGAAATTCCCATGGATGACCTTTCAGACTTGAATATGACATTAT GATAGTTTAAACTTCTTTGTACAGCAGCTTTCTATACCAATGACAACGGAAACAAAGTACTTTTAAGAAATGACTAGTTA CATAGGATAGTCTTATGGCTAATCCTGGCCTCAATTAGGTTATATAGATTCTTTGGTAGACTCCCATCTCCTAGTTGTTT TTTGAGTGACCTTTTCAACTGTTTCGGATTTTGCTAGTGTCGAAGTTCATAACTTCCTCTGTAAAGATCTTTCTGTTGAA GGTACAAGTTAGTGTTCCCAGTGATTATGTTAATAAACATGGTCCTGGTTGTAGCAGTTACAAATCAGACAGTAAGGCCT TTGTACATACATTTGATATTTCTAATAAAATCA 

CDS sequence (LotjaGi6g1v0228500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.

ATGGCAACATCCGCCAAGTTTGATCTATCTTCCAGAAGCCCAGATAGACCATTGTACACTGGGCTGCGTGGATCCCACGT AGCTGGTTCCTTAGATAGATCGGGTAGCTTTCGTGAAAGCATAGAAAATCCAAATCTGTCGACTCTTCCAAACATGTCTA GAAGCAGTTCTTCAGCAACACAAGGGGATGTAATGAGCTTCTTCAATTGTGTGCGTTTCGATCAAAAGTTGGTAGCTCCA GAGCATAAGTCTAATCGTCAAACAGATTATAAACGACATGTCAGTGCTGCTTTTGGAGTTTCACCTGATGAATCTGCTTC TAGTTCTGTAAAAGGCAAGCAATTGCCATCCCCAGCACCAGAAGATATCAAACGACTCAGGGATGGTTTACACGCAAACT TTAGAAGGGCAAGGGAGCGTGCTAAAATGTTCAGTGAAGCCTTATCTAGATTCAACAAAGATTTCCCAAATATAACTTCA AAGAAGAGATCTCGGGCCGAAAGTTTTTCTACTGACCGTTCTAGTTTCATGTTAAGTGATCGGTCTGTCTTGGGGCCGAG CATAAGTAAGGTTGGAGTTCAAGGTCATCCTGTCACAGGTGGTTTTGAACACGAGCAGCAAAAGTTAGAAGAAAGAACCA AAACTGTTGTCCCAAACAAGCGCACTAGAACTTCTTTGGTTGATATAAAGATGGATGTGCGGACTACTTCTCTTGTCAGG CCATCTGGGACTGTAGACAGAGATAAAGAAATGCTACGGGTTGTCAATAATGGCGCGGTCCAGGGTGAGGAACGAACTTT ACCGATTGGAGGTGATGGTTGGGAAAAGTCAAAAATGAAGAAGAAGCGTTCTGGCATCAAACCGGATGGATCTTCAAGTC CAGCATTGACAAAACCTGTTAATATTTTCCAGGAAACTAAACAAGGAATTCAACAAAGACTAACTACTGATTCTCGGTCG AAATTGAGTAGTGATTCTCATTCTTTCAGGCCAGGAGTTTCTAATGGATCTGTCGGAGCTGGAAAACCAGACGCCATCTC TCAACAAACTGGGTTGGGGATACGCGTCTCTACCCCTAAAATTGATCTGGACAACAATTCTGCTGTCAATGAGAGGCGGG ATCGTACTGTCCATTCAGACAAGGAAAGGGTGAATTTCAGAGCTGTTAACAAGGCAACTGTTCGTGATGAATATAATTCA GCTAGTCCTAATTCAAGTGCAAAAATTAATACTATTCGGGCACCACGATCAGGTTCGGGAGTTGCCCCGAAGTTGTCTCC AGTTGTCCACAAAACAGCGGTTCCCAATGATGGGGAACTGTCTCATGGTAGCCCCAAGCCCCCTGCTGGTGCTGGCACTA CCAATCGCAAACGTGCGGCATCAGCACGATCATCTTCCCCACCTGTTGTCAAATGGCAGAGGCCGCAAAAGAGCTCCCGC ACTGCCAGAAGAACAAATTTGGTGCCTGTTACTTCAAGTAATGACGATTCCCCTGCTTTGGATTCTGTATCTGATGTGAC TGGCAATGATCTTGGGTTGGGATTTCCCAAACGTTTGACTGGCAGTTCTCCTCAGCAAATCAAATCAAAAGGGGAATCTG TATCTTCAGCTGCCTTATCTGAAAGTGAAGAGTCAGGGGTGGCTGAGATTAAATCTAAAGAGAAGGGAAGGAAGCCAGAA GAGATAGATCATAAAGCTGGACAAAGTGTTCAAAAGGTTTCTAACTCGGTCCTTCCAACAAGAAAAGGTAAATTTGCCTC CGGGAACGAGCCTGGAGATGGGGTTCGGAGGCAAGGGAGGACAGGGCGCAATTCTCCTGCCACAAGGTCACTGATGCCAA AGTCATCAGAGAAGCTCGGAAACATAAAGCAACTTAGAAGTTCAAGACAAGGATTTGAGAAGAGTGAAAGGGCAGGTCGT CCACCAACTAGGAAACTTTCTGATCGTAAGGCATATGCACGTCAAAAGCATACAGCTCTTAATGCATCAGCAGATATTCT TGATGATGGACAAGCAGAGCTATTGGCTGCTGTAAAGGGTGTTATCAGCTCTGCTCATGCTTTTCCTACCCAATTCTGGA GGCAGATGGAGTCTTTCTTCAGTTTGATAACTGAGGAGGATATTACTTACTGGAAACAACAGACAAATATTGAATCAAGC CCATTGATGCCAACTCCAGTACCTTCAAATATAGATGATTGTGAAGCTGTTGTTAATGGATTTGGGTTGGCTAGATGTGA AAGCGATATTGGACATGGTGCTGAAAGGGGTGCTGGAATTGTTACAGAACAGTTACAACTATCTAAAGGAGATCGTAATG TAATTCCCCTCAGTCAAAGGATGATATCTGCTTTAATTTCAGAGGAGCGTGGTAGTGAAAATGAAGATTACAAGTTTGAT GTGTGTGATAAGGAATTTGAGGCAGATGAGGAGTTGGAACTGAGCAGTTTGGATCCCTACCTACGAGCTAATGATCAGTT TGCATGTCATTCTGCTTACAACGGTTATAGGATAACTGGGAAGCGAAAACATGTTGATACAGAAAATGATATTTCATCTC CTGACTTGAATTCAAGCCAGCCTACCTTGACCTGTTCAGGGTTGGAATACAATACCTTGGATTTGAATGAAAAGCTTCTC TTGGAGCTTAAAAGCATTGGAATTGCCCCAGAACCAGATTCCGGAACGTCACGAACAGATGATGAAGGAATTTGTCAGGA TATCACTAGGTTAGAGGAGGATTACCAAAAACAGATGTGCAAGAGGAAAGGCATGCTAGATGGATTGGTGAAATCTGCCT CAGTGGCCAAAGAACTTCAAGAAAAGGATTTTGAACAACGTGCTCTGGACAAACTTCTTGAGATGGCTTATGAGAAAAAC AAGGGCTGTCGGCGTCCAAGTTCCTCAAGTGCAAAAAGTGCAAGCAACAGATTGGCCAAGCAAGCTGCGCTTGAATTTGT TAAGCGTACATTGGAAAGATGTAAACAATTTGAAGATACAGGCAAGAGCTGCTTCAACGAGCCCAAATTCAAGGATATGT TCCTTGCTGCTTCTTCCCAGCTGAGCGCTGTTCGGCTAGTTGAAGGCACGGAGACTGAATCCACAAAGCCACAAGCTTCT CCCTTTTCTTCTGAAGCAAGAACAGGTTATGTGGCTTCACGGCAGTGTCCTTCACTATTTAGTCAAAATATGAATAACCA TGATATCAATTCACCAGATATTCTTCCAGCTATAAATAACTCATCCAAACAAACTAGCGGGAAGGAAGATTTTTGGTCAA ACAGGGTGAAGAAAAGGGAATTGTCCCTTGATGATGTTGGTGGTACTTCAAGTGCTCCATCAGGAGTTGGCGGTTCGCTA TCAAGCAGTGCAAGAGGGAAGAGGAGTGAGAGAGACAGAGATGGAAAAGGGCAGAGCAGGGAAGTGCTATCCAGAAATGG AAATACCAAAGTTGGCCGGCCAGCATTATCTAATGCTAAGGGAGAAAGGAAACCTAAATCTAAGCCTAAGCAGAAAGCAT CTCAGCATTCTGTTTCTGTAAATGGCCTCCTTGGCAAGCTATCAGATCATTCTAAACCAGAGTTGCCTTCTGTTTCGAAG TCTAATGAAATGTCTACTAACAGCAATACCAAGGAAAAGGGTGTGTTTGGCTCGGGTGAATCGGATGACCATGAGCCTAT TGATCTCTCGAACCTGCAGCTTCCTGGAATAGATGTACTTGATGGCCAAGGTCAAGATTTTGGTTCATGGTTGAATATTG ATGACGATGGATTGCATGATAATGACTGTATGGGCCTTGAAATTCCCATGGATGACCTTTCAGACTTGAATATGACATTA TGA 

Protein sequence (LotjaGi6g1v0228500.2) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.

MATSAKFDLSSRSPDRPLYTGLRGSHVAGSLDRSGSFRESIENPNLSTLPNMSRSSSSATQGDVMSFFNCVRFDQKLVAP EHKSNRQTDYKRHVSAAFGVSPDESASSSVKGKQLPSPAPEDIKRLRDGLHANFRRARERAKMFSEALSRFNKDFPNITS KKRSRAESFSTDRSSFMLSDRSVLGPSISKVGVQGHPVTGGFEHEQQKLEERTKTVVPNKRTRTSLVDIKMDVRTTSLVR PSGTVDRDKEMLRVVNNGAVQGEERTLPIGGDGWEKSKMKKKRSGIKPDGSSSPALTKPVNIFQETKQGIQQRLTTDSRS KLSSDSHSFRPGVSNGSVGAGKPDAISQQTGLGIRVSTPKIDLDNNSAVNERRDRTVHSDKERVNFRAVNKATVRDEYNS ASPNSSAKINTIRAPRSGSGVAPKLSPVVHKTAVPNDGELSHGSPKPPAGAGTTNRKRAASARSSSPPVVKWQRPQKSSR TARRTNLVPVTSSNDDSPALDSVSDVTGNDLGLGFPKRLTGSSPQQIKSKGESVSSAALSESEESGVAEIKSKEKGRKPE EIDHKAGQSVQKVSNSVLPTRKGKFASGNEPGDGVRRQGRTGRNSPATRSLMPKSSEKLGNIKQLRSSRQGFEKSERAGR PPTRKLSDRKAYARQKHTALNASADILDDGQAELLAAVKGVISSAHAFPTQFWRQMESFFSLITEEDITYWKQQTNIESS PLMPTPVPSNIDDCEAVVNGFGLARCESDIGHGAERGAGIVTEQLQLSKGDRNVIPLSQRMISALISEERGSENEDYKFD VCDKEFEADEELELSSLDPYLRANDQFACHSAYNGYRITGKRKHVDTENDISSPDLNSSQPTLTCSGLEYNTLDLNEKLL LELKSIGIAPEPDSGTSRTDDEGICQDITRLEEDYQKQMCKRKGMLDGLVKSASVAKELQEKDFEQRALDKLLEMAYEKN KGCRRPSSSSAKSASNRLAKQAALEFVKRTLERCKQFEDTGKSCFNEPKFKDMFLAASSQLSAVRLVEGTETESTKPQAS PFSSEARTGYVASRQCPSLFSQNMNNHDINSPDILPAINNSSKQTSGKEDFWSNRVKKRELSLDDVGGTSSAPSGVGGSL SSSARGKRSERDRDGKGQSREVLSRNGNTKVGRPALSNAKGERKPKSKPKQKASQHSVSVNGLLGKLSDHSKPELPSVSK SNEMSTNSNTKEKGVFGSGESDDHEPIDLSNLQLPGIDVLDGQGQDFGSWLNIDDDGLHDNDCMGLEIPMDDLSDLNMTL 

Domain prediction

Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.

Merging data from EBeye. Please wait…

Domains

Sorting

Prediction algorithm Identifier Start End Length E-value InterPro ID
PANTHER 1 1279 1279 0.0
MobiDBLite 1 60 60 -
PANTHER 1 1279 1279 0.0
MobiDBLite 36 60 25 -
MobiDBLite 101 122 22 -
MobiDBLite 264 299 36 -
MobiDBLite 269 287 19 -
MobiDBLite 313 333 21 -
MobiDBLite 313 345 33 -
MobiDBLite 365 384 20 -
MobiDBLite 366 384 19 -
MobiDBLite 397 413 17 -
MobiDBLite 397 654 258 -
MobiDBLite 457 504 48 -
MobiDBLite 519 542 24 -
MobiDBLite 546 567 22 -
MobiDBLite 568 582 15 -
MobiDBLite 601 628 28 -
MobiDBLite 629 654 26 -
MobiDBLite 1028 1048 21 -
MobiDBLite 1062 1089 28 -
MobiDBLite 1062 1228 167 -
MobiDBLite 1090 1104 15 -
MobiDBLite 1107 1124 18 -
MobiDBLite 1125 1140 16 -
MobiDBLite 1194 1215 22 -

Gene function (GO predictions)

GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .

Unable to find any GO terms for the transcript with the identifier.

Expression data

Expression pattern

Expression pattern of LotjaGi6g1v0228500.2, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.

Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…