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| Field | Value |
|---|---|
| Gene ID | LotjaGi6g1v0242600 |
| Transcript ID | LotjaGi6g1v0242600.1 |
| Lotus japonicus genome version | Gifu v1.2 |
| Description | PLATZ transcription factor family protein; TAIR: AT1G31040.1 PLATZ transcription factor family protein; Swiss-Prot: sp|P44690|PDXY_HAEIN Pyridoxal kinase PdxY; TrEMBL-Plants: tr|K7LBW3|K7LBW3_SOYBN Uncharacterized protein; Found in the gene: LotjaGi6g1v0242600 |
| Working Lj name | n.a. |
Genomic sequence (LjG1.1_chr6:55483863..55503561) extracted from Lotus japonicus Gifu genome v1.2.
ACTCTCTCTCTTTCTTTCTCTCTCCCCCCTGCACCTGGAGGATAGATCGAGGAAATCAAATATTATATTAATTAACTAAT TCATTTTTTTCTCTTCATTCATTTTCCTCTTCTATAAATAGCCAATATAATAGAAAGCTGCTGTGGTGTTTCACTAGGGT TAACTTCTCAGTCCTCATCAGTCATCACCCCCCAAAAAAATTGAGAGAAAAAAGAAATAAACATCAATTCAATTTCACAA AAGCAAGTACTCCAAGTAGCAATCAAGCATCACCAAATTAAAGCCTCTTCAACTCATAAATAGAGTGAATATATAAGTAG AAGTTAGGTGAGTTAGAGGGAAGGAAAAGAAGAGAAATTGAAGGGAAATTGGAGAGAAATGGTTAGAGACATGATGGGAA CATACTCATCATCAGGAAATTCAAGAAGAGGTTATGGTGGTGGGGGAGAGGGAGACATAGAAGACATGAATATGAATATG AATATGAATATGAATATTGATGATGAGAAACCTGCATGGCTAGAGAGGCTGATGGCTGAGACATTCTTTGGTGCTTGTGG GGTCCACCACAACCGCAGGAAGAACGAGAAGAACATCTTTTGCTTACACTGTTGCCTCAGCATCTGCCCTCACTGCCTCC CTTCTCACCGCTCTCACCCTCTCCTCCAGGTACTATATAATTAATATTATTTTATTTTATATGCCAATTAATTCTATTAT TTTCTTATCAAATTCCATCCTCCAATTCTTTGATTCCTCCATAGATTTTCCATGTGCCCTTAATTGATAATTTTATTGAT TTTTTGTCTAGAGCAAAATTGAAGGTACCTTTTTTTTTCGGTTTACACAGTATTTGGTTTGATCTTTCTTTTTGTTTTTC ACCTTCAATTGGTGAAAGGGAAATTGGAAATTCACTTTGATTTATTCATTGATCTTTAATTCTATTCTATCATGGAACTT 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ATAAGGATCAAACGCCATCGCCTGACGATTGACACCAACAACGAAGTTCAGTCGCTCGCCGGGGTCACCGCCAGTCAATG ACTAAATGATCGGCACATGACCCATGCCTGCCACCTTTCCCGCCGGCGAGCGATCATACACCTGCTCCAACTTATCACCA ATACAAAGTAGTCGTCCTCGCCGCTTGCGGACTTGTGGACTTGCCAGCTTGGTTTACTCGTCAAGTCAGTGGACTGGGTA ACTGAAAATGCTAGTTTCCTTTTGCTCACGCCATGTTGGCGATATAGTTAACTTCTCTTTTTTCAAGCCATGTTGGCAGT GTAGATTCCGGTGTACAATAAGACATGTGACAGCATTTAAAAGACACCCTTAGCTCTCGTACCTCGAGCTCGGTGTCTTG TGGACTAGTGGACTGGGCGAGCCCCTAGAGGGGCAACGCCCAGCGTGTATCCCGCCCTGAGGCGGGGCCCTGGCCTTCAG ATGGGCCCTGATCTTGGAGGCCCAATTGGCCCAATAGGTAGTACCCAAGCTCTATAAATAGGAGGTAGTTATCAATTGTA AGGGACTTTTGGCTCATTTGAGGAAATAACACTTGAAATTCAGCATTCTCTCTCATTCTCACTCTCTCTTGGCACAATCC CTCTATCTCTAGGTACTATGCCTCTCTTCAATGTTCATTCCTAGAACACTCACCAATTCCCTTAATTCACCGACTCTTCC CCCATTTCATGATATTTTAACTTGTACTTTTATTTATGTTTGTGAGTGTCTTTAGCTTACTAACACTAATATTTTGGTCA TAAACTTTTCAATTGACATAAAAAAAAAAATTCAAGTACACAGTGAATAATTTTAATGAGGGATAAATGCAGGTGGATTA CATGGTGTCCGTGGGACAAAGCTTGGCCAGCATTTTACATCGATTTGATGAATCTGACTTTACAATTTCGCAGTTCGAGG GTCTTCGAGTCGATGGCTCAGAGGTAATTGATGAAGATACCCACTTTGCCCCTAGTTGCTCTTATTCCAACAACGAAGCC ACAAGCAATTCGGTAATTTCACGAGAACCCCACAAGAAGGCCAAGGCCAATAGGTTCCTCCCTGGGATCGTCCTCTCTCT TGGCAGCAGAAGAAAAGGTGCACCTCATAGGGCCCCTCTCTCCTAAAATGAGAATCAACATTATCATAATCATAATTAAA ATAATAAAAAATGGTAAATTTTAATTAATAATATATTATCATCAATTAGTATAAATTAAGTTGTTATGGCCAAATAAGAT TGAGTTTTATTTAATCTTTATATGTTTTTAAGGATTTTAATTAAGAGCTGTTATATTATGGTATGTGCATGCACAGCTAT GATCTTCCATTGGTGAAACCACCAATTTTGTATGAGATGCTATATATGGGAATTTGGCGTATGTAATTGTGTATTAGATA TGTTGTTGTATGAATAGAA
CDS sequence (LotjaGi6g1v0242600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 CDS.
ATGGTTAGAGACATGATGGGAACATACTCATCATCAGGAAATTCAAGAAGAGGTTATGGTGGTGGGGGAGAGGGAGACAT AGAAGACATGAATATGAATATGAATATGAATATGAATATTGATGATGAGAAACCTGCATGGCTAGAGAGGCTGATGGCTG AGACATTCTTTGGTGCTTGTGGGGTCCACCACAACCGCAGGAAGAACGAGAAGAACATCTTTTGCTTACACTGTTGCCTC AGCATCTGCCCTCACTGCCTCCCTTCTCACCGCTCTCACCCTCTCCTCCAGGTGCGAAGGTATGTTTACCACGATGTGAT TCGATTGGATGATCTCGAAAAGCTTATTGATTGCTCAAATATTCAGCCGTATACTATTAACAGTGCGAAAGTGATATTCG TAAATCAAAGGCCACAGTCAAGGTCATGCAAAGGTAGCCCCAATGCTTGCTTCACTTGTGACAGGATTCTTCAGGACCCA TTTCATTTCTGTTCTCTTTCATGCAAGGTGGATTACATGGTGTCCGTGGGACAAAGCTTGGCCAGCATTTTACATCGATT TGATGAATCTGACTTTACAATTTCGCAGTTCGAGGGTCTTCGAGTCGATGGCTCAGAGGTAATTGATGAAGATACCCACT TTGCCCCTAGTTGCTCTTATTCCAACAACGAAGCCACAAGCAATTCGGTAATTTCACGAGAACCCCACAAGAAGGCCAAG GCCAATAGGTTCCTCCCTGGGATCGTCCTCTCTCTTGGCAGCAGAAGAAAAGGTGCACCTCATAGGGCCCCTCTCTCCTA A
Protein sequence (LotjaGi6g1v0242600.1) extracted from Lotus japonicus Gifu v1.2 Proteins.
MVRDMMGTYSSSGNSRRGYGGGGEGDIEDMNMNMNMNMNIDDEKPAWLERLMAETFFGACGVHHNRRKNEKNIFCLHCCL SICPHCLPSHRSHPLLQVRRYVYHDVIRLDDLEKLIDCSNIQPYTINSAKVIFVNQRPQSRSCKGSPNACFTCDRILQDP FHFCSLSCKVDYMVSVGQSLASILHRFDESDFTISQFEGLRVDGSEVIDEDTHFAPSCSYSNNEATSNSVISREPHKKAK ANRFLPGIVLSLGSRRKGAPHRAPLS
Data for domain prediction are obtained with InterProScan, and merged with InterPro data obtained from the EB-eye REST service.
| Prediction algorithm | Identifier | Start | End | Length | E-value | InterPro ID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| MobiDBLite | 1 | 24 | 24 | - | – | |
| PANTHER | 43 | 266 | 224 | 1.7E-112 | – | |
| PANTHER | 43 | 266 | 224 | 1.7E-112 | – | |
| Pfam | 99 | 170 | 72 | 1.9E-27 |
GO predictions are based solely on the InterPro-to-GO mappings published by EMBL-EBI, which are in turn based on the mapping of predicted domains to the InterPro dataset. The InterPro-to-GO mapping was last updated on , while the GO metadata was last updated on .
Expression pattern of LotjaGi6g1v0242600.1, powered by ExpAt. For advanced configuration, data transformation and export options, view expression data in the ExpAt application.
Loading expression data from ljgea-geneid. Please wait…